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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF01042 alignment
(27 sequences with 477 bp)


Q07261_YEAST/287-418 ACCCAAAATTTGCCAAAGcaaCAAGCTaaaacaggagaacaaagatttgaaaatcacatgTCGAATGCTCTACCACAA---ACGACAATCaatAAAACCAATGATAAGTTGTACATCTCTAACCTACAATCA---------............---------------CGTAAAAGTGAGACGGTCGAGAAGCAAAGTGAAGATATTTTTACTGAGCTAGCCGACATTCTGCATTCCAACCAGATTCCACGGAATCAT------...---...---ATTTTATCTGCGTCATTATTAATTAGAGATATGTCTAAT...TTCGGAAAAATCAACAAAATATACAATGAATTTTTAGATTTGTCA---...------AAATACGGACCTTTGCCACCATCAAGAGCATGCGTAGGTTCGAAGTGCTTGCCA---......GAAGATTGTCACGTACAGTTATCAGTTGTTGTTGATGTA
Y1627_HAEIN/2-116 ACAATTCAACGCATT---...TTACCC.................................AGTGCACGTTTAAGTGAAGTTTCAATTCAT...------AACAACCTCGCCTATTTTGCAGGGCAAGTTCCA---------............---------GAATTAACCATCGAGCAAAATGCCTACGAACAAACCAAAGAAGTATTAGGTTTAATTGATAAATTGTTAGCAAAAATTGGCTCCAATAAAAGCAAC------...---...---ATTTTAACTGCGCAAATTTTCTTAGCTGATATGAAAGAT...TATGCACAATTAAATCAAGCTTGGGATGAATGGGTCGATCATGTT---...------------------AGCCCACCAAGTCGAGCGACAGTGGAAGCTAAATTAGCGGAT---......CCTCATTGGAAAGTTGAAATTGTTATTATTGCAACTTGT
Y322_HAEDU/1-114 ATGATTACACGTATC---...GATGTG.................................ACTAACCGATTTTCAGAAGTCGCCATTTAC...------AATGGTATCGCTTATTTTGCCGGTCAAGTGCCGACAGATGAA............---------------------AGCAAAGATGCTTATCAACAAACACAGCAAGTATTAAGCGAAATTGATAAATATCTTGCAAAATCAAACACAGATAAAAGTCGC------...---...---ATCTTAATGGCAACCGTTTACCTTGCAAACATGGCAGAT...TACACTGAAATGAATCGAGCTTGGGATGAATGGGTAGCGCCAAAC---...------------------AATGCACCACCTCGTGCTGCAATTGAAGCCCGCTTAGCCAAT---......CCAAATTGGAAAGTTGAAATAGTCATTACCGCAGCAATA
O96876_TRYCR/22-158 GCCGCAGCAGCGCCT---...------.................................GCAACAAATTACGTGTCT---TACGTCTGC...---AGTGGCATGCAGCTGCATGTCTCCGGCCAGCTACCAAAGAATGACgtggggggatgcATGACTGGGCAACTGGGTGCCTCACTGACAGTAACGGAGGGGCAAGCGGCGGCTCGGGCCTGTGCGTTGCAGGTTGTGAGCCAAATGCAGGCAGCTCTGGGCGACCTGGACcgtGTGaaaCGTGTCGTGAAGCTCAACGTCTTTGTGAATTCCTCACCAAGT...TTTACGGAGCAGTCGTACGTTGCCAATGGCGCCTCTGACCTTATTCTAagtGTGTTCGGGGAGGAGGTTGGTCGACATGCTCGGTGTGCAGTGGGGGTGGCGCAGCTGCCG---......TTTGGGGCCGCCGTTGAGGTGGATGCGTTGGTGGAATTG
O69646_MYCTU/16-150 CAAGTGGCGGCGCCG---...------.................................CTGGCGGCCTACGTTCCA---GCTGTGCGC...---ACCGGCAACCTGGTCTACACCGCGGGCCAGCTGCCGTTGGAGGCAggcaagctggtgCGGACCGGCAAGCTCGGCGCCGACGTCAACCCGGAGGAGGGCAAGACGCTCGCGCGGATCTGCGCGCTCAATGCGCTGGCAGCCGTTGAT---TCGCTGGTGGATCTCGACgcgGTGaccCGGGTGGTCAAAGTCGTCGGGTTTGTCGCTTCGGCACCGGGG...TTTCACGGCCAGCCGAGCGTGATCAACGGGGCCTCCGATCTGCTGGCCgagGTGTTC---GGCGATAGCGGCGCGCATGCGCGTTCGGCGGTCGGCGTATCCGAGCTACCG---......TTGGATGCGCCGGTGGAAGTCGAGTTGATCGTGGAGGTC
