EMBL-EBI > Goldman Group

PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam



PANDIT Homepage
pan•dit
PANDIT
Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF02311 phylogeny
for nucleotide alignment


 
(((((((((YFIF_BACSU/24-166,Q8XDK9_ECO57/17-149),(((RHAR_ECOLI/47-192,Q8ZIZ9_YERPE/19-154),(RHAS_ECOLI/13-160,Q8ZJ00_YERPE/13-160)),((((((Q9F4J7_STRMT/16-169,Q9KJ78_STRMU/27-178),Q97J35_CLOAB/18-166),Q8YAK9_LISMO/10-152),((((((LACR_STAXY/16-157,Q8KQ88_STACA/17-158),Q8XMB9_CLOPE/16-157),((MSMR_STRMU/18-158,Q97NW0_STRPN/15-159),Q8XNG3_CLOPE/18-163)),RAFR_PEDPE/16-159),Q9KAQ8_BACHD/19-160),(((O52846_BACME/18-156,Q9K6M6_BACHD/16-157),Q8ZB10_YERPE/49-188),YIDL_ECOLI/35-186))),(Q9KEY8_BACHD/2-137,Y1052_HAEIN/16-180)),Q8TJ65_METAC/33-154))),O31449_BACSU/13-153),(ARAC_ECOLI/20-162,ARAC_ERWCH/25-168)),Q92U90_RHIME/34-177),(O88020_STRCO/32-167,(((((((MMSR_PSEAE/46-190,O87004_PSEAE/10-147),Q8KJH7_RHILO/35-177),(Q8XRZ5_RALSO/20-158,(Q8UH20_AGRT5/13-155,Q92SM3_RHIME/13-152))),(((Q9HZT0_PSEAE/14-157,((Q8UIQ4_AGRT5/38-173,Q98CG6_RHILO/31-167),Q9I0Z3_PSEAE/17-153)),((Q8UGF7_AGRT5/17-158,Q92R06_RHIME/29-170),Q9L019_STRCO/19-156)),(Q9HTL6_PSEAE/12-148,(O50480_STRCO/16-155,(Q9HYX2_PSEAE/18-159,Q9KKU9_VIBCH/21-161))))),(Q9I3A3_PSEAE/11-156,(Q8XQV3_RALSO/13-154,Q9KVF4_VIBCH/14-154))),Q8U8U3_AGRT5/12-140),((Q9I4M6_PSEAE/16-140,(Q8UB64_AGRT5/29-158,Q8XUX1_RALSO/21-142)),(((Q8PDI3_XANCP/32-172,Q9HWR1_PSEAE/30-152),Q9FCG3_STRCO/19-152),Q9RC93_9BACI/17-143))))),(Q9I5X2_PSEAE/16-179,(Q9I0W3_PSEAE/53-201,Q9KK00_9PSED/56-188))),Q989F9_RHILO/80-216),Q8U6Z7_AGRT5/35-171,Q9KIF4_RHIME/35-171);
(((((((((YFIF_BACSU/24-166:0.68685,Q8XDK9_ECO57/17-149:0.61460):0.13287,(((RHAR_ECOLI/47-192:0.23513,Q8ZIZ9_YERPE/19-154:0.30373):0.17634,(RHAS_ECOLI/13-160:0.17130,Q8ZJ00_YERPE/13-160:0.37846):0.31360):0.40974,((((((Q9F4J7_STRMT/16-169:0.52194,Q9KJ78_STRMU/27-178:0.32261):0.24542,Q97J35_CLOAB/18-166:0.49535):0.05279,Q8YAK9_LISMO/10-152:0.72896):0.08168,((((((LACR_STAXY/16-157:0.23988,Q8KQ88_STACA/17-158:0.28466):0.13677,Q8XMB9_CLOPE/16-157:0.26480):0.21930,((MSMR_STRMU/18-158:0.41371,Q97NW0_STRPN/15-159:0.36993):0.11869,Q8XNG3_CLOPE/18-163:0.46228):0.03620):0.07084,RAFR_PEDPE/16-159:0.62496):0.03370,Q9KAQ8_BACHD/19-160:0.69087):0.05931,(((O52846_BACME/18-156:0.41007,Q9K6M6_BACHD/16-157:0.68180):0.16022,Q8ZB10_YERPE/49-188:0.74467):0.18932,YIDL_ECOLI/35-186:0.80196):0.07440):0.10026):0.07895,(Q9KEY8_BACHD/2-137:0.85413,Y1052_HAEIN/16-180:0.61678):0.12782):0.15330,Q8TJ65_METAC/33-154:0.74222):0.16366):0.10655):0.18601,O31449_BACSU/13-153:0.40637):0.32270,(ARAC_ECOLI/20-162:0.21920,ARAC_ERWCH/25-168:0.40102):0.46947):0.22646,Q92U90_RHIME/34-177:0.76095):0.11829,(O88020_STRCO/32-167:0.70233,(((((((MMSR_PSEAE/46-190:0.67634,O87004_PSEAE/10-147:0.30480):0.16639,Q8KJH7_RHILO/35-177:0.55421):0.08899,(Q8XRZ5_RALSO/20-158:0.43740,(Q8UH20_AGRT5/13-155:0.37285,Q92SM3_RHIME/13-152:0.31112):0.04203):0.15038):0.11090,(((Q9HZT0_PSEAE/14-157:0.49418,((Q8UIQ4_AGRT5/38-173:0.35111,Q98CG6_RHILO/31-167:0.20447):0.13989,Q9I0Z3_PSEAE/17-153:0.24545):0.11110):0.06754,((Q8UGF7_AGRT5/17-158:0.19879,Q92R06_RHIME/29-170:0.24792):0.26637,Q9L019_STRCO/19-156:0.32588):0.09560):0.05442,(Q9HTL6_PSEAE/12-148:0.55480,(O50480_STRCO/16-155:0.38377,(Q9HYX2_PSEAE/18-159:0.29611,Q9KKU9_VIBCH/21-161:0.55412):0.11575):0.05697):0.06858):0.02462):0.03682,(Q9I3A3_PSEAE/11-156:0.42168,(Q8XQV3_RALSO/13-154:0.43328,Q9KVF4_VIBCH/14-154:0.59192):0.09429):0.12310):0.06644,Q8U8U3_AGRT5/12-140:0.75723):0.08104,((Q9I4M6_PSEAE/16-140:0.48191,(Q8UB64_AGRT5/29-158:0.70266,Q8XUX1_RALSO/21-142:0.38809):0.18062):0.14903,(((Q8PDI3_XANCP/32-172:0.87309,Q9HWR1_PSEAE/30-152:0.31365):0.16685,Q9FCG3_STRCO/19-152:0.40834):0.02568,Q9RC93_9BACI/17-143:0.88234):0.10226):0.04654):0.06802):0.05834):0.13317,(Q9I5X2_PSEAE/16-179:0.51107,(Q9I0W3_PSEAE/53-201:0.08031,Q9KK00_9PSED/56-188:0.46927):0.41493):0.16229):0.72895,Q989F9_RHILO/80-216:0.17328):0.02645,Q8U6Z7_AGRT5/35-171:0.19361,Q9KIF4_RHIME/35-171:0.12572);