PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam
 pan•dit |
PANDIT Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees |
PF03202 alignment |
| YB47_MYCPN/336-466 | ATGATTACTCAAGGCCCGAATATTGTCGGAATTCATGCCAACGAAAAAGAGGACAAAGAAACACAAAAGTTTATTAACTGATACCTCAATAAAGAAGAGAGTTGATCTGTGCAAAACAGCGGT------TCAACTACAACTAAAAAG............CAAACTGCTGCTCAATATTTTGCCGAACAGTCCTCTTACATCACTCCTTTAAAAAATAACTTTAAA------------.........---GCAGATCAAAGTGCAACAAAAGATAGC.........................................................------------------ACTGTTAACACTAACTATTTCACTAAACAAACATTTGATCTCTTCAAAGAAGTTAATGATGGAAAAGTGCTTGGTTTTAATGATCCAAGTGACTTTAGGAGTGGTAAGTTCCGCAATACTATTGGTTCTACTTTTAAC...GCAACCATCAGTTCTAAAGTT |
| YC88_MYCPN/633-770 | ACCATCACCCAAGGTCCTAATATCATTGGCATTCACGCTAACGAAAAGGAAAACGCCGAAACGCAAAAGTTTGTTAACTGGTTTTTAAACAATACAGAAAGTTGAGAAGTTAAAAAT---GGAAAAGATTCCTCCACTAAACAACAA............---ACTGCTGCCGAATTCTTTGCTGAGTCAGCTTCTTATATCTTGCCTTTAAAAGAAATCTTTGACAAAGAT------.........AACAAAAAAGCTACTGAAAATAAGGAC---.........................................................---AATAATACTAGCAATAAAAAACAAGCTAATACCTATGCTGAAAAGGCGTTAGATTTGTTCCAACAAATTAGTAAAGGTGATATAGTTAGTTACAGCGACCCTAGCGATTTTAGAAGTGGTAAATTCCGCGATGGGATTGGCTCTAATTTTAAC...GCTGCAGTAAGTTCCAAAGCT |
| YC84_MYCPN/633-777 | ACAATTACCCAAGGTCCGAATATTATTGGTATCCATGCTAACGAAAAAGAAAATGCAGAAACCCAAAAGTTTGTTGACTGGTTTTTAAATACAGAAGTAGATTGACCCGCTAAGGAAAATTCTTCTAATAAACAAGATCAACAAAATtcaaccaaaaaaCAAACCGCTGCTGAATTCTTTGTTGAATCCGCTTCTTATATTCTGCCTTTAAAGGAAATCTTCGAAAATAAA---GAG.........AAAAAAGAAAATACAAGCAATAGTGATAAA.........................................................AATAAGAGTAGTAGTCAAAGGAAA------AATACTTACGCTGAGAAAGCGCTAGAACTTTTTCAACAAATAAGTAAAGATGAAATAGTTAGTTACAGCGATCCGAGTGATTTTAGAAGTGGTAAATTCCGCGATGGGATTGGTTCTAACTTTAAT...GCTGCTGTAAGCTCTAAAGCA |
| YF06_MYCPN/640-776 | ACAATTACCCAAGGACCTAACATCATTGGCATTCATGCTAACGAAAAGGAAAATGCAGAAACGCAAAAGTTCGTAGATTGATTCTTAAACAGTCCGCAAACTTGAGAAAAACAAAGTAGAGATAAGAAAGGATCAAGCGAAAAACAA............---ACTGCTGCTGAGTTCTTTGCGGAATCCGCTTCTTACATTCTGCCCTTAAAAGAAATCTTTGACAAAAAC------.........GATACAAAAACAGAAAAAGGTAAG------.........................................................------AACAGTAAAACGCAACAGAGAACTAATACCTATGCTGAAAAAGCTTTGGAACTCTTCAAACAAATTAGTCAAAATCAAATAGTAAGCTACAGTGATCCAAGTGACTTTAGGAGTGGAAAATTCCGTGATGCAATTGGTGCTACTTTCAAT...GCTGCAGTTAGTTCCAAAGCA |
