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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF04054 alignment
(6 sequences with 1245 bp)


Q20937_CAEEL/2092-2481 AGCCTGTTCAATGAGATTACT---------GGACCTGATCCATTGAAACTTCTTGAACCAATA------------GCTTGGAGCATTTTGGAGGCTTTCGGACAAACTTTC------------TTTGCTCTCCAACCACGACGAATG---CCTGGATTCGCTTTCGCTTGGCTCGATATTGTCGGACATAGAAACGTGATTGGACGTCTTTTGGCAAACACTGGCATTGCTGAAACCGTCGATGCTGTGAAAACGGCAGCCACTTACACTCAATTGATCATTTCTCATTTGAAGTTCTTGGCTCCATTCCTTCGTAACATTCAATTGCCAAAATCGATTGCCATTCTGTACAAGGGAACACTACGTGTTCTGCTGGTCATACTTCACGATTTCCCGGAGCTTCTTTGCGAATTCCACTATGTAATTTGCGATACGATTCCACCAAATTGTGTGCAACTTCGCAATTTGATATTATCAGCGTATCCACGTCAAATGCGCCTTCCGGACCCATTTGCATTGAACTTCAAACAAGTTGACACAATTCCAGAGATGGCAGTGGAACCGAAGTCCAATTTAAACATG---GCTACAATCATACCAGATAACATTCGAATTCCATTGGATGAATATCTTGCAAATCGTATATCT---GTCGATTTCCTTCCAAACCTGCCGACTCTTTTGCAAACTCAGAATCAA------GCC---------------GGTACCAAATACAACACTACTGTAATGAACGCTCTCGTTTTGTACGTCGGAATCAGAGCTATTGAGCACTTGCACTTGAGACGTCAACGTATCTCAACGCTGAACATAGCTCATACATCGTATATGGACATTTTCCAGAATTTAGCAATTCAATTGGATACCGAAGGACGTTACCTTCTTTTCAACGGAATCGCCAATCAACTTCGTTATCCAAATGCTCATACACACTACTTCAGCTGTGTATTTTTGTATCTCTTCAAGAACTCTACAAATGAC------------ACAATTCAAGAGCAGATCACACGTATTCTGTTCGAGCGTCTTGTAGCTCTCCGACCTCATCCATGGGGACTTCTTATAACGTTCATAGAGCTCATCAAGAATCCAACATACAACTTCTGGCGTTATGAGTTCACCAGTTGTGCACCAGAAATACAGAGATTGTTCCAAAATGTTGCCAACACTTGTGTCCCAGCCCAAGGATCTCAGCCACAAGCACAACCAGATGGTGCCCCA
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Q9BVZ6_HUMAN/159-539 ATGCTTCTCTTGGAACTCAAT---------------GCACCTGAGCATGTGTTGGAAACCATT------------AATTTCCAGACACTTACAGCTTTCTGCAATACATTC------------CACATCTTGAGGCCTACCAAAGCT---CCTGGCTTTGTATATGCCTGGCTTGAACTGATTTCCCATCGGATATTTATTGCAAGAATGCTGGCACAT------------------ACGCCACAGCAGAAGGGGTGGCCTATGTATGCACAGCTACTGATTGATTTATTCAAATATTTAGCGCCTTTCCTTAGAAATGTGGAACTCACCAAACCTATGCAAATCCTCTACAAGGGCACTTTAAGAGTGCTGCTGGTTCTTTTGCATGATTTCCCAGAGTTCCTTTGTGATTACCATTATGGGTTCTGTGATGTGATCCCACCTAATTGTATCCAGTTAAGAAATTTGATCCTGAGTGCCTTTCCAAGAAACATGAGGCTCCCCGACCCATTCACTCCTAATCTAAAG---GTGGACATGTTGAGTGAAATTAACATTGCTCCCCGGATTCTCACCAATTTC---ACTGGAGTAATGCCACCTCAGTTCAAAAAGGATTTGGATTCCTATCTTAAAACTCGATCACCA---GTCACTTTCCTGTCTGATCTGCGCAGCAACCTACAGGTATCCAATGAA------CCT---------------GGGAATCGCTACAACCTCCAGCTCATCAATGCACTGGTGCTCTATGTCGGGACTCAGGCCATTGCGCACATCCACAACAAGGGCAGCACACCTTCAATGAGCACCATCACTCACTCAGCACACATGGATATCTTCCAGAATTTGGCTGTGGACTTGGACACTGAGGGTCGCTATCTCTTTTTGAATGCAATTGCAAATCAGCTCCGGTACCCAAATAGCCACACTCACTACTTCAGTTGCACCATGCTGTACCTTTTTGCAGAGGCCAATACGGAA------------GCCATCCAAGAACAGATCACAAGAGTTCTCTTGGAACGGTTGATTGTAAATAGGCCACATCCTTGGGGTCTTCTTATTACCTTCATTGAGCTGATTAAAAACCCAGCGTTTAAGTTCTGGAACCATGAATTTGTACACTGTGCCCCAGAAATCGAAAAGTTATTCCAGTCGGTCGCACAGTGCTGCATGGGACAGAAGCAGGCCCAGCAAGTAATGGAAGGGACAGGTGCCAGT
Q9V591_DROME/1779-2160 ATGCTGTTCATGGAGCTGTGC---------------ACGGCCGATGTGATTCTCGAGTCCCTG------------ATGCACAGTATTGTGTCGGCCTTCGCCTACACATAT------------CACTTGTTGAATCCCAGCGTGGCT---CCGGGATTCTGCTTTGCTTGGTTGGAGCTCATTTCGCATCGCGTCTTCCTGGGCCGCATCCTGGTCCAA------------------ATTCCCGGGCAAAAGGGCTGGCCACTTTACGCTCAGTTGCTGCAGGACCTTTTTAAATATCTTGCGCCCTTCTTACGCAACACTGAGCTCGGCAAACCAGTCCAGCTTTTGTACAAGGGGACGCTACGTGTTCTGCTCGTTCTGCTTCACGACTTCCCGGAGTTCTTGTGCGACTATCATTTTGGGTTCTGTGACACCATCCCGCCCAATTGCGTCCAGATGCGTAACATCATCCTGTCGGCGTTTCCGCGCAACATGCGCTTGCCCGATCCCTTCACGCCCAACCTAAAA---GTGGACATGCTGTCGGACAGTAGTAATGCGCCTAAGGTGCTCAGTAGCTACATTATGAACATCCAGCCCGCGAACTTTAAGAAGGATTTGGACTCGTACCTCAAGGCCCGGGCGCCA---GTTACTTTTCTATCGGAATTACGTGGTCACTTGCAGGTGACAAGCGAG------CCA---------------GGAACTCGTTACAACATGGCACTGATGAATGCTCTGGTCATGTATGTGGGAACTCAGGCGATTGCTTTGATCAGAAACAAAAACTTTGTGCCCAACACCTCGAACATAGCACACAGCGCCCACATGGATATCTTCCAGAATCTTGCTGTTGACTTGGATACGGAGGGTCGCTATCTGTTCTTGAATGCGATTGCGAACCAGTTGCGCTATCCCAACAGCCACACGCACTACTTCAGCTGTGCGGTGCTGCATCTGTTTGCCGAGGCCAACTCGGAG------------GCAATTCAGGAGCAGATCACTCGCGTACTTCTGGAACGATTGATCGTGAACCGCCCGCATCCTTGGGGACTGTTGATCACTTTTATTGAGCTGATCAAAAATCCCATCTACAAGTTCTGGGACCATGACTTTGTGCACTGTGCGCCAGAGATCACCAAGCTCTTTGAATCGGTGGCCCGTTCCTGTCTGGCCAAGTCGAACGTCACCCAGCAGTTGAACATGCCCGTCGTCGAT
P87112_SCHPO/1718-2095 AGTATACTCTCCGAGCTTGAT---------------GATGCTAAGGATGTATTGGAGTCCTGC------------TTCGTCGATATCTATAGTGTTATTTTAGAATGCTTC------------CTTGCTATTCAGCCACGCTCTTTC---CCAGCGTTTACATTTGCCTGGCTTAGCCTTATTTCACATTCATACTTACTACCGAAGGTTCTTCTT---------------------GTCAATAATGATAAAATTAATGATTTATTTAGTGAGATCCTGATGTCCTTTTTAAAATTTTTAGAT------TTGAAGGATGATATTGATAAAGCCCAATTTAAACTTCTTTATAATGGCTTCTTGAGGATCATACTTGTTCTTCTTCATGATTTCCCTGGCTTTTTGGCTACCCATTGTTACCAATTGATACCTTATATTCCATTAGAATGCGTGCAACTTCGTAATATGGTATTGAGCGCGTTTCCTAGTGATCTTCATCTTCCTGATCCATTTGCTCAAGGTTTGAAG---GTAGGCAGATTACCTGAGGTAACCCGCGCACCATTAATTTCAAATTCAGTTTCTGCTTCACTTGAGAAATTTGCGTCAGCGTTGGATTTAGAAGCTTGTTTCTCTTCTTCCAAACCA---GCGGAA---GTTGCCAAGCTATTGTTAGAAGTGTACTCAAGTCAAGAT---------------------ACCCCTACTAAATTAAACGAATGG---GCAAACTATTTTATGCTTTGTTTAATACGCCACGCTACTCGTGATTCCCCTGCCAAGCAAGCCCCACAATTTCAA---------TCAAAATCTCCTGAATGTGTAATTATTAGTACTATGAATCGCAGTTGCGATTCAAAGTGCCGCTATTTCTTGTTAACTGCGATTGCTAATCAGCTGCGTTACCCTAGCAGCCATACTTACTATGCTAGCTGTTGTTTCTTGTACCTTTTCAAGAGTTCTTCTAACAACCCTCAAGAATTGCTTATCAAAGAACAGATGACAACTGTACTTTTGGAACGCATAATTTGCAATCGACCACATCCTTGGGGCCTTTTAATTACATTTACTGAATTATTAAAAAATGAAGACTATAACTTTTGGAAACACCCTTATATAAAGCGAAACGATGAAATCTGTCGTTTGTTTGATAGTCTCCATGAACATGTCATGGCACCCTCCTCAGCTAATAATGTCTCTACCGAAGAGGCTACAGAA
NOT1_YEAST/1698-2098 AACATCTTATACGAATGGGCTACCATCAGGACGCACAATTTTGTTAGAATATCTGATTCCAGCACTAGGCAGGAGCTGATCGAATTTGATTCTGTATTTTACAACACTTTCTCAGGATATTTGCACGCTCTGCAACCATTTGCCTTC---CCTGGATTCTCATTTGCATGGGTGACACTATTATCACACAGAATGTTATTACCAATTATGCTAAGA---------------------TTACCCAATAAAATAGGTTGGGAAAAGTTAATGCTTTTGATTATCGATTTGTTTAAATTTTTGGACCAATACACAAGTAAACATGCAGTCTCTGACGCTGTTTCGGTTGTTTATAAGGGAACACTGCGTGTTATTTTAGGCATTTCGAATGATATGCCATCCTTTTTGATTGAAAATCACTATGAATTAATGAACAATCTACCTCCAACATATTTCCAACTAAAGAATGTTATTTTATCTGCTATTCCTAAGAATATGACCGTTCCCAACCCATATGACGTGGATCTTAAT---ATGGAGGATATTCCAGCATGTAAAGAACTACCTGAAGTCTTCTTTGATCCTGTAATTGATTTA------CACTCATTGAAAAAGCCAGTTGACAACTACCTACGTATT---CCCTCAAATTCATTATTAAGAACAATACTAAGCGCTATTTACAAGGATACCTATGACATAAAAAAGGGCGTAGGCTACGACTTTTTATCTGTTGATAGTAAATTAATTCGCGCTATTGTATTACATGTGGGCATTGAAGCT------GGAATAGAGTATAAGAGAACTTCTTCAAATGCGGTATTTAATACGAAGTCTTCTTATTATACTTTATTGTTCAATCTGATTCAAAATGGTAGCATCGAAATGAAATATCAAATTATTCTGTCTATTGTGGAACAATTGCGGTATCCAAACATCCACACCTATTGGTTCAGCTTTGTGTTAATGAATATGTTCAAAAGTGACGAATGGAATGATCAAAAACTTGAAGTCCAAGAAATTATTTTAAGAAACTTTTTAAAAAGAATTATTGTTAACAAACCACATACCTGGGGTGTTTCAGTTTTCTTTACTCAGTTGATAAACAATAACGATATTAATCTTTTAGACCTGCCCTTTGTACAAAGTGTTCCCGAAATTAAACTAATTTTACAACAATTAGTAAAATATTCCAAAAAATACACAACCAGTGAACAAGATGACCAATCCGCCACCATCAAT