PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam
 pan•dit |
PANDIT Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees |
PF01522 phylogeny |
| ((((((((((((((((Q985U0_RHILO/77-213,Q9CCZ2_MYCLE/73-201),(((O69838_STRCO/70-214,Q983K0_RHILO/61-197),((Q9A5L9_CAUCR/35-168,(Q9Z7L6_CHLPN/40-194,Q9FBM6_STRCO/131-288)),Q9V7Z2_DROME/67-203)),(Y4760_STRCO/62-184,O86800_STRCO/103-225))),((((Q9L1T3_STRCO/85-207,Q9XAP6_STRCO/96-224),(((O53444_MYCTU/41-164,Q9X791_MYCLE/41-164),Q9ZBN1_STRCO/59-183),((Q54413_STRLI/40-163,XYND_CELFI/350-474),(Q59300_9GAMM/387-510,Q59674_9GAMM/392-515)))),(((Q59278_CELFI/47-175,Q9X8Z4_STRCO/86-212),(Q9PAV0_XYLFA/97-222,((Q9RV08_DEIRA/33-148,Q9RVF2_DEIRA/33-157),Q9EWZ7_STRCO/52-176))),(Q9A6E1_CAUCR/17-152,(Q9P453_SCHCO/35-158,((CHDE_MUCRO/151-274,Q9P4U2_PHYBL/143-276),(CDA1_YEAST/102-222,CDA2_YEAST/112-232)))))),Q9RCX4_STRCO/8-132)),(((NODB_RHILV/15-140,(NODB_RHIGA/13-138,(NODB_RHIME/15-140,((NODB_RHILP/15-141,((P72333_RHIS3/15-140,Q9RAN6_MESS7/33-158),((Q53253_RHITR/15-140,NODB_RHILO/15-140),(Q9AQ24_BRASW/15-140,(NODB_BRAEL/15-140,Q9Z3I7_BRASS/15-139))))),NODB_RHISN/12-137)))),NODB_RHILT/14-138),NODB_AZOCA/9-134)),Q9P3S0_NEUCR/45-179),((Q52644_RUMAL/468-596,((Q98GK8_RHILO/808-946,(Q982X7_RHILO/88-291,((Q9KYG2_STRCO/47-184,O82833_BACSP/1289-1406),Q9PF00_XYLFA/74-213))),(Q9KVA7_VIBCH/402-543,(((((P94361_BACSU/113-240,Q97LW8_CLOAB/106-234),(Q97GQ0_CLOAB/126-253,Q97TP4_CLOAB/83-210)),(((YCDR_ECOLI/101-271,Q9R7V4_YERPE/101-271),(YADE_ECOLI/226-368,(((Q54067_STAEP/107-248,Q9AIQ6_9STAP/107-248),Q99QX2_STAAM/108-249),Q9CHP6_LACLA/96-236))),(Q99ZT1_STRPY/154-283,Q9CJ95_LACLA/136-266))),(Q9PDB0_XYLFA/55-223,(O85100_ECOLI/55-215,Q99QG8_SHIFL/62-222))),Q9XDJ5_BACFR/73-219)))),Q9KEJ5_BACHD/75-214)),(((O13842_SCHPO/63-190,(Q98CI8_RHILO/66-183,(Q9A559_CAUCR/62-183,Q9I3J6_PSEAE/64-185))),P73597_SYNY3/44-199),((Q9ZMC6_HELPJ/25-146,Q9X9F8_YERPS/25-146),Q97BC0_THEVO/12-145))),Q9KBK9_BACHD/74-199),(Q9P9U2_XYLFA/249-384,(YJEA_BACSU/272-393,Q97PW1_STRPN/262-383))),(Q9CIS3_LACLA/170-291,Q99Z68_STRPY/235-356)),(O52780_CLOTM/474-598,Q9WXW8_THEMA/27-151)),(Q97GI4_CLOAB/50-174,Q97M42_CLOAB/8-133)),(((((Q9XBJ5_BACCE/62-187,Q9KEF7_BACHD/63-188),YFU2_BACST/61-186),PDAA_BACSU/60-185),Q97EU7_CLOAB/97-223),((YBAN_BACSU/51-176,Q9JWQ7_BACHD/50-175),Q9KA84_BACHD/124-248))),((Q97MV1_CLOAB/82-216,(((Q97JC7_CLOAB/83-211,Q97GH1_CLOAB/84-208),(Q97DU4_CLOAB/83-214,Q97ET9_CLOAB/86-214)),Q97K82_CLOAB/62-192)),Q97KF9_CLOAB/30-154)),((O07596_BACSU/79-203,Q9K630_BACHD/116-243),Q9KDB2_BACHD/39-162)),Q99PX1_VIBAL/22-149,Q9KSH6_VIBCH/26-172); |
