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EBI Dbfetch

ID   Z48636; SV 1; linear; genomic DNA; STD; PRO; 6836 BP.
XX
AC   Z48636;
XX
DT   09-MAR-1995 (Rel. 43, Created)
DT   18-APR-2005 (Rel. 83, Last updated, Version 5)
XX
DE   C.novyi gene for alpha-toxin
XX
KW   alpha-toxin.
XX
OS   Clostridium novyi
OC   Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae;
OC   Clostridium.
XX
RN   [1]
RC   (sites)
RX   DOI; 10.1007/BF00290398
RX   PUBMED; 7616958.
RA   Hofmann F., Herrmann A., Habermann E., von Eichel-Streiber C.;
RT   "Sequencing and analysis of the gene encoding the alpha-toxin of
RT   Clostridium novyi proves its homology to toxins A and B of Clostridium
RT   difficile";
RL   Mol. Gen. Genet. 247(6):670-679(1995).
XX
RN   [2]
RP   1-6836
RA   Hofmann F.;
RT   ;
RL   Submitted (09-MAR-1995) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RL   Hofmann F., Johannes-Gutenberg Universitaet Mainz, Institut fuer
RL   Medizinische Mikrobiologie, Obere Zahlbacher Strasse 67, Mainz,
RL   Rheinland-Pfalz, Germany, 55101
XX
FH   Key             Location/Qualifiers
FH
FT   source          1..6836
FT                   /organism="Clostridium novyi"
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FT                   /db_xref="taxon:1542"
FT   5'UTR           1..160
FT   CDS             161..6697
FT                   /transl_table=11
FT                   /product="alpha-toxin"
FT                   /db_xref="InterPro:IPR018337"
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FT                   /citation=[1]
FT                   /protein_id="CAA88565.1"
FT                   /translation="MLITREQLMKIASIPLKRKEPEYNLILDALENFNRDIEGTSVKEI
FT                   YSKLSKLNELVDNYQTKYPSSGRNLALENFRDSLYSELRELIKNSRTSTIASKNLSFIW
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FT                   INIVSNKNDIWNFDVSYIVKESKIEDNKFVLDGFINNIFSTLKVSNDGFKIGKQFISIK
FT                   NTPRAINLSFKINNNIVIVSIYLNHEKSNSITIISSDLNDIKNNFDNLLDNINYIGLGS
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FT                   EKCNVIVSGSNKLNSEGDLADTIDVLDKDLENLYIDSVIIIPKVYTKKIIIHPIPNNPQ
FT                   INIINTQSIHDKCHLIIDSVLTNNYHWESDGDDLIITNGLDINIRILQGLSFGFKYKNI
FT                   YLKFSNYDELSLNDFLLQNYNVKGLYYINGELHYKNIPGDTFEYGWINIDSRWYFFDSI
FT                   NLIAKKGYQEIEGERYYFNPNTGVQESGVFLTPNGLEYFTNKHASSKRWGRAINYTGWL
FT                   TLDGNKYYFQSNSKAVTGLQKISDKYYYFNDNGQMQIKWQIINNNKYYFDGNTGEAIIG
FT                   WFNNNKERYYFDSEGRLLTGYQVIGDKSYYFSDNINGNWEEGSGVLKSGIFKTPSGFKL
FT                   FSSEGDKSAINYKGWLDLNGNKYYFNSDSIAVTGSYNIKGIQYYFNPKTAVLTNGWYTL
FT                   DNNNYYVSNGHNVLGYQDIDGKGYYFDPSTGIQKAGVFPTPNGLRYFTMKPIDGQRWGQ
FT                   CIDYTGWLHLNGNKYYFGYYNSAVTGWRVLGGKRYFFNIKTGAATTGLLTLSGKRYYFN
FT                   EKGEQLTLV"
FT   3'UTR           6698..6836
XX
SQ   Sequence 6836 BP; 2809 A; 658 C; 1034 G; 2335 T; 0 other;
     acgaaacaag ccatttctca aaaaaaagca agaatactaa cagacttgaa aaataaattt        60
     tgtaatgatt aacaaaaaat attaaattat taaaatttta tatttttgta cttggtatgt       120
