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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF03161 alignment
(19 sequences with 687 bp)


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SCE1_YEAST/33-209 CAATTTGAAGCAGGTATTGGTTTAATTTTAGGAGATGCTTATATTCGTAGTCGTGATGAAGGTAAACTA---.........---------TATTGTATGCAATTTGAGTGAAAAAAT---------...---AAGGCATACATGGATCATGTATGTTTATTATATGAT---...CAATGAGTATTATCACCTCCT------CATAAAAAAGAAAGAGTT---....................................AATCATTTAGGTAATTTAGTAATTACCTGAGGAGCTCAAACTTTTAAACAT...CAAGCTTTTAATAAATTAGCTAACTTATTTATTGTA------AATAATAAAAAA---------------CTTATTCCTAATAATTTAGTTGAAAAT......TATTTAACACCTATAAGTTTAGCATATTGATTTATAGATGATGGAGGTAAATGAGATTATAATAAA..................AATTCTCTTAATAAAAGTATTGTATTAAATACACAAAGTTTTACTTTTGAAGAAGTAGAATATTTAGTTAAAGGTTTAAGAAATAAATTTCAATTAAATTGTTATGTTAAAATTAATAAA---------......------AATAAACCAATTATTTATATTGATTCTATAAGTTATTTAATTTTTTAT
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Q9TCC7_NEPOL/34-219 CAAAGAGAATGTATTATAGGCACTCTTTTGGGAGACGCAAGTATTATGAAACCTTTGAAAAATCATTATAAT.........---CCTAATATAAAATGGGAACAAGGTATTCAAAATAGA------...------CAATATATTGATCATATATATGAAATTATGCAT---...CCTTGGGTTGGATCACCGCCTGTGATTCGAAATATTCAAGGAGGG---....................................------GGGGTCCTAGATCGCCAATCTGTTTGGTTTAAAACTTATCAACAT...CCAAGCTTTCGATTTTACAATCAAGAGTTTTATATGCAAGATTCTGATCTTGAAAATCGTCGT---CGGAAAAGAATTCCAAGATTACTTCATCGA......TGGTTAACGCCTCGAGTTCTTGCTTATTGGTTTATGGATGATGGT---------------------..................AATTTGACACCGCATGGTTATGTAATTAATACACAATGTTATCCTTTGCATGAACAAAAACTTGCTGCTCATGTATTAGGTATGAATTTTGGCTTAGAAATTTCCATATGGAAAGATCGAATAAATAGTcgaagtAAATCACCTAGTTATAAATTGTATATTAATGCATCTTCAAGGCAATCTTTTACA
Q9ZZX1_YEAST/423-602 ATTTTATATATTATAACAGGTATTTTATTAACAGATGGTTGAATTGATTATCTATCTAAAAAAGATTTAGATaaaaaaacaATTATAGAAATTAATTGTAGATTTAGATTAAAACAATCAATAATT...CATAGTGAATATTTAATATATGTATTTATATTATTATCA---...CATTATTGTATAAGTTATCCT---------AAAATAAAAATTGCT---....................................AAAGTTAAAGGTAAATCATATAATCAATTAGAATTTTATACTAGATCATTA...CCATGTTTTACTATTTTAAGATATATATTTTATAAT------GGTAGAGTAAAA---------------ATTGTACCTAATAATTTATATGAT---......TTATTAAATTATGAATCTTTAGCTCATATAATTATATGTGATGGT---------TCATTTGTAAAA..................---------GGTGGAGGTTTATATTTAAATTTACAATCTTTTCTAACTAAAGAATTAATTTTTATTATAAATATTTTAAAAATTAAATTTAATTTAAATTGTCTATTACATAAATCTAGA---------......------AATAAATATCTTATTTATATAAGAGTAGAATCTGTTAAAAGATTATTT