| ((((((((((((((((Q985U0_RHILO/77-213:0.56902,Q9CCZ2_MYCLE/73-201:0.49775):0.13140,(((O69838_STRCO/70-214:0.37586,Q983K0_RHILO/61-197:0.58288):0.03193,((Q9A5L9_CAUCR/35-168:0.56552,(Q9Z7L6_CHLPN/40-194:0.98652,Q9FBM6_STRCO/131-288:0.41671):0.16644):0.10682,Q9V7Z2_DROME/67-203:0.88276):0.08799):0.03502,(Y4760_STRCO/62-184:0.29410,O86800_STRCO/103-225:0.16656):0.31355):0.06101):0.04293,((((Q9L1T3_STRCO/85-207:0.18911,Q9XAP6_STRCO/96-224:0.21306):0.22365,(((O53444_MYCTU/41-164:0.08959,Q9X791_MYCLE/41-164:0.18171):0.27836,Q9ZBN1_STRCO/59-183:0.26682):0.10643,((Q54413_STRLI/40-163:0.19023,XYND_CELFI/350-474:0.26098):0.07151,(Q59300_9GAMM/387-510:0.17185,Q59674_9GAMM/392-515:0.15234):0.31895):0.11411):0.02767):0.07696,(((Q59278_CELFI/47-175:0.29400,Q9X8Z4_STRCO/86-212:0.37028):0.11708,(Q9PAV0_XYLFA/97-222:0.60329,((Q9RV08_DEIRA/33-148:0.40119,Q9RVF2_DEIRA/33-157:0.29968):0.10774,Q9EWZ7_STRCO/52-176:0.25112):0.09836):0.11055):0.06738,(Q9A6E1_CAUCR/17-152:0.62654,(Q9P453_SCHCO/35-158:0.33438,((CHDE_MUCRO/151-274:0.35393,Q9P4U2_PHYBL/143-276:0.19171):0.10950,(CDA1_YEAST/102-222:0.32835,CDA2_YEAST/112-232:0.08951):0.53551):0.13644):0.21935):0.04259):0.04028):0.04424,Q9RCX4_STRCO/8-132:0.32696):0.03683):0.16237,(((NODB_RHILV/15-140:0.14562,(NODB_RHIGA/13-138:0.27958,(NODB_RHIME/15-140:0.15420,((NODB_RHILP/15-141:0.26472,((P72333_RHIS3/15-140:0.06769,Q9RAN6_MESS7/33-158:0.21701):0.04382,((Q53253_RHITR/15-140:0.17849,NODB_RHILO/15-140:0.13341):0.04567,(Q9AQ24_BRASW/15-140:0.20718,(NODB_BRAEL/15-140:0.11800,Q9Z3I7_BRASS/15-139:0.26694):0.09926):0.06317):0.00659):0.03670):0.03192,NODB_RHISN/12-137:0.15414):0.05864):0.05916):0.05405):0.06636,NODB_RHILT/14-138:0.20020):0.20504,NODB_AZOCA/9-134:0.57966):0.11035):0.13421,Q9P3S0_NEUCR/45-179:0.71555):0.14183,((Q52644_RUMAL/468-596:0.60586,((Q98GK8_RHILO/808-946:0.74131,(Q982X7_RHILO/88-291:0.52782,((Q9KYG2_STRCO/47-184:0.34413,O82833_BACSP/1289-1406