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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF01735 alignment
(17 sequences with 1707 bp)


PA24A_CHICK/190-675 ATAGCAGTATTGGGATCAGGAGGTGGATTTCGTGCCATGGTTGGGTTTGCTGGAGTCATGAAAGCGCTTTAT---------...------------...---------GAATCAGGAGTTTTAGACTGTGCAACTTACATCGCTGGTCTTTCTGGATCCACCTGGTACATGTCAACTTTA---------------TATTCACACCCGGATTTTCCAGAAAAAGGACCAAAAGAGATTAATCAAGAATTGATGAACTCGGTCAGTCACAAC---CCA...---CTTCTGCTGCTCACTCCT...CAGAAGGTCAAACGCTAC---------ATTGAAGCATTGTGGAATAAAAAAAGCTCAGGGCAG...---CCAGTCACCTTCACTGATATCTTTGGAATGCTAATAGGTGAAACACTTATTCAT------------.........AACAGAATGGACACCACTCTGAGTGACATGAAG------GAGAAAGTCAGTGAAGCACAGTGTGCTCTTCCACTCTTTACGTGTCTC------CATGTCAAA............CCAGATGTCTCAGAGCTTATGTTT---GCAGACTGGGTGGAATTCAGTCCATATGAGATTGGT------ATGGCAAAGTATGGTACTTTTATGTCTCCTGATTTGTTTGGAAGCAAATTTTTTATGGGAACGGTGGTGAAGAAATACAGTGAAAATCCTTTGCATTTCTTAATGGGTGTCTGGGGCAGCGCGTTTTCTATATTATTTAAC...AGAGTGCTCGGTGTCTCCAATTCTCAAAATAAAGGTCCCACCATGGAAGAAGAACTAGAAAATATTAGGCTAAAGCACCTTGTAAGT---AATGACAGCTCAGACAGTGAA...GATGAATCACAGCATCCAaaaGGCACTGAAAATTCAGAGGCAAATGAAGAG...TATCAGAACAGCAGC.......................................CAAGAAAGCTGGGTGCAGCGAATGCTGATGGCTTTGGTGGGTGATAGTGCCCTTTTCAATACCAGGGAAGGGCGTGCTGGGAAAGTGCACAACTTCATGCTGGGATTGAACCTCAACAGCTGTTACCCACTGTCTCCTCTGGCAGACCTCCTGACTCAGGAA...TCTGTGGAGGAAGATGAGCTAGATgcaGCCGTTGCAGATCCTGATGAGTTTGAGAGGATATATGAGCCA---------CTAGATGTG...AAGAGCAAAAAGATTCACATTGTGGACAGTGGTCTTACATTTAACCTTCCATATCCACTTATCCTAAGACCT---CAAAGAGGAGTT..........................................GATCTCATCATCTCTTTTGATTTTTCAGCAAGGCCAAGTGATTCCAGTCCTCCTTTCAAAGAAATTTTACTTGCTGAAAAATGGGCCAAAATGAACAAGCTTCCTTTTCCAAAAATAGATCCAAATGTATTTGAT------CGAGAGGGCTTGAAGGAGTGCTATGTTTTTAAACCAAAGGATACCTCTTCAGAGAAGGATTGCCCAACAATAATCCATTTTGTACTGGCAAACATCAACTTCCGGAAGTACAAAGCTCCAGGTCTTCCAAGAGAGTCAAAGGAAGAGAAGGATTTTGCTGACTTTGACATTTTTGATGATCCTAAT
