spacer

BIOMD0000000014 - Levchenko2000_MAPK_Scaffold

  
 |   |   |  Submit Model Comment/Bug
Reference Publication
Publication ID: 10823939
Proc Natl Acad Sci U S A 2000 May;97(11):5818-23.
Scaffold proteins may biphasically affect the levels of mitogen-activated protein kinase signaling and reduce its threshold properties.
Levchenko A, Bruck J, Sternberg PW.
Division of Engineering and Applied Science and Division of Biology and Howard Hughes Medical Institute, California Institute of Technology, Pasadena, CA 91125, USA. andre@paradise.caltech.edu  [more]
Model
Original Model: BIOMD0000000014.xml.origin
Submitter: Nicolas Le Novère
Submission ID: MODEL6616691524
Submission Date: 13 Sep 2005 13:07:14 UTC
Last Modification Date: 01 Sep 2008 23:40:29 UTC
Creation Date: 25 Feb 2005 23:43:21 UTC
Encoders:  Bruce Shapiro
set #1
bqbiol:is Taxonomy Xenopus laevis
set #2
bqbiol:isHomologTo Reactome REACT_634
set #3
bqbiol:isVersionOf Gene Ontology MAPKKK cascade
Gene Ontology MAP-kinase scaffold activity
Notes

MAPK cascade on a scaffold

Citation
Levchenko, A., Bruck, J., Sternberg, P.W. (2000) .Scaffold proteins may biphasically affect the levels of mitogen-activated protein kinase signaling and reduce its threshold properties. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97(11):5818-5823. http://www.pnas.org/cgi/content/abstract/97/11/5818
Description
This model describes a basic 3-stage Mitogen Activated Protein Kinase (MAPK). Kinases in solution are written as K[3,J], K[2,J], K[1,J] for MAPKKK, MAPKK, and MAPK, respectively, J indicates the phosphorylation level, J=0,1 for K3 and J=0,1,2 for K2 and K1. Scaffolds have three slots, for MAPK, MAPKK, and MAPKKK, respectively. Bound and free scaffold are denoted as S[i,j,k], where i, j, and k indicate the binding of K[1,i], K[2,j] and K[3,k] in their respective slots. Here i,j=-1,0,1,or,2 and k=-1,0,or,1. A value of -1 means the slot is empty, 0 means the unphorphorylated kinase is bound, 1 means the singly phosphorylated kinase is bound, and 2 means the doubly phosphorylated kinase is bound. Thus S[1,-1,2] is a scaffold with K[3,1] bound in the first slot and K[1,2] in the third slot, while the second slot is empty.Note: Indices X[I,J,K] are translated into the unindexed variable X_I_J_K and so forth in the SBML. Negative indices are translated as mI, etc, thus S[1,-1,2] becomes S_1_m1_2.
Rate constant       Reaction
a10 = 5. MAPKP + K[1, 2] -> K_MAPKP[1, 2]
a1 = 1. RAFK + K[3, 0] -> K_RAFK[3, 0]
a2 = 0.5 RAFP + K[3, 1] -> K_RAFP[3, 1]
a3 = 3.3 K[2, 0] + K[3, 1] -> K_K[2, 0, 3,  1]
a4 = 10. MEKP + K[2, 1] -> K_MEKP[2, 1]
a5 = 3.3 K[2, 1] + K[3, 1] -> K_K[2, 1, 3,  1]
a6 = 10. MEKP + K[2, 2] -> K_MEKP[2, 2]
a7 = 20. K[1, 0] + K[2, 2] -> K_K[1, 0, 2,  2]
a8 = 5. MAPKP + K[1, 1] -> K_MAPKP[1, 1]
a9 = 20. K[1, 1] + K[2, 2] -> K_K[1, 1, 2,  2]
d10 = 0.4 K_MAPKP[1, 2] -> MAPKP + K[1, 2]
d1 = 0.4 K_RAFK[3, 0] -> RAFK + K[3, 0]
d1a = 0 S_RAFK[0, 0, 0] -> RAFK + S[0, 0, 0]
d1a = 0 S_RAFK[0, -1, 0] -> RAFK + S[0, -1,  0]
d1a = 0 S_RAFK[0, 1, 0] -> RAFK + S[0, 1, 0]
d1a = 0 S_RAFK[0, 2, 0] -> RAFK + S[0, 2, 0]
d1a = 0 S_RAFK[-1, 0, 0] -> RAFK + S[-1, 0,  0]
d1a = 0 S_RAFK[1, 0, 0] -> RAFK + S[1, 0, 0]
d1a = 0 S_RAFK[-1, -1, 0] -> RAFK + S[-1, -1,  0]
d1a = 0 S_RAFK[-1, 1, 0] -> RAFK + S[-1, 1,  0]
d1a = 0 S_RAFK[1, -1, 0] -> RAFK + S[1, -1,  0]
d1a = 0 S_RAFK[1, 1, 0] -> RAFK + S[1, 1, 0]
d1a = 0 S_RAFK[-1, 2, 0] -> RAFK + S[-1, 2,  0]
d1a = 0 S_RAFK[1, 2, 0] -> RAFK + S[1, 2, 0]
d1a = 0 S_RAFK[2, 0, 0] -> RAFK + S[2, 0, 0]
d1a = 0 S_RAFK[2, -1, 0] -> RAFK + S[2, -1,  0]
d1a = 0 S_RAFK[2, 1, 0] -> RAFK + S[2, 1, 0]
d1a = 0 S_RAFK[2, 2, 0] -> RAFK + S[2, 2, 0]
d2 = 0.5 K_RAFP[3, 1] -> RAFP + K[3, 1]
d3 = 0.42 K_K[2, 0, 3, 1] -> K[2, 0] + K[3,  1]
d4 = 0.8 K_MEKP[2, 1] -> MEKP + K[2, 1]
d5 = 0.4 K_K[2, 1, 3, 1] -> K[2, 1] + K[3,  1]
d6 = 0.8 K_MEKP[2, 2] -> MEKP + K[2, 2]
d7 = 0.6 K_K[1, 0, 2, 2] -> K[1, 0] + K[2,  2]
d8 = 0.4 K_MAPKP[1, 1] -> MAPKP + K[1, 1]
d9 = 0.6 K_K[1, 1, 2, 2] -> K[1, 1] + K[2,  2]
k10 = 0.1 K_MAPKP[1, 2] -> MAPKP + K[1, 1]
k1 = 0.1 K_RAFK[3, 0] -> RAFK + K[3, 1]
k1 = 0.1 S_RAFK[0, 0, 0] -> RAFK + S[0, 0, 1]
k1 = 0.1 S_RAFK[0, -1, 0] -> RAFK + S[0, -1,  1]
k1 = 0.1 S_RAFK[0, 1, 0] -> RAFK + S[0, 1, 1]
k1 = 0.1 S_RAFK[0, 2, 0] -> RAFK + S[0, 2, 1]
k1 = 0.1 S_RAFK[-1, 0, 0] -> RAFK + S[-1, 0,  1]
k1 = 0.1 S_RAFK[1, 0, 0] -> RAFK + S[1, 0, 1]
k1 = 0.1 S_RAFK[-1, -1, 0] -> RAFK + S[-1, -1,  1]
k1 = 0.1 S_RAFK[-1, 1, 0] -> RAFK + S[-1, 1,  1]
k1 = 0.1 S_RAFK[1, -1, 0] -> RAFK + S[1, -1,  1]
k1 = 0.1 S_RAFK[1, 1, 0] -> RAFK + S[1, 1, 1]
k1 = 0.1 S_RAFK[-1, 2, 0] -> RAFK + S[-1, 2,  1]
k1 = 0.1 S_RAFK[1, 2, 0] -> RAFK + S[1, 2, 1]
k1 = 0.1 S_RAFK[2, 0, 0] -> RAFK + S[2, 0, 1]
k1 = 0.1 S_RAFK[2, -1, 0] -> RAFK + S[2, -1,  1]
k1 = 0.1 S_RAFK[2, 1, 0] -> RAFK + S[2, 1, 1]
k1 = 0.1 S_RAFK[2, 2, 0] -> RAFK + S[2, 2, 1]
k1a = 100 RAFK + S[0, 0, 0] -> S_RAFK[0, 0, 0]
k1a = 100 RAFK + S[0, -1, 0] -> S_RAFK[0, -1,  0]
k1a = 100 RAFK + S[0, 1, 0] -> S_RAFK[0, 1, 0]
k1a = 100 RAFK + S[0, 2, 0] -> S_RAFK[0, 2, 0]
k1a = 100 RAFK + S[-1, 0, 0] -> S_RAFK[-1, 0,  0]
k1a = 100 RAFK + S[1, 0, 0] -> S_RAFK[1, 0, 0]
k1a = 100 RAFK + S[-1, -1, 0] -> S_RAFK[-1, -1,  0]
k1a = 100 RAFK + S[-1, 1, 0] -> S_RAFK[-1, 1,  0]
k1a = 100 RAFK + S[1, -1, 0] -> S_RAFK[1, -1,  0]
k1a = 100 RAFK + S[1, 1, 0] -> S_RAFK[1, 1, 0]
k1a = 100 RAFK + S[-1, 2, 0] -> S_RAFK[-1, 2,  0]
k1a = 100 RAFK + S[1, 2, 0] -> S_RAFK[1, 2, 0]
k1a = 100 RAFK + S[2, 0, 0] -> S_RAFK[2, 0, 0]
k1a = 100 RAFK + S[2, -1, 0] -> S_RAFK[2, -1,  0]
k1a = 100 RAFK + S[2, 1, 0] -> S_RAFK[2, 1, 0]
k1a = 100 RAFK + S[2, 2, 0] -> S_RAFK[2, 2, 0]
k2 = 0.1 K_RAFP[3, 1] -> RAFP + K[3, 0]
k3 = 0.1 K_K[2, 0, 3, 1] -> K[2, 1] + K[3,  1]
k3 = 0.1 S[0, 0, 1] -> S[0, 1, 1]
k3 = 0.1 S[-1, 0, 1] -> S[-1, 1, 1]
k3 = 0.1 S[1, 0, 1] -> S[1, 1, 1]
k3 = 0.1 S[2, 0, 1] -> S[2, 1, 1]
k4 = 0.1 K_MEKP[2, 1] -> MEKP + K[2, 0]
k5 = 0.1 K_K[2, 1, 3, 1] -> K[2, 2] + K[3,  1]
k5a = 0.1 S[0, 1, 1] -> S[0, 2, 1]
k5a = 0.1 S[-1, 1, 1] -> S[-1, 2, 1]
k5a = 0.1 S[1, 1, 1] -> S[1, 2, 1]
k5a = 0.1 S[2, 1, 1] -> S[2, 2, 1]
k6 = 0.1 K_MEKP[2, 2] -> MEKP + K[2, 1]
k7 = 0.1 K_K[1, 0, 2, 2] -> K[1, 1] + K[2,  2]
k7 = 0.1 S[0, 2, 0] -> S[1, 2, 0]
k7 = 0.1 S[0, 2, -1] -> S[1, 2, -1]
k7 = 0.1 S[0, 2, 1] -> S[1, 2, 1]
k8 = 0.1 K_MAPKP[1, 1] -> MAPKP + K[1, 0]
k9 = 0.1 K_K[1, 1, 2, 2] -> K[1, 2] + K[2,  2]
k9a = 0.1 S[1, 2, 0] -> S[2, 2, 0]
k9a = 0.1 S[1, 2, -1] -> S[2, 2, -1]
k9a = 0.1 S[1, 2, 1] -> S[2, 2, 1]
koff = 0.5 S[0, 0, 0] -> K[1, 0] + S[-1, 0,  0]
koff = 0.5 S[0, 0, 0] -> K[2, 0] + S[0, -1,  0]
koff = 0.5 S[0, 0, 0] -> K[3, 0] + S[0, 0,  -1]
koff = 0.5 S[0, 0, -1] -> K[1, 0] + S[-1, 0,  -1]
koff = 0.5 S[0, 0, 1] -> K[1, 0] + S[-1, 0,  1]
koff = 0.5 S[0, 0, -1] -> K[2, 0] + S[0, -1,  -1]
koff = 0.5 S[0, 0, 1] -> K[2, 0] + S[0, -1,  1]
koff = 0.5 S[0, -1, 0] -> K[1, 0] + S[-1, -1,  0]
koff = 0.5 S[0, 1, 0] -> K[1, 0] + S[-1, 1,  0]
koff = 0.5 S[0, -1, 0] -> K[3, 0] + S[0, -1,  -1]
koff = 0.5 S[0, 1, 0] -> K[3, 0] + S[0, 1,  -1]
koff = 0.5 S[0, -1, -1] -> K[1, 0] + S[-1, -1,  -1]
koff = 0.5 S[0, -1, 1] -> K[1, 0] + S[-1, -1,  1]
koff = 0.5 S[0, 1, -1] -> K[1, 0] + S[-1, 1,  -1]
koff = 0.5 S[0, 1, 1] -> K[1, 0] + S[-1, 1,  1]
koff = 0.5 S[0, 2, 0] -> K[1, 0] + S[-1, 2,  0]
koff = 0.5 S[0, 2, 0] -> K[3, 0] + S[0, 2,  -1]
koff = 0.5 S[0, 2, -1] -> K[1, 0] + S[-1, 2,  -1]
koff = 0.5 S[0, 2, 1] -> K[1, 0] + S[-1, 2,  1]
koff = 0.5 S[-1, 0, 0] -> K[2, 0] + S[-1, -1,  0]
koff = 0.5 S[1, 0, 0] -> K[2, 0] + S[1, -1,  0]
koff = 0.5 S[-1, 0, 0] -> K[3, 0] + S[-1, 0,  -1]
koff = 0.5 S[1, 0, 0] -> K[3, 0] + S[1, 0,  -1]
koff = 0.5 S[-1, 0, -1] -> K[2, 0] + S[-1, -1,  -1]
koff = 0.5 S[-1, 0, 1] -> K[2, 0] + S[-1, -1,  1]
