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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF01943 alignment
(31 sequences with 972 bp)


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O58158_PYRHO/7-277 ATTGCAAAGAATATGGCTGTGCTATTTCTTGCCAGAATCGTTAGTATGCTATTCGGATTTTTCTATGTGATGTATACTGCAAGACATTTGGGTCCGGCGAATTATGGTATCCTATCATTTGCCTTAGCTTTAAATGGCATATTTGGGGTTATCGCCAACTTTGGCCTTGATCCTTTGACCGTCAGAGAGGTTGCGAGAGATAAGACC---------...------...---------CTGGCAAGGAAATATCTTGCAAATGGACTTGTACTGAAGCTGTTATTCGGAACACTAACATTTTTGATTGTTTTTGTAGTTGTGAAT---........................---...CTCTTAGGCTATCCCGAAATCACGAGAAAAGTTGTATACATAATAACCCTGTCTACT---...ATCATTGCAGGACTAAATAATCTGTTCAATGACATCTATCAAGCGTTT...GAGAGAATGGAGTTTATATCCATCGGGCAGATTCTGCAGAGTGTGTGTTCTTTGATTTTTGCGATAATTGCGATAAAGCTCGGCTTGAAC------.........GTGGTGTATTTTGCGGTGATTTATCTTATTGTGAATTCGATTGTTTTGGGGTATCATGTCGTTATAACAACCTGGAAGTTT------TTA---..............................AAGCCAAAGATTGAGGTTGAT...TTCAACTTTTGGAAAAGCGTTGTAAGGGAAGCGTGGCCGTTTGCTGTGACATCTATTTTTGTATCAATTTATTATCAAATTGACATTGTG...ATGCTCTCTTATATGAAAGGAGACAAAATT---...............------GTTGGATGGTATAATGCAGCATATAGACTAGTATTGATATTATTAATTATCCCACAAATTTATTTTGCT---ACTGTCTATCCAGTAATGTCAAAATTTTAT
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O29660_ARCFU/6-285 GTTCTGAAGAACGTCATCTACAACAGCAGCTCCGTGCTTATCGGGAATCTGGCGGGCCTGGTTATATCCATTTACGTTGCAAGGGTTTTGAAGCCCGAGCTTTTCGGGATTTACTCGCTCGCAATTTCAGTCGCGTTTTTGCTAATGACCTTTACCGATCTCGGGATAAATGCGACTTTGGTAAGATACGTGGCCCACGCCAACATTAAAGGTGACgatGAGCTTgttAGGGGTTATATTCGGAGTCTGACTAAGTTAAAGGCTTTACTTGTGCTGGCTGTGGCCTCAATGCTTTTCTTAGGCTCAGATTTTATTGCTGAGCAA---........................---...TTTTTCAGCAAACCGGAGCTGTCATTGCCCTTGAGAATAATGGCGCTCTACATCACG---...---TTCTTTTCAATGGCAGGATTTATAAACGGCATTTTCAACGCCTTT...AACGACTTCAAGGCAAATTTTGTTAGAGCCCTAGTTTACGAAATTTCAAGGGCAACACTCATTTTTCTTCTCCTCTACCTCGGTCTGTCA------.........GTTGCCGGGGCGTTGCTGGGGTACGTGGGTGCCAGCTTACTTTCGCTTATCGCTCTACTTGCTATGCTTTTCAGAAAATTG------AGAAAT..............................TTTCTGTTTGGTAAAGCGAAG...CGGGTCGACTGGAGAAGGATTGTGAGGTTTACCGGTTACCTCACCGTTGGCTCCATAACATGGACCGTCTTCGCTTACGTCGACTCCGTA...ATGATAGGGGCTATGCTACCTTCAGAGGAT---...............------GTCGGATTTTACAGAGCGGCATACAACATTGTAGGGGCAGTTTCCGGGATTGTCGCTCTGCCAGGCGTG------CTCTTTCCCGTTTTCGTTCAGCTCGAG