PA24A_BRARE/185-664 ATCGCTATTCTGGGCTCTGGAGGAGGTTTTCGTGCAATGGTGGGCTTTTCTGGTGTGATGAAGGCTTTGTAT---------...------------...---------GAATCTGGCGTGTTTGACTGTGCAACATATGTGGCAGGACTTTCAGGATCAACATGGTATATGTCTATGCTG---------------TACTCTCATCCAGAGTTTCCTGCTAAAGGCCCAGGCGACATTAATAAAGAGCTCATGAACAGAGTCAGTAATAAC---CCA...---CTCAAACTGCTCCTGCCC...CAAAACATCAACCGCTAC---------GTCAAAGCACTGTGGAAGAAGAAATCTGCTGGACAG...---CCGGTCACCTTCACTGATATCTTCGGGATGTTGATAGGAGAGACGCTTATTCCA------------.........GGGAGAATGAACATTAAGCTGAGCTCATTGAAA------GGGAAAATTAATGAAGGTCAGAGCCCTCTTCCTCTCTTCACCTGTCTG------CACGTCAAA............CCTGACGTCTCTGAGCTCATGTTT---GCAGATTGGGTGGAGTTCAGCCCTTATGAAATTGGC------ATGGCCAAATATGGCACCTTCATGTCTCCTGGGCTGTTTGGCAGCAAATTCTTCATGGGAAGTGTTGTGAAACAATATGAGGAAAACCCCTTACATTTCCTGATGGGTGTGTGGGGAAGTGCTTTTTCCATCCTCTTTAAC...CGGGTTTTGGGTGTGAAGGAGACGACCAGC---AGTAGCACTATGGAGGAGGAGCTGGAGCAAATTAAACCAGAGCACATTGTGGGT---GACGATTCTGCTGATAACGAG...GAGGAAACTCAAAGAGGA...GGCACAGAGTCTGCAGATGCAGAAGACGAG...CGCCAGCGTCATGCC.......................................CAGGCCAGCTGGGTACAGCGCATGTTGACCTCCATCATGGGCGACACCACTCTGTTCACCACTCGTGAGGGCCGCGCAGGCAAAGTGCACAACTTCATGCTGGGACTGAACCTGAACTCAACCCTGCCCTTCTCTCCCTTCAGCGGCATCACACACCAGACC...TCGCTGGAGGAG---GAAGTGGAC...GCTGTTACTGATCCGGATGAGTTTGAGCGAATCTATGAGCCT---------CTGGATGTG...AAGAGCAAGAAAATCCATGTGGTGGACAGTGGCTTGACCTTTAACCTGCCCTACCCTCTCATTCTGCGGTGT---CAGAGAGGAGTC..........................................GACCTGATCATTTCATTCGACTTCTCAGCCCGACCCAGTGACTCCAGCCCACCGTTCAAAGAGTTACTGCTGGCTGAAAAATGGGCCCGTATGAATAAGCTGCCCTTCCCGAAGATTGATTCGAAAGTATTCGAC------AGAGAGGGTCTAAAAGAGTGCTATGTGTTCAAGCCTGCTAAAGGAGAC------AAGAACTGCCCCACCATCATTCATTTTGTCTTGGCCAACATCAACTTCCGGAATTTTAAAGCCCCTGGAGTTCCTCGAGATTCAGACAAGGACATAGAGTTTGGTGACTTTGACATATTTGACGAGCCAGCC
PA24C_HUMAN/44-487 GTTGCTGTGCTGGGCTCAGGCGGAGGACTGCGGGCTCACATTGCCTGCCTTGGGGTCCTGAGTGAGATGAAA---------...------------...---------GAACAGGGCCTGTTGGATGCCGTCACGTACCTCGCAGGGGTCTCTGGATCCACTTGGGCAATATCTTCTCTC------------TACACCAATGATGGTGACATGGAAGCT---------------------------------------------CTCGAG---GCT...------GACCTGAAACATCGA...TTTACCCGACAGGAGTGG---GACTTGGCTAAGAGCCTACAGAAAACCATCCAAGCAGCGAGGtctGAGAATTACTCTCTGACCGACTTCTGGGCC------------TACATGGTTATCTCTAAGCAAACCAGA.........GAACTGCCGGAGTCTCATTTGTCCAATATGAAG------AAGCCCGTGGAAGAAGGGACACTACCCTACCCGATATTTGCAGCCATTGACAATGACCTGCAA............CCTTCCTGGCAGGAGGCAAGAGCACCAGAGACCTGGTTCGAGTTCACCCCTCACCACGCTGGC------TTCCCTGCACTGGGGGCCTTTGTTTCCATAACCCACTTCGGAAGCAAATTCAAGAAGGGAAGACTGGTCAGAACTCACCCTGAGAGAGACCTGACTTTCCTGAGAGGTTTATGGGGAAGT---------GCTCTTGGTAACactGAAGTCATTAGGGAATACATTTTTGACCAG------------TTAAGGAATCTGACCCTGAAAGGTTTATGGAGAAGGGCTGTTGCT---AATGCTAAAAGC---------...