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PANDIT Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees |
PF01734 alignment |
| TEG_BACME/7-182 | ITFDGGGTLGAL-SLQLLNRLAYQ------.-NPKLISET.NVFSGNSIGSFTALALASGRSPE.......----.--ETFDFFKDQILPAFSVSRPGGPVF.-N.--.--.------.----------------.-QQVP....YSGLIKAIRTFF-.--.-.........-PRDLRLRDLKK.--.-.-...-.-.---.-.---.---...-----RIVVPAFH.LFAPELNRWN.PVL.FHNF--L..................................-GSPYLNEKASDVILRSSAAPATQRAY------.--.....-.-.------Q..NYVDGYTVATNTSTASI |
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| Q9SV43_ARATH/101-301 | LSIDGGGMRGIL-PGKALAYLEHALKSKSGdPNARIADYF.DVAAGSGIGGIYTAMLFGSRDGN.......RPIFkADDTWQFLTRNAKGLYGGAG------.--.--.--.----I-.---LKRVLRTGSG---.-CCSG....TAKLKKVMKESF-.--.-.........--SELTLKDTLK.--.-.-...-.-.---.-.---.---...-----PVLIPCY-.----DLKSSG.PFL.FSRADAL..................................-ETDGYDFRLSEVCRATWAEPGVFEPVEMKSVDgQ-.....-.-.----TKC..VAVGGGLAMSNPTAAAI |
| Q9SZQ3_ARATH/124-338 | LSIDGGGMRGLL-AGKSLIYLEQMLKEKSGdPNARIADYF.DVAAGSGVGGVFAAMIFATRDGN.......RPIFkAEDTWKFLVENAEGFYRSGSGS----.--.--.GGgGAGAA-.---IKRVIRSGSGSGSsSVTAA....TAKLEKAMKASF-.--.-.........--ADLTLKDTLK.--.-.-...-.-.---.-.---.---...-----PILISCY-.----DLSSTA.PFL.FSRADAL..................................-ESDSFDFRLRDICRATWAEPGTFDPVRTCSVDgK-.....-.-.----TRC..VAVGGGLAMSNPTAAAI |
| O48723_ARATH/22-228 | LSIDGGGIRGLI-PAVILGFLESELQKLDG.EEARLADYF.DVIAGTSTGGLVTAMLTAPNKEG.......RPLFaASEIKDFYLEQCPKIFPQDHF-----.--.--.--.-----PfSA-AKKLVKSLTG---.-PKYD....GKYLHQLIHAKL-.--.-.........--GDTKLSQTLT.--.-.-...-.-.---.-.---.---...-----NVVIPTF-.----DIKHLQ.PTI.FSSYEVK..................................-NHPLKDATLADIAISTSAAPTYLPAHFFKVEDlNG.....-.-.--NAKEY..NLIDGGVAANNPALLAI |
| O23181_ARATH/38-252 | LSIDGGGIRGII-PGTILAYLESQLQELDG.EEARLVDYF.DVISGTSTGGLIVAMLTAQDQSGghsrnsnRPLFeAKEIVPFYLKHSPKIFPQPRG-----.--.--.--.-----IfCGWGETIVRLVGG---.-PKFN....GKYLHDLVEGFL-.--.-.........--GDTKLTQSLT.--.-.-...-.-.---.-.---.---...-----NVVIPCF-.----DIKKLQ.PVI.FSSYQAV..................................-NNQAMNAKLSDICISTSAAPTFFPAHRFTNEDsEG.....-.-.--IKHEF..NLIDGGIAANNPTLCAI |
| O23148_ARATH/18-224 | LSLDGGGVRGII-AGVILAFLEKQLQELDG.EEARLADYF.DVIAGTSTGGLVTAMLTVPDETG.......RPHFaAKDIVPFYLEHCPKIFPQPTG-----.--.--.--.-----VlAL-LPKLPKLLSG---.-PKYS....GKYLRNLLSKLL-.--.-.........--GETRLHQTLT.--.-.-...-.-.---.-.---.---...-----NIVIPTF-.----DIKKLQ.PTI.FSSYQLL..................................-VDPSLDVKVSDICIGTSAAPTFFPPHYFSNEDsQG.....-.-.--NKTEF..NLVDGAVTANNPTLVAM |
