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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF02706 alignment
(41 sequences with 843 bp)


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Q9XDD5_BRUME/15-186 ------------GTTGCCGACCTGCTTGAGACCATCAAACGCAGAAAACTCATGCTGACACTGCCGATCATCGCGGGTGTGGGCGTCGGCTTTGCCGGTTAT...---CTGACAGCGCCGGTGAGTTATGTTTCGGAATCCGTGCTGGTGCTGGACATGCGGCGCTTGCAGGCCTTG---...CCGAACGAAAGTGCCATCACG------------------------------CCGCTGCCGCAGGACAGT---...............CCCGTCCTGCGC---TCGGAACTGGACATCATCAATTCACGCATGATGGCGCAAAAGGTCATCGAACTTTTGCAGGCGGAGAAT...------------------ATCGCCGTGCCGACGGACGTGCATTCACGCACGgttctgtcaTCGCAACCTGACAGGATCaccCTGTCG...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...------------------AAGAATGCGCGCGATTTCGATCCGGCAGTACGTGAGCGCCAGCAGATTGACCTGCTTTTGTCCCGCCTGCGGGTG---...AGTAATGACGGG...CGCTCCTTCACGATCTTCATTTCCTATCGC...GCGCCGGACCCGGTTTACGCGGCCAGGGTCGCCAATGCTTTTGCGACGGCC
Q57322_VIBCH/24-219 GATGAAATCGACTTACGCGAGCTGTTTCGCGCGCTGTGGAAAGGCAAGTGGACCATTATTGCGATAACGTTAGTGTTTGCGATAGGCTCGGTGATTTTTGCC...---ATTATGCAGCCTAATATTTACAAAGCAGAAGCTTTGATTGCTCCTGCCTCGGAACAACAAGGTGGCGGCTTAagtGCTTTAGCTTCACAGTTTGGCGGCTTAGCGAGCTTGGCCGGGGTCAATCTAGGCGGTAAAGGTGGGGTA---...............GATAAAACGCAA---ATGGCGATTGAAGTGCTAAAATCGCGCCAATTTACCAGTGAGTTTATCCAGCAACACAATATTCTGGCCgatATAATGGCTGCTAAAAAATGGGACAATAGTGCTGATCAGCTCATTTATGATccagcccttTATAACGCGCAAACCCACactTGGGTGcgtGAAgccAAA............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...---------------------------GCGCCATTTAAACCTGAACCTTCGATGCAAGAAGCGTATAAAGTGTTTAGCAAGCTGGTGACGGTC---...AACAAAGCTAAA...GATAGTGGAATGGTGACGATTGCGGTTGAG...CATTTATCGCCCACCGTTGCCCAACAGTGGGTTACATGGCTCATTGAAGAC
WZZE_ECOLI/16-116 AATGAACTGGATATTCGTGGGTTGTTTCGTACCTTGTGGGCTGGGAAGCTATGGATTATTGGCATGGGGCTGGCGTTTGCGTTAATCGCGCTGGCGTATACG...---TTTTTTGCTCGTCAGGAGTGGAGCTCGACGGCGATTACCGATCGTCCAACG---------------------...------------------------------------------------GTGAATATGCTGGGGGGATAT---...............TACTCGCAGCAG------------CAATTTTTGCGTAACCTGGATGTCCGTTCAAACATGGCTTCTGCC---------GACCAA...---------------CCATCG------------------------------.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...------------------------------------------------------------------------------------------GTC---...------------...------------------------ATGGAC...GAAGCCTATAAAGAGTTTGTTATGCAACTGGCCTCGTGGGATACCCGCAGA
