EBI Dbfetch

ID   AAFI02000039; SV 1; linear; genomic DNA; WGS; INV; 126170 BP.
XX
AC   AAFI02000039; AAFI02000000; AAFI00000000;
XX
PR   Project:201;
XX
DT   04-APR-2006 (Rel. 87, Created)
DT   05-SEP-2009 (Rel. 102, Last updated, Version 8)
XX
DE   Dictyostelium discoideum AX4 chromosome 3 DDB0232522.02, whole genome
DE   shotgun sequence.
XX
KW   WGS.
XX
OS   Dictyostelium discoideum AX4
OC   Eukaryota; Amoebozoa; Mycetozoa; Dictyosteliida; Dictyostelium.
XX
RN   [1]
RP   1-126170
RX   DOI; 10.1038/nature03481
RX   PUBMED; 15875012.
RG   The Dictyostelium discoideum Sequencing Consortium
RA   Eichinger L., Pachebat J.A., Glockner G., Rajandream M.A., Sucgang R.,
RA   Berriman M., Song J., Olsen R., Szafranski K., Xu Q., Tunggal B.,
RA   Kummerfeld S., Madera M., Konfortov B.A., Rivero F., Bankier A.T.,
RA   Lehmann R., Hamlin N., Davies R., Gaudet P., Fey P., Pilcher K., Chen G.,
RA   Saunders D., Sodergren E., Davis P., Kerhornou A., Nie X., Hall N.,
RA   Anjard C., Hemphill L., Bason N., Farbrother P., Desany B., Just E.,
RA   Morio T., Rost R., Churcher C., Cooper J., Haydock S., van Driessche N.,
RA   Cronin A., Goodhead I., Muzny D., Mourier T., Pain A., Lu M., Harper D.,
RA   Lindsay R., Hauser H., James K., Quiles M., Madan Babu M., Saito T.,
RA   Buchrieser C., Wardroper A., Felder M., Thangavelu M., Johnson D.,
RA   Knights A., Loulseged H., Mungall K., Oliver K., Price C., Quail M.A.,
RA   Urushihara H., Hernandez J., Rabbinowitsch E., Steffen D., Sanders M.,
RA   Ma J., Kohara Y., Sharp S., Simmonds M., Spiegler S., Tivey A., Sugano S.,
RA   White B., Walker D., Woodward J., Winckler T., Tanaka Y., Shaulsky G.,
RA   Schleicher M., Weinstock G., Rosenthal A., Cox E.C., Chisholm R.L.,
RA   Gibbs R., Loomis W.F., Platzer M., Kay R.R., Williams J., Dear P.H.,
RA   Noegel A.A., Barrell B., Kuspa A.;
RT   "The genome of the social amoeba Dictyostelium discoideum";
RL   Nature 435(7038):43-57(2005).
XX
RN   [2]
RP   1-126170
RG   The Dictyostelium discoideum Sequencing Consortium
RA   Eichinger L., Pachebat J.A., Gloeckner G., Rajandream M.-A., Sucgang R.,
RA   Song J., Cox E.C., Tunggal B., Szafranski K., Konfortov B.A.,
RA   Farbrother P., Bankier A.T., Lehmann R., Hamlin N., Xu Q., Davies R.,
RA   Gaudet P., Fey P., Pilcher K., Chen G., Saunders D., Sodergren E.,
RA   Davis P., Nie X., Kerhornou A., Hemphill L., Bason N., Berriman M.,
RA   Desany B., Churcher C., Cooper J., van Driessche N., Cronin A.,
RA   Goodhead I., Muzny D., Hall N., Harper D., Lindsay R., Hauser H., James K.,
RA   Quiles M., Buchrieser C., Wardroper A., Thangavelu M., Johnson D.,
RA   Knights A., Loulseged H., Mungall K., Price C., Ma J., Quail M.,
RA   Hernandez J., Rabbinowitsch E., Steffen D., Sanders M., Weinstock G.,
RA   Sharp S., Just E., Shaulsky G., Simmonds M., Tivey A., White B., Walker D.,
RA   Woodward J., Winckler T., Schleicher M., Rosenthal A., Rivero F.,
RA   Chisholm R.L., Gibbs R., Loomis W.F., Platzer M., Kay R.R., Williams J.,
RA   Dear P.H., Noegel A.A., Barrell B., Kuspa A.;
RT   ;
RL   Submitted (08-OCT-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RL   dictyBase, Center for Genetic Medicine, Northwestern University, 303 E
RL   Chicago Ave, Chicago, IL 60611, USA
XX
RN   [3]
RP   1-126170
RG   The Dictyostelium discoideum Sequencing Consortium
RA   Eichinger L., Pachebat J.A., Gloeckner G., Rajandream M.-A., Sucgang R.,
RA   Song J., Cox E.C., Tunggal B., Szafranski K., Konfortov B.A.,
RA   Farbrother P., Bankier A.T., Lehmann R., Hamlin N., Xu Q., Davies R.,
RA   Gaudet P., Fey P., Pilcher K., Chen G., Saunders D., Sodergren E.,
RA   Davis P., Nie X., Kerhornou A., Hemphill L., Bason N., Berriman M.,
RA   Desany B., Churcher C., Cooper J., van Driessche N., Cronin A.,
RA   Goodhead I., Muzny D., Hall N., Harper D., Lindsay R., Hauser H., James K.,
RA   Quiles M., Buchrieser C., Wardroper A., Thangavelu M., Johnson D.,
RA   Knights A., Loulseged H., Mungall K., Price C., Ma J., Quail M.,
RA   Hernandez J., Rabbinowitsch E., Steffen D., Sanders M., Weinstock G.,
RA   Sharp S., Just E., Shaulsky G., Simmonds M., Tivey A., White B., Walker D.,
RA   Woodward J., Winckler T., Schleicher M., Rosenthal A., Rivero F.,
RA   Chisholm R.L., Gibbs R., Loomis W.F., Platzer M., Kay R.R., Williams J.,
RA   Dear P.H., Noegel A.A., Barrell B., Kuspa A.;
RT   ;
RL   Submitted (22-JAN-2008) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RL   dictyBase, Center for Genetic Medicine, Northwestern University, 303 E
RL   Chicago Ave, Chicago, IL 60611, USA
XX
RN   [4]
RP   1-126170
RG   The Dictyostelium discoideum Sequencing Consortium
RA   Eichinger L., Pachebat J.A., Gloeckner G., Rajandream M.-A., Sucgang R.,
RA   Song J., Cox E.C., Tunggal B., Szafranski K., Konfortov B.A.,
RA   Farbrother P., Bankier A.T., Lehmann R., Hamlin N., Xu Q., Davies R.,
RA   Gaudet P., Fey P., Pilcher K., Chen G., Saunders D., Sodergren E.,
