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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF03601 alignment
(13 sequences with 1044 bp)


Y1461_PASMU/8-314 CTTGGCTTAGTTTTTATTGGCATCTTAACTTTTCTAGTGAATCTT---------------------TTGGCGAAAACGCCT...TTCGCTCTCAATGCCAACCTCAGTGCACTGACGATTGCGATTCTGTTAGGTATTTTATTCGGCAACACTTTTTACCCCAAAATTTCTCAATACACCGCGCAAGGCGTGATTTTTGCCAAAGGCACCTTATTACGCTTAGGTATTATTTTGTATGGCTTTCGCCTCACGCTACAAGACATTAGTAACGTTGGCATAAATGCTATTGCGACGGATACCATTATGCTGATTAGCACTTTCTTGCTCACCTTGTGGCTAGGGATTCGTTATTTAAAAATGGATAAACAAATTGTGTATTTAACTGCTGGTGGTTGTAGCATTTGCGGTGCTGCCGCGATTATGTCCATGCAACCGGTCACCAAAGCGGAATCCCATCAT---------GTGTCGATTGCGGTGGCAGTGATTGTGATCTTCGGCACGATTTCGATGTTTTTATACCCCCTCATGTACCCCTATCTTGCCACATGG...---TTGAAC...---GAGCATCAGTTCGGCATTTATATTGGTTCGAGCGTGCATGAAGTGGCACAAGTGTATGCCGCAGGGGGCAATATCAGCCCTGCGGTGGCAGAT------......------ACCGCCGTGATTTCCAAAATGATCCGTGTGATGATGCTTGCTCCGTTCTTATTGTTGGTATCTTGG......CTGTTGACCAAGCAAAATGATCAGGCAAAAACCACGAAC---------------ATCAGC---------------ATTCCTTGGTTTGCCTTTTTATTTATTTTGATGGCAGTGATCAATTCCTTTTCACTCATTCCC---...............------GCCCACATTGTGGCGTGGATTGTGGAAATTGACAGCTTATTACTGATCGCCGCCATGACGGCACTTGGCTTAACTACGCACATCAGTGCCATTAAGCAAGCAGGGATCAAACCACTGATTTTAGGC
Y1643_HAEIN/8-316 TTCGGACTTATATTTATCGCGATTATCGCTGTACTTGCTAACTAT---------------------TTAGGAAGCACCGAC...TTTTCCCATCATTATCATATCAGTGCCTTAATTATTGCCATCTTACTGGGAATGGCAATCGGCAATACCATTTACCCGCAATTTTCTTCACAAGTAGAAAAAGGCGTATTATTTGCGAAAGGCACGCTTCTTCGTGCTGGCATTGTGCTGTATGGTTTTCGTCTCACTTTTGGCGATATTGCCGATGTTGGCTTAAATGCTGTCGTCACTGATGCCATTATGCTAATTTCAACCTTTTTTCTTACCGCACTTTTGGGCATTCGTTATCTAAAAATGGATAAACAATTGGTTTATCTCACTGGGGCAGGATGTAGTATTTGTGGTGCGGCAGCGGTTATGGCGGCAGAGCCTGTTACCAAAGCAGAATCTCATAAA---------GTTTCAGTGGCGATTGCCGTAGTGGTCATTTTCGGGACGCTTTCTATTTTTACTTATCCATTTTTCTACACTTGGTCACAACATTTA...---ATTAAC...---GCTCATCAATTCGGTATTTATGTTGGCTCTAGCGTGCATGAAGTGGCTCAAGTTTACGCTATCGGGGGAAATATAGATCCTATCGTGGCGAAT------......------ACCGCCGTCATTACCAAAATGCTCCGAGTGATGATGCTTGCACCATTTTTATTCATGCTTTCTTGG......TTATTAACACGTAGTGATGGGATATCAGAAAATACATCACAC---------AAAATTACA---------------ATTCCTTGGTTTGCTGTACTTTTTATTGGCGTTGCCATTTTTAATTCTTTTGATTTATTACCA---...............------AAAGAACTCGTGAAATTATTCGTTGAAATCGATTCTTTCTTATTAATTTCAGCGATGGCTGCACTTGGCTTAACTACGCAAGCAAGCGCAATCAAGAAAGCTGGATTAAAACCGCTTGTTTTAGGC
