PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam
 pan•dit |
PANDIT Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees |
PF02706 alignment |
| O66795_AQUAE/63-231 | DEIDLYELWVVLKKRFRVILLTLVIFIAGAVAYV.-FIAPPVYKTEAVIFPIGGEK----.TNLP-----SILEGLPVPLPSV--.....ADKV-TVESVLKSRTLRERVIEKLNLMPvLFKDLWDESRNTWRQ--...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.--------DLEPEDIPTILDGAELLEDLISV-.SSNK.KTGTITFSVEfPEDPHMAYKIAQVSLEE |
| O52499_BRAJA/22-200 | TGFNVLELVNLLWRRKIAIAAAALLGATLAVTVG.-KSVTPRYTATAQLYVDPRELQLV-.DRELTPRAQ--------DVSGMT-.....MVVE-SQARLITSNSVLLQVIQQAGLDK.-----DPEFGGGDARSL...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-MSSL.LgLIGLQPRAPSAAETKEVQLAALDALNRHITV-.RKTE.KSFIVDIEVW.STDPAKAAMLANTLTSA |
| CPSC_STRA3/9-146 | VEINIFNLLKKLWKKKFLITFVAIAFATAGLFYS.LFIVTPQYTSSTRIYVINPNT----.PN-NSITAQ--------DLQAGS-.....FLAN-DYKEIITSTDVLEKVISSEKLNY.-----PS----------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.----------------------SQLLQKITV-.SILK.DTRVISISVE.DANPKMSQKLANSVREA |
| O87930_STRTR/11-148 | VEIDILALLHKLWTKKLLILFIAFYFAAFSFLGT.YFFIQPTYTSTTRIYVVNQAT----.DN-NNLSAQ--------DLQAGT-.....YLVN-DYKEIITSNDVLSEVIKDEKLNL.-----SE----------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.----------------------AELAKMISV-.NIPT.DTRLISISVN.AKTGQDAQTLANKVRKV |
| Q9X4U6_STRSU/9-144 | IEIDVLFLLKTIWRKKFLILLTAVLTAGLAFVYS.SFLVTPQYDSTTRIYVVSQNV----.EAGAGLTNQ--------ELQAGT-.....YLAK-DYREIILSQDVLTQVATELNLKE.-----------------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.-----------------------SLKEKISV-.SIPV.DTRIVSISVR.DADPNEAARIANSLRTF |
| Q9S4X7_STRPN/7-145 | LEIDVLQLFRALWKRKLVILLVAIITSSVAFAYS.TFVIKPEFTSTTRIYVVNRNQ----.EEKSGLTNQ--------DLQAGS-.....YLVK-DYREIILSQDVLEEVISDLKLDL.-----TP----------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.----------------------KGLANKIKV-.TVPV.DTRIVSVSVN.DRVPEEASRIANSLREV |
| Q9ZFT9_STRPN/8-146 | IEIDVFQLLKTLWKHKLIILLVALVTGAGAFAYS.TFIVKPEYTSTTRIYVVNRNQ----.GDKPGLTNQ--------DLQAGT-.....YLVK-DYREIILSQDVLEKVATNLKLDM.-----PA----------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.----------------------KTLTSKVQV-.TVPA.DTRIVSISVK.DKQPEEASRIANSLREV |
| YWQC_BACSU/3-140 | ESTSLKEILSTLTKRILLIMIVTAAATAAGGLIS.FFALTPIYENSTQILVNQSKN----.ER-KEVQFN--------DVQTNL-.....QLIN-TYNVIIKSPAILDEVIKEMGLSM.-----TS----------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.----------------------QELNDKITV-.SSEQ.DSQVVNISVR.DENAETAAHIANTIASV |