Q34834_KLULA/102-290 ATTATATATATAATTAATGGAATTTTATTAACAGATGGTTGAATTGAATATAGTTCAAAAAATACATTA---.........---------ATTAATAGTAGATTAAAATTTAAACAAACTTTAAAA...CAAGTAGAATATGTTTTATATGTATATAATAAATTAAAT---...CATTATTGTGTAAGTCCTCCAAAATTAATTAAAACACCCCGCGGCTCCtcccctggtaatcccaggggaggagtccgcggggaaAGATTAAAAGGTAAAATTTATTATGGAGTTGAAATAACTACTATAGCTTTA...CCTTGTTTTACTAAATTAAGACATCAATTTTATAAT------GGTAGAGTAAAA---------------ATTATACCAAATGATTTATATGAT---......TTATTAAATTATGAATCATTAGCTCATATTATTATAGGAGATGGT---------TCATTTAATAAA..................---------GGTGGAGGTATTACATTAAATTTACAATCATATACTATTAAAGAATTAATTTATTTTATTAATATTTTAAAAATTAAATTTAATTTAGATTGTACTTTACATAAACATAAA---------......------TCATATTATGTTATTTATATTAAAGTTAAATCTATTAAATTATTATAT
Q33758_ALLMA/41-214 ATTCTTAGTATTATATTTGGTAGTTTATTGGGCGATGCCTTTGCTGAATTAAGGAATGGTGCTACAAGA---.........---------ATATGTTTTCAACAAGAATCTTCGCATAGA------...GAATATCTTTTATGGCTTCATCGTAAAATAGCAGATTTA---...GGTTATTGTAATCCCGATGTACCTGAAGTAGCTAGTAGACCTGGT---....................................---TCATCAGGTAAAACAAGATTCCTGTCTAGGTTTAAAACCTGGTCCTTT...ACTAGTTTTACATGGATTCATAGCGTTTTTTATGTC------AATGGAGTAAAG------------------ATTGTTCCAAAATGTATTGAGCTT......TACTTAACACCTTTGGCTCTTGCAATTTGGATACAAGATGATGGAGGC------------------..................---GCAGTTTCTACTACAATGAAAATCGCCACTAACTCTTTTACTCTTTCTGACATTCAATTTTTATGTGATGTGTTAGATCGATTGTACAATATTAAAGCTACCCCAATGAGCGCAGGG---------......TATCCGGGTCAATATTGTATTTATATCAAGGCGGAATCAATGCAGTTAATTGCT
MBI2_YEAST/222-404 ATTTTATCAATTATTTATGGTTCAATATTAGGAGATGGTCATGCTGAAAAAAGAAAAGGTGGTAAAGGA---.........---ACAAGAATTGTATTTCAACAAGAATATTGTAATATTAAT---...---TATTTATATTATTTACATAGTTTATTAGCTAATTTA---...GGTTATTGTAATACTAATTTACCTTTAATTAAAACTAGATTAGGT---....................................---AAAAAAGGTAAAATTAGACAATATTTAAAATTTAATACATGAACTTAT...GATTCATTTAATATGATTTATTCAGAATGGTATATT------AAAAATATATCTGGAAAAGGTAATATTAAAGTTATACCTAAATCTTTAGACAAT......TATTTAACTCCTTTAGCTTTAGCTATTTGAATTATAGATGATGGA---------------TGTAAA..................------TTAGGTAAAGGTTTAAAATTCACAACTAATTGTTTTAGTTATAAAGATGTTCAATATTTACTTTATTTATTACATAATAAATATAATATTAAATCTACTATTCTTAAAGGCAATAAA------......GAAAATACACAATTTGTTATTTATGTATGAAAAGAATCTATACCTATTTTAACT
Q9TC98_NEPOL/26-207 GTAATTAGTGTTTTAGTTGGTAATTTATTAGGAGATGCTCATATTGAATTTCGAAAACCATCCAGTCGT---.........---------GTTAGTTTACATGTAGGATCACCCAATCGT------...TCATATATTCAATGGCTTCATGAATTTTATAGTTCAAGA---...GGGTATTGTAGTACAAATCCATTAGTATATCAGCCACAAATTGGT---....................................---AAAAACTCGAAAGTTTATTATAGCACGAAAATAAACACTTTTTCTTTT...CAAAGTTTCAATTGGTTATATGAATTATTCATGCGAGAAATCAATGGCAAAAAA------------GTCAAAAGAGTTCCAAATAATATAGGCGAT......TATTTAACTGCTCAAGCATTAGCCGTTTGGTTTATGGATGATGCC---------------ACAAGA..................------AGTAATAGCGGCGTTCTTTTTTGTACTGATGCTTTTGTTCTGGAAGATGTACAACTATTACAGGAAGTTTTACGTAAGAAATTTCATTTACATACAACTACTCATTATGGACCTACGAATACT...gaaAAAAAACCAACATACAGGATTTATATAAAAAAGTCTTCGATTCCATTGTTTCGT
