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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF04107 alignment
(12 sequences with 984 bp)


Y2307_ARCFU/12-285 ...---GATGAGAACTTCAATCCTGTTCCCATTTCAGATGAGATACTAAAGAAGATAGGG---------------GGTAGAACAGTTAACGAGGCAAAACTGGGCAGAGTG---------------GTAATAGGCAAGGAGTTGCAGAAACACGTTATCGAGCTAAAACCTGCAAGGCCCTTTGAAAGCCTATCCGAGTTCGAAGAAACTATGCAGGAAGGCGTTGAGGAGCTTCTTAGCGTTATGGAC------GGCTACAAACTTTTAGGACTGGGAATGCACCCC---CTTCTCAGGCTTGAGGATGCCAAAGTTTGGAATCACAGAGACAGAAGGATATACCAAGCCTACGACAGG---...CTTTTCAACATAAAACAGCATGGCTGGCTTAACATCCAGAGCTATCAGCTGAACATACCTTTTTCTTCCGAAAAGGAA...------...GCGGTAGAGCTTCACAACAAGATAAGAGTTCTGCTTCCCTACATTGCTGCGGTAGCTTCAGCCTCTCCAATCTGCGAGGGGAAG---TCTTACTACGTTGACACAAGA---CTTTACTTTTACCGCATAAACCAG---------AAGGAAGTTCCGGAAATCTGCAACGATGTAATTCCA---GAAAGAATATCCAGCCTAAAGGAATACAGGAGCATTCTTAAC------------------------------------------------...---GGCATCTACGAGGAGCTGAGAAGAAAAGGAGCTTACGTCCTC------------TGCAGGGAGTGGGTGAATTCGAGAGGTGTTATA---------...GTGAGGTTCAGCAGGAAATGCCTTGAGATAAAGGTGATGGACGAGCAGGAGTGCATCAAGAGCGATGTTGCTCTTACAGCGTTCATCAGAGCAATTCTTAGAGCT---GAACTTGAAGAACTGCCAGTAGATGTGCTGATTGAGAAGCTC
Q9RH09_ZYMMO/51-361 caaGCCCCTTCCTATGAAGAAAAAGGCGGTATTTGTGACCTGTTACAGGGATTTACCCGA---TTTGGTTGGCAGCCGATTTACGAAAATGATAAAATTATCGGCTTAAGT------GGAGATGACGGCGCGATCAGCCTTGAACCGGCAGGCCAGTTTGAACTTTCGGGCGCG---CCTCGTAGCACTATCCATGAAAGCTATGACGAAATATGTCGCCATATCCAGCAAACGCAAGAAGTTGGCGATGAATTGGGATTAGGCTTTTTGGGATTGGGTCTTTGGCCTGACAAAAAGCGTAGCGACCTGCCTTTAATGCCTAAAGGCCGTTATAAAATCATGACCGAATATATGCCAAAA---...GTTGGCAAGCTCGGTCTGGATATGATGCTTCGCACCTGCACTATTCAATCCAATATCGATTATGGCAGCGAAGCGGAT...------...ATGGTCAAAAAATTTCGAGTTTCCTTGGCGTTACAGCCTTTGGCCACCGCTCTTTTTGCCAATTCGCCTTTTTTGGAAGGACACCCTAACGGCTTTTCATCCTATCGCAGCCATATATGGACGGATACTGATCCCCATCGCACGGGTATTTTGCCTTTCGTCTTTGATGATGATTTCGGCTATGAACGCTATATTGACTATATGCTGTCGGTTCCGATGTATTTCGTCTATCGG------GATGGCCGCTATATTGATGCG---TCTGGTCAGgatTTCCGCGCTTTCTTGAGGGGCGAGTTACCTGCC---CTCCCCAACGAAAAGCCAATATTATCAGATTGGGTTGACCATCTTTCTACGGCCTTTCCT---...GAAGTGCGCCTGAAAAGCTATCTTGAAATGAGAGGGGCAGATGGGGCTTCGGCGATGATGTCGCCCGCTTTAAGCGCTTTTTGGATCAGCATCCTTTACGATTCC---GAATTACTGGATACCGCTTCAGATATTATCAAAAGCTGGAGC
