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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF01396 alignment
(27 sequences with 129 bp)


YRDD_HAEIN/101-141 AAAATTACTTGTCCTGAATGTAAAACGGGACATTTGATTTCTCGTCGAGGTCGCCAAGGA...---AAGATTTTTTACGGCTGTGATAATTTCCCTAAATGTAAATTTTCTTTGCCTGCCAAGCCTTAT
YRDD_ECOLI/103-143 GCAATTACATGCCCCCAATGTCGGACGGGCCATCTGGTCCAGCGCCGCTCCCGTTATGGC...---AAAACATTTCACTCTTGTGATCGCTACCCGGAGTGTCAATTTGCCATTAACTTCAAACCCATA
TOP1_HELPY/660-698 GGCGTGAAATGCCCAGAATGCGGA---GGGGATATTGCTTTAAAAAGGAGTAAGAAAGGC...------TCGTTTTATGGCTGTAACAATTACCCTAAATGCAATTTTTTATCCAACCATAAGCCCATC
TOP1_BACSU/616-656 GGTGTGAAGTGCCCGAGCTGCGGAGAAGGAAACATTGTTGAGCGAAAATCGAAAAAGAAA...---CGGGTGTTTTACGGCTGTGACCGTTATCCGGACTGTGAATTCGTATCATGGGACAAACCAATT
YRDD_HAEIN/59-97 GATGAAATTTGCCCGAAGTGCGGT---AATTTATTGCAGTTGAAACAAGGCAGTTTTGGG...------ATGTTTATTGGTTGTAGTCATTATCCTGAATGCGATTTTGTGGTGCGGGAAGAATCTGAA
YRDD_HAEIN/12-50 CAGGAATATTGCCCTCAATGTGGT---GCGCCGTTGCAAATTAAACAAGGCAAAAAAGGG...------CTGTTTCTAGGTTGCTCTGCTTATCCTGAATGTGATTATTTGCGTCCTTTGCAACGATCG
TOP1_METJA/718-756 GTAGGAAAATGCCCTAAATGTGGA---GGAGATTTAGTTGTTAGAGAAGGTAAGTTTGGA...------AAGTTTGTTGGTTGCTCTAACTATCCAAAGTGTAGATATACTGAAAAACTAAAACTAAAT
TOP1_METTH/677-715 GTCGGTAAATGCCCTGAATGTGGT---TCAGACCTCATAAAGCGCTCCGGACGTTACGGG...------GAATTCGTCGGTTGTAAGGGATTCCCGAAGTGTCGCTTCACCTGTTCCGTTGATGAGGTC
TOP1_METJA/677-715 GATAGGATTTGCCCAAAGTGCGGA---GCTAAGCTAATTTTAAAGAAAGGAGTTTATGGA...------GCATTTTATGGTTGTTCAAACTATCCAAAGTGTAAATATACAGAACCAATAAATAAAAAA
Q43888_STRAG/238-272 GTAGGAAAATGTCCTAAGTGTGGC---AACAATATTGTATTAAAAAAATCG---------...---------TTTTATGGTTGTTCAAATTATCCTGAATGTAAGTTTACTTTAGCTGAACATTTTAGA
Q60149_STRPY/630-664 GTAGGCAAATGTCCTAAGTGCGGC---AATAATATTGTATTAAAAAAATCG---------...---------TTTTATGGTTGTTCAAATTATCCTGAATGTAAGTTCACTTTAGCTGAACATTTTAGA
YRDD_ECOLI/61-99 GGGCAGGTTTGCCCTGCATGTGGC---GCAAATCTGGTATTACGCCAGGGACGCTTTGGT...------ATGTTTATTGGTTGCATTAACTACCCTGAATGCGAACATACCGAACTTATCGATAAACCG
TOP1_BACAN/602-634 GTATGCCAATGCCCT---TGTGGA---AATGGAATAATCTTAGATAGAGGA---------...------AAGTTTTTCGGGTGTAGCAATCACCCGAACTGTAAC------AAGGGATTACCCAAAAGA