RA   Davis P., Nie X., Kerhornou A., Hemphill L., Bason N., Berriman M.,
RA   Desany B., Churcher C., Cooper J., van Driessche N., Cronin A.,
RA   Goodhead I., Muzny D., Hall N., Harper D., Lindsay R., Hauser H., James K.,
RA   Quiles M., Buchrieser C., Wardroper A., Thangavelu M., Johnson D.,
RA   Knights A., Loulseged H., Mungall K., Price C., Ma J., Quail M.,
RA   Hernandez J., Rabbinowitsch E., Steffen D., Sanders M., Weinstock G.,
RA   Sharp S., Just E., Shaulsky G., Simmonds M., Tivey A., White B., Walker D.,
RA   Woodward J., Winckler T., Schleicher M., Rosenthal A., Rivero F.,
RA   Chisholm R.L., Gibbs R., Loomis W.F., Platzer M., Kay R.R., Williams J.,
RA   Dear P.H., Noegel A.A., Barrell B., Kuspa A.;
RT   ;
RL   Submitted (12-AUG-2009) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RL   dictyBase, Center for Genetic Medicine, Northwestern University, 303 E
RL   Chicago Ave, Chicago, IL 60611, USA
XX
DR   EMBL-CON; CM000152.
DR   RFAM; RF00005; tRNA.
XX
CC   Each chromosome was individually shotgun cloned and assembled.
CC   Since the rDNA genes are present on extrachromosomal elements, they
CC   are not included within this project but are present in GenBank
CC   Accession Numbers AY171065-AY171067. Similarly, the mitochondrial
CC   DNA is not included but is present in GenBank Accession Number
CC   AB000109.
CC   In August 2009 contig AAFI02000242 was suppressed because it was a
CC   contaminant, and contigs AAFI02000226 and AAFI02000244 were made
CC   secondary to contigs AAFI02000006 and AAFI02000262, respectively.
CC   Assembly Name: dicty_2.7
CC   Genome Coverage: 8.3x
CC   Sequencing Technology:  Sanger
CC   Annotation was updated on the contigs in August 2009.
XX
FH   Key             Location/Qualifiers
FH
FT   source          1..126170
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FT   mRNA            complement(join(<2433..3058,3174..>4011))
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FT   CDS             complement(join(2433..3058,3174..4011))
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FT                   SVFFLSNISIGTIIDYLLIYKLKQYRKNYNSQHSLLNPKSYYEPNLLNLQQKQQQDGDE
FT                   DFNQLELTNNNERIKDLTPPFYGFIFDKFDKSNNDYENNKLVKYFQCWSLIKNFNSLIY
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FT                   EAELVSPHPTSQLITNIYQKPYYRIGAYIVGILIAFIYTDSKLSKKVRYIYYLRTTRYI
FT                   LYCVSLFITFFLSYISFDFYKNSINFVGNWTTIQKSLYNGFSHTTFSIGVSIIILATFY
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FT                   VTTFAAAFVIHLLIEKPFINLERLIFSSK"
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FT   mRNA            complement(join(<4714..5090,5204..>6149))
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FT   CDS             complement(join(4714..5090,5204..6149))
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FT                   YIRLAKLVYPEWSEIERLSNTKLIHITGGLDFGHQNAEPLKDLIESYKRNNIDYQILSK
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FT                   GPAIGKLISNLVQNKPNPIDTNDEFLLKRFNSKTFPKRISA"
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FT                   ESKKKRGRPRKPTPERCSNCKITHSSYWRRITVNGQKLDFCNACGLHQMKRNNRIKESK
FT                   QRHSIQNIMNQNQEEEEEEREEEEEEEEEEDEEFETLEEEEEDDE"
FT   gene            <11432..>12684
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FT                   /old_locus_tag="DDB_0229333"
FT   mRNA            join(<11432..12233,12308..>12684)
FT                   /locus_tag="DDB_G0280855"
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FT   CDS             join(11432..12233,12308..12684)
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FT                   YVLYQLLTTIKYINSAGVIHRSLDPKTIAVNKEYKTKLFDFSFSISTDYPTDIFFKDYE
FT                   ETPWPYRSPETIIMLKEFSFECDVWSIGVIFAELILGEQLFRGESKQSLLIEISELIGT
FT                   PTYDECKESTNGFARNFILNIPLKSRHGGIKKRIPNATEEEIEILEGMLCWNPKKRWPI
FT                   ERIIQHPYFQNYCHIEQYKCDKKFSLGSPYVFHRLNAKEIKKIIEDEFVTQP"
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FT                   KYVYY"
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FT                   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGIIFNNIDLVNSVNSNSNINIGSVDLNNILS
FT                   YLNYNFNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSITQPNENKFNNENIPTCQNGNNNPESKDN
FT                   LDISQVDSILNNNIGGNDDDDENKMDSQSKANIASIIVKILT"
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FT                   ELVLNNKVNQPKYQFQVKILTFKNRSEDEYPPHMQIVVNGKNVIDQIYKIKKDNIENGI
FT                   TVFYYNPIDVSQNIQNKNTFTINTHETIGVLMLQIVKINGFISTLNLANL"
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FT   mRNA            complement(<19934..>20485)
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FT   CDS             complement(19934..20485)
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FT                   YPNNNYDDSFHLESLPSTVHTLKHISLSKPKNESNCVFVVPPNFKSISFNDFIQWSISK
