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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF03073 alignment
(14 sequences with 477 bp)


P74502_SYNY3/5-153 CCA------------GCTTGGCTATGGATTGGGTTGATCGCTTTTGCCCTAGCCTTTGTGTGTAACCGTTTATCCCCCAGGGATTTGCGT...------TGGTTCAATCGCCTGCGTCGCCCTTCTTGGCTAACTTTTGAGTGG...GCCATCCCCTTCATCTGGATTGCCATTTTCATTGCTGGAGCCATTTCCGCTACCCTAGCCTGGAATGCCACGGCGGACCCGGGACATCGCTGGGGA------TTAATGGTCGGCTATCTTCTGCTGGAATTGACTGTCATGGCCTACACCCCCGTGATGTGTAAACTCCGGAGTTTAAGGGTGGGCAGTATTATTGGTGCGACAGGTTTCTTTGTGGGGCTCGCCCTGGTGATCGCCGTTAGTCAAGTTTCCACCACTGCTTTTGGTTTCTTAGTACCGTTTTTGCTTTGGAGCCCCATTGGCACCTATGTCACCTGGGCCATGATTCCC
Q93367_CAEEL/388-545 ACTCAGGACACTCGTAATGCGATCATCTCGTCGTTGATTCCAGCTGGAGCCGCGGTGGCTGCCTTTGCATCATTTGCCAAAGATCAGCAAgttGCTGATTGGTGGGCGGCATTGAAAAAGCCAAATTGGGCTCCAAAAGACGTTcgaGTCTATTCCGCTGTCGATCTTCTGACTCTATCGCCTTTGGGATACGCTTCTTACCTTGTATACAAGAACGGAGGTGGGTTCGACTACAACGACACAAAGTTGGCTCTTGGTTTGTATGGAGCTAGTGTCACTCTCGCTGTTGCAACAATTCCGATCGTCAAGAAGAAGGAG---CTGGGATGTTTGTGGAAGAATACCACTGTTGTCAGTTTGACTGCTGCAGCTGCATCTTTTGCATTCTACAAGATTGACAAGAAGGCTGGCCTCCTTGTCGTTCCATTCGCTGTATGGACCGCTTTCTACGCTTACCTCGCTTACTCCATCAAGAAG
O94327_SCHPO/5-162 TATCAAGTATTCACTAGCATCTCCAAAAATTGGTGGTCCGCTTCTCTCGTTCCAGTCGCCTGCGGCTGGTTCATTGGGAATTCCTACAAGccaAGAAAGGATTATGAGAACAAAAAGCAACCAAAGTTCCACCCCCCTGCATCT...GCCTTTGGACCAGCATGGACACTACTATACCTAACAATGGGATATGCATCCCATTTGGCGTACAAGGCTGACCCTTTGATGATTACGAATGCCTCTCGAAATGGATCCATTTTATACATTGCACAGTTGGCCGCTAACTTTGCTTGGATGCCCTTGTTCTACGGATTAGCAAAACCAAAATTGGCTCTTGCCGATCTCGGCATTTTGACGGGACTTGTTGGTTGGCTTGCAAAGACATGGTGGCCTCTTGCACCAACGGCTTCCAAATGGTTAATTCCTTATTTAGCCTGGTTGGGATACGCTGGCTACTTGGTAAGTAATGTCACTAAT
Q9WXA8_ACIRU/8-156 TGGGGA---------CCGGTTCTGGTCGCGGCGGTGACCGCGACGGTGGTGGCCGGTGCCGGCGGTGCCGCCAGCACGATCGGGCCG---...------TGGTATCGGGGCTTGCGCAAACCCTCGTGGCAGCCGCCGCCCTGG...CTGTTCGGACCGGTCTGGACCTTGATTTTTGCCCTGATCGCCGGGGCTGGGGTGATCGGCTGGGAAGCCGCGCCGAGTGTGACGAGCGCGACG------TTCCTGCTGGTGTTGTTCGGCATTAATGCGGTGTTCAATGTCGCGTGGAGCGTGCTGTTCTTCACCATGCGCCGGCCGGATTGGGCGTTGATCGATATCGCACCGCTCTGGCTGACGATTCTGGCGCTGGTCGTCACCACCGCGCAATTCGCCGGCACCGCGGCGCTGCTGCTGATGCCGTATCTGCTCTGGGTGACGTTTGCCGGCTACCTGAACCTTGTGATCGTGCGG
