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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF02874 phylogeny
for amino acid alignment


 
synthase alpha/beta family, beta-barrel domain
((((((((((((((((((ATPB_LACCA/8-77:0.13662,Q9RGY1_LACAC/6-75:0.22704):0.05921,(ATPB_ENTHR/6-77:0.11847,(O50159_STRBO/6-77:0.12531,ATPB_LACLC/6-78:0.07668):0.13650):0.09944):0.16645,ATPB_PEPNI/6-83:0.35067):0.06691,(((((ATPB_CYTLY/8-77:0.32265,ATPB_CHLVI/6-74:0.31268):0.08450,ATPB_BACFR/8-79:0.18704):0.06680,((ATPB_AQUPY/9-86:0.57596,(ATPB_HELPY/8-78:0.23342,ATPB_WOLSU/5-75:0.14144):0.23286):0.07543,(ATPBM_CHLRE/40-106:0.15809,(Q8T4C4_DROME/106-173:0.43227,(((((ATPB_YEAST/46-113:0.23837,(ATPB_CAEEL/72-138:0.21277,ATPB_RAT/63-129:0.03614):0.03311):0.04246,((O04275_PEA/89-156:0.47824,ATPBM_HEVBR/94-160:0.00000):0.12568,ATPBM_DAUCA/83-149:0.11268):0.12886):0.07084,ATPB_SCHPO/57-126:0.20659):0.05399,ATPB_RICPR/8-76:0.27948):0.03814,(ATPB_RHORU/8-74:0.20497,(ATPB_NEUCR/51-118:0.15709,(ATPB_RHOBL/12-78:0.14714,Q9Z460_PARDE/8-74:0.15861):0.04664):0.05285):0.05342):0.03902):0.02320):0.14087):0.03137):0.09755,((ATPB_FERIS/9-78:0.13046,ATPB_THEMA/9-78:0.16585):0.15304,((O50142_RUMAL/9-76:0.25573,(ATPB_ACEWO/7-74:0.23861,(ATPB_MYCGA/10-78:0.09123,ATPB_MYCGE/12-80:0.36746):0.44191):0.08277):0.05505,ATPB_CLOAB/8-76:0.26735):0.07860):0.02171):0.08146,Q46585_9DELT/8-79:0.19168):0.02634):0.05099,(ATPB_CORGL/19-90:0.22387,(ATPB_MYCTU/23-94:0.16690,ATPB_STRCO/13-87:0.21643):0.04556):0.27692):0.05845,(ATPB_BACPF/6-80:0.23622,(ATPB_BACSU/6-80:0.15850,(ATPB_BACCA/6-80:0.05532,ATPB_BACME/6-80:0.16273):0.03697):0.05115):0.17796):0.03161,((ATPB_HERAU/6-75:0.32494,ATPB_PROMO/7-74:0.24030):0.10926,((ATPB_SYNP6/13-85:0.15274,((ATPB_GALSU/11-78:0.18241,(((ATPB_ODOSI/11-79:0.29954,(ATPB_PORPU/11-78:0.04879,ATPB_CYACA/24-92:0.24932):0.12839):0.02492,(ATPB_GUITH/11-78:0.14322,Q40612_OCHNE/11-78:0.15770):0.17579):0.08432,ATPB_DICDH/16-84:0.25673):0.02004):0.12266,(ATPB_SYNP1/13-85:0.11714,((ATPB_EUGGR/12-84:0.25743,(Q9TJR9_PROWI/13-85:0.31005,ATPB_CHLRE/12-84:0.19398):0.06410):0.00000,((ATPB_CYAPA/13-85:0.24376,ATPB_CHLVU/13-85:0.06619):0.01536,(((O03071_HUPLU/3-55:0.44411,ATPB_MARPO/21-93:0.05929):0.06096,(Q9SC30_RORGO/23-95:0.06057,Q9TMU1_CONMJ/23-95:0.06548):0.02543):0.03359,ATPB_NEPOL/14-86:0.17374):0.07541):0.02865):0.11529):0.02006):0.04356):0.03587,ATPB_ANASP/13-85:0.14901):0.07499):0.08947):0.01827,(ATPB_PECFR/6-77:0.15929,O05433_MOOTH/6-73:0.28181):0.14776):0.09198,((ATPB_THIFE/13-78:0.39652,(((ATPB_BURCE/11-76:0.29343,O31195_ACTPL/6-70:0.10589):0.06880,ATPB_VIBAL/5-72:0.29409):0.04224,(ATPB_BUCAP/7-74:0.17909