EMBL-EBI > Goldman Group

PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam



PANDIT Homepage
pan•dit
PANDIT
Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF01943 alignment
(31 sequences with 324 aa)


O58127_PYRHO/9-279 LIKNAAWLFGAEIISKLLAYGVIVILSRTLGPEGLGQYSFIFYYVGLLGIFSDFGISYYFMREVARDKS---.--.---KAEELLPDVLGLKIVLALINFGVIAVLTL-........-.FLPKPRWMKVLILLVGAEA-.MFMWISYMFVNLMYAH.EVTKYEAIARTIERVWAFFVGGTILYLYRS--...LSPFIIALLVGYMIRESLRIKWGSKFV--K-..........KVRIYFR.LKNWVFLLRKSYPFWLIGLFTLIYYRTDMV.MLSLMKGDYE-.....--TGIYRAAYTLIEVSLFVPNIVVS-TTMPSIARLW
O58158_PYRHO/7-277 IAKNMAVLFLARIVSMLFGFFYVMYTARHLGPANYGILSFALALNGIFGVIANFGLDPLTVREVARDKT---.--.---LARKYLANGLVLKLLFGTLTFLIVFVVVN-........-.LLGYPEITRKVVYIITLST-.IIAGLNNLFNDIYQAF.ERMEFISIGQILQSVCSLIFAIIAIKLGLN--...VVYFAVIYLIVNSIVLGYHVVITTWKF--L-..........KPKIEVD.FNFWKSVVREAWPFAVTSIFVSIYYQIDIV.MLSYMKGDKI-.....--VGWYNAAYRLVLILLIIPQIYFA-TVYPVMSKFY
O26479_METTH/10-276 LARNTAFLLVATLFTNLAAFVWNVYLARYLGTAGFGILSTALALTGIFSILADLGIGTYITREIARNPGGA-.--.-RELVAAGLGNRIILSCIVFVLILLFPLT-G--........-.LYSGTAAAVIVFIAGYMLL-.--TSFSSFFNSIFQGF.QRMEYQTVWNILNSLFILVGVIAVVWLGGS--...VVHVAVAYLIAAALSLVYSATTFT-------..........RRFFTPG.LSFSRDMIREAIPFGITSVFSLIYFWIDSV.MLSLMKGDVS-.....--VGLYNAPYRLLTVITSLYGVYLT-AVFPVMSRFH
O26442_METTH/7-278 IVKNIGVTGSAQILTALMSFVFMIYLARFLGEAGFGKYNFAFSLTTLLVTFTDLGVNQLLVREIARERD---.--.---LSSYYVNNAVFLKIPLSILTFVLIAVLAW-........-.TFNLSSDASILLYLFGIYN-.ILLTVSGTYLSLFQAW.ERMEYVALFQIIERLFIVTLGLGVLIMGYG--...LMVVAWVYVFAGILDIAVAASLSFRRF--I-..........RPSRSID.TGLQKKLLLMGLPFGLNSLFAVFFFKIDTV.LLGLLRDDVA-.....--VGIYNAAYNPLLALSMIVAGMVSAAVYPVMSRYF
O07870_STRPN/6-276 IKLNALLNIVLTLSNIIFPLITFPYISRILNPNGIGLTSFFSSIGNYGILLASLGISTYGIKAVASVRDD--.--.-RDKLSKVVQELMIINVAMSIITTAILLF-M--........-.TIFITQLNREFSLLLITCG-.TILSSPFALNWLYSGM.EEYTYITTRSVVFKILSLILIFLLVKRPED--...YIVFASISLFSSLSSNILNLWHSRHFI--N-..........IKLYKN-.-LQFKYHFKPMWYLFASLLAVNIYTNLDTV.MLGFINGNEA-.....--VGYYSVASKVKWILLSLITSISAVLLLRLSFYIS
O07342_STRPN/5-273 ISKNLAYNIGYQLIGIAFPLITSPYLSRILGAENLGIHSFTISVALYFMMFMLLGIANYGNRTIATVKREG-.--.-KEILSKTFWNIYYVQLLMSVLVTIAYLIYL--........-.YFWVSSYKFIAILQLFLLL-.---SNAVDITWLFYGL.EDFKQIVFRNALVKLLGLFLIFSFVHESSD--...LWKYTLINGGVTLVGQLLLWGQLK--G--R-..........LSWVKIQ.KKDLLSHIKPILVLFIPVLAISIFSNMDKY.MLGLMVGVKQ-.....--VGFYDNANRIIDIPKALIAALEA-VMLPRTSYLL
