EMBL-EBI > Goldman Group

PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam



PANDIT Homepage
pan•dit
PANDIT
Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF00093 alignment
(19 sequences with 297 bp)


SOG_DROME/941-1019 TGCAAG...GTGGTCAACAAGGTGTACGAGAACGGCCAGGAGTGGCATCCGATCCTGATGTCCCAC...GGCGAGCAGAAGTGCATC---AAGTGCCGCTGCAAGGAC------------------------TCCAAGGTGAACTGCGATCGCAAGCGC......TGCTCCCGC------...---------TCCACGTGCCAGCAGCAGACACGCGTGaccagcaaacggcgtctgttcgagaaaccgGACGCAGCTGCTCCGGCCATCGATGAGTGCTGCTCC---ACCCAGTGC
SOG_DROME/832-898 TGCCGC...CTGGGCGAGCAGTTCCATCCCGCCGGTGCCAGTTGGCATCCATTCCTGCCGCCCAAT...GGCTTCGATACCTGCACC---ACCTGCAGCTGCGATCCC------------------CTGACCCTCGAGATTCGCTGTCCCCGGCTCGTC......TGCCCGCCG------...---------TTGCAGTGCAGCGAGAAGTTG------..............................---GCCTATCGTCCAGACAAGAAGGCATGCTGCAAG------ATCTGT
SOG_DROME/102-174 TGCCAG...TTTGGCAAAGTTTTGCGCGAATTGGGGTCCACCTGGTATGCGGATTTGGGTCCACCCttcGGAGTTATGTACTGCATC---AAGTGTGAATGTGTGGCGATACCCAAGAAGCGGCGCATCGTTGCACGCGTCCAGTGTCGCAATATCAAAaacgagTGCCCGCCG------...---------GCCAAATGCGATGATCCC---------..............................---------ATCTCGTTGCCCGGAAAATGCTGCAAG------ACCTGT
SOG_DROME/744-803 TGCTTT...CACTCCGGACGCTTCTACAACGAATCGGAGCAGTGGCGCAGTGCCCAG---------...------GATTCCTGTCAG---ATGTGCGCCTGTTTGCGT------------------------GGCCAATCCAGTTGCGAGGTGATCAAG......TGTCCGGCT------...---------CTCAAGTGCAAGTCCACG---------..............................GAGCAACTGCTTCAGCGTGATGGTGAATGCTGTCCC------AGCTGT
TSP2_MOUSE/320-374 TGTGTG...CAGGAGGGCCGAATCTTTGCAGAAAATGAAACCTGGGTTGTGGATAGT---------...------------TGTACC---ACATGCACCTGCAAGAAA------------------------TTTAAAACAGTCTGCCATCAGATCACC......TGCTCACCT------...---------GCAACTTGTGCCAACCCA---------..............................---------TCTTTTGTGGAAGGCGAGTGCTGTCCA------TCCTGT
TSP2_HUMAN/320-374 TGCTGG...CAGGATGGCCGGTTCTTTGCGGAAAATGAAACGTGGGTGGTGGACAGC---------...------------TGCACC---ACGTGTACCTGCAAGAAA------------------------TTTAAAACCATTTGCCACCAAATCACC......TGCCCGCCT------...---------GCAACCTGCGCCAGTCCA---------..............................---------TCCTTTGTGGAAGGCGAATGCTGCCCT------TCCTGC
TSP2_CHICK/326-380 TGCTGG...CAGGATGGCCGAGTCTTTGCAGATAGTGAAAGCTGGATTGTAGATAGC---------...------------TGCACA---AAGTGCACCTGCCAGGAC------------------------TCTAAAATTGTGTGCCATCAAATCACC......TGTCCACCA------...---------GTTTCTTGTGCTGATCCGTCCTTT---..............................---------------ATTGAAGGTGAATGCTGTCCA------GTCTGC
TSP1_HUMAN/318-372 TGCTAT...CACAACGGAGTTCAGTACAGAAATAACGAGGAATGGACTGTTGATAGC---------...------------TGCACT---GAGTGTCACTGTCAGAAC------------------------TCAGTTACCATCTGCAAAAAGGTGTCC......TGCCCCATC------...---------ATGCCCTGCTCCAATGCCACAGTTCCT..............................------------------GATGGAGAATGCTGTCCT------CGCTGT
VWF_HUMAN/2582-2644 TGCATG...CTCAATGGCACTGTCATTGGGCCCGGGAAGACTGTGATGATCGATGTG---------...------------TGCACG---ACCTGCCGCTGCATGGTGCAGGTGGGGGTCATCTCT---GGATTCAAGCTGGAGTGCAGGAAGACCACC......TGC------------...---------AACCCCTGCCCCCTGGGT---------..............................TACAAGGAAGAAAATAACACAGGTGAATGTTGTGGG------AGATGT
