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PANDIT Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees |
PF00657 alignment |
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| PHLX_RABIT/394-668 | IGAMGDSLTAGNGagsqpg..nildvltQYRGLSWSVGGDQNISTVTTLAN.................ILREFNPSLQGFSVGTGRETTSQAFFNQAvAGaRADgL-..--------.-..-----.-.-.........-----------------.--..........--.--.-----.-----------IPQAQRLVALMKNDTRINFQEDWKIITVFIGGNDL.......................-------CDF........CNDPVRYSPQNFTDNIGTALDILH-.AEIPR-----AFVNLVKVLeiskl.relyqetKVSCPRMiLRSLCPCVLKFDDNSTEIASLIETIKEYQERTQQLI--.--.-.-.DSGRYDTRDDFTVVLQPFFEKVNMPKTQDGLPDNSFF-.-....-----.--------.....-.----.--.-----.-.--.------.-------.---APDCF........HFSSKAHAHAASAL |
| Q98FI8_RHILO/49-230 | LLVLGDSSAAS--...............--VGIGNSEDGLAAQLAVLISQH.................TGRAVRWRAAGFNSATSGQI---------.--.---.--..--------.-..-----.-.-.........-----------------.--..........--.--.-----.---------------------RDHVLPNLSADPWTHIVLAIGTNDT.......................----------........---KNFHSVPRFKKEFGGLLYGLRAkWPEARVVWSPVLEFTRAP-.............-------.--------------------------AMPPLLGKILEIrATaMnRmGERLCLERGAVPAPRLPITNPEQG--------------.-....-----.--------.....-.----.--.-----.-.--.------.-------.--FASDGF........HASEAGYRAWAEHL |
| P74310_SYNY3/108-371 | VVFVGDSFTAG--...............----DGGNQSWISQLRRRL----.................----DRPEISLYNLGITGAG---------.--.---.--..--------.-..-----.-.-.........-----------------.--..........--.--.-----.-----------------VKQFQQLLTSVKDGAHFDEINIMVIGNDFfrtlwypliqdqalwfcqqentkECVENYPPVM........YIANYNDSQEELVDRAKKLYETKGS.SEEPKLNFLQQLRLYNLACdvysl..gknqssLVHFCPHlKFNQANEYDKNELYKNALASLREIKNSFPNAVVRVVHIpEKgEtFsNKYSLEIGSDIKQIGLEYVPLLEICT------------.-....-----.--------.....-.----.--.-----.-.--.------.-----WNrDMYHKHDA........HFNDLGYHNLTECI |
| Q9A5J3_CAUCR/136-332 | IEFIGDSHTVGYG..............sRSTSRSCTAQQIHDLTDTSLAFG.................PILARRLDADYRIQAFSGRGVVRNYNGGApGLpLP-.--..--------.-..-----.-.-.........-----------------.--..........--.--.-----.-----------VLFPRLIPGQEQPRVDVSDSWSPDLLVIGLGTNDF.......................--STPLNPGE........PWKDEAALRKDYRDRYVAFIEALK-.ASRPK-----AKVFLMAG-.............-------.-------------------------DSFAEDVAEVA--.--.-.-.-DRTGAKAVRITGMDLRACDW-----------------.-....-----.--------.....-.----.--.-----.-.--.------.-------.--------........HPSAADQLMMADRL |
| O13496_NEOPA/166-382 | IEFIGDSITCA--...............-YGVDGTEGTFSTKTEDGTKSYA.................YLASKQLNADYSMFSFSGFGIISGYSTDGtRNeVSTvPQyyEKLGFSY-.-..-----.-.-.........-----------------.--..........--.--.-----.-----------WTQFGSDITQLKEVSWDASQFVPDLVVINLGTNDN.......................-----SYMQN........VKGDRAKEEADFVADYVKFIEQIR-.SVHPNAEILCTLGIMGQE-.............-------.--------------------------LYPQIEEAVS--.--.-.-.TYKAASGDEKVNAYKFNQQNINK---------------.-....-----.--------.....-.----.--.-----.-.--.------.-------.-NGKGIDW........HPAPQSHVEAAEEL |
