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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF02086 alignment
(26 sequences with 957 bp)


MTHB_HAEPH/11-298 TATATCGGCAATAAAGAAAAAATTGCCGAATGGATCTGTGAGCAGTTACCTGTAGATGTAAGA------------------ACCATAGCGGATGTATTCAGCGGTGGTTGTTCTTTTTCTTTTGAAGCGAAAAAG------...---CGTGGTTATCAAGTGATTGCCAACGATATTTTGAATATCAACTATCAACTAGCATTGGCGTTGATTGTAAACAATCAGGAAATAttgACTgctTGTGATGTAGATTTTATTTTCAGTAATCCTCCGAAATCT---...------GGCTTTATGACCAAGAAT------TATAGTGATGTATTTTTCTTTAAAGAAGAATGTCGAGAGcttgatGCTATTCGTGCAAATATATTGAAGCTAAATAATACATATAAGCAAGCGTTAGCATTTGCGTTAATGCGTAGGGCAATGATCCGTAAAATGCCATATTCTCGTTTTACGATCTCTTGGGAAAAGGTTAAGCAGTTGCGAGATGAAGAGTACAGCTATTCCAAATATGGTCGTCGCCGAGCTTATCATAATcaaTCATTTGAATTTCATTTTAGAGAAAACTTGAATTCTTACAATCAAGCTGTGTTTAATAATGGT.........AATATTCATCAGGCATACAATGAGGACGTGTTTGAACTATTAGAT...CATATACAAGCCGATGCAGTTTATTTAGACCCACCTTATACTGGC------ACAATGAACAATTATTTTGGCTTCTATGGTTTACTTGATAGCTATATGTCAGGA------------GAAATTAGACAGCCTTTTGAT.........---AATCATTTTATGGATAAGAATCAAGCAGTAGAATTATTT...GAAAAATTGATTGAAAAGCTAAAACCGTTTAAATACTGGTTGCTTAGTTACAATAATGTATCACGCCCAAATCGTGAAGAATTAACAGCGATG
O30358_NEIGO/10-297 TATATCGGTAATAAAGAGAAAATAGCTTCCTGGATTTGTGACCAGCTTCCGTCTGATGTAGAT------------------ACAGTTGCAGATGTATTTAGTGGAGGCTGTTCCTTTGCCTACGAAGCCAAAAAA------...---CGCGGCTATCGTGTGATTACTAACGATATTTTGGCAATTAATTACCAAATTGCTTTAGCATTAATAGAAAACAACCATGAAACAttaAATgacGATGATGTCGCAATGATTTTTTCAGGCAGCCCGCATGCC---...------GGTTTTATGAGTCAGCGT------TATTCCGAAAAATTCTATTTTCACGATGAATGCCAACAActtgatTTGTACCGTAAAAATATAGGGAAGCTGAATAACCAGTATAAACGTGCTTTGGCGTTTACTTTAATGCGTCGCGCCATGATACGTAAAATGCCCTATTCACGATTCACAATTCCTTGGGAAAAAGTTAAACAACTGCGTGATGAAGAATACAGTTATGCTAAATATGGCCGTCGACGCGCCTACCACAATgaaAGTTTTCAAAGTCATTTTCTGCAAAATTTGGATGACTATAACCAAGCTGTTTTCAATAATGGC.........TGGCGGCATCACGCCTTTAATCAAGATATATTTGATTTATTACCT...AATATACAAGCTGATGCCGTCTATTTAGACCCACCTTACACAGGC------ACGATGAACAATTATTTTGGCTTTTACGGATTATTGGACAGTTACATTACATCA------------TCCATACCCAAACCATTTGCC.........---AATCATTTCATGGATAAAAAGCAGGCTGTCGAATTATTT...AAAAGGGTAATCAATCATTTGAAACCATTTAAATATTGGCTGTTAAGCTACAACAATGCTTCATATCCAAACCGAGATGAATTAGAAGAAATG
Q56004_9BACL/4-286 TACTTGGGTAGCAAGCGGACGCTCGTGCCCGTCCTCGGTGACATCGCTTCGGCCTCT---------------GGAGCAACAGAGGCGGTTGACCTGTTCACCGGCACGACGCGTGTGGCGCAAGAGTTCAAGCGT------...---CGCGGGCTTCGAGTTCTTGCTAACGACGTAGCGACGTACTCCGAGGTTTTGGCCCAGTGCTATATCGCCACCAAC---------...---...---GGCCAAGAAGTGGACCGCCATGCGCTCGAGGCCGCT---...---CTGGCGGAGCTGAACGCCTTGCCCGGCGAACCTGGATACTTCACGGAAACCTTCTGTGAGGCTTCT......------CGC---TACTTCCAGCCCAAGAACGGGGCTCGGGTGGATGCAATCAGGAATGCGATCGACGACCGG------------TACGCGGACTCATGGATGCGACCGATCCTCCTCACGAGCTTGATGCTTGCGGCCGACCGCGTCGACTCCACTACCGGAGTGCAAATGGCGTACCTGAAGCAG---...---TGGGCCGCGCGTGCGCATAATGATCTAGAGTTGCGGCTTCCAGACCTAATCGCA------.........GGTGACGGGGACGTTGCTCGTGAGGATGCGGTGACCCTCGCACAAgagCTGCCTCGCGTCCAGCTGATGTACCTTGATCCTCCCTATAACCAGCACAGGTACTTCACCAACTACCATATTTGGGAGACCCTGATTCGTTGGGATGCCCCTGAGAGTTATGGGATCGCCTGTAAGCGCATTGACTCTcgggatgatGCCACCAAGAGCCCCTATAATATGAAGCGGCGAATGCCCGGCgagATGCGTCGTTTGTTGATGACCATCAAGGCGGATCTCGCGGTTGTATCTTACAACAATGAGTCGTGGATTGATCCGGAGACGATGATGTCGACC
