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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF03916 alignment
(13 sequences with 1374 bp)


Q9JPC7_RHOGE/48-336 GTCGTCACCGGCATGAGCGACCAGGTC---------TCCTGGGGCTTCTACATCGCCAAC...TTCGCCTTCCTCGTC------GGCATCGCGGCGGCA------GCGGTGCTGCTGGTCATCCCGGCC...---...---TATCTGTTCCACCGC---......------GGC......GACGTCAAG.........CAGGTC...GTCATCTTCGGCGAGGCGCTG...GCGGTCGCGGCGGTCGTC...GCG---GCGATGCTCTTCGTCACCGTCGACATCGGC---AGGCCGGAG...CGCATCTGGCACATGCTGcccGTC......GTCGGACGCTTC------AAC---------TGGCCGCTGTCG------ATG---------......------CTGGCC...---TGGGACGTCGTCGTGCTCGTC---...---GGCTACCTG------------------......---CTGCTCAACCTCGGG------.........---CTG...CCGGCC..............................TACGTG...CTGCACGCGCGC............TGGCGCGGCGAG------...GAG.................................CCGGTGACGGCGCGCtacttcCCAGTGGTGATCGTCGCG...ATCTTCTGGGCAGTCTCGATCCACACCGTCACCGCCTTCCTGTTCTCGGCCAACGCCGGGCGGCCGCTGTGGCACAGCGCGCTGCTGGCGCCG---CGCTTCATCGCCTCGGCCTTCGCGTCGGGGCCGgcgCTGATCATCGTC...GCGCTGCTGGCGCTGCGCCGC...TGGGGCGGGCTGGCCGTG...AAGCAGACG...GTGATCGACCTGCTG---------------GCCGTC...GTCATGACG---...GTGGCGCTGCAGATCAGC..................CTG------------TTCTTCGTC...GGC---...GTCGAGCTC---------------------TTCACCGACTTCTAC...---AACGAGACCACGCACGCG...------GCC..................------------TCGATGCGC---------.........---..................TACCTGTTC---TTCGGGCTGGCCGGGGCCGGC---------------AAGCTGCAG...CCC...---TGGATCTGGACCGCGCTGGCGCTCAACGTCGTGGCGGTG...GTCATCCTGTCGATCCACCCGCTGCGG------CGCACGCCGCGGCTGCTGGTGCTGGCCTGCGGCCTGGTCTTC...CTCGGC
O30063_ARCFU/31-338 ---GTAACGAACATGCGGAATCCCTTT---------AGCTGGGGGCTCTACATTGCGATG...TGGGCATTTTTTGTC------GGAACGGCTGCTGGTGGTCTTGTTGTGTCATCTGCGATATACATC...---...---------TTCGGGGCAAGA......GAATTCAAG......CCCATAGCG.........CCAGTG...GCATCAACGACTGCCTTCATC...------TTCGCTGTCGGT...GCG------ATGGTTATGGTTCTACCCGACCTCGGT---AGGGTGGAC...AGAATACTGAACATGTTT...CTT......TACCCCAACTTC------TCA---------TCTCTTCTACCC------TGG---GACCTG......ATAGTACTCTCA...---ACCTACGCTTTCCTTTCGGCC---...---ATTTACACCTACGTTCTTCTGATGCCG......AGAATTGCTGAGAGGGGA------.........------...---GTC..............................TTAGGT...TTTCTAAAGAAAgatgcgactgatTTAGAGTCTTTAAGGCAAaagTCC.................................GAGAAGTATGCGAAA......GTTCTTGCTCCGATAGCC...CTCCCCTTCGCCATACTCATCCACACCGTGACGGCTTGGGTTCTCGCAACGCAACTTTCGAGGCCGTGGTGGTATGGCGGGCTGCTCGCCCCA---ACTTTCATCGCAGCTGCAATCGCCACAGGG---...