koff = 0.5 S[1, 0, -1] -> K[2, 0] + S[1, -1,  -1]
koff = 0.5 S[1, 0, 1] -> K[2, 0] + S[1, -1,  1]
koff = 0.5 S[-1, -1, 0] -> K[3, 0] + S[-1, -1,  -1]
koff = 0.5 S[-1, 1, 0] -> K[3, 0] + S[-1, 1,  -1]
koff = 0.5 S[1, -1, 0] -> K[3, 0] + S[1, -1,  -1]
koff = 0.5 S[1, 1, 0] -> K[3, 0] + S[1, 1,  -1]
koff = 0.5 S[-1, 2, 0] -> K[3, 0] + S[-1, 2,  -1]
koff = 0.5 S[1, 2, 0] -> K[3, 0] + S[1, 2,  -1]
koff = 0.5 S[2, 0, 0] -> K[2, 0] + S[2, -1,  0]
koff = 0.5 S[2, 0, 0] -> K[3, 0] + S[2, 0,  -1]
koff = 0.5 S[2, 0, -1] -> K[2, 0] + S[2, -1,  -1]
koff = 0.5 S[2, 0, 1] -> K[2, 0] + S[2, -1,  1]
koff = 0.5 S[2, -1, 0] -> K[3, 0] + S[2, -1,  -1]
koff = 0.5 S[2, 1, 0] -> K[3, 0] + S[2, 1,  -1]
koff = 0.5 S[2, 2, 0] -> K[3, 0] + S[2, 2,  -1]
kon = 10 K[1, 0] + S[-1, 0, 0] -> S[0, 0,  0]
kon = 10 K[1, 0] + S[-1, 0, -1] -> S[0, 0,  -1]
kon = 10 K[1, 0] + S[-1, 0, 1] -> S[0, 0,  1]
kon = 10 K[1, 0] + S[-1, -1, 0] -> S[0, -1,  0]
kon = 10 K[1, 0] + S[-1, 1, 0] -> S[0, 1,  0]
kon = 10 K[1, 0] + S[-1, -1, -1] -> S[0, -1,  -1]
kon = 10 K[1, 0] + S[-1, -1, 1] -> S[0, -1,  1]
kon = 10 K[1, 0] + S[-1, 1, -1] -> S[0, 1,  -1]
kon = 10 K[1, 0] + S[-1, 1, 1] -> S[0, 1,  1]
kon = 10 K[1, 0] + S[-1, 2, 0] -> S[0, 2,  0]
kon = 10 K[1, 0] + S[-1, 2, -1] -> S[0, 2,  -1]
kon = 10 K[1, 0] + S[-1, 2, 1] -> S[0, 2,  1]
kon = 10 K[2, 0] + S[0, -1, 0] -> S[0, 0,  0]
kon = 10 K[2, 0] + S[0, -1, -1] -> S[0, 0,  -1]
kon = 10 K[2, 0] + S[0, -1, 1] -> S[0, 0,  1]
kon = 10 K[2, 0] + S[-1, -1, 0] -> S[-1, 0,  0]
kon = 10 K[2, 0] + S[1, -1, 0] -> S[1, 0,  0]
kon = 10 K[2, 0] + S[-1, -1, -1] -> S[-1, 0,  -1]
kon = 10 K[2, 0] + S[-1, -1, 1] -> S[-1, 0,  1]
kon = 10 K[2, 0] + S[1, -1, -1] -> S[1, 0,  -1]
kon = 10 K[2, 0] + S[1, -1, 1] -> S[1, 0,  1]
kon = 10 K[2, 0] + S[2, -1, 0] -> S[2, 0,  0]
kon = 10 K[2, 0] + S[2, -1, -1] -> S[2, 0,  -1]
kon = 10 K[2, 0] + S[2, -1, 1] -> S[2, 0,  1]
kon = 10 K[3, 0] + S[0, 0, -1] -> S[0, 0,  0]
kon = 10 K[3, 0] + S[0, -1, -1] -> S[0, -1,  0]
kon = 10 K[3, 0] + S[0, 1, -1] -> S[0, 1,  0]
kon = 10 K[3, 0] + S[0, 2, -1] -> S[0, 2,  0]
kon = 10 K[3, 0] + S[-1, 0, -1] -> S[-1, 0,  0]
kon = 10 K[3, 0] + S[1, 0, -1] -> S[1, 0,  0]
kon = 10 K[3, 0] + S[-1, -1, -1] -> S[-1, -1,  0]
kon = 10 K[3, 0] + S[-1, 1, -1] -> S[-1, 1,  0]
kon = 10 K[3, 0] + S[1, -1, -1] -> S[1, -1,  0]
kon = 10 K[3, 0] + S[1, 1, -1] -> S[1, 1,  0]
kon = 10 K[3, 0] + S[-1, 2, -1] -> S[-1, 2,  0]
kon = 10 K[3, 0] + S[1, 2, -1] -> S[1, 2,  0]
kon = 10 K[3, 0] + S[2, 0, -1] -> S[2, 0,  0]
kon = 10 K[3, 0] + S[2, -1, -1] -> S[2, -1,  0]
kon = 10 K[3, 0] + S[2, 1, -1] -> S[2, 1,  0]
kon = 10 K[3, 0] + S[2, 2, -1] -> S[2, 2,  0]
kpoff = 0.05 S[0, 0, 1] -> K[3, 1] + S[0, 0,  -1]
kpoff = 0.05 S[0, 1, 0] -> K[2, 1] + S[0, -1,  0]
kpoff = 0.05 S[0, 1, -1] -> K[2, 1] + S[0, -1,  -1]
kpoff = 0.05 S[0, 1, 1] -> K[2, 1] + S[0, -1,  1]
kpoff = 0.05 S[0, -1, 1] -> K[3, 1] + S[0, -1,  -1]
kpoff = 0.05 S[0, 1, 1] -> K[3, 1] + S[0, 1,  -1]
kpoff = 0.05 S[0, 2, 0] -> K[2, 2] + S[0, -1,  0]
kpoff = 0.05 S[0, 2, -1] -> K[2, 2] + S[0, -1,  -1]
kpoff = 0.05 S[0, 2, 1] -> K[2, 2] + S[0, -1,  1]
kpoff = 0.05 S[0, 2, 1] -> K[3, 1] + S[0, 2,  -1]
kpoff = 0.05 S[1, 0, 0] -> K[1, 1] + S[-1, 0,  0]
kpoff = 0.05 S[1, 0, -1] -> K[1, 1] + S[-1, 0,  -1]
kpoff = 0.05 S[1, 0, 1] -> K[1, 1] + S[-1, 0,  1]
kpoff = 0.05 S[-1, 0, 1] -> K[3, 1] + S[-1, 0,  -1]
kpoff = 0.05 S[1, 0, 1] -> K[3, 1] + S[1, 0,  -1]
kpoff = 0.05 S[1, -1, 0] -> K[1, 1] + S[-1, -1,  0]
kpoff = 0.05 S[1, 1, 0] -> K[1, 1] + S[-1, 1,  0]
kpoff = 0.05 S[-1, 1, 0] -> K[2, 1] + S[-1, -1,  0]
kpoff = 0.05 S[1, 1, 0] -> K[2, 1] + S[1, -1,  0]
kpoff = 0.05 S[1, -1, -1] -> K[1, 1] + S[-1, -1,  -1]
kpoff = 0.05 S[1, -1, 1] -> K[1, 1] + S[-1, -1,  1]
kpoff = 0.05 S[1, 1, -1] -> K[1, 1] + S[-1, 1,  -1]
kpoff = 0.05 S[1, 1, 1] -> K[1, 1] + S[-1, 1,  1]
kpoff = 0.05 S[-1, 1, -1] -> K[2, 1] + S[-1, -1,  -1]
kpoff = 0.05 S[-1, 1, 1] -> K[2, 1] + S[-1, -1,  1]
kpoff = 0.05 S[1, 1, -1] -> K[2, 1] + S[1, -1,  -1]
kpoff = 0.05 S[1, 1, 1] -> K[2, 1] + S[1, -1,  1]
kpoff = 0.05 S[-1, -1, 1] -> K[3, 1] + S[-1, -1,  -1]
kpoff = 0.05 S[-1, 1, 1] -> K[3, 1] + S[-1, 1,  -1]
kpoff = 0.05 S[1, -1, 1] -> K[3, 1] + S[1, -1,  -1]
kpoff = 0.05 S[1, 1, 1] -> K[3, 1] + S[1, 1,  -1]
kpoff = 0.05 S[1, 2, 0] -> K[1, 1] + S[-1, 2,  0]
kpoff = 0.05 S[-1, 2, 0] -> K[2, 2] + S[-1, -1,  0]
kpoff = 0.05 S[1, 2, 0] -> K[2, 2] + S[1, -1,  0]
kpoff = 0.05 S[1, 2, -1] -> K[1, 1] + S[-1, 2,  -1]
kpoff = 0.05 S[1, 2, 1] -> K[1, 1] + S[-1, 2,  1]
kpoff = 0.05 S[-1, 2, -1] -> K[2, 2] + S[-1, -1,  -1]
kpoff = 0.05 S[-1, 2, 1] -> K[2, 2] + S[-1, -1,  1]
kpoff = 0.05 S[1, 2, -1] -> K[2, 2] + S[1, -1,  -1]
kpoff = 0.05 S[1, 2, 1] -> K[2, 2] + S[1, -1,  1]
kpoff = 0.05 S[-1, 2, 1] -> K[3, 1] + S[-1, 2,  -1]
kpoff = 0.05 S[1, 2, 1] -> K[3, 1] + S[1, 2,  -1]
kpoff = 0.05 S[2, 0, 0] -> K[1, 2] + S[-1, 0,  0]
kpoff = 0.05 S[2, 0, -1] -> K[1, 2] + S[-1, 0,  -1]
kpoff = 0.05 S[2, 0, 1] -> K[1, 2] + S[-1, 0,  1]
kpoff = 0.05 S[2, 0, 1] -> K[3, 1] + S[2, 0,  -1]
kpoff = 0.05 S[2, -1, 0] -> K[1, 2] + S[-1, -1,  0]
kpoff = 0.05 S[2, 1, 0] -> K[1, 2] + S[-1, 1,  0]
kpoff = 0.05 S[2, 1, 0] -> K[2, 1] + S[2, -1,  0]
kpoff = 0.05 S[2, -1, -1] -> K[1, 2] + S[-1, -1,  -1]
kpoff = 0.05 S[2, -1, 1] -> K[1, 2] + S[-1, -1,  1]
kpoff = 0.05 S[2, 1, -1] -> K[1, 2] + S[-1, 1,  -1]
kpoff = 0.05 S[2, 1, 1] -> K[1, 2] + S[-1, 1,  1]
kpoff = 0.05 S[2, 1, -1] -> K[2, 1] + S[2, -1,  -1]
kpoff = 0.05 S[2, 1, 1] -> K[2, 1] + S[2, -1,  1]
kpoff = 0.05 S[2, -1, 1] -> K[3, 1] + S[2, -1,  -1]
kpoff = 0.05 S[2, 1, 1] -> K[3, 1] + S[2, 1,  -1]
kpoff = 0.05 S[2, 2, 0] -> K[1, 2] + S[-1, 2,  0]
kpoff = 0.05 S[2, 2, 0] -> K[2, 2] + S[2, -1,  0]
kpoff = 0.05 S[2, 2, -1] -> K[1, 2] + S[-1, 2,  -1]
kpoff = 0.05 S[2, 2, 1] -> K[1, 2] + S[-1, 2,  1]
kpoff = 0.05 S[2, 2, -1] -> K[2, 2] + S[2, -1,  -1]
kpoff = 0.05 S[2, 2, 1] -> K[2, 2] + S[2, -1,  1]
kpoff = 0.05 S[2, 2, 1] -> K[3, 1] + S[2, 2,  -1]
kpon = 0 K[1, 1] + S[-1, 0, 0] -> S[1, 0,  0]
kpon = 0 K[1, 1] + S[-1, 0, -1] -> S[1, 0,  -1]
kpon = 0 K[1, 1] + S[-1, 0, 1] -> S[1, 0,  1]
kpon = 0 K[1, 1] + S[-1, -1, 0] -> S[1, -1,  0]
kpon = 0 K[1, 1] + S[-1, 1, 0] -> S[1, 1,  0]
kpon = 0 K[1, 1] + S[-1, -1, -1] -> S[1, -1,  -1]
kpon = 0 K[1, 1] + S[-1, -1, 1] -> S[1, -1,  1]
kpon = 0 K[1, 1] + S[-1, 1, -1] -> S[1, 1,  -1]
kpon = 0 K[1, 1] + S[-1, 1, 1] -> S[1, 1,  1]
kpon = 0 K[1, 1] + S[-1, 2, 0] -> S[1, 2,  0]
kpon = 0 K[1, 1] + S[-1, 2, -1] -> S[1, 2,  -1]
kpon = 0 K[1, 1] + S[-1, 2, 1] -> S[1, 2,  1]
kpon = 0 K[1, 2] + S[-1, 0, 0] -> S[2, 0,  0]
kpon = 0 K[1, 2] + S[-1, 0, -1] -> S[2, 0,  -1]
kpon = 0 K[1, 2] + S[-1, 0, 1] -> S[2, 0,  1]
kpon = 0 K[1, 2] + S[-1, -1, 0] -> S[2, -1,  0]
kpon = 0 K[1, 2] + S[-1, 1, 0] -> S[2, 1,  0]
kpon = 0 K[1, 2] + S[-1, -1, -1] -> S[2, -1,  -1]
kpon = 0 K[1, 2] + S[-1, -1, 1] -> S[2, -1,  1]
kpon = 0 K[1, 2] + S[-1, 1, -1] -> S[2, 1,  -1]
kpon = 0 K[1, 2] + S[-1, 1, 1] -> S[2, 1,  1]
kpon = 0 K[1, 2] + S[-1, 2, 0] -> S[2, 2,  0]
kpon = 0 K[1, 2] + S[-1, 2, -1] -> S[2, 2,  -1]
kpon = 0 K[1, 2] + S[-1, 2, 1] -> S[2, 2,  1]
kpon = 0 K[2, 1] + S[0, -1, 0] -> S[0, 1,  0]
kpon = 0 K[2, 1] + S[0, -1, -1] -> S[0, 1,  -1]
kpon = 0 K[2, 1] + S[0, -1, 1] -> S[0, 1,  1]
kpon = 0 K[2, 1] + S[-1, -1, 0] -> S[-1, 1,  0]
kpon = 0 K[2, 1] + S[1, -1, 0] -> S[1, 1,  0]
kpon = 0 K[2, 1] + S[-1, -1, -1] -> S[-1, 1,  -1]
kpon = 0 K[2, 1] + S[-1, -1, 1] -> S[-1, 1,  1]
kpon = 0 K[2, 1] + S[1, -1, -1] -> S[1, 1,  -1]
kpon = 0 K[2, 1] + S[1, -1, 1] -> S[1, 1,  1]
kpon = 0 K[2, 1] + S[2, -1, 0] -> S[2, 1,  0]
kpon = 0 K[2, 1] + S[2, -1, -1] -> S[2, 1,  -1]
kpon = 0 K[2, 1] + S[2, -1, 1] -> S[2, 1,  1]
kpon = 0 K[2, 2] + S[0, -1, 0] -> S[0, 2,  0]
kpon = 0 K[2, 2] + S[0, -1, -1] -> S[0, 2,  -1]