Q9XBT8_VIBAN/11-127 GATGAAATTGACCTGCGTGAGTTGTTTAGTGTGCTATGGCAAGGGAAATTGACCATAGTGCTGTGCACTGTTTTGTTTGCTGTGATGGCGGTGGTATATGCA...---TTGACGGCGCAGCAGTGGTGGAGCGCTAAAGCAACCGTTACCCAGCCTGAATTAAGCCAA------------...------------GTTGTAACCTTCCTG---CAACAGGTGAAG---------CAGTATCAGCCATTGTTT---...............GATCTCTACCAAGAA---------------------------GATGGCACCATTATTGTGAGTAAAGAGCTTGATGGCTTAATT...------------AACCCAGCC------------------------------.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...------------------------------------------------------------------ACTATTTTCCAGCGTTTTGTGCGTGCA---...------------...------------------------TTTAAT...ACTAATGACAATAAA------AAGCGCTTTATGCAAAGTAACCCTACTTTT
Q9ZB25_SHISO/6-125 GATGAAATCGATCTTTTCGAGCTTTTAGGCACCTTGTGGAAGAAAAAATGGGTTATTTTATGTGTCACGTTGCTGACTACGGGGTTAGCAGCAGTGTATGCC...---TTTACCGCAAAAGAGCAGTGGACGGCTAAAACCTATATTCAAGCACCACGTATTGCT---------------...---------------------------------------------------GAATTAGGCAGCTATCTT---...............AAATTTCACCAA---GCGTATGCCCGAATATTAAATCAACCGTTAGATACGAATGCGTTGGCTAATGGATTG------------...---------------------------------------------------.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...------------------------------------------------------------------------TTTTCCGATTTGATTTTGATT---...GCTGAATCGCCA...GACACCAAAGTTAAATTTCTAGAGAGTACT...GAGTATTATAAAAAGGAAACAAATAATTTATCTACTGAACAAGATAAGAAA
WZZB_SALTY/16-155 GAACAGATTGATTTGATTGAGTTATTGCTACAGTTATGGCGTGGGAAGATGACCATTATTGTAGCCGTTATTATCGCCATTTTGCTGGCTGTAGGCTACCTG...---ATGATAGCCAAAGAAAAATGGACATCCACGGCGATTATTACCCAACCTGATGCCGCGCAGGTTGCCACCTATaccAACGCGCTCAACGTCTTGTATGGTGGGAATGCCCCCAAAATC------TCTGAAGTGCAGGCGAATTTTATAagccgc...tttagcTCTGCGTTTTCC---GCATTATCGGAAGTGCTGGATAATCAGAAAGAGCGGGAAAAGCTTACCATTGAA---------------...---------------------------------------------------.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...---------------------------------------------------------------------------------------------CAG...TCGGTAAAAGGG...CAGGCGCTGCCACTCTCGGTTTCTTATGTGagtACTACCGCTGAAGGGGCGCAGCGTCGGCTGGCGGAATATATCCAACAGGTG
WZZB_SHIFL/16-155 GAACAGATTGATTTGATTGATTTACTAGTGCAGTTGTGGCGTGGCAAGATGACAATTATCATTTCCGTCATTGTGGCTATTGCCCTGGCTATTGGTTATTTG...---GCAGTAGCGAAGGAGAAATGGACGTCAACAGCAATTATCACTCAGCCCGACGTGGGGCAAATTGCTGGCTATaacAATGCCATGAATGTTATCTATGGTCAGGCTGCACCGAAAGTA------TCGGATTTGCAGGAGACGTTAATTggtcgc...ttcagtTCTGCCTTCTCT---GCATTAGCAGAAACGCTGGATAATCAGGAAGAGCCAGAAAAACTTACCATCGAA---------------...------------------CCT------------------------------.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...------------------------------------------------------------------------------------------------...TCTGTTAAGAAC...CAGCAATTACCATTGACTGTTTCTTATGTTgggCAAACTGCAGAGGGCGCACAAATGAAGTTGGCCCAATACATTCAGCAAGTT
