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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF02874 phylogeny
for nucleotide alignment


 
((((((((((((ATPB_RICPR/8-76,(O50142_RUMAL/9-76,ATPB_ACEWO/7-74)),((ATPB_PROMO/7-74,ATPB_CLOAB/8-76),(ATPB_FERIS/9-78,ATPB_THEMA/9-78))),(((ATPB_MYCGA/10-78,ATPB_MYCGE/12-80),((((O50159_STRBO/6-77,ATPB_LACLC/6-78),ATPB_ENTHR/6-77),(ATPB_LACCA/8-77,Q9RGY1_LACAC/6-75)),(((ATPB_BUCAP/7-74,(Q9RQ73_9ENTR/6-73,Q9RQ76_9ENTR/6-73)),(ATPB_VIBAL/5-72,O31195_ACTPL/6-70)),(((((ATPB_GALSU/11-78,(ATPB_PORPU/11-78,ATPB_CYACA/24-92)),ATPB_CYAPA/13-85),(((ATPB_NEPOL/14-86,((O03071_HUPLU/3-55,Q9TMU1_CONMJ/23-95),ATPB_MARPO/21-93)),((Q9TJR9_PROWI/13-85,ATPB_CHLVU/13-85),(ATPB_DICDH/16-84,ATPB_EUGGR/12-84))),((ATPB_GUITH/11-78,Q40612_OCHNE/11-78),ATPB_ODOSI/11-79))),((((((ATPB_HERAU/6-75,ATPB_PEPNI/6-83),(((((ATPB_THIFE/13-78,O05433_MOOTH/6-73),ATPB_STIAU/11-83),(ATPB_MYCTU/23-94,(ATPB_CORGL/19-90,ATPB_STRCO/13-87))),Q46585_9DELT/8-79),ATPB_BURCE/11-76)),Q51899_9PLAN/14-85),ATPB_SYNP6/13-85),ATPB_SYNP1/13-85),ATPB_ANASP/13-85)),ATPB_PECFR/6-77)))),(ATPB_BACPF/6-80,((ATPB_BACME/6-80,ATPB_BACCA/6-80),ATPB_BACSU/6-80)))),((ATPB_YEAST/46-113,((((O04275_PEA/89-156,ATPBM_HEVBR/94-160),ATPBM_DAUCA/83-149),((ATPBM_CHLRE/40-106,(ATPB_RHORU/8-74,(ATPB_RHOBL/12-78,Q9Z460_PARDE/8-74))),(((Q8T4C4_DROME/106-173,ATPB_CAEEL/72-138),ATPB_NEUCR/51-118),ATPB_CHLVI/6-74))),ATPB_SCHPO/57-126)),((ATPB_CYTLY/8-77,(ATPB_HELPY/8-78,ATPB_WOLSU/5-75)),ATPB_BACFR/8-79))),O31075_METBA/13-78),ATPB_AQUPY/9-86),(((((((((VATB_SCHPO/27-93,VATB_YEAST/31-97),(((VATB_CYACA/26-92,VATB1_ACEAT/29-95),((VATB_ARATH/22-88,Q9ZQS1_CITUN/24-90),VATB_PLAFA/35-101)),(VATB_TRYCO/30-96,(VATB_CAEEL/32-98,VATB_MANSE/33-99)))),(VATB2_BOVIN/50-116,VATB1_BOVIN/44-110)),(NTPB_ENTHR/8-74,(((VATB_SULAC/12-78,VATB_SULSO/10-76),(VATB_METBA/8-73,VATB_METJA/13-79)),VATB_AERPE/14-80))),(VATB_HALSA/7-72,VATB_HALVO/7-72)),(VATB2_TREPA/9-75,VATB_DEIRA/11-71)),(VATA1_TREPA/8-72,(((VATB_BORBU/8-71,VATB1_TREPA/8-71),VATB_CHLPN/8-72),(VATA_CHLTR/13-77,VATA_CHLPN/13-77)))),(((VATA2_TREPA/11-73,(((VATA_AERPE/8-70,(VATA_METTH/7-69,((VATA_SULAC/6-68,VATA_SULSO/6-68),(VATA_PLAFA/14-76,Q24802_ENTHI/15-77)))),(VATA_ARCFU/12-73,VATA_DESSY/4-66)),((P92128_GIALA/12-74,VATA_THETH/6-68),(Q9SM51_SCHDU/15-77,(Q9VK47_DROME/143-205,((VATA2_DROME/19-81,VATA_TRYCO/17-79),((VATA_NEUCR/18-80,VATA_SCHPO/28-90),((O00779_DICDI/22-84,VATA_CYACA/14-76),(VATA_BRANA/24-86,VATA1_ACEAT/12-74))))))))),(VATA_METBA/7-68,NTPA_ENTHR/6-68)),VATA_HALVO/15-76)),(((ATPA_BUCAP/24-92,ATPA_VIBAL/24-92),ATPA_THIFE/25-93),(((O31082_METBA/44-112,((ATPA_BACME/24-92,((O50157_STRBO/24-92,ATPA_LACLC/24-92),Q9RGY3_LACAC/24-92)),((((((ATPA_MAIZE/25-93,ATPA_EUGGR/25-93),(ATPA_GALSU/25-93,ATPA_PORPU/25-93)),((ATPA_CHLVU/25-93,O99015_PROWI/25-93),(ATPA_CHLRE/24-92,((ATPA_SYNP6/25-93,ATPA_SYNP1/25-93),ATPA_OCHNE/25-93)))),((ATPA_HELPY/25-93,(ATPA_AQUAE/25-93,Q9X1U7_THEMA/24-93)),(((ATPA_MYCGA/24-92,ATPA_MYCGE/24-92),(Q9XPJ9_DICDI/39-108,Q49049_MYCCA/24-82)),((Q9T252_PHYIN/21-90,(O21268_RECAM/24-93,(((ATPA_KLULA/64-132,ATPA_SCHPO/52-120),Q9XXK1_CAEEL/52-120),Q9TC93_NEPOL/24-92))),(ATPA_RICPR/24-92,(Q36517_PLASU/26-94,O96252_PLAF7/57-131)))))),ATPAM_ACACA/27-95),(O50140_RUMAL/24-92,ATPA_CLOAB/24-92)))),O05431_MOOTH/24-92),((ATPA_MYCTU/27-95,ATPA_STRLI/27-95),(((Q96550_CHLRE/87-155,ATPA_MYXXA/24-92),ATPA_RHOBL/24-92),Q9S5B7_9DELT/24-92)))))),FLII_CAUCR/20-86),(FLII_AQUAE/30-93,Q46642_ERWAM/33-97)),(Q9Z7J8_CHLPN/27-91,((Y4YI_RHISN/39-104,(O68539_BORBR/27-92,(HRPB6_XANCV/28-93,Q52495_RALSO/26-91))),YSCN_YEREN/27-92))),(((O30438_YEREN/10-77,SPAL_SHIFL/13-80),O05555_LEGPN/29-93),(FLII_BACSU/25-91,((FLII_BORBU/24-88,FLII_TREPA/25-90),Q9WY61_THEMA/24-88)))),O84722_CHLTR/23-87,Q9Z748_CHLPN/23-87);
((((((((((((ATPB_RICPR/8-76:0.32082,(O50142_RUMAL/9-76:0.33868,ATPB_ACEWO/7-74:0.21389):0.05396):0.07710,((ATPB_PROMO/7-74:0.21622,ATPB_CLOAB/8-76:0.23269):0.06169,(ATPB_FERIS/9-78:0.21139,ATPB_THEMA/9-78:0.22228):0.12325):0.05048):0.04762,(((ATPB_MYCGA/10-78:0.18686,ATPB_MYCGE/12-80:0.23094):0.27786,((((O50159_STRBO/6-77:0.15080,ATPB_LACLC/6-78:0.13074):0.11112,ATPB_ENTHR/6-77:0.19357):0.05880,(ATPB_LACCA/8-77:0.19306,Q9RGY1_LACAC/6-75:0.21514):0.06026):0.12751,(((ATPB_BUCAP/7-74:0.15382,(Q9RQ73_9ENTR/6-73:0.06577,Q9RQ76_9ENTR/6-73:0.15092):0.16986):0.06551,(ATPB_VIBAL/5-72:0.25732,O31195_ACTPL/6-70:0.16611):0.16873):0.08422,(((((ATPB_