kpon = 0 K[2, 2] + S[0, -1, 1] -> S[0, 2,  1]
kpon = 0 K[2, 2] + S[-1, -1, 0] -> S[-1, 2,  0]
kpon = 0 K[2, 2] + S[1, -1, 0] -> S[1, 2,  0]
kpon = 0 K[2, 2] + S[-1, -1, -1] -> S[-1, 2,  -1]
kpon = 0 K[2, 2] + S[-1, -1, 1] -> S[-1, 2,  1]
kpon = 0 K[2, 2] + S[1, -1, -1] -> S[1, 2,  -1]
kpon = 0 K[2, 2] + S[1, -1, 1] -> S[1, 2,  1]
kpon = 0 K[2, 2] + S[2, -1, 0] -> S[2, 2,  0]
kpon = 0 K[2, 2] + S[2, -1, -1] -> S[2, 2,  -1]
kpon = 0 K[2, 2] + S[2, -1, 1] -> S[2, 2,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[0, 0, -1] -> S[0, 0,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[0, -1, -1] -> S[0, -1,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[0, 1, -1] -> S[0, 1,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[0, 2, -1] -> S[0, 2,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[-1, 0, -1] -> S[-1, 0,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[1, 0, -1] -> S[1, 0,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[-1, -1, -1] -> S[-1, -1,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[-1, 1, -1] -> S[-1, 1,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[1, -1, -1] -> S[1, -1,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[1, 1, -1] -> S[1, 1,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[-1, 2, -1] -> S[-1, 2,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[1, 2, -1] -> S[1, 2,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[2, 0, -1] -> S[2, 0,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[2, -1, -1] -> S[2, -1,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[2, 1, -1] -> S[2, 1,  1]
kpon = 0 K[3, 1] + S[2, 2, -1] -> S[2, 2,  1]
Variable IC   ODE
MAPKP 0.3 MAPKP'[t] == -(a8*MAPKP[t]*K[1, 1][t]) - a10*MAPKP[ t]*K[1, 2][t] + d8*K_MAPKP[1, 1][t] + k8*K_MAPKP[ 1, 1][t] + d10*K_MAPKP[1, 2][t] + k10*K_MAPKP[1,  2][t]
MEKP 0.2 MEKP'[t] == -(a4*MEKP[t]*K[2, 1][t]) - a6*MEKP[t]* K[2, 2][t] + d4*K_MEKP[2, 1][t] + k4*K_MEKP[2,  1][t] + d6*K_MEKP[2, 2][t] + k6*K_MEKP[2, 2] [t]
RAFK 0.1 RAFK'[t] == -(a1*RAFK[t]*K[3, 0][t]) + d1*K_RAFK[3,  0][t] + k1*K_RAFK[3, 0][t] - k1a*RAFK[t]*S[-1,  -1, 0][t] - k1a*RAFK[t]*S[-1, 0, 0][t] -  k1a*RAFK[t]*S[-1, 1, 0][t] - k1a*RAFK[t]*S[-1, 2,  0][t] - k1a*RAFK[t]*S[0, -1, 0][t] - k1a* RAFK[t]*S[0, 0, 0][t] - k1a*RAFK[t]*S[0, 1, 0][t]  - k1a*RAFK[t]*S[0, 2, 0][t] - k1a*RAFK[t]*S[1,  -1, 0][t] - k1a*RAFK[t]*S[1, 0, 0][t] -  k1a*RAFK[t]*S[1, 1, 0][t] - k1a*RAFK[t]*S[1, 2,  0][t] - k1a*RAFK[t]*S[2, -1, 0][t] - k1a* RAFK[t]*S[2, 0, 0][t] - k1a*RAFK[t]*S[2, 1, 0][t]  - k1a*RAFK[t]*S[2, 2, 0][t] + d1a*S_RAFK[-1,  -1, 0][t] + k1*S_RAFK[-1, -1, 0][t] +  d1a*S_RAFK[-1, 0, 0][t] + k1*S_RAFK[-1, 0,  0][t] + d1a*S_RAFK[-1, 1, 0][t] + k1*S_RAFK[ -1, 1, 0][t] + d1a*S_RAFK[-1, 2, 0][t] +  k1*S_RAFK[-1, 2, 0][t] + d1a*S_RAFK[0, -1,  0][t] + k1*S_RAFK[0, -1, 0][t] + d1a*S_RAFK[ 0, 0, 0][t] + k1*S_RAFK[0, 0, 0][t] +  d1a*S_RAFK[0, 1, 0][t] + k1*S_RAFK[0, 1, 0][ t] + d1a*S_RAFK[0, 2, 0][t] + k1*S_RAFK[0, 2,  0][t] + d1a*S_RAFK[1, -1, 0][t] + k1*S_RAFK[ 1, -1, 0][t] + d1a*S_RAFK[1, 0, 0][t] +  k1*S_RAFK[1, 0, 0][t] + d1a*S_RAFK[1, 1, 0][ t] + k1*S_RAFK[1, 1, 0][t] + d1a*S_RAFK[1, 2,  0][t] + k1*S_RAFK[1, 2, 0][t] + d1a*S_RAFK[ 2, -1, 0][t] + k1*S_RAFK[2, -1, 0][t] +  d1a*S_RAFK[2, 0, 0][t] + k1*S_RAFK[2, 0, 0][ t] + d1a*S_RAFK[2, 1, 0][t] + k1*S_RAFK[2, 1,  0][t] + d1a*S_RAFK[2, 2, 0][t] + k1*S_RAFK[ 2, 2, 0][t]
RAFP 0.3 RAFP'[t] == -(a2*RAFP[t]*K[3, 1][t]) + d2*K_RAFP[3,  1][t] + k2*K_RAFP[3, 1][t]
K[1, 0] 0.4 (K[1, 0])'[t] == -(a7*K[1, 0][t]*K[2, 2][t]) +  d7*K_K[1, 0, 2, 2][t] + k8*K_MAPKP[1, 1][t]  - kon*K[1, 0][t]*S[-1, -1, -1][t] - kon*K[1,  0][t]*S[-1, -1, 0][t] - kon*K[1, 0][t]*S[-1,  -1, 1][t] - kon*K[1, 0][t]*S[-1, 0, -1][t]  - kon*K[1, 0][t]*S[-1, 0, 0][t] - kon*K[1,  0][t]*S[-1, 0, 1][t] - kon*K[1, 0][t]*S[-1,  1, -1][t] - kon*K[1, 0][t]*S[-1, 1, 0][t]  - kon*K[1, 0][t]*S[-1, 1, 1][t] - kon*K[1,  0][t]*S[-1, 2, -1][t] - kon*K[1, 0][t]*S[-1,  2, 0][t] - kon*K[1, 0][t]*S[-1, 2, 1][t]  + koff*S[0, -1, -1][t] + koff*S[0, -1,  0][t] + koff*S[0, -1, 1][t] + koff*S[0,  0, -1][t] + koff*S[0, 0, 0][t] + koff* S[0, 0, 1][t] + koff*S[0, 1, -1][t] +  koff*S[0, 1, 0][t] + koff*S[0, 1, 1][t]  + koff*S[0, 2, -1][t] + koff*S[0, 2, 0] [t] + koff*S[0, 2, 1][t]
K[1, 1] 0 (K[1, 1])'[t] == -(a8*MAPKP[t]*K[1, 1][t]) -  a9*K[1, 1][t]*K[2, 2][t] + k7*K_K[1, 0, 2,  2][t] + d9*K_K[1, 1, 2, 2][t] + d8* K_MAPKP[1, 1][t] + k10*K_MAPKP[1, 2][t] - kpon*K[ 1, 1][t]*S[-1, -1, -1][t] - kpon*K[1, 1][t]*S[-1,  -1, 0][t] - kpon*K[1, 1][t]*S[-1, -1, 1][t]  - kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 0, -1][t] - kpon*K[ 1, 1][t]*S[-1, 0, 0][t] - kpon*K[1, 1][t]*S[-1,  0, 1][t] - kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 1, -1][t]  - kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 1, 0][t] - kpon*K[1,  1][t]*S[-1, 1, 1][t] - kpon*K[1, 1][t]*S[-1,  2, -1][t] - kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 2, 0][t]  - kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 2, 1][t] + kpoff*S[ 1, -1, -1][t] + kpoff*S[1, -1, 0][t] +  kpoff*S[1, -1, 1][t] + kpoff*S[1, 0, -1][t]  + kpoff*S[1, 0, 0][t] + kpoff*S[1, 0,  1][t] + kpoff*S[1, 1, -1][t] + kpoff*S[1,  1, 0][t] + kpoff*S[1, 1, 1][t] + kpoff* S[1, 2, -1][t] + kpoff*S[1, 2, 0][t] +  kpoff*S[1, 2, 1][t]
K[1, 2] 0 (K[1, 2])'[t] == -(a10*MAPKP[t]*K[1, 2][t]) +  k9*K_K[1, 1, 2, 2][t] + d10*K_MAPKP[1, 2][t]  - kpon*K[1, 2][t]*S[-1, -1, -1][t] - kpon*K[ 1, 2][t]*S[-1, -1, 0][t] - kpon*K[1, 2][t]*S[-1,  -1, 1][t] - kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 0, -1][t]  - kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 0, 0][t] - kpon*K[1,  2][t]*S[-1, 0, 1][t] - kpon*K[1, 2][t]*S[-1,  1, -1][t] - kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 1, 0][t]  - kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 1, 1][t] - kpon*K[1,  2][t]*S[-1, 2, -1][t] - kpon*K[1, 2][t]*S[-1,  2, 0][t] - kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 2, 1][t]  + kpoff*S[2, -1, -1][t] + kpoff*S[2, -1,  0][t] + kpoff*S[2, -1, 1][t] + kpoff*S[2,  0, -1][t] + kpoff*S[2, 0, 0][t] +  kpoff*S[2, 0, 1][t] + kpoff*S[2, 1, -1][t]  + kpoff*S[2, 1, 0][t] + kpoff*S[2, 1,  1][t] + kpoff*S[2, 2, -1][t] + kpoff*S[2,  2, 0][t] + kpoff*S[2, 2, 1][t]
K[2, 0] 0.2 (K[2, 0])'[t] == -(a3*K[2, 0][t]*K[3, 1][t]) +  d3*K_K[2, 0, 3, 1][t] + k4*K_MEKP[2, 1][t]  - kon*K[2, 0][t]*S[-1, -1, -1][t] - kon*K[2,  0][t]*S[-1, -1, 0][t] - kon*K[2, 0][t]*S[-1,  -1, 1][t] + koff*S[-1, 0, -1][t] +  koff*S[-1, 0, 0][t] + koff*S[-1, 0, 1][t]  - kon*K[2, 0][t]*S[0, -1, -1][t] - kon*K[2,  0][t]*S[0, -1, 0][t] - kon*K[2, 0][t]*S[0, - 1, 1][t] + koff*S[0, 0, -1][t] + koff*S[0,  0, 0][t] + koff*S[0, 0, 1][t] - kon*K[ 2, 0][t]*S[1, -1, -1][t] - kon*K[2, 0][t]*S[1,  -1, 0][t] - kon*K[2, 0][t]*S[1, -1, 1][t]  + koff*S[1, 0, -1][t] + koff*S[1, 0, 0] [t] + koff*S[1, 0, 1][t] - kon*K[2, 0][t]*S[ 2, -1, -1][t] - kon*K[2, 0][t]*S[2, -1, 0][t]  - kon*K[2, 0][t]*S[2, -1, 1][t] + koff*S[2,  0, -1][t] + koff*S[2, 0, 0][t] + koff* S[2, 0, 1][t]
K[2, 1] 0 (K[2, 1])'[t] == -(a4*MEKP[t]*K[2, 1][t]) -  a5*K[2, 1][t]*K[3, 1][t] + k3*K_K[2, 0, 3,  1][t] + d5*K_K[2, 1, 3, 1][t] + d4* K_MEKP[2, 1][t] + k6*K_MEKP[2, 2][t] - kpon*K[2,  1][t]*S[-1, -1, -1][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[-1,  -1, 0][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[-1, -1, 1][t]  + kpoff*S[-1, 1, -1][t] + kpoff*S[-1, 1,  0][t] + kpoff*S[-1, 1, 1][t] - kpon*K[2,  1][t]*S[0, -1, -1][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[0,  -1, 0][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[0, -1, 1][t]  + kpoff*S[0, 1, -1][t] + kpoff*S[0, 1,  0][t] + kpoff*S[0, 1, 1][t] - kpon*K[2,  1][t]*S[1, -1, -1][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[1,  -1, 0][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[1, -1, 1][t]  + kpoff*S[1, 1, -1][t] + kpoff*S[1, 1,  0][t] + kpoff*S[1, 1, 1][t] - kpon*K[2,  1][t]*S[2, -1, -1][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[2,  -1, 0][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[2, -1, 1][t]  + kpoff*S[2, 1, -1][t] + kpoff*S[2, 1,  0][t] + kpoff*S[2, 1, 1][t]
