PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam
 pan•dit |
PANDIT Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees |
PF02414 alignment |
| Q44869_BORBU/1-321 | MKGFS------KNPTCHNKHQHKLISLTSTLDFLNKKDKK-YTQQNILYYYNKNLKRNGLAPTTLRTMQNYLYKLEKVLKVTTNYYQHMGVNCGTEIYYKLKYPKKDCYQKIN.-KYFKERKNSRFKSRVNKHLKDNVSKNSSVNLVECLSNKNN---IKEER--...KIKEIEKYQLRNYFNNCNF-KTEEALSILY-....LNTDKDTKIEAINILKQNEIAL....iKKFNIK----..--KS..........................CMKEKQKKLKEILYNTR--KKLEENGYNPKQLEINLQKVYENYKYKPHFIIENHKYS-DLNNIKRKLEESIERKKENPQQNYQNLKENIF-NILIEQLKKETNIEILKPIIKKY |
| Q44710_BORBU/1-330 | MKNLSNVNKTRKNTLCCNKLQQKLIVLVSTLAYINTKYKK-YTQKTILYYFNENLKRNGQATTKLRTLQKYLYRLEKDFKVTTNYYKHLGVNLGTEIYYHLNFEKNKCHFKIN.-QYFQEKKHLRFTTRVKNYLKDKSLKKGSVELGECFNNKNNN--IKEE---...KNKKIENFQIIKYGNKCNF-KCKEILSFILN....LELNKDLKIKMLKFAKIIEIKL....lKYKNIHF---..-NKS..........................CFKDKQNKLKEILENIQ--KQLEKKGYNAEQLETEFKKIYENYKNKPHFIIENQKYN-DLGKIMFKLEKSIELKKENSQKNYEHIKTNIF-NILIEQLGKTANIEILKPIIKKY |
| O50966_BORBU/1-328 | MENSK------KNTLCQNKTQHKSIVLISTLEYINKTHNK-YTQKNILYYFNENLKRNGQLPVKIKTLQNYLYKLEKEIKVTTNYHKHLGVNCGTEIYYQLNFSKKECYQKIY.-KYFQEKKDLRFQNRATRGLKDRFTKNGSVDLKECLNNKNN---IKEER--...KINEIEKYQVRNYFNKCNF-LCKKILSIFLTilfnLDIDKDNIIKILKIIKIIEIKL....lKNKNIHF---..-TKS..........................CMKEKQEKLKKILCNTQ--KEFEKNEYNPKQLEISFQKIYENYKFKPHFIIESHKYS-DLNNIKRKLEKSIERKKENSQQNYQDLKTNIF-NILIEQLKKEVNIELLKPIIKEY |
| O50729_BORBU/25-349 | MINNS------KKPNCHNKLQQKLIVLLSTLAYVNSKYNK-YTQKNILYCFNENLKRNGQPTTTLRTMQNYLYKLEKVFKVTTNYYKHLGINFGTEIYYKLNYSKKECYLKIN.-QHFREKKDYRFKARVDNYLNDKFNKNGSVDLVECLNNKNNN--IKEER--...KIIQIEKYQVIKYFNKCNFSLLKEILPILN-....LDINKDELIKILKIIKRIEINL....tKNKNTYL---..-NVS..........................YFKEKQNKLKKILSNTQ--QQLEKNGYNPEQLEISFQKIYENYKTKPHFIIENHKYK-DLSHIKRKLEKSIERKKENLQKDCENMRTNIF-NILIEQLKKEVKIDVLKPILKIY |
| O50873_BORBU/23-347 | MQNAFTN---RKNTPCQNKLQHKLIVFISTLKYINSKYKK-YTQSNILYYFNENLKRNGQPTVKLKTMQNYLYKLEKEIKVTTNYHKHLGVNFGTEIYYKLNYPKKECYLKIN.-QHFKEKKDIRFQARVNNYLKDKFNKKGNLNLEECNNNNNNK--EEEEEDI...RNNKIEKCQIKKYFNKCNF-LSEEAKSILE-....LNISKNKTIEIIKIIKKIETDL....tKNKNKV----..----..........................CFKKKQKMLKEILSKTK--KQLEKKGYDTKQLKLKIENIYKSYKTKPHFIIENKKYK-DLDKIRLKLEKSIEIKKESITKKYIHIKVNIF-NILIEQLKKELEIKTLKPIIKNY |
| O51031_BORBU/1-328 | MKSIK-------TS--TNKYQHKLIILISTLNYVNSNLEQ-YTQNDILYYFNNNIRRNCQKEVKLKTLQNYLYKLEKVFKVTSNYHRHLGINMGTEVHYKLKYPKKVCYHLIN.-KHFKEIKKKKYKSRVDSYFNKNCIENSSVKNRECFYNISN---NKEEKRN...SRKSIEKLQIRKYIEKCNF--KSNIFSLILN....LGLKKDATIEVCKMIKKAENLI....eKNIFEKLNVVkvIEVN..........................KLKNKQQKLKRILKEVK--IKLENENYKSEQLEIEIKDIYEQYKNKPHFIIEKNKYE-DLEKITEKLKNKFKQEKINIKENDTNIRNNIF-NILIEQLRHKIKIEILIPILKDY |