YJGH_ECOLI/11-128 GGCCGACATTCACTA---...TATGCT.................................GAGCATCGTTATTCTGCG---GCTATTCGT...---TCCGGCGATTTGCTGTTTGTTTCCGGGCAAGTAGGAAGTCGAGAG............GACGGAACACCA---------GAACCCGATTTTCAGCAACAAGTCAGACTGGCATTTGATAATTTGCATGCGACCCTGGCAGCTGCGGGATGCACTTTTGACGAT------...---...---ATCATTGATGTTACGAGCTTCCATACCGATCCAGAAAACcaaTTTGAAGACATCATGACGGTGAAAAATGAAATATTTAGCGCCCCA---...------------------CCTTATCCAAACTGGACGGCGGTGGGTGTTACATGGCTGGCA---......---GGCTTTGATTTTGAAATTAAAGTGATAGCGCGCATC
Q55925_SYNY3/86-202 ATGCTGAATGAATTG---...------.................................------CATTACTCGCAA---GCAGTAAAA...---ATTGGCGATCGTGTGGAGACATCAGGTCAAGGTGGTTGGGAT---............------GACAACCTGCAAATTCCCGAGTTGCTCGCAGATGAGATTGCCCAGGCATTTCAAAATATAGAGCGAACCCTGGCGGCTGCCGGGGCAGGTTGGGAGCAC------...---...---GTTGTCCATGTCAATTCTTATCATGTTGGTGGGTTGCCC...---CCAGAGGTGAACGATGTGATGGTCAGGCTATATCGCCATTAC---...---------ATGCCTAACCATGCCCCAATTTGGACACAGGTAGGAGTTGCAGCACTAGGGCTG......CCGACAATGCGGATTGAGATCCGGGTTACCGCAATTGTC
Q44518_ANAVA/58-181 CCAACCTTATATGAT---...GCAACC.................................CGAAATGGTTATAGTCATATAGCTGTGACAccaGCAAAGTCGAGAACAGTCTATATTTCTGGTCAATTTGGTTCGGATTTG............CAAGGAAATCTTGTC------TCCCCTGAGTTTGAACCACAGTTAATCAGGGCTTTTCAGAACCTCCGCTTTGCCTTAGACGCAGTTGGTGCAAAACCCAGCGAT------...---...---GTTGTCAAAACAACTGTACTTATAGTTGATCATACTCAA...------GATAAATTGATTCCCTTAGGGAGACAAATTCAAAATCTA---...---------TGGCCATTTCGACCACCAGCCAACACCCTCATTCCTGTTCCTAGACTTGCACTT......GACGGGATGTTATTTGAAATTGATGCTTATGCGGTGATT
YCDK_ECOLI/10-126 GGCAGCAGCGCACCG---...------.................................CTGGCCCCCTTCGTTCCC---GGCACGCTG...---GCTGATGGCGTGGTGTATGTCTCCGGTACGCTGGCTTTTGATCAA............CATAATAACGTGCTGTTT---GCCGATGACCCAAAGGCGCAAACCCGCCACGTTCTGGAAACTATCCGCAAGGTGATCGAGACGGCGGGTGGCACGATGGCGGAT------...---...---GTGACCTTCAACAGCATCTTTATTACCGACTGGAAAAAT...TACGCCGCGATTAACGAAATCTACGCCGAGTTTTTTCCGGGTGAT---...---------AAA------------CCGGCGCGATTCTGCATTCAGTGCGGACTGGTAAAA---......CCTGACGCGCTGGTGGAAATCGCCACAATTGCGCATATC
