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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF00831 phylogeny
for nucleotide alignment


 
(((((((((((((((RL29_BORBU/2-59,RL29_FUSNN/3-60),((((((Q8G410_BIFLO/10-67,RL29_CORGL/7-64),(RL29_MYCBO/7-60,RL29_STRCO/7-64)),(((((RL29_RALSO/3-60,RL29_NEIMB/3-60),(((RL29_HAEIN/3-60,(((RL29_BUCAI/4-61,RL29_BUCBP/3-60),RL29_WIGBR/3-60),Q8EK61_SHEON/3-60)),RL29_ECOLI/3-60),RL29_PSEAE/3-60)),(RL29_XANCP/3-60,RL29_XYLFT/3-60)),(RL29_CAUCR/3-60,(((RL29_BRUSU/3-60,RL29_RHILO/3-60),Q89J92_BRAJA/6-63),RL29_AGRT5/3-60))),((RL29_THETH/10-67,(RL29_CHLTR/8-66,(RK29_ARATH/67-124,RK29_MAIZE/68-125))),(RL29_DEIRA/3-60,((((RK29_PORPU/6-63,(RK29_ODOSI/6-63,RK29_GUITH/7-64)),Q8DMM4_SYNEL/6-63),(RL29_SYNP6/6-63,RL29_SYNY3/6-63)),RL29_ANASP/6-63))))),((RL29_LACPL/3-60,RL29_BACTN/3-60),((RL29_LISMO/3-60,RL29_STAEP/3-60),RL29_BACHD/3-60))),(RL29_STRPY/10-67,RL29_LACLA/10-67)),RL29_THEMA/3-60)),(((RL29_CLOPE/6-63,RL29_CLOAB/3-60),(((RL29_SPICI/1-58,RL29_MYCCA/6-63),((RL29_HELPY/3-60,RL29_CAMJE/3-60),RL29_MYCPU/3-60)),(((RL29_UREPA/5-62,RL29_MYCGE/4-61),RL29_MYCGA/2-59),Q8EUC0_MYCPE/4-61))),RL29_THETN/3-60)),(Q26035_PLAFA/6-63,(RL29_SULTO/19-75,RL29_SULSO/5-62))),RL29_LEPIN/6-61),RL29_METJA/6-64),RL29_METTH/6-64),(RL29_THEVO/6-64,(RL29_METKA/8-66,RL29_PYRAE/9-66))),(RL29_METMA/6-64,(RL29_HALMA/5-63,RL29_HALN1/6-64))),RL29_ARCFU/6-64),RL29_CHLTE/3-60),(Q8SQQ7_ENCCU/5-61,O97445_GIALA/6-65)),(((RL35_SCHPO/5-63,RL35_YEAST/6-61),RL35_BABBO/6-64),RL352_ARATH/6-64)),((Q8R102_MOUSE/6-64,Q962T0_SPOFR/6-64),RL35_CAEEL/6-64)),Q96UT5_PARBR/8-66,Q96W38_OPHNO/21-78);
(((((((((((((((RL29_BORBU/2-59:0.45769,RL29_FUSNN/3-60:0.21829):0.05838,((((((Q8G410_BIFLO/10-67:0.24773,RL29_CORGL/7-64:0.17419):0.06064,(RL29_MYCBO/7-60:0.13377,RL29_STRCO/7-64:0.18231):0.06058):0.09532,(((((RL29_RALSO/3-60:0.23180,RL29_NEIMB/3-60:0.39522):0.06667,(((RL29_HAEIN/3-60:0.23624,(((RL29_BUCAI/4-61:0.20335,RL29_BUCBP/3-60:0.30897):0.09768,RL29_WIGBR/3-60:0.21338):0.19077,Q8EK61_SHEON/3-60:0.18805):0.06866):0.08560,RL29_ECOLI/3-60:0.05110):0.11729,RL29_PSEAE/3-60:0.19017):0.08090):0.08594,(RL29_XANCP/3-60:0.07652,RL29_XYLFT/3-