:0.60384):0.12180,Q9PF00_XYLFA/74-213:0.44850):0.06964):0.07330):0.24995,(Q9KVA7_VIBCH/402-543:0.41057,(((((P94361_BACSU/113-240:0.47863,Q97LW8_CLOAB/106-234:0.21149):0.05550,(Q97GQ0_CLOAB/126-253:0.29160,Q97TP4_CLOAB/83-210:0.39736):0.14288):0.06430,(((YCDR_ECOLI/101-271:0.32309,Q9R7V4_YERPE/101-271:0.35250):0.39106,(YADE_ECOLI/226-368:0.65271,(((Q54067_STAEP/107-248:0.21762,Q9AIQ6_9STAP/107-248:0.21027):0.06774,Q99QX2_STAAM/108-249:0.16079):0.21804,Q9CHP6_LACLA/96-236:0.39832):0.07916):0.07636):0.05659,(Q99ZT1_STRPY/154-283:0.36703,Q9CJ95_LACLA/136-266:0.27688):0.11581):0.10184):0.06157,(Q9PDB0_XYLFA/55-223:0.47623,(O85100_ECOLI/55-215:0.28835,Q99QG8_SHIFL/62-222:0.16804):0.12283):0.35539):0.11324,Q9XDJ5_BACFR/73-219:0.70266):0.08802):0.08757):0.10417):0.06310,Q9KEJ5_BACHD/75-214:0.63634):0.09657):0.06696,(((O13842_SCHPO/63-190:0.45963,(Q98CI8_RHILO/66-183:0.25608,(Q9A559_CAUCR/62-183:0.19516,Q9I3J6_PSEAE/64-185:0.21994):0.10599):0.31298):0.25475,P73597_SYNY3/44-199:0.54281):0.10895,((Q9ZMC6_HELPJ/25-146:0.09617,Q9X9F8_YERPS/25-146:0.35947):0.16352,Q97BC0_THEVO/12-145:0.57784):0.20413):0.25166):0.05563,Q9KBK9_BACHD/74-199:0.49381):0.05050,(Q9P9U2_XYLFA/249-384:0.69758,(YJEA_BACSU/272-393:0.33850,Q97PW1_STRPN/262-383:0.29146):0.10956):0.06867):0.07955,(Q9CIS3_LACLA/170-291:0.42248,Q99Z68_STRPY/235-356:0.37287):0.08298):0.02241,(O52780_CLOTM/474-598:0.32286,Q9WXW8_THEMA/27-151:0.34411):0.32513):0.06444,(Q97GI4_CLOAB/50-174:0.27650,Q97M42_CLOAB/8-133:0.70560):0.16643):0.05903,(((((Q9XBJ5_BACCE/62-187:0.24274,Q9KEF7_BACHD/63-188:0.30393):0.08614,YFU2_BACST/61-186:0.20859):0.05418,PDAA_BACSU/60-185:0.28326):0.11175,Q97EU7_CLOAB/97-223:0.31666):0.12467,((YBAN_BACSU/51-176:0.39088,Q9JWQ7_BACHD/50-175:0.28078):0.31761,Q9KA84_BACHD/124-248:0.48035):0.10409):0.06384):0.03588,((Q97MV1_CLOAB/82-216:0.44040,(((Q97JC7_CLOAB/83-211:0.22040,Q97GH1_CLOAB/84-208:0.22313):0.06302,(Q97DU4_CLOAB/83-214:0.15267,Q97ET9_CLOAB/86-214:0.17996):0.04506):0.10574,Q97K82_CLOAB/62-192:0.40275):0.05754):0.10042,Q97KF9_CLOAB/30-154:0.40919):0.17036):0.16209,((O07596_BACSU/79-203:0.53024,Q9K630_BACHD/116-243:0.29707):0.18804,Q9KDB2_BACHD/39-162:0.49763):0.05042):0.64011,Q99PX1_VIBAL/22-149:0.22072,Q9KSH6_VIBCH/26-172:0.11448); |