MTC2_CHVP1/6-287 TATATTGGTTCCAAACTAAAATTGAAGGATTGGATATTCGAGGAAATTTCTAAAAGGACT------GACGATACTTATACAAAATTTGCAGATTTGTTTGCGGGTTCGTGTATTATGACGCACGAGGCCCTCGAG------...---AAAAAATACGAATGTATATCTAACGACCTCGAGACATACTCTTACGTTATTATGAATGGGTTGAAATGTCCG------------...---...---TTTTCCGATAAATTACAAAATATAATAGAAACTCTT---...------GATGATCTAGACACGAAAGATATGGTCATTCCTGGGTTCGTGACGCTGACATATTCCCCGAGA......GGAAACAGAATGTATTTCACCGAAGATATAGCTATGAGAATAGATATCATACGTGAAAATATCGAACGTATGAAGGAGCGTGTTTCTACGGATGAG------TATAACTTTCTTCTTGCATCGTTGTTGACAAGTGCGGATTCCGTTAAAAATACGAGCGTTGTATATGGCGCGTATTTAAAGAAA---...---TTCAAAAAAACTGCTTTAAAACGCATGGTTTTTGCTCCTCTACATACACGTTCTACCACA.........GTGACATTAGAAACGTTCAACGAGGACGCAACCGAATTGGAA---...---ATTAAAACGGACATTGCTTACGTAGACCCTCCGTACAATTCCCGTCAGTATGGTGCAAATTATTTTGTGCTCAACCAAATACTAACACCGAAGGAAATTGGT---AACGGAGTTACAGGACTTCCTGAATATAAA.........AAATCTTCGTTTTGCCGTAAACAAGAAGTTGCTATGTCTTTT...CACAAGATGTTGAAAAATGTGTCC---GCCCGCTTGTTCGTAATATCATACAGCTCCGAATCCCTTCTTTCAAAGGGAGATATGGTTGCGCTT
MTN3_NEILA/3-291 TATATCGGCTCCAAACTAAAACTTTCTAACTGGCTGGAAACTGAAATAAGCAATGTGGCCGGCCATTCGCTGTCTGATAAAGTATTTTGTGATTTATTTGCAGGGACGGGGATTGTCGGAAGAAAATTTAAAACA------...---AATGTAAAGCAGGTGATTGCGAACGATATGGAATATTACAGTTATGTTTTAAATAGAAATTATATCGGC---------------...---...---AATTGCCAAAGTATTCTTAAAGCGGGCGAACTTCTG---...------CAAAGGTTGGAACAGTTGCCG---CCCAGGGAAGGGTTGATTTATCAACATTATTGTTTGGGTtcgggcTCGGAACGCCAATATTTCAGTGATGAGAACGGTAAAAAAATAGATGCTGTCCGGATTCAAATCGAAGAGTGGAAAAATACGCGCTACATTGATGAAGATACTTATTATTTCTTACTGGCAACTTTGCTGGAGGGTGCGGATAAAGTGGCAAATACGGCATCTGTTTACGGGGCTTTTTTGAAAAAT---...---CTAAAAAAGTCGGCATTGAAACCATTGTCGCTCGAACCTGCTTTGTTTGAGATTGGCAGT.........GACGGACACCAAGTTTATCAAGCGGATGCGAATCAGTTAATAAAA...AATATTTCAGGCGATATTTTATACTTAGATCCGCCGTATAACGCCCGCCAATATGGTGCGAATTATCATCTGTTGAACAGTATCGCGCTTTATGATGATTTTACGCCCAAAGGGAAAACGGGCTTAAGGGAATATAGC.........CGCTCGAAATATTGCTCAAAATCGGATGTGGTTCCGGTATTT...GAGGCTTTGATTAGGGATGCGGAC---TTTCAATATATTTTTCTCAGCTACAACAACGAAGGCTTGATGTCTGTCGGGCAGGTAAGGGAGATT
O30889_HELPY/3-290 TACATCGGCTCTAAATACAAGCTCATTCCCTTTATTAAAGAAAATATCCATGCGGTTGTAGGCCATGATCTCTCTGGTGCGATTTTTTGTGATCTGTTCGCTGGGACGGGCATTGTGGGGCGTGCGTTTAAAAAA------...---GCTGTTAATAAGGTTATTTCTAATGATTTGGAGTATTATAGCTTTGTTTTGAATCAAAATTATATTGGC---------------...---...---AACATTCAAGAAATCCCTAATCAAGAAGAGCTTATT---...------GATAGGCTCAATAGCGTTGCT---TTAAGAAAGGGTTTTATTCATTCGCATTATTCTTTGGGGggg...AGTTCAAGGCAGTATTTTAGCGAAACAAACGCTCAAAAAATTGATGCGGTGCGTCTAAAAATTGAAGAGCTTAAGCTTTCTCAAAACATTGATAATTGCGCGTATTATTTTTTGCTCGCATCACTATTAGAGAGCGCGGACAAGGTGGCTAACACCGCTTCGGTTTATGGGGCTTTTTTAAAACGC---...---CTTAAAAAAAGCGCTCAAAAAGAACTCATCTTAAAAGGCGCTCATTTTGATTTGAGTTTA.........AACGCTAATGAGGTGTATCAGCAAGACGCTAGCGAGTTGATCGGA...AAGATTTCAGGGGATATTTTGTATTTAGACCCTCCTTATAATGCGAGGCAATACGGGGCGAATTACCATTTATTGAACACGATAGCTGCTTATACGCCCTTTACTCCAAAAGGTAAAACCGGCTTGCCCAGTTATCAG.........AAATCCTCTTTTTGCTCTCGTTCTCAAATCTTAAACGCTTTT...GAAAACTTGATCAAAAAAGCGCGA---TTCAAATATATTTTTTTAAGCTATAACAATGAAGGGCTTATGAGCGAGATAGAGATTAAAAATATT