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Y5383_PSEAE/21-335 CCCGGCCTGCTGCTCAGCGCCGCCCTGGCCGGCGTGGCGATCCTC---------------------CTGGGTCGTTCGCAA...TGGTTGCAGCACAACGGCATCAGCGCGCTGACCCTGGCCATCGTGCTCGGCATCCTCGTCGGCAACACCCTGTACCCTCGGATCGCCGCCGGCAGCGCCGCCGGCGTCGGCTTCTCCAAGCAGATCCTGCTGCGCGCCGGGATCATCCTCTACGGCCTGCGCCTGACCTTCCAGGACATCGCCGGCGTCGGATTGCACGGCGTGCTGCTGGACGCCCTGATGCTCGCCAGCACCTTCGGCCTGGCGTGCCTGCTCGGCACCCGGCTGTTCGGCCTGGACCGCACCACCACCCTGCTGATCGGCGCCGGCAGTTCGATCTGCGGCGCCGCCGCGGTGATGGCCACCGAGCCGGTCGTGCGTGGCCGCGCCGAACAG---------GTCGCGGTGGCGGTTTCCACCGTGGTGGTGTTCGGCACCCTGGGCATCTTCCTCTATCCGGCGCTGTTCCAGCTCGACCAGGACTGGgggCTGCTACCGcgcGACCCTGGCACCTGGGGCGTGTACATCGGTGCCACGGTGCACGAGGTGGCCCAGGTGGTCGCCGCGGGTCGCTCGATCGGCATCGAGGCAGCGGAT------......------ACCGCAGTGATCGCCAAGATGGTCCGGGTAATGATGTTGGCGCCCTTCCTGATCCTGCTCTCGGCC......TGGCTGGCACGCGACAAGGCGCACCGCCGGCAGCACAGCGGC---GCGACCAAGATCACC---------------ATTCCCTGGTTCGCCGTCGGCTTCGTACTGGTCGCCGGGCTCAACTCGCTGGTCAGCCTGCCG---...............------CCGGCGCTGGTCAGCCACGTCAACGACCTCGACACCTTCCTCCTGGCCATGGCAATGGCCGGCCTCGGCCTCGGCACGCACCTCTCGGCGATCCGCCGCGCCGGCCTCAAGCCGCTGCTGCTGGCC
Y2225_RHILO/7-307 CCCGGCCTCGTGCTGGTGGCGATGATCACAGCCGTTGCCTTCTCG---------------------GCGCACAATGTTTCC...------GGCTTTGCCCTGTTCAGCCCGATGATCCTGGCCGTCGTCGCCGGCATGGTCTATTCCAAC------GTGCTCGGTACGCCGGCGCATGCCAAGGCCGGCATCGCCTTCTCGCAAAAGCGCCTGCTGCGCTTTGCCATCGTGCTGCTCGGCTTCCAGCTGACGCTCGGCCAGGTCGTCTCGATCGGCGCCGGCGGGGTCGGCATCGTGGCGGCGACGCTTGGCGCCACCTTCGTCTTCACCATCACGCTCGGC---CGGCTGATCGGCGTCGACCGCAAGCTCGCGCAGCTGATCGCCGCCGGCACCTCGATCTGCGGCGCCTCGGCCATCGTCGCCACCAACATCGTCACCGATGCGCGCGACGAGGAC---------GTCACTTATGCCGTCGCCTCGATCACGCTGTTCGGCACCGTCGCCATGCTCGGCTTCCCGCTGCTCGCACCCGCGCTCGGCCTCGAC...---------...