---CCTGCCGTT...GTAATACTTGCATCCCTCTTC...GTTTATGGTTATGAAGAT...AGGCTTAAA...AATGCC---------TACAGACTTCTCGGCAAGATTtctGCAGCATCA---...TCCGCTGCTCTCCTTTTC..................ATGTACTACAACGACTTCCTCGTC...AGA---...TACTGGTGG---------------------GGAGAAGGGCTGGAA...---TACGAGGCTCTGGCTATT...------GTC..................------------TTCAGAGAT---TACCTC.........CAC..................ATACACTTC---CTCGAAGTTCTGTTTATC---CTCTTCTCAGCCATCGTGCTGGCC...AAG...---GCGACGACCCGT------------------GCAAGGCTA...ATTATTGGTAGCGTGTCTGTCAACGTGGGTGTCCTCCTCCACAGATTTCTACTGATGCCTCCTGCCTACAACGTC...TTTGCC
Q9HR72_HALN1/45-360 GGCCTCATCGAAACCGGGATGCGCAAC---------GTGTTCTCGTGGGGACTGTATATC...ATGCTGTTCGTGCTGTTCGTGGGGCTGTCGGCTGGC------GGGCTGATCCTGTCCAGTGCGCCG...---...---AAGTTCTTCCACTCCCAG......CGC------......---TACGAG.........GGGTTC...GCTCGGCTGGGCGTGCTCGTG...AGCCTGGGCTGCATCATCgtcGCG---GGGCTGTTGATCCTG---CCCGATATCGGG---CGTCCGGAC...CGCATCTACCAGTTCGTC...ACC......TCCCCGGACTTC------CGG---------TCGCCGATGGTCTGGGACTTC---GGCATC......GTGATGCTGTAC...---GGCGCACTCAACGTCTGGTAC---...---CTGTGGCTGTTGACG------CGCCGT......GATCTCGCCGCCCGAGGGTCGCGGctgtcgctgTGGGTG...TCCGACtcggccgccggccgcgaccgcgaccgcacgCTCATG...TTCTGGACCGCG............GTCTGTGCGCTG------...CCC.................................GCGGCAGTCGCG---......---TTGCACTCCGTGACCggcTGGATCTTCGCCACACAGGTCGGC------CGCGGCGACTGGTTCAGCCCGCTC---------------------------GTCGCGCCCGTG------TTCATCGCGAAAGCGCTGGTCTCGGGG---...---CTTGGACTA...CTGCTCGTGGTGTCGATCCTC...GCGGACCGATTCACGGCG...TTCACCGCC...GACCGCGGGGAGCTCACCAGCCTGGGCAAACTGCTG...GGGATCTTC---...CTGGCGTTCCACGTGGTG..................TAC------------CTG------...------...CTCGCCGCC---------------------GAGCGCCTCCCGCAC...---GCGTGGGCGCACCACTTCgggTTCTGGGCG..................------------ATCACCAGCAACTTCCTCatcggggacACC..................GTCTACTTCTGGCTG---TGGACCGGTCTCGGCGGTGCGGTGCCACTGCTGTTG---...TTG...---GCCACGCCGTCG---CTTCGCAGGCGCACGGCGGTCATC...TTCACCGCGAGCGTGCTGGCGGTGTTCGGCACGCTCTTCGAGGGGATCCGGCTGGTGTTCACCGGCTACCAGCGC...GTGAAC
HMEB_ARCFU/40-332 GGCCTTAACGGGCTGAGCAACCGTGTG---------CCTTGGGGCATTGTCAACGCTGGA...ATCCCCTACTTCATC------GGTTTAAGTGCGGGC------TCGCTCATAGTCTCGGCTCTCGCC...---...---GGAGTGTTCAACATAAAG......AAGTACAAG......GTTTTCAGC.........AGAATT...---------GCCGCATATATG...GCAGCTGCGTGGATTATC...GCA---GCAATTCTCAGCATTGCTCTCGACATAGGA---AAGCTCTAC...CACTTCATGAACGCTGTG...AGG......TACTTCAACCCG------ACG---------TCGATCTTCTCG------TGG---AACGCG......TTTTTGTATTCA...