MTF1_FLAOK/3-300 TTTATTGGCAGCAAAGTTAATCTATTAGACAATATACAAGAAGTTATTGAAGAAAACGTTAAG------GACGATGCTCATGTGTTCATGGATCTTTTTTCAGGAACGGGCATTGTGGGA---GAGAATTTTAAA------...---AAGGATTATCAAGTCTTATCAAACGACAGTTTATACTTTTCGTATATTCTATTAAAAGCTAAAATCGAAAATAATAGTATTCCTaatTTTtcgGAGCTTAAGAAGATTGGAATTAAAGAACCTCTTCATTAT---...------TTAGAAAATGAAGAATTCGAAATATCTCATGAATTCTTTCTTACTCACAATTATTCTCCTTACatggggTGTGAGCGAATGTATTTTACAGTAGAAAATGCAAGTAGAATCGACTTTATTCGACTCACACTTAATCGTTGGAAAAATGAAAGCTTAATTAATGAATTAGAATTTGCTTATTTATTGGCCATTTTGATTGAAGCAGTACCTTTTATCTCAAATATTTCTGGAACTTACGGAGCTTACCTTAAACAT---...---TGGGATAAAAGAGCTTTAGGCAAATTAAAGCTACGAACATTAGACATTGGTAATAACCAT.........TATGCAAATAAAACTTATAATGAAGACGCTAACTCGTTAATTGAA...AAGGTGTACGGGGATATTTTATACATAGATCCTCCTTATAATGGGCGTCAGTATATATCTAATTATCATTTGCTTGAAACAATTGCTCTTTATGATTATCCAGAAATTTATGGGAAAACCGGGTTACGACCTTATGTAgag...agtAAATCTTTGTATTGTCAAAAAAAAGAAGTAGGTAATGCTTTC...AATCATTTGATAGAGAAGGCTAAT---TTTAGACATATTTTGGTGAGTTATAGTTCTGAAGGGCTTTTGTTAGAAGAAGAAATAGAAAGTATC
MTS1_STRSA/3-298 TATATTGGTTCAAAAAAATTACTTCTACCTGAAATTAAAAAAATGGTAGATAAACATACTGAT------GGCTCTGAGGAAGTGTTCTTAGATTTATTTGCTGGTACAAATGTAGTTGCA---AATTATTTTAAA------...---CAATTTTACACAGTCTATTCGAACGACATGTTATTTTTTAGCTATGTCAATGCTAAAGCTACAATTGAAAATAATTCAAAACCAtcaTTTtctAAACTTATTCAGGCAGGTATCAGTTCTCCTATGACTTAT---...------TTACAAAATTTAGAAGTCAACGATGAAACGATAGGATACTACGAAGTTGCTTATTCGCCCACT......GGAGAGGCAAATTACCTTTCAGTACATAATGCAAAAAAACTGGATATAATTCGTAGTCAAATTGAGAGTTGGAAGAATCAAAATTTATTAACAGAACACGAATATTATTATCTACTCTCTTCTCTCATAGAAGCATTGCCATTTATTAGCAACACTACAGGAACTTATGGCGCTTTCCTAAAACAC---...---TGGGATAAAAGATCTTTAAATGATTTAGAATTACAAGATTTTACTATATTTGATAACTCA.........AAACAAAACAAAGCATTCAATGAAGATGCGAATGAACTAGTTCAA...AAAATAAAGGCAGATATTGTCTATATTGATACCCCTTATAATTCAAGACAATATGCCTCTAATTATCATTTACTGGAAAATGTCGCTAGAAATGAACACCCAACTTTAAAAGGTATTACAAAAATTTTCGATTGGAAAaac...cttAAAAGTGATTACGCTACAAAAGGCAAGGCTCTGGTAGCAATG...AGAGATTTAATTCAAAATATAAAT---TCAACTCATATAATTTTGAGTTACAATAATGAAGGTATTATCTCCGAAGAGGATTTGACTAATATT
MTL1_LACLA/3-299 TATTTAGGAAACAAAACTAATTTATTGAATTTCATACAACAGGTTATAAAAAAACATGAT---------ATACAAGGTCAGACATTTGCAGACTTATTTGCGGGAACAGGTTCTGTCGGCGACTACTTCAAAGGT------...------GAATACACCGTTCTCTCAAATGATTATATGTATTTTTCAAAGGTCATTAGTGAAGCAAAATTGTTGAATTCAGAGAAGCCG...---...---AAGTTTGATAGTTTTGTAAAAAGATATGGGAAAACACCTtttCAATGGTTGAACGAACGAGAATATACACCGAATGATGGATATTTTGTTTATAACAACTATACTCCACGT......GCTGAAAGAATGTATTTGACTGAAGAAAACGCTCTTAAAATTGATGGAATGCGACTTGATATCGAGGAGTTGTTTCAGGAAGGAGTTATTTCAAAAGCTGAGTACTCTTATCTGTTGGCTTCTCTATTAGAGAGCGTAACAAAGGTTTCAAATACGTCTGGGACTTATCAGGCTTTCTTCAAGTTT---...---TGGGAATCACGTGCATTAAAAAAATTCACCATAATGCCACTCGAGATGAAAGATTCACTAtcggtttctAAGGACAATAGATGTTTTAATAAAAATACAAATAGATTGGTTAGG...GAAATTTCCGGAGATATTGCTTATATTGATCCACCTTATACAATTACCCAATATACTAATTCGTATCACGTTCTTGAGACAATCGCACGTTATGATAATCCTGAATTGTTTGGTAAAACTGGCAGAAGAGTTAAGCGG......gagTTTTCGGGGTATTCAAATAAGTCAAAGGCATATTATGAATTT...GAAGACTTGTTCCGCCAGATTAAT---TTTACTCATGTGCTTGTTAGCTATAGCAATCAATCAATAGTTCCACTTGATGAATTAGTTGACCTA
Q9ZLZ2_HELPJ/37-278 TATGGTGGGGGCAAGTCTTTAGCTGTAGGGTTAATAGTGGAGTGTATACCTAAT------------------GGTGTGCGTAGGGTTATTAGCCCTTTTATAGGTGGGGGGAGCGTAGAAATTGCATGCGCGACA------...GAGTTGGGTTTAGAAGTGTTGGGCTTTGATATTTTTGATATTTTAGTGAATTTTTATCAAGCGCTACTCAAAGAC------------...---...------AAACAAGCTCTTTATGATAATTTGTTCTCT------...------TTAGAACCT---------------AATCAAGAAACTTACAGCATTATCAAG------------......------------------CAAGAGTTAAAA---------------GCCCATTATAAAAAAGAATGC------------------GTTTTAGACCCTTTAATTTTGGCCAGAGATTATTACTTTAACTTTAATTTAAGTTATGGACCGGGATTTTTGGGGTGGATGAGTAAAATTTATACCGATAAA---...------CAACGCTATCTAAACACCCTTTTAAAAATTAAAGATTTTAACGCCCCTAGT------.........TTAAAAGTGGAATGCTCTAGTTTTGAAGAAGTGTTGATCGCTTAT...------CCTAATGATTTTTTCTATCTTGACCCCTCTTATGTGTTAGAAAATTCTAAAATGTTTAAGGGGATTTACCCTATGCGTAATTTCCCTATCCACCATAATGGTTTTAAACATGAAGTATTGGCTCACATGTTA.........---AAAAGGCATAAAGGGCCATTTATTTTAAGCTATAAT---...---------------GACTGCGAATTGGTAAGGAATGCTTATAAGGAT---------TTTAAAATTTTAGAACCCTCTTGGCAATACACTATG