| YVEK_BACSU/3-139 | ENMSFKELYAIVRHRFVLILLITIGVTLIMGFVQ.FKVISPTYQASTQVLVHESDG----.EENSNLS----------DIQRNL-.....QYSS-TFQSIMKSTALMEEVKAELHLSE.-----SA----------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.----------------------SSLKGKVVT-.SSEN.ESEIINVAVQ.DHDPAKAAEIANTLVNK |
| O06029_LACLC/7-142 | QTIDLRGIFKIIRKRLGLILFSALIVTILGSIYT.FFIASPVYTASTQLVVKLPNS----.DN-SAAYAG--------EVTGNI-.....QMAN-TINQVIVSPVILDKVRSNLNLSD.-----------------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.----------------------DSFQKQVTA-.ANQT.NSQVIMLTVK.YSNPYIAKKIADETAKI |
| CAPA_STAAW/3-139 | EKFDLVKLLNILKKNIKLLLILPAICLVVSAALT.FFVMPDKYTASTQILVNMKKS----.--SSDLAFQ--------NVQSSL-.....QSVN-TYTEIIKSPRILDKVSREFDGQY.-----ST----------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.----------------------AELNSFLKV-.TNQT.NSQIITVSVT.TGNKSESDKIVNKISKV |
| CAPA_STAAU/3-139 | STIDLSELLGRVRKNMKLLIILPLLGLLISAIIS.FFFLDVKYQASTQILVNQK-G----.ND-SQIMAQ--------EVQSNI-.....QLVN-TYSEIVKSPRILDKVSKELDDKY.-----SR----------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.----------------------SEISSMLTV-.TNQA.ESQVLNIDVE.SKSGSNSEKIANKIAEV |
| P95695_STAAU/3-140 | STLELTKIKEVLQKNLKILIILPLLFLIISAIVT.FFVLSPKYQANTQILVNQTKG----.DN-PQFMAQ--------EVQSNI-.....QLVN-TYKEIVKSPRILDEVSKDLNDKY.-----SP----------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.----------------------SKLSSMLTI-.TNQE.NTQLINIQVK.SGHKQDSEKIANSFAKV |
| P72877_SYNY3/27-177 | DSFSLGNLTGVLRRRWWIVVLVALAVGGLNLKRQ.-LDKPPVFQSSFQLLVSPPEN----.ET-VNPLAQLQGSGLLGSLPRGK-.....EYLN-TQSEILQSNILLEPVWSQIYDAL.-----PPEEQISY----...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.----------------------SSFLASLSV-.MVVP.DTGIVEISYR.GNDQERVKAVLEALAEQ |
| Q9WZB2_THEMA/4-172 | RELTLSDILLMFKRRSKLFWLVLVLTVFATGIYL.-FLATPQYEAYARVKVSTQKGM---.--RLGLSIE-GLLGGLSSLLGGG-.....GSQE-DEIQIMLSRRNIIAVIDELDLVHkLLDEKDIEKAKKNGLTE...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-DDLK.LsLYS-------------------YMVEKLITV-.EPVK.NSSILEVKVT.WHEPKLAAEIANKIVEN |
| EPSB2_RALSO/16-272 | NELDLVRYLDVLVANRWLIAGIAAAVMLLGAAYA.-FLARPVYEADIMVQVEDNPNSAK-.----------SLLGDVSSLFDVK-.....TDAN-AEIEILRSRMVVGKAVDNLHLYItAKPRYFPLIGAWISSRAtrlSEPGLFgLGgYvWgtesIdVDGFdVPeAlEgQpFkLiVlGNgRYrLEnKsldApIeGVVGEpLeAkQsIGTIQlQvNNLTAKAGATFELERDSRLKTMEMLQDKLKIA.EKGK.QSGIIGASLD.GTNPALTAAIMNQIATE |
| AMSA_ERWAM/16-252 | IRFELAHLLGQLLDHRWMIVAVSVLFTLMGTLYS.-LFATPIYSADAMVQVEQKNANTV-.------------LNDISQMMPNA-.....QPASAAEIEIITSRMVLGKTVADLGLDVlVQQDHFPLIGAGLSRIIg..QKAQQIaVS.-.-....-.--RLkVPtLwDkReLsVeVdGPdSYtVSkDg.nElFkGKVGQfEqHgD.-VTML.VnSIE-ADAGTRFTVSKLNNLQAIKMISNNLVVA.DMGK.DTGVLGLTYS.GEDPVQISRVLDQVINN |