Q9JMV4_BRAJA/22-335 cgcCCGGTGCCTTACGAAGGCGCACGCGGCATCGGCGCGCTGCTCGAGGGCATGAAGCTCCTGCTCGGCTGGGAGCCGATCATGGAGAAGGGCAACATCATCGGCCTCTACGACGTCACCGGCGGCGGCGCGATCTCGCTCGAGCCGGGCGGACAGTTCGAGCTTTCCGGTGCG---CCGGTCGAAAACGTGCACCAGACCCAGAGCGAGCTGATGGCGCATCTGGCGCAGGTGCGCGAGATCGCAGCGCCGCTCGGCATCGGCTTCCTCGGGCTCGGCATGACGCCGTCCTGGTCGCGCGCCGACATCCCGGTGATGCCCAAGGGCCGCTACAAGATCATGACCAACTACATGCCGAAG---...GTCGGCCAGTACGGCCTCGACATGATGTACCGGACCTGTACGGTGCAGACCAATCTCGACTTCTCCTCCGAAGCCGAC...------...ATGGTCAAGAAGCTGCGTGTGCTGCTCGCGCTCCAGCCGGTCGCAACCGCGCTGTTCGCAAATTCGCCGTTCACCGAAGGCAAGCCGAACGGCTTCCTCTCCTTCCGCTCCGAGATCTGGCGCGACACGGACAATGCGCGCGCGGGCATGATGCCCTGGGCGTTCGAGGACGGCATGGGCTTCGAGCGCTATGTCGACTACGCGCTCGACGTGCCCATGTATTTCGTCAAGCGC------GGCGAAGACTACATCGACGTC---TCGGGCTCCtcgTTCCGCGCCTTCTTCGACGGCCGCAACAACAAT---CTTCCCGGCGAGCGGCCGACATTGTCGGACTGGGCCAACCATCTCTCGACGATCTTCCCG---...GAAGTGCGGCTGAAGCGCTATCTCGAGATGCGCGGCTCCGACGGCGGACCGTGGGGCCGTCTTGCGGCGCTGCCGGCGTTCTGGGTCGGGCTGCTCTATGACGAT---GTGTCGCTCGATGCCGCCTGGGACATGGTGAAGCACTGGAGC
Q9A2Z2_CAUCR/48-358 gagCCCGTGCCCTACGAGGGCGACAAGGGCGTCCACGCCCTGCTGACCGGACTGCAGCGC---TTTGGCTGGACCCCGGTCATGGAAGGACCGACCATCATCGGCCTCGAG------CGCAACGGGGCCAATGTCAGCCTGGAGCCGGGCGGTCAGTTCGAGCTTTCGGGCGCG---CCGCTCTCGACCATGCACGAGATCTGCGAGGAGACCGGCCAGCACCTGGACGAGGTCAAGACCGTCGCCGACGAGCTGGGCCTGGGCTTTACGGGTCTGGGCTTCTCGCCCAAGTGGACGCGCGGGCAGGTGCCGATCATGCCCAAGGGGCGCTACGTGATCATGCGCAACTACATGCCCAAG---...GTCGGCAATCTGGGCCTGGACATGATGCTGCGCACCTGCACGGTGCAGGCCAATCTCGACTTCTCCAGCGAAGCCGAC...------...ATGGTCGCCAAGTTCCGCATGAGCCTGGCTTTGCAGCCGATCGCCACGGCCCTGTTCGCCAATTCGCCGTTCACGGAAGGCAAGCCCAACGGCTTCCTGTCGGCCCGGGCCAATGTCTGGACCGACACCGACCCCAACCGCACGGGCCTCTTGGACTTCGTGTTCGAGGACGGCTTCGATTTCGAGCGCTACGCCCGCTACGCGCTGGATGTGCCGATGTATTTCGTCAAGCGC------GGCGACAAGTACATCGACGTC---GCCGGCCGGtcgTTCCGCGACTTCATCGAGGGCAAGCTGCCCGAG---CTGCCGGGCGAGATCGCCACGATGAAGGACTTCGCCGACCACACGACCACGGCCTTCCCC---...GAAGTGCGCCTGAAGACCTATCTGGAGATGCGCGGCGCCGACGCCGGCCCCTGGAGCCGCCTGTGCGCCCTGCCGGCGCTGTGGACGGGCGTCTTCTACGATGAC---GCCGCGCTCGCCGCCGCGTGGGACCTCTGCAAGGACTGGACG
