PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam
 pan•dit |
PANDIT Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees |
PF00662 alignment |
| NUOL_RHOCA/56-117 | CACATCCATCTGCTGGACTGGATCCGTTCGGGGGCG...CTCGATACCTCCTGGGGGATCCGGCTTGACCGGCTGACCGCGATCATGCTGATCGTCGTCACCACGGTCTCGGCGCTGGTGCATCTCTATTCCTGGGGCTACATGGCC...CATGACGAGAACTGGACC.....................CATCACGAGGCCTACAAGGCGCGG |
| NQO12_PARDE/56-124 | CATATCCCGGTGCTCGACTGGGTCGTGACCGGCGAT...TTCCATGCCGAATGGGCGATCCGGCTGGACCGGCTGACCGCGATCATGCTGATCGTCGTGACCACCGTTTCGGCGCTCGTGCACATGTATTCGCTGGGCTACATGGCC...CATGACGACAACTGGACGcatgacgagcactacaaggccCGCTTCTTCGCCTATCTCTCGTTC |
| NU5M_SCHCO/78-139 | TTTATTAACTTAGGAACTTGGGTAGACTCAGAATAT...ATAAAAATAAGCTGAGAATTTACTTTTAATGAAATAACATTACCTTTCTTATTTACAGTATTATTTATTTCATTTTTAATTCATTTATTTTCTGTAAATTATATGGCT...AATGATCCTCACATTCAA.....................AGATTTTTCTCTTACTTATCTCTT |
| NU5M_RHIST/58-119 | TCTATTAAATTAATGAGCTGGATTGATTCAGAATTT...TTATTAGTATCATGGGGATTTATTTACGATAGTTTAACTGTATCTATGTTATTACCAGTACTTATTGTATCTGCTTTAGTACATATTTATTCTACAAATTATATGAGT...GAAGATCCTCATAATCAA.....................AGATTTTTTGCATATTTATCAATG |
| NU5M_NEUCR/58-119 | ACTATAAATTTATTTAGATGAATAGATAGTGAGTGA...TATAACATTCTTTGAGGTTTTCAATTTGATAGTTTAACAGTGGCAATGTTAATACCTGTATTAATAATAAGTTCTTTAGTTCACATATATTCAATTTCGTACATGAGC...CATGATCCTCATAACCAA.....................AGATTTTTTAGTTATTTAAGTTTA |
| NU5M_EMENI/58-119 | ACAATAAATATAGCAAGATGATTAGATGTAGAATCA...TTATATGTATTATGAATTTTTAGATTTGATTCTTTAACAGTATCAATGTTTATTACAGTATTAATAGTATCAAGTTTAGTACATATATATTCTATAAGTTATATGAGC...CATGACCCACACAACCAA.....................AGATTTTTTAGTTATTTAAGTTTA |
| NU5M_PHYIN/59-120 | ATTATTTATATTTCAAATTGGATTAATAGTGGTTTA...TTTAATTGTAATTGGTGTTTTTTATTTGATAGTTTAACTATGATAATGTTAGTTGTTGTAACGAGTATTTCAACTTTAGTTCATTTATATTCATCACAATATATGGCC...CACGATCCACATTTATCT.....................AGATTTATGTCATATTTATCATTA |
| NU5M_MARPO/58-119 | TATATAAAGATTGCTCCTTGGATTTTTTCGGAACTC...TTTGACGCTGCTTGGGGCTTTTTATTTGACAGCCTTACAGTCATTTTATTATTGGTCGTCACAATTGTAAGTAGCTTAGTTCATATTTATTCAATTTCCTATATGTCT...GAGGATCCGCATAGTCCA.....................CGTTTTTTTTGCTATTTGTCAATT |
| NU5M_ARATH/58-119 | TATCTAAGAATTGCTCCATGGATCTCATCGGAAATG...TTTGATGCTTCTTGGGGCTTCTTGTTCGATAGCCCGACCGTAGTGATGTTAATTGTGGTTACATCCATAAGTAGCTTGGTCCATCTTTATTCCATTTCATATATGTCC...GAGGATCCGCATAGCCCT.....................CGATTTATGTGTTATTTATCCATT |
| NU5M_CHOCR/58-119 | ACTATTTTTTTGGTATCTTGAATTAAATCTGGAGCT...TTTTATGTTTCATGAGGATTTTTATTTGATAGTCTTACAGTTACAATGCTAGTTGTTATTACATTAGTTTCTAGTTTAGTTCATATTTATTCCATAAAATACATGGAA...AATGATCCTCATCAACCG.....................CGATTTATGTCTTATTTAGAAATT |