P74637_SYNY3/26-266 TATCCCGGCGGAAAATCCAAAGCCCTGAGACAAATTTTGCCCCATGTTCCTACT------------------CAAATCAAAGAGTATCGGGAACCTTTTATCGGTGGAGGCTCTGTCTTTTTAGCCATCAAGCAAATTTTTggtCAGCACATTAATAAGTATTGGATTAACGACTTAAATTTTGATTTATATTGTTTCTGGAAATACGCCCAGGAGGAA------------...---...------ATTGAACGGCTAACTGATGCAGTCACA---------...------GTAATTAAACAACACCAAACCGACGGGAGAGAACTTTTTGCCAACTTAACA------------......---------------------AAAGAAGGG------------TTAGAGTTGGACGAATTCCAGCGG------------------GCAGTGCGTTTTTTTGTGCTGAATCGCATTACTTTTTCTGGCACGGTGGAATCTGGAGGCTATTCTCAACAGGCGTTTGAAAAACGTTTTACCGATTCTTCC---...------------------ATTGATAGATTAAAAACTCTGGGAACAATGTTAGCTAAT------.........ACGACTGTTACCAATGGGGATTATCAACAATTAATTGAACAGCCA...---GGAGAGAACGTGTTTATTTTTCTTGATCCTCCCTATCTGAGC---GCGACTAAATCGAAACTCTATGGTAAAAAGGGGGATTTACACACTTCTTTTGGTCATCAAAGATTTGCTGAAGTGATGGAAAATTGTTCT.........---------------CATAAATGGCTGATTACCTATGAT---...---------------GATTCCGAGGAAATCAGAAAATTATTTAGTTTT---------GCCCAGATTATTGAATGGGATTTACAATATGGGATG
DMA_BPT4/7-241 TATACAGGTAATAAACAATCATTATTACCTGAACTCAAATCTCACTTTCCA---------------------AAATATAACAGATTCGTGGATTTATTTTGTGGAGGTTTATCAGTGTCTTTGAATGTT------------...------AATGGCCCTGTATTGGCCAATGATATTCAAGAACCAATTATTGAAATGTATAAGCGTCTTATTAATGTA------------...---...---TCATGGGATGACGTTTTAAAAGTAATAAAG---------...------CAATACAAACTATCAAAA---ACATCAAAAGAAGAGTTTTTGAAATTACGT------------......------------------GAAGATTATAAT---------------AAAACTAGAGATCCTCTTTTA---------------------------CTTTATGTTCTTCATTTTCACGGATTTAGTAATATGATTCGTATAAACGATAAAGGAAATTTTACTACTCCGTTTGGAAAAAGAACTATAAAC---...------------------AAAAATAGTGAAAAACAATATAATCACTTTAAACAAAAT---TGT.........GATAAAATAATCTTTAGTTCATTGCATTTTAAAGATGTTAAAATT...TTAGACGGCGAT---TTTGTATATGTAGATCCTCCGTATCTC---------------ATAACAGTTGCTGATTATAATAAA---TTTTGGTCAGAAGATGAAGAAAAAGACCTTTTAAATCTTTTAGATTCTTTA---.........---AATGATAGAGGAATAAAATTTGGGCAGTCGAATGTTTTA...GAACACCACGGAAAGGAAAACACTCTTCTTAAAGAATGGTCTAAAAAA---------TATAATGTAAAGCATCTTAATAAAAAATACGTCTTT
MTE5_ECOLI/12-260 TCGCAAGGGATTAAGACTAAACTGGTTCCGTGCATAAAGAGAATTGTTCCTAAAAAC---------------TTTAATGGGGTATGGGTCGAGCCGTTTATGGGGACTGGAGTTGTTGCCTTTAACGTT------------...---GCTCCTAAAGATGCATTATTATGTGATACAAACCCTCATTTGATTTCTTTTTATAATGCATTGAAAAATAAAGAT---------...---...---ATAACAGGGGATCTTGTTAAGGATTTTTTATATCGT---...------GAAGGTGAAAAACTCTTATTAAGTAATGGTGAGTATTATTATGAAGTCAGG------------......------------------GAAAGGTTTAAT---------------------AATTACAAGGAACCG---------------------TTAGATTTTTTATTCTTAAATAGGTCTTGTTTTAATGGTATGATTAGGTTTAATAGTAAAGGAGGGTTTAATGTTCCTTTTTGTAAAAAACCAAACAGATTTgcaCAAGCATATATTACCAAGATTTCGAATCAAGTTGATAGGATTTCTGAAATAATATCAAAAGGG......aacTATACATTCTTGTGTCAGTCATTTGAAAAAACTATTGGCATGGTA...---AATAGGGATGATGTTGTTTATTGTGATCCTCCATATATTGGT------------------AGGCATGTTGATTATTTTAATTCATGGGGAGAGCGTGACGAGCGTTTATTATTTGAAACGTTATCATCTTTGAAT.........---GCTACATTTATAACGTCTACGTGGCATCATAATGATTAT...------------AGGGAAAATAAGTACGTTCGTGATTTATGGTCATCT---------TTTAGAATATTGACAAAAGAACATTTTTATCATGTT