---ATTGGACACCTTATT...---------TTTGCCCGATTACTGAGGCTG...CAAGAAAGTTCACAAggggaacatcctcccccagaagatgaaggcggtgagcctGAACACACCTGGCTGACTGAGATGCTCGAGAATTGGACCAGGACCTCC---CTGGAAAAGCAGGAGCAGCCCCATGAGGACCCCGAAAGGAAAGGCTCACTCAGTAACTTGATGGATTTTGTGAAGAAAACAGGCATTTGCGCTTCAAAGTGGGAATGGGGG...ACCACTCACAACTTCCTGTACAAA...------------------------------CACGGTGGCATCCGGGACAAGATAATGAGC...AGCCGGAAGCACCTCCACCTGGTGGATGCTGGTTTAGCCATCAACACTCCCTTCCCACTCGTGCTGCCCCCG---ACGCGGGAGGTT..........................................CACCTCATCCTCTCCTTCGACTTC---------------AGTGCCGGAGATCCTTTCGAGACCATCCGGGCTACCACTGATTACTGCCGCCGCCACAAGATCCCCTTTCCCCAAGTAGAAGAGGCTGAGCTGGATTTGTGGTCCAAGGCCCCCGCCAGCTGCTACATCCTGAAAGGAGAAACTGGACCAGTG------------------GTGATGCATTTTCCCCTGTTCAACATA---------------GATGCCTGTGGAGGTGATATTGAGGCA------------------------------TGGAGTGACACATACGAC
PLB2_CANAL/87-564 ATTGGACTTGCATTTAGCGGTGGAGGCTACAGAGCTATGTTAGCTGGTGCTGGTGAATTACTTGCTTTAGATTCACGAGCA...ACTAATCCTTCA...------GTTTTAAGTGGGATCTTGCAGAGTTCAAGCTATATTGTTGGTTTATCTGGCGGCTCATGGCTAGTTGGAAGTCTTGCCAGTAATGATTTGATACCAGTGGATCAACTTTTACGA------------GAAGACAAATTGTGGGATATACAAAATTCATTAGTTGCA---TAC...---TATGGAGTAAATATTGTT...AGAAATACTGCAATGTGGGGTAACATTAATTTGCAGGTCCAAACCAAACAATTAGCTGGTTTT...---ACTGTCAGTATAACAGATGTCTATGGGAGAGCTTTGAGTCACCAATTGTTAACAAATTTTGACAAT.........CAAGGGGCTTCATTTTTATGGTCAGATGTAACTGAGACCACATCATTCCAAAATAATGAAATGCCATATCCAATACTAGCCGCGTTG------GGAAGGGAA............CCAAACACTGTGCTCATGAATTTCAATTCTACCGTATTTGAATTAACCCCTTATGAAGTGGGTTCATGGGATCCAAGTTTGAGAAGCTTTGTTGATACCAAATATATTGGAACCAGGCTTGATGATGGGGCTCCTGTC---TCTAAAAGATGTGTTAATGGGTTTGATAATGCAGGGTTTTTCATGGGCACATCCTCATCTTTATTTAAT...ATAGTGTTGCAACAACTTAATAACATGCCA---------------ATCCCACCATTCCTTAAAGAGCTCATTAGCAAATTCACCCTC---GACCCTGTTGAAAAGTTAAATattGATATTGCACAATACAAT...CCAAATCCATTTCACAAAAGCAAT------...