,(Q9RQ73_9ENTR/6-73:0.11469,Q9RQ76_9ENTR/6-73:0.14166):0.05257):0.13049):0.11404):0.17072,Q51899_9PLAN/14-85:0.55885):0.08051):0.21229,ATPB_STIAU/11-83:0.12242):0.32937,O31075_METBA/13-78:0.58996):1.01129,(((O31082_METBA/44-112:0.80944,(ATPA_MYCGA/24-92:0.30423,ATPA_MYCGE/24-92:0.40552):0.11435):0.11875,(((ATPA_MYXXA/24-92:0.37436,((Q49049_MYCCA/24-82:0.38074,(((ATPA_CHLRE/24-92:0.21730,(((ATPA_PORPU/25-93:0.06687,(ATPA_OCHNE/25-93:0.13689,ATPA_GALSU/25-93:0.12516):0.06771):0.11111,((ATPA_MAIZE/25-93:0.24851,ATPA_SPIOL/25-93:0.01717):0.08252,((ATPA_CHLVU/25-93:0.10860,ATPA_EUGGR/25-93:0.14191):0.00000,(ATPA_SYNP1/25-93:0.16790,ATPA_SYNP6/25-93:0.07450):0.06009):0.06908):0.01562):0.02188,O99015_PROWI/25-93:0.23127):0.11487):0.30097,(O50140_RUMAL/24-92:0.36698,ATPA_CLOAB/24-92:0.16260):0.14030):0.03310,Q9S5B7_9DELT/24-92:0.28307):0.01830):0.02112,(O05431_MOOTH/24-92:0.13537,ATPA_PROMO/24-92:0.30151):0.03385):0.00000):0.04369,((ATPA_RICPR/24-92:0.34196,(ATPA_HELPY/25-93:0.49707,(Q36517_PLASU/26-94:0.09140,(O96252_PLAF7/57-131:0.39953,((Q96550_CHLRE/87-155:0.40504,((ATPA_RHOBL/24-92:0.20394,O21268_RECAM/24-93:0.08433):0.05888,Q9TC93_NEPOL/24-92:0.19080):0.02997):0.00891,(Q9T252_PHYIN/21-90:0.36769,((ATPA_KLULA/64-132:0.14220,ATPA_SCHPO/52-120:0.21224):0.10069,(ATPA2_PIG/67-135:0.07682,Q9XXK1_CAEEL/52-120:0.12267):0.02959):0.01878):0.04910):0.07689):0.05148):0.15043):0.08890):0.08922,((ATPA_BACME/24-92:0.11203,((O50157_STRBO/24-92:0.04382,Q9RGY3_LACAC/24-92:0.26434):0.10104,ATPA_LACLC/24-92:0.15159):0.18579):0.14558,(ATPA_AQUAE/25-93:0.29964,Q9X1U7_THEMA/24-93:0.30872):0.05972):0.07439):0.07534):0.05056,((ATPA_THIFE/25-93:0.22942,(ATPA_BUCAP/24-92:0.38526,ATPA_VIBAL/24-92:0.08766):0.19988):0.34142,(ATPAM_ACACA/27-95:0.47783,Q9XPJ9_DICDI/39-108:0.66155):0.26105):0.08377):0.10172):0.26683,(ATPA_MYCTU/27-95:0.14052,ATPA_STRLI/27-95:0.30897):0.03270):1.39907):0.78042,(NTPA_ENTHR/6-68:0.38584,(VATA2_TREPA/11-73:0.56547,(((VATA_HALVO/15-76:0.23838,VATA_METBA/7-68:0.18605):0.19515,VATA_ARCFU/12-73:0.33634):0.08651,(VATA_DESSY/4-66:0.15170,((VATA_METJA/7-69:0.07686,((VATA_THETH/6-68:0.19036,((((Q9SM51_SCHDU/15-77:0.18922,Q24802_ENTHI/15-77:0.24559):0.12997,((((VATA1_ACEAT/12-74:0.13716,VATA_BRANA/24-86:0.12883):0.01471,O00779_DICDI/22-84:0.14577):0.04323,((VATA2_DROME/19-81:0.13141,Q9VK47_DROME/143-205:0.11915):0.06636,(VATA_NEUCR/18-80:0.14951,VATA_SCHPO/28-90:0.18685):0.10374):0.05381):0.02621,(VATA_CYACA/14-76:0.09163,VATA_TRYCO/17-79:0.18009):0.02491):0.00000):0.19159,VATA_PLAFA/14-76:0.27566):0.05727,P92128_GIALA/12-74:0.46575):0.0636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