K[2, 2] 0 (K[2, 2])'[t] == -(a6*MEKP[t]*K[2, 2][t]) -  a7*K[1, 0][t]*K[2, 2][t] - a9*K[1, 1][t]*K[2,  2][t] + d7*K_K[1, 0, 2, 2][t] + k7*K_K[ 1, 0, 2, 2][t] + d9*K_K[1, 1, 2, 2][t]  + k9*K_K[1, 1, 2, 2][t] + k5*K_K[2, 1,  3, 1][t] + d6*K_MEKP[2, 2][t] - kpon*K[2,  2][t]*S[-1, -1, -1][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[-1,  -1, 0][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[-1, -1, 1][t]  + kpoff*S[-1, 2, -1][t] + kpoff*S[-1, 2,  0][t] + kpoff*S[-1, 2, 1][t] - kpon*K[2,  2][t]*S[0, -1, -1][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[0,  -1, 0][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[0, -1, 1][t]  + kpoff*S[0, 2, -1][t] + kpoff*S[0, 2,  0][t] + kpoff*S[0, 2, 1][t] - kpon*K[2,  2][t]*S[1, -1, -1][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[1,  -1, 0][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[1, -1, 1][t]  + kpoff*S[1, 2, -1][t] + kpoff*S[1, 2,  0][t] + kpoff*S[1, 2, 1][t] - kpon*K[2,  2][t]*S[2, -1, -1][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[2,  -1, 0][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[2, -1, 1][t]  + kpoff*S[2, 2, -1][t] + kpoff*S[2, 2,  0][t] + kpoff*S[2, 2, 1][t]
K[3, 0] 0.3 (K[3, 0])'[t] == -(a1*RAFK[t]*K[3, 0][t]) +  d1*K_RAFK[3, 0][t] + k2*K_RAFP[3, 1][t] -  kon*K[3, 0][t]*S[-1, -1, -1][t] + koff*S[-1,  -1, 0][t] - kon*K[3, 0][t]*S[-1, 0, -1][t]  + koff*S[-1, 0, 0][t] - kon*K[3, 0][t]*S[-1,  1, -1][t] + koff*S[-1, 1, 0][t] - kon* K[3, 0][t]*S[-1, 2, -1][t] + koff*S[-1, 2, 0] [t] - kon*K[3, 0][t]*S[0, -1, -1][t] + koff* S[0, -1, 0][t] - kon*K[3, 0][t]*S[0, 0, -1][ t] + koff*S[0, 0, 0][t] - kon*K[3, 0][t]*S[0,  1, -1][t] + koff*S[0, 1, 0][t] - kon*K[ 3, 0][t]*S[0, 2, -1][t] + koff*S[0, 2, 0][t]  - kon*K[3, 0][t]*S[1, -1, -1][t] + koff*S[1,  -1, 0][t] - kon*K[3, 0][t]*S[1, 0, -1][t]  + koff*S[1, 0, 0][t] - kon*K[3, 0][t]*S[1,  1, -1][t] + koff*S[1, 1, 0][t] - kon*K[ 3, 0][t]*S[1, 2, -1][t] + koff*S[1, 2, 0][t]  - kon*K[3, 0][t]*S[2, -1, -1][t] + koff*S[2,  -1, 0][t] - kon*K[3, 0][t]*S[2, 0, -1][t]  + koff*S[2, 0, 0][t] - kon*K[3, 0][t]*S[2,  1, -1][t] + koff*S[2, 1, 0][t] - kon*K[ 3, 0][t]*S[2, 2, -1][t] + koff*S[2, 2, 0][t]
K[3, 1] 0 (K[3, 1])'[t] == -(a2*RAFP[t]*K[3, 1][t]) -  a3*K[2, 0][t]*K[3, 1][t] - a5*K[2, 1][t]*K[3,  1][t] + d3*K_K[2, 0, 3, 1][t] + k3*K_K[ 2, 0, 3, 1][t] + d5*K_K[2, 1, 3, 1][t]  + k5*K_K[2, 1, 3, 1][t] + k1*K_RAFK[3,  0][t] + d2*K_RAFP[3, 1][t] - kpon*K[3, 1][t] *S[-1, -1, -1][t] + kpoff*S[-1, -1, 1][t] -  kpon*K[3, 1][t]*S[-1, 0, -1][t] + kpoff*S[-1,  0, 1][t] - kpon*K[3, 1][t]*S[-1, 1, -1][t]  + kpoff*S[-1, 1, 1][t] - kpon*K[3, 1][t]*S[- 1, 2, -1][t] + kpoff*S[-1, 2, 1][t] -  kpon*K[3, 1][t]*S[0, -1, -1][t] + kpoff*S[0,  -1, 1][t] - kpon*K[3, 1][t]*S[0, 0, -1][t]  + kpoff*S[0, 0, 1][t] - kpon*K[3, 1][t]*S[0,  1, -1][t] + kpoff*S[0, 1, 1][t] - kpon* K[3, 1][t]*S[0, 2, -1][t] + kpoff*S[0, 2, 1][ t] - kpon*K[3, 1][t]*S[1, -1, -1][t] + kpoff* S[1, -1, 1][t] - kpon*K[3, 1][t]*S[1, 0, -1][ t] + kpoff*S[1, 0, 1][t] - kpon*K[3, 1][t]*S[ 1, 1, -1][t] + kpoff*S[1, 1, 1][t] -  kpon*K[3, 1][t]*S[1, 2, -1][t] + kpoff*S[1,  2, 1][t] - kpon*K[3, 1][t]*S[2, -1, -1][t]  + kpoff*S[2, -1, 1][t] - kpon*K[3, 1][t]*S[ 2, 0, -1][t] + kpoff*S[2, 0, 1][t] -  kpon*K[3, 1][t]*S[2, 1, -1][t] + kpoff*S[2,  1, 1][t] - kpon*K[3, 1][t]*S[2, 2, -1][t]  + kpoff*S[2, 2, 1][t]
K_K[1, 0, 2, 2] 0 (K_K[1, 0, 2, 2])'[t] == a7*K[1, 0][t]*K[2,  2][t] - d7*K_K[1, 0, 2, 2][t] - k7*K_K[ 1, 0, 2, 2][t]
K_K[1, 1, 2, 2] 0 (K_K[1, 1, 2, 2])'[t] == a9*K[1, 1][t]*K[2,  2][t] - d9*K_K[1, 1, 2, 2][t] - k9*K_K[ 1, 1, 2, 2][t]
K_K[2, 0, 3, 1] 0 (K_K[2, 0, 3, 1])'[t] == a3*K[2, 0][t]*K[3,  1][t] - d3*K_K[2, 0, 3, 1][t] - k3*K_K[ 2, 0, 3, 1][t]
K_K[2, 1, 3, 1] 0 (K_K[2, 1, 3, 1])'[t] == a5*K[2, 1][t]*K[3,  1][t] - d5*K_K[2, 1, 3, 1][t] - k5*K_K[ 2, 1, 3, 1][t]
K_MAPKP[1, 1] 0 (K_MAPKP[1, 1])'[t] == a8*MAPKP[t]*K[1, 1][t] -  d8*K_MAPKP[1, 1][t] - k8*K_MAPKP[1, 1][t]
K_MAPKP[1, 2] 0 (K_MAPKP[1, 2])'[t] == a10*MAPKP[t]*K[1, 2][t] -  d10*K_MAPKP[1, 2][t] - k10*K_MAPKP[1, 2][t]
K_MEKP[2, 1] 0 (K_MEKP[2, 1])'[t] == a4*MEKP[t]*K[2, 1][t] -  d4*K_MEKP[2, 1][t] - k4*K_MEKP[2, 1][t]
K_MEKP[2, 2] 0 (K_MEKP[2, 2])'[t] == a6*MEKP[t]*K[2, 2][t] -  d6*K_MEKP[2, 2][t] - k6*K_MEKP[2, 2][t]
K_RAFK[3, 0] 0 (K_RAFK[3, 0])'[t] == a1*RAFK[t]*K[3, 0][t] -  d1*K_RAFK[3, 0][t] - k1*K_RAFK[3, 0][t]
K_RAFP[3, 1] 0 (K_RAFP[3, 1])'[t] == a2*RAFP[t]*K[3, 1][t] -  d2*K_RAFP[3, 1][t] - k2*K_RAFP[3, 1][t]
S[-1, -1, -1] 0.1 (S[-1, -1, -1])'[t] == -(kon*K[1, 0][t]*S[-1,  -1, -1][t]) - kpon*K[1, 1][t]*S[-1, -1, -1][ t] - kpon*K[1, 2][t]*S[-1, -1, -1][t] - kon* K[2, 0][t]*S[-1, -1, -1][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[- 1, -1, -1][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[-1, -1, -1] [t] - kon*K[3, 0][t]*S[-1, -1, -1][t] - kpon* K[3, 1][t]*S[-1, -1, -1][t] + koff*S[-1, -1,  0][t] + kpoff*S[-1, -1, 1][t] + koff*S[-1,  0, -1][t] + kpoff*S[-1, 1, -1][t] +  kpoff*S[-1, 2, -1][t] + koff*S[0, -1, -1][t]  + kpoff*S[1, -1, -1][t] + kpoff*S[2, -1,  -1][t]
S[-1, -1, 0] 0 (S[-1, -1, 0])'[t] == kon*K[3, 0][t]*S[-1, -1,  -1][t] - koff*S[-1, -1, 0][t] - k1a*RAFK[t]* S[-1, -1, 0][t] - kon*K[1, 0][t]*S[-1, -1, 0] [t] - kpon*K[1, 1][t]*S[-1, -1, 0][t] - kpon* K[1, 2][t]*S[-1, -1, 0][t] - kon*K[2, 0][t]*S[-1,  -1, 0][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[-1, -1, 0][t]  - kpon*K[2, 2][t]*S[-1, -1, 0][t] + koff*S[- 1, 0, 0][t] + kpoff*S[-1, 1, 0][t] +  kpoff*S[-1, 2, 0][t] + koff*S[0, -1, 0][t]  + kpoff*S[1, -1, 0][t] + kpoff*S[2, -1,  0][t] + d1a*S_RAFK[-1, -1, 0][t]
S[-1, -1, 1] 0 (S[-1, -1, 1])'[t] == kpon*K[3, 1][t]*S[-1, - 1, -1][t] - kpoff*S[-1, -1, 1][t] - kon*K[1,  0][t]*S[-1, -1, 1][t] - kpon*K[1, 1][t]*S[-1,  -1, 1][t] - kpon*K[1, 2][t]*S[-1, -1, 1][t]  - kon*K[2, 0][t]*S[-1, -1, 1][t] - kpon*K[2,  1][t]*S[-1, -1, 1][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[-1,  -1, 1][t] + koff*S[-1, 0, 1][t] +  kpoff*S[-1, 1, 1][t] + kpoff*S[-1, 2, 1][t]  + koff*S[0, -1, 1][t] + kpoff*S[1, -1,  1][t] + kpoff*S[2, -1, 1][t] + k1*S_RAFK[-1,  -1, 0][t]
S[-1, 0, -1] 0 (S[-1, 0, -1])'[t] == kon*K[2, 0][t]*S[-1, -1,  -1][t] - koff*S[-1, 0, -1][t] - kon*K[1,  0][t]*S[-1, 0, -1][t] - kpon*K[1, 1][t]*S[-1,  0, -1][t] - kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 0, -1][t]  - kon*K[3, 0][t]*S[-1, 0, -1][t] - kpon*K[3,  1][t]*S[-1, 0, -1][t] + koff*S[-1, 0, 0][t]  + kpoff*S[-1, 0, 1][t] + koff*S[0, 0, - 1][t] + kpoff*S[1, 0, -1][t] + kpoff*S[2, 0,  -1][t]
S[-1, 0, 0] 0 (S[-1, 0, 0])'[t] == kon*K[2, 0][t]*S[-1, -1,  0][t] + kon*K[3, 0][t]*S[-1, 0, -1][t] -  2*koff*S[-1, 0, 0][t] - k1a*RAFK[t]*S[-1, 0,  0][t] - kon*K[1, 0][t]*S[-1, 0, 0][t] -  kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 0, 0][t] - kpon*K[1,  2][t]*S[-1, 0, 0][t] + koff*S[0, 0, 0][t]  + kpoff*S[1, 0, 0][t] + kpoff*S[2, 0,  0][t] + d1a*S_RAFK[-1, 0, 0][t]
S[-1, 0, 1] 0 (S[-1, 0, 1])'[t] == kon*K[2, 0][t]*S[-1, -1,  1][t] + kpon*K[3, 1][t]*S[-1, 0, -1][t] -  k3*S[-1, 0, 1][t] - koff*S[-1, 0, 1][t]  - kpoff*S[-1, 0, 1][t] - kon*K[1, 0][t]*S[- 1, 0, 1][t] - kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 0, 1][t]  - kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 0, 1][t] + koff*S[0,  0, 1][t] + kpoff*S[1, 0, 1][t] + kpoff* S[2, 0, 1][t] + k1*S_RAFK[-1, 0, 0][t]