MTC1_CHVN1/7-241 TGGTCGGGTGGCAAAACAGATGAGCTGAAACGTTTCGAAGATTATATTCCATCT------------------GATTGTTCTACGTTTATAGAACCATTTGCAGGTGGAGCTGCAACTTTTTTTCACGTTGGAAAC------...---CAATTCGAAAACAAGGTGTTATCAGATGTTCATGTAGAGCTCGTAGCGTTGTATCGT---GCGATTGCCAAT------------...---...---GGAAAATCTCAAGCTATTTACGATTTCATGAAA------...------TCTCACGCC------------AATGATGAAAAAACATATTATGAAGTGCGA------------......---------------------AGCTGGAAA---------------CCAGAAGATTACGTTGACGTT------------------GCTAGTCGGTTTTATTATCTTCGTAAAACGTGTTTTCGCGGAATGATGAGGTACAACAAGAATGGTGGGTTCAACGTACCATTTGGTCGTTACAAAACATAT---...---------AATTTCGAAGATATAATAAATGAAGAATATTATAACATTCTTAAAGAT------.........ACGATTATTCTTGAAAAGTCGTTTGATTACATATTCGAAACATAT...AATGATAGTAGTAATTTTGTATTTTTGGATCCGCCATACGAC---------------TCTGTTTTCACGGATTATGGTTATTGTTCTTTTGGAAAAGAAGAACATGTTAGACTTTCTAACTTCTTCAAGACGACT---.........------------AAAAACAAGTGTTTGATGGTAATAGGA---...---------------GCAACTGATTTTATCAGAGAATTGTACGATGGTTATATACACACC---GAATACGAAAAGAAATATAGGTTCAAACTA
O41063_CHVP1/8-248 TGGGTGGGTGGAAAACAAAAATTCGTCAATAACATTATTACTCATTTTCCTAAA------------------AATATAGATACATATCACGAACCATTTCTTGGAGGGGGTAGTGTGCTACTAGCCGTTTTAAACTCGGAC...ATCCAAATCAAGAAAATAAGAGCAAATGATTTGAATGCATATCTCATACAAACTTACATAGATGTCAAGGATAAC------------...---...------ACAGAGGAACTCATTGAGGAACTGAAATCACTC---...------AAG------------------AATAGCGAAGAGGATTATTATGAAAATAGA------------......------------------AAAATATTCAATTCGCTAAAAAAAGAAGGTCATTTTTCTGTGAAGGCG------------------TCTGCATTGTTTATTTATCTGAACAAAACATGTTTCCGCGGATTGTATCGAGAAGGACCGAACGGG---TTCAATGTACCCTTTGGTCATTACAAGAATCCG---...------AATTGGATAAACGCGGATCTTCTGAGAGGTTGGTCCGATAAAATAAAAAAC------.........GTAGAGTTTTCTTGTCTTCCATATCAGGATTTTTTGAACGATGTA...---GGCGAACATGATTTTGTATATCTTGATCCTCCGTATGCTCCA---GAAAACAAGACTTCATTCACGAAGTACAATGTTTCGGACTTTCTCGATCACGAACAA------CTCTTTTCAATTGTCAAGTCGTTGCCA.........------------------CAGTTTGTGATGAGTAATTCA---...---------------AAGACTGAAAAAACATTGAATGCTTTTGCTAGT---------TTTGAAATACTAGAAATTACCACAAGGAGGGCAATA
MTM3_METJA/9-270 TGGGCTGGAGGAAAAACACAAATTTTAAGTCAAATAGAAGAAAATTTACCAAAAGAATTGAAG---GAAGGAAACATTAAAAAATATATAGAACCCTTTGTTGGTGGAGGGGCAGTTTTATTTTACCTTTTACAAAAATAC...---GAATTTAAAAAAGTTATTATCAGTGATATTAACGAGGATTTGATGCTATGCTATAAA---GTTGTTAAAAAT------------...---...---GATGTCGATAGATTAATTGAGGAGTTATCATCCTTAAGG...GATGAATTTTTATCATTGGATGAAGAAAAAAGGAAAGAATTTTATTATAAAGTTAGA------------......------------------GATGACTTTAAC---AAAAACAAGAATGATTGTGATGAAGTTAAAAGA------------------GTGGCACAGTTTATATTTTTAAATAAAACATGTTATAATGGGCTATATAGGGTTAATAAAAAAGGAGAATTTAATGTTCCTTATGGAAGGTATAAAAACCCA---...------AAGATTTTTGATGAACAAAATTTGAAAAATGTTTCAAAATTATTAAAGAAC------.........GTTAAAATCCTCTGTGGAGATTTTGAGATTGTTGATGAGTATGTT...GATGCTGAAAGC---TTTGTTTATTTCGATCCACCATATAAGCCGTTAAATAAAACATCTTCCTTCACATCCTATACAAAGTATGATTTTAACGATGATGATCAAATTAGATTGGCAAAATTTTATAGAAAATTGGAT.........------AAAAGAGGGGCTAAGTTGATGTTAAGCAACTCT---...------------TATAATGTTGATTTCTTTGGAAAGCTTTATGAGGGC---------TTTAATATAAAAAAGGTTGTTGCTAAGAGGATGATT