O86895_STRPN/3-267 ILKNYAYNLSYQLLVIILPIITTPYVTRVFSSDDLGTYGYFSSIVTYFTLLATLGVANYGTKEISAHRKE--.--.-IGKNFWGIYSLQFGATWLSILLYLALCFLF--........-.TSMQNPVAYILGLSLVSKG-.------LDISWLFQGL.EDFRKITVRNITVKLVGAISIFLFVKSAND--...LYLYVFLLTIFELLGQLSMWLPAR--Q--F-..........IGKSYFD.WKYAKKHLKPVILLFLPQIAISLYVTLDRT.MLGVLASTKD-.....--VGIYDQALKLVNILLTLVTSLGS-VMLPRVSSLL
O06039_LACLC/3-269 LIKNYLMTSSYQLLIIILPIITTPYISRVLSPEGIGLYSYTYTITQYFVLFATLGTVTYGSREIAYYQSN--.--.-KQKRSEIFWGITFLSWATGAISLLIFYI-F--........-.IFFNGKYSVLFFWQSFLIF-.---GVIFDINWYFTGM.EKFKVIISRNFCIKIISLLCIFVFVKSEKD--...LSLYIVILGLSNIIGNILVWPYLR--K--E-..........VYKPNFS.KLSFKKHLGSTWIFFLPQTSVTLNSLINQN.MIAYFDSITS-.....--LGYFTQTNKFTVIAISIVISIGT-VMLPRMSNLV
O26447_METTH/15-286 VLDNIISLTGIQLVQYLLPLITFPYLTRVLGPANFGKVAFAVAFITYFQILTDYGFNFSATREISIHRDD--.--.-TERVSLIYSSVMVTKTILLAVTFMAMLV-T--........-.VFLIDRFRSDYLLYIFTYG-.LVVGNLLFPVWFFQGV.ERMRYISILRIVSSLIYTALIFLAVRGPGD--...YLYVPLINSAGFMAVGLYSQRIVMREF--G-..........VKFMIPS.PADIREQLLEGWHLFISTLAISLYTTSNRF.ILGLLVSSAT-.....--LGYYAVAEDITRALQGIVSPISQ-AIYPYFSRIQ
O26467_METTH/18-289 LAENFLSLSTLQVLVYIIPFITLPYLTRVLGVYNYGLVNFAIAFNTYFIIITDYGFNLSAVREISVNRED--.--.-PHRVSEIFSSVMLIKGILATLSFCILLL-V--........-.ILNIPRFSVNWQVYTFAFG-.LVIGNVIFPTWFYQGM.ERMKYITVLNVLTNLIFLAAIFIFIRRPSD--...YLYVPLLQSMGTLTAGVISQWIIRTRF--N-..........VRFHLPP.LRTVYETFRDSTQFFLSRVSVSIYTGSNSF.FLGLFAGNTA-.....--VGTTRSAEELYTAAQGLYSPLIA-VTYPYMAKTH
Q56913_YEREN/4-274 LRRNIFSLLLLQGSNYIIPLLTLPYLTRVLGVEGFGVYSLTLSLAQYFVILIDFGFNLSASKKIAEHQDD--.--.-PEYISKIFFETLISKSILCLVSIVIVVL----........-.LLATNSHAVIQRELIYTVL-.MLIGTTLMPVWFFQGI.EKLSIVTNLMIVAKLSMLPLFFIFVDNDAD--...VKYRRNDSIINQPSGWIIAIIYIYRKK--L-..........VRVVDFS.NLRVSYTLKDSFPIFCATLSISLYTMSTTI.IIGIFSNVYE-.....--VSIFTAADRVKGAILGVFLVLGN-AFYPRINSLL
RFBX_SHIDY/1-270 MKKNILLLFLVHGANYLFPFIVLPYQTRILSIETFADVAKIQAAVMLLSLIVNYGYNLSSTRAIARAVS---.--.-QAEINKIYSETLIVKLLLATICLALGCV-H--........-.LMYVKEYSLIYPFIISSIY-.-LYGSALFATWLFQGL.EKMKAVVIATTIAKLTGVILTFILVKSPND--...IVAALFTQNIGMFISGIISIYLVRKNK--Y-..........ATVICFR.LKNIIVSLKEAWPFFLSLAATSVYTYFNVI.LLSFYAGDYV-.....--VANFNAADKLRMAAQGLLIPIGQ-AVFPRLSKLE
