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EBI DbfetchID AAFI02000066; SV 1; linear; genomic DNA; WGS; INV; 170615 BP. XX AC AAFI02000066; AAFI02000000; AAFI00000000; XX PR Project:201; XX DT 04-APR-2006 (Rel. 87, Created) DT 05-SEP-2009 (Rel. 102, Last updated, Version 8) XX DE Dictyostelium discoideum AX4 chromosome 4 DDB0232600.02, whole genome DE shotgun sequence. XX KW WGS. XX OS Dictyostelium discoideum AX4 OC Eukaryota; Amoebozoa; Mycetozoa; Dictyosteliida; Dictyostelium. XX RN [1] RP 1-170615 RX DOI; 10.1038/nature03481 RX PUBMED; 15875012. RG The Dictyostelium discoideum Sequencing Consortium RA Eichinger L., Pachebat J.A., Glockner G., Rajandream M.A., Sucgang R., RA Berriman M., Song J., Olsen R., Szafranski K., Xu Q., Tunggal B., RA Kummerfeld S., Madera M., Konfortov B.A., Rivero F., Bankier A.T., RA Lehmann R., Hamlin N., Davies R., Gaudet P., Fey P., Pilcher K., Chen G., RA Saunders D., Sodergren E., Davis P., Kerhornou A., Nie X., Hall N., RA Anjard C., Hemphill L., Bason N., Farbrother P., Desany B., Just E., RA Morio T., Rost R., Churcher C., Cooper J., Haydock S., van Driessche N., RA Cronin A., Goodhead I., Muzny D., Mourier T., Pain A., Lu M., Harper D., RA Lindsay R., Hauser H., James K., Quiles M., Madan Babu M., Saito T., RA Buchrieser C., Wardroper A., Felder M., Thangavelu M., Johnson D., RA Knights A., Loulseged H., Mungall K., Oliver K., Price C., Quail M.A., RA Urushihara H., Hernandez J., Rabbinowitsch E., Steffen D., Sanders M., RA Ma J., Kohara Y., Sharp S., Simmonds M., Spiegler S., Tivey A., Sugano S., RA White B., Walker D., Woodward J., Winckler T., Tanaka Y., Shaulsky G., RA Schleicher M., Weinstock G., Rosenthal A., Cox E.C., Chisholm R.L., RA Gibbs R., Loomis W.F., Platzer M., Kay R.R., Williams J., Dear P.H., RA Noegel A.A., Barrell B., Kuspa A.; RT "The genome of the social amoeba Dictyostelium discoideum"; RL Nature 435(7038):43-57(2005). XX RN [2] RP 1-170615 RG The Dictyostelium discoideum Sequencing Consortium RA Eichinger L., Pachebat J.A., Gloeckner G., Rajandream M.-A., Sucgang R., RA Song J., Cox E.C., Tunggal B., Szafranski K., Konfortov B.A., RA Farbrother P., Bankier A.T., Lehmann R., Hamlin N., Xu Q., Davies R., RA Gaudet P., Fey P., Pilcher K., Chen G., Saunders D., Sodergren E., RA Davis P., Nie X., Kerhornou A., Hemphill L., Bason N., Berriman M., RA Desany B., Churcher C., Cooper J., van Driessche N., Cronin A., RA Goodhead I., Muzny D., Hall N., Harper D., Lindsay R., Hauser H., James K., RA Quiles M., Buchrieser C., Wardroper A., Thangavelu M., Johnson D., RA Knights A., Loulseged H., Mungall K., Price C., Ma J., Quail M., RA Hernandez J., Rabbinowitsch E., Steffen D., Sanders M., Weinstock G., RA Sharp S., Just E., Shaulsky G., Simmonds M., Tivey A., White B., Walker D., RA Woodward J., Winckler T., Schleicher M., Rosenthal A., Rivero F., RA Chisholm R.L., Gibbs R., Loomis W.F., Platzer M., Kay R.R., Williams J., RA Dear P.H., Noegel A.A., Barrell B., Kuspa A.; RT ; RL Submitted (08-OCT-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. RL dictyBase, Center for Genetic Medicine, Northwestern University, 303 E RL Chicago Ave, Chicago, IL 60611, USA XX RN [3] RP 1-170615 RG The Dictyostelium discoideum Sequencing Consortium RA Eichinger L., Pachebat J.A., Gloeckner G., Rajandream M.