GALSU/11-78:0.16361,(ATPB_PORPU/11-78:0.12868,ATPB_CYACA/24-92:0.23230):0.06122):0.08113,ATPB_CYAPA/13-85:0.16025):0.04625,(((ATPB_NEPOL/14-86:0.26155,((O03071_HUPLU/3-55:0.24941,Q9TMU1_CONMJ/23-95:0.09102):0.08606,ATPB_MARPO/21-93:0.08911):0.03276):0.03751,((Q9TJR9_PROWI/13-85:0.20611,ATPB_CHLVU/13-85:0.11171):0.05660,(ATPB_DICDH/16-84:0.20925,ATPB_EUGGR/12-84:0.19360):0.08006):0.01981):0.06167,((ATPB_GUITH/11-78:0.12718,Q40612_OCHNE/11-78:0.24166):0.08128,ATPB_ODOSI/11-79:0.28246):0.04644):0.02293):0.05165,((((((ATPB_HERAU/6-75:0.32325,ATPB_PEPNI/6-83:0.26835):0.07611,(((((ATPB_THIFE/13-78:0.38973,O05433_MOOTH/6-73:0.29310):0.06836,ATPB_STIAU/11-83:0.18964):0.05897,(ATPB_MYCTU/23-94:0.19014,(ATPB_CORGL/19-90:0.26346,ATPB_STRCO/13-87:0.13015):0.04006):0.08625):0.06214,Q46585_9DELT/8-79:0.17132):0.04809,ATPB_BURCE/11-76:0.29305):0.07624):0.05109,Q51899_9PLAN/14-85:0.34448):0.07931,ATPB_SYNP6/13-85:0.15895):0.07220,ATPB_SYNP1/13-85:0.25179):0.10952,ATPB_ANASP/13-85:0.10633):0.18385):0.06580,ATPB_PECFR/6-77:0.34150):0.03484):0.06151):0.02376):0.04976,(ATPB_BACPF/6-80:0.16008,((ATPB_BACME/6-80:0.14297,ATPB_BACCA/6-80:0.18840):0.05338,ATPB_BACSU/6-80:0.22066):0.08400):0.16733):0.04890):0.05776,((ATPB_YEAST/46-113:0.19443,((((O04275_PEA/89-156:0.31342,ATPBM_HEVBR/94-160:0.08994):0.12232,ATPBM_DAUCA/83-149:0.14870):0.12462,((ATPBM_CHLRE/40-106:0.18266,(ATPB_RHORU/8-74:0.21165,(ATPB_RHOBL/12-78:0.21755,Q9Z460_PARDE/8-74:0.06102):0.03683):0.07067):0.07019,(((Q8T4C4_DROME/106-173:0.29694,ATPB_CAEEL/72-138:0.20449):0.09751,ATPB_NEUCR/51-118:0.14982):0.07498,ATPB_CHLVI/6-74:0.41447):0.04123):0.14561):0.07419,ATPB_SCHPO/57-126:0.22916):0.05943):0.11447,((ATPB_CYTLY/8-77:0.26547,(ATPB_HELPY/8-78:0.29092,ATPB_WOLSU/5-75:0.19208):0.20532):0.07020,ATPB_BACFR/8-79:0.30187):0.04838):0.06931):0.18898,O31075_METBA/13-78:0.56820):0.13482,ATPB_AQUPY/9-86:0.18892):0.58489,(((((((((VATB_SCHPO/27-93:0.32912,VATB_YEAST/31-97:0.11095):0.12234,(((VATB_CYACA/26-92:0.29256,VATB1_ACEAT/29-95:0.20774):0.04328,((VATB_ARATH/22-88:0.11388,Q9ZQS1_CITUN/24-90:0.10517):0.09424,VATB_PLAFA/35-101:0.36935):0.08079):0.05569,(VATB_TRYCO/30-96:0.22898,(VATB_CAEEL/32-98:0.13659,VATB_MANSE/33-99:0.17629):0.11945