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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF00801 phylogeny
for restricted amino acid alignment


 
(PKD1_HUMAN/855-928,(PKD1_HUMAN/745-817,(((((O08852_MOUSE/277-352,PKD1_HUMAN/277-352),((((O08852_MOUSE/2062-2137,PKD1_HUMAN/2066-2141),O42181_FUGRU/2131-2204),(Q15142_HUMAN/1425-1493,(O08852_MOUSE/1888-1963,PKD1_HUMAN/1892-1967))),(((O42181_FUGRU/1180-1255,(O08852_MOUSE/1125-1202,PKD1_HUMAN/1131-1208)),(PM17_HUMAN/224-300,P115_CHICK/230-315)),((((O42181_FUGRU/1264-1338,(O08852_MOUSE/1211-1285,PKD1_HUMAN/1217-1291)),SORC3_HUMAN/826-910),((O42181_FUGRU/1432-1509,(O08852_MOUSE/1379-1456,PKD1_HUMAN/1385-1462)),(O42181_FUGRU/1074-1171,(O08852_MOUSE/1018-1116,PKD1_HUMAN/1024-1122)))),((O42181_FUGRU/1518-1593,((O08852_MOUSE/1465-1538,PKD1_HUMAN/1471-1544),Q15142_HUMAN/1152-1247)),((Q9Z5Z7_METCA/130-207,(((O42181_FUGRU/1788-1862,(O42181_FUGRU/987-1063,Q15142_HUMAN/652-728)),((O42181_FUGRU/1956-2032,(O42181_FUGRU/1602-1677,PKD1_HUMAN/1553-1628)),((O08852_MOUSE/1720-1795,PKD1_HUMAN/1723-1798),((O42181_FUGRU/1871-1947,(O08852_MOUSE/1631-1711,PKD1_HUMAN/1637-1714)),((O42181_FUGRU/2041-2118,PKD1_HUMAN/1976-2057),(O08852_MOUSE/1804-1879,PKD1_HUMAN/1807-1883)))))),((HOC_BPT4/106-186,(Q9ZIX3_9GAMM/348-425,(((GUNA_PSEFL/730-813,((Q9RQJ3_AERHY/668-748,Q43919_AERPU/671-751),(Q9ZIX2_9GAMM/597-675,CHIA_ALTSO/599-678))),Q9ZIX2_9GAMM/692-769),CHIA_ALTSO/692-768))),O07351_VIBCH/843-917))),(((((O58659_PYRHO/3454-3527,(((((Y1468_METJA/730-806,O58659_PYRHO/3917-3986),Y1468_METJA/900-973),O28874_ARCFU/242-314),P71140_CLOTM/1365-1442),O28621_ARCFU/382-455)),(COLA_CLOPE/781-855,(Q9YFD7_AERPE/72-149,Q9YFD7_AERPE/171-260))),((Q46085_CLOHI/732-808,Q9X721_CLOHI/802-878),Q46085_CLOHI/823-898)),((O07351_VIBCH/766-836,((Y1468_METJA/818-882,O26179_METTH/182-253),(((((O53132_METMA/115-188,O53132_METMA/33-104),(O26812_METTH/252-327,O26812_METTH/1357-1430)),(Q50246_METMA/245-314,Q50245_METMA/353-424)),((((Q50247_METMA/192-264,Q50247_METMA/627-699),(Q50247_METMA/542-614,(((Q50247_METMA/457-527,(Q50244_METMA/575-647,Q50247_METMA/370-442)),(Q50247_METMA/105-177,Q50247_METMA/22-92)),Q50247_METMA/278-348))),Q50247_METMA/705-781),Q50244_METMA/316-386)),((Q9XBW4_PORGI/571-646,Q9XBW4_PORGI/486-562),Q9XBW4_PORGI/658-732)))),((((O54108_STRCO/673-749,API_ACHLY/483-553),(XANP_XANS2/645-715,Q9WXI8_9BACI/1264-1356)),O27076_METTH/276-350),COLA_VIBAL/614-688))),O69947_STRCO/512-588))))))),O42181_FUGRU/296-364),(O42181_FUGRU/1348-1423,PKD1_HUMAN/1301-1376)),Q9WXI8_9BACI/1570-1651)),O08852_MOUSE/845-922);
(PKD1_HUMAN/855-928:0.25957,(PKD1_HUMAN/745-817:1.36793,(((((O08852_MOUSE/277-352:0.05746,PKD1_HUMAN/277-352:0.26359):1.09656,((((O08852_MOUSE/2062-2137:0.23069,PKD1_HUMAN/2066-2141:0.00683):0.19494,O42181_FUGRU/2131-2204:1.07890):0.13153,(Q15142_HUMAN/1425-1493:0.02067,(O08852_MOUSE/1888-1963:0.16207,PKD1_HUMAN/1892-1967:0.08945):0.44718):0.36632):0.59302,(((O42181_FUGRU/1180-1255:0.94788,(O08852_MOUSE/1125-1202:0.19511,PKD1_HUMAN/1131-1208:0.21282):0.27998):0.10683,(PM17_HUMAN/224-300:0.69637,P115_CHICK/230-315:0.32666):0.98686):0.16505,((((O42181_FUGRU/1264-1338:0.56202,(O08852_MOUSE/1211-1285:0.02772,PKD1_HUMAN/1217-1291:0.23415):0.61732):0.49769,SORC3_HUMAN/826-910:1.17925):0.45134,((O42181_FUGRU/1432-1509:0.49027,(