EMBL-EBI > Goldman Group

PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam



PANDIT Homepage
pan•dit
PANDIT
Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF03725 alignment
(32 sequences with 294 bp)


MTR3_YEAST/199-250 ACTGTCGTATCATTCATCAAAAATGGA------------------------.........---...............GAGGAAATTGTAGGTtttTGGAAGGATGATGGTGACGATGAAGATCTT...------------------------------------......---------...------------------TTGGAATGCCTTGATCGTTGCAAG------...GAGCAATATAACCGTTATAGAGATTTAATGATAAGCTGTTTAATGAACCAGGAAACT---
RRP46_YEAST/162-234 AGTATGTGCGCAAGCATCCCTATTGCAATAATCAAAGACACTAGT------.........---...............------GATATCATT...---GTCGATCCCACTGCCGAGCAATTGAAGattTCGCTCTCTGTCCACACTTTAGCTCTGGAGTTCGTC......AATGGCGGT...---AAAGTCGTGAAAAACGTTTTATTGTTAGACAGCAATGGT------...---------GATTTTAATGAAGATCAATTGTTCAGTTTACTGGAGCTGGGTGAGCAAAAG
RRP42_YEAST/183-254 AATCCGCCTTTAGTGTTTATATTGGCCGTTGTAGGCAAC------------.........---...............------AATATGCTA...---TTGGACCCTGCAGCCAACGAAAGCGAA...---GTGGCCAATAATGGCCTAATCATTTCCTGGTCT......---AATGGTaagATTACATCACCTATCAGATCAGTAGCATTGAATGATTCA---------...AACGTTAAAAGCTTTAAACCTCATTTGTTGAAGCAAGGTCTTGCAATGGTGGAGAAATAC
ECX2_ARCFU/182-248 GACCTTCCGGTGTCTGTGACGTCGCTGATTGTGGGTAAC------------.........---...............------AAGTATCTC...---GTCGACCCCAGCAGGGAGGAAATGAGC...---GTTGGAGATACGACTCTTACAATCACAACCGAC......AAGGAT---...------------GATAACGTCGTTGCGATGCAGAAA------AGCGGT...---GGTTACCTGCTAGATGAAAAGCTTTTCGATGAGCTTCTGGATGTGAGCATAAACTGC
EXOS7_HUMAN/196-262 AATGTCCCCTGCATTGTCACTCTGTGCAAGATTGGC---------------.........---...............---TATCGGCATGTG...---GTGGATGCTACTCTTCAGGAGGAGGCC...---TGCTCGCTGGCCAGCTTGCTGGTGTCGGTGACC......AGCAAGGGA...---------------GTTGTGACGTGCATGAGGAAA------GTGGGG...---AAGGGCAGCCTGGACCCAGAGAGCATCTTCGAGATGATGGAGACTGGCAAGCGTGTG
ECX2_METTH/191-257 AGGAAGGCCCTCATGTGCACCTTCGCCAAGATAGGAAAC------------.........---...............------GAGATCGTG...---CTCGACCCCTCCCTCGAGGAGGAGGAC...---ATACTCACAGCAAGGATATCCATAGGTGTTACT......GAGGAGGGC...---------------TCCATATGCGCCATGCAGAAGGGT------GGT...---GAGGGGCCACTCACAAGGGATGATGTCCTTAAGGCAGTCTCAATTGCAGTGGAGAAG
RRP45_YEAST/191-271 CATATTCCAATATGTGTAACTTTTTCTTTCTTCAATCCTCAAGAC---ACCgaggaaaacATAaaaggtgagactaacTCAGAAATTTCCATC...---ATTGATGCAACATTGAAAGAGGAA---...CTACTGCGAGATGGTGTATTGACGGTTACGCTAAAC......---------...------------AAAAACCGTGAAGTGGTACAAGTTTCCAAAGCGGGT...---GGTTTACCAATGGATGCGTTGACGCTAATGAAATGTTGTCACGAGGCTTACAGCATT
