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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF00053 phylogeny
for nucleotide alignment


 
((((((((((((((((((LAMB1_DROME/1045-1093,LAMB2_RAT/1041-1095),(LAMB1_DROME/839-882,LAMC1_DROME/902-953)),(LAMB1_HUMAN/1028-1086,LAMC1_MOUSE/882-930)),LAMB1_HUMAN/821-864),(((LAMB1_DROME/480-528,LAMC1_MOUSE/396-440),(LAMC1_MOUSE/933-978,LAMC1_DROME/414-458)),(LAMB1_HUMAN/773-818,LAMB2_RAT/786-831))),((((AGRN_CHICK/729-773,UNC6_CAEEL/410-457),AGRN_RAT/742-796),LAMA1_HUMAN/951-995),((LAMB1_DROME/1096-1144,LAMB2_RAT/1098-1143),(LAMA1_HUMAN/397-451,LAMA1_MOUSE/404-463)))),(LAMA1_HUMAN/902-948,(LAMB1_HUMAN/458-507,LAMB2_RAT/473-522))),(LAMC1_DROME/956-1001,AGRN_CHICK/675-726)),((LAMB1_HUMAN/1132-1176,(LAMB2_RAT/834-877,LAMB2_RAT/1146-1190)),(LAMC1_MOUSE/981-1026,LAMC1_DROME/1004-1053))),(LAMB2_RAT/413-470,LAMB1_HUMAN/398-455)),(((LAMC1_MOUSE/443-490,(LAMA1_HUMAN/454-500,LAMC1_DROME/461-511)),(LAMA1_HUMAN/1090-1147,LAMA1_MOUSE/1097-1154)),LAMB1_DROME/420-477)),(LAMA1_HUMAN/1403-1449,LAMC1_MOUSE/722-768)),((LAMB2_RAT/880-927,LAMA1_HUMAN/742-788),(((UNC52_CAEEL/1011-1058,((UNC6_CAEEL/347-407,UNC52_CAEEL/955-1002),((LAMC1_DROME/299-356,UNC6_CAEEL/291-344),(LAMB1_DROME/357-417,(LAMB1_HUMAN/335-395,LAMB2_RAT/350-410))))),LAMC1_DROME/744-790),(((LAMC1_MOUSE/826-879,LAMC1_DROME/847-899),((LAMB2_RAT/989-1038,LAMB1_HUMAN/976-1025),LAMB1_DROME/993-1042)),LAMA1_HUMAN/849-899)))),(LAMB1_DROME/885-932,LAMB1_HUMAN/867-914)),(LAMC1_DROME/359-411,LAMC1_MOUSE/340-393)),(LAMA1_HUMAN/791-846,LAMA1_HUMAN/1452-1506)),LAMB1_DROME/935-990),UNC52_CAEEL/1061-1109,LAMB1_HUMAN/917-973);
((((((((((((((((((LAMB1_DROME/1045-1093:0.25929,LAMB2_RAT/1041-1095:0.42037):0.19433,(LAMB1_DROME/839-882:0.26650,LAMC1_DROME/902-953:0.29812):0.11377):0.07794,(LAMB1_HUMAN/1028-1086:0.34729,LAMC1_MOUSE/882-930:0.34674):0.03551):0.09153,LAMB1_HUMAN/821-864:0.35565):0.12934,(((LAMB1_DROME/480-528:0.31568,LAMC1_MOUSE/396-440:0.36033):0.12471,(LAMC1_MOUSE/933-978:0.25108,LAMC1_DROME/414-458:0.32663):0.07601):0.07939,(LAMB1_HUMAN/773-818:0.26509,LAMB2_RAT/786-831:0.18862):0.16234):0.06011):0.03948,((((AGRN_CHICK/729-773:0.16597,UNC6_CAEEL/410-457:0.49778):0.08066,AGRN_RAT/742-796:0.37981):0.18389,LAMA1_HUMAN/951-995:0.35974):0.14499,((LAMB1_DROME/1096-1144:0.30295,LAMB2_RAT/1098-1143:0.41515):0.17860,(LAMA1_HUMAN/397-451:0.14450,LAMA1_MOUSE/404-463:0.10440):0.20849):0.07173):0.08585):0.04995,(LAMA1_HUMAN/902-948:0.26039,(LAMB1_HUMAN/458-507:0.15870,LAMB2_RAT/473-522:0.27163):0.22379):0.12613):0.04419,(LAMC1_DROME/956-1001:0.29445,AGRN_CHICK/675-726:0.34031):0.10540):0.12007,((LAMB1_HUMAN/1132-1176:0.16068,(LAMB2_RAT/834-877:0.36746,LAMB2_RAT/1146-1190:0.21507):0.15094):0.15775,(LAMC1_MOUSE/981-1026:0.36239,LAMC1_DROME/1004-1053:0.38774):0.08762):0.12832):0.04408,(LAMB2_RAT/413-470:0.28495,LAMB1_HUMAN/398-455:0.39233):0.13675):0.10855,(((LAMC1_MOUSE/443-490:0.31018,(LAMA1_HUMAN/454-500:0.32487,LAMC1_DROME/461-511:0.28949):0.07062):0.15039,(LAMA1_HUMAN/1090-1147:0.19252,LAMA1_MOUSE/1097-1154:0.12947):0.23147):0.04493,LAMB1_DROME/420-477:0.32340):0.09832):0.25473,(LAMA1_HUMAN/1403-1449:0.34485,LAMC1_MOUSE/722-768:0.22051):0.06197):0.08094,((LAMB2_RAT/880-927:0.21800,LAMA1_HUMAN/742-788:0.34341):0.12045,(((UNC52_CAEEL/1011-1058:0.38606,((UNC6_CAEEL/347-407:0.46989,UNC52_CAEEL/955-1002:0.18637):0.08499,((LAMC1_DROME/299-356:0.44052,UNC6_CAEEL/291-344:0.36715):0.13660,(LAMB1_DROME/357-417:0.29083,(LAMB1_HUMAN/335-395:0.18012,LAMB2_RAT/350-410:0.21228):0.08339):0.13597):0.19885):0.04880):0.09429,LAMC1_DROME/744-790:0.24070):0.10158,(((LAMC1_MOUSE/826-879:0.23866,LAMC1_DROME/847-899:0.30545):0.09124,((LAMB2_RAT/989-1038:0.34930,LAMB1_HUMAN/976-1025:0.24829):0.08016,LAMB1_DROME/993-1042:0.19354):0.10701):0.05244,LAMA1_HUMAN/849-899:0.22170):0.06924):0.09531):0.07728):0.02265,(LAMB1_DROME/885-932:0.43265,LAMB1_HUMAN/867-914:0.14430):0.10935):0.07909,(LAMC1_DROME/359-411:0.26194,LAMC1_MOUSE/340-393:0.29638):0.18622):0.34916,(LAMA1_HUMAN/791-846:0.17189,LAMA1_HUMAN/1452-1506:0.53034):0.14148):0.19655,LAMB1_DROME/935-990:0.41208):0.20454,UNC52_CAEEL/1061-1109:0.47801,LAMB1_HUMAN/917-973:0.34550);