-A., Sucgang R., RA Song J., Cox E.C., Tunggal B., Szafranski K., Konfortov B.A., RA Farbrother P., Bankier A.T., Lehmann R., Hamlin N., Xu Q., Davies R., RA Gaudet P., Fey P., Pilcher K., Chen G., Saunders D., Sodergren E., RA Davis P., Nie X., Kerhornou A., Hemphill L., Bason N., Berriman M., RA Desany B., Churcher C., Cooper J., van Driessche N., Cronin A., RA Goodhead I., Muzny D., Hall N., Harper D., Lindsay R., Hauser H., James K., RA Quiles M., Buchrieser C., Wardroper A., Thangavelu M., Johnson D., RA Knights A., Loulseged H., Mungall K., Price C., Ma J., Quail M., RA Hernandez J., Rabbinowitsch E., Steffen D., Sanders M., Weinstock G., RA Sharp S., Just E., Shaulsky G., Simmonds M., Tivey A., White B., Walker D., RA Woodward J., Winckler T., Schleicher M., Rosenthal A., Rivero F., RA Chisholm R.L., Gibbs R., Loomis W.F., Platzer M., Kay R.R., Williams J., RA Dear P.H., Noegel A.A., Barrell B., Kuspa A.; RT ; RL Submitted (22-JAN-2008) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. RL dictyBase, Center for Genetic Medicine, Northwestern University, 303 E RL Chicago Ave, Chicago, IL 60611, USA XX RN [4] RP 1-170615 RG The Dictyostelium discoideum Sequencing Consortium RA Eichinger L., Pachebat J.A., Gloeckner G., Rajandream M.-A., Sucgang R., RA Song J., Cox E.C., Tunggal B., Szafranski K., Konfortov B.A., RA Farbrother P., Bankier A.T., Lehmann R., Hamlin N., Xu Q., Davies R., RA Gaudet P., Fey P., Pilcher K., Chen G., Saunders D., Sodergren E., RA Davis P., Nie X., Kerhornou A., Hemphill L., Bason N., Berriman M., RA Desany B., Churcher C., Cooper J., van Driessche N., Cronin A., RA Goodhead I., Muzny D., Hall N., Harper D., Lindsay R., Hauser H., James K., RA Quiles M., Buchrieser C., Wardroper A., Thangavelu M., Johnson D., RA Knights A., Loulseged H., Mungall K., Price C., Ma J., Quail M., RA Hernandez J., Rabbinowitsch E., Steffen D., Sanders M., Weinstock G., RA Sharp S., Just E., Shaulsky G., Simmonds M., Tivey A., White B., Walker D., RA Woodward J., Winckler T., Schleicher M., Rosenthal A., Rivero F., RA Chisholm R.L., Gibbs R., Loomis W.F., Platzer M., Kay R.R., Williams J., RA Dear P.H., Noegel A.A., Barrell B., Kuspa A.; RT ; RL Submitted (12-AUG-2009) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. RL dictyBase, Center for Genetic Medicine, Northwestern University, 303 E RL Chicago Ave, Chicago, IL 60611, USA XX DR EMBL-CON; CM000153. XX CC Each chromosome was individually shotgun cloned and assembled. CC Since the rDNA genes are present on extrachromosomal elements, they CC are not included within this project but are present in GenBank CC Accession Numbers AY171065-AY171067. Similarly, the mitochondrial CC DNA is not included but is present in GenBank Accession Number CC AB000109. CC In August 2009 contig AAFI02000242 was suppressed because it was a CC contaminant, and contigs AAFI02000226 and AAFI02000244 were made CC secondary to contigs AAFI02000006 and AAFI02000262, respectively. CC Assembly Name: dicty_2.7 CC Genome Coverage: 8.3x CC Sequencing Technology: Sanger CC Annotation was updated on the contigs in August 2009. 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tattcagtgg tatctgtatc 128400 atgatcttca tatcttgaat ttacatgtgt agcttgtttt cttgctggtc tattcaataa 128460 tgatgcttgt aattctataa tatctgctcc tactttagtt aatccgctag attttggttt 128520 tttacttttc tttttatctt ttgttgttgc tgttgttgag gttgttgttg tagtagtagt 128580 tgtatttggt ggtgttggtg ttattgtatc tattgatgat ttttgtttct ttgatgtcat 128640 attaatatta ttcttggttc actccaaaat ttaatttttt aaaaaaataa aacaaaaaaa 128700 ataaaaaaat aaaaaataaa aaattaaaaa taaaaataaa ttaaaaaaaa aaaaaaaaaa 128760 gaaaatttag aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaataaa taaaaaatta taaaaaaata 128820 aatcttaaac ttatcggtta ctgttttatt tattttttat ttttttttct tgaaactaat 128880 tatttaaaac tctaattcaa aaaaactatt aataaaaaca ttttgatact tgaaaaataa 128940 tttcattttt ttaattcttt atcctttttt tttttttttt ttttttatta aacaatggtt 129000 taattttatt tatttttaat atggattcaa tgtagaaaaa tagaacacac aaaaaaacat 129060 aaaatcatat aaaatataaa aaaaataaat gaaataattc tttttttttt tttttttttt 129120 tttttgtcaa aaattttatt tttataattt aattatttaa cattcatttt ttgtaactgt 129180 tttttattta gaagaacaaa 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