| GUNE_CLOTM/606-804 | IEFIGDSITCAY-...............GNEGTSKEQSFTPKNENSYMSYA.................AITARNLNASANMIAWSGIGLTMNYGGAPgPL.---.--..--------.-..-----.-.-.........-----------------.--..........--.--.-----.-----------IMDRYPYTLPYSGVRWDFSKYVPQVVVINLGTNDF.......................----------........--STSFADKTKFVTAYKNLISEVRRnYPDAHIFCCVGPMLWGTG-.............-------.------------------------LDLCRSYVTEVV--.--.-.-.-----NDCNRSGDLKVYFVEFPQQDGS-----------.-....-----.--------.....-.----.--.-----.-.--.------.-------.-TGYGEDW........HPSIATHQLMAERL |
| Q9RDP5_STRCO/66-296 | VAAVGDSITRGFD.............acAVLSDCPEVSWATGSSAKVDSLAv...............rLLGKADAAEHSWNYAVTGAR---------.--.---.--..--------.-..-----.-.-.........-----------------.--..........--.--.-----.------------------MADLTAQVTRAAQREPELVAVMAGANDA.......................--------CR........STTSAMTPVADFRAQFEEAMATLR-.KKLPKAQVYVSSIPDLKRLwsqgr..tnplgkQVWKLGLcPSMLGDADSLDSAATLRRNTVRDRVADYNEVLREVC--.--.-.AkDRRCRSDDGAVHEFRFGTDQL-----------------.-....-----.--------.....-.----.--.-----.-.--.------.-------.--SHWDWF........HPSVDGQARLAEIA |
| Q9X7W9_STRCO/5-186 | YVAVGDSFTEG--...............--VGDPGPDGAFVGWADRLAVLL.................ADRRPEGDFTYTNLAVRGRL---------.--.---.--..--------.-..-----.-.-.........-----------------.--..........--.--.-----.-----------------LDQIVAEQVPRVVGLAPDLVSFAAGGNDI.......................----------........---------IRPGTDPDEVAERFEL.AVAALTAAAGTVLVTTGF-.............-------.----------DTRGVPVLKHLRGKIATYNGHVRAIA--.--.-.-.-----------DRYGCPVLDLWSLRSVQDRRA------.-....-----.--------.....-.----.--.-----.-.--.------.-------.--WDADRL........HLSPEGHTRVALRA |
| Q9FCB4_STRCO/10-188 | LVAVGDSFTEG--...............--MSDLLPDGSYRGWADLLATRM.................--AARSPGFRYANLAVRGKL---------.--.---.--..--------.-..-----.-.-.........-----------------.--..........--.--.-----.-----------------IGQIVDEQVDVAAAMGADVITLVGGLNDT.......................----------........---------LRPKCDMARVRDLLTQ.AVERLAPHCEQLVLMRSP-.............-------.-----------GRQGPVLERFRPRMEALFAVIDDLA--.--.-.-.-----------GRHGAVVVDLYGAQSLADPRM------.-....-----.--------.....-.----.--.-----.-.--.------.-------.--WDVDRL........HLTAEGHRRVAEAV |
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| Q9KZ70_STRCO/75-262 | LMMLGDSTAAG--...............------QGVHRAGQTPGALLASG.................LAAVAERPVRLGSVAQPGAC---------.--.---.--..--------.-..-----.-.-.........-----------------.--..........--.--.-----.---------------SDDLDRQVALVLAEPDRVPDICVIMVGANDV.......................----------........---THRMPATRSVRHLSSAVRRLR-.TAGAEVVVGTCPDLGTIE-.............-------.-----------------------------RVRQPLRWLaRRaSrQlAAAQTIGAVEQGGRTVSLGDLLGPEFAQNPREL-----.-....-----.--------.....-.----.--.-----.-.--.------.-------.--FGPDNY........HPSAEGYATAAMAV |