WZZB_ECO11/16-155 GAACAGATTGATTTGATTGATTTACTCATGCAGTTATGGCGTGGGAAGGTAACGATTATTATCTGCATTGTTGTGGCAATAGCGTTGGCAGTAGGCTATTTG...---GCGGTGGCTAAGGAGAAATGGACCTCGATAGCTATCGTTACACAACCCGATGCTGGCCAGCTTGCCAGCTACaatAATGCT---ATGGATGTACTGTTTGGGGCTAACGCACCCGAAATG---ACAGATGTTCAGGCGGGTTTTATCgggcgt...tttagtTCGGCATTTTCT---GCACTGGCTGAAACGTTGGATAACCAGCAAGAACCGGAAAAACTTTCAATTGAT---------------...---------------------------------------------------.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...---------------------------------------------------------------------------------------------GCT...GCTGTTAAAGGT...CAGACTCTGCCGTTAAAGGTTTCTTATACCggcAAAACCTCTGAAGAGGCACAAAAAACGCTGGCTCAGTATATTCAACAAGTT
Q57210_YEREN/25-157 GAAGAAGTAGACCTTATAGAGATAATTTCAATAATATTTAGATCATCCAAGTTGATCTTTATTGTCATCGCTATATTTACTCTTGTGGGTGGAGGGGTTGTG...---TTTTTTTCTCCAAAAGAATGGACTAGTTATGCAATAGTATCAGTTACTTCTGATGGTAAGATGCAACCACTTgaaTCTATTGAGTCATCATTATCAGTGCTT---------AATATTGATTTG---AATATTACCGCAGATGATCTG...............------CTCATG---GATTTCAGGAAATACTACTCTTCTAAAGATATGTTGAGTAAATATATGTCCAAAGAG------------...---------------------------------------------------.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...---------------------------------------------------------------------------------------AAGGTT---...AACGCTAATAAT...TTTGCTGGGGTTAAAGGCAAGAATATAAAT...TCAGATAGTGATGTTAAAGGTAATTACATTCTTACTTATAGTTCTAATTTA
FEPE_ECOLI/25-175 AATGAAATTGATTTACTTAATCTAATCTCAGTTTTATGGCGGGCCAAAAAAACGGTCATGGCGGTCGTTTTTGCGTTTGCCTGCGCAGGCTTGCTGATCTCT...---TTCATCCTGCCGCAAAAATGGACCAGCGCGGCGGTTGTCACGCCTCCAGAACCTGTTCAGTGGCAA------...GAGTTGGAGAAATCATTCACTAAGCTT------------------------CGTGTGCTGGATCTGGATATCaaaattgatcgtacaGAAGCATTTAAC---CTGTTTATCAAGAAGTTTCAGTCGGTTAGCTTGCTGGAAGAGTACCTGCGTTCATCACCTTATGTGATG...---------------GACCAATTAAAAGAGGCGAAAATCGACGAACTGGAT.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...------------------------------------------------------------------------TTGCATCGCGCAATTGTCGCA---...---------TTG...AGCGAAAAAATGAAAGCGGTTGATGACAAT...GCCAGTAAGAAAAAAGATGAACCGTCACTGTATACCTCCTGGACGCTAAGT
Q9RCC2_YERPE/28-180 AATGAAATTGATCTCTTTGAAATTTTTAGTGTTGTATTTAAATCAAAGTTCAAGATAATATTAATAACACTATTTTTCTTAATTAGTGGTTTAGTGGTCTCA...---TATATCCTCCCCCAAAAATGGACAAGCACTGCAATAATAGCTCTTCCTGGTGATGAGCAAGTTCAAGTTCTGgatGAACTAATCACAAATCTAACCGTACTTGATATAAAG------------GTTGATGTGAGTGCTAATTATTTG...............------CTGTCA---ACATTCAAACAAAATTTCGATTCTCAAGATCTCCGTGAACAATATTTAGTAAATACTAATTACTTTAAAcgtTTGATGAAGAATAATCCAGAA---------GATGGTTTGGATAAAAGAGCG.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...---------------------------------------------------------------------------------------TTAATA---...GAGCGAATCGTA...AATGAAAATATTTCTTCGGTTAACCCATTGaaaGATAAAACCGAGGGTGAAAATGAATATCGCTATTATAAATTATCATATAGT
