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PANDIT Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees |
PF02861 phylogeny |
| ((((((((((((O83560_TREPA/17-69,Q9RVB2_DEIRA/91-143),((CLPC_MYCTU/16-68,(CLPC_MYCTU/91-143,(Q93HB2_STRAW/178-228,(Q9X8L2_STRCO/184-234,Y2667_MYCTU/183-233)))),(Q9RVB2_DEIRA/16-67,(Q8KFX9_CHLTE/16-68,(Q9WY41_THEMA/91-143,((((((CLPC_ODOSI/91-143,CLPC_CHLTR/92-144),(((ERD1_ARATH/179-231,O67325_AQUAE/88-140),HLYB_TREHY/94-146),(((CLPC_ODOSI/16-68,O48931_ARATH/108-160),HLYB_TREHY/18-70),(((Q8XHP1_CLOPE/17-68,Q8NXY8_STAAW/17-69),(((Q8YAB6_LISMO/17-69,CLPC_BACSU/17-69),Q93CX3_LACSK/16-68),CLPC_CHLTR/16-68)),Q8R7S1_THETN/18-70)))),((Q8YAB6_LISMO/91-143,Q8NXY8_STAAW/91-143),(CLPC_CYACA/122-174,((O48931_ARATH/183-235,CLPC_PORPU/91-143),CLPC_GUITH/91-143)))),Q8R7S1_THETN/92-144),Q97EC4_CLOAB/93-145),Q8YVL2_ANASP/91-143)))))),((((Q93WL3_ARATH/97-149,O83560_TREPA/94-146),Q9WY41_THEMA/16-68),(((Q97EC4_CLOAB/17-69,(Q9CHS9_LACLA/19-71,CLP_TRYBB/19-69)),O67325_AQUAE/16-67),((ERD1_ARATH/94-144,Q9X1B1_THEMA/98-150),(Q93CX3_LACSK/95-147,Q8KFX9_CHLTE/92-144)))),CLPB2_CHLTE/97-148)),((((CLPB_CHLPN/15-67,CLPB_CHLTR/15-67),((((CLPB_STAAW/17-69,((CLPB_CLOPE/17-69,CLPB_CLOAB/17-69),CLPB_RICCN/17-69)),(CLPB_LACLC/17-68,CLPB_LISMO/17-68)),(((O69287_CAMJE/19-71,Q8U7V5_AGRT5/24-74),CLPB_HELPY/18-70),Q9CHS9_LACLA/93-145)),(CLPB2_SYNY3/20-71,((Q8VYJ7_ARATH/99-151,Q9LF37_ARATH/93-145),(CLPB1_ANASP/20-72,(CLPB1_SYNY3/20-72,CLPB2_SYNP7/20-72)))))),CLPB_AQUAE/18-70),CLPB_TREPA/17-69)),(((CLPB_MYCTU/94-145,CLPB_CORGL/95-146),CLPB_STRAL/96-146),((CLPB_RALSO/93-144,CLPB_PSEAE/94-145),(((CLPB_TREPA/94-145,((((((O77222_PLAFA/103-155,(((CLPB_STAAW/96-144,(CLPB_CHLPN/92-144,CLPB_CHLTR/92-144)),CLPB_LISMO/95-147),CLPB_CLOAB/97-149)),(CLPB2_SYNY3/96-147,((CLPB1_ANASP/96-147,(CLPB2_SYNP7/96-147,CLPB1_SYNY3/96-147)),((Q8VYJ7_ARATH/175-226,Q9LLI0_PHALU/182-233),Q9LF37_ARATH/170-221)))),((HS104_YEAST/99-149,Q96W68_CANAL/97-147),(O94641_SCHPO/98-148,(Q8W2B5_ORYSA/98-148,HS101_ARATH/96-146)))),(((CLPB_HAEIN/94-145,CLPB_PASMU/94-144),(((CLPB_SALTI/94-145,CLPB_YERPE/94-145),Q9KHC1_9ENTR/94-145),CLPB_BACNO/98-149)),CLPB_VIBCH/94-145)),(((Q93WL3_ARATH/174-226,CLPB_RICCN/95-146),(O69287_CAMJE/97-146,CLPB_HELPY/96-143)),CLPB_LACLC/95-147)),CLPB_NEIMA/94-145)),Q25317_LEIMA/94-144),(((CLPB_RHIME/94-146,CLPB_AGRT5/94-146),CLPB_RHILO/94-146),CLPB_CAUCR/94-145))))),((((CLPB_RALSO/17-69,CLPB_BACNO/21-73),((((CLPB_SALTI/17-69,CLPB_YERPE/17-69),(Q9KHC1_9ENTR/17-69,CLPB_PASMU/17-69)),CLPB_VIBCH/17-69),CLPB_PSEAE/17-69)),(CLPB_NEIMA/17-69,((CLPB_RHILO/17-69,(CLPB_AGRT5/17-69,CLPB_RHIME/17-69)),CLPB_CAUCR/17-69))),((O69936_STRCO/46-96,Q93IZ7_STRCO/53-103),(Q9I1A8_PSEAE/21-73,Q8XRT2_RALSO/23-75)))),(((Q9F3K2_STRCO/133-184,(O69936_STRCO/124-176,Q93IZ7_STRCO/126-178)),Q9I659_PSEAE/93-145