| O24152_TOBAC/32-230 | LSIDGGGIKGII-PATVLSFLESQLQELDNnEDARLADYF.DVIAGTSTGGILTTMISAPNEKG.......RPFSaAKDIVSFYFEHGPKIFPQGVW-----.--.--.--.------.--------PPILG---.-PKYD....GKYLHKVLEDKL-.--.-.........--GETRLHQTLT.--.-.-...-.-.---.-.---.---...-----NVVIPTF-.----DMKKFQ.PII.FTKSEIA..................................-NSPHLDAKMSDICYGTAAAPTYFPPYYFENDDgKG.....-.-.--NQHEF..NLIDGGVVAVNPALIAV |
| PAT2_SOLTU/32-228 | LSIDGGGIKGII-PAIILEFLEGQLQEVDNnKDARLADYF.DVIGGTSTGGLLTAMITTPNENN.......RPFAaAKDIVPFYFEHGPHIFNYS-------.--.--.--.------.--------GSILG---.-PMYD....GKYLLQVLQEKL-.--.-.........--GETRVHQALT.--.-.-...-.-.---.-.---.---...-----EVAISSF-.----DIKTNK.PVI.FTKSNLA..................................-KSPELDAKMYDICYSTAAAPIYFPPHHFVTHTsNG.....-.-.--ARYEF..NLVDGAVATVGDPALLS |
| Q9XE77_SORBI/27-251 | LSIDGGGIRGLI-PATIIAHLEAKLQELDG.PDARIADYF.DVIAGTSTGALLTSMLAAPDDNN.......RPLFsAKDLTTFYLENGPKIFPQKKPKQGLC.-GdLWwTGgALQAGFlTP-VRNLLGLVRG---.-PKYD....GVFLHDKIKSLT-.--.-.........--HDVKVADTVT.--.-.-...-.-.---.-.---.---...-----NIIVPAF-.----DVKYLQ.PII.FSTYEAK..................................-ADTLKNAHLSDICISTSAAPTYFPAHFFKTEAtDG.....-.-.--RSREF..HLVDGGVAANNPTMVAM |
| O23784_CUCSA/27-233 | LSIDGGGIRGII-PSIILAFLESKLQELDG.PDVRIADYF.DVIAGTSTGGLVTSMLTAPDKNN.......RPLYsASDLALFYIEHAPKIFPQRNY-----.--.--.--.-----FlCS-LVNFFGKVMG---.-PKYN....GLYLRSLIKGLL-.--.-.........--GDITLKQTLS.--.-.-...-.-.---.-.---.---...-----QVVIPAF-.----DIKLLQ.PVI.FTTIEAK..................................-CSELKNPKLADVCISTSAAPTFLPGYEFQTKDsKG.....-.-.--NIRNY..EMVDGGVAANNPTLAAM |
| O04008_HEVBR/17-218 | LSIDGGGIRGII-PGIILASLESKLQDLDG.PDARIADYF.DIIAGTSTGGLITTMLTAPNEDK.......KPMYqAKDIKDFYLENCPKIFPKESR-----.--.--.--.-----DnYD-PIH----SIG---.-PIYD....GEYLRELCNNLL-.--.-.........--KDLTVKDTST.--.-.-...-.-.---.-.---.---...-----DVIIPTF-.----DIKLLL.PVI.FPSDDAK..................................-CNALKNARLADVCISTSAAPVLLPAHSFTTEDdK-.....-.-.--NIHTF..ELIDGGVAATNPTLLAL |
| O80693_ARATH/456-702 | LTMDGGGMKGLA-TVQILKEIEKGS-----.-GKPIHELF.DLICGTSTGGMLAIALGVKLMT-.......----.LEQCEEIYKNLGKLVFAESVPKDNEA.-AsWReKLdQL----.----YKSSSQSFRVVIhGSKHS....ANEFERLLKEMCAdE-.-.........-DGDLLIESAVK.--.-.-...-.-.---.-.---.---...-----N--VPKVF.VVSTLVSVMPaQPFiFRNYQYPvgtpemsyafsdhsggstltsstasdqagyykqsAFMGSCKHQVWQAIRASSAAPYYLDDFSVGTN-.--.....-.-.-----SY..RWQDGAIVANNPTIFAI |