| NU5M_ALLMA/60-121 | ACAATTTATCTGTCACCATGGATGAACGTTATAGGT...GCTCATGCAGATTGGGCTTTTTACTTTGATTCAATTTCAATTACAATGTGTGTTGTGGTTTCATCAATCTCATCACTTGTTCATCTTTATTCAATAGGATATATGCAA...GGTGATCCACACATACAA.....................AGATTTTTCTCTTATTTATCTTTA |
| NU5C_SYNP2/69-130 | TTTACCTACACCCTAGAATGGGCGGCGGCAGGCGAT...TTTCATCTGCAGATGGGCTATACCGTGGATCACCTGAGTGCCTTGATGTCGGTGATCGTAACCACGGTGGCCTTGCTGGTGATGATCTATACCGATGGTTACATGGCC...CACGATCCGGGTTATGTC.....................CGTTTTTATGCTTATTTGAGCATT |
| NU5C_MARPO/69-130 | CATAGATATTTATGGTCTTGGGTTCTTTATAAAAAT...TTTGTTTTAGAAATAGGCTATTTACTTGATCCACTTACTTCAATTATGTTAGTTTTAGTAACTACAGTAGCAGTTATGGTTATGATTTATAGTGATAGTTATATGTTT...TATGATGAAGGATATATA.....................AAATTTTTTTGTTATTTAAGTCTT |
| NU5C_ADEHI/69-130 | TATCAATATGTATGGTCTTGGATTATCAATAATGAT...TTTTCTTTAGAATTTGGATACTTGATCGATCCACTTACTTCTATTATGTCAATATTAATAACTACTGTTGGAATTATGGTTCTTATTTATAGTGATAATTATATGTCT...CATGATCACGGATATTTG.....................AGATTTTTTGCTTATATGAGTTTT |
| NUOL_ECOLI/61-122 | AGCCAGCCGCTGTGGACGTGGATGTCGGTAGGCGAC...TTTAACATCGGTTTTAACCTGGTGCTGGACGGCCTGTCGCTGACCATGCTCTCGGTGGTCACTGGTGTGGGTTTCCTTATTCACATGTACGCCTCCTGGTATATGCGC...GGTGAAGAGGGCTACTCT.....................CGCTTCTTCGCTTACACCAACCTG |
| NU5M_CANPA/14-75 | TCAATTAGTCTAGGTAATTGATTAAATATAGGTGAT...ATTATAATTCCTTATGGTTTATCACTTGATTCATTAGCTATGACTGTAATGATACCTGTAGGTATAGTAACTTTATGTGTTCTTTTATATGCTATTGAATATATGAGT...CATGATCCTAATCGTAAT.....................ACATTTTATATAATATTAAGTGTA |
| NU5M_XENLA/64-125 | ATTACCACTAACTTTCACTGAATAAACATTAATACA...TTTGACATTAATATGAGCTTTAAATTTGATATTTATTCTTCTATTTTTATCCCTATCGCTTTATTCGTAACATGATCTATCTTAGAATTTGCCACCTGATATATAGCC...TCAGACCCAATAATTTCC.....................CGATTCTTTAAATACCTTCTTACT |
| NU5M_CYPCA/63-124 | ATTATTACGAACTGACAATGAATAAACACCCAAGCA...TTTGACGTAAACATCAGTTTCAAATTCGACCACTACTCCCTAATCTTCGTCCCAATCGCCCTATACGTCACCTGATCAATTTTAGAATTCGCACTATGATATATACAC...TCCGACCCCAACATTGAC.....................CGATTCTTCAAATACTTACTCACA |
| NU5M_CROLA/67-128 | ATTGTGACAAACTGACACTGAATGAACACCACAATA...TTTGACATCAACATTAGCTTCAAATTTGACTACTACTCCCTCGTCTTTACCCCCATCGCCCTTTATGTAACTTGATCAATCCTTGAATTTGCCTCCTGGTACATACAC...GCCGACCCCTATGTTAAC.....................CGCTTCTTTAAATATTTACTAACA |
| NU5M_CHICK/63-124 | ATTGCCACCCACTGAGAATGACAATTTATCCCCAAC...TTCAAGATCCCCATCTCCCTAAAAATAGACATATACTCCATAATATTCTTCCCCATTGCACTATTTGTAACCTGATCCATCTTAGAGTTCGCAACATGATACATAGCA...TCCGAACCATTTATTACA.....................AAATTCTTTACCTACCTACTCACC |
| NU5M_RAT/62-123 | ATAATTACTAACTGACATTGACTAACTATTAATTCT...ATTAAACTTACTATAAGTTTCAAAATTGACTATTTCTCAATCCTATTCCTATCAGTATCCCTATTCGTAACATGATCAATTATACAATTCTCTTCATGATATATACAC...TCTGACCCCCACATTAAC.....................CGATTCATTAAGTACTTAATAATA |