RRP43_SCHPO/203-269 ACTGAAGTTCGTTCTTTCTCATGGTCAGTATTTGACGAC------------.........---...............------AAGTTGTTA...---GCCGACCCTACAGACGAGGAGGAGGAC...---CTTTCAACTGAATTTTTGACAATTATGCTTAAT......---------...------------AGCTCCAAAAATATTGTTAAGATAATAAAGCTTGGA...---GGCACTCACATTCAACCCCTTTTATTAAAAAAGTGTATTGAGGTTGCAAGGTCTAAG
Q20128_CAEEL/189-257 CATATGCCAATTTGTACAACCATCGGATTATTGGATAAAGGACAA------.........---...............------ATTGTAGTC...---ATCGATCCAACAGATAAAGAAACTGCA...---TGTCTTGATGGATCAATTGTAGTTGCCTGCAAT......---------...------AAGCGTCGCGAAGTTTGTGCCCTCCATCAGAGCACA------...---AATCTCATTTTATCAACAAAGCAGATCGAGCGTTGCGTAAAGTTGGCAATGGCTCGT
RRP43_YEAST/322-384 GATATGGATAAATTGAACACTGTGCTAATAGCAGAC---------------.........---...............---------------...---CTAGATACTGAAGCGGAAGAAACAAGT...ATACACAGTACGATCTCCATCCTCGCTGCTCCTTCA......GGTAAC---...---------TATAAGCAATTAACATTAGTGGGAGGAGGCGCT------...---------AAAATAACGCCAGAAATGATAAAAAGATCATTGTTGTTATCTAGGGTTAGA
RNPH_MYCTU/160-227 TGTGCCATCGCCGCGGTCAGCGTCGGTGTTGTCGACGGCAGG---------.........---...............---------ATCCGG...---GTGGATCTGCCCTACGAGGAAGATTCG...---CGCGCCGAGGTCGACATGAACGTCGTCGCTACC......GACACCGGA...---------------ACCCTGGTAGAGATTCAGGGCACCGGCGAAGGC...------GCGACGTTCGCACGTTCGACACTGGATAAGCTGCTGGACATGGCACTGGGCGCC
RNPH_BACSU/157-225 GATTTTCTTGCTGCAATCTCTGTTGGAATTGATAAGGAACAGGGA------.........---...............---------ATTTTG...---TTAGATTTAAATTATGAAGAAGATTCC...---TCTGCTGAAGTTGACATGAATGTCATCATGACA......GGCAGCGGC...---------------CGTTTTGTGGAATTGCAGGGAACCGGG------...GAAGAGGCAACTTTTTCTAGAGAGGATCTGAACGGTCTTCTGGGTCTTGCGGAAAAAGGA
RNPH_ECOLI/157-224 GGGATGGTAGCCGCAGTTTCTGTCGGAATTGTGAACGGCGAA---------.........---...............---------GCGGTT...---TGCGATCTGGAATACGTTGAAGACTCT...---GCCGCAGAGACCGACATGAACGTAGTGATGACC......GAAGACGGG...---------------CGCATCATTGAAGTGCAGGGGACGGCA------...GAAGGCGAGCCGTTCACCCATGAAGAGCTACTCATCTTGTTGGCTCTGGCCCGAGGGGGA
RNPH_PSEAE/158-225 CAAATGGTCGCCGCCGTTTCCGTGGGCATCTACCAGGGCGTG---------.........---...............---------CCGGTC...---CTCGACCTGGACTACCTGGAGGATTCC...---GCCGCGGAAACCGACCTGAACGTAGTGATGACC......GATGCCGGC...---------------GGCTTCATCGAGGTGCAGGGAACCGCCGAAGGC...------GCGCCGTTCCGTCCCGCCGAGCTGAACGCCATGCTCGAACTGGCCCAGCAGGGC
RNPH_CAUCR/157-224 GGCCAGGTGGCCGCCGTCTCGTGCGGCGTGTTCAACGGCGTG---------.........---...............---------CCGGTG...---CTGGACCTCGACTACGAGGAAGACAGC...---AACGCCGAGGCCGACAGCAACTTCGTCCTGACG......GGCGTGGGC...---------------GACATCGTCGAGATCCAGGCCACGGGC------...GAAAAGCGCGGCTTCACCCGCGCCGAGTTCGAAAGTCTCTACGGGCTGGCCGAGAAGGGG
ECX1_ARCFU/157-225 GGAATGATCACGTCCGTTGCGGTGGGGAAGGCTGACGGACAG---------.........---...............---------CTCGTC...---CTCGACCCAATGAAAGAGGAGGACAAT...---TTTGGTGAGGCCGACATGCCCTTCGCATTCCTC...atcAGAAACGGA...------AAGATTGAGTCCATTGCACTTCTCCAGATGGACGGCAGA---...------------ATGACGAGGGATGAGGTAAAGCAGGCGATTGAGCTTGCGAAGAAGGGA