Q02672_PODAN/50-226 GTAAAGGAAATATTAATAGGGATTTTACTTGGTGATGCCCACATAGTAAGAAGATCACCAACTGCTAAT---.........---------------TCTAGATTAGTTTATGCTCAAACTGCCATAaaaCATAAAGAATATTTCGATTATGTATTTAGTTTCTTTTTA---...CCTTTTTGTGCAAATGACTATAAACCCCAATCTAGACTAGTAGTGGAC....................................AATAGCACTAAAAAAATATACAGTGCTATATCATTCACAACTATGCAACTT...CCTTGTTTTAATGTATATAGAGAATTATTTTATGAT------TTAAATAGAAAA---------------AAAATAGTTCCCGAAAATATAAGAGAA......TTGTTAACTCCCCGTGGTTTAGCTTTTTGAATTATGGATGACGGA---------------AGTAAA..................CAA------GGTAGCGGTTTACATATAAGCGTTTATGGATTCTCTAATACAGATGTCGATAAATTAATGTTTACTCTACAAGATAAATTTAATCTTAAATGCTCTATACATTATAACAGGGAT------......------AATAAACCCCGTATTTATATATTTAAAGAATCCATGGATACTTTAATA
O21151_DICDI/21-199 ATAATTAGTATATTAATAGGGTGTTTATTAGGAGATGCATATGGTAGTAATAGATCTAGAGAAGGTGTGCGT.........---------TTTAGTTTTAAACAAAGTAGTAAAAATAAA------...GAATATTTATTTATGATCTATGAATTCTTTAATAAAAAT---...GGTTATTGTACCAATAATATTCCA---AGAAAATATATAGTAAAATTAaaa..............................catAACGATGACGTAAAAGACTTTGAACGTTATGAATTTGTGACCTATACGTTT...AGAAGCTTTAAATATATTTATGAAATGTTCTATAAA------AAGCAAAAAAAA---------------GTATTACATTTAGAAAAAATAAAAGAA......TATCTAGATGAACGAGCATTAGCCCATTGGATTATGGATGATGGCGGG------------------..................---TATACTGGAGCAGGTATTAGAATAGCAACAAATGCCTTTACTTTAAAAGAAGTAATGTTTTTGAAAGAGTTATTAGAAGACAAATTTAAATTAAAATGTACAATTCAAGAGATCTATATA------......AAA---GATAAATGGTCAATCTATATTACAAAAGACTCGATGACTCATTTAATT
Q06824_CHLSM/177-352 TTCTGCGATATCGCTGTTGGATTGCTCCTAAGCGACGCTCATGCAGAGCGACATGGTAAAGGGGTACGT---.........---------TTGACTTTCAGTCAATCCACTTCTCACCGA------...------CCGTTTTTTGAGCACACTGCCAAAGCATTGCAACGCcttGGTTACGTCCACGAGAAAACT------TACACTCCTCTTCCAACTACC....................................GATAGTAACGGTAAAGTGTGCGAGTACCTACGATTGCACACCTTCGTGTTC...GGATCCCTATCTTGGCTGCGAGATCTGTTCTACGTC------GACAACATCAAG------------------GTTGTAAAACCGGAGCTAGAGCCT......TTTTTGACTCCGCGAGCGCTAGCTTATTGGATCGCAGGCGATGGC---------------------..................TGTTGGGACAACGCTGGCCTTCGTCTGAGTACCCACAACTTTAAACATGACGAGTGCGTCATGCTTACTCACATGCTGAGTCGCCGATTTGGTCTAGAGTGTACGGTTCAAAAACAAAAGAACGGT---......GAGACCATTTACTACCGTATTTATGTAGTAGCTAAGTCTATGCCACGCTTGCGT
O79861_9CHLO/1-180 ATGCATCAAATTGTCGTCGGTTGCTTATTAGGAGATGGTCACTTAGAGCGCCGCGGCAATACTCGACTAGGA......aaaATCTTCGATTTTTCCGTAGGTATTTCTTTTAAACACGTGTATAAAgacGTTGCTGATTGGTACTTAACCATGTTTTATGGTTTAGGT---...---TATCAAGACAATATTGCTTTTGAAAATTACTCAACACGAACT---....................................TATCCTTCTGGTCGTGTTTATAAGTATTATCAAGTTCGTACCCGCAGCTAT...TCTAATTTTAATATTCTTTATGAACGCTGGTACCCA------TCTCGCGTAAAA------------------GTAGTACCAGCTTATATTGTTGAA......TTCCTAACTCCACTCGCTTTAGCTCTGTGGTGTATGGGTGACGGC------------------TCG..................GCAATGGATTGTGGTGGTTTTAAATTATCAACACATGGCTTTACTTATGAAGACAATTTATTTCTAGCCCGTACCTTAAAAGAATTATACGGGCTAGAAGTTACTTTACACCGTGACCCC---------......---------GCGGCG---CCTTGGGCCGAAGCCGCAAATATTATCATCTTTATG