EXOT_RHIME/10-277 GTAACGCGCAACGTCGGCTGGAGCGTTCTTTCCAAGACAGGGACATTCGGGCTTAAATTTGTCACGGTGCCGATTCTGGCCCGCATTCTGTCTCCCGAGGAATTCGGCGCCGTCGCGGTTGCGCTCACCGTGGTGCAGTTCCTCGCCATGATCGGCGGCGCCGGCCTCACCTCCGCACTCGTCATCCAGCAGCATGAGGAGATGGAAACC------...------...---------GTGCACTCGGTTTTCTGGGCAAACCTCGCCATCGCGCTCATGATGGCGCTCGGACTGTTCGTTTTTGCCGAGCCCCTGGCCACG------........................---...CTGCTCGGCGCGCCGGAGGCTGCCTACCTGCTAAGGATCATGAGTCTGCTGATCCCG---...CTGCAGCTCGGCGGCGACGTTGCCTATTCGCTGCTTGTCCGGAGGATG...AATTTCCGCAAGGATGCCGTCTGGAGCATGATCTCCGAATCACTCGGTGCCGTTATTGCCGTTCTTCTGGCGCTGCTCGGTTTCGGC---------.........ATATGGTCGCTGCTCGCTCAGCTTTTCGTCTCCGCGCTGGTGCGCCTGTCCGGCCTCTATGCCGTTTCCCGT------TAC------GCA---..............................CCGCGCTTCGTATTCTCG---...CTGCAACGCGTTCTGGCGCTCAGCCGCTTCAGTTTCGGCATGATGGGCTCCGAGATCGCGAACTTCATCACCTTCCAGTCCCCGATGGTG...GTGATATCCCGCTATCTCGGGCTGTCCGAC---...............------GCAGGCGCCTATTCGGCGGCGAACCGGTTCGCGAGCATCCCGAACCAGGTCGTCCTCTCCGCCGTCATGGGGGTGCTGTTCCCAACCTTCGGCCAGATGATG
P74815_9SPHN/37-317 CTGCGGGGGCAGATGGTGGTCGGCTTCGGCGTCAAGGGCTTCGGCGCCGTCACCAGTTTCGCTTTCACCTGGCTGGTCGCCCGCGCCTTTGGCCCCGCCGGCGTCGGTGCCTTCGGTACGGCGCTCACGACTGCGCAGATGCTGGTCATTCTGTCGCTGATCGGCCTCGATACCATCCTGGTGCGCACCGTGGCCGTCTGCGTGTCGCAAAATCGGacgGGTGTGgcgCGTACCGCAGTGCGGCATGCCACGCGGGTCGCGGTGGGTGGTGGCCTGGTCCTGATGGTGATGATCCTGCTGTTTCACCAACAGATTGCCACCAAC---........................---...CTGCTGGGCAGCCCCGCCATGGCGCCGGACCTTCTGATCATGGGGTTTCTCATTCCG---...---GTCAGCGCCTATTGCCGTCTCGCTTCGACGACGCTGCGCGGCATGgggGATATCGGCAAGTCGCAGATGGTCGATGGGCCGCTCGGCACCTTCCTGGGTGGGGCGATGCTGGCCGGCGCGCTGCTGATCGGCGTTGCCCATAAT.........CCGCTGCTGCCGTCGGTGCTGTACCTGGTCGGCTGGCTGGTGACGATGTTTGCCGCGACGATCATCGTCCGCCGC------------------..............................ATGACGCGTGATTGGGCGCCGgccGAGCCGTTGGACCGGCCGATGCTTCGCCCCGGCTTCATGGTGCTGATCACCAACGTCAACAACTTCTTCGTCGACTGGTTTGCCACCGTG...ATCCTTGCCGCGACGCACGGCCCCGCCGAA---...............------GCCGGTCTGTTCCGGGTGGGCTATCAGATCGCATCCTCGCTCAAGTTGCTGTCGGCCACCTCCGAGACG---ATCCTGCATCCGGTCTTTGCCGCCTCCTAC