P72148_PSEAE/13-169 GGCGATATCGATCTGGTTGAGCTGGTTCGAGGATTATGGGAGGAGAAGTGGATAGTTCTTATATTTTCTTTGCTAGGTATTTTGTTTGCAGCTATCTACGCT...---TTTCTCAGTACTCCTGTCTATGAGGCCCGCATAGCGATTTTGCCTCCGTCGTTGAGTGATGTGGCA------...------------GGTTTCAATCAGGGACGTACCAGGGAAACCGGGCTTGGTCCCTTCAAGGTCCAG------...............GATGTGTACTCT---GTTTTTGTTCGCAACCTGCAGGCTGATGGAACTCGTCATCGTTTTTTCAATGAGACCTATTTGCCTTCT...---------------TTGGATGAAGAGCTTCGTTCGGTTTCGCGTGATGCG.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...------------------------------------------------------------CTCTATAAAAGGTTCACTGATCAGATAAGTATTAGT...TTGCCGGGGAAAgacTTTCCGGGTCGTTATCTTGTTGCGATTGAA...CAGGAGGATCCGGAGCGTGCGGCGAGTTGGGTTCGTCGGTATATAGCTGAT
Q9RHD8_PSEAE/4-148 ---------------------------------TTGTGGTCCCTGAGATGGCTGATTGCTTTGCTGGCAGTGTTGCCGGTGTTGTTGGCTATTGTTTATCTA...---TTCATCACCAAGCCCGTCTATGAGGCTCGTGTCTCGACGCTGCCTCCTTCACTCAGCGAT------------...------ATAGCTGGTTTCAACTTGGGA---AGATCGGAAAACGGGCTTCCCGCGTTTTCGGCAAATGGTGTC...............------TATTCA---ATCTTCGTGCGAAATCTCCAGTCCGAAGAGACTCGCCGTCAGTTCTTTCGAGATGTATATATT------...---------------CCTTCC------------------------------.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...------------------------TTGGAGGAGGGGGCTTCTGTTGGTTCGCGGGATCAGCTTTATGCGCTTCTCATGAATTCGGTAACTATTCAG...AAGCCTAGCAAAgagGATAGCGAGCGCTACACTGTCGTCATCGAG...CGGCATGATCCTTCGCAGGCGGCGGAGTGGGGCGAGAAATATATAGGAATT
Q9XC65_PSEAE/5-161 GGTGAGGTTGACCTGGTGAAGCTGGTCAAGGAGCTTTGGGTTAACAAGGTTCTGATTCTTCTGACTACTCTTCTTGCATTAATCGGGTCTTTTACCTATGCG...---TATCTGAGTAAGCCTGTATATGAATATAGGGTTGCAGTAGTGCCTCCTGCTCTT------------------...GGGTCTATCGAAGGTTTCAATGTTGGT---AGAAGGGAGAATGGCCTA---GATGCATATACTGTTAGA---...............AGTATCTATGCG---ATCTTTTCGCGCAATCTGCTTTCGGATGAGAATAAAAAAGAGTTCTTCTATAAGATATACCTT------...---------------------------------------------------.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...---------------CCCCAGGTGGGTGAGGGAGCGGAAAGCGAAGATGAGCAGGAGGAGTTTTATAAGAAGTTCTCCAAAGAGGTAAAGATTGATcctGCTAACAAGCCA...GATGCAGACCGTTATACGGTAATTGTGGAG...GGCACGAAGCGAGAGGTTCTTGCTACATGGGCACAAGCTTTCGTGCGTTTG
TUAF_BACSU/2-126 AACGATATA---TTGATAAGAATAGCCCGTCGCATAAAAAAAAATATCATTTGGATCATAGCGGTGCCAATTATATTAGGTGCGGCGGGGTATATCCTGCCGtcaCAGATCGCTGATCAAAAGAGCTATACAGCTGAAGATACTTTGGCTGTGGGGAGCTATGATCAT------------...------------------------------------------------------------CCGGTTTAT---...............AACAGCACAGAA---GAGATTCCGCTTCTATTAAAGAGCGACTCCTTTTTGAAGGAGGCGCTTCCTGATGAAAAG---GATGAAgatGTA------------------------------------------------.........------------------...------...---...---............---...------------...------...---...---...---...---...---...---...------...------...------...---.........---...---...---------------...---...---...---...---------------...---...------------------------------------------------------------------GCAGAGATCAAAGAGAAGCTTACAATC---...---AATACGGAA...TCCAAATCGTTACTGACTTTAAGCTATAGT...GACGAGGATAAGGATAGAACGGAATCTGTCTTAAACGCCATATCCTCCACC