O58765_PYRHO/8-274 TGGGCCGGCGGAAAGAGGCAAATCCTCCATTATATAGTCTCTCTAATGCCTTCCGATTAT------------AAGGATAGGCGTTTCCATGAACCATTCTTTGGTGGTGGGGCCGTCACATTTTGGCTG------------...---GAGCCAAAAGAGGGAACGATCAACGACATTAATCCAAAGCTGATTAACTTCTACATC---ATCCTACGTGAT------------...---...---TACCCTGAAGAGTTAATTGAAGATGCAAAG---------...------ATGCATAAG------------AATGAAAGGGAGTACTACTATAGAATGCGAAGAGAATACAATaaacttGCCCTCAGTAGTTGGTTTAGGGACTTTGTAAGGAGGGGATTTAAGGTAGAGAGTGAGCAGGATAGGAGAAATGCAATTCGTCTTGCAAGCCTCCTGCTTTACCTGAATAAGACTGCATATAATGGGCTGTACAGGGAGAACAGGAAGGGCGAGTTTAACGTTCCCTTTGGGAGGTACAAAAATCCTAGG...---------ATCGTTGATGAGAAGAGATTAAGGGAAGCGAGCAGAGTTTTAAGAAAC------.........CTCGAAATTTATAATACTGACTTCTCATATGTCCTCGATAAGGCT...AAGGAGGGAGAT---CTAGTTTACTTTGATCCTCCATACCAGCCCATTTCCCAAACGGCTAGCTTTACAGATTACTCTAAGGAAGGATTCACATACAAGGATCAAATAAGGCTTAGAGATGTGTGCTTAGAACTC---.........---CATAGGAGAGGAGTATATTTCATCTTGAGCAATTCT---...---------------TCAGCTCCAGAGATAGTTAAGCTCTATAAAGATATCCCTGAATTCGACATAATAATTGTGAAAGCAAAGAGGGTTATT
Q51829_PORGI/22-269 TGGGTAGGAGGGAAAAGGCAACTTATCCCAGAGATCAAAAATTTATTACCAAAAGGCATT------------TTGAGCCATCCTTACTATGAGCCTTTCATAGGAGGGGGAGCTTTATTGTTTGAACTA------------...---CAGCCCAAAAACGCTACAATAAATGATTATAATGAAGAACTGATCAATGTCTATAAA---GTCATAAGAGAT------------...---...---AACCCGCACGAACTTATTGAAGACTTGAAA---------...------AAACATAAG------------AATACAGCCGAATATTTTTATGAAATCAGA------------......---------GCAATAGATAGAAATCCTCTT---------TTTATCAACCTTACCGATATAGAAAGA------------------GCATCACGGATTATATATCTAAACAAAACTTGCTATAATGGTTTATATAGGGTCAATAATGCAGGAGAGTTCAATTCTCCATTTGGGAAATATAAAAACCCAAAC...---------ATTGTAAATGAGCCTGTGATCAAAGCCGTTAGCAAGTACCTAAACACGGCAAAG.........ATTCAAATATTCAACGGAGACTATCAAACGATTTTAAAAGATATA...CCGAGAAGCTCT---TTCGTGTATTTAGATCCACCGTATCATCCCATTTCGCAGAGTGCTAATTTTACAGGATACGTACAAGGAGGTTGGGATGAAAAGGATCAAATCAGACTAAGGAATGTTTGCAATACATTG---.........---AACGAAAGAGGAATCAAATTCCTTTTGTCGAATTCT---...---------------TCGTCTGACTTTATAAAAGAAATATACTCTGAT---------TATAATATCTATGTTGTTCAAGCAACCCGAGCAGTA
MTD21_STRPN/17-264 TGGACAGGTGGTAAAAGACAATTATTGCCTGTTATTAGAGAATTAATACCTAAA---ACC------------TATAACAGG---TATTTCGAACCTTTTGTTGGAGGTGGAGCTTTATTTTTTGATTTG------------...---GCTCCTAAAGATGCAGTTATTAATGATTTTAACGCTGAACTAATAAATTGCTATCAA---CAAATTAAGGAC------------...---...---AATCCTCAAGAATTGATTGAAATTTTGAAA---------...------GTTCATCAGGAATAT------AATTCAAAAGAATATTATTTAGATTTACGT------------......---------TCTGCAGATCGTGATGAAAGA---------ATAGATATGATGTCCGAAGTACAAAGA------------------GCTGCACGTATTCTATATATGTTGAGAGTGAACTTTAATGGTCTATATCGTGTGAATTCTAAGAATCAATTTAATGTTCCATATGGACGTTATAAGAATCCTAAA...---------ATTGTTGATGAGGAATTGATATCTGCTATTTCAGTTTATATAAATAACAATCAA.........CTAGAAATTAAAGTGGGAGATTTTGAAAAGGCAATTGTAGATGTT...CGAACAGGAGAT---TTTGTGTATTTTGACCCTCCATATATTCCATTGTCTGAGACGAGTGCATTTACGTCTTATACTCATGAGGGATTCTCTTTTGCAGATCAAGTAAGATTAAGAGATGCCTTTAAGAGATTG---.........---AGTGATACAGGAGCTTATGTTATGTTATCAAATTCT---...---------------TCTAGTGCTTTAGTAGAGGAGTTGTATAAGGAT---------TTTAATATACATTATGTTGAAGCTACCCGAACTAAT