Q56865_YEREN/18-287 GCTTTGAGAAATTCGGGATGGCTTATTTTCGATAAAATAGCGAGTCTAACGATTGGTCTTTGGGTCGGTATTCTTTTGGCAAAGTATCTCGGCCCCGCTAATTATGGTCAGATCGTATATGCAGTAACATACGTTACATTTTTCCAAACTATCAGTATTCTTGGGTTGGACTCAATTGTTGTTCGAGATCTATCCAATGGCGTAGAA---------...------...---------AAATGCTCTGCTATAATTAGTACGATTTTTACAGCTAGATTTTTAATGTCTATGGTATGTTTAATTATTGCAATTTCTCTAGCT------........................---...TATAATAGCAGGCCAGATAAGAGGCTTATACTATCTATTATATCTCTAAATATACTT---...------TTTTCGGTCGGGAGCGTATTTGATTATTTGGTTCAAAGCCAG...AGTAAAAGTCGTTTGACTATTTGCGCTAAATTAATATCCTATATTTTCTGCGCACATGTTAAAATATTTATGATTTACTTACATGTCGAA------.........CTAATTAATTTTTCAATCATAATTGTTATAGAGGTTTTACTATATTCAAGTATACTTTATTTTCTAATGAATAAAAATTAT------AGTGAA..............................ATAAAAGTATCGCTAAGTATTaatAGTGTTTATTTGAAGAGTGCTTTAAAAGAGTCATGGCCTCTAATGTTATCTGCATTTTCTGTAGTGATATTTATGAAGTCTAATATATTA...TTCATTCAACATATGTTGGGTGATAATTAC---...............------GTTGGAATTTATTCTGTTGGCGCAAATTTAGCAGAATTAACATATTTCTTCCCTGCGATCATAGTCACC---AGTTTTTTGCCTATCTTAGCAAAGTTAAAA
O52526_RHILT/10-273 CAGGGCAGCATGTGGCTGAGCCTGTCCCGCGCCATCGTCAACGGG------CTTTCGGCGCTCAGCACCTTCGTTCTCGCCTGGTACCTCGCACCGTCCGATTTCGGTCTCGTTGCCATTGCAACGACGATCCAGGTCATCCTGAGTTCCGTCACCGAACTCTCGCTCAATCAGGCGCTCATCCGCCACGAGGACCCGAGCGAGGTT---------...------...------CATTTCAGCGCGGTTTGGACGCTGAGCGTGACAAGAAGCGCGATCCTGGCTTTGCTGTTTGCCGCCAGTTCCTTTCCAATTGCCGAA------........................---...TTTTATAACGAGCCCCGGCTGACCAGCGTCATGCTTGCTTTGAGTTTCAGCTTGCTC---...CTTAGCGGCCTGGCCCATCCACGTCGCGTCATGCTCCAGCGTGATCTG...ATCTTCTGGCAGGAATTCGTTCTCAACGTATCGCAAAAGCTGGTCGGCTTCGTCGTGACGGTGGCAATCGCTGCGATCTACCAGAGC---------.........TATTGGGCTCTTGTTCTCGGCACCCTCGCCTATCAGATTACCAATATCATCGTTTCCTATACCGTCTTGCCG------TTC------TGG---..............................CCGCGCATAACCTTCCGG---...------CATGCGCGGGAATTGTTTTCGTTCTCGCTTTGGCTGACGGCAGGACAGATCGTCAACACGTTGAACTGGCGGATCGAATATCTG...CTGATCGGCAAGATGTTGGGCGCCACACAG---...............------CTAGGCCACTATACCGTCGGCAACACCCTTTCGACACTGCCGACCCGTGAGGCCACGGCACCGTTGAACCAGACGATTTATCCGGGCTTTTCCAGAGTACGC
Q56776_XANCA/21-288 CGTGCCGCTGGCGCCGCCGTGACCATGATCGGGCAGTCGGCCAAGATGATCGTGCAGTTCGGCGGCATCGTGCTGCTGGCACGCTTGTTGACGCCGTACGACTACGGCTTGATGGCCATGGTGACCGCCATCGTGGGGGCCGCCGAAATCCTGCGCGACTTCGGTCTCTCCGCAGCCGCCGTCCAGGCGAAACATGTCAGCCGCGAG---------...------...------CAACGCGACAACCTGTTCTGGATCAATAGCGGCATCGGTCTGATGCTGTCGGTGGTGGTGTTCGCCAGCGCGCACTGGATTGCGGAC------........................