ECX1_METTH/157-222 GACATGGTTGTTGCCTGTGCAGCAGGTAAGGTCGGTGATCAG---------.........---...............---------GTGGTC...---CTTGACCTCTCTGAGGAGGAGGACAAG...---GAGGGCCAGGCAGACGTACCGGTGGCGATACTC......---------...---CCGAGGACACGTGAAATCACACTGCTCCAGAGTGATGGA------...---------AACCTCACACCCGAGGAATTTGAAAGGGCACTTGACCTTGCAGTGGAGGGA
O25812_HELPY/457-527 GATTTAGTCGCTGGGGTGGCTATGGGCATGGTGAGCGAAGGGCAA------.........---...............GATCACGCTATTTTA...---AGCGATATTAGCGGCTTAGAAGACGCA...---GAAGGCGATATGGATTTTAAGATTGCTGGGAAT......TTAGAA---...---------------GGCATTACGGCCATGCAAATGGATACC------...AAAATGAGCGGTATCAAGCTAGAAATTTTATACCAAGCCTTACTCCAAGCCAAAGAAGCA
O24288_PEA/589-665 TGCTCAATTGCTGGAATTGCTATGGGTTTGGTTCTTGATACCAAG------.........GAAtttggtggagatggaACTCCGCTTATTCTG...---TCTGACATAACTGGATCTGAAGATGCA...---TCTGGAGATATGGATTTTAAGGTTGCTGGGAAT......GAAGAT---...---------------GGCATAACTGCATTTCAGATGGACATT------...AAGGTTGCTGGAATTACTTTGCCCATAATGAGAGAAGCACTGCTACAGGCAAGAGACGGC
PNP_BACSU/459-529 GCGCCAGTTGCTGGTATTGCGATGGGTCTTGTCAAATCAGGCGAA------.........---...............CATTACACTGTCTTG...---ACTGACATCCAAGGCATGGAAGACGCG...---CTCGGAGATATGGACTTTAAAGTAGCGGGAACT......GAAAAA---...---------------GGCGTAACGGCCCTGCAAATGGACATT------...AAAATTGAAGGCCTTTCCAGAGAGATTCTTGAAGAAGCGCTTCAGCAGGCGAAAAAGGGC
PNP_ECOLI/459-529 GCTGCCGTTGCGGGTATCGCAATGGGTCTGGTGAAAGAAGGCGAC------.........---...............AACTACGTTGTACTG...---TCTGACATTTTGGGCGACGAAGATCAC...---CTGGGCGATATGGACTTCAAAGTTGCAGGTTCC......CGCGAC---...---------------GGTATCTCTGCACTGCAGATGGATATC------...AAAATTGAAGGTATCACCAAAGAGATCATGCAGGTTGCGCTGAACCAGGCTAAAGGTGCG
P72659_SYNY3/470-540 AAACCCGTTAGTGGCGCCGCCATGGGTTTAATCAAGGAAGGGGATGAA---.........---...............---ATTCGCATTCTC...---ACCGACATTCAGGGCATTGAAGATTTC...---CTTGGCGACATGGATTTCAAAGTAGCTGGTACC......GATTCC---...---------------GGTATTACCGCCCTGCAAATGGATATG------...AAAATTGATGGTCTGAGCATGGAAGTGGTGTCCAAAGCCATTATGCAAGCTCTCCCCGCC
O32966_MYCLE/501-579 GCGCCGGTGGCTGGCATTGCTATGGGGCTGGTCTCCGACGATGTT------.........GAGtttgacggagggactGAGCGTCGTTTTGTCaccTTGACCGACATCCTGGGCGCCGAAGACGCC...---TTCGGCGACATGGATTTTAAATGCGCCGGTACC......AAGGAC---...---------------TTTGTCACCGCGCTGCAGCTCGATACC------...AAACTTGACGGTATTCCCTCCCAGGTGCTCGCGGGTGCGCTTGCGCAGGCCAAAGACGCC
O25812_HELPY/143-212 AAAAGCGTGAGCGCTTGCAGGATCGCTAGGATGGATAAC------------.........---...............------GAATTTATC...---ATTAACCCTAGCGCAAGCCTTTTGAAT...---CAATCCAGTTTGGATTTGTTCGTGTCTGGAACG......---------...AAA---------GAGAGTTTGAACATGATAGAAATGCGCTCTTTGGGGcaaAAATTGAACGCTTTAGAAGAGCCTTTAATGTTAGAAGCTTTAGAATTGGCTCAAAAAAGT