Q9RD01_STRCO/35-342 aggCTCCTCGGCGTCGAGGTGGAATGGCTCGTCCACGAACTGCGCGCGCCGCGGCTCCCC---------GTGTCACCCGAACGGCTCCAGGCGGTGTACACCGCGCTGCGGGCCGTGCCCCTGAGGTCGGCGCTGACCGTCGAACCCGGCGGCCAGCTGGAGCTGAGTTCGCTC---CCCGCCGCCTCGCTGACGGAGTGCGTCCGCTCCGTCTCCGCCGATCTGGAAGCCGTCCGCGCCGTGCTGCGCGAGGACGGCCTCGCCCTGGTCGGCCTCGGCCACGATCCC---TGGCACCCGCCGCGCCGCTACCTGCGGCAGCCG---CGCTACGACGCCATGGAGTCCTGTCTCGACCGC---...ACCGGCCCCGGTGGCCGCTTCATGATGTGCGCCTCGGCCTCGGTGCAGGTGTGCGTGGACGCCGGGCACGAGGAGCCGgggCCACTGggaCACGTGCGCCGGTGGTGGCTGGCCCACCACCTGGGCGCGGTCCTGCTGGCCGCGTTCGCCAACTCCCCGCTGTCCGGCGGGCGCCCCACCGGCTGGCGGTCCACCCGGCAGCTGCGGTGGACGCAGATCGGCGCCGGGCGGGCGGGCGGTCCCCCGCTGGACAGCGACCCG---------CGCGGCACCTGGGCGCGGCACGTGCTGGACGCCCCGGTGATGTGCGTGCGCCGC------GACGGCGGCCCCTGGGACGTGCCGGAGGGCCTGacgCTGCGGGAGTGGTCCCGCGAGCTGGTGCCC------CGGCCGCCG---------ACCCGGGAGGACCTCGACTACCACCTCACCACGCTCTTCCCG---...CCGGTCAGGCCGCGCGGCCACCTGGAGCTGCGCATGATCGACGCGCAGCCCGGGGACGACGGCTGGATCGTGCCGCTGGCGGTGACCGCCGCGCTGTTCGACGACCCCGAGGCCACCGAGACCGCCTACCGGGCCGTCAAGCCCCTGGCG
O69672_MYCTU/44-355 ggaCGCGTCGGTCTGGAGATGGAGGCGCACTGCTTCGACCCGGCCGATCCGTTTCGCCGG---CCCAGCTGGGAAGAGATCACCGAG------GTTCTCGAATGGCTCAGTCCGCTGCCGGGCGGCAGCGTGGTCAGCGTGGAGCCCGGTGGTGCCGTCGAACTGTCCGGACCG---CCCGCCGACGGCGTGCTGGCAGCCATCGGTGCCATGACGCGCGATCAGGCGGTGCTACGGTCGGCGCTTGCCAATGCCGGGCTGGGTTTGGTCTTCCTGGGTGCAGACCCG------CTGCGGTCGCCGGTGCGGGTCAATCCGGGCGCACGCTATCGGGCCATGGAGCAGTTTTTCGCCGCCAGCcatAGCGGAGTGCCGGGTGCGGCGATGATGACCTCGACAGCCGCGATCCAGGTCAATCTGGATGCCGGACCGCAGGAAGGA...------...TGGGCTGAGCGAGTCCGCCTGGCGCACGCCTTGGGGCCGACGATGATCGCGATTGCCGCCAACTCCCCGATGCTGGGCGGCCGGTTTTCCGGCTGGCAGTCCACCCGGCAGCGGGTGTGGGGCCAGATGGACTCCGCGCGCTGCGGCCCCATTCTTGGTGCCAGTGGCGACCACCCC---GGCATCGACTGGGCTAAGTATGCCTTGAAGGCGCCGGTGATGATGGTGCGAAGCCCGGACACTCAAGACACCCGTGCGGTGACGGACTACGTGcccTTCACCGACTGGGTTGACGGTCGGGTGCTG------CTGGACGGTCGCCGCGCTACCGTCGCCGACCTGGTTTACCACCTGACAACGTTGTTCCCG---...CCGGTGCGTCCTCGGCAATGGCTGGAAATTCGCTACCTCGACAGCGTGCCC---GACGAGGTGTGGCCCGCGGTGGTGTTCACCTTGGTGACGCTGCTCGACGACCCGGTGGCGGCAGATTTGGCGGTCGACGCGGTCGAACCGGTGGCC