---CAGCATGCTTTCGGCCTGTGGGCCGGCGCCTCCATCCATGAGGTGGCGCAGGTCATCGGCGCCGGTTTCCAGAACGGCACCCAGTCCGGCGAG------......------ATCGCCACCGTGGCCAAGCTGACGCGCGTTACCATGCTGGCGCCGATGGTCATCGCGCTCGGC---......CTGATGGCACGGCGCAAGACGAGCGGCGGCCAGCAGGCTGCG---------CGGCCGCCC---------------ATGCCGTGGTTCGTCGCCGCCTTCGTCGCCGTCGTGGCTCTGAACAGCCTGGTCACCGTACCG---...............------GCGGAAGTAAAATCGGCGATGGCGCTCGCCACCACCATCATGCTGACCATGGGACTGGCTGCCATGGGCCTGCAGGCCGACATTTCGCAGCTCCGCTCGCGCGGCCTGCGCCCGCTGGCGCTCGCC
Y999_CAMJE/18-342 AAGGGTTTGCTTTTTACTGCTTGTATAGTGATTTTTGCTATGTAT---------------------CTTTCTAGTGTTCAAagtATCAAAGATACCACTCATTTAGCAGCGACTGCTTTTGCTATTATCATAGGAGTGTTGCTTTCT---CCTTGGTTTTTTAAATACCAACATCATTTTCAAGCCGGAGTGCATTTTAGTGCGAAAAAACTTTTAAGACTTGGCATTGTTTTATATGGTTTTAATATCACTTTAACTGAGCTTTTAAGTGTAGGATTGAAAGGATTTTTGCTTTCTGCTATAGTGATATTTTTTGTTTTTATTATTGCTTTATTTGTGGGAACGAAAATTTTTAAACTCGATAAAGAAACTTCTATGCTTGTTGGAGCTGGAAGTGCGATTTGCGGTGCGGCAGCGGTTTTAGCACTAGAGTCAAGTTTGAAAAGTGATCCTTTTAAG---------GGAATTTTAGCTGTAGGTACGGTGGTGATTTTTGGACTTGTATTTATGTTCTTATATCCCATAGCTTTTTCTTTAAATCTTTTTCCT...TTTTTTGAT...---CAAAATGCTATGGGTGTTTTTATGGGAGCTACGTTGCATGAGGTGGCAAATGTCGCAGGTGCTGCTGAAATGGCAAAGGATATGGCAGGATTTGAGCAAggtgctTCTAATGTTGCAGTGATTATAAAAATGATGAGAGTGATTTTACTTGTGCCTTTTTTGCTTATAGTGACTTAT......TTTTTCGCTAAAAATCAACATTCAAGCAGTGGAAAAACTGCAAAA------AGTATCACT---------------ATACCTTATTTTGCTTTTGCATTTTTAGGCATGATAGTTTTAAATACTTATTTAGCAAGCAAAGAAagtattttaggtattGCTACGAGCGATATCATCTCTTTAGGTAAAACACTTTGTACTTTATGTATCGTTTTTGCTATGGCAGCTTTAGGCTTGCAAATTGACTTTAAAAAATTTTTAAAAAGTGGCTCTAGGGTATTTGGCTTGGCT
Y341_STAAM/11-311 ATTGGACTATCATTAACATTTATAGTCGCATTATTTAGCTTTTTA---------------------GCAGCTAAATTGCCA...------ATCTTAGATAAGGTTGGCGCATTAACTATCGCGATATTAATCGCTATTCTATATCGT------CACTTTAGAGGATATCCTGAACAATATAGCTCAGGTATTACGTTTTCATCTAAATATTTATTAAGATTTGCAATCATCCTATATGGACTTAAACTCAATATATTCGATATTATCGGTCAAGGTAGTAAACTATTAGCCATCGATGTAGGTGTCGTTATTTTCAGTATTGTAATGATGCTCTTTGTCAAC---AAACTGTTGCATGGTGACAAAAACATCGCATTATTACTAGGTGTCGGCACAGGCGTTTGTGGTGCTGCCGCTATTGCCGCAGTCGCTCCAATATTCAAATCACGTGAAAAGGAT---------ACAGCTATTAGTATCGGTATCATCGCATTGATTGGTACGATATTCTCACTTATATATACAGCTATCTACGCTATCTTTTCAATGACG...