| YC06_KLEPN/14-253 | DDLDFGRMVGELIDHRKIIIALTSFATLIALLYA.-FFATPIYKADALIQVEQKQANAI-.-----LSNL-------SQMLPDS-.....QPQSAPEIALIQSRMILGKTVDDLNLQAvVSPKYFPIFGRGWARLSg..EHQGNIqLS.-.-....RlYVSSsIGdEeNpPeFtLkVkDSnRYvIEfG..gEeInGKVGElIeKdG.-ITLK.IdEIN-AKPGAEFTIKYVSKLKAIADLQENLSVA.DQGK.DTGILILSYL.GDDPLKIKNIVDSISEN |
| Q9X4B9_ECOLI/15-254 | DEIDLGRVIGELIDHRKLIISITSVFTLFAILYA.-LLATPIYETDALIQIEQKQGN---.----------AILSSLSQVLPDG-.....QPQSAPETALLQSRMILGKTIDDLNLQIqIEQKYFPVIARGLAGLMg..EKPGNIdIT.-.-....RlYLPDsDDiSnNtPsIiLtVkDKeNYsINsD..gIqLnGVVGTlLnEkG.-ISLL.VnEID-AKPGDQFVITQLPRLKAISDLLKSFSVA.DLGK.DTGMLTLTLT.GDNPKRISHILDSISQN |
| ETK_ECOLI/16-252 | NEIDLLRLVGELWDHRKFIISVTALFTLIAVAYS.-LLSTPIYQADTLVQVEQKQGN---.----------AILSGLSDMIPNS-.....SPESAPEIQLLQSRMILGKTIAELNLRDiVEQKYFPIVGRGWARLTk..EKPGELaIS.-.-....-.-WMHiPQlNgQdQqLtLtVgENgHYtLEgE..eFtVnGMVGQrLeKdG.-VALT.IaDIK-AKPGTQFVLSQRTELEAINALQETFTVS.ERSK.ESGMLELTMT.GDDPQLITRILNSIANN |
| WZC_ECOLI/16-252 | DEIDIGRLVGTVIEARWWVIGITTVFALCAVVYT.-FFATPIYSADALVQIEQNSGN---.----------SLVQDIGSALANK-.....PPASDAEIQLIRSRLVLGKTVDDLDLDIaVSKNTFPIFGAGWDRLMg..RQNETVkVT.-.-....-.--TFnRPkEmAdQvFtLnVlDNkNYtLSsDg.gFsArGQAGQmLkKeG.-VTLM.VeAIH-ASPGSEFTVTKYSTLGMINQLQNSLTVT.ENGK.DAGVLSLTYT.GEDREQIRDILNSIARN |
| PTK_ACIJO/12-265 | DTIDLKELFFSLIAQWKLIALCIILSLICALLYL.-RATPDTYSVNALVQVEENKGASA-.----------ALLGDLSSMIEQK-.....QPAQ-AEIEILKSRLVLGNVIQHLNLDLkISGTENSFT--DRLLSPhhyQTEYQPkSVlFkDdekvFdIRQFnIPaSfRdKkIeLrFkDGqFSlTNtQteqViLtGKTNQsNtLrTaD-GLWnIsIYTQDQLNDVYLIQKQSLPAAVNNILTNYSVA.EKGK.LTGILGLNYQ.GTDKTHITQVLNAILVS |
| Q9RMD9_ACILW/9-125 | DTIDLKELFFALIAQWKLIALCIILSLVFALLYL.-RATPDTYSVDALVQVEDSKGASA-.----------ALLGDLSQMIEQK-.....SPAQ-SEIEILKSRLVLGSVIQALHLDL.-----------------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.--------------------------------.----.-------EIA.SENNTFSHRLLNKTDYE |
| EXOP_RHIME/26-208 | GFIDLDRLVAAVFRRARLVAAFVVLFIALGAAYL.-LFATPYYTSMTQILLDENLSKYA-.EEEPTPVNS--------QMLD---.....TQIA-SAVEILKSGELALRVVDKLKLSEnDTILNPPRSPVDMVKEW...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-LKTA.TgLFSGGPDVTEEAARNGRRQKAAAIIQQSLAV-.ERVS.RSSVVAVAFR.SSDPLLAATIARGYASA |
| Q9RJK3_STRCO/15-142 | PLLDLQALVVAVRRRRRLWGSLALLGLLLGAAVA.-VLLPPRPTAVTKVLVAHKDD----.-----------------QPNDTG-.....TLIR-TDVELLDTTRIAAAALRTLG---.-----SRENPEDFMRDY...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.-------------------------------R.GTGL.TNNLLRIDVT.ADSDAEAVARAKALADT |