O28797_ARCFU/3-150 ATA------------CTGAAGCTTGTGGCATCCATCTTAGCAGTTCTGGCAATAGGTTTCGCTGGCTCCTTTTTCACAGCTCAATCTGTG...CAGACTTGGTATGCAGGAGTTGAAAAGCCCTTTTTCACTCCCCCCAACTGG...CTTTTCGGTCCAGCTTGGACATTGCTCTACTTCCTGATTGGGATAGTTCTTTACATCGCATGG------GAAAATGGGTTCTGGAATGATTCC------AGAGTGAAAGCCACATTCTTCACGCAGCTCGGACTCAACTTCCTCTGGTCTATCCTCTTCTTTGGTCTCCAGAATCCTCTCGCCGGATTGGTGGACATTATCGCTCTGGACATCGCCGTAATACTGACGATTGTTTACATCTATCATCACTCCAAG---GCTTCATTGCTTCTCCTGCCCTATCTCGGCTGGATACTGTTTGCAAGTGCCCTGAACTTCGCCATCTATCTT
Q9ZGF6_HELMO/10-165 GTAGCAATCAATGTCCTCAAACTCATCGCGAGCATCATCATCTGCCAGGTAGCGAGTTTAATTGGCGCTAAGTTCACCATTCATCCGGCCaatATCATATGGTATGCCCAACTGGCCAAACCTGCATTCAACCCGACGAATGAC...GCCTTTTATCCTGTTTGGATAGTTCTATATACACTTATGGGAATCGCCCTGTATTTGGTGTGGCGA------AAAAACCTTGAACAAGGCGAAGTAAAAATCGCCTTATCCTTGTTTTCGGCGCAATTATTGCTAAATGTCTTATGGTCATGGGTTTTTTTCGAGTTACAAGCTCCCTTTTACGCTTTTTTCGAGATTATTTTGCTGGCAATAGTAATTTTATCGACTGTAATCGCTTTTTATAAGCAGTCCGAATTGGCGGCTGTCTTGATGATGCCCTATTTTTTACGGGTTTGTTACGAAGCGATATTGAACTATTATATTTGGCAA
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BZRP_MOUSE/5-156 TGG------------GTGCCTGCCGTGGGCCTCACTCTGGTGCCCAGCCTGGGGGGCTTCATGGGAGCCTACTTTGTACGTGGCGAGGGC...CTCCGGTGGTATGCTAGCTTGCAGAAACCCTCTTGGCATCCGCCTCGCTGG...ACACTGGCTCCCATCTGGGGCACACTGTATTCAGCCATGGGGTATGGCTCCTACATAGTCTGGAAAGAGCTGGGAGGTTTCACAGAGGACGCTATG---GTTCCCTTGGGTCTCTACACTGGTCAGCTGGCTCTGAACTGGGCGTGGCCCCCCATCTTCTTTGGTGCCCGGCAGATGGGCTGGGCCTTGGCCGATCTTCTGCTTGTCAGTGGGGTGGCGACTGCCACAACCCTGGCTTGGCACCGAGTGAGCCCGCCGGCTGCCCGCTTGCTGTACCCTTACCTGGCCTGGCTGGCTTTTGCCACCGTGCTCAACTACTATGTATGGCGC
BZRP_BOVIN/5-156 TGG------------GTGCCTGCCGTGGGCTTCACGCTGTTGCCCAGTCTGGGGGGCTTCCTGGGTGCCCAGTACACCCGCGGAGAGGGT...TTCCGCTGGTACGCCAGCCTGCAGAAGCCCCCGTGGCACCCGCCCCGCTGG...ATTCTGGCTCCCATCTGGGGCACACTCTACTCGGCCATGGGGTATGGTTCCTACATGATCTGGAAAGAGCTGGGGGGCTTCTCGAAGGAGGCGGTG---GTTCCCCTGGGCCTCTACGCTGGGCAGCTGGCTCTGAACTGGGCATGGCCTCCCCTCTTCTTCGGCACTCGACAAATGGGCTGGGCCTTGGTGGATCTCCTGCTGACTGGCGGCATGGCAGCAGCCACGGCCATGGCCTGGCACCAGGTGAGCCCGCCGGCTGCCTGCCTGCTGTACCCGTACCTGGCCTGGCTGGCCTTTGCCGGCATGCTCAACTACCGCATGTGGCAG
Q9R9N7_RHIME/6-152 CTT------------CTCGTGCTGGTCGCCTTCGAGGTCGCGAGCTTCGCTGCGGCGGCTACCGGCGTGATCTTTAGGCCAGGCGAC---...------TGGTACAAGCAGCTCAACAAGCCACGATGGCGCCCGCCCGATTGG...CTATTCGCCCCGGTCTGGGCGGTTCTCTATGCATCGATTGGACTGTCGGGCTGGCTCGTATGG---CAAGAAGCAGGCATTGCTGGCGCGGCA------CTGCCTCTCGGTACCTATGCAGTCCAACTTCTGCTCAATGCTGCGTGGACGCCGATCTTTTTTGGACTTCACCGACCCGGGCTGGCCGCGGTGGAAATTATGGTGCTTTGGGCTGCGATCCTGGCGACGACCGTAATGTTTCACCCCGTGAATGCGGCTGCTGCCTTGCTGCTTGTTCCTTACCTGGCGTGGGTGAGTTTCGCGGCGGCACTCAACTTGTCCATCTGGCGG