---------...---ACAAATGTTTATGGCGCTTGGTCTGGTGTTAGTCTTCATGAAATTGCGCACGTTGTCTTAGCTGGTGGCTTTGGTGGTAGTGATGCACTTAAA------......------ATTGCACTTCTTGGTAAACTTGGTAGAGTATTCTTACTGATTCCATTAACCATCGTACTTATTTTA......ATTATGCGTTTCCGTTCATCAGAATCATCTAGCAAGGGT------------CGAATAAGC---------------ATTCCATACTTTTTAATTGGATTTGTCATTATGGCCTTAGTGAATACATATGTAACTATTCCA---...............------TCAGTATTGTTAAATATTTTAAATACTATATCAACAATTTGCTTATTAATGGCCATGGTTGCTTTAGGGTTAAATGTTGCATTTAAAGATCTTAAAAATCGTGCACTTAAACCGCTTATGACAATC
Y034_STRPN/9-315 GCAGGTATCTTGGCCTGCCTTCTCATTTCCATCCTATCTTGGTAC---------------------TTAGGAGGA------...------TTCTTCCCTGTGGTTGGCGCGCCCGTTTTTGCCATTTTCATAGGCATGCTCCTACAT------CCCTTTCTCTCGTCCTATAAACAACTGGATGCTGGTTTGACCTTTAGTTCCAAGAAGTTGCTCCAATATGCCGTTGTCTTGCTTGGTTTTGGTCTCAATATCTCGCAGGTCTTCGCAGTTGGCCAA---TCTTCACTCCCTGTCATCCTGTCCACTATCTCAATAGCTCTGATTATTGCCTACCTCTTCCAGCGTTTCTTTGCCCTGGATACAAAACTGGCTACCTTGGTTGGAGTAGGTTCTTCTATCTGTGGGGGTTCTGCCATTGCAGCGACAGCGCCCGTTATTGATGCTAAGGAAAAGGAA---------GTAGCCCAAGCCATTTCCGTTATCTTTTTCTTCAATGTCTTGGCTGCGCTCATCTTTCCAACCCTCGGCACCTGGCTTCATCTATCC...---------...---AATGAAGGCTTCGCCCTCTTTGCAGGGACTGCGGTCAACGACACTTCCTCTGTAACGGCTGCCGCCAGCGCTTGGGACAGTCTTTACCAAAGCAATACC......CTCGAGTCTGCAACCATTGTTAAACTCACACGTACTTTGGCCATTATCCCTATCACGCTCTTTCTATCCTAC......TGGCAAAGTCGCCAACAAGAA---------AACAAGCAAAGCCTGCAACTGAAAAAAGTC---------------TTCCCACTTTTTATCCTTTACTTTATCCTTGCCTCTCTCCTCACTACACTACTCACCTCTCTAGGT...............GTGTCCAGTAGTTTCTTTACTCCTCTCAAAGAACTCTCTAAATTCCTTATTGTCATGGCCATGAGTGCTATCGGTCTCAAAACCAATCTGGTCGCTATGGTCAAATCCAGTGGAAAATCCATTCTTCTTGGA
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YDHF_LACLA/5-311 CCAGGCTTTCTGCTCTCCTTTGCCATTGCTATAGTAAGTTATTTA---------------------CTCAATCGT------...