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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF02874 phylogeny
for restricted amino acid alignment


 
((((((((((((((((((((ATPB_LACCA/8-77,Q9RGY1_LACAC/6-75),(ATPB_ENTHR/6-77,(O50159_STRBO/6-77,ATPB_LACLC/6-78))),ATPB_PEPNI/6-83),(((((ATPB_CYTLY/8-77,ATPB_CHLVI/6-74),ATPB_BACFR/8-79),((ATPB_AQUPY/9-86,(ATPB_HELPY/8-78,ATPB_WOLSU/5-75)),((ATPB_RHORU/8-74,(Q9Z460_PARDE/8-74,(ATPB_RHOBL/12-78,(ATPB_CAEEL/72-138,ATPB_NEUCR/51-118)))),(((Q8T4C4_DROME/106-173,ATPBM_CHLRE/40-106),ATPB_RICPR/8-76),((((O04275_PEA/89-156,ATPBM_HEVBR/94-160),ATPBM_DAUCA/83-149),ATPB_YEAST/46-113),ATPB_SCHPO/57-126))))),((ATPB_FERIS/9-78,ATPB_THEMA/9-78),((O50142_RUMAL/9-76,(ATPB_ACEWO/7-74,(ATPB_MYCGA/10-78,ATPB_MYCGE/12-80))),ATPB_CLOAB/8-76))),Q46585_9DELT/8-79)),(ATPB_CORGL/19-90,(ATPB_MYCTU/23-94,ATPB_STRCO/13-87))),(ATPB_BACPF/6-80,(ATPB_BACSU/6-80,(ATPB_BACCA/6-80,ATPB_BACME/6-80)))),((ATPB_HERAU/6-75,ATPB_PROMO/7-74),((((ATPB_SYNP6/13-85,((ATPB_GUITH/11-78,Q40612_OCHNE/11-78),((ATPB_DICDH/16-84,ATPB_GALSU/11-78),(ATPB_ODOSI/11-79,(ATPB_PORPU/11-78,ATPB_CYACA/24-92))))),((((Q9TJR9_PROWI/13-85,ATPB_EUGGR/12-84),ATPB_CHLVU/13-85),(((O03071_HUPLU/3-55,Q9TMU1_CONMJ/23-95),ATPB_MARPO/21-93),ATPB_NEPOL/14-86)),ATPB_CYAPA/13-85)),ATPB_SYNP1/13-85),ATPB_ANASP/13-85))),(ATPB_PECFR/6-77,O05433_MOOTH/6-73)),Q51899_9PLAN/14-85),(ATPB_THIFE/13-78,(((ATPB_BUCAP/7-74,(Q9RQ73_9ENTR/6-73,Q9RQ76_9ENTR/6-73)),ATPB_BURCE/11-76),(ATPB_VIBAL/5-72,O31195_ACTPL/6-70)))),ATPB_STIAU/11-83),O31075_METBA/13-78),((ATPAM_ACACA/27-95,Q9XPJ9_DICDI/39-108),((((((ATPA_BACME/24-92,((O50157_STRBO/24-92,Q9RGY3_LACAC/24-92),ATPA_LACLC/24-92)),(ATPA_AQUAE/25-93,Q9X1U7_THEMA/24-93)),((ATPA_MYCTU/27-95,ATPA_STRLI/27-95),(((ATPA_PORPU/25-93,(ATPA_OCHNE/25-93,ATPA_GALSU/25-93)),(ATPA_MAIZE/25-93,O99015_PROWI/25-93)),((((ATPA_CHLVU/25-93,ATPA_CHLRE/24-92),ATPA_EUGGR/25-93),ATPA_SYNP6/25-93),ATPA_SYNP1/25-93)))),(((ATPA_THIFE/25-93,(ATPA_BUCAP/24-92,ATPA_VIBAL/24-92)),(O50140_RUMAL/24-92,ATPA_CLOAB/24-92)),((ATPA_MYXXA/24-92,Q9S5B7_9DELT/24-92),(O05431_MOOTH/24-92,Q49049_MYCCA/24-82)))),((ATPA_HELPY/25-93,ATPA_RICPR/24-92),(Q36517_PLASU/26-94,(O96252_PLAF7/57-131,((Q9T252_PHYIN/21-90,Q9XXK1_CAEEL/52-120),(Q96550_CHLRE/87-155,((ATPA_KLULA/64-132,ATPA_SCHPO/52-120),((ATPA_RHOBL/24-92,O21268_RECAM/24-93),Q9TC93_NEPOL/24-92)))))))),((O31082_METBA/44-112,ATPA_MYCGE/24-92),ATPA_MYCGA/24-92)))),(NTPA_ENTHR/6-68,(VATA2_TREPA/11-73,(((VATA_HALVO/15-76,VATA_METBA/7-68),VATA_ARCFU/12-73),(VATA_DESSY/4-66,(((VATA_THETH/6-68,((((((VATA_NEUCR/18-80,VATA_SCHPO/28-90),(VATA2_DROME/19-81,Q9VK47_DROME/143-205)),(O00779_DICDI/22-84,VATA_BRANA/24-86)),(((Q9SM51_SCHDU/15-77,Q24802_ENTHI/15-77),VATA1_ACEAT/12-74),(VATA_CYACA/14-76,VATA_TRYCO/17-79))),VATA_PLAFA/14-76),P92128_GIALA/12-74)),VATA_METTH/7-69),(VATA_AERPE/8-70,(VATA_SULSO/6-68,VATA_SULAC/6-68)))))))),(((FLII_AQUAE/30-93,Q46642_ERWAM/33-97),((((O30438_YEREN/10-77,SPAL_SHIFL/13-80),(Y4YI_RHISN/39-104,((O68539_BORBR/27-92,YSCN_YEREN/27-92),(Q9Z7J8_CHLPN/27-91,(HRPB6_XANCV/28-93,Q52495_RALSO/26-91))))),O05555_LEGPN/29-93),(((((O84722_CHLTR/23-87,Q9Z748_CHLPN/23-87),FLII_TREPA/25-90),FLII_BORBU/24-88),Q9WY61_THEMA/24-88),FLII_BACSU/25-91))),FLII_CAUCR/20-86)),VATB_CHLPN/8-72),(VATB_BORBU/8-71,VATB1_TREPA/8-71)),((((VATB_YEAST/31-97,((VATB2_BOVIN/50-116,VATB1_BOVIN/44-110),VATB_SCHPO/27-93)),(((VATB_ARATH/22-88,Q9ZQS1_CITUN/24-90),VATB1_ACEAT/29-95),(((VATB_CAEEL/32-98,VATB_MANSE/33-99),(VATB_TRYCO/30-96,VATB_CYACA/26-92)),VATB_PLAFA/35-101))),(NTPB_ENTHR/8-74,(((VATB_HALSA/7-72,VATB_HALVO/7-72),VATB_METBA/8-73),(VATB_METJA/13-79,((VATB_SULAC/12-78,VATB_SULSO/10-76),VATB_AERPE/14-80))))),(VATB_DEIRA/11-71,VATB2_TREPA/9-75))),VATA1_TREPA/8-72),VATA_CHLTR/13-77,VATA_CHLPN/13-77);
((((((((((((((((((((ATPB_LACCA/8-77:0.13603,Q9RGY1_LACAC/6-75:0.22767):0.05928,(ATPB_ENTHR/6-77:0.11840,(O50159_STRBO/6-77:0.12538,ATPB_LACLC/6-78:0.07666):0.13669):0.09987):0.16465,ATPB_PEPNI/6-83:0.35299):0.06741,(((((ATPB_CYTLY/8-77:0.32344,ATPB_CHLVI/6-74:0.31259):0.08105,ATPB_BACFR/8-79:0.18878):0.05476,((ATPB_AQUPY/9-86:0.55761,(ATPB_HELPY/8-78:0.22656,ATPB_WOLSU/5-75:0.15107):0.24280):0.07231,((ATPB_RHORU/8-74:0.16557,(Q9Z460_PARDE/8-74:0.12291,(ATPB_RHOBL/12-78:0.15139,(ATPB_CAEEL/72-138:0.23237,ATPB_NEUCR/51-118:0.11299):0.09136):0.04482):0.07875):0.07041,(((Q8T4C4_DROME/106-173:0.38004,ATPBM_CHLRE/40-106:0.16753):0.06836,