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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF00043 phylogeny
for amino acid alignment


 
(((((((YK67_CAEEL/108-219,GTZ1_DIACA/98-203),(YIBF_ECOLI/85-192,((((((((GTH1_MAIZE/92-200,GTH1_WHEAT/98-210),GTH3_MAIZE/93-202),(GTH1_TOBAC/94-202,GTH_SILCU/95-204)),(LIGF_PSEPA/94-234,(DCMA_METDI/105-220,(GTT1_RAT/92-199,GTT2_RAT/92-198)))),GTA_PLEPL/96-202),(GT_ECOLI/88-189,GT_PROMI/88-189)),(URE2_YEAST/210-345,((EF1G_SCHPO/88-196,((EF1G_ARTSA/89-194,(EF1G_HUMAN/92-197,EF1G1_XENLA/93-198)),((EF1G1_YEAST/94-199,EF1G2_YEAST/91-196),SYV2_HUMAN/94-198))),(GTH1_YEAST/101-218,((((GTX1_SOLTU/83-192,GTX1_TOBAC/83-192),GTX6_SOYBN/87-198),(GTXA_TOBAC/86-194,(GTX4_TOBAC/87-195,(SSPA_ECOLI/88-193,SSPA_HAESO/89-194)))),EF1G_TRYCR/92-198))))),LIGE_PSEPA/101-223))),PCPC_SPHCR/124-232),GTT1_DROER/81-181),GTY2_ISSOR/86-185),((((SC1_OCTDO/84-201,(SC1_OCTVU/83-200,SC2_OCTDO/84-201)),(SC04_OMMSL/177-288,(SC20_OMMSL/84-208,SC11_OMMSL/84-191))),SC4_OCTDO/84-201),(((GTP_BOVIN/84-187,GTP1_CAEEL/82-186),((GT26_SCHJA/86-186,GT26_FASHE/86-186),((GSTM3_HUMAN/95-195,GSTM2_CHICK/91-191),(GSTM2_HUMAN/91-191,((GSTM2_RAT/91-191,GTMU_CRILO/91-191),GTMU_CAVPO/91-191))))),(GTS1_DROME/129-235,((GTA3_CHICK/86-191,GTA4_MOUSE/87-192),(GTA2_MOUSE/86-191,(GTA1_HUMAN/86-191,GTC_MOUSE/86-191))))))),GT28_SCHBO/90-196,GT28_SCHJA/85-191);
(((((((YK67_CAEEL/108-219:1.32300,GTZ1_DIACA/98-203:1.65936):0.37108,(YIBF_ECOLI/85-192:1.56893,((((((((GTH1_MAIZE/92-200:0.29384,GTH1_WHEAT/98-210:0.32186):0.23215,GTH3_MAIZE/93-202:0.48140):0.15138,(GTH1_TOBAC/94-202:0.33358,GTH_SILCU/95-204:0.24767):0.20632):0.50260,(LIGF_PSEPA/94-234:1.50236,(DCMA_METDI/105-220:1.16391,(GTT1_RAT/92-199:0.70952,GTT2_RAT/92-198:0.39333):0.30409):0.60753):0.13466):0.35892,GTA_PLEPL/96-202:1.13905):0.08503,(GT_ECOLI/88-189:0.09226,GT_PROMI/88-189:0.71343):1.26579):0.13930,(URE2_YEAST/210-345:1.62840,((EF1G_SCHPO/88-196:0.98361,((EF1G_ARTSA/89-194:0.28887,(EF1G_HUMAN/92-197:0.15030,EF1G1_XENLA/93-198:0.12290):0.12804):0.07194,((EF1G1_YEAST/94-199:0.25457,EF1G2_YEAST/91-196:0.51322):0.90816,SYV2_HUMAN/94-198:0.83070):0.12423):0.55382):0.07977,(GTH1_YEAST/101-218:1.73919,((((GTX1_SOLTU/83-192:0.23917,GTX1_TOBAC/83-192:0.11892):0.15949,GTX6_SOYBN/87-198:0.35627):0.22300,(GTXA_TOBAC/86-194:0.13038,(GTX4_TOBAC/87-195:0.13223,(SSPA_ECOLI/88-193:0.00000,SSPA_HAESO/89-194:0.49683):1.77823):0.13282):0.66082):0.86470,EF1G_TRYCR/92-198:0.70958):0.36986):0.03436):0.22424):0.10298):0.07852,LIGE_PSEPA/101-223:2.44223):0.07575):0.23390):0.09713,PCPC_SPHCR/124-232:0.99912):0.34553,GTT1_DROER/81-181:1.18244):0.04588,GTY2_ISSOR/86-185:1.31178):0.51692,((((SC1_OCTDO/84-201:0.13895,(SC1_OCTVU/83-200:0.07732,SC2_OCTDO/84-201:0.11738):0.06444):0.01915,(SC04_OMMSL/177-288:0.69160,(SC20_OMMSL/84-208:0.25337,SC11_OMMSL/84-191:0.57231):0.05988):0.12255):0.05636,SC4_OCTDO/84-201:0.06549):0.93178,(((GTP_BOVIN/84-187:0.34419,GTP1_CAEEL/82-186:0.88381):0.41378,((GT26_SCHJA/86-186:0.63483,GT26_FASHE/86-186:0.31441):0.18656,((GSTM3_HUMAN/95-195:0.18596,GSTM2_CHICK/91-191:0.37413):0.03800,(GSTM2_HUMAN/91-191:0.20651,((GSTM2_RAT/91-191:0.11061,GTMU_CRILO/91-191:0.18300):0.05375,GTMU_CAVPO/91-191:0.13419):0.08325):0.09429):0.32113):0.36663):0.20579,(GTS1_DROME/129-235:1.41225,((GTA3_CHICK/86-191:0.28220,GTA4_MOUSE/87-192:0.29275):0.12597,(GTA2_MOUSE/86-191:0.20430,(GTA1_HUMAN/86-191:0.06780,GTC_MOUSE/86-191:0.24981):0.08049):0.17353):0.62331):0.15296):0.32363):0.15720):1.24502,GT28_SCHBO/90-196:0.10769,GT28_SCHJA/85-191:0.16177);