EMBL-EBI > Goldman Group

PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam



PANDIT Homepage
pan•dit
PANDIT
Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF01841 alignment
(36 sequences with 285 bp)


P72653_SYNY3/426-492 CGGGGGGTCGGTTCCTGTGGGGAATATGTGGGAGTTTTGTTAGCCCTAGCTCGTTTGAATGGCATTGCTTGCCGCACCGCTGGCCGCTATAAATGTCCACCCCATCCC------------------------------------......---------CTCCAGCGTAATTTGCCTATGGAGCCGGACTTCAACCATGTTTGGTTTGAATTTTATTTACCT------------------GGC............---ATTGGTTGGTTGCCCATGGAATCTAAC
P71843_MYCTU/79-153 CACGGGGTCGCCTTCTGCATGGGCAAGGCAAGTTCCTTCGTCGCCCTGTGCCGAGCCGCCGGTGTCCCGGCCCGTATCGCGTTCCAGACGATCGACGCCCCCGATAAG------------------GAG---TTTCTGTCCCCGcaggtaCGTGCCCTATGGGGAGGC---CGAACTGGCCGGCCCTTCCCGTGGCACTCGCTGGGTGAGGCATATCTTGGT---------------------............---CGGCGATGGGTCAAGCTGGACGCCACC
O30313_ARCFU/111-161 TTCAAAGTTGGAGGATGTGGAGAGCTTGCTCGCCTTTTCTGTGAAGCGGCTAAACGTGCAGGGTTTGAAGCGAGAGTGGTTAGCGATCTTGGA---------------------------------------------------......---------------------------------------TACGATCATGCTTGGGTTGAGGTGAAGATTAAC---------------------............---AACAGTTGGGTTGTAGCTGATCCGACA
O74739_SCHPO/158-209 TCAAGGAAGGGAAGATGTGGAGAGTGGGCCAACTGTTTCACTTTCCTATGCAGAGCACTTGGATCTAGAGCTAGGTGGATTTGG------------------------------------------------------------......---------------------------------AATGCTGAGGACCATGTGTGGACGGAAGTCTATAGTAAT------------------AAA............CAGCAACGCTGGGTGCATGTCGATAGTGGT
Q02890_YEAST/186-237 ACTAGAAAGGGAAGATGCGGTGAATGGTGCAATTTATTTACTTTGATTTTGAAGTCGTTTGGGTTAGATGTTCGCTACGTCTGG------------------------------------------------------------......---------------------------------AATAGAGAAGATCATGTTTGGTGTGAATATTTTTCAAAT------------------TTT............TTGAATAGGTGGGTTCATGTCGACTCCTGT
O26886_METTH/319-377 TTAAGGAAGGGCAACTGCGTTGACCAGGCACACCTCATGGTAGCCCTTGCAAGGACCAGTGGTATACCTGCACGCTACGTCCGTGGTTACTGCAGATTCATAAGCGGG------------------------------------......---------------------------------AACTGGTACTCCCATGTATGGGCCCAGGTATGGATAAGG------------------GGT............CGTGGA---TGGGTTACTGCAGACACAACC
O26933_METTH/198-255 AGTGGATCAGCAAATTGCTGCGACCATACACACCTTCTTGTTGCCCTTGCCAGGGCATCAGGCATACCCGCAAGGTACATGCATGGTAACTGTGTATTCAGGAGCGGT------------------------------------......---------------------------------AACACCTATGGACACGTCTGGGGACAGCTGTACGTCAAT------------------GGA............AGA------TGGTATGACGCCGATGCAACA
