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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF01621 alignment
(7 sequences with 1077 bp)


Q69296_9ALPH/1-336 ATGCTGCGACCAGAATGTCTAAAATGGGCAGTAATTTTAACCGGAACGATACATATAGTCTTCTTGGTATGGTATGTATGCTCTAAAATTTCCACTGACTCAAAGGACGACTGCTTGTACGTACTCGCAAATATTAAATGGCTCCTGCCCGGACAGCAAGAATTCAATCCTGTTCACCAACCCCCCGCTACATTTAATTCTTCACTAGTTTATGTCCTCACAAAATATACACAG---------CGTCTAAACAACTACGAGAACCACCAGACGAGATGTGTTAAAGGAGCTTATTTTGAAAATGAGACTGTACTCATTTCT---------CGTCTGATCCCACTGGCCAAAGAACAGTATTCGTCATGGAAGTGGCAGACTGTCTCTTTACATATGGTTTTCCCAGATCAGAGTTGCATTTCCACGGTTATTGTACATATGTTACTTGCTGACCCGTGCCAGAGGCGAATGTTCGGCTCTGTCTGCCGCGAGAAC---GCATTGCGATTGGATGCATATCATCTAAACTACTGGACAGCGTTTACTTCGAGGCTGATATTACGGGTGCCATACACAAAGATGCAACGGTTTTTGAGGGAATTTGAACATGTCCGAGATTGCAAAAGCTTGAACTACGTAGCAGACCCTCTAGGCTTTTGCATCTGTAATCCAGGGGTCTTAGTACTGAAAACACTCGAGATCGGTTTATATTTAGCATCGCTTATTATGTCCACCATGACATTGCGGATTTGCTATGATCCGTGTGCATATATTTTACATGAACACGTAAAAATTAGTGCTTGGGTATATGTAATTGTCTCAGCGGTTCTAGAACTCTTATCACTGATGGGTTACACGACTCCGGCAAAGACTAAAGTCTCCGCATCGAAACCTCCCAGT------------------------------------------------ATCTTGACTTCATGCCTTGCCAATATTGCTTCGAGCTTAGTCTTGCGTGCATTGTGCGTGGCTGCGATTGCGAGCATTGTAATAATTGCATTTAAATACGAACAGAAGATACAAAACAAATTGTTCGGG
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Q65547_9ALPH/2-335 CTGCTCGGGGGGCGGACTGTTAACTTGGCCGCGCTGGCGCTGCTCACGGCCCACCTCGCGCTGGCGCTGTGGGCCCCCCTCGCC---------GCGCCGCTGCGCGAGCGCTGTGCGCTCGCCGTCCGCGCCACCGGC---------------------------GCCAACGGCTCGCTCCGCTGGGAGCTGCGCGACCCCGGCGCCGTCTACGTCTGGGGCGGCGCGAACAACGCCACGCTCGCGGCCGACGCCCCG------------------TGCCGGCACGCCGTCGTGCAGCACATCCCGCCCGGGCTGCTCGACGGCGACGAAGCGCTGCACGGCCGCGTGCGCGCCGTGGCCGGCGCGCGCGATTGCCGCGCCTACCTGTGGTCCGCGCAGGCTCGC---AGCGCGCTGCTGGCATGGCTGCTGTACGTCGCGTTCGTGTACCTGCGCCAGGAGCGGCGCATGTTCGGCATTTGCCGCAACGACGCCGACTTCCTCAGCCCCGGCGGCTACACCCTCAACTACGCTGCCGCCGCGCTCGCGGCCGTAGTCGGCCACGGCCCGTACACGAAGCTCGCGCGGCTCATGTGCGAGCTCTCGGCGCGCCGGCGCGCGCTTGCTGTCAACTTCCGCCTCGACCCCCTGGGCTGCGCCTGGCGCCGCCCGGGGCTGCTGCTCCCGCTGCTTGCGGAGGGCTTGGCGCGGCTCGGCGCGCGGATTGCGGCGGCCAGCAGCGTCGGCATAACGCACGCGCCCTGCGCGGCCGCCTACCCGCTGTACCTGAAAATCTGGGCGTGGGTTCACGTCGCCCTCTTTGCCGGATTGGAACTGGTCTCGCTGCTATACCGCAAGCCCGCGCGGCGGCGCGGGGGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGGCGGC------------------GATGGCGGCGAGAGCGGGATCAGAAAGGTGTGCGTGAACTGCTGCTCCACGCTGCTCGCGGGGCTGCTCGTAAAGGCGCTCTACCTGGCCGCTATCGTGGGGGGCGTCATCGCGCTGCTGCACTACGAGCACAACCTGCGCCTGCGGCTGCTGGGC
