EMBL-EBI > Goldman Group

PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam



PANDIT Homepage
pan•dit
PANDIT
Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF01193 phylogeny
for amino acid alignment


 
(((((((((((((((((((((Q48981_MYCCA/17-232,RPOA_MYCGA/17-237),((RPOA_UREPA/18-240,RPOA_MYCGE/19-242),RPOA_MYCPE/18-240)),(((RPOA_FUSNN/18-228,((RPOA_BIFLO/12-224,RPOA_MYCTU/16-224),RPOA_CORGL/16-223)),((RPOA_CHLPN/30-255,RPOA_CHLMU/32-257),(((((RPOA_RALSO/14-229,RPOA_BORPE/15-230),(RPOA_NEIMB/14-232,(RPOA_HELPY/20-236,RPOA_CAMJE/21-229))),RPOA_XYLFT/21-232),((RPOA_BUCAP/20-233,RPOA_WIGBR/21-231),((RPOA_HAEIN/21-232,(RPOA_VIBCH/21-234,(RPOA_PSEPU/21-232,RPOA_SHESP/21-232))),RPOA_BUCBP/21-235))),((RPOA_RICCN/24-234,RPOA_CAUCR/22-232),RPOA_BRUME/23-231)))),RPOA_CHLTE/19-229)),((Q8GE27_HELMO/17-226,((RPOA_STRP3/14-224,RPOA_LACLA/16-224),(RPOA_LACPL/16-226,(RPOA_STAAW/17-226,(RPOA_LISMO/17-226,RPOA_BACHD/17-226))))),((RPOA_CLOAB/17-226,RPOA_CLOPE/17-226),RPOA_THETN/17-226))),((RPOA_TREPA/21-243,RPOA_LEPIN/23-236),(RPOA_AQUAE/18-227,(RPOA_DEIRA/13-221,RPOA_THEAQ/14-227)))),((RPOA_MYCSP/15-243,RPOA_MYCPU/15-244),RPOA_THEMA/17-232)),RPOA_BACTN/18-230),RPOA_BORBU/25-245),((((RPOA_CHLRE/29-324,RPOA_SCEOB/18-125),Q9BAC8_FUCVE/15-225),RPOA_NEPOL/12-299),((((RPOA_CHLVU/17-272,RPOA_CYACA/18-228),RPOA_MESVI/19-230),(RPOA_SPIMX/22-230,(RPOA_CHAGL/23-231,((RPOA_MARQU/29-237,(RPOA_MARPO/23-231,RPOA_PSINU/23-231)),(((RPOA_PINTH/23-231,(RPOA_ARATH/23-231,RPOA_CUSRE/23-229)),RPOA_PHAAN/23-231),Q8LVZ8_ELYCA/23-231))))),((RPOA_CYAPA/14-225,(RPOA_ODOSI/14-225,(RPOA_GUITH/14-225,(RPOA_PYRSA/14-225,RPOA_PORPU/14-225)))),(((RPOA_SYNEL/13-233,RPOA_SYNP6/13-225),RPOA_SYNY3/14-226),RPOA_ANASP/14-226))))),Q8IEN9_PLAF7/258-464),(Q8IKB1_PLAF7/439-675,((((((RPOL_METTH/5-80,RPOL_HALN1/7-88),RPOL_PYRFU/7-87),RPOL_METJA/7-93),(RPOL_SULSO/9-85,(RPOL_SULAC/7-85,RPOL_SULTO/10-85))),(Q9C256_NEUCR/29-103,(((Q8ILU4_PLAF7/10-87,((RPA9_MOUSE/36-112,(RPC19_CAEEL/57-133,Q9VIZ0_DROME/15-82)),(RPC19_YEAST/59-133,RPC19_SCHPO/33-107))),Q42483_ARATH/6-83),((RPB11_ARATH/29-103,(RPB11_CAEEL/28-102,(RPB11_MOUSE/29-103,Q8IH32_DROME/29-122))),(RPB11_YEAST/29-103,RPB11_SCHPO/28-102))))),RPOL_METKA/16-101))),(RPOA_EUGST/22-209,RPOA_RECAM/19-221)),RPOA_EUGMY/25-203),CNJC_TETTH/14-295),(Q8IHT3_PLAF7/54-325,(Q9U177_LEIMA/118-423,((((Q39216_ARATH/90-382,Q8LD68_ARATH/82-374),(((Q9UAY9_CAEEL/66-359,O08521_CRIGR/55-339),Q9VMX3_DROME/51-328),RPA5_HUMAN/58-338)),RPC5_YEAST/48-330),Q8SSL9_ENCCU/40-297)))),((Q8I2S6_PLAF7/21-304,(Q8SRR5_ENCCU/12-234,((Q9P5U3_NEUCR/24-270,(RPB3_SCHPO/15-261,RPB3_YEAST/16-260)),(Q93338_CAEEL/13-269,((O97183_DROME/17-262,Q8IGG6_DROME/17-104),RPB3_HUMAN/17-261))))),(Q8MUV1_GIALA/12-301,Q8LAJ1_ARATH/16-298))),((RPOD_PYRAE/8-248,RPOD_THEVO/10-267),((((RPOD_METKA/17-266,(RPOD_METMA/12-261,(RPOD_HALN1/12-244,RPOD_HALMA/14-255))),RPOD_METTH/7-259),RPOD_ARCFU/13-258),(RPOD_METJA/12-184,(RPOD_PYRHO/12-252,RPOD_PYRFU/14-254))))),(Q98S79_GUITH/60-325,Q9AW23_GUITH/9-291)),RPOD_AERPE/19-280),RPOD_SULSO/9-258),RPOD_SULTO/10-259,RPOD_SULAC/7-258);