O26512_METTH/498-555 TACAGGACAGGTAACTGTGTGGATCACTCGCACCTCCTGGTGGCCCTCTTCAGGACCGCTGGTCTTGCCGCCAGGTACGTGCATGGAACCTGCACCTTCACATCAGGT------------------------------------......---------------------------------AACACCTACGGCCATGTGTGGGCACAGGTGCTTGTGGGT------------------GAC............ACA------TGGTACGCTGCAGATGCCACG
O26457_METTH/652-709 AACAGGACAGGAAACTGTGTTGACATAACACACCTCCTGGTTGCCCTTTCAAGGGCCTCAGGCATAGCAGCCAGGTATGTGCATGCCACATGCACATTCGTCTCAGGG------------------------------------......---------------------------------AACACCTACGGCCATGTCTGGGCACAGCTCTACATAAAT------------------GGT............TCC------TGGGTTAACGCTGACGCATCA
P71734_MYCTU/170-233 CAAGGCAAGGGCGTCTGCCAGGACTTCGTGCACTTGTCGCTGATGGTGTTGCGCAGCATGGGAATTCCCTGTCGGTACGTGTCTGGGTATCTACACCCT---------------------------AAGCGT------------......GATGCCGTGGTGGGA------AAGACGGTAGACGGGCGCAGC---CATGCCTGGGTTCAGGCCTGGACC------------------------............---GGTGGATGGTGGCACTACGACCCCACC
Y2569_MYCTU/191-261 GCCCGCGAAGGGGTATGCCAAGATTTCGCCAGGCTGGCGATCGCCTGCCTACGGGCCAACGGTTTGGCGGCCTGTTATGTGTCGGGCTACCTGGCCACCGACCCGCCG------------------------------------......---------CCCGGAAAGGATCGGATGATCGGCATCGACGCGACGCATGCCTGGGCCTCGGTGTGGACTCCGCAGCAG---------CCCGGG............CGGTTCGAGTGGCTGGGGCTGGATCCCACC
O68811_SYNP2/175-235 CAGCGGACAGGTACCTGCCGTGATTTTGCCTTGTTATGGGTTGAGGCCTGTCGAGTCGCTGGTCTAGCGGCACGGTTTGTCAGTGGCTACCAACGG------------------------------------------------......---------GGCGAT------GAAACCACAACCCAACATGAACTCCATGCCTGGGGAGAAGTGTATATGCCG------------------GGA............---GGTGGCTGGCGTGGCTTTGATCCCACC
P74011_SYNY3/177-237 AGTCGAGAAGGCTCCTGTCGAGATCTAACAGTGCTATTTATGGAAGTCTGTCGCGCCATGGGTTTAGCCGCCCGGTTTGTCAGTGGTTACGAAGTG------------------------------------------------......---------GGAGAT------CCGGAGATTAGTCAATGGGAACTCCATGCCTGGGCGGAAGTGTACTTGCCT------------------GGA............---GCTGGTTGGCGGGGCTATGACCCTACC
Q50732_MYCTU/213-285 ACCGGCGTCGGCTCGTGCCGGGACTCGGCGTGGCTGCTGGTCTCGATCCTGCGTCAGTTCGGGCTGGCCGCCCGGTTCGTGTCCGGCTACCTGGTTCAGCTGGCATCC---------------GACATCGAAGCGCTC------......GACGGGCCGTCGGGG------CCCGCCGCCGACTTCACCGACCTGCACGCGTGGGCCGAGGCATACATCCCG------------------GGT............---GCCGGCTGGATCGGGCTGGACCCGACG