TOP1_METJA/597-635 GTTGGAAAATGTCCTAAATGTGGAGGAGACTTAATTTTAATAAGACATAAAAAGGGC---...------AGGTTTGTTGGCTGCTCTAACTATCCTGAATGTGATGTAAAATACTCCTTACCAGATAAA
TOP1_ARCFU/580-619 GTTGGAAAATGTCCAGAATGTGGTGGAGAGCTTGTGGTGAGACAGTCCAAGGCCGGTAAG...------AGGTTCATAGGTTGCAGCAACTATCCTGACTGCACCTTCACCCTTCCACTTCCCCAGAAT
TOP1_METTH/595-635 GTGGGTGAATGCCCCGCCTGTGGT---GGGAAGCTCGTCATAAAATACTCTCCCAGAAAC...AGGAGCACCTTTGTGGGGTGTTCCAGCTACCCTGACTGCAGGACCGTTTACTCACTTCCAAGGGGC
Y664_METJA/263-301 GATAACACTTGCCCATGGTGTGGA---GCTAAGTTGAGAGTAGTTAGAACAAAAAAAGGA...------GAGTTCTTGGGATGCACAAATTATCCAAACTGTCTATATAGAAGATTTCCAAAGAAAAAT
TOP1_MYCPN/670-711 GAAGAACTGTGTCCGGAGTGTAAC---AGCCAACTAGTGAAAAGACGCACTAAGTTTAATcccAATAAAACCTTTGTTGGTTGTAGTAATTTCCCTAGGTGCCGCTACATAAAGAAGGATAATGCTAGC
TOP1_MYCGE/664-705 GATGAATTGTGTCCTGAGTGTAAC---AATAAACTGGTTAAGAGGAGAACTAAATTTAACgctAAAAAGACCTTTATAGGTTGCAGTAATTTCCCTAACTGCCGTTTTATCAAAAAGGATAATGCTGCT
TOP1_MYCPN/621-661 GGTCGTGATTGTCCAAGCTGTGCT---AGTCCCTTGTTGTACCGCTATACTAAACGGGGT...AATGAAAAGTTTGTTGGGTGCAGTAACTTTCCCAACTGTAAATACAACGAGTTTAGCCAAAATAAA
TOP1_MYCGE/615-655 GAAAGAGATTGTCCTAAATGTAAT---CAACCGTTGGTATATCGTTACACCAAAAGAGGT...AATGAGAAGTTTGTTGGTTGTAGTGATTTTCCTAAGTGTAAATACAGTGAGTTTAGTAATCCTAAA
TOP1_HELPY/613-651 CAAGAATTGTGCGAAAAATGCGGA---GGGGAAATGGTGCAAAAATTCAGCAGAAACGGG...------GCGTTTTTAGCTTGCAACAATTACCCTGAATGCAAAAACACCAAATCGTTAAAAAACACC
TOP1_HELPY/569-607 GGTCAATCATGCCCTAAATGCGGT---GGGGAATTAGTCAAAAAAAATAGCCGTTATGGG...------GAGTTTATCGCTTGCAACAATTACCCTAAATGCAAATATGTCAAACAAACTGAAAGCGCT
TOP1_HAEIN/713-748 GTTGTTGAGTGTGATAAATGCGGT---GCGGATATGCATCTAAAACTTGGTCGTTTTGGC...------AAGTATATGGGATGTACAAAT---------TGTGATAACACACGCAAAATTTTGAAAAAT
TOP1_ECOLI/708-745 ATCGTTGAGTGTGAAAAATGTGGC---TCTGAAATGCACCTGAAAATGGGGCGTTTCGGT...------AAATACATGGCCTGCACCAACGAA---GAGTGTAAAAACACACGTAAGATTTTACGTAAC
TOP1_BACSU/576-614 GGAGAGGATTGTGAATTGTGCAGT---TCTCCAATGGTATATAAAATGGGACGGTACGGT...------AAATTCTTAGCTTGCTCCAACTTCCCTGACTGCCGGAACACGAAACCGATTGTGAAACAA
TP3A_HUMAN/655-694 ATCAGGAAGTGCCCACAGTGCAAC---AAGGACATGGTCCTTAAGACCAAGAAGAATGGC...---GGGTTCTACCTCAGCTGCATGGGTTTCCCAGAGTGTCGCTCAGCTGTGTGGCTTCCTGACTCG