S[-1, 1, -1] 0 (S[-1, 1, -1])'[t] == kpon*K[2, 1][t]*S[-1, - 1, -1][t] - kpoff*S[-1, 1, -1][t] - kon*K[1,  0][t]*S[-1, 1, -1][t] - kpon*K[1, 1][t]*S[-1,  1, -1][t] - kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 1, -1][t]  - kon*K[3, 0][t]*S[-1, 1, -1][t] - kpon*K[3,  1][t]*S[-1, 1, -1][t] + koff*S[-1, 1, 0][t]  + kpoff*S[-1, 1, 1][t] + koff*S[0, 1, - 1][t] + kpoff*S[1, 1, -1][t] + kpoff*S[2, 1,  -1][t]
S[-1, 1, 0] 0 (S[-1, 1, 0])'[t] == kpon*K[2, 1][t]*S[-1, -1,  0][t] + kon*K[3, 0][t]*S[-1, 1, -1][t] -  koff*S[-1, 1, 0][t] - kpoff*S[-1, 1, 0][t]  - k1a*RAFK[t]*S[-1, 1, 0][t] - kon*K[1, 0][ t]*S[-1, 1, 0][t] - kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 1,  0][t] - kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 1, 0][t] +  koff*S[0, 1, 0][t] + kpoff*S[1, 1, 0][t]  + kpoff*S[2, 1, 0][t] + d1a*S_RAFK[-1, 1,  0][t]
S[-1, 1, 1] 0 (S[-1, 1, 1])'[t] == kpon*K[2, 1][t]*S[-1, -1,  1][t] + k3*S[-1, 0, 1][t] + kpon*K[3,  1][t]*S[-1, 1, -1][t] - k5a*S[-1, 1, 1][t]  - 2*kpoff*S[-1, 1, 1][t] - kon*K[1, 0][t]*S[ -1, 1, 1][t] - kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 1, 1][t]  - kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 1, 1][t] + koff*S[0,  1, 1][t] + kpoff*S[1, 1, 1][t] + kpoff* S[2, 1, 1][t] + k1*S_RAFK[-1, 1, 0][t]
S[-1, 2, -1] 0 (S[-1, 2, -1])'[t] == kpon*K[2, 2][t]*S[-1, - 1, -1][t] - kpoff*S[-1, 2, -1][t] - kon*K[1,  0][t]*S[-1, 2, -1][t] - kpon*K[1, 1][t]*S[-1,  2, -1][t] - kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 2, -1][t]  - kon*K[3, 0][t]*S[-1, 2, -1][t] - kpon*K[3,  1][t]*S[-1, 2, -1][t] + koff*S[-1, 2, 0][t]  + kpoff*S[-1, 2, 1][t] + koff*S[0, 2, - 1][t] + kpoff*S[1, 2, -1][t] + kpoff*S[2, 2,  -1][t]
S[-1, 2, 0] 0 (S[-1, 2, 0])'[t] == kpon*K[2, 2][t]*S[-1, -1,  0][t] + kon*K[3, 0][t]*S[-1, 2, -1][t] -  koff*S[-1, 2, 0][t] - kpoff*S[-1, 2, 0][t]  - k1a*RAFK[t]*S[-1, 2, 0][t] - kon*K[1, 0][ t]*S[-1, 2, 0][t] - kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 2,  0][t] - kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 2, 0][t] +  koff*S[0, 2, 0][t] + kpoff*S[1, 2, 0][t]  + kpoff*S[2, 2, 0][t] + d1a*S_RAFK[-1, 2,  0][t]
S[-1, 2, 1] 0 (S[-1, 2, 1])'[t] == kpon*K[2, 2][t]*S[-1, -1,  1][t] + k5a*S[-1, 1, 1][t] + kpon*K[3,  1][t]*S[-1, 2, -1][t] - 2*kpoff*S[-1, 2, 1][ t] - kon*K[1, 0][t]*S[-1, 2, 1][t] - kpon*K[ 1, 1][t]*S[-1, 2, 1][t] - kpon*K[1, 2][t]*S[-1,  2, 1][t] + koff*S[0, 2, 1][t] + kpoff* S[1, 2, 1][t] + kpoff*S[2, 2, 1][t] +  k1*S_RAFK[-1, 2, 0][t]
S[0, -1, -1] 0 (S[0, -1, -1])'[t] == kon*K[1, 0][t]*S[-1, -1,  -1][t] - koff*S[0, -1, -1][t] - kon*K[2,  0][t]*S[0, -1, -1][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[0,  -1, -1][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[0, -1, -1][t]  - kon*K[3, 0][t]*S[0, -1, -1][t] - kpon*K[3,  1][t]*S[0, -1, -1][t] + koff*S[0, -1, 0][t]  + kpoff*S[0, -1, 1][t] + koff*S[0, 0, - 1][t] + kpoff*S[0, 1, -1][t] + kpoff*S[0, 2,  -1][t]
S[0, -1, 0] 0 (S[0, -1, 0])'[t] == kon*K[1, 0][t]*S[-1, -1,  0][t] + kon*K[3, 0][t]*S[0, -1, -1][t] -  2*koff*S[0, -1, 0][t] - k1a*RAFK[t]*S[0, -1,  0][t] - kon*K[2, 0][t]*S[0, -1, 0][t] -  kpon*K[2, 1][t]*S[0, -1, 0][t] - kpon*K[2,  2][t]*S[0, -1, 0][t] + koff*S[0, 0, 0][t]  + kpoff*S[0, 1, 0][t] + kpoff*S[0, 2,  0][t] + d1a*S_RAFK[0, -1, 0][t]
S[0, -1, 1] 0 (S[0, -1, 1])'[t] == kon*K[1, 0][t]*S[-1, -1,  1][t] + kpon*K[3, 1][t]*S[0, -1, -1][t] -  koff*S[0, -1, 1][t] - kpoff*S[0, -1, 1][t]  - kon*K[2, 0][t]*S[0, -1, 1][t] - kpon*K[2,  1][t]*S[0, -1, 1][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[0,  -1, 1][t] + koff*S[0, 0, 1][t] + kpoff* S[0, 1, 1][t] + kpoff*S[0, 2, 1][t] +  k1*S_RAFK[0, -1, 0][t]
S[0, 0, -1] 0 (S[0, 0, -1])'[t] == kon*K[1, 0][t]*S[-1, 0,  -1][t] + kon*K[2, 0][t]*S[0, -1, -1][t] -  2*koff*S[0, 0, -1][t] - kon*K[3, 0][t]*S[0,  0, -1][t] - kpon*K[3, 1][t]*S[0, 0, -1][t]  + koff*S[0, 0, 0][t] + kpoff*S[0, 0, 1] [t]
S[0, 0, 0] 0 (S[0, 0, 0])'[t] == kon*K[1, 0][t]*S[-1, 0,  0][t] + kon*K[2, 0][t]*S[0, -1, 0][t] +  kon*K[3, 0][t]*S[0, 0, -1][t] - 3*koff*S[0,  0, 0][t] - k1a*RAFK[t]*S[0, 0, 0][t] +  d1a*S_RAFK[0, 0, 0][t]
S[0, 0, 1] 0 (S[0, 0, 1])'[t] == kon*K[1, 0][t]*S[-1, 0,  1][t] + kon*K[2, 0][t]*S[0, -1, 1][t] +  kpon*K[3, 1][t]*S[0, 0, -1][t] - k3*S[0, 0,  1][t] - 2*koff*S[0, 0, 1][t] - kpoff*S[0,  0, 1][t] + k1*S_RAFK[0, 0, 0][t]
S[0, 1, -1] 0 (S[0, 1, -1])'[t] == kon*K[1, 0][t]*S[-1, 1,  -1][t] + kpon*K[2, 1][t]*S[0, -1, -1][t] -  koff*S[0, 1, -1][t] - kpoff*S[0, 1, -1][t]  - kon*K[3, 0][t]*S[0, 1, -1][t] - kpon*K[3,  1][t]*S[0, 1, -1][t] + koff*S[0, 1, 0][t]  + kpoff*S[0, 1, 1][t]
S[0, 1, 0] 0 (S[0, 1, 0])'[t] == kon*K[1, 0][t]*S[-1, 1,  0][t] + kpon*K[2, 1][t]*S[0, -1, 0][t] +  kon*K[3, 0][t]*S[0, 1, -1][t] - 2*koff*S[0,  1, 0][t] - kpoff*S[0, 1, 0][t] - k1a* RAFK[t]*S[0, 1, 0][t] + d1a*S_RAFK[0, 1, 0][t]
S[0, 1, 1] 0 (S[0, 1, 1])'[t] == kon*K[1, 0][t]*S[-1, 1,  1][t] + kpon*K[2, 1][t]*S[0, -1, 1][t] +  k3*S[0, 0, 1][t] + kpon*K[3, 1][t]*S[0, 1,  -1][t] - k5a*S[0, 1, 1][t] - koff*S[0,  1, 1][t] - 2*kpoff*S[0, 1, 1][t] + k1* S_RAFK[0, 1, 0][t]
S[0, 2, -1] 0 (S[0, 2, -1])'[t] == kon*K[1, 0][t]*S[-1, 2,  -1][t] + kpon*K[2, 2][t]*S[0, -1, -1][t] -  k7*S[0, 2, -1][t] - koff*S[0, 2, -1][t]  - kpoff*S[0, 2, -1][t] - kon*K[3, 0][t]*S[0,  2, -1][t] - kpon*K[3, 1][t]*S[0, 2, -1][t]  + koff*S[0, 2, 0][t] + kpoff*S[0, 2, 1] [t]
S[0, 2, 0] 0 (S[0, 2, 0])'[t] == kon*K[1, 0][t]*S[-1, 2,  0][t] + kpon*K[2, 2][t]*S[0, -1, 0][t] +  kon*K[3, 0][t]*S[0, 2, -1][t] - k7*S[0, 2,  0][t] - 2*koff*S[0, 2, 0][t] - kpoff*S[0,  2, 0][t] - k1a*RAFK[t]*S[0, 2, 0][t] +  d1a*S_RAFK[0, 2, 0][t]
S[0, 2, 1] 0 (S[0, 2, 1])'[t] == kon*K[1, 0][t]*S[-1, 2,  1][t] + kpon*K[2, 2][t]*S[0, -1, 1][t] +  k5a*S[0, 1, 1][t] + kpon*K[3, 1][t]*S[0, 2,  -1][t] - k7*S[0, 2, 1][t] - koff*S[0,  2, 1][t] - 2*kpoff*S[0, 2, 1][t] + k1* S_RAFK[0, 2, 0][t]
S[1, -1, -1] 0 (S[1, -1, -1])'[t] == kpon*K[1, 1][t]*S[-1, - 1, -1][t] - kpoff*S[1, -1, -1][t] - kon*K[2,  0][t]*S[1, -1, -1][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[1,  -1, -1][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[1, -1, -1][t]  - kon*K[3, 0][t]*S[1, -1, -1][t] - kpon*K[3,  1][t]*S[1, -1, -1][t] + koff*S[1, -1, 0][t]  + kpoff*S[1, -1, 1][t] + koff*S[1, 0, - 1][t] + kpoff*S[1, 1, -1][t] + kpoff*S[1, 2,  -1][t]
S[1, -1, 0] 0 (S[1, -1, 0])'[t] == kpon*K[1, 1][t]*S[-1, -1,  0][t] + kon*K[3, 0][t]*S[1, -1, -1][t] -  koff*S[1, -1, 0][t] - kpoff*S[1, -1, 0][t]  - k1a*RAFK[t]*S[1, -1, 0][t] - kon*K[2, 0][ t]*S[1, -1, 0][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[1, -1,  0][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[1, -1, 0][t] +  koff*S[1, 0, 0][t] + kpoff*S[1, 1, 0][t]  + kpoff*S[1, 2, 0][t] + d1a*S_RAFK[1, -1,  0][t]
S[1, -1, 1] 0 (S[1, -1, 1])'[t] == kpon*K[1, 1][t]*S[-1, -1,  1][t] + kpon*K[3, 1][t]*S[1, -1, -1][t] -  2*kpoff*S[1, -1, 1][t] - kon*K[2, 0][t]*S[1,  -1, 1][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[1, -1, 1][t]  - kpon*K[2, 2][t]*S[1, -1, 1][t] + koff*S[1,  0, 1][t] + kpoff*S[1, 1, 1][t] + kpoff* S[1, 2, 1][t] + k1*S_RAFK[1, -1, 0][t]
S[1, 0, -1] 0 (S[1, 0, -1])'[t] == kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 0,  -1][t] + kon*K[2, 0][t]*S[1, -1, -1][t] -  koff*S[1, 0, -1][t] - kpoff*S[1, 0, -1][t]  - kon*K[3, 0][t]*S[1, 0, -1][t] - kpon*K[3,  1][t]*S[1, 0, -1][t] + koff*S[1, 0, 0][t]  + kpoff*S[1, 0, 1][t]
S[1, 0, 0] 0 (S[1, 0, 0])'[t] == kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 0,  0][t] + kon*K[2, 0][t]*S[1, -1, 0][t] +  kon*K[3, 0][t]*S[1, 0, -1][t] - 2*koff*S[1,  0, 0][t] - kpoff*S[1, 0, 0][t] - k1a* RAFK[t]*S[1, 0, 0][t] + d1a*S_RAFK[1, 0, 0][t]
S[1, 0, 1] 0 (S[1, 0, 1])'[t] == kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 0,  1][t] + kon*K[2, 0][t]*S[1, -1, 1][t] +  kpon*K[3, 1][t]*S[1, 0, -1][t] - k3*S[1, 0,  1][t] - koff*S[1, 0, 1][t] - 2*kpoff*S[1,  0, 1][t] + k1*S_RAFK[1, 0, 0][t]