---AGCTACTTTGTCATCTGTTCC---...---ATTTACCTGCTTGTGCAGTTTGAG---......------GAGATGGAAAAG------.........------...------..............................------...------------............------------------...GCA.................................ACAAGGTTCATGGCC......GGATTGGCAGTTTTCTGG...---------GCTGTCCTCGTTCACAGCGGTACCGGAGCCATCTACAGCTTTGTTTATTCAAAAGAACTTTACCACTCAGCTCTAACGCCACCA---ATGTTCATCGTGTGTGCTATCACCTCAGGT---...---TTG---GGA...TTGCTCCTTGCGAACCTCTAC...TTCACCTTCCGCTTTACC...AAGAGGGAGcttGATCCAAAGCTGATCAGAGGGTTG------------...GCTCTGATT---...TTCGCCGGGCTGATGATG..................GTT------------CTTGGCTAC...TTC---...CTTGCAGTT---------------------GAGGGGCTTGAAAAGgggTACATCCCAGCGCTGCATGAA...------GCG..................------------GTTCAGTTTGTGTTCCTG.........ACAcccacatcaggcgtattcTGGAGCTTCTGGCTGCTGGTA---ATCTTCGGCATAGCGATACCGATAATA------...ATT...---GTCCTGAACCCAAAGACTGGATACGACCTCAGATGGATA...ACCTTTGCCGGAATCCTGCACGCTGCACTGGTCTTTGCAGAGCGTTTCTACCTGATCATCCCTGGACAGGTGTTC...CCTGAG
Q9F2A1_CHRVI/43-337 TGGGTCAGCGGCATGAACAACTCGGTG---------GTCTGGGGCACGCCGCATGTGTTC...GCGGTCTTCCTCATC------ATCGCGGCCTCGGGG------GCGCTCAACATCGCCTCGATCGGC...---...---ACCGTGTTCAAGAAGCCG......ATCTACAAA......CCGCTCGGA.........CGGCTC...------TCCGGCCTGCTG---...---GCGGTAGCGATGCTG...ATGGGCGGTCTGCTGGTGCTGGTCATGGATCTCGGG---CGCCCGGAG...CGTCTGATCGTGGCCATG...ACC......AACTACAACTTC------AGC---------TCGATCTTCGCC------TGG---AACATC......TTCCTCTATACC...---GGCTTCATGGCCATCGTCATC---...---GCGTATCTGTGGTCGATGGCCGACCGT......CAGGGCGGACCGTTCAAC------.........---TAT...CCG---..............................ATCGGC...ATCCTGGCGCTG............GTCTGGCGTCTG------...GCG.................................---------------......------------------...------CTGACCACGGGTACCGGCTCGATCTTCGGCTTCCTGGTG---GCGCGTCAGGCCTAT---------GATGCCGCCATCCTCGGTCCG---ATGTTCGTGGCGCTGTCCTTCGCCTATGGG---...---CTGGCGGTG...TTCATGCTGGTG------CTG...ATGTTCGGCTTCGAGGAG...GAGGGACGC...CCGATCGGC---------------------CCGCGC...ATGATGCGC---...CGGTTGCGCAATCTGCTG..................GCG------------CTCTTCATC...GGCATCgcgCTCTATTTC---------------------ACGCTGGTCTATCAC...---CTGACCAATCTCTACATG...------GCCaagaacgacagcctggagCACTGGTTGCTGCTCAGCGGCGGGATCTAC.........ACC..................TTCCTGTTCTGGGTCGGCTGGATCCTGGTCGGCAGTCTGGCACCGATGTGGATC---...CTC...---TATCATCCGGTG---CTGAGTCAGAAGCGCGAGTGGATC...ATTGGCGCCTGCACCCTGGTCATCGTCGGCGGCTTCTCGGCCATGTATGTCATCATCATCGGCAGCCAGGCGTTCccgATCGCG
