EMBL-EBI > Goldman Group

PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam



PANDIT Homepage
pan•dit
PANDIT
Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF03323 alignment
(10 sequences with 503 aa)


O07504_BACME/25-507 QTVSSLKNLLS-----E-----NLTLIKEKTGNSSDIVIRHFKIGVN.NSLAAAIVYIEGIVDN----QAIQDYLLQ-SLMKDNQKND.LNDQNALELISEDIVTMGNVSFADNWNDLLSSLMSGDSLLIVDGIN-RVLSVSTQGGEKRAIAESTTQMVVRGPKGAFTESIGTNLAMVRRIIKTPDLWLESMKIGRVTKTDVTLMYIHGIANDKVVKEIRKRLKNIDIDSILE-SGYVEQLIEDQTVTPFPTIYNTERPDVVAGNLLEGRIAIFVDGTPFGLIAPALFIQFFQSAEDYYARFDIATSIRLLRVFMFMISLIAPATYVAVTTFHQEMVPTTLIVALAAQRESVPFPAFVEAFFMEVTFEILREAGIRLPKAIGSAVSIVGALVIGQAAVQAGIVSPAMVIIVSITAIASFATPSFDMAISARLIRFLFILGAATFGFYGIILILLMGVGHLCSLRSFG.VPYMTPLAPFIPVSNEDTLLRLPWWTMRRRPKLIS
GERKA_BACSU/26-510 QQQEKERPVLISPSLAK-----NIAETKKEVGSSSDVIIREIKIGEQ.DHVHLAVIYISGLVDN----NTIHESLID-PLVQDES---.IQNTHAIQQILEKTLPLGGVKAEKSWDKLFSELMLGNALIFADGHD-EALICSTQGGEQRSIQEPSTQVSFRGPRQGFTESLQTNISMIRRYIKNPNLWVEKMKKGSVTNTDIALMYIQGICDEKVLKEVKQRLEKIDIDSILE-SGYIEQLIEDETFTTFPTMYHTERPDVVAGNLLEGRFAIIVDGTPFVLIAPALFVQFFQSVEDYYSRFDIATSIRILRVLVFFISLVAPAVYVAATTFHQEMIPTQLLVVIAAQREIVPFPAVVEALTMEVAFEILREAGVRLPRVVGSAVSIVGALVIGQAAVQAGIVSPAMVIIVALTAIASFATPAFAMAISARLIRFIFIIASAVMGFYGLILGIIMMFVHLCSLRSFG.VPYMSPLAPFSSQGVKDALFRVPWWADEKRPESVS
YFKQ_BACSU/14-493 LEDNQDRPISPN--LKE-----NLENLTLLTEGCSDIVFRQFDFG--.NGLCGFIVYIEGIVKS----EHIQDHALR-PFLMHLT---.-DQIDEHEEALQNTLSISSVALETSMSKVAASIIEGNAVLFADGHS-KGLILNIKGGQRRSIEEPITESTIRGSREGFTESLRVNTALVRFRVKTFQLKMISFKIGTKTKTDVVLAYIDGLADPKVIDKAKKRIKKIKIDAVLE-SGYIEEFIEDDTYSPFPQLQYTERPDTVAAQLLEGRFAIFTDNTPFVLTGPITFWQLMQASEDYYERYLMSNLIRWLRYMFLFVALYLPAIYVAVITYHQDLMPTNLMFSVASAREPIPFPAIIEALIMEISFEALREAGVRLPKTIGQTVSILGALVIGTAAVEAGIVSAPMVIIVSLTGIASFTIPRFNLAISIRMLRFPLMFLASIFGIFGIMLGTIILVLHLCKLQSFG.IPYLSGISPFKRDEVKDIFVRAPWWTMTRRPGTYS
