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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF01041 alignment
(37 sequences with 1419 bp)


Y3402_MYCTU/44-405 AGCTTTCCCGGGCCAGCCGAGCTCGCCGAGGACTTCGTACAGATCGCCCAGGCTaacTGGTACACGAAC------.........TTCGGTCCGAACGAGCGGCGGTTTGCCCGCGCCCTGCGCGACTATCTGGGA...cctCATCTGCACGTTGCTACCCTCGCCAACGGCACCCTGGCACTCCTCGCGGCGCTCCACGTCAGT------TTCGGCGCCGGT------...---ACGCGGGACCGCTACCTGCTGATGCCGTCGTTCACGTTCGTCGGCGTGGCTCAGGCTGCGCTATGGACTGGGTACCGTCCCTGGTTCATCGACATCGAC...------......---GCCAACACATGGCAGCCATGCGTCCACTCCGCCCGCGCCGTCATCGAACGCTTCCGCgaccgg.........ATCGCCGGCATCCTGCTGGCCAATGTGTTCGGCGTCGGCAATCCCCAGATCAGCGTCTGGGAGGAGCTCGCCGCCGAATGGGAGCTACCGATTGTGCTCGACTCGGCGGCCGGCTTCGGC......TCCACGTACGCCGAC...---...GGC.......................................---...GAGCGCCTCGGTGGACGCGGT......GCATGCGAGATCTTCTCCTTCCATGCGACCAAGCCGTTC---GCGGTTGGTGAGGGCGGCGCTCTGGTTTCTCGCGATCCACGGCTCGTCGAGCACGCATAC........................AAGTTCCAGAACTTCGGC---------...............------TTGGTGCAAACACGCGAGTCCATCCAG---------------------------------CTCGGAATGAACGGCAAGCTGTCGGAGATCAGCGCCGCTATTGGCCTACGCCAACTAGTCGGGCTTGATCGCCGCCTGGCAAGTCGCCGCAAGGTCCTCGAGTGCTATCGCACCGGTATGGCCGACGCGGGT------------GTGCGTTTCCAGGACAACGCCAAT------------...............---------GTTGCGTCGCTCTGTTTCGCGAGCGCTTGCTGCACGTCC---------GCCGACCACAAGGCCGCGGTTCTGGGTAGCCTGCGTAGGCAC------GCGATCGAGGCGCGCGACTACTACAAC............------CCACCGCAGCACCGACATCCGTAC------..................TTTGTGACGAATGCCGAGTTAGTCGAGTCGACCGATCTAGCCGTCACGGCGGACATTTGCTCGCGAATCGTGTCGCTGCCAGTCCACGACCACATGGCC.........CCGGATGACGTTGCCCGGGTCGTCGCCGCCGTGCAG
SPSC_BACSU/14-382 CCGTTAATCGGTAAGGAAGAAATTCAGGAGGTTACAGAAACGCTTGAATCGGGA...TGGCTCTCTAAA------.........---GGCCCGAAGGTTCAGCAGTTTGAAAAAGAGTTTGCCGCGTTTGTCGGG......GCGAAGCACGCCGTGGCGGTGAATTCATGTACCGCAGCTTTATTTTTGGCTTTGAAAGCA---------AAAGGGATTGGG------...------CCCGGGGACGAGGTCATTACCTCTCCGCTTACGTTCAGCTCGACCGCCAATACGATTATTCATACGGGAGCGACGCCTGTGTTTGCGGATATTGAC...------......---GAAAACACGCTCAATATTGACCCGGTAAAGCTTGAGGCGGCCGTCACACCGCGAACG...............---AAAGCAGTTGTGCCCGTCCACTTTGGCGGGCAGTCCTGC---GATATGGATGCAATATTGGCTGTTGCCCAAAATCATGGTTTATTCGTGCTGGAGGATGCGGCACATGCGGTATAT......ACGACTTATAAGCAA...---...---.......................................