EMBL-EBI > Goldman Group

PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam



PANDIT Homepage
pan•dit
PANDIT
Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF00238 alignment
(19 sequences with 142 aa)


RM38_YEAST/1-138 MIFLKSVIKVIDNSGAQLAECIKVIRKGS---PKSPAMVGDRIVCVIQKAKPLTqnitGTANTNRVKKGDICHAIVVRSKQRNMCRKDGSTVAFGDTACVLINkNTGEPLGTRIMAndgCVDRTLKDKG.YNKICSLASRVI
RM14_ACACA/1-129 MINVQTVLKVADNSGAVFVSCIRLLNSS----SRVGAGVGDTITVVVKKSIIKK....NIKKSKEVKKGQVCSAVILRTI-KGVKRWGNFFLRSSSNSVALIN.KYCLPIGSRLLG...PVFREIRVNLkFSKIISIAQVTL
RL14_THETH/1-122 MIQPQTYLEVADNTGARKIMCIRVLKGS----NAKYATVGDVIVASVKEAIPRG....AVKEGDVVK------AVVVRTK-KEVKRPDGSAIRFDDNAAVIIN.NQLEPRGTRVFG...PVARELREKG.FMKIVSLAPEVL
RL14_BUCAK/1-123 MIQEQTMLNVADNSGARRVMCIKVLGGS----HRRYAGVGDIIKITIKEAIPRG....KVKKGDVLK------AVVVRTK-KGVRRPDGSVIRFDGNACVILNnNSEQPVGTRIFG...PVTRELRNER.FMKIISLAPEVL
RL14_BACST/1-122 MIQQESRLKVADNSGAREVLVIKVLGGS----GRRYANIGDVVVATVKDATPGG....VVKKGQVVK------AVVVRTK-RGVRRPDGSYIRFDENACVIIR.DDKSPRGTRIFG...PVARELRDKD.FMKIISLAPEVI
RL14_THEMA/1-122 MIQQETYLNVADNSGAKKLRVIRVIGGF----HKKYGTVGDIVVCSVREAIPNS....DVKKGDVVR------AVIVRTK-KEIRRNDGTYIRFDDNAAVLID.KFNAPRGTRIFG...PVARELREKG.FMKIVSLAPEVW
RL14_CHLTR/1-122 MIQQESQLKVADNTGAKKVKCFKVLGGS----RRRYATVGDVIVCSVRDVEPDS....SVKKGDVVK------AVIVRTR-NDIHRKDGSTLRFDTNSCVIID.DKGNPKGTRIFG...PIAREIRDRG.FVKISSLAPEVI
RK14_MARPO/1-122 MIQPQTYLNVADNSGARKLMCIRVIGTS----NRKYANIGDIIIAVVKEAVPNM....PIKKSEIVR------AVIVRTC-KEFKRNNGSIIKFDDNAAVVIN.QEGNPKGTRVFG...PIARELRESN.FTKIVSLAPEVL
RK14_MAIZE/1-123 MIQPQTLLNVADNSGARKLMCIRVIGAAG---NQRYARIGDVIIAVIKDAVPQM....PLERSEVIR------AVIVRTR-KEFKGDDGIIIRYDDNAAVIID.QKGNPKGTRVFG...AVAEELRELN.LTKIVSLAPEVL
RK14_SPIOL/1-121 MIQPQTHLNVADNSGARELMCIRIIGAS----NRRYARIGDVIVAVIKEAIPNT....PLERSEVIR------AVVVRTC-KELKRDNGMIIRYDDNAAVIID.QEGNPKGTRIFG...AIARELRQK-.FAKIVSLAPEVL
RK14_CYAPA/1-122 MIQPQSYLTAADNSGARKLMCIRVLGGG----NRRYARIGDVIVAVVKDGIPNI....PIKKSDTVK------AVIVRTR-KELKRDNGMNICFDDNAAVIIN.ADGNPRGTRVFG...PVARELRDKN.FTKIISLAPEVL
RK14_CHLRE/1-122 MIKPLSYLNVADNSGARELMCIRALGGS----YRESANIGDVIIAVVKDALPNM....PVKRSDIVR------AVIVRTR-KGIRRENGMAIRFDDNAAVIIN.KEGNPRGTRVFG...PIARELRDKN.FTKIVSLAPEVL
RK14_EUGGR/1-121 MIKPQTYLKIADNTGAQKIMCIRILGPN-----CQYANIGDIIIAVVKEAIPNM....VVKKSDIVK------AVIVRTV-KGVRRESGMAIRFDENAAVIIN.NDRSPKGTRIFG...PIARELREKE.FVKIMSLAPEVV
RL14_MYCCA/1-122 MIQTLSKLKVADNSGAKEVRVIRNLGGS----VRKFSGIGDIIICSVISATPGA....VIKKGQVVK------AVIVRTT-RELRREDGTYIKFSENAAVLIK.EDKTPRGTRIFG...PIAREIKEAG.FAKIASLAPEVL
RL23_RAT/19-140 GLPVGAVINCADNTGAKNLYIISVKGIKGRLNRLPAAGVGDMVMATVKKGKPE-....--LRKKVHP------AVVIRQR-KSYRRKDGVFLYFEDNAGVIVN.NKGEMKGSAITG...PVAKECADL-.WPRIASNAGSIA
RL14_METVA/11-132 SLPNGARLVCADNTGAKELEVIAVKNYSGTVRRLPSAGVGQIVFVSVKKGTPE-....--MRKQVLP------AIIIRQK-KEYKRADGTRVKFEDNAAVIVT.PEGTPKGSDIKG...PVSKEAAER-.WPGVSRLAKIIH
RL14_HALMA/11-132 GLEKGSLITCADNTGARELKVISVHGYSGTKNRHPKAGLGDKITVSVTKGTPE-....--MRRQVLE------AVVVRQR-KPIRRPDGTRVKFEDNAAVIVD.ENEDPRGTELKG...PIAREVAQR-.FGSVASAATMIV
RM14_TETPY/1-119 MIQKETNLKPIDKCGVWSVRAFHLYGGS----FRNQSTISNFLKVSVKKTRANN....WVPKKTKLK------AIIVTLK-KELKKIDGSYIKFRTNNVVLLK.KRLTPKGKILMG...PVSSNLRRKR.--FLTSFCGSI-
RM14_PARTE/1-119 MIQKETQLNVCDTSSVWVVNTFHIYRGF----RHRIGRLGDYIKVSIRSTKPEC....TIKRGKKKK------AIIVRHAFGRLKR-DGSFSKFSSNVCVLLK.KRTAPLGREIKG...PIFYGVKKKK.--FVASFPGRV-