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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF02945 alignment
(16 sequences with 393 bp)


Q854C9_9CAUD/61-142 GCGCGGCGCTGGGATAGCATCTACGGGATA------------ACCCCTGATGAATACGCC---GCAATTCTAGAAGAGCAGGGTGGG...---CGTTGCGCCCTA------TGCCAG---AGGGCCAATGGGACC---ACGAAGGCATTA---...------GCAGTTGAACATGACCAT---------------AAAACCGGCGTG---...---------------------GTGAGGGGCATTTGCTGCGGCCCCTGCAACCTCGGCGTGCTTGGCCAT......GCT...---...---......------------------------...---CGCGACGATATCGCGTTCTTCGAGCGC------GCGATCGACTACCTGAATTCC
Q9B067_BPMB1/49-130 GAGAAGCGCCTTCTGGAGCTCTACGACATC------------ACCGCCGATGAGTACTGG---CAGATATACGAGGCTCAAGGTGGC...---AGGTGCTACATC------TGTCGC---AAAGGCCGAGGCCTG---CGGAAGAAGCTG---...------GCCGTCGACCACGACCAC---------------CGAACAGGGCAC---...---------------------GTTCGCGGGCTGCTGGATACGCCCTGTAACCGCAACGTACTCGGTCAC......CTT...---...---......------------------------...---GGTGACGACCCCGAAGCTCTCCAGCGA------GGGATCGACTACCTGGAGAAC
Q857G3_BPMB2/60-141 GAGACAAGGATCTTCGCCACCTACGGCATC------------ACCGCCGAGGAGTACTGG---GCGATCTACGAGTTCCAAGGAGGC...---CGGTGCTACGGC------TGCCGC---CGCGCCAACGGCAAG---CGGAAGCGGCTC---...------AGCGTCGACCACGACCAC---------------GAAACAGGCATC---...---------------------GTCAGGGGGCTTCTATGCACCGCGTGCAACCGCAACGTCCTGGGCCAT......CTG...---...---......------------------------...---AGGGACGAGCGCGAGGCGTTCCAGCGG------TTCATCGACTACCTGGACAAC
VG59_BPMD2/49-130 GAGACCCGGATCCTGGCCACCTACGGCATC------------ACCGCTGAAGAGTACTGG---GCCATCTATGAGTTCCAGGGTGGC...---CGCTGCTACATC------TGCCAG---CGGGCGAACGGAAAG---AGGAAACGGCTA---...------TCGGTAGACCATGACCAC---------------AAGACGGGCATC---...---------------------GTTCGAGGGCTGCTCTGCACGATGTGCAACAAGTACATCCTCGGCTGG......GCG...---...---......------------------------...---CGGGATTGCATCGAGATGCTCCAGCGA------GCGATCGACTACCTGCGTAAG
Q856T3_9CAUD/46-138 GGCCGAAGAGTCGAATCTGGGTACGGGATA------------CCCCAGGAGCTGTATTGG---GCGCTGTACGAGGCCCAGGGCGGT...---AAATGCGCCATA------TGCCAGATC---GCCACCGGCAAG---ACCAAGAGGCTC---...------GCCGTCGACCACGATCACAAGATGGCCGTCAACGTGTGCGGCCACGACgccAACAAGGGCTGCCCTCAGTGCATCCGCGGTCTGCTGTGCGGCCCGTGCAATCAGGGC---ATCGGCCGC......TGG...---...---......------------------------...---------TCGCCGGAAGCGCTGGTCCGC------GCGCTGAACTACCGACTCGAC
Q99PZ8_STRCO/154-212 GAGGAGCGCATCCCCATCTGGTACGCCTGG---------------------------TGG---CGGCTGCACGACATCCAGGACGGC...---ACGTGCGCCACT------TGCAGCGCC---------------------CCCGCCTAC---...------GCCATCGACCACGACCAT---------------CACACTGGCCTT---...---------------------GTCCGCGGCTTGTTGTGCGTTTCCTGCAACAAG---CGGGAGGGCACC......TGC...---...---......------------------------...------------------------CGACGG---------------------CGCGCG
Q9MBZ1_9CAUD/47-128 GATAGAAACCTTCGTCGTCTATACGGAATC------------GGTCTGAATGAGTATGAA---GAAATGCTCACTAAGCAGAATGGC...---GTCTGTGCAATC------TGCGGTATTACCGAGAGAGTTGAG---GGACGGGCGTTA---...------GCGGTTGACCATTGCCAC---------------GCCACTGGCGCT---...---------------------GTTCGTGGTCTCCTTTGCTCTGCCTGTAACATC---GCTCTTGGGAAA......TTC...---...---......------------------------...---GAGGACGACACCGAGCGTCTTCGGAAG------GCAATCACTTACCTAAGAGGA
O87597_STRCO/77-153 GTAGGGCACTTGAAGCGTCACTACGGCCTC------------ACCGAGGCCGAGCGGGAC---GCGATGGTCGCCTCTCAGATGGGC...---CTCTGCGTGATT------TGTTTGAAG------------------GCTCCGGCCGTA---...------CACGTGGATCACTGTCAC---------------AAGACGGGTAAG---...---------------------GTCCGTGGCGTACTGTGCTTCAACTGCAATTCG---GCCATCGGCAAG......TTG...---...---......------------------------...---GGAGACGATCCCGACGCTGTTCGTCGG------GCTGCCGCCTACCTGGAGGGA