| O50717_BORBU/14-338 | VEEAEVKVN--KSLQIQSKYQHKLIALIATLEYINKNKKK-YNQSDILYCFNSNLRRNGQKEVSIKTLRNYFYKLEK-LNITINYYRHLGINMGTEIYYALRHSKKDCYNLLN.-QHFRNKKTERFQRRVNVYIKINYDKKDNVKNGECLNNKYK----KEERETe..RKKRINKLKLKKYAKKCNF--DNEISSFIIN....LNLKKETTIKLFKFIIK-EKYY....fKKENKCN---..-LQK..........................TLQNKKRDLISILRKTQ--KILIKEGCDKKKIKTQIQNTYQKYKNKPHFILESNKYK-DFDQIIKKIKDDTN--KTEPQKHKDNIETNIY-NILLDQLHRKTNTTNLRSKIKEY |
| O50911_BORBU/6-372 | KKSPNTT---KRVKKTTMNFQHNLIVLISTLNFINLNFKK-YTQKNILYLLNKNLERNKQKLIKLKTLQNYLYILEKKFKVTLNYCKHLGKNSGSETYYKLKYEKEKCYLIIN.-TYFKEKIINKIN-EFTQRIKKFNQINSSVK-WECINNTNNIYKYKEYRNIhknSKKTTNNEIIKKYLSKCNF--KTEIPALIMN....LKTTNSTKIYHLRNLKHIENDLkeidpKKIEKHISNVikENINnpgylckffrnsgykriihkikepekKYKNKNEILKKILEEKI--KELEKEQYKKEDLEKFFGKTYEIYKIKPHFIIEHKKYP-DLEKLVKRAKTEIP-KIQDKMVRQKSIKNNIF-SILLEQLRHKVDNDKLIPTLKKF |
| O50986_BORBU/1-302 | MYQIKTN---KMPFNKVVDRRLKIFWVIQKLSANYFISKKKYSLSNVVAMTNSILEKKGFKRVTKRTIQNDIKIFET-LGLIKSHFNPLGKNNGSFTYYTINKALEKLAKKIIsTAYFIDKKTKHEKSKNKQLKKIKIIEESQKYKISHQITSHVL---------...SNNISKKYKNSKYSFRRKN---QNIKKTIN-....-FLEKEIKKKS-KSINLEEIK-.....K---------..----..........................-ITENDITYKNSLWNLKD-FMEELKEYEEKKIIKFYKKNLEKKKQKIWFMAKKFKNT-DFDKLIKKFKIKNK-------MEREKNYENEN-QIHTSNNIKNAIVLMKTLIKKQK |
| O51230_BORBU/6-316 | KSEINLLKIEKDKNLIELGKILKNNNIVELKNLNHYPNLK--LVEKELYQMKSNLSKSEENENILKNLNKKIYILKKEYKSTSKSYKKNLKEIAKTIIEIYPQNLELISKYNM.-NFSKLKLEKYKKIELASDHKTKNYLQRIMLEVSSTINNIIN-MINVYK--...ISKEFEKQVFTKYYPSENFESIMNEFSLN--....-KKLNNVIVKEFKIINEIKTN-.....----------..----..........................-IKNIKEEIKEIISTSK----KEKIYKKN-TIKNEINVITKNKENILKKIAEEFIEITKKDKMTAKTNAISS----IIQKIEKINQKILNLNNDLIKITKQEEIKNIQQKIQAL |
| O50774_BORBU/5-331 | LLNHNHN---KTNTNKLLSKDSRLKKIISVINYLNKSFEKKYDISIYRIHFNSEKLKELYPHHQIDILRVLNSNISK-EGYKPTVIRTLREDLRFLIHIKAIEKKILTFSNNL.-GKFKGKLCIYKVSPIAYKLISAYFEAYKADLYRKIKKSKDG--LDTQ---...NVTKNVTVYINYHKNIYNKNSIETVFKKSYT...kKKTKKKNKKEFTKNNLEKRLKL....pEEITKEI--I..SIAK..........................KTKNPDKTYKNTLFNYKDFLNYLSYDYKKEDISYFFLSKLKEYKNKIHFMRKYAPYKTDFYLLAGEFKDSYH-------SKWKTNKKTNF-SGHVKEIANNILSKILEKELKFE |
| O50682_BORBU/5-298 | ISNHNH----QTNKNKLLGKICRLKKIISVINYLNKEFKKKYNTSINKEHFTSKKVKELRVHHQGDILRVLNSNIHR-ENKKETTINTLRLDLKFLVKLKALEKRILTFSNSF.-GEFKGKLCIYKVSPIAYKLINAYFNNTKIDLLKKVKEEKES--FKPK---...NITENITVYNKQYINIYNKNSIE--------....-------------NSFFKRIK-.....----------..SIIF..........................NAKEPTKSLKNTLLNYKDFKNYLKYDYETKDIKEFFLSKLSLYKHKIHFMRKTAPYKTDFYTLAGEFKDTYT-------TKWKVNKITSF-SGHARIIANNILVNTLKKGLKFE |
| P70840_BORBU/5-334 | IKNNVNTNFNNLITLEEIIKYNQKNASSNLIELKRSRLKSYLTKKRAIYQRILKVCWAIDLKNKQYYKSNKLKTYST-IEIHNIVNKCLAKDNKKISIRTLEYDISFLNQILL.-IKTKLKHLGKDNGSFAFYIQNKNLWKHRFIIIQEAINKEIKEYLKDK---...KIVSDFFKEINNTINKNNIRNIKPKSSIAD-....ESIADVIP-KGIKGINKIENSIe....KNNGKIN---..----..........................KISYKEYIANKLVEVHKIEKMQITKILKISNNEKTYINALRNLKLAIEKYKEEYKIEDISNHFIKEFKNKYS--KKIWMMNGKTDRTNDFYEIWEKRFKKTFLNKNLKKQYRSN |