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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF00034 alignment
(26 sequences with 393 bp)


C550_CYAPA/53-145 .........---CGTGGAAAACGTTTATTTAAT---AGTACTTGCGGAATTTGTCATGTTGGCGGTATC------...............ACTAAAACAAATCCTAATGTTGGTTTAGATAGTGAAGCGTTAGCTTTAGCAACTCCTCCG------CGTAACAATATTGAATCTCTTGTTGATTACATGAAAAAT---...------......CCTACAAGTTACGATGGGTCAGAAGAAATCTATGATATTCACCCAAGTATTCGTAGTGCTGAT---...------...---..................---...---------GCATTTCCAAAAATGCGTAATCTAACT---GAAGAAGATTTATATGATATTGCAGGACATATTTTA
QCRC_MYCTU/161-239 aacgacctgGGCCGCGGCGGCGACTTGTTCCGGCTCAAC---TGCGCCTCGTGTCACAACTTCACCGGC------...............---------------AAGGGCGGAGCATTGTCGTCCGGCAAATACGCACCCGACCTTGCGCCCGCCAATGAACAGCAAATCCTCACCGCGATGCTGACGGGT------...------......------------CCACAGAAC------------------ATGCCGAAGTTCTCCAACCGCCAG---...------...---..................---...------------------------CTCTCCTTCGAAGCGAAAAAGGACATCATTGCCTACGTGAAGGTCGCCACC
C553_DESVH/22-103 ggtgtcgctGCCGATGGCGCCGCACTCTACAAGTCA------TGCATCGGATGCCACGGTGCCGAT---------...............------------------GGTTCCAAGGCTGCCATGGGTTCGGCCAAGCCCGTGAAGGGG------CAGGGGGCCGAGGAACTGTACAAGAAGATGAAAGGC------...------......TATGCAGACGGTTCCTACGGTGGCGAGCGCAAGGCCATGATGACCAACGCCGTCAAGAAA------...------...---..................---...------------------------TACTCTGATGAGGAATTGAAGGCGCTCGCCGACTACATGAGCAAGCTC---
QCRC_BACSU/181-253 .........GCAGAAGGATATAAGGTTTTTAAGGAACAGGGCTGTATTTCTTGCCATGGGGATAAC---------...............------------------CTTCAGGGAGGAGCGGCCGGGCCTTCATTGGTTGACAGCGGG------CTGAAACCGGATGAAATCAAAAAAATCGCTGTAGAA------...------......---------GGGAAAGGCAAA------------------ATGCCGGCGGGTGTGTTCAAA------...------...---..................---...------------------------GGAAATGATAAGCAGCTCGAAGAACTTGCAAAATTTATTTCTGAAACAACC
C555_METCA/32-110 caggccaccTACAATGGCTTCAAGATCTACAAGCAGCAGCGTTGCGAAACCTGCCACGGCGCCACC---------...............---------------GGCGAAGGCAGCGCGGCATTCCCCAACCTGCTGAACAGCCTCAAG---AACCTGAGCAAGGATCAGTTCAAGGAAGTGGTTCTGAAA------...------......GGCCGCAACGCCATGCCGCCG------------------TTCGAAGCCAACAAGAAG---------...------...---..................---...------------------------GTGGCAGAGGGC---ATCGATGACCTGTACACCTACATCAAAGGCCGCTCG
CYCA_ACEPO/317-407 accgccagcGTTCCGGGTGCTGATACGTATGTGAAGGAA---TGCGCCATCTGTCACCGTAACGACGGTGGT---...............---------------GGCGTGGCCCGCATGTTCCCGCCGCTGGCTGGCAACCCGGTTGTCGTGACCGAGAACCCGACCTCGCTGGTGAACGTGATTGCGCATGGT---...------......GGCGTGCTGCCGCCGAGCAAC---------------TGGGCACCGTCCGCAGTGGCAATGCCGGGT...------...---..................---...------------TACAGCAAGTCGCTGTCCGCCCAGCAGATTGCTGATGTGGTCAACTTCATCCGCACCAGCTGG