Q53597_STRAT/154-219 GGCCCGTACGGCGGCGTCCGCGTCGCGCTGATCCGCGGCCAG---------.........---...............---TGGGTGGCCTTC...---------CCGACGCACACCGAGCTCGAG...---GACGCCGTCTTCGACATGGTCGTCGCGGGCCGCgtcctgGAGGACGGC...---------GACGTCGCGATCATGATGGTCGAGGCCGAGGCC------...------------------ACCGAGAAGACCGTCCAGCTCGTCAAGGACGGCGCCGAGGCC
P72659_SYNY3/145-209 GGTCCCATGGCCGCTGTGCGGGTAGGTTTAGTAGGGGATGAT---------.........---...............---------TTCATT...---ATTAATCCCACCTATCGGGAAGTCCAT...---AACGGAGATTTGGACCTGGTGGTGGCCGGTACC......---------...CCCGCC---------GGTATTGTCATGGTGGAAGCTGGGGCG------...------AACCAGTTGCCGGAACAGGACATCATCGAAGCAATTGATTTTGGCTATGAAGCA
Q41370_SPIOL/220-284 AAGCCAGTTGCTGGAGTCCGTGTTGGTCTTGTTGGGGGAAAG---------.........---...............---------TATATT...---GTAAACCCTACAACTAATGAGATGGAA...---AATTCTGAGTTGGATTTAGTAGTAGCAGGCACA......---------...GATAGC---------GCTATCCTGATGATAGAGGGC------------...TATTGCAATTTTCTCCCAGAAGAAAAGCTGCTGGAAGCTGTAGAAGTTGGACAGGATGCA
PNP_BACSU/146-210 GGACCGATTGCAGGGGTTACTGTCGGACGCATTGATGATCAA---------.........---...............---------TTTATC...---ATTAACCCGACAGTCGATCAGCTTGAA...---AAAAGCGATATCAATCTTGTCGTTGCCGGCACG......---------...AAAGAT---------GCGATTAACATGGTAGAAGCGGGAGCG------...------GACGAAGTTCCTGAGGAAATCATGCTTGAGGCCATTATGTTCGGCCATGAAGAG
PNP_ECOLI/147-211 GGCCCGATTGGTGCTGCCCGCGTAGGTTACATCAATGACCAG---------.........---...............---------TACGTA...---CTGAACCCGACTCAGGACGAGCTGAAA...---GAGAGCAAACTGGATCTGGTTGTTGCCGGTACT......---------...GAAGCC---------GCTGTACTGATGGTTGAATCTGAAGCT------...------CAACTGCTGAGCGAAGACCAGATGCTGGGCGCAGTAGTGTTCGGTCATGAACAA
RRP41_YEAST/156-220 GATTACATAAGTGGTATATCCGTCGGGCTGTACGATACT------------.........---...............------ACCCCATTA...---TTAGATACCAATTCATTAGAAGAAAAT...GCTATGAGTACAGTGACACTAGGTGTGGTAGGG---......---------...AAGTCAGAAAAACTTTCTCTTTTATTGGTGGAA---------------...------GACAAAATTCCGTTAGATAGGTTAGAGAACGTTCTTGCCATCGGCATCGCAGGT
RRP41_SCHPO/154-218 GATTTCGTTTGCTGTAGTACAGCTGGGATTGTTGAGTCTGAT---------.........---...............---------ATGCTG...---TTGGATTTAAACTCACTAGAGGAGTCA...GCTCTTTCATGGTTGACGGTTGCTGTTTTGGGGAAC......---------...---------ATAAAAAAGGTCGTATATATGCAGCTGGAAACT------...---------AGTATGCATTTGGATTATTTGGAGTCAGTAATGAATATGGCGATCGCTGGA
EXOS4_CAEEL/150-215 GGCATCGCATCTGCAGCGACGTGTGGTGTTGTCGATGGAAAA---------.........---...............---------CCAATT...---GTTGATCTTACTTCTAGAGAAGAAACTgatCTCCTTCCCAGAGTTACTCTCGCCACAATCTGCGGT......---------...---------CGTGACGAAGTGATTCTCGTGGAACTTCAA---------...------AATCGTCTTCACATTGATCATCTTTCCACAGTCATGGATGCAGCGAAAGCCACG