| O95035_HUMAN/43-238 | LSIDGGGTRGVV-ALQTLRKLVELT-----.-QKPVHQLF.DYICGVSTGAILAFMLGLFHMP-.......----.LDECEELYRKLGSDVFSQNVIVGTVK.-MsWS.--.------.----------------.HAFYD....SQTWENILKDR--.--.-.........-MGSALMIETAR.--.-.-...-.-.---.-.---.---...-----NPTCPKVAaVSTIVNRGITpKAFvFRNYGHFpg.............................insHYLGGCQYKMWQAIRASSAAPGYFAEYALGND-.--.....-.-.-------..LHQDGGLLLNNPSALAM |
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| PA2G6_HUMAN/481-665 | LCLDGGGVKGLI-IIQLLIAIEKAS-----.-GVATKDLF.DWVAGTSTGGILALAILHS-KS-.......----.MAYMRGMYFRMKDEVFRG----S---.--.--.--.------.----------------.-RPYE....SGPLEEFLKRE--.--.-.........-FGEHTKMTDVR.--.-.-...-.-.---.-.---.---...-----K---PKVM.LTGTLSDRQPaELHlFRNYDAPetvrepr...................fnqnvnlrPPAQPSDQLVWRAARSSGAAPTYFRP-------.--.....-.-.-----NG..RFLDGGLLANNPTLDAM |
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| Q9VUH7_DROME/3-170 | LSFAGCGFLGIY-HVGVAVCFKKYAP----.---HLL--L.EKIGGASAGSLAACCLLCDL--P.......----.LGSMTSDFFRVVNE------------.--.--.--.------.-ARRYSLGPFS-PS--.-----....FN-IQTCLLEGL-.--.-.........--QKHLPDDAH-.--.-.-...-.-.---.-.---.---...KRVNGRLHISLT-.----RVYDGK.NVI.I------..................................-SEFESREEVLQALLCACFIPGFSGIL------.--.....-.-.PPRFRGV..RYMDGAFSDNLPILDEN |
| Q9VXY8_DROME/9-176 | LSFSGCGFLGIY-HVGVAVCLRQHAP----.---QLL--L.ERIAGASAGALAACCLICDL--P.......----.LECMAGDFLRVVQE------------.--.--.--.------.-IQRHSLGAFS-PW--.-----....FN-LPECLLEGM-.--.-.........--RSWLPEDAH-.--.-.-...-.-.---.-.---.---...LLASGRLHISLT-.----RVSDRR.NVV.M------..................................-SEFSSRQELLQALMCSCFIPGLSGLV------.--.....-.-.PPQVRGV..RYMDGAFSDNLPLLDEH |
| YPD7_CAEEL/13-180 | LSFSGCGFLCVY-HAGVAAAIKEYAP----.---ELL--Q.NKILGASAGSIVACGLITGV--C.......----.ISHATSTILKVVSQ------------.--.--.--.------.-ARSRTFGPLH-PE--.-----....FN-LLGIVRDEL-.--.-.........--EVILPPNAY-.--.-.-...-.-.---.-.---.---...EMCTGRLVISLT-.----RWSDHE.NVI.I------..................................-DEYRSNADLIDAIMCSCFIPLYCGIT------.--.....-.-.PPKFRGV..QYIDGGVSDNQPIYDEH |
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| YLBK_BACSU/8-166 | LALGSGGARGLA-HLGVLSSLHKHQI----.-------EV.DMIAGSSMGALVGSFYAAGHDVA.......TM--.----KKVAK-----------------.--.--.--.----AFkRRLYADYTVPK-----.LGFLK....GDRVRQLVHAYT-.--.-.........--FGKPIEELQI.--.-.-...-.-.---.-.---.---...-----PLGIVAC-.----DLQTGE.KIV.FR-----..................................------KGSVSDAVRASISIPGIFIPQR-----.--.....-.-.---LDGR..LLVDGAVVDRIPVSVVK |
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