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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF03391 alignment
(11 sequences with 528 bp)


POL2_BRAV/1268-1433 CCCACCCTCGTTTTGCCTCAAGCATTTGGGGGTGATTTACCATTAGATTTGTGGCGTGGCCCCTATACCTTCCCATTAGGGGGGGGTACCAAGCGTTTATCCACTTCGTTGGATATTGGGACGTCGACAACGACCGTTAGTGGGTGGCGTACTGTTTCTTTTCCCGCTGCTTATGCTCTTTTCTTACAAGGGCATGGTGGTAGTTTAGTTGGTGAGGTGGTGCATACTGGTTCGGCCGCTGTGTCATGTGCACTTCACCTTTGTATATCCTTTGGCGGTGCCCCTCCTACTTTGGAGGAAGCACTCGTCTTTCCTGGTTTTCGTTTACCTTCCGGTGAGGGCAAATTTCATATTAAGGTACAAACGCCATATGGGCGATTAAGCACTTTAACTCCAGACTGTGCCTTATATGTTTATTTAGCCGGA------------------------GGACCTATTGCTGTTGCACCAATGTCGGTGCCCTATCAATTCTGCATCCATTTGGAGAGATTGGTAGATGAT------
POL2_TORVR/1497-1662 CCTTTTATTACCTTACCCCATATTTTT---AATAGATTAGATATAGGTTATTGGCGCGGGCCAACAGAGATAGATTTAACATCAACTCCCGCACCAAACGCCTATCGTTTACTTTTCGGCTTGTCCACTGTCATTAGTGGTAACATGTCGACTTTGAATGCCAATCAAGCCTTATTGCGTTTTTTCCAGGGCTCGAATGGCACTTTACATGGGCGCATTAAAAAGATAGGGACAGCACTTACAACCTGTTCCCTTTTATTATCGTTGCGCCACAAAGATGCGAGTCTCACATTGGAGACCGCATATCAAAGGCCCCATTACATTTTGGCT------GACGGACAAGGGGCTTTTTCATTACCAATTTCTACCCCCCATGCAGCAACCTCCTTTTTAGAGGACATGTTGCGCCTGGAGATTTTTGCT------------------ATTGCTGGGCCTTTTAGTCCCAAAGATAATAAAGCAAAATACCAATTCATGTGTTATTTCGATCACATAGAATTGGTT---GAG
POL2_RRVS/768-936 CCTACTTTTGTATGGCCCCCGAAGCCG---ACTGATATATCTCTTCTTAAGGAAGTATGGGGGCCATACCGTTTTACGCTGGATGGTACCGAGGCCAAAGAAAGTTTTGCTATAATGCCCGGTACAGCTATTCTCCATGGGCAGCAGATTGTGCGCACATTTCCCCGAGTCGTTGCCGCACACTTCCGATCATGGACTGGAAAGGTCAGGATGTCCATTCAAGAGGTTTCCTCTATTTTCCTGACCGGAACATATATGGTTGGTGTGTCCTGG---AATGCTACTGCGGATCTCGCCGACATCGTCACTCGGAAACATTGGATTGTAAAGTCC---AATGAGATTTTTGAGGTGGACTTATATTGTCCATATGGTGAGAATCCTACCTTTACGGGTCAGGCCAATGGAAAGCCATTCATCATAGTGCATAAA------------CTTGGTGGAATCGTTGGGCCCAAGGACTCAGTTGGGACGTTTGGTTTTATGATACACATACACGGCTTGACTGGTGTATATAAG