),(((CLPA_RHOBL/36-86,P96980_RHOCA/15-65),((Q9A5H9_CAUCR/15-65,Q9F879_BRAJA/15-65),Q8UFN3_AGRT5/15-65)),((Q9I0L8_PSEAE/13-63,Q8XWL0_RALSO/13-63),((CLPA_ECOLI/13-63,Q9KSW2_VIBCH/13-63),(O83779_TREPA/16-66,Q8PL05_XANAC/13-63)))))),(Q9RWS7_DEIRA/13-63,(CLPB_THETH/17-69,(CLPB_STRAL/16-58,CLPB2_CHLTE/19-71)))),((Y2667_MYCTU/110-162,(Q93HB2_STRAW/104-155,Q9X8L2_STRCO/109-161)),((CLPB_MYCTU/17-69,CLPB_MYCLE/17-69),CLPB_CORGL/17-69))),((HS101_ARATH/17-67,Q9ZT13_TOBAC/17-68),Q39889_SOYBN/17-68)),Q9SPH4_WHEAT/17-69),Q8W2B5_ORYSA/17-69,Q9ZT12_WHEAT/17-69); |
| ((((((((((((O83560_TREPA/17-69:0.54807,Q9RVB2_DEIRA/91-143:0.44274):0.22728,((CLPC_MYCTU/16-68:0.22259,(CLPC_MYCTU/91-143:0.19765,(Q93HB2_STRAW/178-228:0.29781,(Q9X8L2_STRCO/184-234:0.09764,Y2667_MYCTU/183-233:0.33152):0.06121):0.22855):0.13084):0.06630,(Q9RVB2_DEIRA/16-67:0.27535,(Q8KFX9_CHLTE/16-68:0.25247,(Q9WY41_THEMA/91-143:0.26756,((((((CLPC_ODOSI/91-143:0.30256,CLPC_CHLTR/92-144:0.24877):0.15790,(((ERD1_ARATH/179-231:0.47231,O67325_AQUAE/88-140:0.42953):0.04851,HLYB_TREHY/94-146:0.31636):0.12651,(((CLPC_ODOSI/16-68:0.28284,O48931_ARATH/108-160:0.23053):0.05632,HLYB_TREHY/18-70:0.47403):0.06080,(((Q8XHP1_CLOPE/17-68:0.52648,Q8NXY8_STAAW/17-69:0.10322):0.10186,(((Q8YAB6_LISMO/17-69:0.11464,CLPC_BACSU/17-69:0.22889):0.04236,Q93CX3_LACSK/16-68:0.40485):0.08734,CLPC_CHLTR/16-68:0.39149):0.06074):0.06500,Q8R7S1_THETN/18-70:0.28515):0.06042):0.04598):0.03927):0.03548,((Q8YAB6_LISMO/91-143:0.24461,Q8NXY8_STAAW/91-143:0.17810):0.07601,(CLPC_CYACA/122-174:0.22742,((O48931_ARATH/183-235:0.30277,CLPC_PORPU/91-143:0.18311):0.03950,CLPC_GUITH/91-143:0.16201):0.04782):0.11309):0.05312):0.12626,Q8R7S1_THETN/92-144:0.27323):0.06603,Q97EC4_CLOAB/93-145:0.25768):0.13176,Q8YVL2_ANASP/91-143:0.39625):0.14976):0.21343):0.05947):0.08768):0.03340):0.04783,((((Q93WL3_ARATH/97-149:0.52295,O83560_TREPA/94-146:0.66300):0.08571,Q9WY41_THEMA/16-68:0.24470):0.08269,(((Q97EC4_CLOAB/17-69:0.33818,(Q9CHS9_LACLA/19-71:0.63635,CLP_TRYBB/19-69:0.49635):0.10455):0.11949,O67325_AQUAE/16-67:0.31856):0.19842,((ERD1_ARATH/94-144:0.50671,Q9X1B1_THEMA/98-150:0.52061):0.13174,(Q93CX3_LACSK/95-147:0.63168,Q8KFX9_CHLTE/92-144:0.26890):0.09766):0.07340):0.11512):0.13138,CLPB2_CHLTE/97-148:0.45073):0.05546):0.05804,((((CLPB_CHLPN/15-67:0.17626,CLPB_CHLTR/15-67:0.30521):0.56968,((((CLPB_STAAW/17-69:0.57322,((CLPB_CLOPE/17-69:0.09308,CLPB_CLOAB/17-69:0.36530):0.07028,CLPB_RICCN/17-69:0.49902):0.12441):0.07205,(CLPB_LACLC/17-68:0.51224,CLPB_LISMO/17-68:0.34858):0.06128):0.05259,(((O69287_CAMJE/19-71:0.18896,Q8U7V5_AGRT5/24-74:0.84888):0.05325,CLPB_HELPY/18-70:0.54578):0.18470,Q9CHS9_LACLA/93-145:0.42999):0.17105):0.10889,(CLPB2_SYNY3/20-71:0.37865,((Q8VYJ7_ARATH/99-151:0.30667,Q9LF37_ARATH/93-145:0.19350):0.17860,(CLPB1_ANASP/20-72:0.35730,(CLPB1_SYNY3/20