     atcaataata taagttaatt tatttaaagg agtgaatttt atgcttataa caagagaaca       180
     attaatgaaa attgcaagta taccattaaa acgtaaggaa ccagaatata accttatttt       240
     agatgctctt gaaaatttca atagagacat tgaaggtact tcagttaaag agatctattc       300
     taaacttagt aaactaaatg aattagttga taattatcaa actaaatatc cgtcatctgg       360
     aagaaattta gctttggaga attttaggga tagtttgtat tctgagctaa gggaacttat       420
     aaaaaattct agaacttcaa ctatcgctag taaaaattta agttttattt ggataggtgg       480
     tcctatatca gaccaatctt tagaatacta taatatgtgg aaaatgttta ataaagatta       540
     taatatacga ttattttatg ataagaattc attgctagta aatacattaa aaacagctat       600
     aattcaagaa agctcaaaag taataattga gcagaatcaa tccaatatct tggatggaac       660
     ttatggtcat aataaatttt attctgatag aatgaaatta atttatagat ataaaagaga       720
     attgaaaatg ttatatgaaa atatgaagca aaacaattct gttgatgata taattataaa       780
     ttttttatca aactatttta aatatgacat aggaaaattg aacaaccaaa aagaaaataa       840
     taataataaa atgatagcaa ttggagctac agatattaat actgaaaaca ttttaacaaa       900
     taaacttaag tcttattatt atcaagaatt aatacaaaca aataatttag cagctgcatc       960
     agatatatta agaattgcta tattgaaaaa atatggtggt gtatattgtg atttagattt      1020
     tcttcctgga gttaatttga gtttattcaa tgatatatca aagcctaatg gaatggatag      1080
     taattattgg gaggcagcta tttttgaagc aatagctaat gaaaaaaaac ttatgaataa      1140
     ttatccatat aagtatatgg agcaagttcc atctgaaata aaagaaagaa tattatcttt      1200
     tgtaagaaat catgatatta atgatttaat attaccattg ggagatatta aaatatcaca      1260
     attagaaata ttattatcaa gattaaaggc tgcaactgga aaaaaaactt ttagcaatgc      1320
     ttttataatt tcaaataatg attctttaac attaaataat ctcataagtc agcttgaaaa      1380
     tagatatgaa atattaaata gtattataca agaaaaattt aaaatatgtg aaacttatga      1440
     tagctatatt aatagtgtaa gtgaattagt acttgaaaca acccctaaaa atttatctat      1500
     ggatggaagt agcttttatc agcaaataat aggttattta tcatctggat ttaaacctga      1560
     agtcaattca actgtttttt tttctggacc taatatttat tccagtgcta cttgtgatac      1620
     ttaccatttt attaaaaata catttgatat gttatcatca caaaatcaag agatttttga      1680
     ggcttcgaat aatttatatt tttcaaaaac acatgatgaa tttaaaagta gttggctttt      1740
     aagaagtaat atagctgaaa aagagtttca gaaactgata aaaacttata taggaagaac      1800
     tctcaattat gaagatggtt taaattttaa taagtggaaa cgagtaacta cttctgagtt      1860
     gctaaaagta atagaggaag ttaattctac taaaatatat gagaactatg atttaaatat      1920
     gattttgcaa attcaaggtg atgacattag ctatgaatct gcagttaatg tttttggtaa      1980
     aaatccaaat aaaagcattt taatccaagg agtagatgat tttgcaaacg tattttattt      2040
     tgaaaatgga attgttcaat ctgataatat aaataatata ttatctagat ttaatgatat      2100
     aaaaaaaata aaattgacat taataggaca tggagaaaat gtttttaatc ctaaattatt      2160
     tggtggtaaa acagtaaatg atttatatac taatattatt aaaccaaaac ttcaacattt      2220
     attagagaga gaaggagtaa tacttaagaa taaatattta aaaataaata tacttggatg      2280
     ttatatgttt actccaaagg tagatattaa ttctactttt gtaggaaagt tattcaataa      2340