COAT_TRSV/179-344 CCAACTATGACGTGGCCTATTCAATTG---GGTGATACTTTCGCCATTGATAGATATTATGAGGCGAAAGAGATTAAACTTGATGGGTCAACCTCCATGTTGTCCATATCTTATAATTTTGGAGGTCCCGTTAAGCATTCTAAGAAACATGCCATTTCATATTCCCGGGCAGTTATGTCTAGGAATCTTGGGTGGTCTGGCACTATAAGCGGAAGTGTCAAGAGTGTTTCTTCTTTATTTTGTACCGCTTCTTTTGTCATTTTTCCATGGGAGTGTGAAGCACCTCCAACCCTACGTCAGGTGTTATGGGGCCCACATCAGATAATGCACGGA---GATGGTCAATTTGAAATTGCTATCAAGACTCGTCTTCATTCAGCTGCTACA---ACTGAAGAAGGGTTTGGTAGACTTGGCATACTCCCG------------------CTCTCCGGGCCTATAGCTCCTGATGCACATGTTGGGTCATACGAGTTTATTGTACATATAAATACTTGGCGGCCCGAC---TCT
Q88483_9COMO/1003-1166 AATCCACTGACATATCCCATAAAGCCG---GGGCACCTAGAAGATTTGGATCTTGTTCTCAAGTCCGGCAGTATTGCTATAGGCACTTACACTATGACTAAGGTGCCTGTTTCTCTTGCCATGCGTGTGGATTCAGCTGCAAAACGCCAGGCATATTCTTATGCAGCTGGAGTACTGTCCCATTTCTTGGGAGTTGGTGGTGATATTATATTTAGTGTACACAGCACTGCAAGTACTTTTGTTTCTTGCAGCTTACGTGTTGCA---CTCTGG---GGTACAATCCCAACCACCGAAGAACTGGCACAGATACCACATGTGGACGTCACCCTT---GACGCAAAGGCAACTTTGCAGATTCAGTCTCCTTTCTTTGCCACGGCAAAT---TTTGGCGACGACGGGACGGCATTTTACATTGCTACT------------------CTATGCGCACCTCTGGCACCAGAGACCATGGAAACTGGATTCCAATACTACATACACATCCATGGTATCAATGCCAAA---GCC
POL2_BRSV/1007-1170 CAGCCCTTGTCATATCCTATTGAGGCT---AGGCATCTTACAGATCTAAATCTGATGCTGGCCCCAAAACAAATTGCTGTTGGGACTTATGCAATGATAACATTTCCAGTATCCCTAGCAGCAAAACTGCAATCAACTTCTGGTAGAACCGCTTATTCTTATGCGGCTGGTTTGTTGTCCCATTTTTTGGGAGTGGGCGGTACAATTCATTTTGTGGTGCGTACTACTTCTAGTGCTTTTGTTACTAGTAAGTTGCGTATTGCT---CTATGG---GGTACAGTACCCGAGACAGATCAGCTTGCACAGATGCCGCATGTTGATGTAGAAGTG---AATGTTGATGCAAGCCTGCAGATACAATCTCCCTTCTTCTCAACTGCTAAT---TTTGGAAATAGCGGATCGGCCTTTTATGTGTCGACT------------------CTATGTGCACCCATGGCACCAGAGACAGTAGAAACCGGATCTGAGTATTACATTCAGATCAAAGGTATTGAGGCGAAT---CCT
POL2_GCMV/981-1144 AGTATTGTGACATACCCTATTAGTCTA---GAACATTTGAAAGACATTGAGATAATGCTTCCCCCTCGCCAAATGGCAATTGGGAATGCTGGCTCAATAAATTTTCCACTGTCTTTCGCGGTGCAGCAGAAATCCAGCAGTGGCCGAATTGCATACTCTTATGCTGCTGGTCTTTTGTCACATTTCCTGGGGATAGGGGGTACAATACATTTTAAAATACAATGTACCTCCAGTGCCTTTGTTACGGCACGTCTCCGGGTTGCG---TTATGG---GGGGATACCATAACATTAGAACAGTTGTCCCAGATGCCACACGTTGACTGTGATGTT---GACGTTGTATCATCTCTAAAGATACAATCCCCTTTTTATGCAACTGCAAAT---TTTGGGGATAGTGGGGCACGATTTTGGGTAACCCCT------------------ATGAGCTCTCCCATGGCACCTGAGACCATGGAATCCAAATTGGAGTATTATATCCAAATTTTGGGTATCGATGCTGAT---CCG