-72:0.31631,CLPB2_SYNP7/20-72:0.38888):0.10216):0.25806):0.08046):0.11992):0.14020):0.15376,CLPB_AQUAE/18-70:0.49385):0.12051,CLPB_TREPA/17-69:0.45119):0.36088):0.05006,(((CLPB_MYCTU/94-145:0.09162,CLPB_CORGL/95-146:0.51720):0.02584,CLPB_STRAL/96-146:0.52773):0.13552,((CLPB_RALSO/93-144:0.25335,CLPB_PSEAE/94-145:0.31213):0.10622,(((CLPB_TREPA/94-145:0.50219,((((((O77222_PLAFA/103-155:0.46089,(((CLPB_STAAW/96-144:0.40103,(CLPB_CHLPN/92-144:0.14414,CLPB_CHLTR/92-144:0.28928):0.34360):0.05402,CLPB_LISMO/95-147:0.34162):0.03546,CLPB_CLOAB/97-149:0.40661):0.03517):0.12434,(CLPB2_SYNY3/96-147:0.40625,((CLPB1_ANASP/96-147:0.24006,(CLPB2_SYNP7/96-147:0.41648,CLPB1_SYNY3/96-147:0.28823):0.23831):0.19894,((Q8VYJ7_ARATH/175-226:0.32471,Q9LLI0_PHALU/182-233:0.16223):0.13648,Q9LF37_ARATH/170-221:0.22631):0.17870):0.09352):0.08655):0.06467,((HS104_YEAST/99-149:0.27656,Q96W68_CANAL/97-147:0.18797):0.25610,(O94641_SCHPO/98-148:0.33812,(Q8W2B5_ORYSA/98-148:0.45213,HS101_ARATH/96-146:0.05369):0.39073):0.06430):0.22660):0.10032,(((CLPB_HAEIN/94-145:0.28941,CLPB_PASMU/94-144:0.05185):0.10311,(((CLPB_SALTI/94-145:0.16568,CLPB_YERPE/94-145:0.22857):0.16972,Q9KHC1_9ENTR/94-145:0.21007):0.05025,CLPB_BACNO/98-149:0.45786):0.11167):0.16247,CLPB_VIBCH/94-145:0.22150):0.16603):0.05496,(((Q93WL3_ARATH/174-226:0.62834,CLPB_RICCN/95-146:0.32319):0.14408,(O69287_CAMJE/97-146:0.33060,CLPB_HELPY/96-143:0.42189):0.35710):0.16887,CLPB_LACLC/95-147:0.36055):0.05386):0.29259,CLPB_NEIMA/94-145:0.17414):0.19186):0.14979,Q25317_LEIMA/94-144:0.55815):0.12398,(((CLPB_RHIME/94-146:0.13186,CLPB_AGRT5/94-146:0.19735):0.04918,CLPB_RHILO/94-146:0.10723):0.22173,CLPB_CAUCR/94-145:0.19489):0.12645):0.06575):0.04845):0.12810):0.02953,((((CLPB_RALSO/17-69:0.28778,CLPB_BACNO/21-73:0.49803):0.06578,((((CLPB_SALTI/17-69:0.20388,CLPB_YERPE/17-69:0.16418):0.12995,(Q9KHC1_9ENTR/17-69:0.11878,CLPB_PASMU/17-69:0.32277):0.16282):0.16129,CLPB_VIBCH/17-69:0.25361):0.22042,CLPB_PSEAE/17-69:0.16878):0.12070):0.12802,(CLPB_NEIMA/17-69:0.60134,((CLPB_RHILO/17-69:0.11965,(CLPB_AGRT5/17-69:0.18380,CLPB_RHIME/17-69:0.19599):0.11018):0.14579,CLPB_CAUCR/17-69:0.21715):0.13655):0.13361):0.09681,((O69936_STRCO/46-96:0.16505,Q93IZ7_STRCO/53-103:0.28600):0.22854,(Q9I1A8_PSEAE/21-73:0.24504,Q8XRT2_RALSO/23-75:0.40718):0.12253):0.05949):0.10286):0.04188,(((Q9F3K2_STRCO/133-184:0.40471,(O69936_STRCO/124-176:0.30568,Q93IZ7_STRCO/126-178:0.39481):0.09695):0.04382,Q9I659_PSEAE/93-145:0.38060):0.07734,(((CLPA_RHOBL/36-86:0.18673,P96980_RHOCA/15-65:0.14423):0.03810,((Q9A5H9_CAUCR/15-65:0.20321,Q9F879_BRAJA/15-65:0.16047):0.05168,Q8UFN3_AGRT5/15-65:0.16456):0.07285):0.15222,((Q9I0L8_PSEAE/13-63:0.26604,Q8XWL0_RALSO/13-63:0.18326):0.05016,((CLPA_ECOLI/13-63:0.23974,Q9KSW2_VIBCH/13-63:0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