MTL21_LACLC/17-264 TGGACAGGTGGGAAAAGGCAACTACTGCCACACATTCAATACCTAATGCCAGAA------------------AAATACAATCATTTTTTCGAACCTTTTATTGGTGGTGGCGCTTTGTTTTTTGAACTC------------...---GCTCCTCAAAAAGCAGTTATTAACGACTTCAATTCTGAGCTTATAAACTGTTACCGG---CAGATGAAAGAT------------...---...---AATCCTGAGCAATTGATAGAATTGTTGACTAATCAT---...------CAGCGGGAA------------AATTCTAAAGAATATTATTTAGACTTACGT------------......------------------TCTTCTGATAGAGATGGAAGAATTGATAAGATGAGCGAAGTTGAACGT------------------GCTGCTAGAATTATGTATATGCTACGTGTTGATTTTAATGGTTTATATCGTGTTAATTCGAAAAACCAGTTTAATGTGCCTTATGGAAGATATAAAAATCCT---...------AAGATAGTTGATAAAGAATTGATTGAAAGTATTTCCGAGTACTTGAATAACAATTCT.........ATTAAGATCATGAGTGGAGATTTTGAAAAAGCCGTTAAAGAAGCA...CAGGATGGAGAT---TTTGTTTATTTCGACCCTCCATACATTCCACTTTCTGAAACTAGCGCCTTTACTTCTTATACACACGAAGGCTTTAGCTACGAAGATCAAGTTAGGCTAAGAGATTGTTTCAAACAGTTAGAT.........------TCAAAAGGGGTATTCGTCATGCTTTCAAATTCT---...---------------TCAAGCCCTTTAGCGGAGGAATTATATAAAGAT---------TTTAACATCCATAAAATTGAAGCTACTCGAACAAAT
MT1A_MORBO/7-275 TGGGCGGGCGGTAAGAATTCTTTGCTTGATGAAATTCAAAAACGCTTGCCTGATTTTGTTCACTCA------CAAGATTTTTGTTTGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGGTGGGGCGGTGTCCTTATGGGCATTGTCCGATTTG...CCACATCTAAAACAGCTTGTCATCAATGATTGCAATGCCGATTTAATCAATGTTTATCAA---GTTATTAAAAAC------------...---...---AACCCCGATGATTTGATAGGATATATTGAAAATTTGCAAagtCATTATGATAAATTAACTGATTTAGAAAGTAAAAAACCTTATTTTTATCACAAACGA------------......------------------GATGTTTTTAAT---------CAAAGAACCAGTAATGATATTGAGCAG------------------GCAGGGTTATTTATCTTTTTAAACAAATCTGCTTTTAATGGCTTATATCGTGTTAATAAAAATAATCAATTCAACGTTCCCATTGGTAATTATAAAAAACCA---...------ACTTTTGTAGATAAAGAAAATATTTTAAATATTTCAAAAAAACTACAAAAC------.........ACCAAAATACTATCAGGTGATTTTGAATTGGTTTTGGCTCATTTGccaAATAATTTTCCCTGCCTATTTTACCTTGATCCGCCTTATCGTCCGATTAGTGATACCGCAAGTTTTACTTCTTATTCTGATAATGGCTTTGATGATAATGAACAAAAACGCTTGGCAAATTTTTGTAAAAAAATAGAT.........------AAGTTGGGTCATTATTTTTTATTAAGCAATTCCGATccaAAAAATACCAATTCATCTGATGAATTTTTTGATGAATTATATCAAGAT---------TTTAAAATTGAGAGAATACAAGCTAACCGCACCATT
DMA7_ECOLI/7-244 TGGGCGGGAAATAAAACCGCCATTATGTCCGAACTGAAAAAACACCTTCCT---------------------GCTGGCCCGCGACTGGTTGAACCTTTCGCGGGTTCCTGTGCTGTGATGATGGCGACG------------...---GATTACCCCAGCTATCTGGTTGCGGATATTAATCCTGATTTAATCAACCTCTATAAAAAGATTGCCGCTGAT------------...---...------TGCGAGGCGTTTATATCTCGCGCCAGAGTTTTA---...------TTTGAGATCGCAAAC---------AGGGAGGTGGCTTATTACAACATAAGG------------......------------------CAGGAGTTTAAT------TACTCAACTGAAATTACTGATTTCATGAAA------------------GCGGTATATTTCCTGTATCTCAATCGTCATGGTTACCGTGGGTTATGTCGCTATAACAAGAGCGGGCATTTCAACATTCCCTACGGGAATTATAAAAATCCG---...---------TATTTCCCTGAAAAAGAAATTCGCAAATTTGCAGAAAAAGCCCAGCGA------.........GCAACGTTTATCTGCGCCAGCTTTGATGAAACGCTGGCGATGCTG...CAGGTGGGGGAT---GTGGTGTATTGCGATCCGCCTTATGACGGT---------------ACGTTTTCCGGCTATCACACTGACGGCTTCACTGAAGATGACCAGTATCACCTGGCATCTGTTCTTGAATATCGA---.........---TCATCAGAAGGTCATCCAGTCATTGTTTCTAACAGT---...---------------GACACATCCCTGATCCGTTCGCTGTATCGCAAT---------TTCACTCACCACTACATCAAGGCAAAACGCAGCATC
DMA_SERMA/10-252 TGGGCTGGTGGAAAATACCCGCTGGTAGATGAGATTCGTCGCCATCTGCCG---------------------GCGGGAGACTGCTTAATCGAGCCCTTCGTGGGTGCGGGATCCGTCTTTCTGAATACG------------...---GATTACGACGCCTACATTCTCGCCGACATCAATAGCGATCTTATCAACCTGTATAAC---ATCGTTAAGCTG------------...---...---CGCACGGATGACTTCGTGCGCGATGCCCGC---ACG---...------CTTTTCGCCGATGAATTC---AATAACTCGGATCAGTTTTACCTGCTGCGA------------......------------------GAAGAGTTCAAT------------ACTAGCACCGAGCCTTACCGCCGG------------------GCGCTGCTGTTCCTGTACCTGAACCGTCACTGCTATAACGGCCTGTGCCGCTATAACCTGCGCGGCGAGTTCAATGTGCCGTTTGGCCGGTACAAGAAACCG---...---------TACTTCCCGGAAGAAGAGCTCTACTGGTTTGCTGAAAAATCGCGCAAT------.........GCCACTTTTGTCTGTGAGCATTACCGCGATACCATGGCGAAGGCT...GCAGCCGGCGCC---GTGGTGTATTGCGATCCGCCTTATGCGCCGCTGTCGGCGACGGCGAATTTCACCGCTTACCACACCAACAGCTTCAGCATCGCCGATCAGCAGAGCCTGGCGCATCTGGCGCATCAGCTCTCG.........---GTAGAGAGCCGGGTGCCGGTATTGATTTCCAATCAC---...---------------GATACCGAGCTGACGCGCGACTGGTACCAGCAT---------GCTGCGCTGTATGTGGTGAAAGCGCGCCGCACGATC