------AATTCCGAT.......................................ACC---------------------------AAAATAGCACAATCTCGAACACTATATTTGGCAGATGGAGGTGAAGACGGT------CAGAATGTTCCCTTGCTTCCATTGATCCAC------CGTAAGGTAAGTGCAATCTTTGCTTTTGATCAATCGGCA...GATAAAAACAAT---TGGCCAGAT...GGATCAGCTTTAATCAAAACTTTTGAACGACAATTCTCA------------TCACAGGGA...GATGGCATTGCCTTCCCATATGTCCCAGATCAGAACACTTTCCGGAAC---ACAAATTTAACTAGTAAGCCAACGTTTTTTGGATGT..........................................GATGCCCAGAACTTGACATCATTA------ACTGAAAATATCTATGATGTTCCTGTGGTTATATATCTTGCAAATCGTCCATTCACATACTTTTCCAATATATCTACTTTCAAACTCAAGTATTCTGATACGGAA------CGACAAGGAATGATTTCAAAT---GGATATGATGTTGCATCTCGCTTGAATGGTAAATTGGACAACGAGTGGGCAGCTTGTGTTGGTTGTGCCATTATACGCAGAGAACAAGAACGTCTAGGAATCGAACAAACGGAACAATGCAAAAAGTGTTTTGAGAATTATTGCTGGGATGGTACAATATAC
PLB1_CANAL/88-565 ATTGGTCTTGCATTCAGTGGCGGAGGGTATAGAGCAATGTTGACTGGAGCAGGTGAAATCAGTAGCTTGGACTCAAGAACAaaaACCAATACTCCA...------GTTTTAGCAGGCATTTTACAAGCTTCGAGTTATATTGCTGGGTTATCAGGTGGATCGTGGTTAGTTGGAAGTCTTGCAAGTAATAATTTGAACTCTGTTGATGACATGTTATCT------CAAGGT---------TTGTGGGAACTCACACACTCATTTCTTAGT---TAC...---TATGGCATTGAACATCCTataAAGCAAGTTGAAGAATGGGTTAATGTTGGTAATCAAGTTGCCAGCAAAAGAAATGCAAATTTT...---AACGTTTCTTTAACTGACATATATGGAAGACTATTAAGTTACCCTTTGCTCACAAACACAGAAGAC.........GAAGGTGATGCTTATTTGTGGTCAGATGTAACGAGTGCTTCAAACTTCCAAAGCCACCAAATGCCGTTTCCAATATTGATCAGTGAT------GGTAGAGCT............CCAGATACTACCATTATTAATCTCAACTCCACTGTGATTGAATTAACTCCATACGAATTTGGTTCATGGGATCCTAGTTTAAATGAATTTGTTGACACTAGATATTTGGGAACAAAATTAGACAATGGTCGTCCAACT------GGTAAGTGTTATAATGGATTTGACAATGCTGGGTTTTTCATGGGTACTTCTTCTGCTCTTTTCAAC...GAAGCGGTGTTGTCTATCACTGAAGCTAAC---------------ATACCTAGCTTTTTAAAAGATATAATTGATGATATTTTGGTA---GATCCAATTCTCAAGTCCAACataGACGTGTCTGCTTACAAT...CCAAATCCATTTTTCAAAAGTTCT------...------GGCAGCAAT.......................................ACT---------------------------GCTATTTCTCAATCAAAAAATCTTTATTTAGTTGACGGTGGAGAAGATGGC------CAAAACATTCCAATAAGTCCCTTGTTGCAT------CGTAACGTAAGTGCTATATTTGCCTTTGACAATTCCAAT...GACGTTTTAAAC---TGGCCAGAT...GGGACTTCGTTGGTGAAAACTTATGAACGTCAATTCTCA------------TCACAGGGT...AATGGTATTGCTTTCCCATATGTTCCTGATCAATACACTTTCCGTAAT---TTGAACTTGACTAGCAAACCTACATTTTTTGGTTGC..........................................