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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF00043 phylogeny
for nucleotide alignment


 
((((((((((((LIGE_PSEPA/101-223,LIGF_PSEPA/94-234),(DCMA_METDI/105-220,(GTT1_RAT/92-199,GTT2_RAT/92-198))),((((GTH1_TOBAC/94-202,GTH_SILCU/95-204),GTH1_WHEAT/98-210),GTH1_MAIZE/92-200),GTH3_MAIZE/93-202)),(YIBF_ECOLI/85-192,GTA_PLEPL/96-202)),((((GTH1_YEAST/101-218,(EF1G1_YEAST/94-199,EF1G2_YEAST/91-196)),(EF1G_SCHPO/88-196,GTY2_ISSOR/86-185)),((EF1G_HUMAN/92-197,(EF1G_ARTSA/89-194,EF1G1_XENLA/93-198)),SYV2_HUMAN/94-198)),(PCPC_SPHCR/124-232,EF1G_TRYCR/92-198))),((GT_ECOLI/88-189,GT_PROMI/88-189),(((GTS1_DROME/129-235,(((GTP_BOVIN/84-187,GTP1_CAEEL/82-186),(SC11_OMMSL/84-191,(SC04_OMMSL/177-288,(SC20_OMMSL/84-208,((SC1_OCTDO/84-201,(SC1_OCTVU/83-200,SC2_OCTDO/84-201)),SC4_OCTDO/84-201))))),((GT26_SCHJA/86-186,GT26_FASHE/86-186),((GSTM3_HUMAN/95-195,(GSTM2_HUMAN/91-191,(GSTM2_RAT/91-191,GTMU_CRILO/91-191))),GSTM2_CHICK/91-191)))),((GTA3_CHICK/86-191,GTA4_MOUSE/87-192),((GTA2_MOUSE/86-191,GTA1_HUMAN/86-191),GTC_MOUSE/86-191))),GT28_SCHJA/85-191))),URE2_YEAST/210-345),YK67_CAEEL/108-219),(GTZ1_DIACA/98-203,(SSPA_ECOLI/88-193,SSPA_HAESO/89-194))),(GTX4_TOBAC/87-195,GTXA_TOBAC/86-194)),GTX6_SOYBN/87-198),GTX1_SOLTU/83-192,GTX1_TOBAC/83-192);
((((((((((((LIGE_PSEPA/101-223:0.75818,LIGF_PSEPA/94-234:0.59131):0.10837,(DCMA_METDI/105-220:0.57548,(GTT1_RAT/92-199:0.38112,GTT2_RAT/92-198:0.30063):0.24460):0.16883):0.12056,((((GTH1_TOBAC/94-202:0.29056,GTH_SILCU/95-204:0.23729):0.37091,GTH1_WHEAT/98-210:0.17724):0.08236,GTH1_MAIZE/92-200:0.21266):0.11785,GTH3_MAIZE/93-202:0.27542):0.29307):0.10798,(YIBF_ECOLI/85-192:0.85195,GTA_PLEPL/96-202:0.52932):0.06863):0.04387,((((GTH1_YEAST/101-218:0.69391,(EF1G1_YEAST/94-199:0.06697,EF1G2_YEAST/91-196:0.52291):0.38162):0.15813,(EF1G_SCHPO/88-196:0.48577,GTY2_ISSOR/86-185:0.81463):0.35068):0.10634,((EF1G_HUMAN/92-197:0.13047,(EF1G_ARTSA/89-194:0.34026,EF1G1_XENLA/93-198:0.20605):0.10226):0.16948,SYV2_HUMAN/94-198:0.52006):0.23712):0.11545,(PCPC_SPHCR/124-232:0.61478,EF1G_TRYCR/92-198:0.49926):0.13064):0.08730):0.25806,((GT_ECOLI/88-189:0.26535,GT_PROMI/88-189:0.46645):0.50250,(((GTS1_DROME/129-235:0.63567,(((GTP_BOVIN/84-187:0.33146,GTP1_CAEEL/82-186:0.60912):0.04935,(SC11_OMMSL/84-191:0.29546,(SC04_OMMSL/177-288:0.42328,(SC20_OMMSL/84-208:0.19654,((SC1_OCTDO/84-201:0.11156,(SC1_OCTVU/83-200:0.07262,SC2_OCTDO/84-201:0.13948):0.07809):0.03484,SC4_OCTDO/84-201:0.12056):0.14143):0.04409):0.08591):0.57446):0.08391,((GT26_SCHJA/86-186:0.57270,GT26_FASHE/86-186:0.16891):0.32035,((GSTM3_HUMAN/95-195:0.18062,(GSTM2_HUMAN/91-191:0.14782,(GSTM2_RAT/91-191:0.09487,GTMU_CRILO/91-191:0.10008):0.04187):0.08097):0.05553,GSTM2_CHICK/91-191:0.26915):0.13091):0.18006):0.11384):0.16716,((GTA3_CHICK/86-191:0.25333,GTA4_MOUSE/87-192:0.21072):0.08168,((GTA2_MOUSE/86-191:0.17375,GTA1_HUMAN/86-191:0.09993):0.07179,GTC_MOUSE/86-191:0.13706):0.12760):0.31645):0.12189,GT28_SCHJA/85-191:0.78042):0.12322):0.07368):0.15667,URE2_YEAST/210-345:0.99605):0.12473,YK67_CAEEL/108-219:0.75638):0.14028,(GTZ1_DIACA/98-203:0.72773,(SSPA_ECOLI/88-193:0.31149,SSPA_HAESO/89-194:0.21812):0.51914):0.19722):0.08280,(GTX4_TOBAC/87-195:0.24570,GTXA_TOBAC/86-194:0.12056):0.27934):0.31786,GTX6_SOYBN/87-198:0.28007):0.12076,GTX1_SOLTU/83-192:0.16287,GTX1_TOBAC/83-192:0.08179);