EMBL-EBI > Goldman Group

PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam



PANDIT Homepage
pan•dit
PANDIT
Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF02684 alignment
(8 sequences with 1158 bp)


LPXB_RICPR/4-374 ATTTACTTTATAGCTGGTGAGATGTCAGGAGATTTTATCGGTGGGCATGTAATTCAAAACTTAAAAAGTAATGAA---------------GGATTAGAGTTTACCGGAATTGGAGGTAAATATATGGAAGAAGCTGGTAACTTTAAAAGCTTATTTACTATTACTGCTATAAATTTAATTGGTTTTATAGAAATAATACCTCATCTTTTAAAGATTAAAAAATTAATTGATAAAACTGTAGAGCATATAATAAATAGTAAAGCTGATTTATTAATTACTATAGATTCACCAGGGTTTACTTATCGTGTGGCAAAGCGTGTCAGAAAACTTTTGCCAAATCTTAAAATGATTCATATCGTTGCACCGTCAGTTTGGGCATATAAAGCAGATAGA------GCAGTAAATTACGCAAAAATTTATGATTGCTTATTTGCTTTATTACCATTTGAACCTCCTTATTTCACTAAGGTCGGT...CTTGATTGTAGATATATAGGTCATCCAATCATGGAGCAGGAGTTTTATCGTGATAAA---ATAGCTTTGCGTAAAGAGTTAAAA---ATAGATGAGAATGAGAGAATTTTATGTGTTACTCTTGGAACAAGAAAAGGAGAAATTTTGCGGCATTTACCGATTTTTATTGATGCTATTCAAGAAATTTCAAAAGATTATAAAAATCTTACAATAATATTTCCACTTGCGCACCCTGATCATGAAGCA------ATAATAAAACCATTTTTAGATAATATTCAATTTAATTATTTATTTTTATCAAATGAAAGACTAAAAGCTTATGCGGTATCTGATTTAGCTCTTGCAAAATCTGGTACTAATACTTTAGAAATATCAGCTTCTGGTACTCCTATGGTTGTAGCTTATAAAGTGAATATAATAAGCTTTATTATTATTATGTTATTGATAAAAATAAAATAT------GTGTCGTTAATTAATATTATAGCAGGTAGTGAAATAATTCCAGAATTTATCCAATTTAATTGCAAAGCTAATCTTATTAGTAATAAGTTAAAAGAATTATTATCAAATTCTCAAAAA---CGATATAATCAGGTAGTAAAAAGCAAAAAAATCTTACAGAAATTAGGGTTTGAATCAAATCGATCACCTTCTTATATTGCTGCAAAAATT
LPXB_AQUAE/4-356 ATATTCCTCTCTTTAGCGGATCGCTCTGCCTCCAATTACGTGTATGAAATACTTAAGGAAGGCTTTGAGGAGTAC---------------------GAAATCTACGGACTTACTGACGAAAAACTGGAAAAA---ATAGGCGTAAAAAGTGTGGCAAGGTATTCTGAAATATCCACGGTAGGACTGATAGAAGCGCTTCCAAAAGTATTTAAATTCTTAAAAATTTACAGAAAAATCCTTAAAAAC------TTAAAAAATACTGACACCCTAATAGCATGCGATGCTCCGGCCCTTAACTTAAGGCTTATAAAAGATGCGAGAAAACTCGGAGTAAAGCGG---ATTATTTACTTCATATCTCCTCAAGTGTGGGCTTGGAAGCCAAAAAGA------GCGGAGATTATAGCCAATTACTGCGATCACGTAATAGTAATCCTCCCGTTTGAAAAAAAGATTTATAGAAAATTCCCGaacTTGAAAGTTCACTACGTAGGACACCCCCTAGTGGATTTGGTAAAACCTCAAAAAACAAAAGAAGAATTTATGAAAGCTTTCAAA------------AAAGAGCCA---CTGCCCCTACTTCTCGGAAGCAGGGAAGGTGAAATAAGGAGACATGTTAAATTATTAAAGGGAATAATTGAAGAATTAAAAAAGAGTTTTGACGTAATTTCTCCGACTTTTAGAGAATTTTCAAAGTTTATTGAGAGA------------------------GAACTTAAA---GTGAAAACCCTTACGTACGAAGGGGCTTCTTACGACTGCTTCTTTTACTCAAAAGCCTCACTAATAGCCTCGGGAACAGCTTCCTTAGAGGCGGGAATTGCGGGAAACCCTCACGTGGTTTATTACAAGGTAAACCCGATTACCTACTTTCTTGGGAAAAGACTTGTAAAAGTTCCCTAC------ATAAGTTTAGTAAACATACTTTTAAAGGAAGAAGTAGTTCCAGAGTTTATCCAAAAAAGTTCAGATGAGATACTGAAAGGTTTTGAAAAGGTTTACAAAAACGAAGAAGAA------------ATTAAGGAAAAACTTGGAACGTTGAAGTTTATCCTCGGTGAGAGGTTCGTTATAAGGAAGCTCAGGGAGTTGTTCTTGGAAATAGTA
LPXB_CHLPN/224-598 TGCTTTCTCTCTGCTGGAGAAGCTAGCGGTGACATTTTGGGGGGTAAGTTAATCCAATCCATAAAGTCTCTCTATCCA------------AACATACGGTTCTGGGGTGTTGGAGGTCCTGCAATGCGACAA---GAAGGTCTCCAGCCCATTCTAAACATGGAGGAGTTTCAAGTTTCAGGATTTGCTGAAGTTCTGGGGTCATTATTTAGATTATATCGAAATTACCGCAAAATCCTAAAAACGATACTCAAACACAAGCCAGCGACTCTTATCTTCATTGATTTCCCCGATTTTCACCTTCTCTTAATTAAAAAGCTGAGAAAACATGGGTATCGAGGAAAAATCATCCATTACGTTTGCCCGAGTATTTGGGCATGGCGCCCCAAAAGA------AAACGCATACTAGAGCAACATCTTGATATGCTCCTACTGATCCTTCCTTTTGAAGAAGGCCTTTTCAAAAACACATCT...CTTGAGACTGTGTATTTAGGACACCCCCTAGTTGAGGAGATCTCTGACTACAAAGAA---CAGGCCTCTTGGAAAGAGAAATTC---CTTAATTCTGACCGTCCTATTGTTGCTGCGTTTCCTGGAAGTCGTCGTGGTGACATCAGCCGAAAT---TTACGGATCCAGGTACAAGCTTTTCTAAATTCATCGCTATCTCAAACACATCAATTTGTGGTTTCCTCATCAAGCGCTAAGTACGACGAAATCATTGAAGATACTCTAAAAGCAGAAGGATGTCAGCATAGTCAAATCATCCCCATGAATTTCCGCTATGAGCTCATGAGAAGCTGTGATTGTGCACTAGCAAAATGTGGCACTATAGTCTTAGAAACTGCCTTAAATCAAACACCCACAATAGTCATGTGTCGACTTCGACCTTTTGACACATTCTTAGCAAAATATATTTTTAAAATTCTTTTGCCCGCGTATTCCTTACCAAATATCATTATGAACTCCGTGATTTTTCCAGAGTTCATTGGAGGGAAAAAAGATTTTCATCCAGAAGAAATCGCTACCGCTTTAGATTTGCTAAATCAACATGGCTCTAAAGAAAAACAAAAGGAGGACTGCCGCAAATTATGTAAAGTGATGACGACAGGGCAAATAGCTTCTGAAGAGTTTTTAAAAAGAATTTTT