| NU5M_MOUSE/62-123 | ATAATTACAACCTGGCACTGAGTCACCATAAATTCA...ATAGAACTTAAAATAAGCTTCAAAACTGACTTTTTCTCTATCCTGTTTACATCTGTAGCCCTTTTTGTCACATGATCAATTATACAACTCTCTTCATGATATATACAC...TCAGACCCAAACATCAAT.....................CGATTCATTAAATATCTTACACTA |
| NU5M_HORSE/60-121 | ATTATCTCAAACTGACACTGAATAACCATACAAACC...CTCAAACTATCCCTAAGCTTCAAACTAGATTACTTCTCAATAATTTTCGTACCAGTAGCCCTATTCGTAACATGATCTATTATGGAATTCTCCCTATGATACATGCAC...TCAGATCCTTACATTACT.....................CGATTTTTTAAATACTTACTTACA |
| NU5M_BALMU/62-123 | CTCATCTCAAACTGACACTGAATCACCATTCAAACC...CTCAAACTAACACTTAGCTTTAAAATAGACTACTTTTCACTCATATTTATACCAGTAGCCCTATTTATTACATGATCCATCATAGAGTTCTCAATATGATATATACAC...TCCGACCCCTACATCAAC.....................CAATTCTTTAAATACCTACTCCTT |
| NU5M_DIDMA/64-125 | ATTATTACTAACTGACATTGATTCTCTATCCATTCA...TTTAACATCTCAATAAGTTTTAAAATAGACTTTTTCTCAATTATTTTTATCCCAATTGCCCTATTTGTTACATGAGCAATTTTAGAATTTTCCTTATGATATATACAC...TCAGACCCTAATATTTCC.....................CAATTTTTTAAATACCTTATCATC |
| NU5M_STRPU/94-155 | AAAATCACTCTCTCCTTGTGGCTAAGAAACACCCCC...CTAAAAATTTCACTTAATTTTATTTATGATCAATACTTTCTAGTTTTTCTTTCAGTGGCCCTAATAGTTACATGATCGATCATGGAGTTCTCATTTTATTACATGACA...GAAGACCCTAAAAGAAGC.....................GCTTTCTTCCGGTTATTAACTATT |
| NU5M_PARLI/94-155 | AAACTAACATTTTCCCTATGATTTAAAAAAACCCCG...ACTAACGTGTCAATAAACTTTCTGCTTGACCAGTATTTTCTACTTTTTTTATCCGTTGGACTAATAGTAACCTGATCAATAATGGAATTTTCTTACTACTACATGAAG...GAGGACCCTAAAGGAAAG.....................GCCTTCTTCCGGCCTTTTGGCCAT |
| NU5M_ASTPE/88-149 | ACCGTCTCCCTATTTAATTGACTTCCTAAAAAAGGA...TTTTCATTAAATGTAGAATTTCGTTTTGACCTAAAGTTTAAAACCTTTTTGTCAGTTGCCCTTATAGTCTCATGGTCCATATTAGAATTTTCATACTACTACATGGAC...AACGACCCAAATCCTAAT.....................AAATTTTTTCGGCTTCTTATAATC |
| NU5M_APILI/32-94 | TTTTTTTTTGAATGAAATATTTATACATTTAATTCA...ATAAAGTTTAATTTTTTGTTATTAATTGATTATAAATCATTAATATTTATTTTTTTAGTTAGAATAATTTTTTCTATAATTATTATTTATAGAATTAGATATATAGATttaAGTGAATTAAAAATGGAT.....................CGTTTTTTATATTTAATAATTTTA |
| NU5M_ANOAR/36-97 | TATTTTATTGAATGAGAAATTTTAAGATTACAATCT...ATATCTATTGTTATAACATTTTTATTTGATTGAATAAGCTTAATATTTATATCTTTTGTTTTGTTAATTTCTTCTTTAGTAATTTTTTATAGAAATCAATATATAGAA...GAAGATTATAATATTAAT.....................CGGTTTATTTTATTAGTATTAATA |
| NU5M_ALBCO/24-85 | TATCTTTTAATATTTAATTTATTTTCAACCCAAAGG...GTTAACTTTAACTTAGCTTTAATTTGTGATAAAGTAAGCACAAGGTTTTTGGTAGTGGTATTACTAATTTCTAGCTGTGTTTTTCTTTTTGCTAATGAATATATATCT...GAAGATCATTATAACATC.....................CGTTTTGGTTGAATTTTAATCAGA |
| NU5M_PARTE/58-120 | GCGATTCACCTCTTCAGGTGGTTCCCCCTTTCAGCAggcTACCTCGTAAACTTTAGCTTTTACATCGATACGGTAGCCTACAGCTTTACTCTCCTAACCTTGACGATAGGTGTTTTCGTGAACTTATACACGTATTCTTATTTTAGG...TACGAGCCCCATATCAGC.....................CGCCTCATCTCCCTCATAAACGCT |