FT                   ETKNNFIQIPDIRSKSFLKS"
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FT                   /product="hypothetical protein"
FT   CDS             join(22252..22260,22372..23205)
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FT                   YNFVSDYNQQYAFIQYVNRQFHLRNYRQVNMQESQNLIEQILQTYKNQSQSSDDNNNNN
FT                   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNDRPDNDENLQNDQNQEQ
FT                   NEEEDEEEEEEDQYEEGEEEDQSEYQEQQSQNLFQQDQDFEQLQQDQDLSLQSSHIFF"
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FT   mRNA            complement(join(<23778..23839,24005..24902,25192..>25209))
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FT   CDS             complement(join(23778..23839,24005..24902,25192..25209))
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FT                   /locus_tag="DDB_G0280865"
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FT                   LFLRRKLLKMLQDSKNQQFIINNHLEFNNQQIKSPPQKQYQKILQLQSNQTNLLTLSSV
FT                   KLTQSPCTSPPPSSPPSPLLENNYSPLYEDQTKQQIEMINEINENKTSFNRGIKRLFTI
FT                   EYNQKCSYVLILSENTWKIILDQSRRISIQLKFYYKQTENDFKYDSTDYDLSINDYYFE
FT                   NHENEKKVKSHSPFEQLSIKKPIDITDFILDYNGLCFSHPGASGILIIELIQTQPINKS
FT                   KLIKKTNYLIKNYENKFLKKTVKKKPVRIPPHNQFIPELDGHQC"
FT   gene            complement(<25548..>26036)
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FT   mRNA            complement(join(<25548..25868,26034..>26036))
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FT                   /old_locus_tag="DDB_0218268"
FT                   /product="hypothetical protein"
FT   CDS             complement(join(25548..25868,26034..26036))
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FT                   EYQQQKQRLKEKDYIELLKLIDTAKNYEYPSEEIKQQELKEKEKRVKEIVDEIVKMIEE
FT                   YKN"
FT   gene            <26749..>31645
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FT                   28286..28594,28683..29351,29442..31645)
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FT                   /old_locus_tag="DDB_0238788"
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FT                   /protein_id="EAL66975.1"
FT                   /translation="MTPKNNTMKIFLLILVILFFFFFIFCNAQNPIIKLYDVSENTVDR
FT                   YTKYPDGTTSTQCHFYFEILIVDTSKSGVGFIVSSSNPNPLFTTIYSIDSAMVFSTEPR
FT                   VEQNGNYSDTIFTSLLNDSTIINNITINYSCQSIDFGDLTFMYFMANTSLKSTFGFSGV
FT                   FFFTTKYPIKGFDITSTDALANQIGINSGVYIFNGEFSLDNFIEYNSVQINFLNGNNIE
FT                   VQIPQSKYQNSNNNNTEIVTVPDINENIILFGKNTHPLFTLISNATDVNPFLFCLGSGG
FT                   SQSIAQPIYQTNQGIKYLGAFNDYYSAKYNLYLQLNGSLSIIYNATINVTREIPSPLYY
FT                   TQFIITNTFKNETFLKNSSIFNVHGNSIMKYDGSSSFSMIFGDFQSYITFPFGFINGTN
FT                   FNYTTKISLLQEPISKQPSQSFLINNYVSQVPADIVATPSELHRVLPKLLYFEIVKLFD
FT                   GFFLFRITIANGIYMRMKDDSGYTIIGYESLVTNGNGGFFFEFIGIYRSSVFESIDIFN
FT                   EFGLKTTYFVGDYYSVDPVSKIYSTHKPINSYLAYDISFLKNDIDVTNKSIDNILFFSF
FT                   DGIDNNTPIFFIKGDDASFSNDLKEFSYGKWNSTISKYQINFRVPGNTQTGIFPFNLMF
FT                   GFSIPMVSDVLPYTSQLRIKNSYLDVFGPIFQTITKINNNNVIGWSFSISDPINGFLKG
FT                   KIIVKGEMDSSIYIFNLNETNLISGDIYLGSYEINITIPLKCASQNYIITDVELIDRQN
FT                   NLNLFSTWNIKASIKTPFFNFLNDSSINKIYKLCNGVNDGIDSSPPVLKSFDVVRFSSG
FT                   NNLHSIFFVFVAVDEETGLKDDQFPIVYLTSLYLETLQCTSRLVSKNSTSATFSCEIEI
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FT                   46575..46945))
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FT                   SEKQLNSYKTIFNNNSLEPISKVTDLEKLLFDFFEINKRTNIINNNNFNNSTNNSNISF
FT                   YYKNGIVLNKNGNKELVDMDSSVNYNSSRMPTYLADRSGLVSPITDIDLGIYPEGDKRI
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FT                   YNNCNNNNNNNNNNNNNNNSNNNNNNNNNNNNNNNNNNININNNQFKEDYIEFPKNLLD
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FT                   NNYKNNNNNKNNNYSNNNNYNYNYNYNYNYNYNVKRKNESTYSYKNTKSGSNSSRSRDR
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FT                   51776..52277)
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FT                   KKVEIKTGEFGITPYNIPTLTESYKRYVTLETIRDLKETSCRVSDTKDLGEDINIAQVP
FT                   YELPDGNLLEIGSDRFQIPELLFNPTPLNEQILNNNNNNSNGENTTTSSVVQQPQYQGL
FT                   GRMIIESLEKSDTDIRKELISNLIITGGNTLFAGFQERLVRDISEISYNKPKIVANQTE
FT                   KKNSVWIGGSVLGSLGTFQQMWMSKSEWEEFGRPLVEKKCP"
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FT                   ASPCWSCNEHIEKKKIFCPMCNKVQQMDDSIDIFYLFDMYVFILLHFLNLFLFFFCKPS
FT                   FRVDLKDLSHRFKKLQKQLHPDLFEQSDSQKEKNISKEITTSLNTAHNILKSPFLRAEY
FT                   ILNQKGLDLSSVGDVDPEVLMEVLEVREAIDEGTEEDITKIAHENRQKINDVVEKLENE
FT                   FQNKNYQEALKQTVYLRYLTRIQEEVHNRLDTHI"
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FT   CDS             complement(join(53729..55106,55282..55393,55494..55884))