60:0.39386):0.22435):0.13737,(RL29_CAUCR/3-60:0.16762,(((RL29_BRUSU/3-60:0.10335,RL29_RHILO/3-60:0.12961):0.05347,Q89J92_BRAJA/6-63:0.18996):0.04375,RL29_AGRT5/3-60:0.16126):0.07919):0.03066):0.08107,((RL29_THETH/10-67:0.34625,(RL29_CHLTR/8-66:0.77749,(RK29_ARATH/67-124:0.32935,RK29_MAIZE/68-125:0.08324):0.14617):0.19118):0.14855,(RL29_DEIRA/3-60:0.27962,((((RK29_PORPU/6-63:0.22651,(RK29_ODOSI/6-63:0.30540,RK29_GUITH/7-64:0.43717):0.12936):0.27154,Q8DMM4_SYNEL/6-63:0.17629):0.12682,(RL29_SYNP6/6-63:0.24876,RL29_SYNY3/6-63:0.25054):0.05973):0.06547,RL29_ANASP/6-63:0.24586):0.24940):0.15848):0.06978):0.05387):0.39255,((RL29_LACPL/3-60:0.10575,RL29_BACTN/3-60:0.55077):0.11540,((RL29_LISMO/3-60:0.13545,RL29_STAEP/3-60:0.16469):0.06799,RL29_BACHD/3-60:0.15310):0.07129):0.04806):0.09634,(RL29_STRPY/10-67:0.09003,RL29_LACLA/10-67:0.23811):0.22570):0.10702,RL29_THEMA/3-60:0.59861):0.07872):0.00000,(((RL29_CLOPE/6-63:0.21947,RL29_CLOAB/3-60:0.13298):0.10794,(((RL29_SPICI/1-58:0.23958,RL29_MYCCA/6-63:0.23851):0.16847,((RL29_HELPY/3-60:0.32611,RL29_CAMJE/3-60:0.33325):0.24126,RL29_MYCPU/3-60:0.21831):0.05664):0.11891,(((RL29_UREPA/5-62:0.35813,RL29_MYCGE/4-61:0.33049):0.06169,RL29_MYCGA/2-59:0.19935):0.06663,Q8EUC0_MYCPE/4-61:0.27300):0.15132):0.07518):0.05060,RL29_THETN/3-60:0.28211):0.04702):0.16118,(Q26035_PLAFA/6-63:0.47563,(RL29_SULTO/19-75:0.29072,RL29_SULSO/5-62:0.20065):0.10161):0.08910):0.02869,RL29_LEPIN/6-61:0.71991):0.12163,RL29_METJA/6-64:0.17480):0.16107,RL29_METTH/6-64:0.32373):0.18703,(RL29_THEVO/6-64:0.45446,(RL29_METKA/8-66:0.19658,RL29_PYRAE/9-66:0.43524):0.06008):0.07874):0.08937,(RL29_METMA/6-64:0.28630,(RL29_HALMA/5-63:0.16598,RL29_HALN1/6-64:0.13842):0.13587):0.04437):0.11614,RL29_ARCFU/6-64:0.40677):0.10931,RL29_CHLTE/3-60:0.66164):0.09197,(Q8SQQ7_ENCCU/5-61:0.51922,O97445_GIALA/6-65:0.38673):0.08644):0.11462,(((RL35_SCHPO/5-63:0.29326,RL35_YEAST/6-61:0.38463):0.12776,RL35_BABBO/6-64:0.34683):0.09206,RL352_ARATH/6-64:0.35601):0.04915):0.07524,((Q8R102_MOUSE/6-64:0.16305,Q962T0_SPOFR/6-64:0.33917):0.10780,RL35_CAEEL/6-64:0.21824):0.02647):0.13985,Q96UT5_PARBR/8-66:0.13961,Q96W38_OPHNO/21-78:0.18338);