| P74824_9SPHN/1-157 | --MNIIQFFRILWVRRWIILPAFLVCVTTAALVV.-QFLPERYRATTRLVLDTFKPDPV-.------TGQ--------VMNSQFMr....AYVQ-TQTELIEDYATSGRVVDELGWAN.-----DPANI-------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.---AAFNASSSAATGDIRRWLAKQISDNTKA-.DVIE.GSNILEISYS.DSSPERAERIANLIRTA |
| Q56769_XANCA/2-171 | ------DYWRALVSQLWLIILIAVGALLLAFGIT.-MLMPEKYRATSTLQIERDSLNVV-.NVDNLMPV---------ESPQDR-.....DFYQ-TQYQLLQSRSLARAVIREAKLDQ.-----EPAFKEQVEEAL...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-AKAA.EkNPEAGKSLDSRQAI--VERSLTDTLLAGLVV-.EPIL.NSRLVYVNYD.SPDPVLAAKIANTYPKV |
| Q9XDD5_BRUME/15-186 | ----VADLLETIKRRKLMLTLPIIAGVGVGFAGY.-LTAPVSYVSESVLVLDMRRLQAL-.PNESAIT----------PLPQDS-.....PVLR-SELDIINSRMMAQKVIELLQAEN.------IAVPTDVHSRTvlsSQPDRItLS.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.------KNARDFDPAVRERQQIDLLLSRLRV-.SNDG.RSFTIFISYR.APDPVYAARVANAFATA |
| Q57322_VIBCH/24-219 | DEIDLRELFRALWKGKWTIIAITLVFAIGSVIFA.-IMQPNIYKAEALIAPASEQQGGGLsALASQFGGLASLAGVNLGGKGGV-.....DKTQ-MAIEVLKSRQFTSEFIQQHNILAdIMAAKKWDNSADQLIYDpalYNAQTHtWVrEaK....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.---------APFKPEPSMQEAYKVFSKLVTV-.NKAK.DSGMVTIAVE.HLSPTVAQQWVTWLIED |
| WZZE_ECOLI/16-116 | NELDIRGLFRTLWAGKLWIIGMGLAFALIALAYT.-FFARQEWSSTAITDRPT-------.----------------VNMLGGY-.....YSQQ----QFLRNLDVRSNMASA---DQ.-----PS----------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.------------------------------V-.----.--------MD.EAYKEFVMQLASWDTRR |
| Q9XBT8_VIBAN/11-127 | DEIDLRELFSVLWQGKLTIVLCTVLFAVMAVVYA.-LTAQQWWSAKATVTQPELSQ----.----VVTFL-QQVK---QYQPLF-.....DLYQE---------DGTIIVSKELDGLI.----NPA----------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.----------------------TIFQRFVRA-.----.--------FN.TNDNK--KRFMQSNPTF |
| Q9ZB25_SHISO/6-125 | DEIDLFELLGTLWKKKWVILCVTLLTTGLAAVYA.-FTAKEQWTAKTYIQAPRIA-----.-----------------ELGSYL-.....KFHQ-AYARILNQPLDTNALANGL----.-----------------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.------------------------FSDLILI-.AESP.DTKVKFLEST.EYYKKETNNLSTEQDKK |
| WZZB_SALTY/16-155 | EQIDLIELLLQLWRGKMTIIVAVIIAILLAVGYL.-MIAKEKWTSTAIITQPDAAQVATYtNALNVLYGGNAPKI--SEVQANFIsr.fsSAFS-ALSEVLDNQKEREKLTIE-----.-----------------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.-------------------------------Q.SVKG.QALPLSVSYVsTTAEGAQRRLAEYIQQV |