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| IAH1_YEAST/6-203 | FLLFGDSITEFAFn............trPIEDGKDQYALGAALVNEY----.................-----TRKMDILQRGFKGYT---------.--.---.--..--------.-..-----.-.-.........-----------------.--..........--.--.-----.-----------SRWALKILPEILKH-----ESNIVMATIFLGANDA.......................---------C........SAGPQSVPLPEFIDNIRQMVSLMKS.YHIRPIIIGPGLVDREKW-.............-------.------EKEKSEEIALGYFRTNENFAIYSDALAKLA--.--.-.-.-----------NEEKVPFVALNKAFQQEGGDAWQQ---.-....-----.--------.....-.----.--.-----.-.--.------.-------.--LLTDGL........HFSGKGYKIFHDEL |
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| Q97DM5_CLOAB/3-182 | LVCIGDSLTYG--...............--YGVSSTSSWVELLKAHF----.................-------SINVINKGINGDT---------.--.---.--..--------.-..-----.-.-.........-----------------.--..........--.--.-----.-----------------TSGILSRSYSDIVKEKPNYVIIMAGTNDM.......................----------........---LMDYSTKLIKDNIELLLKEAKE.NNITPILALQPPVISPLA-.............-------.------------------KTYWDSEIDYEKVAISLL--.--.-.-.-DYIRWAKAYCINNNIAFVSFNIVFINKDNIEA-----.-....-----.--------.....-.----.--.-----.-.--.------.-------.--LYNDGI........HPNSEGHKLMFNEL |
| YQEF_BACSU/25-235 | VVAFGDSNTRG--...............--------SNWDYRDYPKAQQWVn...............iLKTAERGNLDILNAGIGGQT---------.--.---.--..--------.-..-----.-.-.........-----------------.--..........--.--.-----.-----------------TEDARLRFQTDVLDQKPKYLFIMFGTNDA.......................-------AIL........TEGKPRVSKQRFRENLVYFIEESRK.HGIKPILMTCIPIIEGNG-.............-------.KHHLFYYSRYQAAAFEPKGGARKWHNSYNDITRDVS--.--.-.-.-----------KRLDVPLVDNWKHFIEADGGKATDEA-.-....-----.--------.....-.----.--.-----.-.--.------.------LiQSGLIDPSg......nHMTPKGARIVYEGI |
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| Q98E95_RHILO/55-223 | IVGFGDSLTAG--...............--YGLGPGEGFTDKLQAAL----.................--RAKGRDVTVANAGVSGDT---------.--.---.--..--------.-..-----.-.-.........-----------------.--..........--.--.-----.------------------TSGGLARLDWSVPDGTRLVILELGANDM.......................----------........---LRGVLPDIARKNLDEMLARLKQ.RKIAVLLAGMRAAPNLGA-.............-------.----------------------DYQTAFDAIFPELA--.--.-.-.-----------KKYDVALYPFFLDGVAGQPGM------.-....-----.--------.....-.----.--.-----.-.--.------.-------.--QLEDGL........HPSAKGVDLMVERI |
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| GCAT_AERHY/28-322 | IVMFGDSLSDTGKmyskmrgylpssppyYEGRFSNGPVWLEQLTNEFPGLTi...............aNEAEGGPTAVAYNKISWNPK---------.--.---.--..--------.-..-----.-.-.........-----------------.--..........--.--.-----.-----------YQVINNLDYEVTQFLQKDSFKPDDLVILWVGANDY.......................--------LA........YGWNTEQDAKRVRDAISDAANRMV-.LNGAK-----EILLFNLP-.............-------.----DLGQNPSARSQKVVEAASHVSAYHNQLLLNLA--.--.-.-.RQLAPTGMVKLFEIDKQFAEMLRDPQNFGLSDQRNACYgGsyvwKPFASrSASTDSQL.....SaFNPQeRLaIAGNPlLaQAvASPMAArSASTLNCeGKMFWDQV........HPTTVVHAALSEPA |
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