CO5A2_HUMAN/41-96 TGCACT...CAGAATGGCCAGATGTACTTAAACAGGGACATTTGGAAACCTGCCCCT---------...------------TGTCAG---ATCTGTGTCTGTGACAAT------------------------GGAGCCATTCTCTGTGACAAGATAGAA......TGCCAGGATGTG---...---------CTGGACTGTGCCGACCCT---------..............................---------GTAACGCCCCCTGGGGAATGCTGTCCT------GTCTGT
CO2A1_MOUSE/34-88 TGTCTG...CAGAATGGGCAGAGGTATAAAGATAAGGATGTATGGAAGCCCTCATCT---------...------------TGCCGC---ATCTGTGTGTGTGACACT------------------------GGGAATGTCCTCTGCGATGACATTATC......TGTGAAGAC------...---------CCAGACTGCCTCAACCCC---------..............................---------GAGATCCCCTTCGGAGAGTGCTGTCCC------ATCTGC
CO1A1_CHICK/33-88 TGCGTC...CAGGACGGGCTGACGTACAACGATAAGGATGTGTGGAAACCCGAACCG---------...------------TGCCAG---ATCTGCGTCTGCGACAGC------------------------GGCAACATCCTCTGCGACGAGGTGATC......TGCGAGGACACC---...---------TCCGACTGCCCCAACGCC---------..............................---------GAAATCCCCTTCGGAGAGTGCTGCCCC------ATCTGC
CO3A1_MOUSE/33-89 TGCAGC...CACCTTGGTCAGTCCTATGAGTCTAGAGATGTCTGGAAGCCAGAACCA---------...------------TGTCAA---ATATGTGTCTGTGACTCA------------------------GGATCTGTCCTTTGCGATGACATAATC......TGTGATGAGGAG---...------CCACTAGACTGCCCCAACCCA---------..............................---------GAGATCCCATTTGGAGAATGTTGTGCA------ATATGC
CO1A1_HUMAN/40-95 TGCGTA...CAGAACGGCCTCAGGTACCATGACCGAGACGTGTGGAAACCCGAGCCC---------...------------TGCCGG---ATCTGCGTCTGCGACAAC------------------------GGCAAGGTGTTGTGCGATGACGTGATC......TGTGACGAGACC---...---------AAGAACTGCCCCGGCGCC---------..............................---------GAAGTCCCCGAGGGCGAGTGCTGTCCC------GTCTGC
VWF_HUMAN/2257-2325 TGCATTggtGAGGATGGAGTCCAGCACCAGTTCCTGGAAGCCTGGGTCCCGGACCACCAGCCC---...------------TGTCAG---ATCTGCACATGCCTCAGC---------------------GGGCGGAAGGTCAACTGCACAACGCAGCCC......TGCCCCACGGCCAAAgctCCCACGTGTGGCCTGTGTGAAGTAGCC---------..............................---CGCCTCCGCCAGAATGCAGACCAGTGCTGCCCCGAGTATGAGTGT
VWF_HUMAN/2431-2494 TGTGTC...CACCGAAGCACCATCTACCCTGTGGGCCAGTTCTGGGAGGAGGGC------------...------------TGCGAT---GTGTGCACCTGCACCGACATGGAGGATGCCGTGATGGGCCTCCGCGTGGCCCAGTGCTCCCAGAAGCCC......TGTGAG---------...---------GACAGCTGTCGGTCGGGC---------..............................TTCACTTACGTTCTGCATGAAGGCGAGTGCTGTGGA------AGGTGC
NOV_CHICK/106-169 TGCGTG...TTCGATGGGATGATTTACCGCAACGGGGAGACGTTCCAGCCCAGC------------...------------TGCAAGTACCAGTGCACCTGCCGGGAC------------------------GGGCAGATCGGGTGCCTGCCCCGC---......TGCAACCTGGGCCTGctgCTCCCCGGCCCCGACTGCCCCTTCCCGCGG------..............................------AAGATCGAAGTCCCCGGAGAGTGCTGCGAGAAGTGGGTGTGC
CTGF_HUMAN/103-166 TGCATC...TTCGGTGGTACGGTGTACCGCAGCGGAGAGTCCTTCCAGAGCAGC------------...------------TGCAAGTACCAGTGCACGTGCCTGGAC------------------------GGGGCGGTGGGCTGCATGCCCCTG---......TGCAGCATGGACGTTcgtCTGCCCAGCCCTGACTGCCCCTTCCCGAGG------..............................------AGGGTCAAGCTGCCCGGGAAATGCTGCGAGGAGTGGGTGTGT
CEF10_CHICK/100-163 TGCGAA...TACAACTCCAAAATCTACCAGAACGGCGAAAGCTTCCAGCCCAAC------------...------------TGCAAGCACCAGTGTACGTGCATAGAT------------------------GGAGCTGTGGGCTGCATCCCGCTC---......TGCCCGCAGGAGCTCtccCTCCCCAACCTGGGCTGCCCCAGCCCCAGG------..............................------CTGGTCAAAGTGCCTGGGCAGTGCTGCGAGGAGTGGGTCTGC