---...AGAATGATCGGTTCTATCGGG......GATGCAACGGCATTCAGCTTTTACGCCACCAAAAACCTC---GCGACAGGGGAAGGCGGCATGCTGACGACTGATGATGAGGAGCTTGCCGATAAGATACGG........................GTGCTAAGCCTTCACGGCATGAGTAAA...............GCCGCATGGAACCGTTATTCTTCAAATGGC------------AGCTGGTACTATGAAGTCGAATCGCCCGGCTATAAGATGAATATGTTTGATTTGCAGGCGGCCCTCGGACTTCATCAGCTGAAACGGCTGGATGATATGCAGAAACGGAGAGAAGAGATTGCCGGCCGCTATCAAACCGCTTTTCAGCAGATTCCTGGGCTG---ATCACGCCGTTTGTCCATGATGACGGC------------...............------AGGCACGCCTGGCATCTATATGTTCTGCAAGTTGATGAAAAAAAGGCCGGGGTTACG---CGCAGCGAAATGATTACGGCTTTAAAGGATGAATAC---AATATCGGCACTAGCGTTCATTTT---............---ATT---CCAGTACACATTCATCCGTAT------..................---TATCAAAAGCAATTTGGATATAAGGAAGCGGACTTTCCGAATGCCATGAATTACTATAAACGAACCCTTTCTCTCCCGCTCTATCCATCAATGTCT.........GACGATGATGTAGATGATGTCATTGAAGCTGTGCGG
Y1066_METJA/12-379 CCATGTATTGGTGAAGAAGAGATAAATGAAGTTATAGATACATTAAAGTCAGAT...TGGATAACTATG------.........---GGTCCAAAAACATTAAAATTTGAAGAATTGTTTAGAAATTATATTGGA......AGTAAATTTGCAATATCCTTAAATTCATGCACAGCCGGGTTACATCTGTCATTGGTTGCA---------TTAAATATAAAG------...------GATAAAGATGAAGTCATAACTACACCATATACCTTTGCAGCAACTGGGAACGTTATAGTTCATCAAAGGGCAAAGCCCGTATTTGTTGATATTGAT...------......---AAAGAAACCTATAATATTAACGTTGAGGAGATAGAAAATGCCATAACTGAGAGAACA...............---AAGGCAATAATTCCTGTCCATTATGCAGGACATCCATGT---GAAATGGATGAAATATTAAAAATAGCAAGAGACTATGATTTATATGTAATTGAAGATGCTGCACATGCATTGGGG......GCAGAGTATAAAGGA...---...---.......................................---...AAAAAAATAGGTACTATTGGA......GATACAACATCATTCAGCTTTTATGCAACAAAAAATATA---ACCACTGGGGAGGGGGGAATGGTTACTACTGACAATGAAGAGATTGCAGAAAAAATAAAA........................ATACTGCGACTACATGGGATAAGTAGA...............GACGCTTGGAAAAGATACTCATCCGAGGGC------------TCATGGTACTATGAGATTATCGAGTGTGGTTATAAATATAACATGACCGACATTCAAGCATCAATCGGAATACATCAACTAAAAAAAGCAGAGATAATGAGAAAAAGAAGAGAAGAAATCGCTAAAATTTATAATGAAGAGTTTGAAAATCTTGAGGGGTTA---ATAACTCCAACCATAAAAAAACATGTT------------...............------AAACATGCATGGCACTTATATCCGTTGTTAATAAATATCGATAGATTGAAGATAAAC---AGAACCAAATTTATTGAAGAGTTAAAAAAACAG------AATATTGGAACAAGTGTTCATTTT---............---ATC---CCATTACACTTGCATCCATTT------..................---TATAGGAAAACTTTTGGATATAAAAAAGGTGATTTTCCAAATGCAGAGTGGGTTTATGAGAGAGAGATTTCCTTGCCAATATATCCAAAAATGACT.........GATGATGATGTAATTGATGTAGTTAATGCGGTTAAA
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