Q9VPR1_DROME/10-162 ATT------------CTCCGCATCGCCGGGGCCGTGATTCTGCCCAATCTGGGCGGCATCTATAACGGGCGGCTGACCAGGCAGCATCTC...CAGAGCTGGTACGCCAACCTTAAGTTCCCGTCCTTCAAGCCGCCCAACTCG...GTCTTTGCGCCGATGTGGATCTCCTTGTACGCGGGAATGGGCTACGGCTCCTACCTGGTGTGGCGTGATGGCGGAGGCTTCGCCGGCGAGGCGGCCAAACTGCCCCTGATCGCGTACGGCACCCAGCTGGCCTTGAACTGGGCGTGGACGCCCATTTTCTTCGGGCAGCACAACATCAAGGGCGGCCTTATTGACATAGTTGCACTCACGGCCGCCGCGTCCGCCTGCGGCGTTCTGTTCTACCGAGTGAACAAGACCGCTGGATTGCTCTTCGTACCCTACGTCGCCTGGCTGGGATTCGCGACGGCTCTGAACTACGCCATCTGGAAG
Q9RFC8_RHOSH/5-148 TGG------------GCTCTTTTCCTCACCTTCCTCGCTGCCTGCGGCGCGCCCGCGACGACGGGGGCGTTGCTGAAGCCCGATGAA---...------TGGTACGACAATCTGAACAAGCCCTGGTGGAACCCGCCGCGCTGG...GTGTTTCCGCTGGCCTGGACCTCGCTCTATTTCCTCATGAGCCTCGCGGCCATGCGGGTGGCG---CAGCTCGAAGGTTCGGGGCAG---------------GCGCTGGCCTTCTATGCCGCGCAGCTCGCCTTCAACACGCTCTGGACGCCGGTCTTCTTCGGGATGAAGCGGATGGCCACCGCGCTCGCCGTGGTGATGGTGATGTGGCTCTTCGTGGCCGCGACCATGTGGGCCTTCTTCCAGCTCGACACCTGGGCGGGGGTGCTGTTCGTGCCCTACCTGATCTGGGCCACCGCCGCGACCGGCCTCAATTTCGAGGCGATGCGG
CRTK_RHOCA/3-150 CTG------------ACTCTCTTTGCCGTCTATTTCGTCGCCTGCGCCTGCGCGGGCGCGACCGGAGCGATCTTCAGCCCCGGCGCA---...------TGGTATGACAGCCTGAAGAAACCGAGCTGGGTGCCGCCGAACTGG...CTGTTTCCCGTCGCCTGGTCCACGCTTTACATCCTGATGTCGATTTCGGCGGCGCGGGTATCC---GGGCTGGCGATGGAAAACGAACTGGCCGTG---CTGGGTCTGGCCTTCTGGGCGGTGCAGATCGCGGTCAACACGCTTTGGACGCCGATCTTCTTCGGCCTGCACCGGCTGGCGGGCGGGATGCTGGTTCTGGTGCTTTTGTGGCTGAGCGTCTTTGCCACCTGCGTCCTGTTCTGGAGCGTCGACTGGCTCTCGGGGCTGATGTTCGTGCCCTATGTGATCTGGGTGACGGTGGCCGGGGCGCTGAATTTCAGCGTCTGGCGG
O34694_BACSU/5-152 GTCGGC------------GCTTTAGCCGTTTTTGTGATTACATATGCGCTGTTTTCAGCCGCAGGCTACCTGTTTCCTGTGGACCAA---...---GAATGGTACAATTCATTGAAAAAACCGGACTGGACGCCAAGCGGAACT...GCGATCGGCATCATTTGGGCCATCCTGTTTGCCCTGATCTCCCTTTCAGCAGCCATTGTATATGCTGCGTTTTCATTTAAAGGTGCGAAAAGC---------TTTTGGTTTACACTTTTGATAAATTACGTGCTCAATCAAGCCTTCAGCTATTTCCAGTTTACGCAAAAAAATCTGCTGGCTGCATCGCTTGACTGCCTGCTTGTCGCCATCACAGCAATCGTATTACTGATCATTGCCAAAAAATACAGCAGAGCCGCAAGCTATCTTCTTTTGCCTTATTTTTTATGGAGTGCATTTGCGACGTTCTTATCCTTTACAATCAATTCA