Q9CPL1_PASMU/2-319 AACAGTCCATTTCATTTCCCGTCTTTA---------GTATGGGATCATACCATCGCCGTT...TATTTGTTCTTATTG------GGGATCTCTGCCGGT------GCAACCATGTTAGCCGTTTTGTTA...---...---AAACGCGCA---GGGCTA......GCTGGCGCAgaaccgTCAAACAAT.........CATGTG...ATACGTTGTACGGCATTTTTG...GCGCCATTAAGTCTGATT...ATT---GGCTTGGTGATTTTGATTTTCCATTTAACT---AAGCCATGG...ACCTTTTGGTACTTGATG...TTT......AATTACAGTACC------ACC---------TCTATTATGTCG------ATG---GGGGTT......ATGCTATTCCAG...---GCCTACATGTTGTTTTTACTG---...---GTCTGGTTAGCGATTATTTTCCATCAG......CTTGTGGCAACTTTAATTGAGCAA.........TATGCCaaaCCG---..............................TTACGA...TTTGTGAATAAA............TTGATTGCTTTT------...GCT.................................GCCAAATTCACTGGA......TTAATTGAAATTATTTTG...ATAATTCTCTCTGTGTTATTGGGCGCCTATACGGGCTTCTTATTATCGGCTTTGATTAGCTACCCAATGTTGAATAACCCAGTGTTACCAATT---TTATTCTTGGCCTCAGGGACATCCTCAGGT---...---ATTGCGGCA...TTAATTTTCTGTACCTTGCTC...TTTACTAAAGAAGACACC...CATTCACCT...GCGTTAGGCTTCTTACATAAGTTTGAATTGCCGGTA...GTGTTGATG---...GAAATCTTTTTACTTGCC..................GCC------------TTCTTTATT...GGC---...TTGTATTTA---------------------GGGGGCGGTCAAAAA...---ACGGTGGCATTTGAGACC...------GCA..................------------CTTTTAGGTGGATTCTGG.........GCA..................CATGTCTTCTGGATTGGGGTAGTTGGTATTGGTTTAGTCTTGCCATTACTCCTCAATggcATA...---GCCACTCCGCAG---TTAAAACATCGCAAAGGCTTTATG...CTACTGGTGGCTTGCTTAGGCTTAATTGGCGTGTTATGTTTGCGTTTCTTTATCCTCTATGCAGGACAAATGACG...CTAGCA
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PSRC_WOLSU/6-317 GGATCAATCGAACAATACAACACAGTC---------GTATGGCATTGGCCTATCGCGGTC...TATCTCTTTTTGGCG------GGTCTCTCGGCTGGA------GCCATCATCTCAGCGATTATCATC...---...---AAATGGATGAAAGGCAAT......GAGAGCTCT......CCTTGGGAT.........GGAATC...ATCAAAGCGGGCGCGCTGATT...GCGCCTTTGACGATCGGA...GCA---GGACTTTTGCTCTTGATTTTTGACCTAACG---CGACCGCTT...CATTTCTGGAAGCTGTTG...ATT......TTCTACAATTTC------AGT---------TCTGTAATGACC------TTG---GGCGTT......TTGGCGCTTTTT...---GCCTATTTCCCCGTGGTGCTT---...---ATCTTCTTGTTGGGTGTATTCAAAAAA......GAGCTTTGCGATGAGGGA------.........------...CCC---..............................TTTGGC...TTCCTTGCACCC............CTAGCCAATATC------...GCC.................................TATAGCATGGCTAGA......CCTCTTGAGATTGTCACT...TTTGTTTTGGCCATTGGCGTAGGAGCTTACACAGGATTCTTGCTCTCAGCGATGTATAGCTATCCGTTGCTCAATACGCCTATCTTACCTTTG---CTTTTCCTCGCTTCAGGAATCTCAGCGGGA---...