LPXB_CHLTR/228-603 TGCTTTATTTCTGCGGGCGAACATAGTGGAGATACTTTGGGAGGGAATTTATTAAAAGAAATGCACGCAAAATACCCT------------GATATTCATTGCTTTGGCGTGGGGGGACCGCAAATGCGTGCA---CAGAATTTTCATGCACTTTTCGCTATGGAGAAATTTCAGGTTAGCGGATTCTGGGAAGTACTTTTAGCACTACCTAAATTATGGTACCGCTATCAGCTTCTCTATAGAAATATTCTGAAAACAAATCCGCGCACAGTGATTTGCATTGATTTCCCTGATTTTCATTTCTTATTAATAAAAAAATTACGCTCTCGAGGATATAAAGGAAAGATTGTTCACTATGTATGCCCTAGCATATGGGCTTGGAGACCTTCACGG------AAAACAGTTTTGGAAAAATATCTAGACCTGCTTTTACTAATACTTCCTTTTGAACAAAACTTATTCAAAGATTCAGCT...CTGCGTACAGTCTATTTAGGGCATCCTCTTTCTGAAACAATTAAAAGCTTTTCTCCC---AATCTAAATTGGAAAGATCAGCTCCATCTTCCTACCGATAAACCTTTCATTGCAGCGTTTCCTGGTAGCCGTCGCAGCGATATCCTGCGTAAT---CTAACCATTCAAGTGCAGGCCTTTCAAGCATCCTCTCTTGCATCCACACACCATTTACTTGTATCGTCTGCAAATCCGGAATATGACCATCTTATCCTCGAAGTGCTTCAACAGAATCGGTGTTTGCACAGTCATATTGTTCCTTCCCAGTTTCGTTATGAATTAATGAGAGAATGTGATTTTGCCCTCGCCAAATGTGGAACTATCGTCCTAGAAACGGCTCTCAATCTAACTCCTACGATCGTCACTTGCCAGCTCCGACCTTTGGATACTTTTTTAGCTAAGTATATCTTTAATATTATCCTTCCAGCCTACTCGCTCCCTAATATCATTCTAGGCAGAACGATTTTTCCTGAATTCATAGGTGGGAAAAAAGATTTTCAATATGAAGATGTTGCTGCTGCTCTAAACATTCTGAAAACATCTCAAGCTCAAGAAAAACAAAAAGACTCTTGCAGAGATGTGTATCAAGCAATCAATGAATCTGCATCCTCTATGAAAGAGTGTCTTTCTCTCATATTC
LPXB_SYNY3/3-385 ATATTTATTAGCACGGGGGAAGTTTCCGGAGATTTGCAAGGATCTCTGCTGGTCGGAGCATTAAGACAGCAAGCTGAAGAGCAAAACTTAGAATTGGAACTGGTGGGTTTGGGGGGAGAAAAAATGGCCGCT---GCCGGTCTGACGTTGCTGGCCAATACGGCGGCGATCGGCTCTGTGGGCTTGACGGAGTCCCTGCGGTTTATTATTCCCACTTGGCAGATTCAACAACGGGTTAAACGTTATTTAAAAACTAATCCCATTGATTTGTTAGTCTTGATTGATTACATGGGACCCAATTTAACCATTGCTAATTATTTACGGAAAACCTATCCCAATCTGCCAATTTTGTACTATATCGCCCCCCAGGCCTGGGTGTGGTCCCCCACGAAAAGGGAAACGGCCCAGATTATGGCGGTAACCGATCGCCTGTTGGCCATTTTTCCAGGGGAAGCGGAATTTTTCCAAAAACAAGGT...TTGGATGTGACCTGGGTGGGCCATCCCTTGTTAGACCGCATTACCAAGGAGGCCCCCAGTCGAGGGTCAGCCCGTGAAAAGTTAGGCATTGACCATAACGAAACGGTAATTACCCTCCTACCCGCTTCCCGCATTCAGGAACTGCGTTACCTGTTGCCGTCCATTTGTGGTGCCGCCCAACAATTGCAGAGCCAATTACCCAATGTAAAACTGCTGTTGCCCGTTTCCCTTAAGGATTATCAACCTCAAATCGAACAAACCCTCAAGGAATTTAATCTCACGGTGCAACTGTTGGAAGGGAAA---GAAACGCTGACGGCGATCGCCGCGGCTGATTTGGCCATCACCAAGTCGGGAACGGTGAATCTGGAAATTGCTTTACTAAATGTGCCCCAGGTTATCCTTTATCGGGTTAGTCCTTTGACCATGGCGATCGCCAGACGGATTTTTAAATTTAATCTACCCTTCGTTTCCCCTACCAACATTGTGCTCAACCGGGGCATTATGCCGGAACTACTCCAGGAACAGGCCACCGCCAGCAACATTGCCCAAGCTGGATTGGAATTGCTTCTAAACGGCGATCGCCAAGCAAAAATTGCCCAGGATTACCAAGAATTAAGGGAAGCATTAGGGGAACCGGGGGTATGTGAGCGAGCCGCCCAGGCTGTCTTGGAGTTT
LPXB_HAEIN/8-380 ATTGCTCTTGTTGCAGGAGAAGTGTCTGGCGATATTCTCGGGGCGGGATTAATACGCCAGCTCAAAGCACATTATCCT------------AATGCGCGCTTTATTGGCATTGCAGGCCCAAGAATGTTGGCT---GAAGGTTGTGAGACGCTTGTTGATATGGAAGAGCTTTCAGTCATGGGCTTGGCTGAAATATTAAAACATCTTCCTCGTCTGTTGAAAATTCGCAAAAATGTCATTCAAACTATGTTGCAAGAAAAACCTGATGTTTACATCGGCATTGATGCGCCTGATTTTAATTTGGATGTAGAACTTAAACTAAAAGCGAACGGAATTAAA------ACTATTCATTACGTGAGCCCCTCTGTATGGGCTTGGCGTCAAAACCGC------ATCCATAAAATTGCCAAAGCAACTCATCAAGTTCTAGCCTTTTTGCCTTTTGAGAAAGCCTTTTACGATAAATTTAAT...GTGCCTTGCCGTTTTATTGGGCACACAATGGCAGATGCTATTCCGCTCAAACCAAAC---CGTGCCGAAGCCTGCCAAACGTTACAGATTGATCCCGCACAACGCTATTTAGCAATCTTAGTTGGAAGCCGAGGTTCAGAAGTGGAATTTCTGGCTGAGCCTTTCTTAAAAACCGCTTTATTATTAAAAGAACAATTCCCAGATTTACAATTCCTCGTGCCTTTAGTGAACGAAAAACGACGAATTCAATTTGAAACCATTAAAGCTAAAATTACGCCAAATCTAGACCTGCATTTAATTGATGGCAATGCACGACAAGCAATGATCGCAGCTGATGCAACACTTCTTGCTTCAGGAACAGCAGCACTTGAAGCAATGCTTTGTAAATCCCCCATGGTAGTTGGCTATCGAATGAAACCACTGACCTATTTCTTAGCAAAACGTTTAGTGAAAACTGATTAT------ATTTCTTTACCAAACTTGCTTGCGAATGAAATGCTTGTTCCTGAAATGATTCAAGAAGAATGCACGCCAGAATTGCTTGCTGAAAAACTATCAGTTTATCTTTCTGATGATGAAAGTGCGGTAAAAAATCGCCATGTTTTAATTCAGCACTTCACGGATTTACACCAAAAAATTCAATGCAATGCCGATAAGCAAGCGGCTCAAGCGGTC
LPXB_ECOLI/9-377 ATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCC------------AACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCT---GAAGGCTGCGAAGCCTGGTACGAAATGGAAGAACTGGCGGTGATGGGCATTGTTGAAGTGCTCGGTCGTCTGCGTCGCTTACTGCATATTCGTGCCGATCTGACAAAGCGTTTTGGCGAACTGAAGCCAGATGTTTTTGTTGGTATTGATGCGCCTGACTTCAATATTACTCTTGAAGGTAACCTCAAAAAGCAGGGTATCAAA------ACCATTCATTACGTCAGTCCGTCAGTCTGGGCGTGGCGACAGAAACGT------GTTTTCAAAATAGGCAGAGCCACCGATCTGGTGCTCGCATTTCTGCCTTTCGAAAAAGCGTTTTATGACAAATACAAC...GTACCGTGCCGCTTTATCGGTCATACCATGGCTGATGCCATGCCATTAGATCCAGAT---AAAAATGCCGCCCGTGATGTGCTGGGGATCCCTCACGATGCCCACTGCCTGGCGTTGCTACCGGGGAGCCGTGGTGCAGAAGTTGAAATGCTTAGTGCCGATTTCCTGAAAACGGCCCAGCTTTTGCGCCAGACATATCCGGATCTCGAAATCGTGGTGCCACTGGTGAATGCCAAACGCCGCGAGCAGTTTGAACGCATCAAAGCTGAAGTCGCGCCAGACCTTTCAGTTCATTTGCTGGATGGGATGGGCCGTGAGGCGATGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGCGAAATGCCCGATGGTGGTGGGATATCGCATGAAGCCTTTTACCTTCTGGTTGGCGAAGCGGCTGGTGAAAACTGATTAT------GTCTCGCTGCCAAATCTGCTGGCGGGCAGAGAGTTAGTCAAAGAATTATTGCAGGAAGAGTGTGAGCCGCAAAAACTGGCTGCGGCGCTGTTACCGCTGTTGGCGAACGGG------------AAAACCAGCCACGCGATGCACGATACCTTCCGTGAACTGCATCAGCAGATCCGCTGCAATGCCGATGAGCAGGCGGCACAAGCCGTT
LPXB_HELPY/4-350 ATTTTAGTGAGCGCTTTAGAAGCGAGCTCTAATGCGCATTTAGAGGAATTACGCCAAAATTTGCCTGAAGATTAT---------------------CGTTTTATTGGCGTGTTT---------------------GAAGGCAAAGAGGTGCTCTATAGCCCTAGGGAATTTTCTATCATGGGTTTTAGAGATGTGATAGGCCGTTTAGGGTTTTTACTCAAAGCCCATAAAGAAATGGTCCAA------TTAGCCAAACAAGCGGATATGGTGCTTTTAATGGATTCTTCTTCTTTCAATATCCCCCTAGCCAAAAAAATCAAAAAACAAGATCCGCATAAAAAAATCATGTATTATATTTTACCGCAAGTTTGGGCATGGAAAAAATGGCGC------GCTAAAAGCCTTGAAAAATACTGCGATTTTTTGGGAGCGATTTTGCCTTTTGAAGTGGGCTATTACCAAAAAAAA---...------GCCCAATATGTAGGACACCCTTTATTAGATGAGATTAAACACTATAAAAAA---GATATTAAGGGCGAAACTCTGGTG------------------------------TTTATGCCAGGAAGTAGGAAAAGCGAAATCGCTAAAATG---TTCCCTTTGTTTGTCAAAGCGGCTCAAATGTTAGAACAAAACGAAGGGTTTAAAAGGCGTGTGCTGGTCGTGCCGAGTTTCTTTAAGGGG------TTGGATTTGAAAGCCCTTTATGGAGAAGACATTCAATTATTTGAAATTTCTTATGATGCACATAAGAGTTTGTTTGAAGCGGAGTTTGCGTTCATTTGCAGCGGCACAGCGACTTTAGAGGCCGCTTTGATTGGCACGCCTTTTGTGTTAGCGTATAGGGCTAAAACGATGGATTTTTTGATCGCTAGAATGTTGGTCAATTTGCATTAT------ATAGGTTTAGCAAACATCTTTTATAACGCCCTAAATAATGAAACTCCAGGGCTTGGGGAGAGCCAATTGCACCCGGAATTGATCCAGCATTTTTTGAGCGTAGAGGGTTTGTTAAAA---GCGTATAAAGAAATGGACAGAGAACGCTATTTTAAAGAAAGTTTGAGATTAAGGGAATATTTAAAACATGGGAGCGCGAGAAAAATCGCT