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FT                   STSINALSPLKEPNDSSLILNDEKSSISNLKDHSNTSPIVNFLIKRIFVKWDSIYFIRI
FT                   AEFGYEHEQNHAFFPLFPLLMNIVGKALNSFSFIHSLSFSDCIIVSGFIISNLSFVLSA
FT                   VQLLNEFAFTATLLYCINPAGVFTTAVYTENLFNLMIFSGLVQVFGGDYYLLEMNGREL
FT                   GTHSMPLSRKIWCTTLASLFFSLATATRSNGILMCGFIIYTYYSSYITHMARLILRFLH
FT                   STKTYKKTYLLKPSNSMDKLPLVNSAFDNSTLSKDLLLYPLLIIIQSLIIILPYIIFQY
FT                   YGYSRFCNNNNNNNFELIKNGDWPRPWCGSGDTSGLFKYPNLYGFVQNHYWNQGFFNYY
FT                   TVSQIPNFLFATPMVLLSVGSILSYLRYFINQPNQMIYSTFKSRSKNITIDTTSQLASI
FT                   GHTSDTFSVVYYSPHLLPFIVYLSFLTIFSVTFMHVQVITRFFIHSPLIFWFCAKFFMN
FT                   KIPEVPTSSPRMSDSSSNNNDNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSNNNN
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FT   mRNA            join(<57008..57213,57478..57745,57856..>58338)
FT                   /gene="rbsk"
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FT                   /translation="MENNITVVGASNWDTFIYVDKMPRVGETIKGTDLKVSYGGKAANQ
FT                   AVQASLLGSNCTLITKLGDDPSGVNTLKNFKDKNINCEFVSVVSNVPSGCATIIVDKNG
FT                   DNNIIIIGGSNDLLNEKDVDNAKSQIQNSSLLLCQLEVSLNVTLHALKIAKESNKCKTM
FT                   LNLTPINNDPLILEMFKFVDILIVNEIELIGLYNSTFNNNNNNEKDFNINQLMEMCDNL
FT                   IKKFENFENIIVTLGGNGQLLVSKENNKNCHIELKEKVKVVDTSGAGDSFIGSFAHYLV
FT                   TENKPLKDSIESASKVASISVTRHGTQTSYPKSNEIN"
FT   gene            complement(<58452..>63049)
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FT                   /old_locus_tag="DDB_0252882"
FT   mRNA            complement(join(<58452..62334,62427..>63049))
FT                   /locus_tag="DDB_G0280895"
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FT                   /old_locus_tag="DDB_0252882"
FT                   /product="WD40 repeat-containing protein"
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FT                   GSSLSIDGTSTCNSLILNGGGSINLSGTLNVNTQLSCDGIVKGGGSIKINGTLNVKSLN
FT                   LVGGGPIPTIYQNGIINLNGNANFSNGLILNDNSQLLIKSGICTIDGVLTTTTNSIIHN
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FT                   DFSIDINSRLIIESSSTNSFIGSVKCSIGSIVKVVDSIVNFKSPIVIDTLLIDNSKSSL
FT                   INIISNVTITNGIESLAPLSKISIDPVIGILNIGGNSVIGNVLNLSGTSQFNLINKANC
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FT                   NGPFSITGSSGSISISDGIINFYQGIQIPTTKCPFNILKSSTCNIHSTSLISSPVYCLN
FT                   DSTLNIISTINNNNNNNNNKLENIIQFEGGLFTDINSMFIIDNSIISLNSTSIISGLVM
FT                   LNESQLVSCGQTTFQNGIDSIINGKEGNNTLLVNSGYCLINTTNSIELSGSINIMEKAF
FT                   LSIRSPNTTCYKGIRNSGSLLIGSIVNLKNSMINQLNGDSSLELLQGSNLITVGANFAS
FT                   GIVSGIGKITIINSTNNNNNNNNNNNNNSSSSESNSIGKCESGGILSGWITIDGQLKLL
FT                   ESSVIRVNIVSSTNVSKIICTGSTIINGLIDVLFDTDTVEETLTKGMVFPVLSSSISIT
FT                   GNLSLSDTLDSKQFSCKPQQQQQSSSSSSTGSEYSLVYQQTNVPSNKITSTEDSTNSSK
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FT                   91914..92470))
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FT                   NNNNNNKNKINDDNDEDEEDGDALQPKIIDKDFLSDSNVTLYDYQVDTVNFALANHRGI
FT                   IKCATGGGKTLILAAFIKALGPDVPIVILVSKRSLVTQIYKVLKELNICNIGRNSSDFS
FT                   ETGMITISTVRSTHKIPEHVKNCRVLIVDEVHEFSGPFSEKVFQQFENAYCRLGFSATP
FT                   FKNEDPVHNHILTSIFGTQLCDITTRELTKNEILSGAIIHFYPINAPVIKFEKGTHFQK
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FT                   REHVIKKLRKSDPNKKVIAIFSSIGNVGIDVKIHHLINACGGKDPNSTIQKLGRGLRRA
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FT                   /gene="tRNA-Gly-GCC-6"
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FT                   GELNRNKIIRPSDIQREISEINTVEKTVDIKEKRLGSFKRGVLKIPLAFVQMIAISIAL
FT                   ICLLIP"
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FT                   /translation="MSVLIFNKKLFIYDILVILILLLIVLTLVKSDNSNNSLNKNINEN
FT                   NVIKENKIIIINEEVENQIQIIKENQINYSIHYVSFVQMITLSIMLICGLIPFEDFKNN
FT                   NNNNKNNNNKNKKK"
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FT   CDS             complement(join(96875..97056,97185..97236))
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FT                   VPPVNAFKLDLDGDIRRGGNKKSERVSGFSGR"
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FT   mRNA            join(<98733..98835,98931..>101977)
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FT                   /product="Phox domain-containing protein"
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FT                   QQQRQQPQQQQQYQRQHQPPYHQDSFYPKIVDEDDDEDAVDEVYENEDILQQQQQRQTK
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FT                   LQQQQQQQQQQQQQQQQMYQQQRQNNNHQQQTNQPQQMQQQQQMKQQQQQQQQQQQQQQ
FT                   QMQNRNNNYQQQNNSRNVINEDNFNNIQLPTTTTTTTTNNNQKDSSPPTKSNNNNNNNQ