):0.11630):0.14046):0.04345,(VATB2_BOVIN/50-116:0.14829,VATB1_BOVIN/44-110:0.24854):0.08830):0.32420,(NTPB_ENTHR/8-74:0.47355,(((VATB_SULAC/12-78:0.15280,VATB_SULSO/10-76:0.15921):0.22597,(VATB_METBA/8-73:0.46793,VATB_METJA/13-79:0.26794):0.09141):0.12482,VATB_AERPE/14-80:0.24912):0.11977):0.04236):0.10122,(VATB_HALSA/7-72:0.20094,VATB_HALVO/7-72:0.08412):0.18652):0.15958,(VATB2_TREPA/9-75:0.59128,VATB_DEIRA/11-71:0.28265):0.08020):0.06084,(VATA1_TREPA/8-72:0.32737,(((VATB_BORBU/8-71:0.18951,VATB1_TREPA/8-71:0.43432):0.11487,VATB_CHLPN/8-72:0.39980):0.34731,(VATA_CHLTR/13-77:0.20368,VATA_CHLPN/13-77:0.17098):0.20060):0.16054):0.39010):0.21436,(((VATA2_TREPA/11-73:0.47632,(((VATA_AERPE/8-70:0.22763,(VATA_METTH/7-69:0.11285,((VATA_SULAC/6-68:0.22886,VATA_SULSO/6-68:0.13608):0.11511,(VATA_PLAFA/14-76:0.22283,Q24802_ENTHI/15-77:0.28905):0.11222):0.25198):0.08871):0.09260,(VATA_ARCFU/12-73:0.32104,VATA_DESSY/4-66:0.17158):0.09817):0.06432,((P92128_GIALA/12-74:0.43542,VATA_THETH/6-68:0.13561):0.08187,(Q9SM51_SCHDU/15-77:0.25715,(Q9VK47_DROME/143-205:0.14883,((VATA2_DROME/19-81:0.11112,VATA_TRYCO/17-79:0.28588):0.06681,((VATA_NEUCR/18-80:0.14645,VATA_SCHPO/28-90:0.22653):0.07488,((O00779_DICDI/22-84:0.18414,VATA_CYACA/14-76:0.22637):0.07298,(VATA_BRANA/24-86:0.18400,VATA1_ACEAT/12-74:0.19849):0.06850):0.04514):0.12476):0.04727):0.07944):0.16349):0.04481):0.04903):0.07589,(VATA_METBA/7-68:0.25909,NTPA_ENTHR/6-68:0.45982):0.14678):0.09949,VATA_HALVO/15-76:0.14037):0.09205):0.12019,(((ATPA_BUCAP/24-92:0.48037,ATPA_VIBAL/24-92:0.03583):0.32780,ATPA_THIFE/25-93:0.17687):0.10951,(((O31082_METBA/44-112:0.54167,((ATPA_BACME/24-92:0.16037,((O50157_STRBO/24-92:0.09440,ATPA_LACLC/24-92:0.18457):0.06807,Q9RGY3_LACAC/24-92:0.22085):0.12314):0.08803,((((((ATPA_MAIZE/25-93:0.29975,ATPA_EUGGR/25-93:0.18551):0.04132,(ATPA_GALSU/25-93:0.20532,ATPA_PORPU/25-93:0.16472):0.09761):0.02051,((ATPA_CHLVU/25-93:0.17782,O99015_PROWI/25-93:0.17836):0.04362,(ATPA_CHLRE/24-92:0.23014,((ATPA_SYNP6/25-93:0.23522,ATPA_SYNP1/25-93:0.11944):0.11376,ATPA_OCHNE/25-93:0.15005):0.08848):0.05261):0.03163):0.15867,((ATPA_HELPY/25-93:0.35898,(ATPA_AQUAE/25-93:0.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