---...TTTTATCACGAGCCCGCATTGGTGACGATTTCGCAGGCATTGGCGGTGACCTTCCTG---...CTCAACGGGATGACCACCCAATACCGCGCACACCTCAGTCGGGGGCTG...CGCTTCGGTCAGGTAGCGCTGAGCGATGTGGGTTCGCAGGTGTTGGGGTTGGGT---GCTGCAGTTGCGGCCGCCTTGGCCGGCTGGGGC------.........TACTGGGCGTTGATCGTGCAGCAGGTGGTGCAGGCCATCGTGAACCTGATTATCGCTGGCGCATGTGCACGC------TGG------TTG---..............................CCGCGCGGGTACGCGCGG---...CAGGCGCCGATGCGCGATTTCATGAGCTTTGGCTGGAACCTGATGGCGGCGCAGCTGCTCGGCTATGCGAGCCGCAACGTTGGCCAGGTG...ATCATCGGCTGGAGGACCGGGCCCGACGCG---...............------CTGGGTCTGTACAACCGTGCCTTCCAGTTGTTGATGATGCCGTTGAATCAGATCAATGCGCCTGCGACTAGTGTGGCGCTGCCGGTGTTGTCGCAATTGCAG
TUAB_BACSU/10-277 AGCGGTGCAAAGTGGACAAGTATTTCAACCATGTGTATTACAATC------ATACAAATTGTTCAGTTTGCCCTGCTTGGAAATATGATGACCTTAACAGAATTTGGGCTTGTCGGCATGATCACAACGGTTACAGTTTTCGCCCAGATTGTGCTCGATATGGGTTTTGGCGCAGCATTAATTCAGAGAGACGACGCGACGGAGCGC---------...------...------CAGCTGTCAACATTGTATTGGCTTAACATTATGACGGGCGTTTTGCTGTTTGTTCTTTTATATGTGAGCAGTCCTGTCATTGCGGGA------........................---...TTTTATCAAAGAGAAGAGCTGGTGTTTCTGGTTCGGATTCTGGCGATTATGTTTTTG---...ATCGCGCCAATTGGACAGCAATATCAGTATATGCTGCAAAAGCAGCTG...CATTTTAATACGTTAAGCAAAATAGAGATTTTTTCAAATGTATTGTCATTCGGA---TATTTAGCGATAGCGGTTTTTATGATGGATGCG------.........ATTTTGGCGTACGTGATTTCTCAAGTCCTGCTGCAGTCCAGTAAAGGGATTTTATATTGGGCTGTATACCGAAAAAAGTGG------CAT---..............................CCTGCTTTTGTTTTTGAT---...TTGAGAGGCATGAAGGATTTCTTTTCTTTTGGAGCCTTTCAGCTTTCATCCCGTCTTGTGAACAGGCTGGGAGCAAATATCGACATGATT...TTGATCGGCCGGTTTATTGGTGCTGAAGCA---...............------TTGGGGATTTATAACCTCGCTTATCAGATTGTCACCATTCCGGTTTTGAAGATCAATCCGATTGTCACACGGGTGGCATTCCCTATTTTCGCAAAAAACAAA
YC11_KLEPN/9-277 AAAAGCACGAAATGGTCAGCGTTATCATCTTTGACAATTATTGTG------CTTGGTTTTTTACAAATGGTAATACTATCTCGTATTCTGGAGCCATTTGAATTCGGTGTTTTGTCAATAATGACAGTTGTCTTTTTATTCACTGATATGCTTGCGGACTGTGGTCTCTCCAACGCCATTATTCAGAAAAAAAATATAACGTTAGAT---------...------...------GAGTTATCAGCTTTATATTGGGTTAATATATTTTTGGGGGTATTTTTATTTGTTGTGACGATCATTTTGTCATATGAGATTTCTTCA------........................