C552_THETH/18-108 ......cagGCGGACGGGGCCAAGATCTACGCCCAG------TGCGCGGGGTGCCACCAGCAAAACGGCCAA---...............---------------GGCATCCCCGGGGCCTTCCCGCCCCTCGCGGGCCACGTGGCGGAGATCCTCGCCAAGGAAGGCGGTAGGGAGTACCTCATCCTGGTC------...------......CTTCTCTACGGCCTCCAGGGCCAGATTGAGGTCAAGGGCATGAAGTACAACGGCGTCATGTCC---...------...---..................---...------------TCCTTCGCCCAGCTCAAGGACGAGGAGATCGCCGCCGTCCTCAACCACATCGCCACCGCCTGG
CY4C_PSEPU/38-107 .........GGCAGTGGCAAGAACCTGTATGACAAGGTT---TGTGGCCATTGCCACAAGCCCGAAGTCGGG---...............------------------GTAGGGCCGGTTCTTGAGGGTCGCGGCCTGCCGGAAGCCTACATCAAGGACATTGTGCGCAACGGCTTCCGTGCCATGCCGGCA------...------......------------TTCCCGGCG------------------------------TCTTAT---------...------...---..................---...------------------------GTTGATGACGAATCCCTTACTCAGGTGGCTGAATACCTGTCGAGCCTGCCG
C55L_SYNY3/32-105 ggagatgcgGATAGGGGTCGGGCCATTTTTCAAGCTAAC---TGTGCAGTTTGCCATGGCATCCAAGCTGACGGT...............---------------TACATTGGCCCCAGTCTTTGGGGGGTATCCCAACGGCGGTCCCAGAGCCACATCATTCATCAGGTGGTGAGTGGTCAAACTCCTCCC------...------......------------ATGCCCCAG------------------------------TTTGAA---------...------...---..................---...------------------------CCCAATCCCCAGGAGATGGCGGATTTATTGAATTACCTCAAAACCCTC---
CYCM_BRAJA/75-173 .........GAGAAGGGCGCTGCCGCCGCCAAG---AAG---TGCGGCGCCTGCCACACCTTCGAG---------...............AAGGGCGGTCCGAATCGCGTCGGTCCGAACCTCTATGGCGTCGTCGGCGAGGCACGGGGCGAGGGCCGCAATGGCTTCAACTTCTCGGCGGCCATGAAGGGCAAG---...---GGC......GGCACCTGGACGTTCGACGACCTCAACAAGTTCATCGCCAATCCGAAGGGCTTCATCCCGGGC---...------...---..................---...ACCGCGATGGGCTTCGCCGGCATTCCCAAGGATTCCGAGCGCGCCGATGTCATCGCCTATCTGAATTCGCTGTCG
CYC1_DROME/3-104 ggtgatgcaGAGAACGGCAAGAAGATATTTGTGCAGAAG---TGCGCCCAGTGCCACACCTACGAA---------...............GTGGGGGGCAAACACAAGGTGGGCCCAAATCTTGGCGGGGTCGTGGGTCGCAAGTGTGGC---ACAGCAGCGGGATACAAGTATACCGATGCCAATATAAAGAAG---...---GGC......GTTACCTGGACAGAGGGGAATTTGGACGAGTACCTCAAGGACCCGAAGAAATACATTCCCGGA---...------...---..................---...ACAAAGATGGTGTTCGCAGGTCTTAAAAAGGCTGAGGAGCGGGCCGATTTGATTGCCTTCCTCAAGTCAAACAAG
C550_PARDE/23-139 ggcgacgccGCCAAAGGCGAGAAAGAATTCAACAAG------TGCAAGGCTTGCCACATGATCCAGGCGCCGGACggcaccgacatcatcAAGGGCGGC------AAGACCGGGCCCAACCTTTACGGCGTCGTCGGCCGCAAGATCGCC---TCGGAGGAGGGCTTCAAATACGGCGAAGGCATCCTCGAGGTCGCCgaaAAGAACcccgacCTGACCTGGACCGAGGCCGACCTGATCGAATACGTCACCGACCCCAAGCCCTGGCTGGTCAAGATGaccGACGACaagGGC..................GCCaagACCAAGATGACCTTCAAG---ATGGGCAAGAACCAG------GCCGACGTGGTGGCCTTCCTGGCCCAGAACTCG
C550_BACSU/46-120 aaagatgcaAACGCTTCACCAGAAGAAATTTACAAGGCAAACTGCATCGCATGCCACGGTGAAAAT---------...............---------------TATGAAGGTGTTTCGGGTCCTAGCTTAAAAGGTGTAGGGGATAAG---------AAAGATGTCGCTGAAATTAAAACAAAGATCGAA------...------......------AAAGGCGGTAATGGA------------------ATGCCTTCCGGTCTTGTTCCG------...------...---..................---...------------------------------GCCGATAAGCTGGATGATATGGCAGAGTGGGTGTCAAAAATTAAA