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DNE1_CHLHU/7-195 CAAAAAGACTTAATTTTCGGATCTCTACTGGGTGATGGAAATTTACAAACTGGTTCAGTAGGTAGGACT---.........---------TGGCGCTATCGAGCGCTCCATAAAAGTGAGCAT---...---CAGACATACTTATTTCATAAGTATGAAATCTTAAAG---...CCGCTTTGTGGCGAAAATACTCTCCCAACAGAAAGTATAGTGTTCGAC....................................GAAAGAACAAACAAGGAGGTTAAACGTTGGTTTTTCAACACATTAACCAAT...CCTTCCTTAAAATTCTTCGCAGACATGTTCTACACATATGACCAAAACACACAAAAA------TGGGTTAAAGATGTACCTGTAAAGGTTCAAACA......TTCTTAACTCCTCAAGCTTTAGCATACTTTTATATAGACGATGGA---------GCGTTAAAATGG..................CTTAATAAGTCTAACGCTATGCAAATTTGTACTGAAAGTTTCAGTCAAGGGGGCACGATTCGGATCCAAAAAGCACTAAAAACGCTCTATAATATTGATACAACGTTGACAAAAAAAACTCTACAAGAC......GGCAGAATTGGCTATCGTATAGCTATTCCTGAAGCCAGTAGCGGTGCTTTTCGT
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Q02449_CHLEU/27-209 CTAAGAGATATTATACATGGTTATATAGCTTCGGATGGTAATGTAAGCTCTGAGGGAATTTTGACAGTT---.........---------------GATCATGGTGAAAAACAA------------...---GAAAAATTTGTTCAATGGCTATATCAAAAATTAGAA---...AAACTTCGAACTGATAATACTATTTCAACAGTAACCAGAACAGAC---....................................AAAAGAACAGGCAAAAAAACAATATCAAAACGTTTTAATACAAGAACTCTTttaAAAGGATTTCATAAAATGTGGTACCAAAGTTATATCGATGACAATGGTAACACAAAG------TATAAAAAACGTCTTCCAAATAAAATCGAGGGG......TTTTTTAGTAGTACTTTTTTAGCTGTTTGGTTTGCTGGAGATGGG---------------ACCAAA..................ATTGTTGGTAGCCGAGGTGCAAAATATGAGGTTACGTCCTTAACGGTAGATGAACGACATCAATTACAAAGACTTTTTAAAAAAAAATTTGATATTGATGCTGTTATAATTCGTTCAGGTGAATCAAAA...aaaGGCTCACCACAATGGGCACTTTCAATTAATGCACCAGACTATGATAAATTTAGA
Q9XIL5_ARATH/329-494 CAGCGTGAGGTATTGGTAGGTTTGTTGTTAGGTGGCTTGCAAATCGAATCAGACAAAGAGAAGAAGAGC---.........---------CACATGATCAAATTTGAATTTAGAGAA---------...------AATTCTCAAGCTCATCTGGTTCTTAAACAAAAC---...---ATACATGACCAGTTCCGTGAGTGGTTGCATCCTTTGAGCAAT---....................................------TTTCAGGAGGATATTATACCGTTCGAATTCTACTCCGTTCCCCAT...TCATACTTCGGGTTTTACGCTGAACATTACTGGCCA------AAGGGTCAGCCA------------------GAGATTCCAAAACTGATTCATCGG......TGGCTATCGCCACACTCACTCGCGTATTGGTACATGTACAGCGGC---------------------..................GTTAAAACATCATCAGGAGACATTATCTTGAGATTGAAGGGAAGTCTCGAAGGTGTTGAGAAAGTAGTAAAGGCTCTTCAAGCCAAATCT---ATGGAATGTCGAGTTAAGAAGAAAGGA---------......------AAAGTCTTCTGGATTGGACTTCAGGGAACAAACTCAGCTTTGTTCTGG