| WZZB_SHIFL/16-155 | EQIDLIDLLVQLWRGKMTIIISVIVAIALAIGYL.-AVAKEKWTSTAIITQPDVGQIAGYnNAMNVIYGQAAPKV--SDLQETLIgr.fsSAFS-ALAETLDNQEEPEKLTIE-----.------P----------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.--------------------------------.SVKN.QQLPLTVSYVgQTAEGAQMKLAQYIQQV |
| WZZB_ECO11/16-155 | EQIDLIDLLMQLWRGKVTIIICIVVAIALAVGYL.-AVAKEKWTSIAIVTQPDAGQLASYnNA-MDVLFGANAPEM-TDVQAGFIgr.fsSAFS-ALAETLDNQQEPEKLSID-----.-----------------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.-------------------------------A.AVKG.QTLPLKVSYTgKTSEEAQKTLAQYIQQV |
| Q57210_YEREN/25-157 | EEVDLIEIISIIFRSSKLIFIVIAIFTLVGGGVV.-FFSPKEWTSYAIVSVTSDGKMQPLeSIESSLSVL---NIDL-NITADDL.....--LM-DFRKYYSSKDMLSKYMSKE----.-----------------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.-----------------------------KV-.NANN.FAGVKGKNIN.SDSDVKGNYILTYSSNL |
| FEPE_ECOLI/25-175 | NEIDLLNLISVLWRAKKTVMAVVFAFACAGLLIS.-FILPQKWTSAAVVTPPEPVQWQ--.ELEKSFTKL--------RVLDLDIkidrtEAFN-LFIKKFQSVSLLEEYLRSSPYVM.-----DQLKEAKIDELD...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.------------------------LHRAIVA-.---L.SEKMKAVDDN.ASKKKDEPSLYTSWTLS |
| Q9RCC2_YERPE/28-180 | NEIDLFEIFSVVFKSKFKIILITLFFLISGLVVS.-YILPQKWTSTAIIALPGDEQVQVLdELITNLTVLDIK----VDVSANYL.....--LS-TFKQNFDSQDLREQYLVNTNYFKrLMKNNPE---DGLDKRA...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.-----------------------------LI-.ERIV.NENISSVNPLkDKTEGENEYRYYKLSYS |
| P72148_PSEAE/13-169 | GDIDLVELVRGLWEEKWIVLIFSLLGILFAAIYA.-FLSTPVYEARIAILPPSLSDVA--.----GFNQGRTRETGLGPFKVQ--.....DVYS-VFVRNLQADGTRHRFFNETYLPS.-----LDEELRSVSRDA...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.--------------------LYKRFTDQISIS.LPGKdFPGRYLVAIE.QEDPERAASWVRRYIAD |
| Q9RHD8_PSEAE/4-148 | -----------LWSLRWLIALLAVLPVLLAIVYL.-FITKPVYEARVSTLPPSLSD----.--IAGFNLG-RSENGLPAFSANGV.....--YS-IFVRNLQSEETRRQFFRDVYI--.-----PS----------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.--------LEEGASVGSRDQLYALLMNSVTIQ.KPSKeDSERYTVVIE.RHDPSQAAEWGEKYIGI |
| Q9XC65_PSEAE/5-161 | GEVDLVKLVKELWVNKVLILLTTLLALIGSFTYA.-YLSKPVYEYRVAVVPPAL------.GSIEGFNVG-RRENGL-DAYTVR-.....SIYA-IFSRNLLSDENKKEFFYKIYL--.-----------------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.-----PQVGEGAESEDEQEEFYKKFSKEVKIDpANKP.DADRYTVIVE.GTKREVLATWAQAFVRL |
| TUAF_BACSU/2-126 | NDI-LIRIARRIKKNIIWIIAVPIILGAAGYILPsQIADQKSYTAEDTLAVGSYDH----.--------------------PVY-.....NSTE-EIPLLLKSDSFLKEALPDEK-DEdV----------------...------.--.-.-....-.----.--.-.-.-.-.-.-.--.--.--.-...-.-.-----.-.-.-.-----.-.----------------------AEIKEKLTI-.-NTE.SKSLLTLSYS.DEDKDRTESVLNAISST |