S[1, 1, -1] 0 (S[1, 1, -1])'[t] == kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 1,  -1][t] + kpon*K[2, 1][t]*S[1, -1, -1][t] -  2*kpoff*S[1, 1, -1][t] - kon*K[3, 0][t]*S[1,  1, -1][t] - kpon*K[3, 1][t]*S[1, 1, -1][t]  + koff*S[1, 1, 0][t] + kpoff*S[1, 1, 1] [t]
S[1, 1, 0] 0 (S[1, 1, 0])'[t] == kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 1,  0][t] + kpon*K[2, 1][t]*S[1, -1, 0][t] +  kon*K[3, 0][t]*S[1, 1, -1][t] - koff*S[1, 1,  0][t] - 2*kpoff*S[1, 1, 0][t] - k1a*RAFK[t]* S[1, 1, 0][t] + d1a*S_RAFK[1, 1, 0][t]
S[1, 1, 1] 0 (S[1, 1, 1])'[t] == kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 1,  1][t] + kpon*K[2, 1][t]*S[1, -1, 1][t] +  k3*S[1, 0, 1][t] + kpon*K[3, 1][t]*S[1, 1,  -1][t] - k5a*S[1, 1, 1][t] - 3*kpoff*S[1,  1, 1][t] + k1*S_RAFK[1, 1, 0][t]
S[1, 2, -1] 0 (S[1, 2, -1])'[t] == kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 2,  -1][t] + k7*S[0, 2, -1][t] + kpon*K[2,  2][t]*S[1, -1, -1][t] - k9a*S[1, 2, -1][t]  - 2*kpoff*S[1, 2, -1][t] - kon*K[3, 0][t]*S[ 1, 2, -1][t] - kpon*K[3, 1][t]*S[1, 2, -1][t]  + koff*S[1, 2, 0][t] + kpoff*S[1, 2, 1] [t]
S[1, 2, 0] 0 (S[1, 2, 0])'[t] == kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 2,  0][t] + k7*S[0, 2, 0][t] + kpon*K[2, 2] [t]*S[1, -1, 0][t] + kon*K[3, 0][t]*S[1, 2, - 1][t] - k9a*S[1, 2, 0][t] - koff*S[1, 2,  0][t] - 2*kpoff*S[1, 2, 0][t] - k1a*RAFK[t]* S[1, 2, 0][t] + d1a*S_RAFK[1, 2, 0][t]
S[1, 2, 1] 0 (S[1, 2, 1])'[t] == kpon*K[1, 1][t]*S[-1, 2,  1][t] + k7*S[0, 2, 1][t] + kpon*K[2, 2] [t]*S[1, -1, 1][t] + k5a*S[1, 1, 1][t] +  kpon*K[3, 1][t]*S[1, 2, -1][t] - k9a*S[1, 2,  1][t] - 3*kpoff*S[1, 2, 1][t] + k1*S_RAFK[1,  2, 0][t]
S[2, -1, -1] 0 (S[2, -1, -1])'[t] == kpon*K[1, 2][t]*S[-1, - 1, -1][t] - kpoff*S[2, -1, -1][t] - kon*K[2,  0][t]*S[2, -1, -1][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[2,  -1, -1][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[2, -1, -1][t]  - kon*K[3, 0][t]*S[2, -1, -1][t] - kpon*K[3,  1][t]*S[2, -1, -1][t] + koff*S[2, -1, 0][t]  + kpoff*S[2, -1, 1][t] + koff*S[2, 0, - 1][t] + kpoff*S[2, 1, -1][t] + kpoff*S[2, 2,  -1][t]
S[2, -1, 0] 0 (S[2, -1, 0])'[t] == kpon*K[1, 2][t]*S[-1, -1,  0][t] + kon*K[3, 0][t]*S[2, -1, -1][t] -  koff*S[2, -1, 0][t] - kpoff*S[2, -1, 0][t]  - k1a*RAFK[t]*S[2, -1, 0][t] - kon*K[2, 0][ t]*S[2, -1, 0][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[2, -1,  0][t] - kpon*K[2, 2][t]*S[2, -1, 0][t] +  koff*S[2, 0, 0][t] + kpoff*S[2, 1, 0][t]  + kpoff*S[2, 2, 0][t] + d1a*S_RAFK[2, -1,  0][t]
S[2, -1, 1] 0 (S[2, -1, 1])'[t] == kpon*K[1, 2][t]*S[-1, -1,  1][t] + kpon*K[3, 1][t]*S[2, -1, -1][t] -  2*kpoff*S[2, -1, 1][t] - kon*K[2, 0][t]*S[2,  -1, 1][t] - kpon*K[2, 1][t]*S[2, -1, 1][t]  - kpon*K[2, 2][t]*S[2, -1, 1][t] + koff*S[2,  0, 1][t] + kpoff*S[2, 1, 1][t] + kpoff* S[2, 2, 1][t] + k1*S_RAFK[2, -1, 0][t]
S[2, 0, -1] 0 (S[2, 0, -1])'[t] == kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 0,  -1][t] + kon*K[2, 0][t]*S[2, -1, -1][t] -  koff*S[2, 0, -1][t] - kpoff*S[2, 0, -1][t]  - kon*K[3, 0][t]*S[2, 0, -1][t] - kpon*K[3,  1][t]*S[2, 0, -1][t] + koff*S[2, 0, 0][t]  + kpoff*S[2, 0, 1][t]
S[2, 0, 0] 0 (S[2, 0, 0])'[t] == kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 0,  0][t] + kon*K[2, 0][t]*S[2, -1, 0][t] +  kon*K[3, 0][t]*S[2, 0, -1][t] - 2*koff*S[2,  0, 0][t] - kpoff*S[2, 0, 0][t] - k1a* RAFK[t]*S[2, 0, 0][t] + d1a*S_RAFK[2, 0, 0][t]
S[2, 0, 1] 0 (S[2, 0, 1])'[t] == kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 0,  1][t] + kon*K[2, 0][t]*S[2, -1, 1][t] +  kpon*K[3, 1][t]*S[2, 0, -1][t] - k3*S[2, 0,  1][t] - koff*S[2, 0, 1][t] - 2*kpoff*S[2,  0, 1][t] + k1*S_RAFK[2, 0, 0][t]
S[2, 1, -1] 0 (S[2, 1, -1])'[t] == kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 1,  -1][t] + kpon*K[2, 1][t]*S[2, -1, -1][t] -  2*kpoff*S[2, 1, -1][t] - kon*K[3, 0][t]*S[2,  1, -1][t] - kpon*K[3, 1][t]*S[2, 1, -1][t]  + koff*S[2, 1, 0][t] + kpoff*S[2, 1, 1] [t]
S[2, 1, 0] 0 (S[2, 1, 0])'[t] == kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 1,  0][t] + kpon*K[2, 1][t]*S[2, -1, 0][t] +  kon*K[3, 0][t]*S[2, 1, -1][t] - koff*S[2, 1,  0][t] - 2*kpoff*S[2, 1, 0][t] - k1a*RAFK[t]* S[2, 1, 0][t] + d1a*S_RAFK[2, 1, 0][t]
S[2, 1, 1] 0 (S[2, 1, 1])'[t] == kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 1,  1][t] + kpon*K[2, 1][t]*S[2, -1, 1][t] +  k3*S[2, 0, 1][t] + kpon*K[3, 1][t]*S[2, 1,  -1][t] - k5a*S[2, 1, 1][t] - 3*kpoff*S[2,  1, 1][t] + k1*S_RAFK[2, 1, 0][t]
S[2, 2, -1] 0 (S[2, 2, -1])'[t] == kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 2,  -1][t] + k9a*S[1, 2, -1][t] + kpon*K[2,  2][t]*S[2, -1, -1][t] - 2*kpoff*S[2, 2, -1][ t] - kon*K[3, 0][t]*S[2, 2, -1][t] - kpon*K[ 3, 1][t]*S[2, 2, -1][t] + koff*S[2, 2, 0][t]  + kpoff*S[2, 2, 1][t]
S[2, 2, 0] 0 (S[2, 2, 0])'[t] == kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 2,  0][t] + k9a*S[1, 2, 0][t] + kpon*K[2,  2][t]*S[2, -1, 0][t] + kon*K[3, 0][t]*S[2,  2, -1][t] - koff*S[2, 2, 0][t] - 2* kpoff*S[2, 2, 0][t] - k1a*RAFK[t]*S[2, 2, 0][t]  + d1a*S_RAFK[2, 2, 0][t]
S[2, 2, 1] 0 (S[2, 2, 1])'[t] == kpon*K[1, 2][t]*S[-1, 2,  1][t] + k9a*S[1, 2, 1][t] + kpon*K[2,  2][t]*S[2, -1, 1][t] + k5a*S[2, 1, 1][t]  + kpon*K[3, 1][t]*S[2, 2, -1][t] - 3*kpoff* S[2, 2, 1][t] + k1*S_RAFK[2, 2, 0][t]
S_RAFK[-1, -1, 0] 0 (S_RAFK[-1, -1, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[-1, -1,  0][t] - d1a*S_RAFK[-1, -1, 0][t] - k1* S_RAFK[-1, -1, 0][t]
S_RAFK[-1, 0, 0] 0 (S_RAFK[-1, 0, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[-1, 0,  0][t] - d1a*S_RAFK[-1, 0, 0][t] - k1*S_RAFK[ -1, 0, 0][t]
S_RAFK[-1, 1, 0] 0 (S_RAFK[-1, 1, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[-1, 1,  0][t] - d1a*S_RAFK[-1, 1, 0][t] - k1*S_RAFK[ -1, 1, 0][t]
S_RAFK[-1, 2, 0] 0 (S_RAFK[-1, 2, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[-1, 2,  0][t] - d1a*S_RAFK[-1, 2, 0][t] - k1*S_RAFK[ -1, 2, 0][t]
S_RAFK[0, -1, 0] 0 (S_RAFK[0, -1, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[0, -1,  0][t] - d1a*S_RAFK[0, -1, 0][t] - k1*S_RAFK[ 0, -1, 0][t]
S_RAFK[0, 0, 0] 0 (S_RAFK[0, 0, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[0, 0,  0][t] - d1a*S_RAFK[0, 0, 0][t] - k1*S_RAFK[ 0, 0, 0][t]
S_RAFK[0, 1, 0] 0 (S_RAFK[0, 1, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[0, 1,  0][t] - d1a*S_RAFK[0, 1, 0][t] - k1*S_RAFK[ 0, 1, 0][t]
S_RAFK[0, 2, 0] 0 (S_RAFK[0, 2, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[0, 2,  0][t] - d1a*S_RAFK[0, 2, 0][t] - k1*S_RAFK[ 0, 2, 0][t]
S_RAFK[1, -1, 0] 0 (S_RAFK[1, -1, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[1, -1,  0][t] - d1a*S_RAFK[1, -1, 0][t] - k1*S_RAFK[ 1, -1, 0][t]
S_RAFK[1, 0, 0] 0 (S_RAFK[1, 0, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[1, 0,  0][t] - d1a*S_RAFK[1, 0, 0][t] - k1*S_RAFK[ 1, 0, 0][t]
S_RAFK[1, 1, 0] 0 (S_RAFK[1, 1, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[1, 1,  0][t] - d1a*S_RAFK[1, 1, 0][t] - k1*S_RAFK[ 1, 1, 0][t]
S_RAFK[1, 2, 0] 0 (S_RAFK[1, 2, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[1, 2,  0][t] - d1a*S_RAFK[1, 2, 0][t] - k1*S_RAFK[ 1, 2, 0][t]
S_RAFK[2, -1, 0] 0 (S_RAFK[2, -1, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[2, -1,  0][t] - d1a*S_RAFK[2, -1, 0][t] - k1*S_RAFK[ 2, -1, 0][t]
S_RAFK[2, 0, 0] 0 (S_RAFK[2, 0, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[2, 0,  0][t] - d1a*S_RAFK[2, 0, 0][t] - k1*S_RAFK[ 2, 0, 0][t]
S_RAFK[2, 1, 0] 0 (S_RAFK[2, 1, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[2, 1,  0][t] - d1a*S_RAFK[2, 1, 0][t] - k1*S_RAFK[ 2, 1, 0][t]
S_RAFK[2, 2, 0] 0 (S_RAFK[2, 2, 0])'[t] == k1a*RAFK[t]*S[2, 2,  0][t] - d1a*S_RAFK[2, 2, 0][t] - k1*S_RAFK[ 2, 2, 0][t]