P95893_SULSO/147-202 ATGGGTTCTGGGGTTTGTGTAAATTACAGTCATGTTGCCATAGGAATTCTTAGAGCATTAGGAATTCCAGCTAGATACGTTATTGGTTTGATCCCATTTTCC------------------------------------------......---------------------------------ACTAAGGAAGCTCATGCATGGATTGAAGTTAAGATTGGT---------------------............---GATGTATGGTTTCCCGTTGATCCCACT
O53920_MYCTU/180-245 TGCTCGGTGGGCAACTGCAACGACATCCACGCATTGTTCGTCTCGCTGTGCCGATCGGTCGACATCCCCGCACGATTTGTGCTCGGTCAGGCCTTGGAGCTACCGCAG------------------------------------......---------CCCGGT---GCGCAGGATTGCGAGGTGTGCGGCTACCACTGCTGGGCGGAATTCTTCGTCGCT------------------GGG............---CTGGGTTGGCTACCGGCGGACGCCTCC
Y1048_HAEIN/205-284 GTGTTAAAAGGTAAATGTACCGATATTAACTCTGTATTTGTGGCACTTGCTCGTGCTGCAGGCATCCCTGCTCGTGAAATTTTTGGTATTCGCTTAGGTGCGGCAGAGAAAATGGGCAAATATTCAAAAGGTGCCTTCGGTAGT......GCAAATGAACAAGGC------ATCGCAAACGTAAGTGGTGGCCAACACTGCCGCGCTGAATTCTACCTTGCA------------------GGG............TTT---GGATGGGTACCAGTTGATTCCGCA
O67142_AQUAE/30-100 AAGATAGGAGGGAAGTCTGCTGATCAGAGTTCCCTGTTTGTCGCACTGTGCAGATCGGTGGGCATTCCGGCAAGGGAAGTCTTCGGTATAAGGGTGCTACCCTCGAGC------------TTTTCTGAGGGGCTCTCC------......---ATAAAGCCTGGA------AGTAAAGACATAACTAAGGCACAGCACTGCAGGGCAGAGTTCTGGGCGGGG---------------------............------GAGTGGATACCGGTAGATCCCGCG
P73845_SYNY3/515-582 TACGAAGGGGGGTTGCCGGACCACTTTGCTACAGTGTTGACCATTATGTTGCGGAGTTTAGACATTCCCGCTCGATTAACCGTGGGCTTTGCTCCCGGACAGTTTAAC------------------------------------......------CCTTTCACTGGTTATTATTTGGTCCATAATACCGATGCCTACGCCTTGACGGAGGTACTTTTCCCC---------------------............CGGCTGGGTTGGTTTATGTTCGACCCCATT
O67746_AQUAE/269-335 ACGAAAAGGGGAAACTGCGAGTACTTTGCCTCTGCAACTGCGGTACTCCTCAGGTTGATGGACGTTCCTACAAGGCTTGTGAGCGGGTTCTACGGAGCTATGAAGAAC------------------------------------......------GAATACGGGAACTACTACATAGTCATCAACGCCATGGCACACGTGTGGGTTGAAGCATACGAC---------------------GGA............---AAAAAGTGGGTAAGGGTAGATACTACA
P94476_BACSU/420-491 ACGAAAATGGGTTATTGTGATAACTTTTCTTCCGCCATGGTGGTGCTCTTGCGCTCGGCCGGCATTCCGGCCCGCTGGGTAAAGGGTTATACGTCCGGCGAATACAAAGAAGCAGGG---------------------------......---AACAAAAATGGCAGCATTTACGAAGTGACAAATAACAATGCCCATTCCTGGGTAGAGGTGTATTTCCCG---------------------............GAACAGGGCTGGGTTACATTTGAGCCGACT