Q9ZBJ6_STRCO/11-130 GAGGGCGTCGCGCCC---...------.................................GCCGCTCAGTACACCCATGTCGTCCTCGGC...---ACCGGGCGCTTCGTGGCCGTCTCGGGGCAGCTCGCCCTGGAC---............GAGGACGGCAAGGTGGTCGGCGAGGGCGACCCCGCGGCCCAGGCCCGCCAGGTCTTCGAGAACCTGCGCCGGTGCCTGGCCTCGGCCGGAGCGGCCTTCGACGAC------...---...---GTGGTGAAGCTGACCTTCTTCGTCACGGACATGGCCAAC...ATGGGCGCGATCCGCGCCGCCCGCGCCGAGCACATACCCGACGAC---...------------------CGGCTGCCGGCCGCCTCCGCGGTGCAGGTGGCCGCGCTGGTCCGG......CCGGAGTTCCTCATGGAGATCGAGGCGTTCGCGGTCGTG
MMF1_YEAST/26-143 ACCAAGTTGGCCCCA---...CCCGCT.................................GCCGCCTCTTACTCCCAA---GCTATGAAG...---GCCAACAATTTTGTGTACGTGTCTGGTCAAATCCCTTATACTCCA............---GATAACAAGCCTGTT---CAAGGTTCTATCTCTGAGAAGGCCGAACAAGTTTTTCAAAACGTTAAGAATATCTTAGCAGAAAGTAATTCTTCTTTAGACAAT------...---...---ATAGTCAAAGTCAACGTATTCTTGGCTGACATGAAAAAC...TTTGCCGAATTCAACTCTGTATACGCCAAACACTTCCACACCCAT---...---------AAG------------CCTGCAAGATCCTGTGTTGGTGTTGCTTCCTTACCT---......TTGAATGTTGATTTAGAAATGGAAGTTATCGCTGTTGAA
HMF1_YEAST/10-127 TGTGAATCCGCTCCA---...GCTGCT.................................GCGGCTTCATACTCCCAT---GCCATGAAA...---GTGAACAATTTGATTTTCCTTTCTGGCCAAATTCCAGTGACCCCA............---GACAACAAGTTAGTT---GAAGGTTCCATTGCTGATAAGGCTGAACAGGTGATTCAAAACATTAAGAATGTTCTAGAAGCAAGCAATTCCTCATTGGACAGG------...---...---GTCGTAAAAGTTAACATTTTCTTGGCAGATATCAATCAC...TTTGCTGAGTTTAACTCCGTTTACGCCAAGTACTTCAATACTCAC---...---------AAA------------CCTGCCAGATCATGCGTTGCTGTTGCAGCATTGCCA---......TTAGGCGTTGACATGGAAATGGAAGCCATTGCTGCCGAA
MMF1_SCHPO/41-162 CCAATCAACAGTCCCAAActtTCCAGT.................................GCTGGTCCTTACAACCAA---GCTATTAAG...---GCTAATGGTGTAATCTATTGCTCTGGCCAAATCCCTGTCGCT---............---AATGGCAAAGTCATT---GAGGGCACTGTTGGTGATCAAACTCGCCAGTGCTTGTTGAATCTTCAAGAGGTATTGACAGAAGCTGGTAGTAGCTTGAATAAA------...---...---ATCGTTAAGGTCAACATTTTCTTAGCTGATATGGATGAT...TTTGCTGCTGTTAACAAAGTCTACACTGAAGTCCTTCCGGATCCT---...---------AAG------------CCTGCACGCTCCTGTGTCGCTGTTAAGACCGTTCCTCTAagcactCAAGGTGTTAAGATTGAGATTGAATGCATCGCTCTTGAA
Y364_AQUAE/6-125 ACCCCTAAGGCTCCC---...GTTCCC.................................GTCGGTCCTTACTCTCAA---GCAGTTGAA...---GTAAACGGCTTTTTATTCATCTCAGGACAGATAGGTATAAACCCC............GAAACGGGAAAACTGGTC---GAAGGTTTTAAA---GAACAGGTAATTCAGATATTCAAGAACGTAGACGCAATTCTGGAGGAAGCGGGTCTCAAGAGGGAGAAT------...---...---ATAGTAAAAGTTACCATTTACATTACGGACATAAAGAAG...TTTAAGGAACTCAACGAAATTTACGAAGATTACTTCAAAGATGTT---...---------TCGGTCAAA------CCCGCAAGGGTAACTGTAGGTGTGAAAGAACTACCT---......CTTAATGCGGAAGTAGAAATAGAAATTGTGGCGGTAAAA
