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PANDIT Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees |
PF01522 phylogeny |
| ((((((((Q9A5L9_CAUCR/35-168,((Q9XDJ5_BACFR/73-219,(((P94361_BACSU/113-240,(Q99ZT1_STRPY/154-283,Q9CJ95_LACLA/136-266)),((Q97GQ0_CLOAB/126-253,Q97TP4_CLOAB/83-210),Q97LW8_CLOAB/106-234)),(((YADE_ECOLI/226-368,(((Q54067_STAEP/107-248,Q9AIQ6_9STAP/107-248),Q99QX2_STAAM/108-249),Q9CHP6_LACLA/96-236)),(Q9PDB0_XYLFA/55-223,(O85100_ECOLI/55-215,Q99QG8_SHIFL/62-222))),((YCDR_ECOLI/101-271,Q9R7V4_YERPE/101-271),Q9FBM6_STRCO/131-288)))),((Q9V7Z2_DROME/67-203,Q97M42_CLOAB/8-133),((O82833_BACSP/1289-1406,Q52644_RUMAL/468-596),(Q9KVA7_VIBCH/402-543,(Q9PF00_XYLFA/74-213,((Q9KYG2_STRCO/47-184,Q98GK8_RHILO/808-946),Q982X7_RHILO/88-291))))))),Q9Z7L6_CHLPN/40-194),(((O13842_SCHPO/63-190,(Q9I3J6_PSEAE/64-185,(Q9A559_CAUCR/62-183,Q98CI8_RHILO/66-183))),P73597_SYNY3/44-199),((Q9ZMC6_HELPJ/25-146,Q9X9F8_YERPS/25-146),Q97BC0_THEVO/12-145))),Q9P3S0_NEUCR/45-179),(((((YFU2_BACST/61-186,(Q9XBJ5_BACCE/62-187,Q9KEF7_BACHD/63-188)),PDAA_BACSU/60-185),Q97EU7_CLOAB/97-223),(Q97GI4_CLOAB/50-174,((YBAN_BACSU/51-176,Q9JWQ7_BACHD/50-175),Q9KA84_BACHD/124-248))),(((O52780_CLOTM/474-598,Q9WXW8_THEMA/27-151),Q9KDB2_BACHD/39-162),((((CDA1_YEAST/102-222,CDA2_YEAST/112-232),((CHDE_MUCRO/151-274,Q9P4U2_PHYBL/143-276),Q9P453_SCHCO/35-158)),((Q59278_CELFI/47-175,Q9X8Z4_STRCO/86-212),(Q9PAV0_XYLFA/97-222,((Q9RV08_DEIRA/33-148,Q9RVF2_DEIRA/33-157),Q9EWZ7_STRCO/52-176)))),(((((Q9KBK9_BACHD/74-199,(Q9P9U2_XYLFA/249-384,(Q9L1T3_STRCO/85-207,Q9XAP6_STRCO/96-224))),(((((NODB_RHIME/15-140,((Q9Z3I7_BRASS/15-139,(((Q53253_RHITR/15-140,(NODB_RHILP/15-141,Q9AQ24_BRASW/15-140)),NODB_RHILO/15-140),(NODB_BRAEL/15-140,(P72333_RHIS3/15-140,Q9RAN6_MESS7/33-158)))),NODB_RHISN/12-137)),NODB_RHILV/15-140),NODB_RHIGA/13-138),NODB_RHILT/14-138),NODB_AZOCA/9-134)),(Q9CIS3_LACLA/170-291,(((O53444_MYCTU/41-164,Q9X791_MYCLE/41-164),((Q54413_STRLI/40-163,XYND_CELFI/350-474),(Q59300_9GAMM/387-510,Q59674_9GAMM/392-515))),Q9ZBN1_STRCO/59-183))),(((Y4760_STRCO/62-184,O86800_STRCO/103-225),Q9CCZ2_MYCLE/73-201),(Q9A6E1_CAUCR/17-152,((Q985U0_RHILO/77-213,Q9KEJ5_BACHD/75-214),O69838_STRCO/70-214)))),((Q99Z68_STRPY/235-356,(YJEA_BACSU/272-393,Q97PW1_STRPN/262-383)),Q9RCX4_STRCO/8-132)))))),(Q983K0_RHILO/61-197,(((((Q97ET9_CLOAB/86-214,Q97GH1_CLOAB/84-208),Q97DU4_CLOAB/83-214),Q97JC7_CLOAB/83-211),(Q97MV1_CLOAB/82-216,Q97K82_CLOAB/62-192)),Q97KF9_CLOAB/30-154))),(O07596_BACSU/79-203,Q9K630_BACHD/116-243)),Q99PX1_VIBAL/22-149,Q9KSH6_VIBCH/26-172); |