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FT                   YQIIGKYKDDESDQQQQQQQQQEVTNAVSTRRRYREFEWLHSQLSQPSNHHSRIPSLPQ
FT                   KSIYQYWNNTDVALLRQRCSALDQFMKSISVSASLRNHAAVKLFMTQKPIPIQINSLTE
FT                   IISNNILSPQGALTSLTQAVITTATGVSGGGISTNNNNYLDSIDPNFTNESSVERDYWI
FT                   SRKLMSKWKRIPKRLPFSKFLVVILGTVSAGKSSFINNFFNLQVKVSADEQLDTHFTLI
FT                   ETVPRDRFYELSNQQPMKSKFTKEQLAQRIKGEAVSDPRHGHVFLYLDKTFTLSRYDAQ
FT                   FSNYRDIISNLNLVRTVLINEDYLTGAPDEISNQKKTIFIDSPGFEPKTEHDPEKLLGS
FT                   IRVVQFFQSTSDLTLFMMKAKELALVSSQIQIVELCVLYKTYGADVVDHMVTQMFNKKG
FT                   ESKSFFSLFEMVKGLVEQIRLKNIPKTQESNGTSVWDGIKFVMTQIDTINSNLKEQYFE
FT                   LGRLLGKGLMFLDPPTYRQCKAIALPIDREFSSPQERSQKCGDLDELLHYIYNLNRGST
FT                   YNSRLECAIEEMTTDLLNNIQRSWTNYLFNSDYNLVLQLKERSKNRVSGPSHMHSNSLR
FT                   R"
FT   gene            complement(102443..102507)
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FT                   /gene="sno14"
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FT                   /old_locus_tag="DDB_0215258"
FT                   /product="hypothetical protein"
FT   CDS             join(103037..103102,103228..103304,103406..103544)
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FT                   /locus_tag="DDB_G0280923"
FT                   /old_locus_tag="DDBDRAFT_0215258"
FT                   /old_locus_tag="DDB_0215258"
FT                   /product="hypothetical protein"
FT                   /db_xref="InterPro:IPR002110"
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FT                   /translation="MSDNGAKLRDAAKSGNEELVKSLIAEGPSSILDYKDRSGFTPLHM
FT                   AAMFGHQNICTILLQAGASNDIKTVDDETACDVAKTVTLGNFIKNFKK"
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FT   mRNA            complement(<103735..>105891)
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FT                   ERIASHATNRRITLTRYGAAYLHIVSQIRTKIKQQQSLPIDPVEYPSHSYTVSLQPNLL
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FT                   DLLTAALQETTLQETARKQMDQQAQEKIKKTVGEVSDSLENIELVIEDAKEQWQSLHPP
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FT   mRNA            complement(join(<117327..117619,117709..>117721))
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FT   mRNA            complement(join(<119854..120140,120259..>120271))
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FT   CDS             complement(join(119854..120140,120259..120271))
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FT                   ILGSGLGLGLGLGLDLTGGSRSRGACGGNRGNGNGNGGMGGGNGSCCGGPCCGI"
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FT   mRNA            complement(<120962..>123163)
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FT                   protein; hypothetical protein"
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FT                   /note="hypothetical protein; cyclin-like F-box containing
FT                   protein"
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FT                   SNGIDTTTTTPTKKPTRDRQLFSFSELAGTNLTLLLDSEILIRIFSKLEYSDLFIVKRV
FT                   CSRWKPLCEHKSLFNSLDMQSFILYCRILPMTILNNFLQTLSMDKDEIDALKMVCREMP
FT                   KITITNTPNIYLDTPPPTISNQQVPLNTQYITSSSSSSSTTTVTTTINTSNSSNTATTF
FT                   ITNTPIGGSTTPPIKNSFVNAFTATTSSLKSFLNTSGSGIATTLNGSNGSISSPPSPNL
FT                   NSNNNNNNNSQNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
FT                   NNNNNNSQNGHLRVSSLDDTLSISSTSSNGSLSSLDSLTINNSNNSSSNNNNNNSNNNS
FT                   INGNSGNTPISNRRNVFGQSLTLNEKEQKKKDKNRKERERRMEESLKIWNEDMIPNWDK
FT                   RKGTKKCREMVLQGIPSLVRSKVWPLLIGNDLNITPELFSIFGARAERAKQKSEARSLG
FT                   REKTVSLIHLDLPRTFPMLSIFQDEGPLHQSLANVLEAYVCYRPDVGYVQGMSYLAAVF
FT                   LLILDEFNSFVCLSNFLNNPCYMTFYTMNLDQMAVYMNTMDQLMAQNLPKIQKHLKELG
FT                   IQPDIFMIDWVLTVFSKALPLDVASHVWDTIFLDGEVVIFQTALGILKMYSKDLEFGDF
FT                   DVCMTLLTHLPTDIDEDELFQHINSFQINQKLLNKMLNK"
XX
SQ   Sequence 126170 BP; 49901 A; 13239 C; 12902 G; 50127 T; 1 other;
     tttaaatttg gagttgtggt tgaggttgaa gttaaagttg aagttggggt tgaaattaaa        60
     gttgaagttg aagttaaagt tgaagttgaa gtagaaccag aagatgatgg agtataacca       120
     gaagatgatg aagtataacc agaagaatat ggagtataac cagaagatga tggagtataa       180
     ccagaagatg atggagtata accagaggaa tatggagtgt aaccagaaga agatgaagta       240
     gaaccagaag aaggcgaagt agaaccagat gaaggcaaag tgtaaccaga agagggcgaa       300
     gtataaccag aagaagatag tcctacttct tgaatattct cattaccagt tttttttaaa       360
     gtttttttag ccatcattgc atcagtatca tcataattat tattattatt attattatta       420
     ttattataat tattattatt aaattccatt ttaaaagtga ttaaataaaa ttaattaatt       480
     ttaaaatatt attgggtata taattttctt ttttttattt ttttttttta tatatattgt       540
     aaatttttat ttttttgaag agacagaact aacaattaat taatgtgaat tttttaaaga       600
     aaaggacaat aaaaataata attaattttt aactataaat aattaaatta ttattttttt       660