     aattagtagg gatcttcaac caaaaggttt tagtaaaaat cagctagaaa tttctgcgaa      2400
     taagtatgca ataagaataa atagagaagg taaaagagag gttctcgatt actttggtaa      2460
     gtgggtttct aatactgatt taatagctga acagatatct aataaatatg tagtatattg      2520
     gaatgaagta gaaaatactc tttcagctag ggtggagcag cttaataaag ttgctgaatt      2580
     tgcaaaagat ataaattcta taattcagac aactaataat caagaactta aacaaagttt      2640
     agttaatact tatgcagatc ttattacaac attatattca gaactgttaa aggaagacat      2700
     tccatttgaa ttagataata ttcaaattaa ggaaagaata attttaaatg aaatttccag      2760
     gttacatgat ttttctaata ttattcttga cttttaccaa aaaaataata tatctaataa      2820
     tatgataata ttgtttgata gtataataaa agaaaaagat tactataatg ttaaattagc      2880
     taataaaatt actggtgaga catcagttat taaaacatat tcagattcgt tatggaattt      2940
     taccaataaa tataaaaaaa ttgtagatga tataaaagga ataattgtta aggatattaa      3000
     tggtgaattt ataaaaaagg cagattttga gatagaacaa aatccatcat tattaaattc      3060
     agctatgtta atgcaattat taatagatta taagccttat actgaaattt tgactaatat      3120
     gaatactagt ttaaaagtac aagcatatgc acaaattttt caattatcaa taggtgcgat      3180
     tcaagaggcc acagagatag ttaccataat ttcagatgct ttaaatgcga actttaatat      3240
     tttatctaaa ttaaaggttg gatcatcagt agcatctgta attatagatg gaattaattt      3300
     aattgcagct ttaactgaat taaaaaatgt aaaaactaat tttgaaagaa aattgataga      3360
     agctaaagtt ggaatgtatt caattggatt tatactcgaa agttctagct taatttcggg      3420
     actgctagga gcgacagcag tatctgagat attaggtgtt atttcagtac ctgttgcagg      3480
     tatattagtt ggtcttccat cacttgtaaa taacattctt gtcttaggag aaaaatataa      3540
     tcaaatatta gattacttca gtaaattcta tccaatagtt ggtaaaaatc cattttctat      3600
     tcaagacaat ataataattc cttatgatga catagctatt acagaattaa atttcaaata      3660
     taataagttt aaatatggat atgctaaaat aagtggtttg aaggtgggtc tggtcacaca      3720
     tattggggaa aatatagatc actattttag tgcacctagt cttgatcatt atatagaatt      3780
     atcaatatat ccagcattaa aattgaatga tacaaatttg ccaaaaggaa atgtagtatt      3840
     acttccatca ggacttaata aggtttataa accagagatt tcagctattg caggtgcaaa      3900
     tagtcaagag ggtaatggag tggaagtatt aaatttaatt cgaaattatt atgtagattc      3960
     taatggaaat actaaattcc catggaaata tgaagcacct tttgaatata gtttttcata      4020
     tatgagagtt gaatattttg atacaaaagt taatgtgatt ttagataatg aaaataaaac      4080
     gttaataatt ccagtattga ctattgatga aatgagaaat aagatttcat atgaaatttt      4140
     aggtgatggt ggacaatata atgttatttt acctgtaaat caaactaata taaatatagt      4200
     atcaaataaa aatgatatat ggaattttga tgtaagttat atagtaaaag agtctaaaat      4260
     agaagataat aaatttgttt tagatggatt tataaataat attttttcaa cattaaaagt      4320
     atcaaatgat ggatttaaaa ttggaaagca atttatcagt ataaaaaata cacctagagc      4380
     aataaatcta tcttttaaaa ttaataataa tatagttata gtaagtatat atttaaatca      4440
     tgaaaaaagt aattcaataa caataattag ttctgattta aatgatatta aaaataattt      4500
     cgataattta ttggataata ttaattatat aggattagga agtatttcag ataatacaat      4560
     aaattgtatt gtaagaaatg atgaagtgta tatggaagga aaaatatttc taaacgaaaa      4620