RFBX_ECOLI/8-279 LRRNVIYLAVVQGSNYLLPLLTFPYLVRTLGPENFGIFGFCQATMLYMIMFVEYGFNLTATQSIAKAADS--.--.-KDKVTSIFWAVIFSKIVLIVITLIFLTS-M--........-.TLLVPEYNKHAVIIWSFVP-.ALVGNLIYPIWLFQGK.EKMKWLTLSSILSRLAIIPLTFIFVNTKSD--...IAIAGFIQSSANLVAGIIALAIVVHEG--W-..........IGKVTLS.LHNVRRSLADGFHVFISTSAISLYSTGIVI.ILGFISGPTS-.....--VGNFNAANTIRNALQGLLNPITQ-AIYPRISSTL
Y1068_METJA/7-302 AVKGVSWHLLSYFLAAPIAYLVRVLYANEIPKLDVGLFYAVLDFFSMLVVFRAFGLDQALIRYIPKYLAENRlDMlKSSIVFVGILQTILAFIVAFLVVIFAPYIAEFYin....nqGqFTGRLDLVINILIIMAMGYY.FLDSIVAFFSNILTGF.QLQNYASSTRVVRILSVFIFSLIFIYLFNVHN..aYVPSVSYLLMAVVMIIIYGYIVVKKIFPKFA..........KEKVIFS.RKLIRNLFSYGMYVMIGYAGSLILGYLDGI.CLTYFTGLNA-.....--VADYRNVAMPTVNILSYFAFSVGAVLFPMSSELW
RFBE_SHIFL/3-283 IIKNSVWNLFGYAIPTLIAIPSLGFLARGLGPEGFGVYTIAIALVGYAGIF-DVGLTRSVIREIAIHRDN--.--.-HHERTKVISTSTSFLVLFSCFGAFLLLIFSDGiv....nyLkISGVEHSDIQLAFKLLAICI.PLFILNQLWSAILEGD.EKFGIVNIQKSISSSCIAGIPAIFVFYSAT--...LSAAVAGLIFARVISILVSAYYVRNDI--K-..........ISGVHFC.YKTFKRLFFFGGWMTVSNIISPVMVYFDRF.IVSNIMGADK-.....--VAFYSAPAEVILKLGIIPAAIGR-AVFPRLSNIK
Y1375_METJA/3-283 LCKDSIYILMSNLYSKGMAYLFYFITAFLLGTEAFGILKGLMPIADTLTIFFSSGIPPAIAKFLAEEKE---.--.--VDINKYIPILYLMILLSVVGFILTPYIKY--........-.ILGGHYLNLPNILYFAVGLCvVASTVIAFSRGILQGL.LKMKYLSLTWIVEYTAKVILVFILTLYLG---...IFGSLLSISLAYLVGGIFGLYLIYKALK-GK..........FDFKKLIdIKNTTKNIFSNFNLDILRYSIPIALTSSSYrLFGDIDNIVIM....sIMGGFWSGIYGYSSLISRGIFMFASAVSIPLLPRIS
O85002_STRPN/7-276 LAKNTGIFALANFSSKILIFLLVPIYTRVLTTTEYGFYDLVYTTIQLFVPILTLNISEAVMRFLMKDGVS--.--.----KKSVFSIAVLDIFIGSIAFALLLLVNN--........-.LFSLSDLISQYSIYIFVIF-.VFYTLNNFLIQFSKGI.DKIGVTAISGVISTAVMLAMNVILLVLFDWG-...LLGFFIANVCGYVIPCIYIVSKLR-----LW..........ELFEIKIdKKLQWEMVYYALPLVLNILSWWVNNTSNRY.IVTAIVGIQA-.....--SAIISVAYKIPQILSTISAIFIQ-SWQISAIKIQ
O87185_STRAG/6-275 LLQSGFIYTLGNLLVQGLAFITLPIYTRVISTEVYGQYSLYVAWMNIIMLFIGLQTSGSLS-SARVKYG---.--.--EEFKSYSGSAFSVGNIWFLIILLIAFLFR--........-.SFLAPLVGFSESIFLLMVCQsYASYVVTFFGQYFIQQ.QRSLANLILSLANAVSSVALSLFLIFHWSDD-...FLSRVFGAFVPTIITGIVAFAYIYYHS----..........KSFYNP-.-KYFRFIVTVSVPLIFHLLGHQLLGQLDRI.MLARLYNTKE-.....--VAMYSFGYSLGMIIQIVLNSINM-AWIPWFFDAR