GATGCAAAAAACTTGACTTCATTG------ACAAAGGATATTTATGATGTTCCCTTGGTTATATACTTGGCAAATCGTCCATTCACTTACTGGTCTAATACATCAACTTTCAAATTAACATACGACGATAACGAA------AGACAAGGCATGATTTCCAAT---GGATTTGAAATTGCCACTAGATCAAGTGGATCCTTGGATGATGAATGGGCAGCATGTGTTGGATGCGCCATCATACGGAGAGAGCAAGAAAGACAAGGTATTGAACAGACAGAACAATGTAAGAGATGCTTTGAAAACTATTGCTGGGATGGTACCATCTAT
PLB3_CANAL/177-670 ATTGGGTTGTCATTCAGTGGTGGAGGGTACAGAGCTATGTTAGCTGGTGCAGGTCAAATATTGGGTTTAGATGGACGATAC...GAAGATGCTAAT...AAGCACGGGTTAGGTGGATTATTAGATAGTTCAACGTATGTGGTTGGGTTGTCTGGTGGTAACTGGTTAGTTGGACTGTTGGCATTGAACGATTGGCTTTCAGTTGGAGATATAGTGAAT---------GGGAAATCAACCATTTGGCAGTTACAAGACTCAATACTTAAT---CCA...---AGTGGTATGAGAATTGAC...AAGACTATTGCTTACTATTACGGATTGGCCCAAGCAGTTCAGGCCAAAGAGGATGCAGGGTTT...---CAAACCTCAGTAACAGATACTTGGGGTAGAGCCTTATCTTATCAATTCTTTGAA---GAGGACGACagtggaactGGTGGAGCCAACATCACCTGGTCAAGTATTCGTAACCTTTCCAGTTTTCAGGACCATCTGATGCCATATCCAATTGTGGTTGCCAAT------GGAAGAACA............CCTGGAACATACATTATTAATGAAAATTCTACAATATTCGAGATCAGTCCTTACGAATTGGGGTCATGGGACCCTTCATTGAAATCGTTTAGTAATATTCAGTATCTTGGATCTTCCGTAAACAATGGAAATCCAAACAACACTGATATTTGTGTAAATAATTTTGATAATGCTGGGTTTATCATGGGCACATCATCATCTTTATTCAAT...CAGATTTTGCTTCAACTCGACAATTATTCA---------------ATCAATTCAATAATTAAAATGATTTTGGAAAAGGTATTAACA---GATGTAAGTGACGAGGAATAC...GATATTGCTGTGTATGAG...CCAAATCCATTTTTTGGTGCAGAC------...---TCTGCAGGAATC.......................................AAA---------------------------TCCATAACTACTAACGATACCCTCTATTTGTGTGACGGGGGTGAAGATTTA------CAAAACGTTCCCTTTTATCCATTAATCCAAAATAAGCGTGGTGTTGATGTAATATTCGCATTTGATAATTCTGCT...GATACTAATTCAAGTTGGCCCAAC...GGTACTTCGATACAGGAAACTTACAAACGACAATTTTCT------------AAACAAGGG...AAAGGAACCCCATTCCCATTTGCACCTGACTATAAAACATTTTTAGAT---AAGAATATGGGAGACAAACCTGTATTTTTTGGGTGCaattcttcagacttggaagatttggtagcttggcatgaaaacGATAAAATAAATGTTACCGATGTT---------------------------CCATTAGTTGTGTACACATCGAACACTCGCATGAGTTACAATTCAAACTTTTCCACTTTCAAGTTATCTTATTCTGACCAAGAG------AAATTTGGTGCTATCAGGAAT---GGGTTTGAAACGGTAACAAGAAATAATTTAACGGACGACGAAAATTGGTCAACGTGTGTTGGCTGTGCAATAATTAGAAGACAACAAGAACGGTTAGGTGAGGAGCAGTCCGATGAATGTAAAAAATGTTTCCAAGAATATTGTTGGACTGGTGGATTCAAA
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