GERAA_BACSU/3-470 QTEFKEYIHDN------------LALVLPKLKENDDLVKNKKMLA--.NGLVFYYLYFSEMTDE----NKVSEAIKT--LIKDEE---.---TLTLDQVKKRLDQLDARPVE-TAKKTIESILNGNCAVFINGLD-KAYILTTGKKKTRSLTEPTTEKVVRGPKVAFVEDIDTNLALIRQRTSHPKLITKKIMIGENKLKPAAIMYIEGKAKKSVIKEVKARLKNIQLEDIQD-SGTLEELIEDNKYSPFPQIQNTERPDKVSSALFNGRVAILVDSSPFVLLVPVSLGILMQSPDDYYERWISASLIRSLRFASIFITLFLSSIYIALVPFHQGLLPTALAVTISANRENVPFPPIFEALLMEVTIELLREAGLRLPNPLGQTIGLVGGVVIGQAAVEANLVSSILVIVVSVIALASFTVPQYGMGLSFRVLRFISMFSAAILGLYGIILFMLVVYTHLTRQTSFG.SPYFSPNGFFSLKNTDDSIIRLP---IKNKPKEVN
GERBA_BACSU/2-474 QIDSDLQN--N------------LDTLKKTLGQNDDMMFYTFAFG-D.SRQKACLLYIDGLT-E---NKMLAQYVIS-PLQKEALAHK.-EC--SIEDLSAFFFGFHHSVVS-TMKEIEQLVFSGQAILLADGYR-GGLAFDTKSVATRSLDEPSSEVVERGPKIGFIEKLRTNTALLRERTSDPNLVIKEMTLGKRTKKKIAVAYIQDIAPDYVVKEVFKRLKSVNIDNLPE-SGTLEQLIEDEPFSIFPTILSTERPDRVESSLLEGRVSILVDGTPFALIVPATVDEFIHSPDDYSQRWIPMSLVRLLRYSSILITIYLPGLYISLVSFHTGLLPTRMAISIAGSRLNVPFPPFVEAFIMIFTIELIREAGLRLPKPIGQTIGLIGGVVIGQAAVQAQIVSALMVIVVSVTALASFTVPSYAYNFPLRIIRIGVMISATALGMYGVIMVYLFVIGHLMRLKSLArITLSDHAQPG--QDLKDTVIRIPTMFLKRRPTRND
YNDD_BACSU/24-512 KQDQDVLTGNIG----Y-----DLEHVKRKIGHNGDVHFRELEIT-Q.LHVKAALIFVEGLSDQDLINKGLSVLVMNQPNQVSDEISQsGKGILTSKQIKNQIVSIGDVIDSEKISDIVLNVFMGSTALLIDGIP-QAFLLGTVKKQNRSIEEPLSEALVRGPRTGFTEELSTNTALLRQQGKNDQLTLQRFEVGTRLKKDLIIAYMNDIADPKVVEEVRKRVRGIEIDHLPE-SGYVEQLIEDNYLSPFPQVQSTERPDRVISGLMEGRVAILLDGTPFALIVPVTFSMMLQSPEDYYERWFPSSLIRLLRFIAAMITLFAPALYISFISFHPGLIPTKLAISISGTRQGVPFPSLIEALFMEVAIEILREAGLRLPKPIGPAIGIVGGLIIGEAAVQAGIVSPIMVIVVALTAISSFAIPHYSTGIALRMLRFGAMFCAAVFGLFGVIMYYLLLSSHVVKLKSFG.VPYASPAVPYHLKDWKDFVIRMPLLVMKRRPKMMN
Q46191_CLOPA/29-510 NNEKKYNNQKLFKTLEQ-----NEQYLKSIFNNCYDLTIRKISLYNE.NKGKIAIAYLNEFTTE----KLINDSIIN-KFPLNLS---.--AQNDIEESIKYTLAINDNNICENFAQCIDAILDGNVIIFSDMLN-KAFIENIKSPPERSIEEPNIESTIRGPREGFTESMSKNIILLRKKIKNINLKTEKHTIGKNVKSNIVICYMEDAVDKKILEEVKARIRKINIDTFA--SNYVLEAISDDKFSLVPTIFKTERPDVAASKLLEGKILILVDNTPIVLSIPALFVEFMQASDDYYTNYIPATLNRCFRYIGLMITLTLPGIYVALVTFHHELIPTPFITTIIKARAGIPLPSMWECFLMLSAYEIIREAGLRIPKTIGQTVSIVGTLILGEAAARAGIVSEPMIIVVAFVGTALYTIPSPELNSMILFIRYIILLLGGALGIFGVLCGLLFLITYMTSRRSFG.VPYMYPIMPFSLKRNEDVIVRTPIEKLDKKMKLFR
