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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF03275 alignment
(8 sequences with 672 bp)


O06934_MYCTU/156-366 GCGTTCGTCAAGGGGTACACGGCCAAGCAATGGCAGACTGACCCCAAAGAACTTCCGGCCGCCAACATCACGCGGCTTCCCGTGCGCTACACCTTCGACAACCGGTATTTCAGCGATACT---TACGAGGGTTTGCCGACCGACGGGTACACGGCGTGGTTGCAAAACATGGCCGCTGACCACCGCATCGAGGTCAGGCTGAAC------ACCGACTGGTTCGACGTGCGCGGCCAGCTGCGCCCC------------------GGCAGCCCGGCGGCCCCGGTCGTTTACACCGGCCCGCTGGACCGCTACTTCGACTACGCCGAAGGCCGATTGGGCTGGCGCACCTTGGACTTCGAGGTGGAAGTGCTACCGATCGGGGACTTTCAGGGCACCGCGGTGATGAACTACAACGATCTCGACGTCCCCTACACGCGCATCCACGAGTTCCGCCACTTCCACCCCGAGCGTGACTACCCAACGGACAAAACGGTGATCATGCGGGAATACTCC---CGGTTCGCC---------GAGGACGACGACGAGCCATACTATCCGATCAACACCGAGGCTGACCGCGCCCTGTTGGCCACCTATCGGGCCAGGGCGAAGTCCGAGACCGCGTCATCGAAGGTACTGTTCGGCGGCCGGTTGGGCACCTACCAATAT
Q9ZIH7_STRPN/1-201 TTGTTAGAAGCGGTCCATACTGAGAAGCAATGGGAACGCTCAGCGACAGAACTTCCTCCATTTATCATTAAACGCCTTCCAGTTCGTTTAACCTTTGATAATAACTATTTTAACGACCGT---TATCAAGTGATTCCTATTGGTGGATACAATGTGATTATTGAAAATATACTTAAAGAC------GTAGAAGTTGGGCTAGGA------GTGGATTGCTTTGACTATCGTGAAGAGCTG------------------------GAAGCATCTGCTAACAAAGTTGCTTTTACAGGAATGATTGACCAGTATTTTGATTATAAGCATGGTGAGCTAGAGTATCGCAGTTTACGTTTTAAGCACGAAGTGCTTGATGAGGAAAATCACCAAGGAAATGCTGTAGTGAACTATACAGATCGTGAGATTCCTTATACTCGTATCATTGAGCATAAAAAATTTGAG---------TATGGTCTGCAGCCTAAGACAGTCATAACGCATGAATATCCA---GCTGACTGG---------AAACGTGGAGATGAACCATATTATCCAATTAATGATGAGAAAAATAATGCTATCTTTTCTAAATACCACGAAGAAGCTTCACAGAAT---------GATAAGGTTATCTTCTGTGGACGTTTAGCAGATTATAAATAT
GLF_ECOLI/146-346 GCATTGATAAAGGGTTATACGGAGAAGCAGTGGGGAAGAAGTGCAAAAGAATTGCCTGCATTTATTATTAAGCGAATCCCAGTGAGATTTACGTTTGATAACAATTATTTTTCCGATCGC---TATCAAGGTATTCCGGTGGGAGGCTACACTAAGCTTATTGAAAAAATGCTTGAAGGT------GTGGACGTAAAATTAGGC------ATTGATTTTTTGAAAGACAAAGATTCTCTA------------------------GCGAGTAAAGCCCATAGAATCATCTACACTGGACCCATTGATCAGTACTTCGACTATAGGTTTGGAGCGTTAGAATATCGCTCTTTAAAATTTGAGACGGAACGCCATGAATTTCCAAACTTCCAAGGGAATGCAGTAATAAATTTCACTGATGCTAATGTACCATATACCAGAATAATTGAGCATAAACATTTTGAC---------TATGTTGAGACAAAGCATACGGTTGTTACAAAAGAATATCCA---TTAGAGTGG---------AAAGTTGGCGACGAACCCTACTATCCAGTTAATGATAATAAAAACATGGAGCTTTTTAAGAAATATAGAGAGTTAGCTAGCAGAGAA---------GACAAGGTTATATTTGGCGGGCGTTTGGCCGAGTATAAATAT
GLF8_KLEPN/150-349 GCATTCTTTAAAGGCTACACCATAAAACAATGGGGGATGGAGCCTTCGGAGTTACCGGCTTCGATACTTAAGCGCCTACCGGTTCGCTTTAATTACGATGATAACTACTTCAATCATAAA---TTCCAGGGAATGCCAAAACTTGGCTATACCCGGATGATTGAGGCCATCGCCGATCATGAGAACATCAGTATTGAACTGCAG------CGTGAGTTCCTTCCTGAGGAACGTGAAGAT---------------------------------TACGCTCATGTCTTCTATAGCGGCCCTCTTGACGCCTTCTATTCGTACCAGTACGGTCGGTTAGGCTACCGCACTCTGGATTTCGAAAAATTTACCTATCAAGGT---GACTATCAGGGGTGCGCTGTGATGAATTATTGCTCCATCGATGTGCCATATACACGCATCACTGAGCATAAGTATTTTTCTCCA------TGGGAAAGCCATGAAGGTTCGGTCTGCTATAAAGAATACAGTCGCGCTTGCGGC------------GAGAATGATATTCCTTATTACCCCATTCGACAGATGGGGGAGATGGCTTTACTGGAAAAATATCTTTCTCTTGCCGAAAGTGAA---------AAAAATATTACCTTCGTCGGTCGGTTAGGTACCTATCGGTAT