| YB52_MYCPN/668-794 | ACCATCACCCAAGGTCCGAATATCATTGGAATTCACGTCAACGAAAAGGAAAATGCAGAAACACAAAAGTTTGTGGATTGATTCTTAAACAGTCCGCAAACTTGAGAGGGTAAG------GGAAAAGGTAAAGAA---CAAACTAAT............AAAACCGCAGCTGAATTCTTTGCTGAATCGGCTTCTTATATCTTGCCACTCAAGGAAATTTTTGAGCAAAAGAATGAA.........AAGAAAGAAGGCAGCGATCAAAAAGAT---.........................................................AGTAAAAGCAATGGTAGAGGTAAACAAACTAACCTCTACACCGAAAAGGCCTTGGAACTATTTAGAGGTATTAGTACCGATCAAATAGTAAGTTACAGT---------GAC------------------CAAGTGACTTTAGGA------------...GTGGTCGTTTCCGTGATGGAA |
| YD64_MYCPN/520-660 | GCAATCACCCAAGAACCTAACCTAATTGGTATCCATGCTAACGAAAAGGAAAATGAGGAAACACGTAAGTTTGTTAATTGGTTTTTAAACAGTGAGCAAACTTGGGAATCCAAGAAATACAGTAAAAATAAGCAAAACTCCAACGAA.........aagAGAACTCCTGCACAATTCTTTGCTGATTCCGCGTCTTACATTCTACCCTTAAAGAAAACCTTCGATAATGCC------.........AACAAAAAAGAAGATCAAAGTAAG------.........................................................GCCAATAACAAGACTAATAGCCAAAGAACTAACACCTATATCGAAAAGGCATTAGAAATTTTTAAAGGAATTAGCCAAAACCAAATAACAAGTTACAGTGATCCAAGCGACTTTAGAAGTGGTCGCTTCCGCGATGGTATTGGTTCTAACTTTAAT...GCAGTAGTAAATTCCAAAGTG |
| YC00_MYCPN/651-779 | ATGATCACCCAAGGTCCTAACCTAATAGGGGTTCATGCTAATACTAAAGAAAATGAAGAGACTAAGAAATTTGTTAACTGGTTTTTAAATAAAACCGAAAGTTGAGAAGTTAAAGGAAACGGAAAGGATTCACAAACTACTAAATCA............CTTACACCAGCGCAATATTTTGCTGAATCAGCATCTTATATTTTGCCGCTAAAGGAAACTGTTGAAAAAGAT------.........CAT---AAAGAACAAACTAATAAA------.........................................................------------------------------AACACCTATGTTGCCAAAGCTTTAGAAATGCTCAAGGAAGTTAGTGAAAACAAATCAGTCAGCTATAGTGATCCGAGTGATTTTAGAAGTGGTAGATTCCGTGATGCACTTGGTGCTAACTTTAAT...GCCACTATTAATTCAAAAGCA |
| YA98_MYCPN/1-128 | ATGATGACTCAAGGTCCTAATCTAATTGGTATCCATACTAATACCAAGGAAAATGAAGAAACGCAAAAGTTTGTTAACTGGTTCTTAAATACCAGTCTAACTTGAGATAACAACGAA------------------------AGC---............AAAACACCAGCGCAGTACTTTACCGAGTCTGCTTCTTACATCCTGCCTTTAAAAGAAACTTTTACC---GGCTCTAAC......aacAAAGGTCAA---AGCGGCAAGAATGACGGT.........................................................------------------AAGAATTCCAATAACACCTTTAAAGCCAAAGCACTAGAGCTCTTTAAGGAACAGAGCGAAAACAAAATAGTGGGTTACAGTGATCCAAGCGATTTCAGGGGTGGTAAATTCCGCGAATCAATTGGTTCTGCCTTTAAC...GCCACGGTCAATTCACACGTT |