ATPB_RICPR/8-76:0.28925):0.04727,((((O04275_PEA/89-156:0.47834,ATPBM_HEVBR/94-160:0.00001):0.13821,ATPBM_DAUCA/83-149:0.10075):0.14507,ATPB_YEAST/46-113:0.21829):0.06193,ATPB_SCHPO/57-126:0.19255):0.02988):0.02298):0.13491):0.03067):0.11325,((ATPB_FERIS/9-78:0.13154,ATPB_THEMA/9-78:0.16502):0.15140,((O50142_RUMAL/9-76:0.25642,(ATPB_ACEWO/7-74:0.23797,(ATPB_MYCGA/10-78:0.09085,ATPB_MYCGE/12-80:0.36779):0.44304):0.08250):0.05435,ATPB_CLOAB/8-76:0.26955):0.08048):0.02267):0.07869,Q46585_9DELT/8-79:0.19146):0.02605):0.05209,(ATPB_CORGL/19-90:0.22202,(ATPB_MYCTU/23-94:0.16647,ATPB_STRCO/13-87:0.21628):0.04763):0.27420):0.05975,(ATPB_BACPF/6-80:0.23634,(ATPB_BACSU/6-80:0.15806,(ATPB_BACCA/6-80:0.05583,ATPB_BACME/6-80:0.16253):0.03698):0.05089):0.17494):0.03894,((ATPB_HERAU/6-75:0.32874,ATPB_PROMO/7-74:0.23673):0.11478,((((ATPB_SYNP6/13-85:0.12654,((ATPB_GUITH/11-78:0.10396,Q40612_OCHNE/11-78:0.18556):0.12545,((ATPB_DICDH/16-84:0.25571,ATPB_GALSU/11-78:0.19001):0.05557,(ATPB_ODOSI/11-79:0.30736,(ATPB_PORPU/11-78:0.06774,ATPB_CYACA/24-92:0.23484):0.10931):0.03677):0.10956):0.08345):0.01368,((((Q9TJR9_PROWI/13-85:0.32956,ATPB_EUGGR/12-84:0.24712):0.05436,ATPB_CHLVU/13-85:0.06706):0.03049,(((O03071_HUPLU/3-55:0.43366,Q9TMU1_CONMJ/23-95:0.04300):0.06051,ATPB_MARPO/21-93:0.10681):0.03020,ATPB_NEPOL/14-86:0.18164):0.06218):0.06213,ATPB_CYAPA/13-85:0.20785):0.08100):0.01593,ATPB_SYNP1/13-85:0.16685):0.03215,ATPB_ANASP/13-85:0.15088):0.07354):0.07393):0.01647,(ATPB_PECFR/6-77:0.16032,O05433_MOOTH/6-73:0.28098):0.14273):0.09217,Q51899_9PLAN/14-85:0.59345):0.06746,(ATPB_THIFE/13-78:0.35551,(((ATPB_BUCAP/7-74:0.18840,(Q9RQ73_9ENTR/6-73:0.11121,Q9RQ76_9ENTR/6-73:0.14546):0.04364):0.14900,ATPB_BURCE/11-76:0.26438):0.03451,(ATPB_VIBAL/5-72:0.28367,O31195_ACTPL/6-70:0.11904):0.06554):0.11684):0.21276):0.16075,ATPB_STIAU/11-83:0.12914):0.25218,O31075_METBA/13-78:0.69044):1.12608,((ATPAM_ACACA/27-95:0.63459,Q9XPJ9_DICDI/39-108:0.50135):0.15618,((((((ATPA_BACME/24-92:0.08117,((O50157_STRBO/24-92:0.04405,Q9RGY3_LACAC/24-92:0.26370):0.09479,ATPA_LACLC/24-92:0.15739):0.21576):0.13221,(ATPA_AQUAE/25-93:0.30275,Q9X1U7_THEMA/24-93:0.29863):0.07250):0.05160,((ATPA_MYCTU/27-95:0.18283,ATPA_STRLI/27-95