O30271_ARCFU/251-314 ACGAAAAGGGGCACTGCAAGAGAATTTGCCACCGCCTTTGTGCTCCTCGCCCAGTCGATAGGAATTCCCGCAAGGGCAGTATTCGGCTATCTTGCAGACCCTGTCGAG---------------ACCAATCAGACCATT------......------------------------------TTCGCCAGCGATGCCTACGTCTGGGCGGAGGTGAGGTTCAAG---------------------............GAA---GGCTGGATGGAGTTCGACCCCGCT
O58064_PYRHO/245-309 ACTAAGAGGGGAGTCTGCTTGGACTTTAACACCGCTTTCGTTATTCTTGCGAGGATCGCTGGCATTCCCGCTAGACTGGTAACTGGATATAAGATCGATCCTATTCCT---------------GGGGAACAAATTGTT------......------------------------------AGGGCCAAGCAAGCCCATGCATGGGCCGAGATCTACCTAAAG------------------GGT............GTT---GGATGGATTCCTATAGATGCAACT
EPB42_HUMAN/262-351 GTGTATGATGGCCAGGCCTGGGTGTTGGCTGCTGTTGCTTGCACAGTGCTGCGATGCCTGGGAATCCCTGCCCGCGTGGTGACCACGTTTGCCTCAGCACAGGGCACCGGTGGGCGTCTTCTCATAGATGAATACTATAATGAG...gagGGACTTCAGAACGGAGAAGGCCAGAGAGGCAGAATCTGGATCTTCCAGACTTCCACAGAGTGCTGGATGACGCGGCCTGCCTTGCCCCAGGGT............TATGATGGATGGCAGATTCTCGACCCAAGT
Q90714_CHICK/316-405 GTGCGATATGGACAGTGCTGGGTCTTTGCCGGTGTCTTCAACACATTTTTGAGGTGCCTGGGGATACCTGCAAGACTCATTACCAATTATTCTTCTGCCCATGACGACAATGCCAATTTACAGTTGGACTTCTTTCTGGATGAT...gaaGGGCAGGTGGACAACAGATTGACCAAAGACTCTGTCTGGAACTATCATTGCTGGAATGAAGCTTGGATGACCAGACCTGATCTTCCTGTTGGT............TTTGGAGGATGGCAGGCAGTTGATGGTACA
Q91171_ONCKE/267-356 GTGCGCTACGGACAGTGCTGGGTGTTTTCAGGCGTAGCCTGTACAGTTCTTCGCTGTCTGGGCATACCCACTCGCCCAGTTACAAACTACTCTTCTGCCCATGACACTGATGGCAACCTGAATGTGGACTATCTGTATGATGAGcagctgGAGAGTGTGTCTGAAGGC---AGGAAGGACATGATCTGGAACTACCATTGCTGGGTGGAGTCCTGGATGGACAGGGAGGATCTTCCTAAAGGC............TATGATGGGTGGCAGGCTCTGGATCCCACC
TGM2_PAGMA/267-357 GTCAAATATGGCCAGTGCTGGGTGTTTGCTGCCGTCGCCTGCACAGTGCTGCGCTGCCTGGGAATCCCAACACGCCCCATCACCAACTTCGCTTCAGCCCATGATGTCGATGGTAACCTCTCGGTAGACTTCCTGCTGAATGAGagactgGAGAGCTTGGACAGTAGACAGAGAAGTGACAGTAGCTGGAACTTCCACTGTTGGGTTGAATCCTGGATGAGCAGAGAGGATCTCCCTGAAGGA............AATGATGGCTGGCAGGTTTTGGATCCCACC
TGM2_HUMAN/272-360 GTCAAGTATGGCCAGTGCTGGGTCTTCGCCGCCGTGGCCTGCACAGTGCTGAGGTGCCTAGGCATCCCTACCCGCGTCGTGACCAACTACAACTCGGCCCATGACCAGAACAGCAACCTTCTCATCGAGTACTTCCGCAATGAG......TTTGGGGAGATCCAGGGTGACAAGAGCGAGATGATCTGGAACTTCCACTGCTGGGTGGAGTCGTGGATGACCAGGCCGGACCTGCAGCCGGGG............TACGAGGGCTGGCAGGCCCTGGACCCAACG
P91590_CIOIN/343-431 GTCAAGTATGGACAATGCTGGGTCTTCTCCGGGTTGCTTACTACAGTTCTTCGTGCGCTTGGTATTCCCGCCCGTAGCATCACCAACTTCAACTCCGCCCACGACACCGAATACAACATGACAATCGATAAGTTCTTGACCGAG...gatGGCGAAAGCGCTGAGGGA---ACGGGGGATTCTATTTGGAACTTCCATGTTTGGAATGAAGGATTTTTCCGACGACCAGATCTGCCTAAAGGT............TATGACGGTTGGCAAGCTGTTGACGCAACC