     tctttttttt tttttttttt tatttatttt ttttcttttt tattaaaaat tttttttttt       720
     ttttttcttt tttatatttt tatcacacta ccactatttg atccaaaaat agtttcatta       780
     tgataacagg ttgtgcaaca ttgatgggta ttttcaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa       840
     aaaaaaaaaa aaaaacacaa taaacaacaa acaccccaca cagtgtgtta atataaatat       900
     taattaatat tgaatataag aaaaataaaa aaaaaaaaat actattggag tgattgaaat       960
     tttttattgt aatgacctat tatttttttt tattattatt attgctatta ctctatcatt      1020
     tattgtagtg atacataatt tatcatttgt tggtgtgagt gtgtttgctt gtgttagtgt      1080
     gtgctataat aaataaataa aaatattgat agtaatttat taaatttttt attttttgag      1140
     aggtttttac aacaacactt cattaattta cattgtaaat aatctcctcc ttgagagata      1200
     taaaaatgtt ttttaatcga tcgccataat tttttttttt tccatttcca ataaacaata      1260
     ataattacat ttttaatttt tttttttttt attttttttt tttaaaatat gatgttttac      1320
     caccccttca aatttttatc tacatattta tattagtgag tttattttta gaattttgta      1380
     ttattttttt taattcattt tttttttttt tatttattta tttttttatt ttttttttta      1440
     ataaatttta atgaacagac aatttgggtt gggggttaga tatatgatga ttattgaaaa      1500
     tccatatgca acatttatga tgaaaaccta ctcataatta ttattttagc tttatatgtt      1560
     ataaaaatat aattcagaaa tgatttaatt tttgcaagta aaaaagagta aaagtagtag      1620
     caatgtgtga acaataattc caataataaa aaaaaaaagt gtaataacaa tgtcaaaaaa      1680
     aaaaaaaaaa gaaagaaaaa agaaaataaa ttataataaa taattagccc aataattaaa      1740
     tctataacaa caacaatcaa aaattacaat attgtcttaa aaaaatgagt aacaatgatt      1800
     aaaaaagcaa gcaacaacaa taaacaataa acaacaaaca acaaaattat aaacaacagc      1860
     aacaacaaca attaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaccaca acaaaagtaa caaaaaaaag      1920
     acaacaacaa ccgccaaata ataaaaataa taataataaa aataataaca ataataaaaa      1980
     ataataaata taataataaa attaataata aaaataatag taataataaa aataataata      2040
     ataaataata ataataaata ataataataa taataataat aataataata ataataataa      2100
     taataataat aataataata ataataataa taataataat aataataata ataataataa      2160
     taataataat aataataata ataataataa taataataat aataattata acaataataa      2220
     taataatttt aaaaaaaaac aaataataaa aataatttta attttaatga tattggtaaa      2280
     aataaataaa taaataaatt taaaaaattt aaaaataaaa aaataaataa attatcacat      2340
     catctggtgt ttttttgatt tagaattttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt      2400
     tttttttttt ttttttgatt aatttaactt ttttattttg atgagaaaat taatctttct      2460
     aaattaataa atggtttttc gattaataaa tgaataacga atgcagcggc aaatgttgta      2520
     actacatttc caatgtataa aattgaaaat tcaatggttg agtaatgaag aaagtttgtc      2580
     attgagtaaa gtctatattc aattatcaat ggatgaatta aataagagga gtaggttaat      2640
     tttgaaaaga atttccatat tccaagtttt aaaaaccatt ggactatacc gccataacca      2700
     tagaatgttg ctaaaataat aattgaaaca ccaattgaaa aagttgtatg agagaaacca      2760
     ttatataatg acttttgaat tgttgtccaa tttccaacaa aattaattga attcttataa      2820
     aaatcaaaag aaatataaga taaaaagaat gtgataaaca atgatacaca atataatata      2880
     tatcttgttg tacgaaggta ataaatgtat ctaacttttt tagatagttt ggaatcagta      2940
     tatataaaag caattaaaat accaacaata taagcaccaa ttctataata tggtttttga      3000
     taaatgtttg taattaattg acttgttgga tgaggtgaaa ctagttcagc ttcagtacct      3060
     aacaaatcaa aaaatgttgg tatttcatat ttaatcgaaa ctgccaatgt tgccatcatt      3120
     gatgaatatt aaaaagtaat ataatggaat tagtctatca actgcaaatt cacctgcaaa      3180
     aataacttgg aatgaaaatg aactaaaagc acctccgagt gattctaaat tatcaattcc      3240
     aaaaccatca gttgcaaata aaattgtatg acctaaaatt acccaacatg tacctaatgt      3300
     tctaatacca tctaatgatt gaaaataacc ttttggattt gaaccataaa ttaaagaatt      3360
     gaaattttta attaatgacc aacattgaaa atatttaaca agtttattat tttcataatc      3420
     attattggat ttatcaaatt tatcaaaaat aaatccataa aaaggtggtg ttaaatcttt      3480
     aattctttca ttgttatttg ttaattctaa ttgattaaaa tcttcatcac catcttgttg      3540
     ttgtttttgt tgtaaattaa gtaaatttgg ttcataataa ctttttggat ttaataaaga      3600
     gtgttgtgaa ttataatttt ttctatattg ttttaattta taaattaaaa gataatcaat      3660
     gatagtacca atggaaatgt ttgaaaggaa gaaaacacta attccagtta aaacccaagt      3720
     accagcatta ctttgaattt taacagtttg atattcacta ttataacaat gtaaattatt      3780
     tgatgcatta aaactcattt caagttgcaa gacatttaaa attgtatatt gtgtcattaa      3840
     tccaataata tcatcttgag aacaataatt tgaacttgga taacaaactc caatataaaa      3900
     tgttactgaa tcaaaattac cttcaaataa acaatattga gtagtatttg aaggtaaggc      3960
     taaacaagat ccataatttc ctaattcatt aaaaccaata ccactataca ttactttttt      4020
     tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt taaaaaaaaa aatttaatat      4080
     aaaaaattat ttttttattt ttttttattg attattaaac aaacaaaata aataattaat      4140
     aatattactc atcatcatat ttgtaacatc aggatttgaa aaatctaaaa ttgaatctat      4200
     ttcatcagaa caatttttag aaacttgata actatttgat agtttcggaa ttaaatttaa      4260
