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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF01051 alignment
(45 sequences with 351 aa)


Q08088_ECOLI/18-213 DSGEVIQLFPTL-...........KQTIQPKVLLRLGVFVPTLKSTDKGGRKShhIDATEPLSRLSIVEGEGYSQIQIYGPRLDMDTDFKSWCGIVYALSNRP-..........---....---.-.-.----.-----------.....-.-.--.---.---.------------.-.---------LDSEGQLELNF-PEFAKFCG--...---.-FDTKRIDK--QLKERFDASLTRIARTNISF--------------IKKIPGTDDQITIN-----MHLVEST....YY--DSSTGKIIIKP-NSKLNTL---.---YRVD---...----GKtrlYLKTLQ-KL
REPA_ECOLI/19-189 QKPLTV---NELN...........--TIQPVAFMRLGLFVPKPSRSSDYSPM-..IDVSELSSTFEFARLEGFTDIKITGERLDMDTDFKVWIGIVKAFSKYG-..........---....---.-.-.----.-----------.....-.-.--.---.---.------------.-.----------ISSNRIKLKFSEFAKDC----...---.GFPGKKLDK--KLRA-H---IDESLRKIRG-----------------------KSIS---FKRGKDSQSA-....Y-------HTGLIKIAY--FNADTD-.--VVELEADE...------...RLWEL-YYF
REP5_ECOLI/18-188 AKELTVNSNN---...........--TVQPVALMRLGVFVPKPSKSKGESKE-..IDATKAFSQLEIAKAEGYDDIKITGPRLDMDTDFKTWIGVIYAFSKYG-..........---....---.-.-.----.-----------.....-.-.--.---.---.------------.-.----------LSSNTIQLSFQEFAKAC----...---.GFPSKRLD--AKLR----LTIHESLGRLR-----------------------NKGIA---FKRGKDAKGG-....YQTGLLKVGRFDADLDLIELEADS--.----------...------...KLWEL-FQL
O32604_ERWST/19-189 DKQLTVNSSN---...........--TVQPVALMRLGVFVPKPTKSHGENNV-..VDASELFSQLEIVRAEGYDHINISGPRLNMDNDFKVWIGVIYAFSKYG-..........---....---.-.-.----.-----------.....-.-.--.---.---.------------.-.----------LASNKIELKFTEFAKGC----...---.GFSAKRID--ARLR----LTIHESLGKLR-----------------------NKSIS---FKRGSDARGS-....YQTGL--LKTGYFD-AQRDI------.---VQLEADE...------...KLWEL-FQL
O06449_SERMA/20-278 KTYQLTP--NS--...........SKSVQPVALLRLSVFTPVGTKENRDRNFE..VDASDELSCMEIARSEGYDDIKITGVKLSMSTDFKCWLGIIMAFSKYGF..........---....TSEkIsLtFNEFaKMCGISSTNIN....kRtRaRFkESLmNLAsVVLAFSDSRSGRfTvTHLVQKAMIDPKSDTVEL-VGD---PSMWEL..yRYD.HKTLLSLQVLYILAKKEAA---QSLYIY-----------------FEAMPAGTLFVNMKRLRERLLLTTP-....-----IRTQNQIIRKAMRELESI---.-GYLDYQ---...EVKKGR...DI---QFQI
REPB_ECOLI/7-270 ELVTLTPNNNNTV..........qPVALMRLGVFVPTLKSLKNSKKNTLSRTD..--ATEELTRLSLARAEGFDKVEITGPRLDMDNDFKTWVGIIHSFARHNV..........---....IGDkVeLpFVEFaKLCGIPSSQSS....rRlReRIsPSLkRIAgTVISFSRTDEKHtReYITHLVQSAYYDTERDIVQLQAD--PRLFEL..yQFD.RKVLLQLKAINALKRRESA---QALYTF-----------------IESLPRDPAPISLARLRARLNLKSPV....FS------QNQTVRRAMEQLREI---.-GYLDYTE--...-IQRGR...--TKF-FCI