YBDK_ECOLI/12-292 tttACCCTCGGTATTGAACTGGAAATGCAGGTGGTTAATCCGCCGGGCTATGACTTAAGC------CAGGACTCTTCAATGCTGATTGACGCGGTTAAAAATAAGATCACG---------GCCGGAGAGGTAAAGCACGATATCACCGAAAGTATGCTGGAGCTGGCGACGGAT---GTTTGCCGTGATATCAACCAGGCTGCCGGGCAGTTTTCAGCGATGCAGAAAGTCGTATTGCAGGCAGCCACAGACCATCATCTGGAAATTTGCGGCGGTGGCACGCACCCGTTTCAGAAATGGCAGCGTCAGGAGGTATGCGATAACGAACGCTATCAACGCACGCTGGAAAACTTTGGTTAT---...------CTC---ATTCAGCAGGCGACCGTTTTTGGTCAGCATGTCCATGTTGGCTGCGCCAGTGGCGATGACGCCATT...------...------TATTTGCTGCACGGCTTGTCACGATTTGTGCCGCACTTTATCGCCCTTTCCGCCGCGTCGCCATATATGCAGGGAACGGATACGCGTTTTGCCTCCTCACGACCGAATATTTTTTCCGCCTTTCCTGAT------AATGGCCCGATGCCGTGGGTCAGTAACTGGCAACAA---TTTGAAGCCCTGTTTCGCTGTCTGAGTTACACCACGATGATCGACAGCATTAAA---------------------------------------...---GATCTGCACTGGGATATTCGCCCCAGTCCT---CATTTTGGC------------ACGGTGGAGGTTCGGGTGATGGATACCCCG------------...TTAACCCTTAGCCACGCAGTAAATATGGCGGGATTAATTCAGGCTACCGCCCACTGGTTACTGACGGAACGCCCGTTTAAACATCAGGAAAAAGATTACCTGCTG------TATAAATTCAACCGTTTCCAGGCCTGTCGCTATGGGCTT
Y441_MYCBO/18-297 cccACCCTCGGTGTGGAGTGGGAGTTCGCGCTCGTTGACTCGCAGACCCGCGATCTGAGC------------AATGAAGCCACCGCGGTTATCGCCGAAATCGGCGAAAAC------------CCGCGGGTCCACAAGGAATTGCTGCGCAACACCGTAGAGATTGTCAGCGGT---ATCTGCGAATGTACCGCCGAGGCAATGCAGGATCTGCGCGATACCCTGGGCCCCGCCCGTCAGATCGTGCGCGACCGCGGGATGGAGCTGTTCTGCGCGGGTACCCACCCCTTCGCGCGGTGGTCGGCCCAGAAGCTCACCGACGCGCCGCGGTACGCGGAGCTGATCAAACGCACCCAGTGG---...------TGG---GGCCGGCAGATGCTGATCTGGGGTGTACACGTGCATGTCGGGATTCGCTCGGCGCACAAAGTGATG...------...------CCGATCATGACGTCGCTGCTCAACTACTACCCGCATCTGTTGGCGCTCTCGGCCTCATCACCCTGGTGGGGTGGCGAAGACACCGGGTATGCCAGCAACCGGGCGATGATGTTCCAGCAGTTGCCCACC---------GCCGGGCTGCCGTTTCACTTTCAGAGGTGGGCGGAGTTCGAAGGTTTCGTGTACGACCAGAAGAAGACCGGCATCATCGACCATATGGAC---------------------------------------...---GAAATCCGTTGGGATATAAGACCCTCACCC---CATCTGGGC------------ACCCTGGAGGTGCGGATCTGCGATGGCGTGTCCAACCTA---...CGAGAGCTCGGCGCGCTGGTCGCGCTGACGCATTGCCTGATCGTCGATCTGGACCGCCGCTTGGACGCCGGCGAAACGCTACCGACCATGCCTCCCTGGCACGTCCAG---------GAGAACAAGTGGCGTGCCGCCCGCTACGGCCTG