:0.29275):0.38343,(((ATPA_PORPU/25-93:0.08459,(ATPA_OCHNE/25-93:0.12820,ATPA_GALSU/25-93:0.13025):0.05875):0.09657,(ATPA_MAIZE/25-93:0.25191,O99015_PROWI/25-93:0.20272):0.07817):0.07421,((((ATPA_CHLVU/25-93:0.05542,ATPA_CHLRE/24-92:0.28884):0.06957,ATPA_EUGGR/25-93:0.13522):0.04852,ATPA_SYNP6/25-93:0.08543):0.03248,ATPA_SYNP1/25-93:0.16006):0.00352):0.25857):0.00625):0.05189,(((ATPA_THIFE/25-93:0.15294,(ATPA_BUCAP/24-92:0.40363,ATPA_VIBAL/24-92:0.06810):0.27229):0.40479,(O50140_RUMAL/24-92:0.37227,ATPA_CLOAB/24-92:0.14714):0.13333):0.08036,((ATPA_MYXXA/24-92:0.26825,Q9S5B7_9DELT/24-92:0.21164):0.07091,(O05431_MOOTH/24-92:0.13691,Q49049_MYCCA/24-82:0.36752):0.03130):0.04122):0.07445):0.05521,((ATPA_HELPY/25-93:0.42100,ATPA_RICPR/24-92:0.29149):0.07830,(Q36517_PLASU/26-94:0.10824,(O96252_PLAF7/57-131:0.41669,((Q9T252_PHYIN/21-90:0.36743,Q9XXK1_CAEEL/52-120:0.12812):0.02043,(Q96550_CHLRE/87-155:0.37153,((ATPA_KLULA/64-132:0.14429,ATPA_SCHPO/52-120:0.19369):0.12828,((ATPA_RHOBL/24-92:0.20500,O21268_RECAM/24-93:0.08632):0.04935,Q9TC93_NEPOL/24-92:0.18724):0.02288):0.04981):0.04443):0.07194):0.02393):0.19446):0.08206):0.14105,((O31082_METBA/44-112:0.89256,ATPA_MYCGE/24-92:0.31735):0.05063,ATPA_MYCGA/24-92:0.35397):0.15969):0.05024):1.46462):0.25655,(NTPA_ENTHR/6-68:0.40010,(VATA2_TREPA/11-73:0.60363,(((VATA_HALVO/15-76:0.23938,VATA_METBA/7-68:0.18542):0.20415,VATA_ARCFU/12-73:0.33006):0.09596,(VATA_DESSY/4-66:0.20787,(((VATA_THETH/6-68:0.18507,((((((VATA_NEUCR/18-80:0.14695,VATA_SCHPO/28-90:0.19014):0.10359,(VATA2_DROME/19-81:0.13235,Q9VK47_DROME/143-205:0.11933):0.06723):0.04440,(O00779_DICDI/22-84:0.11530,VATA_BRANA/24-86:0.14205):0.05362):0.03845,(((Q9SM51_SCHDU/15-77:0.17713,Q24802_ENTHI/15-77:0.25206):0.11046,VATA1_ACEAT/12-74:0.12228):0.05325,(VATA_CYACA/14-76:0.09759,VATA_TRYCO/17-79:0.17809):0.02558):0.00000):0.20452,VATA_PLAFA/14-76:0.26779):0.04906,P92128_GIALA/12-74:0.48896):0.07054):0.16488,VATA_METTH/7-69:0.14655):0.08447,(VATA_AERPE/8-70:0.08818,(VATA_SULSO/6-68:0.07994,VATA_SULAC/6-68:0.28838):0.10642):0.13487):0.11137):0.02618):0.07057):0.04387):0.45614):0.36703,(((FLII_AQUAE/30-93:0.99836,Q46642_ERWAM/33-9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