     aaagttagta tttatacaaa atgaattaga actacatctt tatgattcag taaataaaga      4680
     tagccagtat cttataaata atcctataaa taatgtagtt aaatataaag atggatatat      4740
     tgtagaagga acttttttaa taaatagtac tgaaaacaaa tacagtctgt acattgaaaa      4800
     taataaaatt atgcttaaag ggctttattt agaatcatct gtttttaaaa ctatacaaga      4860
     taagatatac tctaaagaaa aagtaaatga ctatatactt tctcttatta aaaaattttt      4920
     tacagttaat atacaattgt gcccatttat gattgtatca ggtgtagatg aaaataatag      4980
     atatttagaa tatatgttaa gcacaaataa taaatggata ataaacggtg gatattggga      5040
     aaatgacttt aataattata aaatagttga ctttgaaaaa tgtaatgtta tagtttctgg      5100
     ctctaacaaa ttaaactcag aaggtgatct agcagatact attgatgttt tagacaagga      5160
     tttagaaaat ttgtatatag atagtgttat tataatacct aaagtttata ctaaaaaaat      5220
     tattatacat cctataccaa ataatccaca aataaatatt ataaatactc agagcattca      5280
     tgataaatgt cacttaataa tagattcagt tttaactaat aattatcatt gggaatctga      5340
     tggagatgat ttaataatta caaatggttt agatattaat ataagaatac tgcaaggttt      5400
     atcttttggg tttaaatata aaaatatata cttgaagttt agtaattatg atgagttatc      5460
     tctaaatgat tttttattac aaaattataa tgtaaaagga ttatattata taaatggaga      5520
     gcttcattac aaaaatatac caggtgatac ttttgaatat ggatggatta atattgattc      5580
     aagatggtat ttctttgata gtattaacct tatagctaaa aaaggatatc aagagataga      5640
     gggagaaagg tattatttta atcctaatac tggagttcaa gaatcaggag tgtttcttac      5700
     gccaaatgga ctagaatatt ttacaaataa acatgcaagc tccaaaagat gggggcgagc      5760
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     taaagcagta acaggattac aaaaaatatc tgataaatat tattacttta atgataatgg      5880
     acaaatgcaa ataaaatggc aaattataaa taacaataaa tattattttg atggaaatac      5940
     aggcgaagct ataattggat ggtttaataa taataaagaa agatattatt ttgatagtga      6000
     aggtagactt ttaacaggat atcaagttat aggagataaa tcatattatt tttcagataa      6060
     tataaatgga aattgggaag aaggaagtgg agtgttaaaa agtggtattt tcaaaactcc      6120
     ttctggattt aaactttttt catctgaagg agataaaagt gctataaatt ataaaggatg      6180
     gctagattta aatggaaata aatattattt taatagtgat tcaatagcag ttacaggatc      6240
     ttacaatata aagggaattc aatattattt taatcctaaa acagcagtat taacaaatgg      6300
     atggtatact ttagataata ataattatta tgtttctaat ggacataatg tattaggata      6360
     ccaagacata gatggaaaag gatattactt tgatcctagt acaggaattc aaaaagctgg      6420
     ggtattccct actccaaatg gattaagata ttttactatg aaacctatag atggacaaag      6480
     atggggtcaa tgtatagatt atactggatg gctacactta aatggaaata aatattattt      6540
     tggatattac aatagtgcag taacgggttg gcgagtatta ggtggaaaaa gatatttctt      6600
     taatattaaa acgggtgccg caactacagg tttattaacc ttgagtggta agagatatta      6660
     ttttaatgaa aaaggagaac agttgaccct ggtataatgt aaataataga tttaaaaaag      6720
     cctctagttt aaagaggctt ttttaaatct tcaaaagaat tttaaaaatt atcttttaat      6780
     aagatgtact tatagttact ttttaaataa agccttccag gtatccttac ctacaa          6836
//


  
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