     tttttttttt tttagaaatt cattatttat ttctttagtt ttaactaaaa aatcatttct      4320
     aatattaata ttttttttta aaataggaga ataatctcca ctactaaaat ttaaaaaagt      4380
     taaaataata aaagatataa ttattatttg tttaaacatt tttaagtttt tatttttttt      4440
     atttttttat tttttatttt ttatttttat acaaaaaaaa taaataaagg tttaaattag      4500
     attaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaatc attttgatgg tttcgtactg ggttacatgg      4560
     cttagttaga actgttaatt ttaaattttt tttatttttt ttattttttt ttttggtgag      4620
     attcctcctg tttatttgag tttaagtcca aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa      4680
     aaagagatat ttttttttat tttatttttt aatttatgca gatattcttt ttgggaaagt      4740
     tttggaattg aatcttttta ataaaaattc atcatttgta tcaattggat ttggtttatt      4800
     ttgaactaaa tttgaaatta attttccaat ggcaggacca aacttaaaac catgaccgga      4860
     acaaggtgat gcaataacaa catttgtaaa tcttggatgt ttatcaataa taaaatgcca      4920
     atctgatgta tttgtgtaat ggcaaacaac gctatgaccc tctttatcat tatttaaacc      4980
     tggcatatat tcaccaacat atcctttaac tttatcataa ttttcttttt taaatggtaa      5040
     ttttttactt tccatatttt ccaaaacatt accactatga tgatatccaa ctaaaaaaaa      5100
     aaataaaata aaataaaata ttaataattt tattttattt tatttttttt tatttttatt      5160
     tttatttttt tttttaaaat tataataata aaactttact tacttttaac ccctttaaca      5220
     tcaatttgag gtaaagaata ataaacatca gaattattat cataaaagat tgaaacaggg      5280
     ttattaaatt gagtataatc aattgtatta tttaattttg gttcccagta aaatacagtt      5340
     tcttgagaga tttctaaagg taatgtaatg tttaattgtg aattatgaat taaatcatta      5400
     atccaaccac cacatgctaa aactattttt ttagttttat aaactgattg atcttcacat      5460
     aatacagtta tgagtgactc tgattcaact ttaatacgag acaccttttt attatctaaa      5520
     atttgaccac caaatctttt gcatagcgac caaatggttt taattgattt acttgcgtat      5580
     gcaacaccac tatctttttg aaatacgatt aaatcattgt ctctgaattt aaattgtggg      5640
     aattttgatt ctgcctcttt ttttgagaga atttggtagt cgatattatt tcttttatag      5700
     gattcgatta aatcttttaa tggttctgca ttttggtgac cgaaatccaa gccaccagtg      5760
     atatgaatta atttggtatt tgataatctt tcaatctctg accattctgg ataaaccaat      5820
     ttagctaatc taatataggt atcctctgga tatgaaaatc ttataattct accatcgcca      5880
     tgtgatgatc ctttatcatg tgcttcttta aattgttcta acattaatac ctttaatcca      5940
     tcttttgcca tttgataaca tgctgatgat cctgtgatac caccaccaat tacaatacaa      6000
     tcatataata cttcattatt attattattt ttattattaa aattaatatt attattatta      6060
     ttactattat tactattatt attactattt acaatatgtg attgaatatt ttgaattctt      6120
     ctggtatatg ttgcttgttg attattcatt ttttatttca atattggtgt tgggaaaaaa      6180
     gttttaaata aaaaaaaaat aacaactcta aataaaaaaa aaaaataaaa aaaaatgaaa      6240
     actgggggaa aaaaaaaaaa ataaatgaaa aaataataaa aaaaaaaaat aaaaataaaa      6300
     aaaaatatct ttttttgaaa tctcaaataa ttttatttat ttttttattt aaataatcga      6360
     atgggggtaa aaatggacac tgaccttttt tgttatagat ccaaatttat tttttaattt      6420
     ttttttatga tttatctaga attgaaaaag aaaactaaaa aaaaaatatc agatattaaa      6480
     aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaataatgaa aattataatt gtttgatata aaaaaaaaaa      6540
     aaaaaggata aaaaaaaaaa aggataaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaata aaagaaaaaa      6600
     aaaaaaaaaa ataaagaaaa aaaaaaaaaa aaaaataaag aaaaaataat attttataaa      6660
     tataaaattc tttttatata aaaaataaaa ataaaaaaat gattttttat gaatcagaaa      6720
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     aaaaaaaaaa aaaaattaga aaaaaaaaaa aaaaaaatga tgaaaaatta aataactttg      6960
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     taataataat aataataata ataataataa taataataat aataataata ataataataa      7440
     taataataat aataataata ataataataa taataataat agagatttta ttattagaac      7500
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     tttattattt ttgtttgttt atttgttttt ttatttttat ttttattttt attttatttt      7620
     attttatttt ttatttatta ttttttaatt attatttaaa tttactaatt tttttttttt      7680
     tttttgttat tatttagatt atgcaagact tgaggcttgg aattagagat attattcatc      7740
     cttctactct tactggtttg cttggaggtt atattaatgc ccttgcaaac cttgaccaaa      7800
     atcaatcatc atcatcatcc tctggtgcat caggatcaag aagtgggagt agtgctctta      7860
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     aatataatca agtagttaga gatgaagaag atgatgatta tgataatggt gcagaagatg      7980
     gttttgacta tgatggggat gacaatgaag atggatctga ttctgcttgt gaaagtaaaa      8040
     aaaaaagagg tagaccccgt aagccaactc cagagcgttg ttccaattgt aagattactc      8100
     attcttcata ctggagaaga atcacagtca atggccaaaa actagatttc tgtaatgctt      8160
     gtggtttaca tcaaatgaaa agaaacaacc gtataaagga atcaaaacaa agacatagta      8220
     ttcaaaatat tatgaaccaa aatcaagagg aagaagaaga agaaagagaa gaagaagaag      8280
     aagaagaaga ggaagaagat gaagaatttg agactttgga ggaagaagag gaagatgatg      8340