| ((((((((Q9A5L9_CAUCR/35-168:1.57144,((Q9XDJ5_BACFR/73-219:1.25726,(((P94361_BACSU/113-240:0.41458,(Q99ZT1_STRPY/154-283:0.43238,Q9CJ95_LACLA/136-266:0.40232):0.16845):0.23296,((Q97GQ0_CLOAB/126-253:0.40122,Q97TP4_CLOAB/83-210:0.62834):0.10436,Q97LW8_CLOAB/106-234:0.31739):0.08822):0.07293,(((YADE_ECOLI/226-368:0.77901,(((Q54067_STAEP/107-248:0.21638,Q9AIQ6_9STAP/107-248:0.21990):0.09470,Q99QX2_STAAM/108-249:0.15182):0.33594,Q9CHP6_LACLA/96-236:0.77928):0.16191):0.16725,(Q9PDB0_XYLFA/55-223:0.51385,(O85100_ECOLI/55-215:0.29067,Q99QG8_SHIFL/62-222:0.14227):0.22343):0.52521):0.08250,((YCDR_ECOLI/101-271:0.38992,Q9R7V4_YERPE/101-271:0.44442):0.50038,Q9FBM6_STRCO/131-288:0.99468):0.20216):0.11616):0.35063):0.06705,((Q9V7Z2_DROME/67-203:1.48410,Q97M42_CLOAB/8-133:0.60838):0.38037,((O82833_BACSP/1289-1406:1.04474,Q52644_RUMAL/468-596:0.83660):0.12996,(Q9KVA7_VIBCH/402-543:0.49525,(Q9PF00_XYLFA/74-213:0.58522,((Q9KYG2_STRCO/47-184:0.49326,Q98GK8_RHILO/808-946:1.11755):0.22995,Q982X7_RHILO/88-291:0.94741):0.09161):0.20181):0.16766):0.12717):0.04159):0.07608):0.06950,Q9Z7L6_CHLPN/40-194:1.71099):0.21363,(((O13842_SCHPO/63-190:0.51037,(Q9I3J6_PSEAE/64-185:0.24933,(Q9A559_CAUCR/62-183:0.19819,Q98CI8_RHILO/66-183:0.48032):0.10168):0.18832):0.52034,P73597_SYNY3/44-199:0.71433):0.26198,((Q9ZMC6_HELPJ/25-146:0.09758,Q9X9F8_YERPS/25-146:0.22342):0.35907,Q97BC0_THEVO/12-145:0.70147):0.32975):0.34349):0.08893,Q9P3S0_NEUCR/45-179:1.45314):0.05803,(((((YFU2_BACST/61-186:0.18905,(Q9XBJ5_BACCE/62-187:0.19182,Q9KEF7_BACHD/63-188:0.35047):0.08381):0.09629,PDAA_BACSU/60-185:0.34104):0.09712,Q97EU7_CLOAB/97-223:0.38510):0.31438,(Q97GI4_CLOAB/50-174:0.56353,((YBAN_BACSU/51-176:0.40078,Q9JWQ7_BACHD/50-175:0.36704):0.56644,Q9KA84_BACHD/124-248:0.68504):0.00538):0.08993):0.07993,(((O52780_CLOTM/474-598:0.28909,Q9WXW8_THEMA/27-151:0.45257):0.40386,Q9KDB2_BACHD/39-162:0.72279):0.11165,((((CDA1_YEAST/102-222:0.25918