---...TGGATGAGGCTGGATAGATTAAGCTTTCTTATACAATTAACTGCTCTTGTTTTTATT---...ATCATGCCTCATGGCCAGCAATACCGAGCGTTAATGCAAAAAGAACTT...GAATTTGATATTCTGTCTAAAATTGAAAGTTTTTCTTATCTTACTGGGTTTTGTTTGACAGTCATCATTGGAATAATAACTAAAAATGCC------.........TCATGTGCTGTTTTTGGATATTTACTTACAGTTTCAATGAGAACT---GTAATATTAAGTTTTGTTGGTCGGAAATATTAT------CAT---..............................CCGACTTGGAAGAGAAGTAAA...TTACGAGAGATTAAAAAACAACTTTTATTCTCATTTTACCTTACGCTTGATAGTATATTAAATTATATCAACTCCTCAATAACAACACCG...ATAGTCGCTAGAGTTCTTGGTGCTATTTAT---...............------GTTGGGGGGTATAATTTATCATTTAACGTTGCAGTCAATCCACCATCTAAAATTAGCCCTATAATCACCAGGGTTTTATTTCCAGCATTATCAAAAATACAA
WZXC_ECOLI/9-276 AGCGGCGCGAAGTGGTCGGCGATTGCCACGGTGATCATCATCGGC------CTCGGGCTGGTGCAGATGACCGTGCTGGCGCGGATTATCGACAACCACCAGTTCGGCCTGCTTACCGTGTCGCTGGTGATTATCGCGCTGGCAGATACGCTTTCTGACTTCGGTATCGCTAACTCGATTATTCAGCGAAAAGAAATCAGTCACCTT---------...------...------GAACTCACCACGTTGTACTGGCTGAACGTCGGGCTGGGGATCGTGGTGTGCGTGGCGGTGTTTTTGTTGAGTGATCTCATCGGCGAC------........................---...GTGCTGAATAACCCGGACCTGGCACCGTTGATTAAAACATTATCGCTGGCGTTTGTG---...GTAATCCCCCACGGGCAACAGTTCCGCGCGTTGATGCAAAAAGAGCTG...GAGTTCAACAAAATCGGCATGATCGAAACCAGCGCGGTGCTGGCGGGCTTCACTTGTACGGTGGTTAGCGCCCATTTCTGGCCGCTGGCG------.........ATGACCGCGATCCTCGGTTATCTGGTCAATAGTGCGGTGAGAACG---CTGCTGTTTGGCTACTTTGGCCGCAAAATTTAT------CGC---..............................CCCGGTCTGCATTTCTCG---...CTGGCGTCGGTGGCACCGAACTTACGCTTTGGTGCCTGGCTGACGGCGGACAGCATCATCAACTATCTCAATACCAACCTTTCAACGCTC...GTGCTGGCGCGTATTCTCGGCGCGGGCGTG---...............------GCAGGGGGATACAACCTGGCGTACAACGTGGCCGTTGTGCCACCGATGAAGCTGAACCCAATCATCACCCGCGTGTTGTTTCCGGCATTCGCCAAAATTCAG
O34674_BACSU/5-320 CTGTTAAGAGGCACGTTTGTATTAACGCTCGGTACATATATATCGCGGATTCTGGGGATGGTCTATTTAATTCCCTTCAGCATTATGGTCGGGGCGACAGGCGGTGCATTATTTCAATACGGATACAACCAATACACTTTATTTTTGAATATTGCTACGATGGGCTTTCCGGCCGCTGTTTCTAAATTTGTTTCCAAATATAATTCAAAAGGGGAT...------...---TATGAGACAAGCAGGAAAATGCTCAAGGCGGGCATGTCGGTTATGCTAGTCACAGGAATGATAGCCTTTTTCATTCTGTATCTATCGGCTCCGATGtttgcggaaatatcgctgggaggcAAGgatAATAACGGCCTGACAATTGATCATGTCGTTTATGTCATCCGCATGGTCAGCTTAGCGCTT...TTGGTCGTACCGATTATGAGCCTTGTCCGCGGATTCTTTCAAGGGCAC...CAAATGATGGGTCCGACAGCTGTTTCCCAAGTCGTTGAACAGATTGTCCGCATCATCTTTCTATTGAGTGCGACATTCTTGATTTTGAAGGTTTTCaacggcggcCTTGTCATCGCTGTGGGCTATGCAACCTTCGCAGCGCTGATCGGTGCCTTCGGAGGGCTGGTCGTGCTTTATATTTATTGGAACAAACGGAAGggcagcctgctggcgatgatgccgaatacgGGTCCGACAGCAAACCTAAGCtacAAGAAAATGTTTTTCGAGCTGTTCAGCTATGCTGCTCCGTACGTTTTTGTCGGACTAGCCATCCCTTTGTATAACTATATTGATACAAATacgTTTAACAAAGCGATGATTGAAGCCGGTCATCAAgccatc...agccagGACATGCTTGCGATTCTAACCCTGTATGTTCAGAAGCTCGTGATGATCCCGGTTTCCCTAGCAACTGCTTTTGGACTGACATTAATTCCAACGATTACTGAATCGTTT