CYC4_AZOVI/22-109 ggagatgccGCCGCCGGCCAAGGCAAGGCGGCC------GTCTGCGGCGCCTGCCACGGCCCGGAC---------...............---------GGCAACAGCGCGGCCCCCAACTTCCCGAAACTGGCCGGCCAGGGCGAG------------CGCTATCTGCTCAAGCAGATGCAGGACATCAAG------...------......---GCCGGCACCAAGCCGGGCGCTCCCGAAGGCAGCGGTCGCAAGGTGCTGGAAATGACCGGC---...------...---..................---...---------ATGCTCGACAACTTCAGCGACCAGGAC---CTGGCCGACCTCGCCGCCTACTTCACCTCGCAGAAG
CYSD_CHRVI/25-102 ......gccGAGCCTACCGCCGAGATGCTGACCAACAAC---TGCGCCGGCTGCCACGGCACCCATGGCAAC---...............---------------AGCGTCGGCCCCGCCTCGCCCTCCATTGCCCAGATGGACCCGATGGTCTTCGTCGAGGTGATGGAAGGCTTCAAGAGCGGCGAGATC------...------......---GCCTCGACCATCATGGGC---------------------CGTATCGCCAAGGGC---------...------...---..................---...------------------------TACTCGACGGCGGACTTCGAGAAGATGGCCGGCTACTTCAAGCAGCAGACC
COX2_BACSU/258-352 ...ttggctAAGCAGGGTGAAGAACTGTTTAAAGAGAAAAACTGCCTGAGCTGCCATGCGGTAGAGCCG------...............AATGATAAGCGTGCAGAAGCCGCTAGAACGGCACCTAACTTGGCGACCTTCGGTGAA---------AGGACAAAAGTGGCAGGGGTGAAAGAGGCCAACAAA------...------......GAAAATGTGAAGGCTTGGCTGAAGGACCCTGACAGCATAAAGCCGGGGAACAAAATGACAGGC---...------...---..................---...---------ACATATCCAAAGCTCTCAGACAGCGAA---ACAAATGCGCTTTATGAATACTTAAAAGGCTTAAAA
COX2_BACP3/262-354 ......gccAAAGAAGGGGAAGCGATTTTCAAT---AAAAGCTGTATTGGCTGTCATGCGGTGACGCCT------...............CTTGATAAGCGTCCGGCGCAACGGCGCACAGCGCCGAACTTGGCGGATTTTGGCGAT---------CGCGAACGAATTGCGGGTATTTTGGAACATAATGAA------...------......GAAAATCTAAAAAAATGGCTGAGAGACCCGAACAGCGTGAAGCCTGGAAATAAAATGGCGGGT---...------...---..................---...---------ACATACGGCCACTTGACGGAAGAGCAA---ATTGACGCATTGACGAAATATTTGATGAGCTTAAAA
COX2_BACPF/252-339 ......gctAACCAAGGTCGTCAAGTATTTGAAGAAAACTCATGTATTGGATGTCACGCGGTAGGT---------...............------GGAACGGGAACTGCAGCAGGT------CCGGCTTTCACTAACTTTGGAGAG---------CGTGAAGTAATTGCTGGTTATCTTGAGAATAACGAT------...------......GAGAACCTAGAGGCATGGATTCGTGATCCTCAATCTCTAAAACAAGGTAATGTTATGCCA------...------...---..................---...---------GCATACCCTGATATGAGCGAGGAAGAT---ATGGAAGCACTAATTGCATACCTTCGTTCATTAAAA
C552_HYDTH/18-98 .........GCCAATGAACAGCTTGCCAAGCAAAAGGGC---TGTATGGCTTGCCACGATCTGAAAGCTAAG---...............---------------AAGGTGGGACCTGCTTACGCAGATGTAGCTAAGAAGTATGCGGGAAGAAAGGATGCTGTTGATTATCTGGCTGGCAAGATAAAGAAG------...------......GGCGGTTCTGGTGTGTGGGGT---------------TCTGTTCCCATGCCTCCTCAA---------...------...---..................---...---------------AAT------GTAACCGATGCGGAAGCAAAACAGCTTGCCCAGTGGATACTCTCCATAAAG