,CDA2_YEAST/112-232:0.16297):0.54041,((CHDE_MUCRO/151-274:0.39209,Q9P4U2_PHYBL/143-276:0.33567):0.23066,Q9P453_SCHCO/35-158:0.64323):0.18494):0.30179,((Q59278_CELFI/47-175:0.75870,Q9X8Z4_STRCO/86-212:0.67720):0.26242,(Q9PAV0_XYLFA/97-222:0.74968,((Q9RV08_DEIRA/33-148:0.82204,Q9RVF2_DEIRA/33-157:0.50127):0.24751,Q9EWZ7_STRCO/52-176:0.49192):0.18242):0.18320):0.10448):0.15042,(((((Q9KBK9_BACHD/74-199:0.61252,(Q9P9U2_XYLFA/249-384:0.99653,(Q9L1T3_STRCO/85-207:0.36558,Q9XAP6_STRCO/96-224:0.25226):0.39208):0.10238):0.11319,(((((NODB_RHIME/15-140:0.16512,((Q9Z3I7_BRASS/15-139:0.44208,(((Q53253_RHITR/15-140:0.19591,(NODB_RHILP/15-141:0.23767,Q9AQ24_BRASW/15-140:0.27627):0.02611):0.03078,NODB_RHILO/15-140:0.22411):0.04535,(NODB_BRAEL/15-140:0.16538,(P72333_RHIS3/15-140:0.05247,Q9RAN6_MESS7/33-158:0.33906):0.05845):0.02369):0.01946):0.04780,NODB_RHISN/12-137:0.14309):0.08189):0.07931,NODB_RHILV/15-140:0.15755):0.05343,NODB_RHIGA/13-138:0.27988):0.10644,NODB_RHILT/14-138:0.18190):0.33529,NODB_AZOCA/9-134:0.73370):0.20161):0.13248,(Q9CIS3_LACLA/170-291:0.55466,(((O53444_MYCTU/41-164:0.11588,Q9X791_MYCLE/41-164:0.12668):0.41459,((Q54413_STRLI/40-163:0.24623,XYND_CELFI/350-474:0.41946):0.13330,(Q59300_9GAMM/387-510:0.10767,Q59674_9GAMM/392-515:0.13848):0.35297):0.35108):0.17266,Q9ZBN1_STRCO/59-183:0.42694):0.12402):0.08127):0.02493,(((Y4760_STRCO/62-184:0.69704,O86800_STRCO/103-225:0.23012):0.56713,Q9CCZ2_MYCLE/73-201:0.94627):0.26487,(Q9A6E1_CAUCR/17-152:1.08627,((Q985U0_RHILO/77-213:0.79074,Q9KEJ5_BACHD/75-214:0.68749):0.27815,O69838_STRCO/70-214:0.93300):0.21334):0.07430):0.12166):0.04931,((Q99Z68_STRPY/235-356:0.45717,(YJEA_BACSU/272-393:0.41315,Q97PW1_STRPN/262-383:0.34624):0.22308):0.12114,Q9RCX4_STRCO/8-132:0.64862):0.04911):0.05299):0.08781):0.06726):0.07194):0.18509,(Q983K0_RHILO/61-197:1.25241,(((((Q97ET9_CLOAB/86-214:0.19545,Q97GH1_CLOAB/84-208:0.31301):0.03411,Q97DU4_CLOAB/83-214:0.21932):0.11793,Q97JC7_CLOAB/83-211:0.31809):0.12252,(Q97MV1_CLOAB/82-216:0.61328,Q97K82_CLOAB/62-192:0.52549):0.10466):0.16880,Q97KF9_CLOAB/30-154:0.76383):0.14041):0.15592):0.19970,(O07596_BACSU/79-203:0.53700,Q9K630_BACHD/116-243:0.42458):0.37676):1.26831,Q99PX1_VIBAL/22-149:0.12404,Q9KSH6_VIBCH/26-172:0.11243); |