CAPF_STAAU/1-264 MVKNFNYMFVANILSALCKFLILLVIVRLGTPEDVGRYNYALVITAPIFLFISLKIRSVIVTNDKYSPN---.--.------EYIS-AILSLNIITLIFVAIFVY----........-.VLGNGDLTTILIVSLIKLF-.--ENIKEVPYGIYQKN.ESLKLLGISMGIYNILSLILFYIIYSFSHN--...LNMALLFLVISCIFSFAIIDRWYLSKY--YN..........IKLHYNNnIAKFKEIFILTIPLAFSSALGSLNTGIPRI.VLENLFGKYT-.....--LGIFSTIAYVLVIGGLFANSISQ-VFLPKLRKLY
O29660_ARCFU/6-285 VLKNVIYNSSSVLIGNLAGLVISIYVARVLKPELFGIYSLAISVAFLLMTFTDLGINATLVRYVAHANIKGDdELvRGYIRSLTKLKALLVLAVASMLFLGSDFIAEQ-........-.FFSKPELSLPLRIMALYIT-.-FFSMAGFINGIFNAF.NDFKANFVRALVYEISRATLIFLLLYLGLS--...VAGALLGYVGASLLSLIALLAMLFRKL--RN..........FLFGKAK.RVDWRRIVRFTGYLTVGSITWTVFAYVDSV.MIGAMLPSED-.....--VGFYRAAYNIVGAVSGIVALPGV--LFPVFVQLE
EXOT_RHIME/10-277 VTRNVGWSVLSKTGTFGLKFVTVPILARILSPEEFGAVAVALTVVQFLAMIGGAGLTSALVIQQHEEMET--.--.---VHSVFWANLAIALMMALGLFVFAEPLAT--........-.LLGAPEAAYLLRIMSLLIP-.LQLGGDVAYSLLVRRM.NFRKDAVWSMISESLGAVIAVLLALLGFG---...IWSLLAQLFVSALVRLSGLYAVSR--Y--A-..........PRFVFS-.LQRVLALSRFSFGMMGSEIANFITFQSPMV.VISRYLGLSD-.....--AGAYSAANRFASIPNQVVLSAVMGVLFPTFGQMM
P74815_9SPHN/37-317 LRGQMVVGFGVKGFGAVTSFAFTWLVARAFGPAGVGAFGTALTTAQMLVILSLIGLDTILVRTVAVCVSQNRtGVaRTAVRHATRVAVGGGLVLMVMILLFHQQIATN-........-.LLGSPAMAPDLLIMGFLIP-.-VSAYCRLASTTLRGMgDIGKSQMVDGPLGTFLGGAMLAGALLIGVAHN...PLLPSVLYLVGWLVTMFAATIIVRR------..........MTRDWAPaEPLDRPMLRPGFMVLITNVNNFFVDWFATV.ILAATHGPAE-.....--AGLFRVGYQIASSLKLLSATSET-ILHPVFAASY
Q56865_YEREN/18-287 ALRNSGWLIFDKIASLTIGLWVGILLAKYLGPANYGQIVYAVTYVTFFQTISILGLDSIVVRDLSNGVE---.--.---KCSAIISTIFTARFLMSMVCLIIAISLA--........-.YNSRPDKRLILSIISLNIL-.--FSVGSVFDYLVQSQ.SKSRLTICAKLISYIFCAHVKIFMIYLHVE--...LINFSIIIVIEVLLYSSILYFLMNKNY--SE..........IKVSLSInSVYLKSALKESWPLMLSAFSVVIFMKSNIL.FIQHMLGDNY-.....--VGIYSVGANLAELTYFFPAIIVT-SFLPILAKLK
O52526_RHILT/10-273 QGSMWLSLSRAIVNG--LSALSTFVLAWYLAPSDFGLVAIATTIQVILSSVTELSLNQALIRHEDPSEV---.--.--HFSAVWTLSVTRSAILALLFAASSFPIAE--........-.FYNEPRLTSVMLALSFSLL-.LSGLAHPRRVMLQRDL.IFWQEFVLNVSQKLVGFVVTVAIAAIYQS---...YWALVLGTLAYQITNIIVSYTVLP--F--W-..........PRITFR-.--HARELFSFSLWLTAGQIVNTLNWRIEYL.LIGKMLGATQ-.....--LGHYTVGNTLSTLPTREATAPLNQTIYPGFSRVR
Q56776_XANCA/21-288 RAAGAAVTMIGQSAKMIVQFGGIVLLARLLTPYDYGLMAMVTAIVGAAEILRDFGLSAAAVQAKHVSRE---.--.--QRDNLFWINSGIGLMLSVVVFASAHWIAD--........-.FYHEPALVTISQALAVTFL-.LNGMTTQYRAHLSRGL.RFGQVALSDVGSQVLGLG-AAVAAALAGWG--...YWALIVQQVVQAIVNLIIAGACAR--W--L-..........PRGYAR-.QAPMRDFMSFGWNLMAAQLLGYASRNVGQV.IIGWRTGPDA-.....--LGLYNRAFQLLMMPLNQINAPATSVALPVLSQLQ