---TTCATCTTCCATAGTTTAGGTTCAGCAACCATTGCAATATTATTAGGAATTATTTTAGGTAAT------TTGTACTTCAAACAAGTCACTTTATTTGCAGGAACAGCTTGGTCAGAAAAAAAACTTCTGGAATTTTCAGTGATGTTTTTAGGGGCCACAGTCACTTTCCAAACCATTGGTAAGTTAGGATTCTCCGGAGTAGGATTTATACTAATACAAATGATTTCAACAATTATTTTTGTTTTGTTTATGGGT---AAAAAACTAGGATTTTCTGCTAATGTTTCTGCCCTAATGGCTTCTGGGAATGCAGTTTGTGGTTCATCAGCAATTGCCGCAGTTGAACCAGTTATTGGAGCTGAAACCAGTGAG---------AAAAGAACATCGATTGCGATGGTCAATCTTATGGGAACTATTTTAATGCTAAGTCTTCCATTTTTAGGAACTTGGATGTTCGGTAAT...---------...AATGATTTATTAAGGGGGGCACTGATTGGTGGAACAGAACAATCTGTTGGTCAAGTCGTTGCTTCAGCAACAATGGTAAATCCAAACACAACAACC------......------TTAGCCACTCTATTTAAAATTATGCGAATTATCATGCTCGTTTTTGTTGTTTTATATTTTGGTTTCagaagtAAAAAACAAAAAAGAAATGAACAAGGACCTACTCAAATAAAAATTAAAAGAAATTCTTTT---------------TTACCCTGGTATGTTCTTGGTTTCTTAGTGCTTTGTACTTTAGATACATTGATTCATTTTGTG---...............------CCGGAAGTTTCAGCTACCGCAAAATTTCTATCCGGTTGGTGTGAAACCATTGCCTTAGCTGCTATTGGTTTACGACTAAATTTGGTTGAATTTATAAAAGCAGGAAAAAAATTACTGATTTATGGT
Y425_CAUCR/147-446 CCTGGCCTGCTGGCCGGTCTGTTGATGGCGGTGCTGGCCAAGCTC---------------------CTGTCCCAGAGC---...------------CTGCACGCCCCGGCCCCGCTGCTAGCGGTGGTGCTGGGCATGATGCTGGGC---------GCGCTGGGTCTGCAGGGGCAGCTGGGCGCGGGGCTCGACGTGTTCGCCAAGCCGGGCCTGCGGCTGGGCGTGGCCATGATGGGCGCCCAGATCAGCTGGAGCGAGTTCGCCGCCCTGGGCGGTCCGGCCGTGCTGGCCAGCGGCGCGGTGGTGCTGGGCGGCCTCGGGATCGGAGCCCTGGCCGGC---GCGGCCCTGGGCCTGCCGCTGGCCGAGGCCCTGATCGCGGCGGCCGCCTGCTCGATCTGCGGCGCTTCGGCGGCTCTGGCCGCCTCGCAGGCCGCCCCGTCCAGCCCCGAGAACCAGCGCACGACGGCCCTGGTCATTGTCGGGGTCAACCTGCTCTCGACCGTGGCCATGCTGGCCTATCCGCCGATCGCCAACGCCCTGGGTTTGACC...---------...---GCGCACCAGGCCGGCGTGTTCTTCGGCCTGTCGATCCATGACGTGGCGCAGGTGGCCGGCGCCGGCGCCTCGGTGTCGCCGGAGGTCGCGGGG------......------ACGGCGGCGTTGGCCAAGCTGTCGCGGATCCTGTGGCTGGGCCCGGCCGTGGTGCTGATCGGCCTG......ATGCTGACCCGCACCGCCCAGGGCGGCCGGATCTCCGGC------------CTGCAGGCC---------------CCGCCGCTGTTCGTCTGGGGCTTCGCCGCCCTGGCCGCCGCCCGGGGCCTCAATCTGATCCCG---...............------CCGGCCCTGGTGTCGGCCCTGGGCGCCTGTTCGGGCTTCCTGCTGCTGGCCGGTGTCGGGGCCATCTCGGCCAAGCTCGGCCCCAAGGCCCTGCTCGAGGTCAAGCCGCGTCTGGCGATCCTGCTG