(((((((((((((((((((((Q48981_MYCCA/17-232:0.29941,RPOA_MYCGA/17-237:0.24201):0.07604,((RPOA_UREPA/18-240:0.40426,RPOA_MYCGE/19-242:0.29499):0.06096,RPOA_MYCPE/18-240:0.32064):0.11068):0.19099,(((RPOA_FUSNN/18-228:0.47874,((RPOA_BIFLO/12-224:0.10863,RPOA_MYCTU/16-224:0.04732):0.00536,RPOA_CORGL/16-223:0.07167):0.35994):0.08494,((RPOA_CHLPN/30-255:0.05051,RPOA_CHLMU/32-257:0.16115):0.49873,(((((RPOA_RALSO/14-229:0.09927,RPOA_BORPE/15-230:0.03875):0.10426,(RPOA_NEIMB/14-232:0.17438,(RPOA_HELPY/20-236:0.32284,RPOA_CAMJE/21-229:0.40014):0.48154):0.07480):0.10396,RPOA_XYLFT/21-232:0.21555):0.03802,((RPOA_BUCAP/20-233:0.05923,RPOA_WIGBR/21-231:0.04641):0.01175,((RPOA_HAEIN/21-232:0.05162,(RPOA_VIBCH/21-234:0.05380,(RPOA_PSEPU/21-232:0.12283,RPOA_SHESP/21-232:0.00000):0.03045):0.01536):0.06403,RPOA_BUCBP/21-235:0.13413):0.03281):0.21583):0.22166,((RPOA_RICCN/24-234:0.24163,RPOA_CAUCR/22-232:0.12386):0.09303,RPOA_BRUME/23-231:0.11553):0.06828):0.06657):0.06792):0.07480,RPOA_CHLTE/19-229:0.45837):0.03965):0.05146,((Q8GE27_HELMO/17-226:0.15763,((RPOA_STRP3/14-224:0.15554,RPOA_LACLA/16-224:0.05016):0.10280,(RPOA_LACPL/16-226:0.04080,(RPOA_STAAW/17-226:0.10614,(RPOA_LISMO/17-226:0.08135,RPOA_BACHD/17-226:0.01519):0.04211):0.05390):0.05454):0.03951):0.02898,((RPOA_CLOAB/17-226:0.07555,RPOA_CLOPE/17-226:0.14283):0.09115,RPOA_THETN/17-226:0.21098):0.11919):0.04625):0.05681,((RPOA_TREPA/21-243:0.36898,RPOA_LEPIN/23-236:0.17175):0.16504,(RPOA_AQUAE/18-227:0.41299,(RPOA_DEIRA/13-221:0.30246,RPOA_THEAQ/14-227:0.09588):0.20715):0.07818):0.07703):0.19785,((RPOA_MYCSP/15-243:0.28224,RPOA_MYCPU/15-244:0.29027):0.42693,RPOA_THEMA/17-232:0.42476):0.09815):0.02838,RPOA_BACTN/18-230:0.33530):0.03874,RPOA_BORBU/25-245:0.38739):0.07372,((((RPOA_CHLRE/29-324:0.57106,RPOA_SCEOB/18-125:0.59413):0.39796,Q9BAC8_FUCVE/15-225:0.67519):0.12088,RPOA_NEPOL/12-299:0.47345):0.08349,((((RPOA_CHLVU/17-272:0.72354,RPOA_CYACA/18-228:0.28475):0.11027,RPOA_MESVI/19-230:0.31745):0.05987,(RPOA_SPIMX/22-230:0.51763,(RPOA_CHAGL/23-231:0.25464,((RPOA_MARQU/29-237:0.21048,(RPOA_MARPO/23-231:0.11565,RPOA_PSINU/23-231:0.13465):0.06018):0.04361,(((RPOA_PINTH/23-231:0.13798,(RPOA_ARATH/23-231:0.03708,RPOA_CUSRE/23-229:0.06259):0.02611):0.01281,RPOA_PHAAN/23-231:0.05062):0.02168,Q8LVZ8_ELYCA/23-231:0.04621):0.09174):0.14014):0.07737):0.26418):0.06605,((RPOA_CYAPA/14-225:0.24324,(RPOA_ODOSI/14-225:0.49409,(RPOA_GUITH/14-225:0.26407,(RPOA_PYRSA/14-225:0.29214,RPOA_PORPU/14-225:0.21609):0.06536):0.06603):0.03897):0.05519,(((RPOA_SYNEL/13-233:0.23143,RPOA_SYNP6/13-225:0.10147):0.07873,RPOA_SYNY3/14-226:0.27088):0.06483,RPOA_ANASP/14-226:0.05522):0.12632):0.01198):0.07474):0.06405):0.09204,Q8IEN9_PLAF7/258-464:1.35855):0.11415,(Q8IKB1_PLAF7/439-675:1.35001,((((((RPOL_METTH/5-80:0.50295,RPOL_HALN1/7-88:0.74193):0.14739,RPOL_PYRFU/7-87:0.55214):0.11947,RPOL_METJA/7-93:0.57947):0.14941,(RPOL_SULSO/9-85:0.28086,(RPOL_SULAC/7-85:0.21728,RPOL_SULTO/10-85:0.07851):0.32869):0.20214):0.08427,(Q9C256_NEUCR/29-103:0.48565,(((Q8ILU4_PLAF7/10-87:0.41703,((RPA9_MOUSE/36-112:0.29449,(RPC19_CAEEL/57-133:0.62240,Q9VIZ0_DROME/15-82:0.57073):0.39565):0.10479,(RPC19_YEAST/59-133:0.17471,RPC19_SCHPO/33-107:0.14075):0.21603):0.23092):0.16546,Q42483_ARATH/6-83:0.46746):0.29324,((RPB11_ARATH/29-103:0.39887,(RPB11_CAEEL/28-102:0.28001,(RPB11_MOUSE/29-103:0.08745,Q8IH32_DROME/29-122:0.13161):0.03616):0.13982):0.10273,(RPB11_YEAST/29-103:0.33917,RPB11_SCHPO/28-102:0.39480):0.16056):0.17607):0.11301):0.38576):0.19214,RPOL_METKA/16-101:0.84950):0.06296):0.11256):0.28179,(RPOA_EUGST/22-209:0.71901,RPOA_RECAM/19-221:0.89800):0.11984):0.10024,RPOA_EUGMY/25-203:0.47987):0.32912,CNJC_TETTH/14-295:0.52605):0.24600,(Q8IHT3_PLAF7/54-325:0.39784,(Q9U177_LEIMA/118-423:0.81913,((((Q39216_ARATH/90-382:0.20566,Q8LD68_ARATH/82-374:0.10376):0.08160,(((Q9UAY9_CAEEL/66-359:0.32197,O08521_CRIGR/55-339:0.30383):0.05489,Q9VMX3_DROME/51-328:0.26022):0.03264,RPA5_HUMAN/58-338:0.16764):0.12970):0.18224,RPC5_YEAST/48-330:0.37096):0.06059,Q8SSL9_ENCCU/40-297:0.59025):0.10803):0.02296):0.12386):0.02855,((Q8I2S6_PLAF7/21-304:0.45129,(Q8SRR5_ENCCU/12-234:0.56872,((Q9P5U3_NEUCR/24-270:0.25068,(RPB3_SCHPO/15-261:0.26030,RPB3_YEAST/16-260:0.28080):0.06110):0.09396,(Q93338_CAEEL/13-269:0.33404,((O97183_DROME/17-262:0.00056,Q8IGG6_DROME/17-104:0.59600):0.14720,RPB3_HUMAN/17-261:0.26533):0.05550):0.17992):0.15026):0.10366):0.13699,(Q8MUV1_GIALA/12-301:0.85694,Q8LAJ1_ARATH/16-298:0.23686):0.19687):0.22773):0.06465,((RPOD_PYRAE/8-248:0.72372,RPOD_THEVO/10-267:0.70094):0.12360,((((RPOD_METKA/17-266:0.61667,(RPOD_METMA/12-261:0.35228,(RPOD_HALN1/12-244:0.15277,RPOD_HALMA/14-255:0.20497):0.30063):0.13845):0.18009,RPOD_METTH/7-259:0.48540):0.11409,RPOD_ARCFU/13-258:0.50048):0.17067,(RPOD_METJA/12-184:0.68714,(RPOD_PYRHO/12-252:0.16803,RPOD_PYRFU/14-254:0.05339):0.33140):0.15185):0.06194):0.04349):0.14054,(Q98S79_GUITH/60-325:0.71869,Q9AW23_GUITH/9-291:0.57038):0.25845):0.35086,RPOD_AERPE/19-280:0.52155):0.42959,RPOD_SULSO/9-258:0.09491):0.16324,RPOD_SULTO/10-259:0.10669,RPOD_SULAC/7-258:0.13588);