Q65029_ARMV/745-916 CCCAACTTCATTTATAGCGCTGACGCT---TTTAATGGGTCTCTCAAGTTTCTGACTATCCCACCACTGGAATATGACTTAAGTGCAACCAGTGCCTACAAGAGTGTGTCCCTGTTATTGGGGCAGACTCTTGTTGACGGTACTCATAAGGTGTATAATTTTAATAATACACTCTTGAGTTACTATTTAGGCATTGGGGGTATTGTCAAGGGAAAGGTGCATGTTTGTAGCCCTTGCACTTATGGCATAGTCCTAAGAGTTGTTAGTGAATGGAACGGGGTCACTAACAACTGGAATCAACTGTTTAAATACCCCGGGTGTTACATCGAGGAG---GATGGGAGCTTTGCTATTGAAATACGCTCCCCCTACCACCGAACTCCACTTCGCTTAATTGACGCGCAATCAGCAAGCTCTTTTACGAGTACGTTGAATTTTTACGCAATCTCAGGGCCCATAGCCCCAAGTGGAGAAACAGCGAAGATGCCAGTAGTCGTGCAAATTGAAGAAATCGCACTT------CCG
POL2_ARMVS/792-963 CCCAACTTCATTTATAGCGCTGACGCT---TTTAATGGGTCTCTCAAGTTTCTGACTATCCCACCACTGGAATATGACTTAAGTGCAACCAGTGCCTACAAGAGTGTGTCCCTGTTATTGGGGCAGACTCTTGTTGACGGTACTCATAAGGTGTATAATTTTAATAATACACTCTTGAGTTACTATTTAGGCATTGGGGGTATTGTCAAGGGAAAGGTGCATGTTTGTAGCCCTTGCACTTATGGCATAGTCCTAAGAGTTGTTAGTGAATGGAACGGGGTCACTAACAACTGGAATCAACTGTTTAAATACCCCGGGTGTTACATCGAGGAG---GATGGGAGCTTTGCTATTGAAATACGCTCCCCCTACCACCGAACTCCACTTCGCTTAATTGACGCGCAATCAGCAAGCTCTTTTACGAGTACGTTGAATTTTTACGCAATCTCAGGGCCCATAGCCCCAAGTGGAGAAACAGCGAAGATGCCAGTAGTCGTGCAAATTGAAGAAATCGCACTT------CCG
Q67703_GFLV/166-336 CCAACTTTGGTTTTTGACCCAGGTGTT---TTTAATGGTAAATTCCAATTTCTCACTTGCCCTCCCATATTCTTCGATTTGACGGCCGTCACGGCTCTTAAGAGTGCTGGGCTGACATTGGGACAAGTCCCAATGGTTGGCACTACTAGGGTTTATAATCTAAATAGCACTCTCGTAAGCTGTGTTTTGGGTATGGGAGGTACTATTAGAGGAAAGGTGCACATTTGTGCTCCAATCTTCTATAGTATTGTTTTGTGGGTCGTTAGTGAGTGGAACGGGACCACTATGGATTGGAATGAACTTTTTAAGTATCCCGGGGTGTATGTGGAAGAG---GACGGAAGTTCTGAAGTCAAAATTCGCTCTCCATATCACCGAACGCCTGCTAGATTGCTTGCTGGTCAAAGTCAGAGGGACATGAGCTCT---CTAAATTTTTACGCAATAGCAGGGCCTATCGCTCCATCGGGTGAGACTGCGCGACTTCCTATCGTTGTGCAGATTGAAGAAATTGTGCGC------CCG
POL2_GFLV/771-941 CCAACTTTGGTTTTTGACCCAGGTGTT---TTCAATGGCAAATTTCAATTTCTTACTTGCCCTCCCATATTCTTTGATTTAACGGCCGTCACGGCCCTTAGGAGTGCTGGGCTGACATTGGGGCAAGTCCCAATGGTTGGCACCACTAAGGTTTATAATCTAAACAGCACTCTTGTGAGTTGTGTTTTGGGTATGGGAGGTACTGTTAGAGGGAGGGTGCACATTTGTGCGCCAATCTTCTACAGTATTGTTTTATGGGTCGTTAGTGAGTGGAACGGGACCACTATGGACTGGAATGAACTTTTTAAGTATCCCGGGGTGTATGTGGAAGAG---GACGGAAGTTTTGAAGTAAAGATTCGCTCTCCATATCACCGAACTCCTGCCAGATTGCTTGCTGGTCAAAGTCAGAGAGACATGAGCTCT---CTTAATTTTTATGCAATAGCAGGACCTATCGCTCCTTCGGGTGAGACTGCGCAACTTCCTATTGTTGTGCAGATAGATGAAATTGTGCGC------CCA