TGM4_HUMAN/263-352 GTGTGCTTTGGCCAGTGCTGGGTGTTTGCTGGGATCCTGACTACAGTGCTGAGAGCGTTGGGCATCCCAGCACGCAGTGTGACAGGCTTCGATTCAGCTCACGACACAGAAAGGAACCTCACGGTGGACACCTATGTGAATGAG...aatGGCGAGAAAATCACCAGTATGACCCACGACTCTGTCTGGAATTTCCATGTGTGGACGGATGCCTGGATGAAGCGACCGGATCTGCCCAAGGGC............TACGACGGCTGGCAGGCTGTGGACGCAACG
TGM4_RAT/250-339 GTACGCTTTGGCCAGTGCTGGGTTTTCTCTGGAGTCCTGACCACAGCACTGAGAGCAGTGGGCATCCCAGCTCGCAGCGTGACTAACTTTGAGTCAGCCCACGATACAGAAAAGAACCTCAGAGTAGACATCTACCTGGATGAA...tcgGGCAAGACAATTCCACATCTGACCAAAGACTCTGTCTGGAATTTCCATATGTGGACAGATGCCTGGATGAAAAGACAGGATCTACCCCAGGGC............CATGATGGTTGGCAGGTCCTGGATTCTACA
TGM1_RAT/380-469 GTCCCCTATGGCCAATGCTGGGTCTTTGCCGGTGTGACCACCACAGTGCTCCGATGTCTGGGCCTTGCTACCCGTACTGTCACCAACTTCAACTCTGCACACGACACGGACACGTCCCTCACTATGGACATTTATTTTGATGAG...aacATGAAGCCACTGGAGCACCTGAACCACGATTCTGTTTGGAACTTCCACGTGTGGAACGACTGCTGGATGAAGAGGCCAGATCTGCCCTCAGGC............TTTGATGGGTGGCAGGTTGTGGATGCCACA
ANNU_SCHAM/336-429 GTGAAATATGGTCAGTGCTGGGTATTTGCAGGGGTACTCACGACTGTTTGCCGAGCTCTGGGTCTACCAGCACGTACTGTAACAACATACTCAGCTGCCCATGACACCCAAAACAGTCTGACAGTTGACTATTTTGTTGATGAT...aagGGTGAGATCATGGAAGAAATGAACAGTGACTCCATATGGAACTTCCACGTATGGACTGAAGTATGGATGGAACGCCCTGATCTGATGCCTGGAgatggagcccacTATGGTGGCTGGCAGGCAGTTGATTCAACA
TGMH_TACTR/338-427 GTGAAATACGGACAGTGCTGGGTGTTTGCTGGCGTAGCAAATACTGTGTCTCGAGCCTTGGGCATCCCCAGCAGGACCGTGACCAATTATGATTCAGCCCATGACACGGATGACACCTTGACCATTGACAAATGGTTCGACAAA...aatGGAGATAAAATTGAGGATGCTACAAGTGATTCAATTTGGAATTTCCATGTGTGGAATGACTGTTGGATGGCGAGACCTGATTTACCTACAGGG............TACGGAGGATGGCAAGCATATGATTCTACA
TGM5_HUMAN/273-362 GTGCGCTACGGGCAATGCTGGGTCTTTGCTGCCGTCATGTGCACAGTGATGAGGTGTCTGGGGATCCCTACCCGTGTGATCACCAACTTCGACTCTGGCCACGATACAGATGGAAACCTGATCATAGATGAGTATTATGACAAC...acaGGCAGGATTTTGGGGAATAAGAAGAAGGATACTATCTGGAACTTCCATGTCTGGAATGAGTGCTGGATGGCCCGGAAGGATCTGCCCCCTGCA............TATGGAGGCTGGCAGGTGCTGGACGCCACA
TGM3_HUMAN/268-356 GTCCGATATGGCCAGTGCTGGGTCTTTGCTGGGACCCTCAACACAGCGCTGCGGTCTTTGGGGATTCCTTCCCGGGTGATCACCAACTTCAACTCAGCTCATGACACAGACCGAAATCTCAGTGTGGATGTGTACTACGACCCC...atgGGAAACCCCCTGGACAAG---GGTAGTGATAGCGTATGGAATTTCCATGTCTGGAATGAAGGCTGGTTTGTGAGGTCTGACCTGGGCCCCTCG............TACGGTGGATGGCAGGTGTTGGATGCTACC