     aataaaggta aatttgaatt caaataataa tatactccaa aataataata acaaaggacc      8400
     atcgttaaat gaaaaataat tgtaactctt atattggggt ttattttatt ctcatattaa      8460
     attcaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa      8520
     aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aataataata ataataattg aatctttact gtaatggaga      8580
     ttaaaagcaa tatttaatat atatattcca atgcaagatg taataaaaaa ataaaaataa      8640
     aattaaaata aatattaaaa ttaaaaataa aattaaaata aaattgaagt tttaattttt      8700
     gatactaaat aaaatatctt tttaatttga aatgatgaca atcaattaaa aaatttaaaa      8760
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     attctattga aaattaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aatagaatgg      8880
     tttcttaaat tttttttatt ttttatatct ttaatgtatt ttttagtttc aatttatagt      8940
     atataatatc aaaaataaag ttaaatcatt aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa gatgaaattt      9000
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     agaggtcaca taatatttat aattatttaa ttataattat gttatattta tttaatttta      9780
     tttaatttca attttttttt tttttttttt tttttattgc acctcctaca ataaataaaa      9840
     acaataacta ttattttttt tcattttttt atttttttta ttattaatta ttaaatattt      9900
     ataaattatc cttttacttt tattaatttt aaatattata tatacaataa cttattatac      9960
     cgctggttgt tcaatctctg ttccaagaaa gatgctaatt aattcaaata aaattgctga     10020
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     tttttaaatc catattaaaa aatgaatttt aatttatcta acacaattat gattattata     10260
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     aaaaaaaaaa aattaaaatt aaatcaattt tttattttat aataaatata actatttaga     10380
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     taaaattaat tttatttatt tacttattta tttttttaat attgcacaga aacccctatc     10560
     ataatctatt tttatattta ttttttattt aatttttttt tttttttttt tttaaattta     10620
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     aaaaaaataa aaaaataaaa aaataaaaaa aaaaaaataa aaaaaaagaa tataataata     11280
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     taaagtttca aaaagaaaat cattaaatat taaaacaaaa aatctaattg aatctccagt     11820
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     gattagatca gataaagcag cttcaagaaa acaatgtcca tatgttttgt accaattatt     11940
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     aattgcagtt aataaagaat ataaaactaa attatttgat tttagttttt caatttcaac     12060
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     tgttgttgca gcaattgcaa aagcaccacc aattggaaga gcaacagcaa gtgggatgac     12960
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     atttaaaaaa aaaaaaagaa aaaaaagaaa attaaaatta ataatatgtt ataaatttat     13080
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     agtatgggtc aatcattttc ttttttattt atatcttcag ttacatctga tttcatttga     13380
     atttgtaaac tatattacat tcttgattgg atttacaatc acaaatgcaa gaaccagaat     13440
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     ttgaccttgt aaatagtgtt aatagtaata gtaatattaa tattggcagc gttgatttaa     17520
     ataatatttt aagctacctc aattataatt ttaataataa taataataat aataataata     17580
     ataataataa taataataat aataataata ataataataa ctccattact caacctaatg     17640
     aaaacaaatt taataatgaa aatataccaa cttgtcaaaa tggtaataat aatccagaat     17700
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     ttgtaaaaat tttaacttaa taaattaata tatatattta tttgtttaac tttattttaa     17880
     tttaatttat ttttatttta gtttcttaat taaaataata aaaaaaaaaa aaataaaaaa     17940
     aaaaaaaaaa atagattttt aaatcaaaat agttttttga gaattaaaaa aaaaaaataa     18000
     gatctatatt ttaataaaaa taaaatgata tattaattaa aatttaaaaa aaaaaaaaac     18060
     taccataaaa tttattttaa tttttatttt ttcatttttg cattccactg tttacaaaaa     18120
     aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaacaaaaac aaaaacactt     18180
     tttagtggga tttgtttaat ttctttaatt taccaataat atattaattt ttacaatttc     18240
     aaagatttat catttatttt gatattaaat aaaaaatgag tatctttttg attttgtatt     18300
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     tcatttttta gtttttgttt tttttttttt ttttttaatt tttatttttt ttttattttt     53580
     taattttttt taaaaggaaa taaaaaatat ctgaaaaaca tccagcaaat tattaggtcc     53640
     aaaaaaggtt ttgttttttt ttttttgttt tttttttatt ttttaaatta attaatttaa     53700
     tattttttat ttttaatttt ttaactattt atgtccatgg ataaaaatta gtaaataaaa     53760
     cagaacctaa aacattataa agtataaaat aagataaaat taaaattctt tcaactcttt     53820
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     ttcggtgtgg gtcaaaagtt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttatacattt     67560
     attattattt tttttttttt ttaacatttt tttttatttt ttttttttta aaaaaaaaac     67620
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     taaaaaaaat aaaaaaataa aaaaacactt tattaatttc cctatttacg tgtatatttt     77040
     attgtgtttt taatattaaa gattaaaaat caagaattaa aaaatcaaat tagaaaatat     77100
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