Generated by Cellerator Version 1.0 update 2.1203 using Mathematica 4.2 for Mac OS X (June 4, 2002), December 4, 2002 15:06:10, using (PowerMac,PowerPC,Mac OS X,MacOSX,Darwin)

author=B.E.Shapiro

This model originates from BioModels Database: A Database of Annotated Published Models. It is copyright (c) 2005-2010 The BioModels Team.
For more information see the terms of use.
To cite BioModels Database, please use Le Novère N., Bornstein B., Broicher A., Courtot M., Donizelli M., Dharuri H., Li L., Sauro H., Schilstra M., Shapiro B., Snoep J.L., Hucka M. (2006) BioModels Database: A Free, Centralized Database of Curated, Published, Quantitative Kinetic Models of Biochemical and Cellular Systems Nucleic Acids Res., 34: D689-D691.

Model
Publication ID: 10823939 Submission Date: 13 Sep 2005 13:07:14 UTC Last Modification Date: 01 Sep 2008 23:40:29 UTC Creation Date: 25 Feb 2005 23:43:21 UTC
Mathematical expressions
Reactions
binding of RAF and RAFK dissociation of RAF_RAFK phosphorylation of RAF binding of RAF-P and RAF phosphatase
dissociation of RAF-P_RAFPase dephosphorylation of RAF-P binding of MEK and RAF-P dissociation of MEK_RAF-P
phosphorylation of MEK binding of MEK-P and MEK phosphatase dissociation of MEK-P_MEKPase dephosphorylation of MEK-P
binding of MEK-P and RAF-P dissociation of MEK-P_RAF-P phosphorylation of MEK-P binding of MEK-PP and MEK phosphatase
dissociation of MEK-PP_MEKPase dephosphorylation of MEK-PP binding of MAPK and MEK-PP dissociation of MAPK_MEK-PP
phosphorylation of MAPK binding of MAPK-P and MAPK phosphatase dissociation of MAPK-P_MAPKPase dephosphorylation of MAPK-P
binding of MAPK-P and MEK-PP dissociation of MAPK-P_MEK-PP phosphorylation of MAPK-P binding of MAPK-PP and MAPK phosphatase
dissociation of MAPK-PP_MAPKPase dephosphorylation of MAPK-PP binding of MAPK on scaffold dissociation of MAPK from scaffold
binding of MAPK on scaffold dissociation of MAPK from scaffold binding of MAPK on scaffold dissociation of MAPK from scaffold
binding of MAPK on scaffold dissociation of MAPK from scaffold binding of MAPK on scaffold dissociation of MAPK from scaffold
binding of MAPK on scaffold dissociation of MAPK from scaffold binding of MAPK on scaffold dissociation of MAPK from scaffold
binding of MAPK on scaffold dissociation of MAPK from scaffold binding of MAPK on scaffold dissociation of MAPK from scaffold
binding of MAPK on scaffold dissociation of MAPK from scaffold binding of MAPK on scaffold dissociation of MAPK from scaffold
binding of MAPK on scaffold dissociation of MAPK from scaffold binding of MAPK-P on scaffold dissociation of MAPK-P from scaffold
binding of MAPK-P on scaffold dissociation of MAPK-P from scaffold binding of MAPK-P on scaffold dissociation of MAPK-P from scaffold
binding of MAPK-P on scaffold dissociation of MAPK-P from scaffold binding of MAPK-P on scaffold dissociation of MAPK-P from scaffold
binding of MAPK-P on scaffold dissociation of MAPK-P from scaffold binding of MAPK-P on scaffold dissociation of MAPK-P from scaffold
binding of MAPK-P on scaffold dissociation of MAPK-P from scaffold binding of MAPK-P on scaffold dissociation of MAPK-P from scaffold
binding of MAPK-P on scaffold dissociation of MAPK-P from scaffold binding of MAPK-P on scaffold dissociation of MAPK-P from scaffold
binding of MAPK-P on scaffold dissociation of MAPK-P from scaffold binding of MAPK-PP on scaffold dissociation of MAPK-PP from scaffold
binding of MAPK-PP on scaffold dissociation of MAPK-PP from scaffold binding of MAPK-PP on scaffold dissociation of MAPK-PP from scaffold
binding of MAPK-PP on scaffold dissociation of MAPK-PP from scaffold binding of MAPK-PP on scaffold dissociation of MAPK-PP from scaffold
binding of MAPK-PP on scaffold dissociation of MAPK-PP from scaffold binding of MAPK-PP on scaffold dissociation of MAPK-PP from scaffold
binding of MAPK-PP on scaffold dissociation of MAPK-PP from scaffold binding of MAPK-PP on scaffold dissociation of MAPK-PP from scaffold
binding of MAPK-PP on scaffold dissociation of MAPK-PP from scaffold binding of MAPK-PP on scaffold dissociation of MAPK-PP from scaffold
binding of MAPK-PP on scaffold dissociation of MAPK-PP from scaffold binding of MEK on scaffold dissociation of MEK from scaffold
binding of MEK on scaffold dissociation of MEK from scaffold binding of MEK on scaffold dissociation of MEK from scaffold
binding of MEK-P on scaffold dissociation of MEK-P from scaffold binding of MEK-P on scaffold dissociation of MEK-P from scaffold
binding of MEK-P on scaffold dissociation of MEK-P from scaffold binding of MEK-PP on scaffold dissociation of MEK-PP from scaffold
binding of MEK-PP on scaffold dissociation of MEK-PP from scaffold binding of MEK-PP on scaffold dissociation of MEK-PP from scaffold
binding of MEK on scaffold dissociation of MEK from scaffold binding of MEK on scaffold dissociation of MEK from scaffold
binding of MEK on scaffold dissociation of MEK from scaffold binding of MEK-P on scaffold dissociation of MEK-P from scaffold
binding of MEK-P on scaffold dissociation of MEK-P from scaffold binding of MEK-P on scaffold dissociation of MEK-P from scaffold
binding of MEK-PP on scaffold dissociation of MEK-PP from scaffold binding of MEK-PP on scaffold dissociation of MEK-PP from scaffold
binding of MEK-PP on scaffold dissociation of MEK-PP from scaffold binding of MEK on scaffold dissociation of MEK from scaffold
binding of MEK on scaffold dissociation of MEK from scaffold binding of MEK on scaffold dissociation of MEK from scaffold
binding of MEK-P on scaffold dissociation of MEK-P from scaffold binding of MEK-P on scaffold dissociation of MEK-P from scaffold
binding of MEK-P on scaffold dissociation of MEK-P from scaffold binding of MEK-PP on scaffold dissociation of MEK-PP from scaffold
binding of MEK-PP on scaffold dissociation of MEK-PP from scaffold binding of MEK-PP on scaffold dissociation of MEK-PP from scaffold
binding of MEK on scaffold dissociation of MEK from scaffold binding of MEK on scaffold dissociation of MEK from scaffold
binding of MEK on scaffold dissociation of MEK from scaffold binding of MEK-P on scaffold dissociation of MEK-P from scaffold
binding of MEK-P on scaffold dissociation of MEK-P from scaffold binding of MEK-P on scaffold dissociation of MEK-P from scaffold
binding of MEK-PP on scaffold dissociation of MEK-PP from scaffold binding of MEK-PP on scaffold dissociation of MEK-PP from scaffold
binding of MEK-PP on scaffold dissociation of MEK-PP from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF-P from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF-P from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF-P from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF-P from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF-P from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF-P from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF-P from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF-P from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF-P from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF-P from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF-P from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF-P from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF-P from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF-P from scaffold binding of RAF on scaffold dissociation of RAF from scaffold
binding of RAF-P on scaffold dissociation of RAF-P from scaffold phosphorylation of MAPK on scaffold phosphorylation of MAPK on scaffold
phosphorylation of MAPK on scaffold phosphorylation of MAPK-P on scaffold phosphorylation of MAPK-P on scaffold phosphorylation of MAPK-P on scaffold
phosphorylation of MEK on scaffold phosphorylation of MEK-P on scaffold phosphorylation of MEK on scaffold phosphorylation of MEK-P on scaffold
phosphorylation of MEK on scaffold phosphorylation of MEK-P on scaffold phosphorylation of MEK on scaffold phosphorylation of MEK-P on scaffold
binding of RAF and RAFK dissociation of RAF_RAFK phosphorylation of RAF on scaffold binding of RAF and RAFK
dissociation of RAF_RAFK phosphorylation of RAF on scaffold binding of RAF and RAFK dissociation of RAF_RAFK
phosphorylation of RAF on scaffold binding of RAF and RAFK dissociation of RAF_RAFK phosphorylation of RAF on scaffold
binding of RAF and RAFK dissociation of RAF_RAFK phosphorylation of RAF on scaffold binding of RAF and RAFK
dissociation of RAF_RAFK phosphorylation of RAF on scaffold binding of RAF and RAFK dissociation of RAF_RAFK
phosphorylation of RAF on scaffold binding of RAF and RAFK dissociation of RAF_RAFK phosphorylation of RAF on scaffold
binding of RAF and RAFK dissociation of RAF_RAFK phosphorylation of RAF on scaffold binding of RAF and RAFK
dissociation of RAF_RAFK phosphorylation of RAF on scaffold binding of RAF and RAFK dissociation of RAF_RAFK
phosphorylation of RAF on scaffold binding of RAF and RAFK dissociation of RAF_RAFK phosphorylation of RAF on scaffold
binding of RAF and RAFK dissociation of RAF_RAFK phosphorylation of RAF on scaffold binding of RAF and RAFK
dissociation of RAF_RAFK phosphorylation of RAF on scaffold binding of RAF and RAFK dissociation of RAF_RAFK
phosphorylation of RAF on scaffold binding of RAF and RAFK dissociation of RAF_RAFK phosphorylation of RAF on scaffold
Physical entities
Compartments Species
Cytoplasm MAPK phosphatase MEK phosphatase RAF kinase
RAF phosphatase MAPK MAPK-P
MAPK-PP MEK MEK-P
MEK-PP RAF RAF-P
MAPK_MEK-PP MAPK-P_MEK-PP MEK_RAF-P
MEK-P_RAF-P MAPK-P_MAPKPase MAPK-PP_MAPKPase
MEK-P_MEKPase MEK-PP_MEKPase RAF_RAFK
RAF-P_RAFPase Scaffold Scaffold_RAF
Scaffold_RAF-P Scaffold_MEK Scaffold_MEK_RAF
Scaffold_MEK_RAF-P Scaffold_MEK-P Scaffold_MEK-P_RAF
Scaffold_MEK-P_RAF-P Scaffold_MEK-PP Scaffold_MEK-PP_RAF
Scaffold_MEK-PP_RAF-P Scaffold_MAPK Scaffold_MAPK_RAF
Scaffold_MAPK_RAF-P Scaffold_MAPK_MEK Scaffold_MAPK_MEK_RAF
Scaffold_MAPK_MEK_RAF-P Scaffold_MAPK_MEK-P Scaffold_MAPK_MEK-P_RAF
Scaffold_MAPK_MEK-P_RAF-P Scaffold_MAPK_MEK-PP Scaffold_MAPK_MEK-PP_RAF
Scaffold_MAPK_MEK-PP_RAF-P Scaffold_MAPK-P Scaffold_MAPK-P_RAF
Scaffold_MAPK-P_RAF-P Scaffold_MAPK-P_MEK Scaffold_MAPK-P_MEK_RAF
Scaffold_MAPK-P_MEK_RAF-P Scaffold_MAPK-P_MEK-P Scaffold_MAPK-P_MEK-P_RAF
Scaffold_MAPK-P_MEK-P_RAF-P Scaffold_MAPK-P_MEK-PP Scaffold_MAPK-P_MEK-PP_RAF
Scaffold_MAPK-P_MEK-PP_RAF-P Scaffold_MAPK-PP Scaffold_MAPK-PP_RAF
Scaffold_MAPK-PP_RAF-P Scaffold_MAPK-PP_MEK Scaffold_MAPK-PP_MEK_RAF
Scaffold_MAPK-PP_MEK_RAF-P Scaffold_MAPK-PP_MEK-P Scaffold_MAPK-PP_MEK-P_RAF
Scaffold_MAPK-PP_MEK-P_RAF-P Scaffold_MAPK-PP_MEK-PP Scaffold_MAPK-PP_MEK-PP_RAF
Scaffold_MAPK-PP_MEK-PP_RAF-P Scaffold_RAF Scaffold_MEK_RAF
Scaffold_MEK-P_RAF Scaffold_MEK-PP_RAF Scaffold_MAPK_RAF
Scaffold_MAPK_MEK_RAF Scaffold_MAPK_MEK-P_RAF Scaffold_MAPK_MEK-PP_RAF
Scaffold_MAPK-P_RAF Scaffold_MAPK-P_MEK_RAF Scaffold_MAPK-P_MEK-P_RAF
Scaffold_MAPK-P_MEK-PP_RAF Scaffold_MAPK-PP_RAF Scaffold_MAPK-PP_MEK_RAF
Scaffold_MAPK-PP_MEK-P_RAF Scaffold_MAPK-PP_MEK-PP_RAF  
Reactions (300)
 
 binding of RAF and RAFK [RAF kinase] + [RAF] → [RAF_RAFK];  
 
 dissociation of RAF_RAFK [RAF_RAFK] → [RAF kinase] + [RAF];  
 
 phosphorylation of RAF [RAF_RAFK] → [RAF kinase] + [RAF-P];  
 
 binding of RAF-P and RAF phosphatase [RAF phosphatase] + [RAF-P] → [RAF-P_RAFPase];  
 
 dissociation of RAF-P_RAFPase [RAF-P_RAFPase] → [RAF phosphatase] + [RAF-P];  
 
 dephosphorylation of RAF-P [RAF-P_RAFPase] → [RAF phosphatase] + [RAF];  
 
 binding of MEK and RAF-P [MEK] + [RAF-P] → [MEK_RAF-P];  
 
 dissociation of MEK_RAF-P [MEK_RAF-P] → [MEK] + [RAF-P];  
 
 phosphorylation of MEK [MEK_RAF-P] → [MEK-P] + [RAF-P];  
 
 binding of MEK-P and MEK phosphatase [MEK phosphatase] + [MEK-P] → [MEK-P_MEKPase];  
 
 dissociation of MEK-P_MEKPase [MEK-P_MEKPase] → [MEK phosphatase] + [MEK-P];  
 
 dephosphorylation of MEK-P [MEK-P_MEKPase] → [MEK phosphatase] + [MEK];  
 
 binding of MEK-P and RAF-P [MEK-P] + [RAF-P] → [MEK-P_RAF-P];  
 
 dissociation of MEK-P_RAF-P [MEK-P_RAF-P] → [MEK-P] + [RAF-P];  
 
 phosphorylation of MEK-P [MEK-P_RAF-P] → [MEK-PP] + [RAF-P];  
 
 binding of MEK-PP and MEK phosphatase [MEK phosphatase] + [MEK-PP] → [MEK-PP_MEKPase];  
 
 dissociation of MEK-PP_MEKPase [MEK-PP_MEKPase] → [MEK phosphatase] + [MEK-PP];  
 
 dephosphorylation of MEK-PP [MEK-PP_MEKPase] → [MEK phosphatase] + [MEK-P];  
 
 binding of MAPK and MEK-PP [MAPK] + [MEK-PP] → [MAPK_MEK-PP];  
 
 dissociation of MAPK_MEK-PP [MAPK_MEK-PP] → [MAPK] + [MEK-PP];  
 
 phosphorylation of MAPK [MAPK_MEK-PP] → [MAPK-P] + [MEK-PP];  
 
 binding of MAPK-P and MAPK phosphatase [MAPK phosphatase] + [MAPK-P] → [MAPK-P_MAPKPase];  
 
 dissociation of MAPK-P_MAPKPase [MAPK-P_MAPKPase] → [MAPK phosphatase] + [MAPK-P];  
 
 dephosphorylation of MAPK-P [MAPK-P_MAPKPase] → [MAPK phosphatase] + [MAPK];  
 
 binding of MAPK-P and MEK-PP [MAPK-P] + [MEK-PP] → [MAPK-P_MEK-PP];  
 
 dissociation of MAPK-P_MEK-PP [MAPK-P_MEK-PP] → [MAPK-P] + [MEK-PP];  
 
 phosphorylation of MAPK-P [MAPK-P_MEK-PP] → [MAPK-PP] + [MEK-PP];  
 
 binding of MAPK-PP and MAPK phosphatase [MAPK phosphatase] + [MAPK-PP] → [MAPK-PP_MAPKPase];  
 
 dissociation of MAPK-PP_MAPKPase [MAPK-PP_MAPKPase] → [MAPK phosphatase] + [MAPK-PP];  
 
 dephosphorylation of MAPK-PP [MAPK-PP_MAPKPase] → [MAPK phosphatase] + [MAPK-P];  
 
 binding of MAPK on scaffold [MAPK] + [Scaffold] → [Scaffold_MAPK];  
 
 dissociation of MAPK from scaffold [Scaffold_MAPK] → [MAPK] + [Scaffold];  
 
 binding of MAPK on scaffold [MAPK] + [Scaffold_RAF] → [Scaffold_MAPK_RAF];  
 
 dissociation of MAPK from scaffold [Scaffold_MAPK_RAF] → [MAPK] + [Scaffold_RAF];  
 
 binding of MAPK on scaffold [MAPK] + [Scaffold_RAF-P] → [Scaffold_MAPK_RAF-P];  
 
 dissociation of MAPK from scaffold [Scaffold_MAPK_RAF-P] → [MAPK] + [Scaffold_RAF-P];  
 
 binding of MAPK on scaffold [MAPK] + [Scaffold_MEK] → [Scaffold_MAPK_MEK];  
 
 dissociation of MAPK from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK] → [MAPK] + [Scaffold_MEK];  
 
 binding of MAPK on scaffold [MAPK] + [Scaffold_MEK_RAF] → [Scaffold_MAPK_MEK_RAF];  
 
 dissociation of MAPK from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK_RAF] → [MAPK] + [Scaffold_MEK_RAF];  
 
 binding of MAPK on scaffold [MAPK] + [Scaffold_MEK_RAF-P] → [Scaffold_MAPK_MEK_RAF-P];  
 
 dissociation of MAPK from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK_RAF-P] → [MAPK] + [Scaffold_MEK_RAF-P];  
 