TUAB_BACSU/10-277 SGAKWTSISTMCITI--IQIVQFALLGNMMTLTEFGLVGMITTVTVFAQIVLDMGFGAALIQRDDATER---.--.--QLSTLYWLNIMTGVLLFVLLYVSSPVIAG--........-.FYQREELVFLVRILAIMFL-.IAPIGQQYQYMLQKQL.HFNTLSKIEIFSNVLSFG-YLAIAVFMMDA--...ILAYVISQVLLQSSKGILYWAVYRKKW--H-..........PAFVFD-.LRGMKDFFSFGAFQLSSRLVNRLGANIDMI.LIGRFIGAEA-.....--LGIYNLAYQIVTIPVLKINPIVTRVAFPIFAKNK
YC11_KLEPN/9-277 KSTKWSALSSLTIIV--LGFLQMVILSRILEPFEFGVLSIMTVVFLFTDMLADCGLSNAIIQKKNITLD---.--.--ELSALYWVNIFLGVFLFVVTIILSYEISS--........-.WMRLDRLSFLIQLTALVFI-.IMPHGQQYRALMQKEL.EFDILSKIESFSYLTGFCLTVIIGIITKNA--...SCAVFGYLLTVSMRT-VILSFVGRKYY--H-..........PTWKRSK.LREIKKQLLFSFYLTLDSILNYINSSITTP.IVARVLGAIY-.....--VGGYNLSFNVAVNPPSKISPIITRVLFPALSKIQ
WZXC_ECOLI/9-276 SGAKWSAIATVIIIG--LGLVQMTVLARIIDNHQFGLLTVSLVIIALADTLSDFGIANSIIQRKEISHL---.--.--ELTTLYWLNVGLGIVVCVAVFLLSDLIGD--........-.VLNNPDLAPLIKTLSLAFV-.VIPHGQQFRALMQKEL.EFNKIGMIETSAVLAGFTCTVVSAHFWPLA--...MTAILGYLVNSAVRT-LLFGYFGRKIY--R-..........PGLHFS-.LASVAPNLRFGAWLTADSIINYLNTNLSTL.VLARILGAGV-.....--AGGYNLAYNVAVVPPMKLNPIITRVLFPAFAKIQ
O34674_BACSU/5-320 LLRGTFVLTLGTYISRILGMVYLIPFSIMVGATGGALFQYGYNQYTLFLNIATMGFPAAVSKFVSKYNSKGD.--.-YETSRKMLKAGMSVMLVTGMIAFFILYLSAPMfaeislggKdNNGLTIDHVVYVIRMVSLAL.LVVPIMSLVRGFFQGH.QMMGPTAVSQVVEQIVRIIFLLSATFLILKVFnggLVIAVGYATFAALIGAFGGLVVLYIYWNKRKgsllammpntGPTANLSyKKMFFELFSYAAPYVFVGLAIPLYNYIDTNtFNKAMIEAGHQai.sqDMLAILTLYVQKLVMIPVSLATAFGLTLIPTITESF
SP5B_BACSU/6-308 FLKGTLILIAAGMVTRMLGFVNRVVIARFIGEEGVGLYMMAAPTFFLATTLTQFGLPVAISKLVAEASARG-.--.DHQKTKNILVMSLTITGVLSLIFTPLFLFFAPV........MaETMLTDKRTLYPLLAITPVV.PIIAISSVLRGYFQGK.QNMNPLAMSQVLEQVVRISLVAVCTTIFLPYG...IEYAAAGAMLSSVAGELASLLYLFVCFKYKKtik...irkhFLQSIKNgKQTFTQLMSVSLPTTGSRFIGNLSWFFEPIvVAQSLAIAGVAtvaatKQYGELTGFAMTLLTLPSFITYSLSTALVPAISEGM
YABM_BACSU/12-309 IWQGAFVLILAGVITKILSAVYRVPFQNIVGDVGFYIYQQVYPFLGIAVMLSTSGFPVIISKLMNDYSEK--.--.--NHHTILKISALFLSLIGILLFLCLYLGAVPI........AlFMGDSHLAVLIQVAAYAFL-.LFPFVALLRGGFQGRH.EMLPSALSQMTEQFLRVAVLLGLSFWLVKKGA..sLYTAGAAAASGSLAGSLVALIILGFFWFKTKrdn...qtdrQNENVITtKELTKKLLLYSVTICVSSLLLLFIQLVDALnLYALLSGGEASee.akCLKGIYDRGQPLLQLGSVFAVSIAT-SLVPYISMAV