O08852_MOUSE/1379-1456:0.25380,PKD1_HUMAN/1385-1462:0.04006):0.83522):0.38704,(O42181_FUGRU/1074-1171:0.57354,(O08852_MOUSE/1018-1116:0.04486,PKD1_HUMAN/1024-1122:0.17477):0.34509):0.93204):0.00000):0.09239,((O42181_FUGRU/1518-1593:0.74495,((O08852_MOUSE/1465-1538:0.31083,PKD1_HUMAN/1471-1544:0.00000):0.29287,Q15142_HUMAN/1152-1247:0.13847):0.57945):0.24661,((Q9Z5Z7_METCA/130-207:1.16280,(((O42181_FUGRU/1788-1862:1.03833,(O42181_FUGRU/987-1063:0.42129,Q15142_HUMAN/652-728:0.36015):0.75391):0.40270,((O42181_FUGRU/1956-2032:0.86438,(O42181_FUGRU/1602-1677:0.43698,PKD1_HUMAN/1553-1628:0.10575):0.66496):0.14553,((O08852_MOUSE/1720-1795:0.23884,PKD1_HUMAN/1723-1798:0.04597):0.83685,((O42181_FUGRU/1871-1947:1.05626,(O08852_MOUSE/1631-1711:0.28064,PKD1_HUMAN/1637-1714:0.14486):0.55036):0.34099,((O42181_FUGRU/2041-2118:0.87414,PKD1_HUMAN/1976-2057:0.62907):0.85052,(O08852_MOUSE/1804-1879:0.41017,PKD1_HUMAN/1807-1883:0.06683):0.81175):0.22023):0.06645):0.04581):0.07210):0.09547,((HOC_BPT4/106-186:0.88560,(Q9ZIX3_9GAMM/348-425:0.43401,(((GUNA_PSEFL/730-813:0.89486,((Q9RQJ3_AERHY/668-748:0.14311,Q43919_AERPU/671-751:0.11255):0.35764,(Q9ZIX2_9GAMM/597-675:0.46931,CHIA_ALTSO/599-678:0.55076):0.20764):0.10368):0.24328,Q9ZIX2_9GAMM/692-769:0.14688):0.06826,CHIA_ALTSO/692-768:0.42492):0.36836):0.67617):0.43164,O07351_VIBCH/843-917:0.93819):0.22295):0.00000):0.15779,(((((O58659_PYRHO/3454-3527:0.67719,(((((Y1468_METJA/730-806:0.41635,O58659_PYRHO/3917-3986:0.60138):0.15317,Y1468_METJA/900-973:0.44047):0.15392,O28874_ARCFU/242-314:0.54720):0.10528,P71140_CLOTM/1365-1442:0.35454):0.16355,O28621_ARCFU/382-455:0.63052):0.19565):0.12604,(COLA_CLOPE/781-855:0.49273,(Q9YFD7_AERPE/72-149:0.42897,Q9YFD7_AERPE/171-260:0.61921):0.11637):0.07675):0.19040,((Q46085_CLOHI/732-808:0.45463,Q9X721_CLOHI/802-878:0.32421):0.00654,Q46085_CLOHI/823-898:0.66607):0.14450):0.00000,((O07351_VIBCH/766-836:0.49773,((Y1468_METJA/818-882:0.46724,O26179_METTH/182-253:0.68556):0.00000,(((((O53132_METMA/115-188:0.36985,O53132_METMA/33-104:0.33203):0.29696,(O26812_METTH/252-327:0.11517,O26812_METTH/1357-1430:0.08638):0.47611):0.19713,(Q50246_METMA/245-314:0.29738,Q50245_METMA/353-424:0.31071):0.03171):0.16759,((((Q50247_METMA/192-264:0.30858,Q50247_METMA/627-699:0.10540):0.00000,(Q50247_METMA/542-614:0.10814,(((Q50247_METMA/457-527:0.08728,(Q50244_METMA/575-647:0.49509,Q50247_METMA/370-442:0.11875):0.08886):0.06494,(Q50247_METMA/105-177:0.20433,Q50247_METMA/22-92:0.20278):0.05993):0.04073,Q50247_METMA/278-348:0.30077):0.12649):0.11221):0.16896,Q50247_METMA/705-781:0.65847):0.19627,Q50244_METMA/316-386:0.28254):0.02657):0.15776,((Q9XBW4_PORGI/571-646:0.40767,Q9XBW4_PORGI/486-562:0.25950):0.09771,Q9XBW4_PORGI/658-732:0.42982):0.40143):0.13550):0.19565):0.04725,((((O54108_STRCO/673-749:0.33144,API_ACHLY/483-553:0.03912):0.06779,(XANP_XANS2/645-715:0.02747,Q9WXI8_9BACI/1264-1356:1.22248):0.14251):0.29181,O27076_METTH/276-350:0.78429):0.08190,COLA_VIBAL/614-688:0.46925):0.08206):0.11843):0.20613,O69947_STRCO/512-588:0.69458):0.31489):0.09309):0.12954):0.18323):0.02768):0.05766):0.45481,O42181_FUGRU/296-364:1.07515):0.00000,(O42181_FUGRU/1348-1423:0.49580,PKD1_HUMAN/1301-1376:0.55016):0.65540):0.00000,Q9WXI8_9BACI/1570-1651:1.24908):0.85727):0.91870,O08852_MOUSE/845-922:0.49386);