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CELF_EHV1K/2-338 TTACTCGGTGGTAGAACGGCATACCTATCTGTACTGGGCCTTATCACCGCCTATGCCGCGTTTACCATCTGGTATACCCTCACC---------GCCCAGCTGCACAACCCCTGCGTGTACGCTACAGTTTCCATAGACTCTAAG---------------------GATGGGATTGCTGCCAAGTGGGAAGTATACAACTCCACTATAGTGTATGCGTACCCA---GAAAATGGAGCGAAGCGATTCAGCGACGGCCTGTCTGGATTTGACTACGTCTGCAGGGAGAACTGGGTAAACGAGTCCAAGCTCGACGTCCTGAAGAACATGAAGGAGCTGCACGACAAAGTGCGAATAGTGGTTGGCACTCGCAACTGTAGGGCTTACCTGTGGAGCGTGCAGCTGCAG---ATGATTACCGGGGCGTGGCTTATCTACATTGCGTTTTTGTGTTTGCGTCAAGAGCGCCGCTTGCTGGGACCCTTTAGAAACCAAAACGAGTTCTTATCGCCGACTGGCTACACCTTCAACTATGCTACCTATACGCTTGCTACCACCGTGCTCAAAACGCACTACACAAAGTTTGCTCTGCTGCTGTGCGAAGCGTCTCTGCGCCGCGTGGCTCTAAGCAGGACCTTTAAACGTGACCCCATAGGATTTCTCTGCGAGCACAGCGCCGCCCTGGCGCTCATCGGACTCGAGGTGGGAACGCATTTTGTGGCTAGACTCCTGGTAGTTGGAACCGTAACCTTGGTTCACACCCCCTGCTCTCAGATATACCCCATTTATCTTAAACTCGCCTCGTGGGGGTTTGTGGTGGCTGTAACTATAGTGGAGATAGTGGCTATTATCTACGAAAAGCCCCCAAAG---ACTGGCTCGAGCGCAAACCCCCCGACTCCC---------------------------GCCACCCACGGAGTGAAAGGCCTGTGTACCAGTTGCTGCTCCACGGTGCTGGCTAACCTGTGTGGGAAACTAGTCTATCTGCTACTTGTGATAGGCGCTGTGTCGATTCTGCTGCACTACGAACAGCGTATTCAAATTGGCTTATTGGGC
CELF_HHV1R/2-337 CTCGCCGTCCGTTCCCTGCAGCACCTCTCAACCGTCGTCTTGATAACGGCGTACGGCCTCGTGCTCGTGTGGTACACCGTCTTCGGT------GCCAGTCCGCTGCACCGATGTATTTACGCGGTACGCCCCACCGGCACCAAC---------------------AACGACACCGCCCTCGTGTGGATGAAAATGAACCAGACCCTATTGTTTCTGGGGGCCCCGACGCACCCC---------CCCAACGGGGGCTGGCGCAACCACGCCCATATCTGCTACGCCAATCTTATCGCGGGTAGGGTCGTGCCCTTCCAGGTCCCACCCGACGCCATGAATCGTCGGATCATGAACGTCCACGAGGCAGTTAACTGTCTGGAGACCCTATGGTACACACGGGTGCGT---CTGGTGGTCGTAGGGTGGTTCCTGTATCTGGCGTTCGTCGCCCTCCACCAACGCCGATGTATGTTTGGTGTCGTGAGTCCCGCCCACAAGATGGTGGCCCCGGCCACCTACCTCTTGAACTACGCAGGCCGCATCGTATCGAGCGTGTTCCTGCAGTACCCCTACACGAAAATTACCCGCCTGCTCTGCGAGCTGTCGGTCCAGCGGCAAAACCTGGTTCAGTTGTTTGAGACGGACCCGGTCACCTTCTTGTACCACCGCCCCGCCATCGGGGTCATCGTAGGCTGCGAGTTGATGCTACGCTTTGTGGCCGTGGGTCTCATCGTCGGCACCGCTTTCATATCCCGGGGGGCATGTGCAATCACATACCCCCTGTTTCTGACCATCACCACCTGGTGTTTTGTCTCCACCATCGGCCTGACAGAGCTGTATTGTATTCTGCGGCGGGGCCCGGCCCCCAAGAACGCAGACAAGGCCGCCGCCCCGGGGCGA------------------------------TCCAAGGGGCTGTCGGGCGTCTGCGGGCGCTGCTGTTCCATCATCCTCTCGGGCATCGCAGTGCGATTGTGTTATATCGCCGTGGTGGCCGGGGTGGTGCTCGTGGCGCTTCACTACGAGCAGGAGATCCAGAGGCGCCTGTTTGAT