DMA_ECOLI/10-251 TGGGCAGGGGGCAAGTATCCCCTGCTTGATGATATTAAACGGCATTTGCCC---------------------AAGGGCGAATGTCTGGTTGAGCCTTTTGTAGGTGCCGGGTCGGTGTTTCTCAACACC------------...---GACTTTTCTCGTTACATCCTTGCCGATATCAATAGCGACCTGATCAGTCTCTATAAC---ATTGTGAAGATG------------...---...---CGTACTGATGAGTACGTACAGGCCGCACGC---GAG---...------CTGTTTGTTCCCGAAACA---AATTGCGCCGAGGTTTACTATCAGTTCCGC------------......------------------GAAGAGTTCAAC------------AAAAGCCAGGATCCGTTCCGTCGG------------------GCGGTACTGTTTTTATATTTGAACCGCTACGGTTACAACGGCCTGTGTCGTTACAATCTGCGCGGTGAGTTTAACGTGCCGTTCGGCCGCTACAAAAAACCC---...---------TATTTCCCGGAAGCAGAGTTGTATCACTTCGCTGAAAAAGCGCAGAAT------.........GCCTTTTTCTATTGTGAGTCTTACGCCGATAGCATGGCGCGCGCA...GATGATGCATCC---GTCGTCTATTGCGATCCGCCTTATGCACCGCTGTCTGCGACCGCCAACTTTACGGCGTATCACACAAACAGTTTTACGCTTGAACAACAAGCGCATCTGGCGGAGATCGCCGAAGGTCTG---.........---GTTGAGCGCCATATTCCAGTGCTGATCTCCAATCAC---...---------------GATACGATGTTAACGCGTGAGTGGTATCAGCGC---------GCAAAATTGCATGTCGTCAAAGTTCGACGCAGTATA
P71101_9MICO/33-261 TACCCGGGGTCGAAGTGGTCCCTCGCTCGGCAGATTGTCGCGGAATTCGAT---------------------GACCACTACCACTACGTGGAACCGTTCTTCGGTTCGGGGGCGGTGTTCTTCAGCAAGCCG---------...---CCGGTGCCGCACGAGATCCTCAACGACACCAACGGTCAGGTCGTGAACCTGTTCCGG---GTGCTTCGCGATCGG---------...---...------ACCGAGGATCTGGTGTGGCAGCTTGAGGCGACG---...------CCTTGGTCT------------------CGGGACGAGTATGACCGGTCGCAC------------......------------------GTCCTGACCGGG------------GATGATGTCGAGGACGCCAGACGG---------------TTCGTGGTTCGGTGCTGGCAGGCGCACGCGAGCGACCTGGCGAAGAAGACTGGGTGGAAGACCCGCGGCGCGCAGCAGCGTGCCGGCGGGATGTCGCTGCGGTGG---...---------CAGAAGGTGCCGGCGCAGCTGCGGGAGCTTGCCTGGCGGCTGTTGGAT------.........GCGGAAATCGAGAACCGTGACGCGGTGCAAGTGATCCGCCGGCAC...AACGCCGAGAACGCTCTGATCTACGCAGACCCGCCGTATCTACAC------AGCGTCCGCACGCAGCGCATGTACGGCGAGGAGATGACCGACACCGAGCACATCGCCCTGCTGGACGCGCTACTGGCCCACAAGGGG.........------------------CCGGTGGTGGTCAGCGGGTAC---...---------------------------GCCAACGACCTATACGACACT---------------GCGCTCGAGGGGTGGCGCAAGGTGACAATG
P95820_STRPH/21-271 TATCAGGGCAGCAAGCGAGCGCTTGCCAGCCAGATTCTTTCTCTCTTCCCGCATGGC---------------GGAGTGCCTCGTCTCGTGGAGCCGTTCGCCGGCTCGGCGGCCATCTCTGTCGCGGCGCGCCACTACGGA...---ATCGCGGAGACGGCTCTCATTTCGGACGTCAACGAGCCGCTCATGGGGCTGTGGAAGCTCATCATCGAGGAC------------...---...------CCGCGGCATCTGATCGCCGAGTACACCCGC------...------TTGTGGAACGAACAGCTGGATGACCCTCGCGCGTACTTCCTGGAAGCTCGC------------......------------------GACAAGTTCAAC---------------GCCACGAAG---CAGCCGGAA---------------------ATCCTGCTCTACCTTCTGTGCCGTTGCGTAAAGGCCGCCGTCCGCTACAGCCAGAAGACCGGCGATTTCAACCAGGGCGCCGACCACCGCCGCCTCGGA---...---GCGAATCCGGCGAACATGGCGGAGCGCATCGGCCGGGCTTCCGCCATCATGCAGGGC---.........GTGACCGTGTCCACCTCGACGTACGAGGACGCGCTGGTCAATGCC...---GCACCCGATGAACTCGTCTACATGGATCCGCCGTACCAGGGGACGAGCGGCGTGCCCGACCACCGCTATCTCAAGGGTCTGCAGCGCGAGCCCTTCGCGGAAGTGCTCCAGCAGGCGGTGGACAACAAAGTGTCT.........---------TTCGTCGTCTCGTACGACGCGGTGACCGAC---...---------------GACAACAAGTACGGGTACGCCCTGCCGGAGGAGCTGGGGCTGACCCACCGCCACGTGGTCGCGGGCGTCTCGGCGCAG