Q9HPZ9_HALN1/13-298 ggcACGCTGGGCGTCGAAGAGGAGTTCTTCGTGGTCGACGAGCACGGCGTGCCCACTGCG---------GGCAGCGACGAACTAGTCTACGAGGGGGAGCCGCCGGAACCG------ATCGCGGGCCGCCTCGACCACGAGCTGTTCAAGTTCGTGGTGGAGACCCAGACGCCG---ACGCTCAACGGGGTTGCCGAGGCCCCGGCGGCGATCCGTGAGGTGCGGGCCGCGCTGGTCGCGTACGCCAGCGAGCACGGGCTCCGGATCGCCGGCGCTGGCCTCCACCCGGGCGCGCGGTGGCGCGAACACGAGCACGCCGAGAAACCACGGTATCGGTCTCAGCTCGATCGCATCCAGTAC---...------CCA---CAACACCGGAACACGACGGCCGGGCTGCACATCCACGTGGGCGTCGACGAC---CCCGATAAGGCT...------...---GTGTGGGTGTCCAACCGGATGCGGTGGCATATGCCCGTGCTGTTGGCGCTGTCGGCGAACTCGCCGTACTGGAACGGCTTCGACACGGGGCTGGCGTCGGCGCGCGCGAAGATCTTCGAGGGGCTGCCGAAC---------ACGGGGCTGCCGACTGCCTTCGAGTCGTACGCGGCGTTCCAGGCGTTCGAGCGTCGGATGGTCGAACACGGCGGCATCGAGGACCGCGGG---------------------------GAG---------...------CTGTGGTACGACGTGCGCCCGCATTCG---GGCCACGGC------------ACGGTGGAGGTGCGTGCGCCGGACGCGCAGGCCGACCCG---...GCGGTGGTCGACGCGTTCGTGGAGTACGCCCACGCGCTGGTGACCGAGTACGCCCAGCGGTACGACGACCACCCTGATCCGTTCAGTGTCACTGGCCTGCGCCGCGAGCTGCTCGACGCGAACAAGTGGCGGGCGATGCGTGACGGCCAC
Q9I1T4_PSEAE/11-290 ...CGCTTCGGCATCGAGGAAGAATTCTTCCTGCTCGATGCCTCCGACCTGGACATCGTCCGC---------TCCGCCCCCGCCGGATTCGTCGCGGCCTGCCGTGACACG------CTCGGCGAGCATTTCGCCGAGGAGATGTTCGAATGCCAGGTCGAGGTGGCCAGCCCG---GTGTTCTCCACCCTGGCCGAGGCCGCGCGCTTCCACGGTCAGGCCCGGCAACGCCTGGCGCATCTGGCCATGGACTTCGGCCTGCGCTCGCTCTGCGTCGGCACCCATCCCTTCGCCGACTGGCGGCGGGCGCGAAGCAACCCGGCGGCGCACTTCGCCCGCCTGTTCGAGGACCAGGGGCGG---...------GTG---GCCCGGCGCAGCCTGGTCTGCGGCCTGCACGTGCATGTGGAGATACCGCCGAGCCACGACCGCATG...------...------GCTGTGCTCCAGCGCGTGTTGCCGTGGCTGCCGCTGCTGCTGGCGTTGAGCGCATCCTCGCCGTTCCGCGGCGGCCGGCGCAGCGGCCTGGCGAGCTATCGACGGGCACTCTGCGGCGAGTGGCCGAGG---------ATGAACATTCCTCCTGCCTTGCCCGACGAGGACGCCTATCGCCGCCACCTGGCGCTGCTGCGCGAGACCGGCTGCATCCGCGAGGATGGC---------------------------------------...---CAGGTCTGGTGGATGATCCGGCCGTCATCC---CATGTGCCG------------ACCCTGGAGCTGCGTATCTGCGACGCCTGC------------...CCGCGCCTGGCCGACGCGCTGAGCCTGGCCGGGCTGTTCAGGGCGCTGGTGGGCGAAGCGCTGGGCGCGGACCCGCGTGCGTTGCCGGTCGCGCGCGACGCCTGC------CTGGAGGAAAACTACTGGCAGGCGCTGCGTTACGGTTGC