---ATCTCAGGC...AACCTTCTCATCGGTCTTCTC...TTCTTTGGTAAGAGCACC...AAAGGTGAG...AATGTAGGCTATCTTCATGGGCTTGACTTCAAGGTT...ATCTTGTTT---...GAGGCCTTTTTGCTCTTT..................ATT------------CTTTTTGTG...GGA---...ATGTATTAC---------------------CAAGGTGGAAGCACC...---GCTGAAGTCGCCAAAGCG...------GCG..................------------CTGACCACAGGAGGGCTG.........GCT..................TCACTCTTCTGGCTTGGTGTGGCTGGGATGGGCTTGGCGTTGCCTGTAGTGCTCAAT...GTC...---GCGCTTCCTCATGGAATCAAGCACTCCAGCGGCTTTGTC...ATGCTCAACGCGCTCATTGTGCTAGCGGGTGTGATGGCACTTCGCTTCTATATCCTCTACGCGGGACAGACTTTC...GTAGGC
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Q9Y8M5_AERPE/24-334 GAC------TTCAAAGCAGGAGGGGCA---------ATATGGGGGGTGCTCCTAGTAGTC...TACCCCCTCATGACA------GGAATACTCGCTGGC---AGCTACCTAGTGAGCGCGCTGGCCTACggcTTCggcGTAAAGCGGCTATACAGGGTC......GCAGGGCTA......TCG------.........CTAATA...ATAAGCGTGGGCCTTCTGCTAtcaGCCCCCATATTCCCCATG...GCA------------------------GACTTGAAG---CAGCCCCAGaggGCCTTCGAGATCTTCCTG...AGA......CCCCACGTTATA------CCC---------TCTGACGCCTAT------CCG---GGAGTAtcgcccATGGCGTTCTTCggtATACTGTATATCCCTCTGCTCGTAGTGgcgCTGCTTAACCTCATCTTTGTGTACAGGGCC......GACATGGCTGCTAAGGCA------.........------...GAAGCG..............................ACAGGAaatATCATCTACAGG............ATAGTATCGCTT------...GGCaggggatatagtagagaagatgtggagagggacAGAAGGGTTGTAAAA......ATCCTCTCCATCATAGGA...GTAATCCTCGCAATACTCTTCCACGGATACTTCGACATACTCCTGGCAAGCATTAAGTCGAGAATACTTTGGGTTGACCCCAGCCTGCCTATA---AGGCTATTGGCCTCCGCAGTATTCTCGGGA---...---GCGGCTCTT...GTAACAGTAGCATACTACATA...GCGGCAAGATTTTCGCCTggaGAGAGCATC...GATGCCGGAACCATGAAGACGCTGAGCCTAATAATG...CTCTTTGGC---...CTCGCGGCAGCCCTGATTacggagataacctcagaaATA------------CTTAGAGTA...GGG---...TATTACCTG---------------------CTCCCGGGGGAGGGT...---ATAGAATACTACGAGTCT...---------..................------------CTCAGGGGG---------.........---..................TCCATGTTC---ATAGACAACGCATACTATATACTTGCGCTAATTCTACTCGTGTCT...CTG...---CTGATACCGAGG---GTTAGAGAGAACATACACTCTGTA...------GCCGCTATAGCCGCCCTGGCG---------------------------------------------ATT...GTTGCG
Q9Z4S7_SALTY/9-291 GAAGTGCTGGCTCACCCGCAGGACATT---------AGCTGG---CTGCCGTGGGCGGTAcaaTATTTCTTTTTTATT------GGCATTGCCGCCTGC------GCCGCACTGTTTGCCTGTTATCTT...---...---CACTGGCGGAAAAAAGAC......GCCGCAACA......GAAGAAAATcgggcattaCTGATT...GCCATTACCTGTGCGATTACC...GCACCGCTGGCGCTGACG...GCG---GATCTG---------------CACCAGACCGCCCGCGTCTGG...CATTTC------------...---......---TATGCCTGG------CCGACGCCCTGGTCGTGGATGCCC------TGG---GGAGCG......TTATTCCTGCCG...