GERIA_BACCE/162-642 KQQSSGGNSIYDFTKPEKDRIHSLQNLIEKLKKSSDFVNYHTSDD--.ETMPYWISYYRPSLDG----EKLQKYLMP-TLLERPN---.----ASLEELKEH-IPMSGITITNDLQKIEDMVLKGHAIIQLNQQDQKCMLANIAIDNYRAPTPPLNESTVIGPQEGFVEDIDTNINLVRKRLPVLDLQTKEMIIGEFSKTKVVMMYLDNLAEKDNVDFLEESLRALEYDQIND-SAYLQELMGEK--SIFPLYINTERTDRVTKALIDGKIAIFVDGSPSVLLTPVSYFDFFISPEDYNVSWMYATFSRILRLIAVLFSICATPLYVAVLNYHYELIPSDLLETLILSRAQVPFPPLIEALFLELAIDLLREAGARLPMKVGQTLGIVGGIVIGQASVQAGLTSNILLIIVALSALASFITPIYKMGNAVRLLRFPFLAFAEIGGLFGISLGFIFLFTHLFRLTSLR.KPYA-LFYPTRQQSVKDSWIRFPLTMIDTRDVQAR
GERXA_BACAN/1-477 MKRTVEVN---------------ESILRVWFEGCKDVKIMNRKWCADtTTTTILLVYCQHVIDHTKLKQAIAPEMCN-DLLQSSFK--.----DSNLLASNSQFSVTTLELENSNENVSRMLFEGKLLIIFQEYK-RGYTIDIAKLPTRSIEQSNTEMTIRGSRDGFVEELSTNIGLIRKRLKTSSLSYDEFIIGERTQTKVGLLYLKDVASQETISQVQFKLKEINIDGVVS-SAQIEEFITGDQFSLFPLIEYTGRPDYAVNCLLHGRFILLVDGSPTATIAPVSFPFFVNTAEDQNYFYLFGSFVRLLSLFGIAISIFLPGFWVALVTYHPDQIPYTLLATLSLSREGIPFPAPLEGMIMITLFELLRQAGLRIPAAFGQTLSVVGGLIIGQAAISSGFVSPSMVVMIAISVVSTFTLVNQSFTGTLSILRYGVFLMSSFLGIVGFICSILLIVIHVANLRSFG.LPFLAPYSPPVFSSMLPSTFRIPFTRMKKRPKELH
SP56_BACSU/7-481 EKIRVYRNPAKNE---------EYFKNRVGMGTSYDVGVRKLTIL--.-DKEIQLYYLNGLCDT----AYIIHLMRELVAINNRK---.-EDPDELVDIVENRLLNAQVEKVKTLDETTDQVLSGLVAVIVEGAG-FAFIIDVRSYPGRNPEEPDTEKVVRGARDGFVENIVVNTALLRRRIRDERLRVKMTKVGERSKTDLSICYIEDIADPDLVEIVEKEIASIDVDGLTMADKTVEEFIVNQSYNPFPLVRYTERPDVAANHVLEGHVIIIVDTSPSVIITPTTLFHHVQHAEEYRQAPSVGTFLRWVRFFGILASTLFLPIWFLFV-LQPDLLPDNMKFIGLN--KDTHIPIILQIFLADLGIEFLRMAAIHTPTALSTAMGLIAAVLIGQIAIEVGLFSPEVILYVSLAAIGTFTTPSYELSLAT-NEPSCPHDTRCFISYKRARHRLYSANYAMASIKSLQ.TPYLWPLIPFNGKALWQVLVRTAKPGAKVRPSIVH