END7_BPT4/1-97 ATGTTATTGACTGGCAAATTATAC---------------------AAAGAAGAAAAACAG---AAATTTTATGATGCACAAAACGGT...---AAATGCTTAATT------TGCCAA---CGAGAACTAAATCCTGATGTTCAAGCTAAT---...------CACCTCGACCATGACCATGAATTAAATGGACCAAAAGCAGGAAAG---...---------------------GTGCGTGGATTGCTTTGTAATCTATGCAATGCT---GCAGAAGGTCAA......ATGaagCATaaaTTT......AATCGTTCTGGCTTAAAGGGACAA...GGTGTTGATTATCTTGAATGGTTA------GAAAATTTACTTACTTATTTAAAATCC
Q82RY9_STRAW/40-138 GTCGAACGGCAGGTCCGCCGATACCGGATC------------ACCGTGCCGCGGAGGAAC---GCGATCATGCGCTTCCAGCGCGAC...---GTCTGCGCCCTG------TGCCAGGAAGGCCCGCCGACCGACCACTGCCCCGATGCCGTCagcTTCTGGCACATCGACCACGACCAC---------------CGCTGCTGCCCTCCC...GGCGGCTCATGCGGGCGGTGCGTCCGCGGCCTCCTGTGCCTGCCCTGCAACGCC---ACC------CGC......CTG...---...---......CCCGCCTACGAACGCCTCCCCAACgtcCTCCGCGACAGCCCTCGCTTC------AAC------------ACCTACCTCAACAGC
Q82R65_STRAW/149-228 GAGCTGCTGCACCTGTGGCCTCCCCGCCCGGCCCGTACGGCATCCGTCCGGCGCCTGCGTGCCGCGCTGGTCGACGCGCTCGGCCCC...---GACTGCCATCTG------TGCGGCCTG------------------TACCCCGGGGCG---...------ATGGTCGACCATGACCAC---------------CAGACAGGTCGG---...---------------------GTGCGGGGACTGCTGTGCGCTTACTGCAACCGG---CTC---------......TTG...---...---......---------GAGGAATGCCCGCAC...CTCACCGACTGCCCCAGGGCC---------------------GACTATCTGCTCGCG
Q853W7_9CAUD/109-202 TCCGCAAAGCTGCGCAGCAAGTTTAACATC------------ACGCTCGATCAGTATAATCATCTGCTATACGAAGTGCAGGGCGGC...---AAGTGTGCGAATCCGGGGTGCGACGCCCGCCCGAAAGAGGGG---GCGCGTCGCTTT---...------CCTGTTGACCACGATCAC---------------GCGTGCTGCCCGGATcgtGCCGTTTCGTGCGGCAAGTGCGTTCGCGCCATCCTATGCCCACCCTGCAACACG---ACGTTGGGCCAA......ATG...---...---......------------------------...---AGGGATAGCCCGAAGCGCCTCCGGGGT------CTTGCGGATTTCGTAGAGAAT
Q854H7_9CAUD/21-116 CGGCACTGGTTTGAGTACGCCGCCAGCCGCTGCGTGGGCGGCACCAAGGCGGATTTGAAACTCATCCTTCTAGAGGAGCAGGAG---...CACCGATGCGCCAACCCCGGGTGTCGAGCGCCGCTAGCCGCCGGT------CGCGGCGCC---...------CACCTCGATCACGACCAC---------------GACTGCTGCGGATCG...GGCAAGGCGTGTGTCGCATGCACTCGAGGGATTTTATGCCCGGCCTGCAACCTC---ATGCTCGGCAGC......GCC...---...---......------------------------...---AAGGATGACATCGAGCGGCTTCGCGGC------GCTATCGAGTACCTAGAAACC
Q849E0_STRVN/152-236 GGCCACCTGCGCGGCGTGCTGTACGAGTCG---------------GCCCGCAGGCGCAGC------------ACCCGCGCCGACGGC...TACCTGTGCCGCCTG------TGCTCGGAG------------------TCCCGGGCGGCG---...------GTCTGGGACCACTGCCAC---------------GACCACGGCCTG---...---------------------GTCCGCGGCCCGTTGTGCGGCAGCTGCAACACCTAC---GAGGGAAAGagcaccGCG...CACtccTTCctgcagAACAAGGAGGGTGCCGCCCTGCAC...CTGTTGGAGTGCCGCGGCTGTCTGGAGCGA---------------------CGCACC
Q82YG4_STRAW/252-319 GGCCAACTGCGCGGAGTGCAGTACGAGTCG---------------CCCCGCAGGCGCAGC---------ACCCGGGCCGACGAC---...TACCTGTGCCGTCTG------TGCAAGAAA------------------CGCCAGGCGTCA---...------GCGTGGGATCACTGTCAC---------------GAGCACGGCCAT---...---------------------GTCCGAGGACCGCTATGCGGTAGCTGCAACACC---CGCGAGGGCAAG......GCC...---...---......------------------------...---------ACGCCGTACTACTTCCTCCAG------------------CTCGAAGGC
Q9ZL26_HELPJ/99-187 GAATGCCGAAAAAATATTGAT---GGTGTGAAATTATCTTCCACAGAGAAAAAGAAAATGGATGAAATCGCACCACCTAAAGGAAGCgttTTTACCTGTCCTATT------TGTGAAAAGCGAAGTATAGTTGGCGTTACAGCAAATCTA---...------GTGCACGATCACAATCAC---------------GACACAGGTTGGGGC...------------------------AGAGAGTGGATTTGTGATAGTTGTAACACAGGA---CTTGGCAGA......TTT...---...---......------------------------...---AAAGACAATCCAAAATTTTTA------GAGAAAGTCATAGAATATTTGAAAAAA