Q9KY07_STRCO/2-283 cgcACCGTCGGAGTGGAGGAGGAGCTCCTCCTGGTCGATCCCGCGACCGGTGAGCCGCGG------GCGCTGTCCGCCGCCGTACTCGCCCGGGCCTTCCTCGACGACTCG------GAGCAGGACGTCTTCGAGAAGGAACTGCACGAGCAGATGCTCGAGTTCGCCACGCAT---CCGCAGGCGGACATGGAGCGGCTGCACGCCGAGATCGTCCGCTGCCGCGAGGAGGCCGGGCGGCACGCCGGGGGGATCGGGTGCGCGGTCGCCGCGCTCGCCACCTCACCG------------------CTGCCGGTGACGCCCTCCATCGGCGTGAACCGGCGCTACGAGTGGATGGCCGAGCAG...TACGGCGTCGTGGTCCACGAGCAGCTGGTCCTGGGGTGTCACGTGCACGTCTCCGTCGACTCC---GACGAGGAGGGC...------...---GTCGCGGTGATCGACCGGGTGCGGCCCTGGCTGCCGGTGCTGGCCGCGCTGAGCGCGAACTCGCCGTTCTGGCAGGGCCGGGACTCCTCGTACAGCAGCTACCGCAGCCGGGTCTGGCAGCGCTGGCCGTCG------GCCGGTCCCACGGAGCTGTTCGGCTCGGCC------------GAGCGCTACCACCGCAGGGTCGCGGACATGCTCGCCACCGGGACGGTCCTG------------GACGACGGGATGGTC---------TAC...TTCGACGTCCGGCTCTCCCAGCGGTATCCGACG---GTCGAGTTCCGG---------GTCGCCGACGTCTGCCTGGACGCCTCCACC------------...GCGGTCGTCCTGGCCGCGCTCGCCCGCGCGCTGGTCGACACGGCGGCGCGGGAGTGGCGCGCGGGCGCGGAACCGGCCGAGCACAGTGTGAGCCTGCTCCGCCTC------GCG---------GCCTGGCGGGCCGCCCGGTCCGGGCTG
P74515_SYNY3/3-287 ttgACTAAAGGGTTAGAAGTCGAAATCTATACCGGCAAGAAAACCGGTGAGATTGTGGGG---------------------CTTTCCGATCGCATTGTGCGGGATTTGAGT---------------GGCTTTGTGCGGGAGCCGGACAGCCGCAATGTGGAATACACTACACCT---CCGCTAAATAGTTACGATCGCCTGTTGTGTGGAATTCTTCAGCCCCGTCGTCAATTACGCCATTACCTCAGTCAACTAGGGGAAGACTACACATTAATACCGGGCAGTTGCTTGGCCCTGGGGGGGACGGATACCTTTTACCGTTCTGACCCCCAAAATCCTTACCATACCTACATCGAACAA---...------ACCTACAGTACCCAGGTGGTCACCGCCAGCATTCACATCAATATAGGTATTCCTGATGTGGAGGAGTTGATC...------...------CGGGCCTGTCGTTTAGTGAGGATGGAAGCCCCGTTATATCTTGCCCTCAGTGCATCTTCCCCTTTTCTGAATGGCCAGGTAACAGGCTACCATTCCAGCCGTTGGCAGATGTTCCCCAAAACCCCCCAG------------GAGGTGCCCCTGTTTACAAGCCATGGC---CATTTTGTGCAATGGACAGAGGAGCAATTGACCTTGGGCACTATGCAAAATGTCCGC---------------------------------------...---CATCTTTGGTCAGCGGTGCGTCCCAACGGCGATAATCGACCCCATAACCTGAACCGTTTGGAATTACGGATCTGCGATTTGGTCACTAACCCCCTCtccCTCCTGGCGATCGTGGCCCTACTGGAAGCCCGGTTACAACAAATGCTGGCCGATCCCACCCTGGACCCCCTCCAACAAAGTCAACTTACCCCCTCGGAATTGCTAGCCCTAGCGGATCAAAATGAAATCTCCGCCGCCGTTAGTAGCCTG