O26444_METTH/151-361 AAGGTCTTCCTCAACTACACCAGGAAGCAGTGGGGCCTGAAACCAGAGGAGATGGACCCCGAGGTCACAGGGAGGGTGCCAGTGGTCCTCTCACGGGATGACCGCTACTTCACTGACAGG---TACCAGGCCGTGCCACGGGACGGCTACACAGCCATGGTTGAGAGGATGCTGGACCACCCCTGCATCAAGCTTATGCTCAAC------ACCAGCCACCATGAGGTCCTCGAGCTGAGGGATGGGCAGATCCACTTCATGGGCTCCGAGTTCAGGGGGAAGGTCATATTCACGGGTAAGATCGATGAGCTCTTCGGCTACAGGTATGGTGAGCTCCCCTACAGGTCCCTGGACCTCCAGTTCGAATCCGCTGACACGGAGTGGTTCCAGGAGGTTGCCACCGTCAACTACCCAAAC---GACTATGACTTCACCAGGATCACCGAGTTCAAACACCTCCAC---------CCCACAGATTCCAGGAGGACGACGCTGCTGAGGGAGTACCCCTGCACACACATA---------GACGGGGAGAATGAGGCCTGCTACCCTGTATTCACAGATGAGACCCGGGCGAAGTATGAAAGATACCTTGAACTTGCCAGAGAATTT---------GAGGACCTTATACTGGTCGGGAGGCTTGCAGAGTACCGCTAC
Q9RYF1_DEIRA/174-370 AAGTTTTTTCGCGGCTACACCCGCAAGCAGTGGGGCCTGGACCCCAGCGAACTCGACGCCAGCGTGACCGCCCGTGTGCCTACGCGCACCAACCGCGACAACCGCTACTTCGCCGACACC---TATCAGGCGATGCCGCTGCACGGCTACACCCGGATGTTCCAGAACATGCTCAGCAGCCCGAATATCAAGGTCATGCTGAAC------ACCGATTACCGCGAAATTGCGGACTTC------------ATTCCCTTCCAG------------------CACATGATCTACACCGGGCCGGTGGACGCCTTTTTCGACTTCTGCTACGGCAAGTTGCCTTACCGCAGCCTGGAATTCAGGCACGAGACGCACGACACCGAGCAACTGCTGCCCACCGGCACCGTCAATTACCCCAAC---GACTACGCCTACACCCGCGTGAGCGAGTTCAAGCACATCACC---------GGGCAGCGGCACCACCAGACCAGCGTGGTGTACGAGTACCCC---------------------CGCGCCGAGGGCGACCCCTACTATCCGGTGCCGCGCCCCGAAAATGCCGAGCTGTACAAGAAGTACGAGGCGCTCGCTGACGCCGCC---------CAGGACGTGACCTTCGTGGGCCGCCTGGCGACCTACCGCTAC
GLF_MYCPN/165-380 AAGGTGTACGGTCCTTACAGTGTGAAAATGTGGGGCATGCCATTAGAACAAATTGATCCTAGTGTATTGGGTCGAGTCAAAATTAGTTTAAGTGAAAACAGTAGCTATTTCCCTACAGCCACTATTCAAGGTCTACCTAAGGGTGGTTATACAAAGGCCTTTACAAAGATGGTGGATCATCCTCTGATTGATTTAAGGTTAAACTGTCCAGCTAACTTAATTAGCGTAAACAATAATCAA---------CTCTTGTTTGCAAATCAACCAATTACCAAACCAGTGGTTTATTGTGGTTTAATTGATCAGCTGTTTGGCTATTGTTTTGGGCGATTGCAGTACCGCTCGCTCCACTTTGAATGAAAGCGTTATGCTGTAAAACAACACCAAGCTTACCCCGTAATGAACTGGCCACTC---CACCCAACAATAACGCGCCAAGTGGAATACAAACAGTTAACGCAAGAG---GGTTTGGAGTCTAACCAAACGATTGTTTCGTGTGAAACTCCTGGTGCTTTTAGGGAAGGCGATCCCCGCTTTATGGAGCCGTACTACCCGCTAAATGATGTAAGTAATAATGCCTTGTTTGCGCGTTATTTAAAGTTAGCTAACGCTATT---------CCTAACATACATTTGTTAGGTCGGTTGGCACTGTACCAGTAC
GLF_MYCGE/170-385 AATGTTTATAAACCATACAGTGTCAAAATGTGGGGTTTACCATTTGCAATGATTAATGAGAATGTTATTAACAGGGTCAAGATAGTTTTAAGTGAACAAAGCAGTTATTTTCCTGATGCAATTATCCAGGGATTACCTAAATCAGGTTATACAAACAGTTTTCTTAAGATGTTAGCCAATCCCTTAATTGATGTGCAGTTAAACTGCAAAGATAACCTTTTAGTTTATCAAGATGAAAAA---------CTGTTTTTTAACAATAACTTAATAGAAAAACCAGTTGTTTACTGTGGCTTAATTGACAAGCTATTTAACTTTTGCTTTGGTCATTTGCAATACCGTTCTCTTGCCTTTAGTTGAAAAAGATTTAACCAAAAAAAATACCAAACCTACCCTGTTGTTAATATGCCTTTA---GCTAAATCAATCACAAGGAGTGTGGAATACAAACAACTAACAAACCAA---GGTTCTTTCAAACCGCAAACCATCGTTAGTTTTGAAACCCCTGGCAGCTATGCAATTAACGATCCTAGGTTTAATGAACCTTATTACCCAATTAACAATACACTAAATGATACTCTTTTTAAAAAGTACTGAAAAAAAGCAAGTAAGTTA---------AAGAATCTACACCTTTTGGGAAGATTAGCAACCTACCAATAC