Y2119_MYCPA/67-384 CCGGGCATCCTGCTGCTGATCGGCGTGGGGGTGTTGGGCAAGTACGCCCAGATCTGGTGGAACGCGCTGGCCAAACACGAG...CACTGGACGGTGCCCGACATCGAATATGTGTTGTGGGCCATCGTGATCGGGCTGGTGATCACCAAC------ACCGTCGGGCTGCACCCGATCTTTCGGCCCGGCGTGCTGACCTACGAA---TTCTGGCTGAAGGCCGGGATCGTGGCGCTCGGTTCGCGATTCGTGTTGGGCGACATCGCCAAGCTGGGCGGG---ATCAGCCTGGTGCAGATCCTGGTGGACATGACCATCGCCGGGACGATCATCATCGCCGTGGCCCGCTGGTTCGGGTTGTCGGGCAAGCTCGGTTCGCTGTTGGCGATCGGCACGTCCATCTGCGGGGTGTCGGCCATCGTGGCGGCCAAGGGCGCGATCCGCGCGCGTAACTCCGAC---------GTCAGCTACGCGATCGCCGCGATTCTGGCGTTGGGCGCGGTGTCGCTGTTCGTGTTGCCGCCGCTAGGGCATGCGATCGGGCTGACC...---------...---GATCACGAATTCGGTTTGTGGGCAGGGCTTTCGGTGGACAACACCGCCGAGACCACCGCCACCGGATACCTGTACTCCGAGCACGCCGGCAAG------......------ATCGCGGTGCTGGTCAAGTCGACCCGCAACGCGCTGATCGGTTTCGTGGTGCTGGGTTTCGCGCTG......TTCTGGGCGGGCCGCGGGCAGGCCGACGAGATCGCCCCGGGGGTTCGGGCCAAGGCCGCCTTCATCTGGGCCAAATTCCCGAAGTTCGTGCTGGGCTTCCTGGTGGTCTCGGCGATCGCCACCGCGGGCTGGCTGACC---...............------AAGGGCCAGACGGCCAACCTCGCCAACGTGTCGAAATGGGCGTTCCTGCTGACCTTTGCCGGGGTGGGGCTCAACACCGACATCCGCCAGATCGCCCGCACCGGGTGGCGCCCGCTGGTGGTCGCG
Y1621_ARCFU/22-308 CAGATGCTATTGCTGCTTTTACTTTGCGGTGCAGCTGCTTATATC---------------------ATAAACCTTGCTGAT...------------CCTGCCCTTGAACCCCTCTTTCTGGCTCTTGTTTTTGGTATAGTGGCGGGAAAC---------CTCCAGAGGGACGAGGAAAAGAAAAGAGTGGTTGAGAGATACGTTCCCTTCCTCCTCCCCATTGGTATAACCCTTTACGGTGTGAACATCAACATCCCCTATCTGGGCGAGTTCCATCCAGAAATTGTGGCTGCAACGCTCATCTCAACCTCCCTAATCTTTCTCACCGTTTTCTGGCTCTCG---TCTCGGTTAAAGCTAAGCAGGCAGATGTCCATTCTTCTTGCCTGCGGAAGTGGTATTTGCGGTGTTTCGGCAATTGCAATAATCTCTCCCCTTATAAAACCAAGGAAAGAGGAG---------TTTTCGGCAGCAATTATGATTATAACAGCCGTAGGGCTCACTGGAGCTATACTGTATCCAAGCATAGCCCACTACGCCAGCATCTCC...---------...---CCCGATGAGTTTGCCGTTCTTGCAGGGGCTACGCTTCACCAAACGGGGATTGTGAAAATCTCCTCTCAGCTTTTTGGTGTTGAGGAAGAGGCA------......------CTGGCGATAAAAGGA------ATCAGAATTGCAATGATAGCCCTCGTCGTCCTCATTCTTTCA---......---ATAATCTACTCGGAGAGC------------------------------AGGTTTTAC---------------GTACCGTGGTACATCGTGAGCTTCCTTGGAGTGGCGCTGTTCTCCTCAACCTATTTGCCGGGA---...............---------GAGGTCGTGCAGGCATTGAGACCGCTTGCCACTGTGATGTTCGCCACGACTCTTGCGGCAATCTGCTACACGGTAAACGTAGGAAGGGTGCAGAGGGTTGGAGTGAAGCCTCTTTTTGCCTCA