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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF01538 alignment
(14 sequences with 861 bp)


P89968_9FLAV/620-902 GCCGTGGCGGGCGAGGTTTTTGCGGGCCCTGCCTTGTCCTGGTGCCTTGGGCTTCCCTTCGTGAGTATGATCCTGGGTCTCGCAAACCTGGTGTTGTACTTCCGTTGGATGGGCcctCAACGCCTGATGTTCCTCGTGTTGTGGAAGCTCGCTCGGGGAGCATTCCCACTGGCTTTGTTGATGGGGATTTCAGCCACCCGTGGCCGCACCTCCGTGCTCGGAGCCGAGTTCTGCTTTGATGTCACC---TTCGAAGTGGACACGTCAGTTTTGGGATGGGTGGTGGCCAGCGTGATAGCCTGGGCCATTGCGCTCCTGAGCTCCATGAGCGCCGGGGGCTGGAGGCACAAGGCTGTGATCTATAGAACGTGGTGTAAAGGGTACCAGTGGTTGCGTCACGAAGTGGTGCGGACCCCCCTCGGGGAG---GGGCGGCCCACCAAGCCGTTGACCATCGCTTGGTGCTTTGCTTCCTACATCTGGCCCGAAGCCGTGATGCTGGTGGTTGTTGGGCTGGTACCCTGGTTTGCCCTGTTCGACGCGTTGGATTGGGCCTTGGAGGAGATC------TTGGTGTCCCGGCCCTCGTTGCGGCGTTTGGCTCGGGTGGTTGAGTGCTGTGTGATGGCGGGTGAGAAGGCCACAACCGTCCGGCTGGTCTCCAAGATGTGTGCGCGTGGGGCCTATTTGTTCGACCATATGGGCTCTTTTTCGCGCTCGGTCAAGGAACGCCTGCTGCATTGGGACGCGGCCTTGGAACCCCTGTCTTTCACCAGGACGGACTGTCGCATCATCAGAGATGCTGCTCGGACCTTTGTCTGCGGTCAGTGTGTCACGGGCTTGCCCGTGGTCGATCGC
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POLG_HCVJ8/734-1009 AGGATCTGTGCATGCCTTTGGATGCTCATCATACTGGGCCAAGCCGAAGCGGCGCTTGAGAAGCTCATCATCTTGCACTCCGCTAGTGCTGCTAGTGCCAATGGTCCGCTGTGG...TTTTTCATCTTCTTTACAGCGGCCTGGTACTTAAAGGGCAGGGTGGTCCCCGTGGCCACGTACTCTGTCCTC------------GGCTTATGGTCCTTCCTCCTCCTAGTCCTGGCCTTACCACAGCAGGCTTATGCCTTGGACGCTGCTGAACAA------------GGGGAACTGGGGCTGGCCATATTAGTAATTATATCCATCTTTACTCTTACCCCAGCATACAAGATCCTCCTGAGCCGTTCAGTGTGGTGGCTGTCCTACATGCTGGTCTTGGCCGAGGCCCAGATTCAGCAATGGGTTCCCCCCCTGGAGGTCCGAGGGGGGCGTGACGGGATCATCTGGGTGGCTGTCATTCTACACCCACGCCTTGTGTTTGAGGTCACGAAATGGTTGTTAGCAATCCTGGGGCCTGCCTACCTCCTTAAAGCGTCTCTGCTACGGATACCGTACTTTGTGAGGGCCCACGCTTTGCTACGAGTGTGTACCCTGGTGAAA------CACCTCGCGGGGGCTAGGTACATCCAGATGCTGTTGATCACCATAGGCAGATGGACCGGCACTTACATCTACGACCACCTCTCCCCTTTATCAACTTGGGCGGCCCAGGGTTTGCGGGACCTGGCAATCGCCGTGGAGCCTGTGGTGTTCAGCCCAATGGAGAAGAAGGTCATTGTGTGGGGGGCTGAGACAGTGGCGTGTGGAGACATCCTGCATGGCCTCCCGGTCTCCGCGAGG