SP5B_BACSU/6-308 TTTTTAAAGGGCACTCTTATCCTTATCGCAGCAGGAATGGTTACAAGAATGCTCGGGTTTGTCAACCGGGTGGTTATCGCCCGTTTTATCGGTGAAGAAGGAGTCGGGCTTTACATGATGGCAGCGCCTACTTTCTTCTTGGCCACTACATTAACTCAATTCGGTCTGCCGGTCGCGATCAGCAAGCTAGTCGCTGAAGCCAGTGCGCGCGGA---...------...GATCATCAAAAAACGAAAAATATTTTAGTCATGTCTCTGACCATTACGGGAGTGCTCAGCCTCATCTTTACACCGCTGTTTCTGTTTTTCGCCCCTGTT........................ATGgctGAAACGATGCTGACAGATAAGCGAACACTGTATCCGCTCTTGGCCATTACGCCTGTTGTG...CCGATTATTGCTATATCGAGTGTGCTGAGGGGATACTTTCAAGGAAAA...CAGAATATGAACCCGCTTGCTATGTCACAAGTCCTTGAACAGGTTGTCCGCATTTCACTCGTGGCTGTCTGCACAACGATTTTTCTCCCTTACGGA.........ATTGAATATGCTGCAGCGGGGGCAATGCTATCCTCAGTGGCAGGGGAGCTGGCATCACTTCTTTATTTATTCGTTTGCTTTAAGTATAAAAAGacaattaaa.........atcagaaagcatTTTTTACAGTCAATTAAAAACggaAAACAAACCTTTACCCAATTAATGAGCGTGTCCCTTCCAACAACCGGGAGCCGCTTTATCGGAAACCTCTCTTGGTTTTTCGAGCCAATCgtcGTCGCTCAAAGCCTTGCCATCGCCGGTGTGGCAacagttgccgcaacaAAGCAATACGGGGAACTAACCGGCTTTGCCATGACGCTGCTGACTCTGCCCAGCTTTATTACATATTCTTTGTCGACCGCGCTTGTTCCTGCGATCAGTGAAGGAATG
YABM_BACSU/12-309 ATTTGGCAGGGGGCTTTTGTTTTAATTCTGGCAGGCGTCATCACAAAAATTTTAAGCGCTGTTTACAGAGTCCCGTTTCAAAACATTGTCGGCGATGTTGGATTTTATATATATCAGCAGGTATACCCCTTTCTTGGTATTGCGGTCATGCTGTCCACATCAGGATTTCCAGTCATTATTTCAAAGCTGATGAATGATTATAGTGAAAAA------...------...------AATCATCACACCATATTAAAAATATCAGCGTTGTTTTTGTCTTTAATCGGTATTTTATTATTTCTTTGTTTATATCTGGGTGCTGTTCCTATT........................GCActcTTTATGGGAGATTCGCATCTAGCCGTGTTAATTCAAGTGGCCGCATACGCGTTTCTG---...CTTTTCCCATTTGTCGCGTTGCTAAGAGGCGGTTTTCAGGGGCGGCAC...GAAATGCTCCCTTCAGCCTTATCACAGATGACAGAGCAGTTTCTGCGTGTTGCGGTGCTCTTGGGTTTATCATTTTGGCTCGTGAAAAAGGGAGCC......tcgCTTTATACTGCGGGAGCGGCAGCCGCTTCAGGCTCTCTTGCCGGAAGTTTGGTTGCATTGATAATACTGGGGTTTTTTTGGTTCAAAACGAAAagagacaac.........caaacggataggCAAAACGAAAATGTCATCACAacaAAAGAATTGACGAAAAAACTGCTTTTATATTCGGTCACAATTTGTGTAAGCAGTTTGCTGCTTTTGTTTATCCAGCTTGTTGATGCTTTGaatTTATATGCATTGCTTTCGGGTGGTGAGGCAAGCgaagaa...gcaaaaTGCCTAAAGGGGATCTATGATCGGGGACAACCCTTGTTGCAGCTCGGTTCAGTTTTTGCCGTAAGCATTGCGACG---TCACTCGTTCCGTATATTTCTATGGCTGTA