| Y260_MYCGE/581-746 | ATGATCACCCAAGGTCCTAACTTAATAGGCATCCATGCAAATGAAAAAGAAAATATTGAAACTAAAAAATTTGTTAATTGGTTTTTAAATCAAAGTATTACAGATTGGAATAGTAATAATCAGCAAAAAAATAGTGATCAAACAACA............AAAACTGCTGCTGAATATTTCACTGATCAAGCTTCTTACATCCTTCCTTTAAAGGAAAAATTTAACAAAAGTTCAGATttagaattgAAAGGCAGTAGTAGTTCTTCTAATTTAACAaccagtagtgctagcgcctctttgttaataagtaataatagttcaactgcaagttctCCTGCTCCTAAAAAAACAAACAATAATTCTAATACCTTTACAGCTAAAGCACTAGAATTATTCCAACAAGCTGCTAACAATGAAATTATTCCCTTTAGTGATCCAAGTGACTTTAGGAACGGCACATTCCGTAATAATATAAGCAGTAGTTTTAAT...GCTGCGGTGAATTCTAAGGTT |
| YE08_MYCPN/615-740 | GCTACCGTTCAGGGTCCAAGTATTATTGGTGTTCATGCTAACGCTAAGGAAAACGCTGAAACCCAAAAATTTATCAACTGGTTTATTAACCAAAAAGAAACTTGACCTGAAAATAGTAAGGGAAATAAGAATGGCCAAAATGGTCAA............ATGACCGCAGCACAATACTTTGCTAAGAGCTCTGGTTATGTTTTACCTTACAGTGAAACGTTTACT------------.........------AAACAAAGTGAAGACGAA------.........................................................------------------------------CACAGCACAACTAAAGACGCTTATAAGATCTTGAAAGATGTAAACGATGGTAAGTTAGTTGGTTACAGTGATCCAAGTGATTTCCGTTCTGGTAAATTCCGTGACACAATTGTCGCTGCTTTTAGT...GGTGCTGTAAGCTCTAAAGCT |
| Y185_MYCGE/568-681 | GCTTTAGTGCAAGGTCCTAGTTTAATAGGGATCCATGCAAATGAAAGAGAGGATATTGAAACCAAAAAGTTTGTGAATTGGTATCTGAATACTAAAGTCCAATGGGAAGAAAAT---------------------------TCTATT............AAAACTCCTGCAGAATATGTAGCTGATAAAGCTTCTTATCTTTTACCTTTTAAAAATAGGCTAAATAATACTAAC---.........------------------------------.........................................................---------------------------------AGTTACAATGAGTTTGTTAAAACTGCAGTTAGTCAGTTTGCTGATAAAAATGTAACTAAATTTGCAGAACCTGCTGATTTTTTATCCAACAAAGTACGTGATGGTGTTAAGAGTAATTTAAATgctGCAATTAACAACCACAGCATT |
| YB99_MYCPN/638-741 | GCACTTGTTCAAGGTCCAAGTTTAATCGGTATTCACGCTAACGCTAACGAAGACCGTTCAACCATTAAGTTTCTCAACTGGTACCTTAATGCTGAAGTTGATTGAAAAGATGGA---------------------------GAAAAG............AAAACACCAGCAGAATACTTAGCAGAAAAAGCTTCTTACCTATTGCCGTTTAAAAAAGTATTAGAAAAATCC------.........------------------------------.........................................................---------------------------------------AAGCAAAACATAAAA---GCGACCTCTAAGGAAGGAGAGCAAAATCAAGGCAAGAAAGGTGATGGTGCACAGAACCAAGGTAAGAAGGGC---GATGGAGCTCAAAATGGTAAG---...---------AATGATAAAGCA |