---CTGTTTACCGGATTTCTCGCT---...---CTGTGG---------------------......---TTCCTGGCGCAGCAG------.........------...------..............................------...---ATTAAACGA............TTATTCAATAAA------...AGT.................................TACAACGTCACTAAA......TGGTTGGCGTTAGCCAGC...GCGCTTTGCGCGGTGGGCCTGTTGATTTATACCGGCCGCGAAGTCTCCGTTGTGCTGGCGCGCCCAATCTGGTTTAGCTACGCCTTCCCCGTGGCGATGTTTCTT---------------AGCGCC---...---TTACAGGCG...TTCTTCGCGCTGATGATTGTC...GCCGCCCGACGC------...---------...GACTCGGTAAGGCTGCCAAAAATATTGTGGGGACAA...ATCTGGACGCTGgcgGCGCTGGGGCTGGTTGTG..................GCC------------ATGTGGGTTagcGGC---...GATACGCTT---------------------TCCGGCACGGCAATC...---CGTCAGTGGATTACCGTC...------GCC..................------------CTGTCAGCC---------.........---..................AAATATTACGCTGTCGGCTGGGTAGCGCTGTGGGTATGCACACTGCTGTTCTGTAGC...CTG...---GCGCTACGCCATCCGTTATCACAGCTAAGACGCGTCCTG...CTGGTTCTCAGCGCGCTGGCGCTATGTTGGCTGATG------CGCTGGACATTGTTGATTCAGGTACAA---ACC...GTCCCC
Q97XY0_SULSO/39-347 ACTGAGCCTAATGAC---GAGCCAATA---------CCTTGGGGACTTTTAGTAATTGGC...TATATGTTTTTCGGA------GTTATAGGTACTGGC------GTTAGCACTTACAATTCACTATAT...---...---GAACTGTTTAATAAGAATcatccaGAAAAGAAT......CCGTTTAAG.........AATATCtcaTTAAGAAACGAGTGGATA---...---GCACTAACTGTACTA...ATA---CCGGGCTGGATTATGGTCTTTGCATCAACTTATAAGCCTGGA...GAA------GCTGTCTAT...ATT......TACACGAGCTTTAGAGATACC---------TCAAGAATAGCT------TGGAACGGTTTA......TTGTACGCACTT...---GTGGGTATTGGTATAATTCTA---...---GAAATACTAGCATTAATAGGGGAGAAGagaaggGAATATAAGGACCCTATTAGTAGA.........CTCTTG...GCTTGG..............................CTATCA...TCTAAATCAGTA............TTGATATTAATA------...GTT.................................---------------......GGCTATGCAATACTAATGgagTTAATACTGGATGCGAACTTAGGCTCAGTATTCGGCTACTTATCAACATGGGTCTACGAGTTC------------GGTCCATTCATGTCAATG---TTATTCGTCATATTATCATTCTATTCCGGT---...---ATTGCGATGttaTCATTTATGACTCCGTTATATaatAGATTTAGAAAAGTTAAA...GAAGATCCG...AATAGTTTGAGTATACAT------GAAATGTATAAA...ATACTAGGA---...AGAGACGGTGTATTAGCT..................ACG------------ATAGCAGTA...GGT---...TTTTCACTACTGTGGTGGTTATGGTTAACAGCAACGAATCAGCAA...---ACTTCAGCTTGGGCAGAG...------CTT..................------------ATGATTTCTGGGCCATAT.........AGT..................GTAGTCTTTCTAATAGGTGGAGTACTAGTTGGTGTGATAATTCCAATAATCCTTTAC...GGG...---CTTGTATATAAG------AGGGGAAGTAGCCATATGTTA...GTAACATCTTCGATATTCACATTACTTGGAATGTTCTCGATA---------------------------ATTACG...ATTGCT