Y142_LEUMC/8-130 ACAACTACAGCGCCC---...AAAGCA.................................CTCGGGCCCTATTCGCAA---GCTATTCTA...---AATGACAATACATTGTACATTTCTGGACAAATTGGTATTGATCCA............GAAACCGACGAATTTGCT---GGCGCTACGACAGCCGAACAAGCACATCAAATTTTTGATAACATTGATAACATCTTACACGAAGCTGAATTTTCACGAAATGAT------...---...---ATCGTAAAAGCTGCATTATTTTTTGATGATATCGCAGAC...TTTGCATTAGTTAATGATATCTACGCACAATACTTCGATACAACT---...---------TCGGTTGAGGAATTTCCTGCCCGTTCAGCCGTTCAGGTAGCTGCTTTACCT---......AAAAATGCTAAATTAGAAATTGAAATTACCGCTATGAAA
Y4SK_RHISN/7-125 ACAAACGATGCCCCC---...GGCGCG.................................GTCGGCCCCTACTCCCAG---GCCATCAAG...---GTTGGCGATCTGCTTTTCGTCTCCGGGCAGTTGCCAATCGATCCG............GCCACCGGGGAGTTCAAT---TCGGCCAATGCTGTCGAACAGGCCGAACAATGCCTCAAGAACCTTCAGGCGATCGCCAGGGCCGCCGGCACGGATCTGTCGAAG------...---...---ACGGTCAAGACGACAGTGCTGCTCACCGACCTTGGCGAC...TTCGCGGACATCAATCGCGTTTACACGGGCTTCTTCTCCACCCCC---...---------TAC------------CCGGCGCGCGCCTGCTATGAAGTCAAGGCGCTGCCA---......AAAGGTGCCAAGGTCGAGATTGAAGCCGTCATCTCTCTG
YSD2_CAEEL/19-136 TCCGCAAATGCTCCA---...GGAGCT.................................ATCGGACCATACAGTCAA---GCCGTTCGT...---GCCGGAAATACCATCTACCTTTCCGGATCTCTTGGCTTGGATCCA............AAAACTGGAGATTTG------AAGGAGGGCGTCGTTGAGCAAACTCATCAAAGTCTCAAAAATCTCGGAGAAGTTCTTAAGGCAGCTGGAGCTGATTATGGAAAC------...---...---GTCGTCAAAACCACAGTTCTTCTTCAAAATATTGCTGAT...TTTGCTGCCGTCAATGAGGTCTACGGACAATATTTCAAGTCTCCA---...---------TAT------------CCAGCTCGTGCTGCTTATCAAGTTGCCGCGCTTCCA---......AAAGGCGGACTTGTCGAGATTGAAGCCGTCGCGATTGCT
Y944_HELPJ/7-125 TCAACGCTAGCCCCA---...AAGGCT.................................ATAGGCCCTTACTCTCAA---GCTATCGCT...---ACTAACGATCTTGTTTTTGTCTCTGGGCAATTAGGTATTGATGTA............AGCACCGGCGAATTTAAA---GGTGCGGACATTCATTCTCAAACCACGCAATCCATGGAAAATATCAAAGCGATTTTAAAAGAAGCAGGGTTAGGGATGGATAGC------...---...---GTGGTTAAGACGACTATTTTATTGAAAAGTTTAGACGAT...TTTGCGGTGGTGAATGGAATTTATGGGAGTTATTTTAAAGAGCCT---...---------TAT------------CCGGCTAGAGCGACTTTTCAAGTGGCCAAACTGCCT---......AAAGACGCTTTAGTAGAAATTGAAGCGATAGCCATTAAG
YVN1_AZOVI/8-126 ACCGACAAGGCCCCC---...GCCGCC.................................ATCGGCACCTACTCCCAG---GCGATCAGG...---GCCGGCGATACCGTCTACCTGTCCGGACAGATTCCCCTCGATCCC............GGGACCATGGAACTGGTC---GAGGGCGACTTCGAAGCCCAGACCGTGCGGGTGTTCGAGAATCTCAAGGCGGTCGTCGAGGCGGCCGGCGGCTCGTTCGCCGAC------...---...---ATCGTCAAGCTGAACATCTTCCTCACCGACCTGGCCCAC...TTCGCCAATGGCAACGAATGCATGGGCCGCTACTTCGCACAGCCC---...---------TAC------------CCGGCCCGTGCCGCCATCGCGTGCGCCTCCCTGCCG---......CGCGGCGCGCAGGTGGAGATGGACGGCATCCTGGTCCTC