C551_PSEST/22-104 ...gcgcaaGACGGTGAAGCGCTGTTCAAGAGCAAGCCT---TGCGCGGCCTGCCACAGCGTCGACACCAAG---...............---------------ATGGTTGGCCCGGCTCTGAAAGAAGTCGCCGCCAAGAATGCCGGCGTCGAAGGCGCTGCCGACACCCTGGCTCTGCACATCAAGAAT------...------......GGCAGCCAAGGCGTTTGGGGC---------------CCGATCCCGATGCCGCCAAAC---------...------...---..................---...---------------CCA------GTCACCGAGGAGGAAGCCAAGATCCTCGCCGAGTGGGTTCTTAGCCTCAAG
Q9L933_METSS/65-145 gaggtgatcAAGAAGGGCGAAAGCCTGTTCGCCACCGCC---TGTTCCGGCTGCCATGGGCATTTGGCCGAACGG...............---------------AAGCTGGGGCCGGCCTTGTCCGATGACTACTGGACCTACCCCAAG---AACTCCACCGACAAAGGCCTGTTCGAGACTATTTTTGGC------...------......TGGTGCCGAAGGATGATGGGC---------------------CCGCAACGTGCCGTC---------...------...---..................---...------------------------TTGACGCAGGATGAAATGCTGCAGATCATGAGCTGGGTGCGTTCCATTTAT
Q8RMH3_9PROT/66-146 gaagccttgAATAAAGGTTACGTCATCTTCGCAACAGCT---TGCTCTGGTTGCCATGGCCACTTGGCTGAAGGC...............---------------AAGCTGGGCCCTGCATTGTCAGATGATTACTGGACTTATCCAACC---AATTTGGAAGACAAGGGCCTGTTTGAAACCATTTATGGT------...------......GGGGCGGCTGGTCAAATGGGT---------------------CCGCAGCAGGGCTTG---------...------...---..................---...------------------------CTCGAGCCGGATGAAATTTTGCATGTCATGAGCTGGGTACGCGCTTTGCAA
CYCL_PARDE/66-146 gagatcctgCCCGAGGCCGAAGAGCTTTATGCCGGCATG---TGCTCGGGCTGCCATGGGCATTATGCCGAAGGC...............---------------AAGATCGGTCCCGGCCTGAACGACGCCTACTGGACCTATCCCGGC---AACGAAACCGACGTCGGGCTGTTCTCGACGCTTTACGGC------...------......GGCGCGACGGGGCAGATGGGG---------------------CCGATGTGGGGCAGC---------...------...---..................---...------------------------CTGACGCTGGACGAGATGCTCAGGACCATGGCCTGGGTGCGCCACCTCTAT
CYCL_METEX/77-157 tcctgcctgCGGAATGGCGAGAGTCTGTTCGCGACGTCC---TGCTCGGGCTGCCACGGCCACCTCGCCGAGGGC...............---------------AAGCTCGGGCCGGGCCTGAACGACAATTACTGGACCTACCCGTCC---AACACCACGGATGTGGGCCTGTTCGCCACGATCTTCGGC------...------......GGCGCCAACGGCATGATGGGC---------------------CCGCACAACGAGAAT---------...------...---..................---...------------------------CTGACGCCCGACGAGATGCTTCAGACCATCGCCTGGATTCGCCACCTCTAT
O24761_HYPME/68-147 ggttgtctgCCGAAAGGCGAAGAGGTCTACCTCGAGTCC---TGCTCTGGCTGCCACGGCCACGTGGGCGAAGGC...............---------------AAAGTCGGTCCTGGCTTGGCTGACGCTTACTGGACCTATCCGAAG---AACAAAACCGACAAGGGTATTTTCGAAACGATCTTTGGC------...------......GGCGCTAACGGCATGATGGGT---------------------CCGCACTCGGAT------------...------...---..................---...------------------------ATCGAGCTCGACAACATGCTGAAGCTCATCGCCTGGATCCGGCACATTCAA
Q8RJP0_9RHIZ/91-172 gaggcgctgGCTGCCGGCAAGACAATCTACGAGGACAAC---TGTCAGGCCTGTCACCTCGACGACGGCCGC---...............------------GGCGGCATGGGACCGAGCCTGATCGACAACGTCTTTGTGAACGCGCGC---GCGAACACGGACGTCGGCATGTTCGAGATCATCCACTCC------...------......GGCGCCTCGGGCGCCATGCGA---------------TCGTTCTCCCAGCGCGGG------------...------...---..................---...------------------------GTGACGCAGGACCAGATCCTGAAGGTCATCGCCTATATCCATTCTCTCAAG