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O06448_SERMA/8-245 PSPKSVGRQN---...........---------REYKTVGFDATK--------..-----ELQTLSLMESEGFTNISIVGERLDMSVDFKTWMGIIRTYANHPI..........---....NNDtIsLkFTEFlKLCTPENYRSS....tAsRkRIdASLrRLAsVTLSFTSNNSSKvYtTHLVQSALLDPESDQVVLQVD----PKIFEL..yQYD.HKVLMQLKAIKELAKKESA---QALYTF-----------------IESLPPNPIPISLTRLKNRLNLKTR-....-----ANSQNATVRKALEELASI---.-GYLQYTEIK...--KDGK...----VYFQI
Q9ZN83_STRBO/1-223 MANEIVKHHNDLN...........TVIMRKWTAEEMNFFFAIIAKARNQGTKE..-------LVFDKYQLADLANYSLEHNQRFYETMDNLANNISKLRYIER-..........---....---.-.-.----.---TSHSVDY-.....-.-.--.---.---.-MALFTRFKVEW.-.-------TEDLSDMKATVSISDKFEYIVNKL...EAN.-FTQYELEEFTSIRSTYAKTAYRLLKQWRT------------------IGKKE--FSKEEFKMLMDTPIY-....Y--QVSDIDRLVIKPILKELSQY---.FMGLKVKKIK...SNKRGN...PVLGYEFTW
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Q47808_ENTFA/8-221 A----VKYQNELN...........LVPLKNFNAKQMDLFFALCARMKDKGVEN..-------IRFSFEELKELSDYKMTATKAFVADLEKLYKDMLNLSYRTE-..........---....---.-.-.----.---NDDEIEY-.....-.-.--.---.---.-FVLFNGFKID-.-.----------KKQKFVEVRVNQDLDYIINGL...TTE.-FSRFELSAFTSIRSTYAKTLFRLLMQYRST------------------GYYV--VSIEDFRELLDIPEY-....Y--QMGNIDQKVLKPAMKELHNY---.FENLEVTKIK...-AKKGN...KIAKLEFTF
Q9AC64_STAAN/1-220 MTGETVVYKNEMN...........LVPLRRFTATEINLFFAMCNKLKEQDTNT..-----LRLSFDELKKLSNYSPETRNINRFANDLDNVYKKMLNLTIRYE-..........---....---.-.-.----.---DDDVIER-.....-.-.--.---.---.-FVLFNHYR---.-.--------IHKREQYLEISTSSNLKHILNSI...TNN.-FTKFELKEMTRLKSTYSKNMFRLLKQYKHT------------------GYLK--IHIDDFKNRLDIPKS-....Y--RMTDINKNVFKPIIIELGSI---.FNNLTINKIK...-AKKGR...KIEWIEFTF
Q9R969_STAEP/1-218 MSGETVVYKNDMN...........LVPLRKFNNTEVNLFFTLCNKLKDKG---..----NLTVNVPFEELKELSNYYSHDKKLFIPDLEKFYDQVFSLTYREE-..........---....---.-.-.----.---TENVIRK-.....-.-.--.---.---.-FILFTKVEIY-.-.----------KDKEYVAIGVNPDLEHIINSL...TSN.-FTKFELREMTHLKSTYSKHMFRILKQYKHT------------------GYVK--IKIDDFRERLDIPNS-....Y--RMTNINQKVLAPIIKELGFI---.FKNLNINKLK...-AKKGR...KIEWLEFTF