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YABJ_BACSU/6-123 ACAAAACATGCCCCA---...GCGGCA.................................ATCGGGCCTTATTCACAA---GGGATTATC...---GTCAACAATATGTTTTACAGCTCAGGCCAAATCCCTTTGACTCCT............---TCAGGCGAAATGGTG---AATGGCGATATTAAGGAGCAGACTCATCAAGTATTCAGCAATTTAAAGGCGGTTCTGGAAGAAGCGGGTGCTTCTTTTGAAACA------...---...---GTTGTAAAAGCAACTGTATTTATCGCGGATATGGAACAG...TTTGCGGAAGTAAACGAAGTGTACGGACAATATTTTGACACTCAC---...---------AAA------------CCGGCGAGATCTTGTGTTGAAGTCGCGAGACTCCCG---......AAGGATGCGTTAGTCGAGATCGAAGTTATTGCACTGGTG
Y709_SYNY3/8-128 ACTGCCCAAGCTCCT---...GCCCCT.................................GTTGGCCCCTATAACCAG---GCGATCGCC...---GCCAATGGTTTCCTCTTTACGGCTGGCCAAATTGCCCTCGACCCC............CAAACCATGACCATTATGGGAGAGGGGAACGTGGAAGTCCAAGCAAAACAGGTATTGACTAATTTAGGGGCGGTGCTCCAGGAAGCGGGCTGTGGTTGGGAAAAT------...---...---GTGGTTAAAACTACGGTATTTCTCAAAGATATGAACGAT...TTCGCCGCAGTTAATGCCATCTATGGCCAATATTTTGACGAGGCT---...---------ACGGCT---------CCGGCCCGTAGTTGTGTGGAAGTGGCCCGCCTACCC---......AAAGATGTGTTAGTAGAAATCGATTGTGTCGCTGTGTTA
ALDR_LACLA/6-124 ACATTAGATGCACCA---...GCCGCT.................................ATCGGTCCTTATGTTCAA---GGCAAAATT...---GTTAATGGTTTACTCTATGCATCAGGCCAAATTCCGTTGAATCCA............TTGAATGGAGAGATTGTT---GGAGATAGCATTGAGACTCAAACCGAACAGGTGATGAAAAATATTTCTGCTATTTTGAAAGAAGCACATTCTGATTTTGACTTA------...---...---GTCATCAAAACAACATGTTTCTTGAAAAATATTGAAGAT...TTTTCAAGATTTAATGCAATTTATTCAAAGTTTTTTGATAAGGAA---...---------TTC------------CCAGCGCGTTCCGCTGTTGGAGTCGCAGGATTACCT---......AAAAATGTCCTTATTGAAATAGAAGTCATTGCAGAAGTT
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O07205_MYCTU/10-121 TCCGGATCGGAGTTC---...GAATCA.................................GCCGTCGGCTACTCGCGC---GCGGTACGC...---ATCGGGCCACTCGTGGTGGTGGCCGGAACGACCGGCAGC------............---------------------GGCGATGATATCGCCGCTCAGACGCGAGACGCTCTGCGCCGCATCGAGATTGCGCTCGGACAGGCCGGCGCAACTCTGGCCGAC------...---...---GTGGTCCGTACCCGCATCTATGTGACCGATATTTCCCGC...TGGCGCGAGGTCGGCGAAGTGCATGCACAGGCTTTCGGCAAGATC---...---------------------CGTCCGGTGACGAGCATGGTCGAGGTTACCGCGCTGATTGCG......CCCGGCCTGCTGGTAGAGATCGAGGCCGACGCCTACGTA
O85956_SPHAR/13-126 TCCGGTAATCCGATC---...------.................................---------------------CCGGCCGCAagtCGGGTCGGCAGCCTCGTCGCCACCGGAGGCGTTTATGGGCTGGATCCC............GAAACAGGGATCGTC------GCGGAGACCGCGGAGGACCAGGTACGGCTTACATTCTGGCAATTGGGCCGCATTCTGGAAAAGGCGGGCGGCAGCTTCGACGAT------...---...---GTCGCGAAGATGACCTTCTATGTTGCC------------...TCGGCCGATCTCAAGCCCCTGATCAACAAGTACTGGCTGATGGAA---...---TTCACGGACGAGCAATCAAGGCCAGCCAGACACACACTGATGTACAATTCATTGCCT---......GGAGATATCGTGATCCAGTGCGATGCACTGGCGTTTGTT