 binding of MAPK on scaffold [MAPK] + [Scaffold_MEK-P] → [Scaffold_MAPK_MEK-P];  
 
 dissociation of MAPK from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK-P] → [MAPK] + [Scaffold_MEK-P];  
 
 binding of MAPK on scaffold [MAPK] + [Scaffold_MEK-P_RAF] → [Scaffold_MAPK_MEK-P_RAF];  
 
 dissociation of MAPK from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK-P_RAF] → [MAPK] + [Scaffold_MEK-P_RAF];  
 
 binding of MAPK on scaffold [MAPK] + [Scaffold_MEK-P_RAF-P] → [Scaffold_MAPK_MEK-P_RAF-P];  
 
 dissociation of MAPK from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK-P_RAF-P] → [MAPK] + [Scaffold_MEK-P_RAF-P];  
 
 binding of MAPK on scaffold [MAPK] + [Scaffold_MEK-PP] → [Scaffold_MAPK_MEK-PP];  
 
 dissociation of MAPK from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK-PP] → [MAPK] + [Scaffold_MEK-PP];  
 
 binding of MAPK on scaffold [MAPK] + [Scaffold_MEK-PP_RAF] → [Scaffold_MAPK_MEK-PP_RAF];  
 
 dissociation of MAPK from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK-PP_RAF] → [MAPK] + [Scaffold_MEK-PP_RAF];  
 
 binding of MAPK on scaffold [MAPK] + [Scaffold_MEK-PP_RAF-P] → [Scaffold_MAPK_MEK-PP_RAF-P];  
 
 dissociation of MAPK from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK-PP_RAF-P] → [MAPK] + [Scaffold_MEK-PP_RAF-P];  
 
 binding of MAPK-P on scaffold [MAPK-P] + [Scaffold] → [Scaffold_MAPK-P];  
 
 dissociation of MAPK-P from scaffold [Scaffold_MAPK-P] → [MAPK-P] + [Scaffold];  
 
 binding of MAPK-P on scaffold [MAPK-P] + [Scaffold_RAF] → [Scaffold_MAPK-P_RAF];  
 
 dissociation of MAPK-P from scaffold [Scaffold_MAPK-P_RAF] → [MAPK-P] + [Scaffold_RAF];  
 
 binding of MAPK-P on scaffold [MAPK-P] + [Scaffold_RAF-P] → [Scaffold_MAPK-P_RAF-P];  
 
 dissociation of MAPK-P from scaffold [Scaffold_MAPK-P_RAF-P] → [MAPK-P] + [Scaffold_RAF-P];  
 
 binding of MAPK-P on scaffold [MAPK-P] + [Scaffold_MEK] → [Scaffold_MAPK-P_MEK];  
 
 dissociation of MAPK-P from scaffold [Scaffold_MAPK-P_MEK] → [MAPK-P] + [Scaffold_MEK];  
 
 binding of MAPK-P on scaffold [MAPK-P] + [Scaffold_MEK_RAF] → [Scaffold_MAPK-P_MEK_RAF];  
 
 dissociation of MAPK-P from scaffold [Scaffold_MAPK-P_MEK_RAF] → [MAPK-P] + [Scaffold_MEK_RAF];  
 
 binding of MAPK-P on scaffold [MAPK-P] + [Scaffold_MEK_RAF-P] → [Scaffold_MAPK-P_MEK_RAF-P];  
 
 dissociation of MAPK-P from scaffold [Scaffold_MAPK-P_MEK_RAF-P] → [MAPK-P] + [Scaffold_MEK_RAF-P];  
 
 binding of MAPK-P on scaffold [MAPK-P] + [Scaffold_MEK-P] → [Scaffold_MAPK-P_MEK-P];  
 
 dissociation of MAPK-P from scaffold [Scaffold_MAPK-P_MEK-P] → [MAPK-P] + [Scaffold_MEK-P];  
 
 binding of MAPK-P on scaffold [MAPK-P] + [Scaffold_MEK-P_RAF] → [Scaffold_MAPK-P_MEK-P_RAF];  
 
 dissociation of MAPK-P from scaffold [Scaffold_MAPK-P_MEK-P_RAF] → [MAPK-P] + [Scaffold_MEK-P_RAF];  
 
 binding of MAPK-P on scaffold [MAPK-P] + [Scaffold_MEK-P_RAF-P] → [Scaffold_MAPK-P_MEK-P_RAF-P];  
 
 dissociation of MAPK-P from scaffold [Scaffold_MAPK-P_MEK-P_RAF-P] → [MAPK-P] + [Scaffold_MEK-P_RAF-P];  
 
 binding of MAPK-P on scaffold [MAPK-P] + [Scaffold_MEK-PP] → [Scaffold_MAPK-P_MEK-PP];  
 
 dissociation of MAPK-P from scaffold [Scaffold_MAPK-P_MEK-PP] → [MAPK-P] + [Scaffold_MEK-PP];  
 
 binding of MAPK-P on scaffold [MAPK-P] + [Scaffold_MEK-PP_RAF] → [Scaffold_MAPK-P_MEK-PP_RAF];  
 
 dissociation of MAPK-P from scaffold [Scaffold_MAPK-P_MEK-PP_RAF] → [MAPK-P] + [Scaffold_MEK-PP_RAF];  
 
 binding of MAPK-P on scaffold [MAPK-P] + [Scaffold_MEK-PP_RAF-P] → [Scaffold_MAPK-P_MEK-PP_RAF-P];  
 
 dissociation of MAPK-P from scaffold [Scaffold_MAPK-P_MEK-PP_RAF-P] → [MAPK-P] + [Scaffold_MEK-PP_RAF-P];  
 
 binding of MAPK-PP on scaffold [MAPK-PP] + [Scaffold] → [Scaffold_MAPK-PP];  
 
 dissociation of MAPK-PP from scaffold [Scaffold_MAPK-PP] → [MAPK-PP] + [Scaffold];  
 
 binding of MAPK-PP on scaffold [MAPK-PP] + [Scaffold_RAF] → [Scaffold_MAPK-PP_RAF];  
 
 dissociation of MAPK-PP from scaffold [Scaffold_MAPK-PP_RAF] → [MAPK-PP] + [Scaffold_RAF];  
 
 binding of MAPK-PP on scaffold [MAPK-PP] + [Scaffold_RAF-P] → [Scaffold_MAPK-PP_RAF-P];  
 
 dissociation of MAPK-PP from scaffold [Scaffold_MAPK-PP_RAF-P] → [MAPK-PP] + [Scaffold_RAF-P];  
 
 binding of MAPK-PP on scaffold [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK] → [Scaffold_MAPK-PP_MEK];  
 
 dissociation of MAPK-PP from scaffold [Scaffold_MAPK-PP_MEK] → [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK];  
 
 binding of MAPK-PP on scaffold [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK_RAF] → [Scaffold_MAPK-PP_MEK_RAF];  
 
 dissociation of MAPK-PP from scaffold [Scaffold_MAPK-PP_MEK_RAF] → [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK_RAF];  
 
 binding of MAPK-PP on scaffold [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK_RAF-P] → [Scaffold_MAPK-PP_MEK_RAF-P];  
 
 dissociation of MAPK-PP from scaffold [Scaffold_MAPK-PP_MEK_RAF-P] → [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK_RAF-P];  
 
 binding of MAPK-PP on scaffold [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK-P] → [Scaffold_MAPK-PP_MEK-P];  
 
 dissociation of MAPK-PP from scaffold [Scaffold_MAPK-PP_MEK-P] → [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK-P];  
 
 binding of MAPK-PP on scaffold [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK-P_RAF] → [Scaffold_MAPK-PP_MEK-P_RAF];  
 
 dissociation of MAPK-PP from scaffold [Scaffold_MAPK-PP_MEK-P_RAF] → [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK-P_RAF];  
 
 binding of MAPK-PP on scaffold [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK-P_RAF-P] → [Scaffold_MAPK-PP_MEK-P_RAF-P];  
 
 dissociation of MAPK-PP from scaffold [Scaffold_MAPK-PP_MEK-P_RAF-P] → [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK-P_RAF-P];  
 
 binding of MAPK-PP on scaffold [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK-PP] → [Scaffold_MAPK-PP_MEK-PP];  
 
 dissociation of MAPK-PP from scaffold [Scaffold_MAPK-PP_MEK-PP] → [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK-PP];  
 
 binding of MAPK-PP on scaffold [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK-PP_RAF] → [Scaffold_MAPK-PP_MEK-PP_RAF];  
 
 dissociation of MAPK-PP from scaffold [Scaffold_MAPK-PP_MEK-PP_RAF] → [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK-PP_RAF];  
 
 binding of MAPK-PP on scaffold [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK-PP_RAF-P] → [Scaffold_MAPK-PP_MEK-PP_RAF-P];  
 
 dissociation of MAPK-PP from scaffold [Scaffold_MAPK-PP_MEK-PP_RAF-P] → [MAPK-PP] + [Scaffold_MEK-PP_RAF-P];  
 
 binding of MEK on scaffold [MEK] + [Scaffold] → [Scaffold_MEK];  
 
 dissociation of MEK from scaffold [Scaffold_MEK] → [MEK] + [Scaffold];  
 
 binding of MEK on scaffold [MEK] + [Scaffold_RAF] → [Scaffold_MEK_RAF];  
 
 dissociation of MEK from scaffold [Scaffold_MEK_RAF] → [MEK] + [Scaffold_RAF];  
 
 binding of MEK on scaffold [MEK] + [Scaffold_RAF-P] → [Scaffold_MEK_RAF-P];  
 
 dissociation of MEK from scaffold [Scaffold_MEK_RAF-P] → [MEK] + [Scaffold_RAF-P];  
 
 binding of MEK-P on scaffold [MEK-P] + [Scaffold] → [Scaffold_MEK-P];  
 
 dissociation of MEK-P from scaffold [Scaffold_MEK-P] → [MEK-P] + [Scaffold];  
 
 binding of MEK-P on scaffold [MEK-P] + [Scaffold_RAF] → [Scaffold_MEK-P_RAF];  
 
 dissociation of MEK-P from scaffold [Scaffold_MEK-P_RAF] → [MEK-P] + [Scaffold_RAF];  
 
 binding of MEK-P on scaffold [MEK-P] + [Scaffold_RAF-P] → [Scaffold_MEK-P_RAF-P];  
 
 dissociation of MEK-P from scaffold [Scaffold_MEK-P_RAF-P] → [MEK-P] + [Scaffold_RAF-P];  
 
 binding of MEK-PP on scaffold [MEK-PP] + [Scaffold] → [Scaffold_MEK-PP];  
 
 dissociation of MEK-PP from scaffold [Scaffold_MEK-PP] → [MEK-PP] + [Scaffold];  
 
 binding of MEK-PP on scaffold [MEK-PP] + [Scaffold_RAF] → [Scaffold_MEK-PP_RAF];  
 
 dissociation of MEK-PP from scaffold [Scaffold_MEK-PP_RAF] → [MEK-PP] + [Scaffold_RAF];  
 
 binding of MEK-PP on scaffold [MEK-PP] + [Scaffold_RAF-P] → [Scaffold_MEK-PP_RAF-P];  
 
 dissociation of MEK-PP from scaffold [Scaffold_MEK-PP_RAF-P] → [MEK-PP] + [Scaffold_RAF-P];  
 
 binding of MEK on scaffold [MEK] + [Scaffold_MAPK] → [Scaffold_MAPK_MEK];  
 
 dissociation of MEK from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK] → [MEK] + [Scaffold_MAPK];  
 
 binding of MEK on scaffold [MEK] + [Scaffold_MAPK_RAF] → [Scaffold_MAPK_MEK_RAF];  
 
 dissociation of MEK from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK_RAF] → [MEK] + [Scaffold_MAPK_RAF];  
 
 binding of MEK on scaffold [MEK] + [Scaffold_MAPK_RAF-P] → [Scaffold_MAPK_MEK_RAF-P];  
 
 dissociation of MEK from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK_RAF-P] → [MEK] + [Scaffold_MAPK_RAF-P];  
 
 binding of MEK-P on scaffold [MEK-P] + [Scaffold_MAPK] → [Scaffold_MAPK_MEK-P];  
 
 dissociation of MEK-P from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK-P] → [MEK-P] + [Scaffold_MAPK];  
 
 binding of MEK-P on scaffold [MEK-P] + [Scaffold_MAPK_RAF] → [Scaffold_MAPK_MEK-P_RAF];  
 
 dissociation of MEK-P from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK-P_RAF] → [MEK-P] + [Scaffold_MAPK_RAF];  
 
 binding of MEK-P on scaffold [MEK-P] + [Scaffold_MAPK_RAF-P] → [Scaffold_MAPK_MEK-P_RAF-P];  
 
 dissociation of MEK-P from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK-P_RAF-P] → [MEK-P] + [Scaffold_MAPK_RAF-P];  
 
 binding of MEK-PP on scaffold [MEK-PP] + [Scaffold_MAPK] → [Scaffold_MAPK_MEK-PP];  
 
 dissociation of MEK-PP from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK-PP] → [MEK-PP] + [Scaffold_MAPK];  
 
 binding of MEK-PP on scaffold [MEK-PP] + [Scaffold_MAPK_RAF] → [Scaffold_MAPK_MEK-PP_RAF];  
 
 dissociation of MEK-PP from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK-PP_RAF] → [MEK-PP] + [Scaffold_MAPK_RAF];  
 
 binding of MEK-PP on scaffold [MEK-PP] + [Scaffold_MAPK_RAF-P] → [Scaffold_MAPK_MEK-PP_RAF-P];  
 
 dissociation of MEK-PP from scaffold [Scaffold_MAPK_MEK-PP_RAF-P] → [MEK-PP] + [Scaffold_MAPK_RAF-P];  
 
 binding of MEK on scaffold [MEK] + [Scaffold_MAPK-P] → [Scaffold_MAPK-P_MEK];  
 
 dissociation of MEK from scaffold [Scaffold_MAPK-P_MEK] → [MEK] + [Scaffold_MAPK-P];  
 
 binding of MEK on scaffold [MEK] + [Scaffold_MAPK-P_RAF] → [Scaffold_MAPK-P_MEK_RAF];  
 
 dissociation of MEK from scaffold [Scaffold_MAPK-P_MEK_RAF] → [MEK] + [Scaffold_MAPK-P_RAF];