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Q9ZIR7_HELPY/23-255 KSQKYLITQDNRL..........iYAKYGDTTANELKFFYYIISKLNPLNDKD..--FELCEMPISEILGEALDHENLDANHTYIKNLCRSLSKRILEDESLV-..........---....---.-.-.----.-IDPETNKEDE.....-.-.--.---.-LFeVMAIFKRIQYL-.-.----------KKKAVICYQLNDCLKPYLLGL...RKN.-FTQIPLQRILPIRSGYAIRIYQILLSELKQ------------------NRNEVEMNLLYLQDMLCVPKSL....YI--WDNFKREILEPSLKEINATTD-.---IVADYRP...-LKQ-R..qKIVKLAFEI
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Q47742_ENTFC/23-245 QQYYYVVESNDLI...........TKARHDLDARELKIMDYVVSKIKPDDED-..------------------FNIVQTSM-----------------------..........YEL....-TNvLnLkRNGRtYSQLAESLESM.....-.-.--.---.-RAkSVRVYNEVEKRLtLtGW--FEVVDLWENGKIQLKINKQFAPYLLQL...KHD.-YTQHLLIDTVKLKSKYSILLYKLMREADK-------------DKGKSIAILQG--TPEEFKEWLGAPEN-....Y--DYNRLKENILKKAVEEINLKID-.--DMDLEILQ...-GRYGR...KVVQVEIH-
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Q9ZJ22_9LACT/21-259 EKRK-VVEHNSLI...........-TSIAKMDKTPLKMFELAVSCI---DTEK..-PLEDNTVYLSKRDLFAFFKVSDNDKHSRFKEAVEKMQKQAFFKIKEK-..........---....---.-.-.----.---KEHGFEFE.....-.-.--.---.---.NIVPIPYVKW--.-.---------TDYNDEVLIRFSPEIIPYLVNL...KKN.-FTQHALSDIAELNSKYSIIFYRWLSMNYNQYEHYSVKGGRRADQVESY--RNPSISVKELRIMTDTINE-....YK-DMNNFTKKVLNKPLEEMNAHTS-.---FNVTYEK...-VKKGR...SIDSIVFHI
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Q48654_9LACT/23-261 EKRK-IVEHNDLI...........-TSVAKMDKTPLKIFELAVSCID---TE-..-------------NLPKDNIIYLSK------------------------..........KE-....-LFtFfDvSDNGkHTRFKEAVEKM.qkqaFfEiKEvKGKgYKVkSIVPIPYVEW--.-.---------NSYNDVVTLQFQPQIMPYLIEL...KKN.-FTKYALSDIMRLNSKYSIILYKWLCMFYNQYEHYSVKGGRRAEQVETYRNPS--IKISELRSLTDTINE-....YK-DMSNFTKRVLDNSLKEINHHTS-.---FNVTYDK...-IKKGR...SIDSIVFHI
P94889_9LACT/23-261 EKRK-IVEHNDLI...........-TSVAKMDKVPLKIFELAVSCI---DTD-..-------------NPPKDHTILLSKT--ELFAFFKVSDNDKHSRF----..........---....---.-.-.----.----KEAIEKM.qkqaFfQiKEvKGKgYNMkSIVPIPFVE---.-.--------WNSYNDEVKIEFHREIMPYLIEL...KEK.-FTQYALSDIMELNSKYSIILYKWLSMNYNQYEHYSVKGGRRTEQVESY--RNPSILVKELRIMFDTVNE-....YK-DFRNFDKWVLKKPIEEINKYTS-.---FNVSYEK...-IKKGR...SIDNIVFHI
REPE2_SALTI/13-242 KNSPRIVQSNELT...........-EAAYSLSRDQKRLLYLFVHQIRKSDGS-..LQEHDGICEIHVAKYAETFGLTSAEASKDIRQALKGFAGKEVVFYRPE-..........---....---.-.-.----.---EDAGDEKG.....-.-.--.---.---.------YESFP-.-.--WFIKRAHSPSRGLYSVHINPYLIPFFIGL...QNR.-FTQFRLSETKEITNPYAMRLYESLCQYRKP---------------DGSGVVS--LKIDWIMERYQLPQS-....YQ-RMPDFRRRFLKASVDEINSRTP-.---MRLSYIE...-KKKGR...QTTHIVFSF